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当前共找到 579 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-11-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
PMID:39173624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析年轻与年老小鼠嗅觉上皮，揭示衰老过程中的细胞和分子变化 | 首次在单细胞分辨率下系统绘制哺乳动物嗅觉上皮衰老的转录组图谱，识别了21种细胞类型中的衰老相关差异表达基因 | 研究仅限于小鼠模型，人类嗅觉上皮衰老可能存在物种特异性差异 | 探究哺乳动物嗅觉上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和年老小鼠的嗅觉上皮组织 | 单细胞组学 | 衰老相关嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老小鼠嗅觉上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-06 |
Long-Term Follow-up of Levonorgestrel Intrauterine Device for Atypical Hyperplasia and Early Endometrial Cancer Reveals Relapse Characterized by Immune Exhaustion
2024-Nov-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0362
PMID:38922360
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研究论文 | 评估左炔诺孕酮宫内节育器治疗子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌的长期随访结果及复发机制 | 首次使用空间转录组学分析LIUD治疗过程中免疫微环境变化，揭示复发与免疫耗竭相关 | 样本量较小（仅5例患者的纵向活检），需更大规模研究验证 | 探索LIUD治疗AH/G1EEC的长期疗效及复发机制 | 子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学, 数字空间分析, 细胞类型反卷积分析 | MCP-counter分析 | 组织活检样本 | 43例初始响应患者（其中41例有随访数据），5例患者纵向活检 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMX数字空间分析系统 | Nanostring GeoMX数字空间分析 |
| 243 | 2025-10-06 |
Endoluminal Biopsy for Vein of Galen Malformation
2024-Nov-01, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1227/neu.0000000000002986
PMID:38747605
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研究论文 | 本研究通过血管内组织采样技术对Galen静脉畸形病变进行原位分析，探索其遗传学和发病机制 | 首次在常规血管内治疗过程中通过线圈获取VOGM原位内皮细胞进行单细胞RNA测序分析 | 样本量较小（6名患者），需要更大规模研究验证发现 | 开发VOGM分子遗传学分类系统并探索个性化治疗策略 | Galen静脉畸形患者的内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 脑血管畸形 | 单细胞RNA测序，遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据，DNA序列数据 | 6名患者（年龄12天至约6岁），10次ETS操作 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-06 |
Monocyte Invasion into the Retina Restricts the Regeneration of Neurons from Müller Glia
2024-Nov-13, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0938-24.2024
PMID:39353729
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研究论文 | 本研究揭示外周免疫系统中的单核细胞通过浸润受损视网膜并分泌骨桥蛋白抑制Müller胶质细胞的神经再生能力 | 首次发现外周免疫系统（单核细胞）是中枢神经系统再生的屏障，并鉴定出骨桥蛋白是抑制神经再生的关键细胞因子 | 研究主要基于小鼠模型，在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探索限制哺乳动物视网膜神经元再生的机制 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和浸润的单核细胞 | 神经再生 | 视网膜疾病 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | CCR2基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 不同性别的CCR2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-07 |
Lamination-based organoid spatially resolved transcriptomics technique for primary lung and liver organoid characterization
2024-Nov-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2408939121
PMID:39514315
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研究论文 | 本研究开发了一种基于层压的类器官空间转录组技术，用于表征原代肺和肝脏类器官 | 开发了新型层压式类器官空间转录组技术，解决了传统切片方法不适用于原代组织来源类器官的技术难题 | 技术尚未在其他类型类器官中验证，且依赖于自制层压设备 | 开发适用于原代组织来源类器官的空间转录组表征方法 | 原代小鼠肺和肝脏来源的类器官 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，液滴工程方法，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 小鼠肺和肝脏类器官 | NA | 空间转录组学 | 自制层压设备 | 基于重量压缩的自制层压装置，液滴工程方法制备类器官 |
| 246 | 2025-05-07 |
Cell-type deconvolution for bulk RNA-seq data using single-cell reference: a comparative analysis and recommendation guideline
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf031
PMID:39899596
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研究论文 | 本文通过系统评估九种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，提出了在不同场景下选择合适方法的推荐指南 | 首次系统比较了多种基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法，并提出了实用推荐指南 | 研究仅评估了九种方法，可能未涵盖所有现有方法 | 评估和比较基于单细胞RNA测序数据的反卷积方法在组织细胞类型比例估计中的准确性和鲁棒性 | 九种反卷积方法和五组单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 五组单细胞RNA测序数据集和真实批量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2025-10-07 |
Deciphering cell states and the cellular ecosystem to improve risk stratification in acute myeloid leukemia
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf028
PMID:39865982
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研究论文 | 通过构建急性髓系白血病单细胞转录组图谱和开发sciNMF工作流程，系统解析细胞异质性并建立ACE特征以改善预后预测 | 提出了sciNMF工作流程识别26种白血病和免疫细胞状态，首次定义了AML细胞生态系统(ACE)概念并开发了12基因特征(ACEsig) | 研究基于单细胞转录组数据，需要进一步验证其在更广泛临床场景中的应用效果 | 改善急性髓系白血病的风险分层策略 | 急性髓系白血病患者的白血病细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量，但包含公共RNA-seq队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2025-10-07 |
Salmonella dry surface biofilm: morphology, single-cell landscape, and sanitization
2024-Nov-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01623-24
PMID:39494899
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研究论文 | 本研究比较了鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜的形成特征，并通过单细胞转录组学分析其功能异质性，最后评估了黄酮类化合物与异丙醇联合使用的消毒效果 | 首次全面研究干表面生物膜的特性并探索其潜在生存机制，提出溶解于70%异丙醇的桑色素作为高效干式消毒剂 | 研究仅针对鼠伤寒沙门氏菌，未涉及其他食源性病原体 | 探究干表面生物膜的形成特征、功能异质性及消毒方法 | 鼠伤寒沙门氏菌干表面生物膜和湿表面生物膜 | 微生物学 | 食源性疾病 | 共聚焦激光扫描显微镜,电子显微镜,单细胞转录组学 | NA | 显微镜图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-07 |
CRISPR Screening of Transcribed Super-Enhancers Identifies Drivers of Triple-Negative Breast Cancer Progression
2024-Nov-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3995
PMID:39186674
|
研究论文 | 通过CRISPR筛选技术鉴定三阴性乳腺癌进展的关键调控元件 | 首次系统分析三阴性乳腺癌特异性超级增强子及其eRNA转录本，结合CRISPR干扰和染色质互作图谱揭示调控机制 | 研究聚焦于前30个eRNA产生的超级增强子，可能未覆盖所有相关调控元件 | 揭示三阴性乳腺癌中超级增强子驱动的基因调控网络 | 三阴性乳腺癌细胞系和动物模型 | 功能基因组学 | 三阴性乳腺癌 | CRISPR干扰筛选,RNA测序,Hi-C染色质构象捕获,单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | 基因组学数据,转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,染色质可及性测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-07 |
scMMAE: masked cross-attention network for single-cell multimodal omics fusion to enhance unimodal omics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf010
PMID:39851073
|
研究论文 | 提出一种基于掩码自编码器和交叉注意力机制的单细胞多组学融合框架scMMAE，用于增强单组学分析 | 首次将掩码自编码器与交叉注意力机制结合用于单细胞多组学融合，同时捕获共享特征和独特信息，并能将知识迁移到单组学分析 | NA | 开发单细胞多组学融合方法以增强单组学数据分析 | 单细胞转录组学和蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 掩码自编码器, 交叉注意力网络 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-07 |
Complex hierarchical structures analysis in single-cell data with Poincaré deep manifold transformation
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae687
PMID:39851075
|
研究论文 | 提出一种名为PoincaréDMT的新方法，用于分析单细胞RNA测序数据中的复杂层次结构 | 通过双曲庞加莱圆盘映射保留全局结构，结合数据增强实现局部结构校正，并整合批次图减轻批次效应 | NA | 解决单细胞数据分析中结构保留不完整和嵌入高失真问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度流形变换 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Explainable deep neural networks for predicting sample phenotypes from single-cell transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae673
PMID:39814561
|
研究论文 | 开发了一个名为singleDeep的端到端流程，利用深度神经网络分析单细胞转录组数据以预测样本表型 | 提出了首个专门针对单细胞RNA测序数据的端到端深度神经网络分析流程，能够同时提供表型预测和基因重要性解释 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的可扩展性以及计算资源需求 | 开发能够有效分析单细胞转录组数据并预测样本表型的深度学习方法 | 系统性红斑狼疮、阿尔茨海默病和COVID-19患者的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 自身免疫疾病,神经退行性疾病,传染病 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
scGO: interpretable deep neural network for cell status annotation and disease diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf018
PMID:39820437
|
研究论文 | 提出一种基于基因本体的可解释深度学习框架scGO，用于单细胞RNA测序数据的细胞状态注释和疾病诊断 | 利用稀疏神经网络整合基因、转录因子和GO术语之间的内在生物学关系，显著增强模型可解释性并降低计算成本 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发可解释的深度学习模型用于细胞状态注释和疾病诊断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习、稀疏神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2025-10-07 |
Supervised analysis of alternative polyadenylation from single-cell and spatial transcriptomics data with spvAPA
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae720
PMID:39799000
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研究论文 | 提出了一种用于单细胞和空间转录组数据中可变多聚腺苷酸化分析的监督分析框架spvAPA | 开发了首个专门针对单细胞和空间转录组APA数据的监督分析框架，整合了基因表达和APA双模态数据 | 未明确说明方法在特定数据类型或实验条件下的潜在限制 | 开发专门针对单细胞和空间转录组数据中可变多聚腺苷酸化分析的计算方法 | 单细胞和空间转录组数据中的可变多聚腺苷酸化特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 加权最近邻算法, 稀疏偏最小二乘判别分析 | 基因表达数据, APA数据 | 九个单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Integrating scRNA-seq and scATAC-seq with inter-type attention heterogeneous graph neural networks
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae711
PMID:39800872
|
研究论文 | 提出一种名为scMI的异构图嵌入方法，通过跨模态注意力机制整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 | 设计了跨类型注意力机制来有效捕获基因与染色质可及性区域之间的长程跨模态相互作用，不依赖motif数据库 | 未明确说明方法在特定细胞类型或疾病背景下的适用性限制 | 开发单细胞多组学数据整合方法，改善跨模态关系学习 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 异构图神经网络, 注意力机制 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
Deep learning in integrating spatial transcriptomics with other modalities
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae719
PMID:39800876
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综述 | 系统回顾深度学习在整合空间转录组学与其他模态数据中的应用 | 首次系统综述深度学习整合空间转录组学与多模态数据的方法，提出分类框架并总结整合策略 | 作为综述文章，不包含原始实验验证 | 促进开发更全面利用多模态信息的稳健计算方法 | 空间转录组学数据整合方法 | 机器学习 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序，组织学成像，染色质成像 | 深度学习 | 空间转录组数据，组织学图像，染色质图像，scRNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，空间多组学 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
CellMsg: graph convolutional networks for ligand-receptor-mediated cell-cell communication analysis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae716
PMID:39800874
|
研究论文 | 提出了一种基于图卷积网络的细胞间通讯分析计算框架CellMsg | 结合配体-受体多模态特征和图卷积网络识别高可信度配体-受体相互作用，采用三点估计方法量化细胞间通讯强度 | NA | 开发计算工具解析细胞间通讯 | 细胞间通讯和配体-受体相互作用 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN) | 单细胞RNA测序数据 | 四个基准LRI数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics of IPMN Reveals Divergent Indolent and Malignant Lineages
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620810
PMID:39554015
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研究论文 | 通过空间转录组学分析胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤，揭示了惰性和恶性谱系的分化 | 首次使用数字空间RNA分析技术识别IPMN中与癌症风险相关的三种不同转录组状态 | 样本量较小(仅10个IPMN标本)，需要更大规模研究验证 | 开发改善IPMN风险分类准确性的分子诊断方法 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 数字空间RNA分析(DSP-RNA),全转录组测序 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | 10个IPMN标本，涵盖从正常导管到癌症的各级异型增生 | Illumina | 空间转录组学,全转录组测序 | Illumina测序平台 | 数字空间RNA分析(DSP-RNA)技术 |
| 259 | 2025-10-07 |
Highly neurogenic glia from human and mouse myenteric ganglia generate functional neurons following culture and transplantation into the gut
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114919
PMID:39471175
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研究论文 | 本研究开发了从人和小鼠肠肌层神经节中分离高神经源性肠神经干细胞的方法，并验证了其移植后生成功能性神经元的能力 | 首次发现肠肌层神经节内的胶质细胞亚群是具有高神经源性潜能的肠神经干细胞库，并建立了选择性分离这些细胞的新方法 | 研究主要基于动物模型和异种移植实验，人类临床应用仍需进一步验证 | 开发更有效的肠神经干细胞分离方法，用于神经肠道疾病的再生治疗 | 人和小鼠肠肌层神经节中的肠胶质细胞 | 干细胞与再生医学 | 神经肠道疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 多组学分析, 光遗传学刺激 | NA | 基因表达数据, 生理功能数据 | 人和小鼠肠道组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
Interleukin-1β modulates lymphoid differentiation of Flt3-positive multipotent progenitors after transplantation
2024-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114890
PMID:39425929
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研究论文 | 本研究揭示了IL-1β在移植后通过调节Flt3阳性多能祖细胞命运促进B淋巴细胞生成的新机制 | 首次发现IL-1β能够诱导Flt3 MPPs从髓系偏向向淋巴系偏向的细胞命运转换，并促进B淋巴细胞生成 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类系统中验证 | 探究应激环境中调控造血干细胞和祖细胞行为的因子及其机制 | 表达Flt3的小鼠多能祖细胞(MPPs) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪,克隆分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |