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当前共找到 578 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-12-18 |
Machine Learning Integration with Single-Cell Transcriptome Sequencing Datasets Reveals the Impact of Tumor-Associated Neutrophils on the Immune Microenvironment and Immunotherapy Outcomes in Gastric Cancer
2024-Nov-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312715
PMID:39684426
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习与单细胞转录组测序数据，揭示了肿瘤相关中性粒细胞在胃癌免疫微环境和免疫治疗结果中的影响 | 首次通过大规模单细胞RNA测序数据分析，识别出与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的肿瘤相关中性粒细胞亚群，并构建了预测患者生存的风险评分模型 | 研究仅限于胃癌、结直肠癌和肺癌的数据，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨肿瘤相关中性粒细胞在胃癌免疫微环境和免疫治疗结果中的作用 | 胃癌、结直肠癌和肺癌中的肿瘤相关中性粒细胞及其对免疫检查点抑制剂的反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 转录组数据 | 超过600,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-12-18 |
Decoding Chemotherapy Resistance of Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma at the Single Cell Resolution: A Case Report
2024-Nov-26, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13237176
PMID:39685635
|
病例报告 | 本研究描述了一例对化疗产生抗性的未分化多形性肉瘤（UPS）的单细胞转录组特征 | 首次描述了对两线化疗产生抗性的UPS的单细胞转录组，展示了肿瘤细胞和肿瘤微环境（TME）亚群中的基因表达，这些可能是个性化癌症治疗的潜在标志物 | 本研究仅基于单一病例，样本量较小，可能无法代表所有UPS病例 | 研究对化疗产生抗性的UPS的细胞组成和转录组特征 | 未分化多形性肉瘤（UPS）的肿瘤细胞和肿瘤微环境（TME） | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1例58岁女性患者的UPS样本 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-12-18 |
Flow Cytometry Analyses of Meningioma Immune Cell Composition Using a Short, Optimized Digestion Protocol
2024-Nov-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16233942
PMID:39682129
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研究论文 | 本研究优化了一种快速消化脑膜瘤组织以生成单细胞悬液的协议，并通过流式细胞术分析了浸润的免疫细胞组成 | 提出了一个优化的短时间消化协议，能够快速生成可行的单细胞悬液，并揭示了脑膜瘤中浸润的抗原呈递细胞和淋巴细胞 | 研究仅基于两个患者样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 优化脑膜瘤组织的消化协议，并研究浸润的免疫细胞组成，以探索新的非手术治疗选择 | 脑膜瘤组织中的浸润免疫细胞 | NA | 脑膜瘤 | 流式细胞术 | NA | 细胞 | 两个患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-12-18 |
OVsignGenes: A Gene Expression-Based Neural Network Model Estimated Molecular Subtype of High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2024-Nov-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16233951
PMID:39682139
|
研究论文 | 本文开发了一种基于基因表达数据的神经网络模型OVsignGenes，用于预测高级别浆液性卵巢癌的分子亚型 | 本文首次提出了一个基于深度神经网络的模型OVsignGenes，能够抵抗平台效应，并在测试数据集上表现出高准确性 | 本文仅基于已有的基因表达数据进行分析，未涉及其他类型的数据或实验验证 | 开发一种能够准确预测高级别浆液性卵巢癌分子亚型的模型，以支持个性化医疗和靶向治疗的发展 | 高级别浆液性卵巢癌的分子亚型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | 神经网络 | 基因表达数据 | 535个样本，包括60个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-12-18 |
scPAS: single-cell phenotype-associated subpopulation identifier
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae655
PMID:39681325
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scPAS的新型生物信息学工具，用于整合批量数据以识别单细胞数据中与表型相关的细胞亚群 | scPAS通过网络正则化的稀疏回归模型量化单细胞数据中每个细胞与表型之间的关联，并通过排列检验估计这些关联的显著性，从而识别与表型相关的细胞亚群 | NA | 开发一种新的工具来识别单细胞数据中与疾病表型相关的细胞亚群 | 单细胞数据中的细胞亚群与疾病表型的关联 | 生物信息学 | 乳腺癌、卵巢癌、动脉粥样硬化 | 单细胞测序分析 | 稀疏回归模型 | 单细胞数据、空间转录组数据 | 模拟数据和来自乳腺癌、卵巢癌、动脉粥样硬化的各种单细胞数据集，以及来自多种癌症的空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-12-17 |
Inferring single-cell resolution spatial gene expression via fusing spot-based spatial transcriptomics, location, and histology using GCN
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae630
PMID:39656774
|
研究论文 | 提出了一种基于Vision Transformer和图卷积网络的多模态信息融合方法scstGCN，用于推断单细胞分辨率的空间基因表达 | scstGCN通过融合组织学图像、基于spot的空间转录组数据和空间位置信息，实现了单细胞水平的空间基因表达超分辨率推断 | NA | 提高空间转录组技术的分辨率，以更准确地推断基因表达水平 | 不同组织类型的空间转录组数据，包括疾病和健康样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络（GCN） | 图像和文本 | 多种组织的ST数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-10-09 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing reveals the important role of Dcaf17 in spermatogenesis of golden hamsters
2024-Nov-11, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae144
PMID:39376075
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-12-16 |
Impact of Mitophagy-Related Genes on the Diagnosis and Development of Esophageal Squamous Cell Carcinoma via Single-Cell RNA-seq Analysis and Machine Learning Algorithms
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07052
PMID:39344350
|
研究论文 | 研究探讨了自噬相关基因在食管鳞状细胞癌诊断和预后中的作用，通过单细胞RNA测序和机器学习算法构建预测模型 | 首次通过单细胞RNA测序和机器学习算法构建了基于自噬相关基因的食管鳞状细胞癌预测模型，并验证了PYCARD基因在其中的关键作用 | 研究主要基于基因数据和机器学习模型，未涉及临床试验验证 | 探讨自噬相关基因在食管鳞状细胞癌诊断和预后中的作用，提供新的治疗策略 | 食管鳞状细胞癌及其自噬相关基因 | 机器学习 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因数据 | 169个自噬相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-12-14 |
Single-cell transcriptomics: a new frontier in plant biotechnology research
2024-Nov-25, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03383-9
PMID:39585480
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在植物生物技术研究中的最新进展及其对植物发育理解的深远影响 | 单细胞转录组技术提供了前所未有的细胞分辨率，揭示了复杂的细胞过程和发育途径 | 单细胞转录组技术在植物研究中面临样本准备、细胞分离、数据复杂性和计算分析等挑战 | 探讨单细胞转录组技术在植物生物技术中的应用及其未来发展前景 | 植物细胞的基因表达、发育过程和环境响应 | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-12-14 |
Expression of Anoikis-Related Genes and Potential Biomarkers in Colon Cancer Based on RNA-seq and scRNA-seq
2024-Nov, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-04957-9
PMID:38727936
|
研究论文 | 本研究整合了结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据，评估了患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型 | 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估了结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型 | 研究仅基于现有数据集，未进行体外或体内实验验证 | 通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建结肠癌风险模型 | 结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 结肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-12-13 |
Mutual information for detecting multi-class biomarkers when integrating multiple bulk or single-cell transcriptomic studies
2024-Nov-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae696
PMID:39563471
|
研究论文 | 本文提出了一种基于互信息的统计框架MICA，用于在整合多个bulk或单细胞转录组学研究时检测多类生物标志物 | 本文的创新点在于提出了一种新的统计框架MICA，通过互信息从信息论的角度检测具有一致多类表达模式的生物标志物，适用于多类设计的研究 | 本文的局限性在于主要集中在转录组学数据上，未涵盖其他类型的组学数据 | 本文的研究目的是开发一种新的方法，用于在整合多个转录组学研究时检测多类生物标志物 | 本文的研究对象是多类设计的转录组学研究中的生物标志物 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 包括小鼠代谢相关转录组研究的四个组织和三种雌激素治疗表达谱的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-12-12 |
From fallopian tube epithelium to high-grade serous ovarian cancer: A single-cell resolution review of sex steroid hormone signaling
2024-Nov, Progress in lipid research
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.plipres.2024.101302
PMID:39396711
|
综述 | 本文探讨了从输卵管上皮到高级别浆液性卵巢癌的性类固醇激素信号传导的分子机制 | 提供了性类固醇受体、类固醇生成和类固醇代谢酶的综合基因表达图谱，揭示了不同细胞群体在卵巢癌发生中的作用 | NA | 探讨高级别浆液性卵巢癌的早期分子机制及其预防和早期检测策略 | 输卵管上皮细胞和高级别浆液性卵巢癌 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-12-12 |
scGRN-Entropy: Inferring cell differentiation trajectories using single-cell data and gene regulation network-based transfer entropy
2024-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012638
PMID:39585902
|
研究论文 | 提出了一种新的方法scGRN-Entropy，用于从单细胞RNA测序数据中推断细胞分化轨迹和伪时间 | 通过整合基因调控网络的动态变化，提高了细胞分化轨迹推断的准确性 | NA | 研究细胞分化过程，揭示疾病（如癌症）的内在机制，并推动治疗和精准医学的发展 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 最小生成树算法 | 基因表达数据 | 八个不同的真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-12-11 |
Key Regulatory Elements of the TGFβ-LRRC15 Axis Predict Disease Progression and Immunotherapy Resistance Across Cancer Types
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.22.624939
PMID:39651139
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研究论文 | 本文研究了TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件，揭示其在不同癌症类型中预测疾病进展和免疫治疗抵抗的潜力 | 本文通过结合功能性化合物筛选和单细胞RNA测序，揭示了调控TGFβ增加LRRC15表达的关键基因特征，并验证了这些基因在预测免疫治疗反应中的潜力 | 本文主要基于细胞模型进行验证，尚未在临床试验中验证其效果 | 揭示TGFβ-LRRC15轴的关键调控元件，并探索其在个性化免疫治疗中的应用 | TGFβ-LRRC15轴的关键调控基因及其在癌症进展和免疫治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | 细胞模型 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-12-11 |
An estrogen receptor signaling transcriptional program linked to immune evasion in human hormone receptor-positive breast cancer
2024-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.23.619172
PMID:39651157
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研究论文 | 本文研究了雌激素受体信号传导程序与激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的关系 | 首次定义并研究了与雌激素受体信号传导（ERS）和免疫信号相关的基因模块，揭示了ERS与T细胞浸润减少的潜在机制 | 研究主要基于批量和单细胞转录组数据，缺乏功能验证实验 | 探讨雌激素受体信号传导在激素受体阳性乳腺癌中免疫逃避的机制 | 激素受体阳性乳腺癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序，多重免疫荧光 | NA | 转录组数据，免疫荧光图像 | 来自多个临床来源的乳腺癌组织和人类细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-12-11 |
Prenatal p25-activated Cdk5 induces pituitary tumorigenesis through MCM2 phosphorylation-mediated cell proliferation
2024-11, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101054
PMID:39366214
|
研究论文 | 研究揭示了产前p25激活的Cdk5通过MCM2磷酸化介导的细胞增殖诱导垂体肿瘤发生 | 首次揭示了Cdk5和Mcm2在垂体腺瘤肿瘤发生中的新作用，并提供了一种新的中间叶来源的垂体腺瘤小鼠模型 | NA | 探讨Cdk5在垂体肿瘤发生中的作用及其机制 | Cdk5、Mcm2以及中间叶来源的垂体肿瘤 | NA | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型和293T细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-12-10 |
The Risk Genes S1PR5, CMC1, and ASAH1 as Potential Targets for the Diagnosis, Immunotherapy, and Treatment of Colon Adenocarcinoma by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Analysis
2024-11-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据构建了一个新的免疫细胞功能风险模型，用于预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次提出了S1PR5、CMC1和ASAH1作为结肠腺癌的新型治疗靶点，并通过单细胞和批量RNA测序数据验证了其潜在的临床应用价值 | 本研究仅在特定的数据集和临床队列中验证了模型的有效性，未来需要在更多独立队列中进行验证 | 开发新的风险模型以预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果，并发现新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Lasso回归分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumour Immune Single Cell Hub数据库的COAD单细胞数据集GSE146771，并在多个独立队列中进行了验证 | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-12-09 |
IFN-γ-induced Th1-Treg polarization in inflamed brains limits exacerbation of experimental autoimmune encephalomyelitis
2024-Nov-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401692121
PMID:39560646
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研究论文 | 研究探讨了IFN-γ在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中诱导Th1-Treg极化的作用 | 首次揭示了IFN-γ在EAE中诱导Tregs向Th1-Tregs极化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类疾病 | 探讨IFN-γ在EAE中的作用及其对Tregs极化的影响 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的Tregs和IFN-γ | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-12-09 |
Definition of regulatory elements and transcription factors controlling porcine immune cell gene expression at single cell resolution using single nucleus ATAC-seq
2024-Nov, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110944
PMID:39326643
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研究论文 | 研究使用单核ATAC测序技术定义了猪免疫细胞基因表达调控元件和转录因子 | 首次在单细胞分辨率下研究猪外周血单核细胞的染色质开放景观，并识别了调控元件和转录因子 | 研究仅限于猪的外周血单核细胞，未涵盖其他细胞类型或物种 | 揭示猪免疫细胞基因表达的顺式调控机制 | 猪外周血单核细胞的染色质开放景观和转录因子 | 基因组学 | NA | 单核ATAC测序（snATAC-seq） | NA | 基因组数据 | 猪外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-12-09 |
Methionine restriction reduced growth performance and exacerbated lipid deposition in hybrid grouper (Epinephelus fuscoguttatus ♀ × E. lanceolatus ♂) under high-lipid diets by suppressing the lipid degradation pathways with the single-cell RNA-seq analysis
2024-Nov, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110960
PMID:39536957
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研究论文 | 研究了在高脂饮食下，甲硫氨酸限制对杂交石斑鱼（Epinephelus fuscoguttatus ♀ × ♂ E. lanceolatus）肝脏中脂质沉积的影响 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了甲硫氨酸限制抑制脂质降解途径，导致脂质沉积增加 | NA | 探讨甲硫氨酸限制对杂交石斑鱼在高脂饮食下生长性能和脂质沉积的影响 | 杂交石斑鱼（Epinephelus fuscoguttatus ♀ × ♂ E. lanceolatus）的肝脏 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及九种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |