单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 582 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-12-01 |
Molecular Signatures of Resilience to Alzheimer's Disease in Neocortical Layer 4 Neurons
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.03.621787
PMID:39574639
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研究论文 | 研究通过单细胞组学技术分析阿尔茨海默病中不同神经元的脆弱性和抗性特征 | 首次通过单核和空间转录组学技术，比较了阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域，识别出在初级视觉皮质层4中表达特定基因的抗性兴奋性神经元群体 | 研究主要集中在初级视觉皮质层4的神经元，未涵盖其他脑区的神经元抗性机制 | 探讨阿尔茨海默病中神经元的抗性机制 | 阿尔茨海默病中不同皮质区域层4神经元的抗性特征 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞组学技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域的神经元样本 |
| 282 | 2024-12-01 |
Exercise Induced Endothelial Mesenchymal Transition (EndMT) Facilitates Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403788
PMID:39344749
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研究论文 | 研究展示了内皮间充质转化（EndMT）在膝关节半月板再生中的作用 | 开发了一种手持式生物打印系统，用于手术中制造多孔半月板支架，并结合术后定期运动刺激，促进了羊模型中半月板纤维软骨组织的再生 | 研究主要在羊模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 开发一种有效的转化策略，促进半月板再生，特别是在广泛损伤或退化的情况下 | 膝关节半月板及其再生 | 生物医学工程 | 关节疾病 | 内皮间充质转化（EndMT）、单细胞RNA测序、免疫荧光共染色 | NA | 组织 | 羊模型 |
| 283 | 2024-11-19 |
General-purpose pre-trained large cellular models for single-cell transcriptomics
2024-Nov, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae340
PMID:39555105
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 284 | 2024-12-01 |
Population-Level Cell Trajectory Inference Based on Gaussian Distributions
2024-Nov-01, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111396
PMID:39595573
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研究论文 | 本文介绍了一种基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI，通过高斯混合模型和期望最大化算法优化细胞群体，并结合RNA速度进行高斯过程回归分析 | 提出了一种新的基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI，该方法在处理高维、高噪声的单细胞数据时表现优异 | NA | 解决现有细胞轨迹推断方法在处理高维、高噪声单细胞数据时的不足 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 四个结构多样的模拟数据集和四个真实数据集 |
| 285 | 2024-12-01 |
Glycoengineered extracellular vesicles released from antibacterial hydrogel facilitate diabetic wound healing by promoting angiogenesis
2024-Nov, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70013
PMID:39600241
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研究论文 | 研究了一种新型水凝胶敷料，通过糖基化工程化的细胞外囊泡促进糖尿病伤口愈合 | 开发了一种包含糖基化工程化细胞外囊泡和抗菌水凝胶的新型敷料，显著提高了糖尿病伤口的愈合效果 | 研究主要在体外和小鼠实验中进行，尚未在临床上验证 | 探索新型水凝胶敷料在治疗感染性糖尿病伤口中的潜力 | 糖尿病伤口、细胞外囊泡、水凝胶敷料 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 小鼠实验 |
| 286 | 2024-12-01 |
Downregulation of Notch Signaling-Stimulated Genes in Neurovascular Unit Alterations Induced by Chronic Cerebral Hypoperfusion
2024-Nov, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70082
PMID:39607309
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研究论文 | 研究慢性脑低灌注（CCH）引起的神经血管单元（NVU）变化及其病理机制 | 揭示了CCH引起的NVU变化，特别是神经炎症相关基因的激活和Notch信号通路的下调 | NA | 探讨CCH引起的NVU变化的病理机制 | 小鼠模型中的脑微血管（BMV）和神经血管单元（NVU） | 数字病理学 | 脑血管疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 287 | 2024-12-01 |
Single-cell sequencing reveals cellular landscape alterations in the airway mucosa of patients with pulmonary long COVID
2024-Nov, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01947-2023
PMID:39326914
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示了长期COVID患者气道黏膜的细胞景观变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了长期COVID患者气道黏膜中中性粒细胞的独特聚集及其在慢性小气道炎症中的作用 | 样本量较小，且仅限于加拿大温哥华地区的患者 | 阐明长期COVID患者肺部的重要细胞和分子驱动因素 | 长期COVID患者的气道黏膜细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 18名成年患者，其中9名长期COVID患者和9名对照组 |
| 288 | 2024-12-01 |
Distinct Patterns of Smooth Muscle Phenotypic Modulation in Thoracic and Abdominal Aortic Aneurysms
2024-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd11110349
PMID:39590192
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研究论文 | 研究胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调节的差异模式 | 使用单细胞RNA测序技术分析胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞的转录组特征，揭示了细胞组成的差异 | 需要进一步研究揭示特定基因在病理过程中的作用 | 探讨胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞的表型调节差异 | 胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胸主动脉瘤和腹主动脉瘤样本及其对照组 |
| 289 | 2024-11-30 |
Comprehensive Analysis of Sialylation-Related Gene Profiles and Their Impact on the Immune Microenvironment in Periodontitis
2024-Nov-29, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02177-1
PMID:39609348
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研究论文 | 本研究分析了唾液酸化相关基因在牙周炎中的表达及其对免疫微环境的影响 | 首次系统地鉴定了与牙周炎相关的唾液酸化核心基因，并构建了多基因诊断模型，揭示了这些基因在免疫细胞中的表达及其对细胞发育和通信的影响 | 研究主要基于数据分析和模型构建，缺乏实验验证 | 识别与牙周炎相关的唾液酸化基因，并探讨其对牙周免疫微环境的影响 | 唾液酸化相关基因及其在牙周炎中的表达和功能 | NA | 牙周病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 290 | 2024-11-30 |
Single Cell Data Enables Dissecting Cell Types Present in Bulk Transcriptome Data
2024-Nov-29, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2024.0152
PMID:39611952
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研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序数据分析和解卷积方法，从批量转录组数据中估计细胞类型比例的流程 | 提出了一种新的流程，利用单细胞RNA测序数据对批量转录组数据进行解卷积，以估计细胞类型比例 | 仅在iPSC衍生的肾脏和脑类器官数据上进行了验证，尚未在其他组织类器官中进行测试 | 开发一种方法，利用单细胞RNA测序数据从批量转录组数据中解析细胞类型 | iPSC衍生的肾脏和脑类器官的批量转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个肾脏单细胞RNA测序数据集和一个脑单细胞RNA测序数据集 |
| 291 | 2024-11-30 |
Dissecting the effect of genetic variants on atherosclerosis: integrating bulk and single-cell transcriptomics
2024-Nov-28, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae489
PMID:39607792
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-11-30 |
Unveiling FADS3 as a novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma through comprehensive RNA and single-cell sequencing
2024-Nov-27, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.010
PMID:39609202
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 293 | 2024-11-30 |
GDNF family receptor alpha-like (GFRAL) expression is restricted to the caudal brainstem
2024-Nov-26, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102070
PMID:39608751
|
研究论文 | 研究探讨了GDNF家族受体α样蛋白（GFRAL）在中枢神经系统和外周组织中的表达情况 | 通过高灵敏度和选择性技术，首次全面展示了GFRAL在脑干以外的其他脑区和外周组织中的表达情况 | 研究主要集中在小鼠和人类组织样本上，未涉及其他物种 | 探究GFRAL在外周组织和脑干以外脑区的表达情况 | GFRAL在不同组织中的表达细胞 | 神经科学 | NA | 单分子原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从小鼠和人类组织中收集了12种不同组织的样本 |
| 294 | 2024-11-29 |
Time-resolved single-cell transcriptomic sequencing
2024-Nov-27, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc05700g
PMID:39568874
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综述 | 综述了时间分辨单细胞转录组测序方法及其应用 | 介绍了将“时间锚点”引入单细胞RNA测序库以记录动态表达模式的方法 | 现有的计算方法基于假设，未能反映实际状态 | 探讨时间分辨单细胞转录组测序技术的发展和应用 | 单细胞RNA测序技术及其在不同时间点的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 295 | 2024-11-29 |
Single-cell RNA sequencing reveals key regulators and differentiation trajectory of iPSC-derived cardiomyocytes
2024-11-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-79488-8
PMID:39587160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人诱导多能干细胞（iPSC）向心肌细胞分化的动态基因调控网络和关键调控因子 | 首次在单细胞分辨率下揭示了iPSC向心肌细胞分化的关键调控基因和分化轨迹 | 研究仅基于两个iPSC细胞系，可能存在样本多样性不足的问题 | 揭示心肌细胞分化过程中的动态基因调控网络和关键调控因子 | 人诱导多能干细胞（iPSC）及其分化为心肌细胞的过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32,365个细胞，来自4个分化阶段的两个iPSC细胞系 |
| 296 | 2024-11-29 |
A comprehensive analysis of gene expression and the immune landscape in gastric cancer through single-cell and multi-omics approaches
2024-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01591-z
PMID:39585511
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研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学方法全面分析了胃癌中的基因表达和免疫景观 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胃癌微环境的细胞景观和基因表达谱，并发现了与肿瘤微环境相关的性别偏倚基因功能 | NA | 探讨胃癌微环境中不同细胞类型和基因表达谱的分布，揭示潜在的分子机制 | 胃癌样本中的基因表达和免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 297 | 2024-11-29 |
Inhalation of itraconazole mitigates bleomycin-induced lung fibrosis via regulating SPP1 and C3 signaling pathway pivotal in the interaction between phagocytic macrophages and diseased fibroblasts
2024-Nov-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05895-0
PMID:39587675
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研究论文 | 研究通过吸入伊曲康唑减轻博来霉素诱导的肺纤维化，并探讨其通过调节SPP1和C3信号通路在吞噬性巨噬细胞与病变成纤维细胞相互作用中的作用 | 开发了一种吸入型伊曲康唑制剂，显著提高了药物在肺组织中的积累，从而增强了治疗效果 | 研究仅在动物模型中进行，尚未进行临床试验 | 探索吸入伊曲康唑对肺纤维化的治疗效果及其分子机制 | 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 298 | 2024-11-29 |
Integration of single-cell sequencing and drug sensitivity profiling reveals an 11-gene prognostic model for liver cancer
2024-Nov-25, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00698-2
PMID:39587687
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和药物敏感性分析，构建了一个11基因的肝癌预后模型 | 首次基于单细胞测序数据构建了肝癌的11基因预后模型，并结合药物敏感性分析识别了高风险患者的潜在治疗药物 | 研究仅使用了TCGA-LIHC数据集和GDSC数据库中的15个肝癌细胞系，样本量有限 | 旨在通过单细胞测序和药物敏感性分析，构建肝癌的预后模型并识别潜在治疗药物 | 肝癌患者的预后和治疗 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO模型 | 基因表达数据 | 370名肝癌患者和15个肝癌细胞系 |
| 299 | 2024-11-29 |
Stiffness-dependent LOX regulation via HIF-1 drives extracellular matrix modifications in psoriasis
2024-Nov-25, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.10.611
PMID:39603411
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研究论文 | 研究探讨了银屑病中机械力调节对疾病进展的影响，特别是通过HIF-1介导的LOX调控对细胞外基质（ECM）的重组作用 | 发现了HIF-1在机械敏感性皮肤成纤维细胞中对LOX蛋白调控的新机制，并揭示了机械力在银屑病发病机制中的潜在作用 | 研究主要集中在体外实验和scRNA-seq分析，缺乏体内实验验证 | 探讨机械力调节在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病患者的皮肤成纤维细胞和细胞外基质 | 数字病理学 | 银屑病 | 多光子二次谐波生成显微镜、scRNA-seq | NA | 图像、基因表达数据 | 银屑病患者皮肤样本及体外培养的皮肤成纤维细胞 |
| 300 | 2024-11-29 |
Integrated single-cell transcriptome and TCR profiles of hepatocellular carcinoma highlight the convergence on interferon signaling during immunotherapy
2024-Nov-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010534
PMID:39581706
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研究论文 | 研究分析了肝细胞癌患者在接受免疫检查点抑制剂联合治疗前后的单细胞转录组和T细胞受体谱，揭示了干扰素信号在免疫治疗响应中的关键作用 | 首次全面分析了肝细胞癌患者在接受免疫检查点抑制剂联合治疗前后的单细胞转录组和T细胞受体谱，揭示了干扰素信号在免疫治疗响应中的普遍收敛现象 | 研究样本量较小，仅包括7名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨免疫检查点抑制剂联合治疗对肝细胞癌患者免疫微环境的影响，寻找预测治疗响应的生物标志物 | 肝细胞癌患者的单细胞转录组和T细胞受体谱 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14个腹水样本，来自7名患者 |