本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价10元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
241 | 2024-11-27 |
Predicting survival in bladder cancer with a novel apoptotic gene-related prognostic model
2024-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01575-z
PMID:39580765
|
研究论文 | 本文建立了一种基于凋亡基因的新型膀胱癌预后模型,并通过多种分析方法验证了其预测生存率和免疫治疗反应的能力 | 首次基于凋亡基因建立了膀胱癌的预后模型,并验证了其在预测生存率和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 建立并验证一种基于凋亡基因的膀胱癌预后模型,评估其在预测患者生存率和免疫治疗反应中的作用 | 膀胱癌患者的生存率和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | Cox回归分析 | mRNA表达数据 | TCGA和GEO数据库中的数据 |
242 | 2024-11-27 |
Exploring new mechanisms in cancer molecular pathways and pathogenic cell transformation: PIP4K2A as a prognostic marker and therapeutic target in cutaneous malignant melanoma
2024-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01555-3
PMID:39579298
|
研究论文 | 研究探讨了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 利用单细胞测序和机器学习技术,研究了PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | NA | 探讨PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | PIP4K2A基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达及其对T细胞介导的免疫反应的影响 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自皮肤黑色素瘤患者的样本 |
243 | 2024-11-27 |
Integration of the bulk transcriptome and single-cell transcriptome reveals efferocytosis features in lung adenocarcinoma prognosis and immunotherapy by combining deep learning
2024-Nov-23, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03571-3
PMID:39580462
|
研究论文 | 本研究整合了大量转录组和单细胞转录组数据,通过深度学习揭示了肺腺癌预后和免疫治疗中的吞噬作用特征 | 开发了一种新的与吞噬作用相关的基因预后特征,能够准确预测肺腺癌患者的生存预后和治疗效果 | NA | 研究吞噬作用在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者及其相关基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | NA | 转录组数据 | 涉及TCGA、GEO和CTRP数据库中的多个样本 |
244 | 2024-11-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment niche transitions during the invasive and metastatic processes of ground-glass nodules and part-solid nodules in lung adenocarcinoma
2024-Nov-23, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02177-7
PMID:39580469
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺腺癌中磨玻璃结节和部分实性结节在侵袭和转移过程中的免疫微环境转变 | 首次揭示了CXCL9+和TREM2+肿瘤相关巨噬细胞在不同阶段的显著富集变化,并发现GGN-LUAD在侵袭阶段表现出更强的免疫反应 | 样本量较小,仅包括8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD,可能影响结果的普适性 | 探索肺腺癌不同放射学表型的异质性及其影响肿瘤演变的关联因素 | 肺腺癌中的磨玻璃结节和部分实性结节 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8例GGN-LUAD和7例PSN-LUAD,以及4例邻近正常组织 |
245 | 2024-11-27 |
Single-cell transcriptomics unveils molecular signatures of neuronal vulnerability in a mouse model of prion disease that overlap with Alzheimer's disease
2024-Nov-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54579-2
PMID:39580485
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学研究了朊病毒感染小鼠模型中神经元的分子特征,揭示了与阿尔茨海默病重叠的神经元脆弱性 | 首次通过单细胞转录组学技术识别和表征了朊病毒易感神经元亚群,并发现了与阿尔茨海默病相关的脆弱性相关转录本 | 研究仅限于朊病毒感染的小鼠模型,未涉及其他神经退行性疾病模型 | 通过单细胞转录组学技术识别和表征朊病毒易感神经元亚群,揭示神经元脆弱性的分子机制 | 朊病毒感染的小鼠模型中的活神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 朊病毒感染的雌性小鼠的活神经元 |
246 | 2024-11-27 |
Regulation of disease-associated microglia in the optic nerve by lipoxin B4 and ocular hypertension
2024-Nov-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-024-00775-z
PMID:39568070
|
研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用,并发现其在眼压诱导的神经退行性病变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上,未来需要进一步验证在人类中的适用性 | 探讨脂氧素B4在眼压诱导的神经退行性病变中对小胶质细胞的调控作用 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼模型 |
247 | 2024-11-27 |
TARGET-seq: Linking single-cell transcriptomics of human dopaminergic neurons with their target specificity
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2410331121
PMID:39541349
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TARGET-seq的新方法,用于将人类多巴胺能神经元的单细胞转录组与其目标特异性联系起来 | 开发了TARGET-seq技术,通过AAV介导的逆行富集转录组来标记投射,从而将多巴胺能神经元的转录组与其在大脑前部的特定目标结构联系起来 | NA | 探讨不同多巴胺能神经元的分子表达谱与其特定功能或经典分类(如mesolimbic和nigrostriatal)之间的关系 | 人类多巴胺能神经元的单细胞转录组及其目标特异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
248 | 2024-11-27 |
Augmenting antitumor efficacy of Th17-derived Th1 cells through IFN-γ-induced type I interferon response network via IRF7
2024-Nov-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412120121
PMID:39541355
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了Th1细胞在肿瘤中的存在及其在肿瘤免疫治疗中的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了Th1细胞在肿瘤中的存在及其在肿瘤免疫治疗中的潜在作用,并探讨了IFN-γ通过IRF7上调I型干扰素反应网络和ECM1表达的机制 | 研究主要基于体外实验和数据分析,缺乏体内实验验证 | 探讨Th1细胞在肿瘤免疫治疗中的作用及其机制 | Th1细胞及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
249 | 2024-11-27 |
Clustering-independent estimation of cell abundances in bulk tissues using single-cell RNA-seq data
2024-Nov-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100905
PMID:39561717
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ConDecon的聚类无关方法,用于从单细胞RNA测序数据中估计批量组织中的细胞丰度 | ConDecon方法在表型分辨率和功能上相对于基于回归的方法有所改进,能够推断单细胞数据集中每个细胞在批量组织中的存在可能性,并应用于神经退行性微胶质炎症途径在儿童室管膜瘤间充质转化中的作用研究 | NA | 开发一种新的计算方法,用于从单细胞RNA测序数据中推断批量组织中的细胞组成 | 单细胞RNA测序数据和批量组织数据 | 生物信息学 | 儿童室管膜瘤 | 单细胞RNA测序 | ConDecon方法 | RNA测序数据 | NA |
250 | 2024-11-27 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2024-Nov-15, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00298-9
PMID:39548236
|
研究论文 | 研究了APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达,并探讨了GRHL3在其中的作用 | 发现APOBEC3A在终末分化细胞中表达,且需要GRHL3,而在鳞状细胞癌中,GRHL3的表达和活性扩展到DNA复制阶段的细胞,同时APOBEC3A的表达也扩展到增殖细胞 | NA | 探讨APOBEC3A和APOBEC3B在癌症中的表达及其与GRHL3的关系 | APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | RNA | 健康和恶性黏膜上皮细胞 |
251 | 2024-11-27 |
Non-coding RNAs in oral cancer: Emerging biomarkers and therapeutic frontier
2024-Nov-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40096
PMID:39583806
|
研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在口腔癌中的潜在诊断和治疗作用 | 结合空间转录组学和空间代谢组学与单细胞RNA测序,深入研究肿瘤微环境,提高诊断和治疗的精准度 | NA | 探讨非编码RNA作为口腔癌诊断和治疗工具的潜力 | 口腔癌及其相关非编码RNA | 数字病理学 | 口腔癌 | 空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
252 | 2024-11-27 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.11.566719
PMID:38014231
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Decipher的深度生成模型,用于表征偏离正常状态的细胞状态轨迹 | Decipher能够联合建模和可视化正常和扰动单细胞RNA-seq数据中的基因表达和细胞状态,揭示共享和破坏的动力学 | NA | 开发一种有效的计算工具,用于整合跨条件的单细胞基因组数据并表征从正常到异常细胞状态的转变 | 正常和扰动单细胞RNA-seq数据中的基因表达和细胞状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA |
253 | 2024-11-27 |
A signal-diffusion-based unsupervised contrastive representation learning for spatial transcriptomics analysis
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae663
PMID:39546378
|
研究论文 | 提出了一种基于信号扩散的无监督对比表示学习方法(SDUCL),用于空间转录组学分析 | 设计了一种信号扩散微环境发现算法,通过模拟生物信号扩散过程,有效捕捉和整合细胞微环境中的交互信息 | 未提及具体局限性 | 学习细胞/位点的低维潜在嵌入,以解析组织异质性和分析生物功能 | 空间转录组学数据,包括正常和肿瘤组织 | 生物信息学 | 肿瘤 | 信号扩散 | 无监督对比学习 | 基因表达数据、空间信息、图像数据 | 涉及多个物种的空间转录组学数据集 |
254 | 2024-11-27 |
Single-cell transcriptomics unveils skin cell specific antifungal immune responses and IL-1Ra- IL-1R immune evasion strategies of emerging fungal pathogen Candida auris
2024-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012699
PMID:39536069
|
研究论文 | 研究揭示了新兴真菌病原体白色念珠菌在皮肤组织中的细胞特异性抗真菌免疫反应和IL-1Ra-IL-1R免疫逃避策略 | 首次通过单细胞转录组学揭示了白色念珠菌在皮肤感染中的细胞特异性免疫反应和免疫逃避机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨白色念珠菌在皮肤组织中的免疫反应和免疫逃避机制 | 白色念珠菌感染的小鼠皮肤组织中的免疫细胞和非免疫细胞 | 数字病理学 | 真菌感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 感染白色念珠菌的小鼠皮肤组织中的多个免疫和非免疫细胞 |
255 | 2024-11-27 |
Multi-site Ultrasound-guided Fine Needle Aspiration to Study Cells and Soluble Factors From Human Lymph Nodes
2024-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70063
PMID:39579041
|
研究论文 | 本文介绍了使用超声引导下细针穿刺(FNA)技术从人体淋巴结中采集细胞和可溶性因子的方法 | 首次详细描述了使用超声引导下细针穿刺技术采集淋巴结样本,并介绍了下游分析方法,如多重流式细胞术、单细胞转录组测序和B细胞培养 | NA | 研究淋巴结在免疫反应中的作用,特别是B细胞生发中心反应 | 人体淋巴结中的免疫细胞和可溶性因子 | NA | NA | 超声引导下细针穿刺(FNA) | NA | 细胞和可溶性因子 | NA |
256 | 2024-11-27 |
Identification and analysis of a cell communication prognostic signature for oral squamous cell carcinoma at bulk and single-cell levels
2024-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70166
PMID:39580787
|
研究论文 | 本文通过单细胞和批量测序数据分析,构建了一个新的免疫相关基因预后模型,用于预测口腔鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次整合单细胞和批量测序数据,构建了一个免疫相关基因预后模型,并验证了FCRL4对口腔鳞状细胞癌细胞的影响 | 需要进一步的临床试验来验证模型的实际应用效果 | 开发一个能够有效预测口腔鳞状细胞癌患者预后和免疫治疗反应的预后模型 | 口腔鳞状细胞癌的免疫微环境分析和预后模型构建 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞测序、批量测序、WGCNA分析、XGBoost | XGBoost | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
257 | 2024-11-26 |
Spatial differences in gene expression across the dorsal raphe nucleus in a model of early Alzheimer's disease
2024-Nov-25, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241299119
PMID:39584353
|
研究论文 | 研究阿尔茨海默病早期模型中背侧中缝核基因表达的空间差异 | 首次在阿尔茨海默病早期模型中使用Visium空间基因表达平台分析背侧中缝核的转录组变化,并发现长非编码RNA Map2k3os在tau病理中的潜在调节作用 | 需要进一步的验证和数据整合以克服大规模空间转录组技术的局限性 | 识别与5-HT神经元对阿尔茨海默病病理的易感性或抗性相关的潜在遗传成分 | 背侧中缝核的基因表达和tau病理 | 数字病理 | 阿尔茨海默病 | Visium空间基因表达平台 | NA | 基因表达数据 | 人源tau过表达小鼠模型 |
258 | 2024-11-26 |
RETRACTION: Prognostic Value and Potential Mechanism of Cellular Senescence and Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma: Insights From Bulk Transcriptomics and Single-Cell Sequencing Analysis
2024-Nov-25, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24453
PMID:39584580
|
correction | 该文章因同行评审过程被破坏而被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
259 | 2024-11-26 |
CRISPR-based genetic screens in human pluripotent stem cells derived neurons and brain organoids
2024-Nov-25, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03934-2
PMID:39585363
|
综述 | 本文总结了基于CRISPR的基因筛选技术在人多能干细胞衍生的神经元和脑类器官中的应用 | 结合CRISPR基因筛选和单细胞RNA测序,揭示了人类神经细胞中受遗传变异影响的下游基因和细胞通路,为神经发育障碍的病理机制提供了新见解 | 尽管CRISPR基因筛选技术具有巨大潜力,但仍面临挑战,如技术复杂性和数据解释的困难 | 探讨CRISPR基因筛选技术在神经系统疾病研究和潜在治疗策略开发中的应用 | 人多能干细胞衍生的神经元和脑类器官 | 基因组学 | 神经发育障碍 | CRISPR基因筛选技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
260 | 2024-11-26 |
High CD44 expression and enhanced E-selectin binding identified as biomarkers of chemoresistant leukemic cells in human T-ALL
2024-Nov-24, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02473-7
PMID:39580584
|
研究论文 | 研究识别了CD44高表达和E-选择素增强结合作为化疗耐药白血病细胞的生物标志物 | 通过单细胞RNA测序揭示了化疗耐药白血病细胞的特征,并发现了CD44表达与E-选择素结合的关联 | NA | 研究T-ALL中化疗耐药机制,并寻找新的治疗选项 | T-ALL中的化疗耐药白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 39个T-ALL样本 |