单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 659 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-11-25 |
Single-cell sequencing of full-length transcripts and T-cell receptors with automated high-throughput Smart-seq3
2024-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11036-0
PMID:39574011
|
研究论文 | 开发了一种自动化高通量Smart-seq3工作流程，用于单细胞全长转录本和T细胞受体的测序 | 提出了自动化高通量Smart-seq3工作流程，显著提高了细胞捕获效率、基因检测灵敏度和T细胞受体重建的准确性 | NA | 开发和优化单细胞测序技术，以提高数据质量和细胞异质性解析能力 | 人类初级CD4+ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录本 | 人类初级CD4+ T细胞 |
| 282 | 2024-11-25 |
High content of nuclei-free low-quality cells in reference single-cell atlases: a call for more stringent quality control using nuclear fraction
2024-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-11015-5
PMID:39574015
|
研究论文 | 本文探讨了现有单细胞RNA测序数据集中存在的低质量细胞污染问题，并呼吁采用更严格的质控标准 | 提出了将细胞内含子分数或MALAT1表达纳入质控标准，以提高细胞图谱数据的可靠性 | 未详细描述具体实施这些质控标准的步骤和方法 | 揭示现有单细胞RNA测序数据集中的低质量细胞污染问题，并提出改进建议 | 人类细胞图谱、Tabula Sapiens和Tabula Muris等大型单细胞RNA测序数据集 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多个组织和器官的数据集 |
| 283 | 2024-11-25 |
Wnt 3a-Modified Scaffolds Improve Nerve Regeneration by Boosting Schwann Cell Function
2024-Nov-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c15013
PMID:39520323
|
研究论文 | 研究通过单细胞测序分析探讨了Wnt信号通路和施万细胞在周围神经再生中的作用，并开发了一种含有Wnt3a蛋白的聚己内酯电纺纤维支架，用于改善大鼠坐骨神经缺损模型的神经修复效果 | 首次将Wnt3a蛋白整合到聚己内酯电纺纤维支架中，显著提高了神经修复效果和施万细胞的功能 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类中验证其有效性 | 探讨Wnt信号通路和施万细胞在周围神经再生中的作用，并开发新型神经修复支架 | 施万细胞、Wnt信号通路、周围神经再生 | 生物医学工程 | NA | 单细胞测序分析、电纺技术 | NA | 单细胞数据 | 大鼠坐骨神经缺损模型 |
| 284 | 2024-11-25 |
The establishment of the anther somatic niche with single-cell sequencing
2024-Nov-14, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.11.004
PMID:39547468
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了玉米花药的体细胞微环境发育过程 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了玉米花药体细胞类型的发育轨迹，并鉴定了先前未知的体细胞类型的潜在标记基因 | NA | 研究玉米花药体细胞微环境的发育过程及其基因表达特征 | 玉米花药的体细胞类型及其发育轨迹 | 植物科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 285 | 2024-11-25 |
PPARγ-dependent remodeling of translational machinery in adipose progenitors is impaired in obesity
2024-Nov-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114945
PMID:39579770
|
研究论文 | 研究探讨了PPARγ激动剂在肥胖小鼠中对脂肪前体细胞转录重塑的影响 | 发现PPARγ激动剂通过调节核糖体因子表达促进肥胖小鼠脂肪组织可塑性 | 研究仅限于肥胖小鼠模型，未探讨人类中的应用 | 探讨PPARγ激动剂在肥胖状态下对脂肪组织可塑性的影响 | 肥胖小鼠的脂肪组织和前体细胞 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序、多聚核糖体分析 | NA | RNA | 肥胖小鼠的腹股沟和附睾脂肪组织样本 |
| 286 | 2024-11-25 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
|
研究论文 | 本文详细描述了人类胚胎肢体在空间和时间上的发育过程 | 首次使用单细胞和空间转录组学技术全面解析人类胚胎肢体发育过程，并发现了新的细胞群体和肌肉发育的两个波次 | 研究主要集中在胚胎肢体发育，未涉及其他器官或组织的发育 | 深入了解人类胚胎肢体发育的基因表达调控机制 | 人类胚胎肢体细胞及其发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个解剖连续的空间转录组样本和鼠胚胎肢体样本 |
| 287 | 2024-11-24 |
Global identification of mammalian host and nested gene pairs reveal tissue-specific transcriptional interplay
2024-Nov-22, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279430.124
PMID:39578100
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研究论文 | 本文提供了小鼠和人类中宿主/嵌套基因对的最新目录，揭示了组织特异性的转录相互作用 | 首次全面注释了小鼠和人类中宿主/嵌套基因对的位置及其表达模式，发现转录共现通常是组织特异性的 | NA | 研究宿主/嵌套基因对的转录相互作用及其在不同组织中的表达模式 | 小鼠和人类的宿主/嵌套基因对 | 基因组学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因序列 | 小鼠和人类样本 |
| 288 | 2024-11-24 |
EfficientNet-resDDSC: A Hybrid Deep Learning Model Integrating Residual Blocks and Dilated Convolutions for Inferring Gene Causality in Single-Cell Data
2024-Nov-22, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00667-2
PMID:39578307
|
研究论文 | 提出了一种名为EfficientNet-resDDSC的混合深度学习模型，用于推断单细胞数据中的基因因果关系 | 模型结合了残差块和扩张卷积，能够在不增加计算负担的情况下扩展模型的感受野，从而更全面地揭示高维高噪声单细胞数据中不同基因之间的潜在关系 | NA | 推断基因因果关系，构建基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的基因 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | EfficientNet-resDDSC | 基因数据 | 涉及四个数据集和乳腺癌患者的基因调控网络构建 |
| 289 | 2024-11-24 |
Inference and analysis of cell-cell communication of non-myeloid circulating cells in late sepsis based on single-cell RNA-seq
2024-Nov-22, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12109
PMID:39578684
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症中非髓系循环细胞间的细胞间通讯 | 揭示了脓毒症患者中细胞间相互作用的增加及其在常规树突状细胞和浆细胞样树突状细胞中的显著变化 | NA | 深入了解晚期脓毒症中免疫功能障碍的潜在机制 | 淋巴系来源的白细胞间的细胞间通讯 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 290 | 2024-11-24 |
Macrophage depletion in inflamed rat knees prevents the activation of synovial mesenchymal stem cells by weakening Nampt and Spp1 signaling
2024-Nov-20, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00361-2
PMID:39563425
|
研究论文 | 研究探讨了在炎症状态下，通过清除巨噬细胞来抑制滑膜间充质干细胞的激活 | 首次揭示了巨噬细胞通过Nampt和Spp1信号通路调控滑膜间充质干细胞的激活 | 研究仅在急性炎症模型中进行，未探讨慢性炎症情况下的效果 | 探究巨噬细胞在炎症和组织再生中的作用及其与滑膜间充质干细胞的相互作用 | 滑膜间充质干细胞和巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及大鼠膝关节样本，具体数量未明确提及 |
| 291 | 2024-11-24 |
Divergent WNT signaling and drug sensitivity profiles within hepatoblastoma tumors and organoids
2024-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52757-w
PMID:39567475
|
研究论文 | 研究分析了肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官的分子异质性和药物敏感性 | 通过单细胞RNA测序/ATAC测序、空间转录组学和高通量药物筛选，揭示了肝母细胞瘤中两种不同的肿瘤上皮特征及其药物敏感性 | NA | 研究肝母细胞瘤的分子异质性和药物敏感性，以开发靶向疗法 | 肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序/ATAC测序、空间转录组学、高通量药物筛选 | NA | 基因表达数据 | 肝母细胞瘤及其肿瘤衍生类器官 |
| 292 | 2024-11-24 |
A developmental biliary lineage program cooperates with Wnt activation to promote cell proliferation in hepatoblastoma
2024-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53802-4
PMID:39567523
|
研究论文 | 研究使用组织学引导和空间转录组学技术，分析了肝母细胞瘤中胚胎胆道谱系程序与Wnt激活的相互作用，揭示了非遗传机制对肿瘤进化的影响 | 揭示了胚胎胆道谱系程序与Wnt/β-catenin信号通路的合作，通过FGF19作为旁分泌生长信号促进肿瘤细胞增殖的机制 | NA | 探讨肝母细胞瘤中胚胎胆道谱系程序与Wnt激活的相互作用及其对肿瘤细胞增殖的影响 | 肝母细胞瘤 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 患者来源的肿瘤细胞 |
| 293 | 2024-11-24 |
Pulrodemstat, a selective inhibitor of KDM1A, suppresses head and neck squamous cell carcinoma growth by triggering apoptosis
2024-Nov-20, BMC pharmacology & toxicology
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40360-024-00807-w
PMID:39567962
|
研究论文 | 研究了一种名为Pulrodemstat的选择性KDM1A抑制剂，通过触发凋亡来抑制头颈鳞状细胞癌的生长 | Pulrodemstat在临床试验中显示出比传统化疗药物5-Fu更强的抗肿瘤活性，并且对正常细胞无毒性 | NA | 寻找更精确和有效的头颈鳞状细胞癌治疗方案 | 头颈鳞状细胞癌 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 高通量筛选、单细胞测序、CCK-8检测、流式细胞术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 294 | 2024-11-24 |
KanCell: dissecting cellular heterogeneity in biological tissues through integrated single-cell and spatial transcriptomics
2024-Nov-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.009
PMID:39577768
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研究论文 | KanCell模型通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，增强细胞异质性分析 | KanCell模型基于Kolmogorov-Arnold网络，能够有效捕捉非线性关系并优化计算效率，提供了一种准确且高效的空间转录组学分析工具 | NA | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，增强细胞异质性分析 | 人类淋巴结、心脏、黑色素瘤、乳腺癌、前额叶皮层和鼠胚脑等组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST） | Kolmogorov-Arnold网络（KAN） | 基因表达数据 | 涉及多种技术和组织的模拟和真实数据集 |
| 295 | 2024-11-24 |
TNFR2 blockade promotes antitumoral immune response in PDAC by targeting activated Treg and reducing T cell exhaustion
2024-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008898
PMID:39562007
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研究论文 | 研究通过阻断TNFR2受体来增强胰腺导管腺癌（PDAC）的抗肿瘤免疫反应 | 提出了一种新的治疗策略，即结合CD40激动剂和TNFR2拮抗剂来治疗PDAC | 单独使用TNFR2阻断剂对CD8+ T细胞的激活效果有限，肿瘤生长抑制效果不显著 | 探讨TNFR2阻断剂在PDAC中的抗肿瘤免疫反应机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者和免疫活性小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞分析数据 | 24名PDAC患者和免疫活性小鼠模型 |
| 296 | 2024-11-24 |
Prediction of single-cell RNA expression profiles in live cells by Raman microscopy with Raman2RNA
2024-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-02082-2
PMID:38200118
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Raman2RNA的方法，通过拉曼显微镜图像预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | Raman2RNA方法通过无标记的超光谱拉曼显微镜图像和领域翻译技术，实现了对活细胞中单细胞RNA表达谱的非破坏性预测 | NA | 开发一种非破坏性的方法来预测活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 活细胞中的单细胞RNA表达谱 | 数字病理学 | NA | 拉曼显微镜 | 对抗自编码器 | 图像 | 涉及小鼠成纤维细胞和胚胎干细胞的活细胞追踪 |
| 297 | 2024-11-24 |
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-Nov, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03911-3
PMID:38886331
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值 | 揭示了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌进展中的重要作用，特别是BRAF V600E突变与侵袭性特征的关联 | NA | 探讨BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后意义 | 甲状腺乳头状癌患者中的BRAF和RAS突变 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 甲状腺乳头状癌和正常样本 |
| 298 | 2024-11-24 |
Transcriptomics of Human Brain Tissue in Parkinson's Disease: a Comparison of Bulk and Single-cell RNA Sequencing
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04124-5
PMID:38578357
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综述 | 本文综述了利用RNA测序技术研究帕金森病（PD）的文献，特别是比较了批量RNA测序和单细胞RNA测序的结果 | 本文通过整合批量和单细胞RNA测序的结果，展示了这两种技术在揭示神经退行性疾病转录变化方面的互补性 | 本文主要基于文献综述，未提供新的实验数据 | 评估批量和单细胞RNA测序技术在研究帕金森病中的兼容性和互补性 | 帕金森病患者的人脑组织 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 299 | 2024-11-24 |
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing Research for Neurological Diseases
2024-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04126-3
PMID:38564138
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综述 | 本文详细介绍了单细胞RNA测序技术，并总结了其在神经系统疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术不仅识别了多种细胞类型和反应状态，还揭示了细胞特异性基因表达变化、基因调控网络、细胞间通讯和细胞运动轨迹等 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在神经系统疾病研究中的应用，揭示疾病的具体机制，并为新的治疗策略提供依据 | 神经系统疾病及其相关细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 300 | 2024-11-24 |
Targeting METTL3 as a checkpoint to enhance T cells for tumour immunotherapy
2024-Nov, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70089
PMID:39568154
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研究论文 | 本文研究了通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | 首次探讨了m6A在调节T细胞功能和增强抗肿瘤免疫中的作用，并发现靶向METTL3可以增强肿瘤细胞的免疫原性和T细胞功能 | NA | 探索通过靶向METTL3增强T细胞功能以提高肿瘤免疫疗法的效果 | METTL3抑制剂STM2457对肿瘤细胞和T细胞功能的影响 | 肿瘤学 | NA | RNA测序 (RNA-seq)，单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，CRISPR Cas9 | NA | RNA | 多种癌细胞系，小鼠黑色素瘤 (B16) 和小鼠结直肠腺癌 (MC38) 模型，人黑色素瘤模型 (A375) 和人T细胞 |