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当前共找到 579 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
iGTP: Learning interpretable cellular embedding for inferring biological mechanisms underlying single-cell transcriptomics
2024-Nov-25, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.03.29.24305092
PMID:39649598
|
研究论文 | 提出了一种可解释的生成转录程序框架iGTP，用于从单细胞转录组数据中学习可解释的细胞嵌入表示 | 设计了结合转录程序空间和蛋白质-蛋白质相互作用的新型可解释生成框架，能够建模不同生物状态间的相互作用 | NA | 开发可解释的深度学习方法，从单细胞转录组数据推断潜在的生物学机制 | 单细胞转录组数据中的细胞状态和生物过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 图神经网络, 潜在扩散模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional mapping reveals genetic and non-genetic determinants of aberrant differentiation in AML
2024-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.26.573390
PMID:38234771
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建人类骨髓造血参考图谱，并分析AML中遗传和非遗传因素对异常分化的影响 | 构建了包含263,519个单细胞转录组的人类骨髓造血参考图谱，系统绘制了基因型与表型关联，揭示了AML中12种异常分化模式 | 依赖单细胞RNA测序数据，可能受技术偏差影响；样本来源有限 | 研究急性髓系白血病中遗传突变和非遗传因素对造血分化的影响机制 | 318例AML、混合表型急性白血病和急性红系白血病患者的120万个单细胞转录组 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 263,519个正常骨髓单细胞和120万个白血病单细胞，涵盖318个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2025-10-06 |
Functional profiling of murine glioma models highlights targetable immune evasion phenotypes
2024-11-27, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02831-w
PMID:39592459
|
研究论文 | 通过功能遗传筛选、单细胞转录组学和机器学习方法，系统性评估小鼠胶质瘤模型作为人类胶质母细胞瘤临床前模型的价值 | 首次通过CRISPR全基因组共培养杀伤筛选鉴定出胶质瘤三种关键免疫逃逸机制，并利用机器学习识别出与临床相关的免疫逃逸基因程序 | 研究基于小鼠模型，虽然部分重现了人类GBM特征，但仍存在物种差异 | 探索胶质瘤免疫逃逸机制并建立临床前模型与人类疾病的桥梁 | 小鼠胶质瘤模型（GL261和CT2A）及人类胶质母细胞瘤 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR全基因组筛选、单细胞转录组学、机器学习 | 机器学习方法 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 两个小鼠胶质瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
Integration of Machine Learning and Experimental Validation to Identify Anoikis-Related Prognostic Signature for Predicting the Breast Cancer Tumor Microenvironment and Treatment Response
2024-Nov-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111458
PMID:39596658
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研究论文 | 通过整合机器学习与实验验证，开发了失巢凋亡相关预后特征用于预测乳腺癌肿瘤微环境和治疗反应 | 首次构建了包含5个失巢凋亡相关基因的预后特征，并系统评估其与肿瘤微环境、药物敏感性和免疫治疗的关系 | 需要更大样本量的前瞻性研究进一步验证预后特征的临床适用性 | 探索失巢凋亡相关基因在乳腺癌预后预测和治疗指导中的价值 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RT-PCR, Western blot, ELISA, 单细胞分析, 空间转录组学 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
OrthologAL: A Shiny application for quality-aware humanization of non-human pre-clinical high-dimensional gene expression data
2024-Nov-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.25.625000
PMID:39651293
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研究论文 | 开发了一个名为OrthologAL的Shiny应用程序，用于将非临床前高维基因表达数据质量感知地转换为人类同源基因数据 | 利用BioMart数据库访问Ensembl中的不同基因集，无需用户编写代码即可实现非人类转录组向人类同源基因的转换 | NA | 促进药理学转录组学数据库在临床前研究模型中的应用，并促进非人类转录组的人类同源基因转换 | 单细胞、单核和空间转录组数据，包括髓母细胞瘤患者来源原位异种移植模型以及小鼠和大鼠脊髓损伤模型 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤, 脊髓损伤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
Chromosome-contiguous genome for the Haecon-5 strain of Haemonchus contortus reveals marked genetic variability and enables the discovery of essential gene candidates
2024-11, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2024.08.003
PMID:39168434
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研究论文 | 本研究报道了澳大利亚Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株的高质量染色体水平基因组，并利用机器学习方法预测了潜在的关键基因 | 首次提供了Haecon-5菌株的染色体连续基因组，揭示了与英国ISE菌株的显著遗传差异，并采用跨物种机器学习方法预测了必需基因 | 研究主要基于计算预测，候选基因的功能验证需要后续实验研究 | 构建高质量基因组资源以支持捻转血矛线虫的基础研究和药物靶点发现 | Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 基因组测序, 转录组分析, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习 | 基因组序列, 转录组数据, 表观遗传数据 | 一个特定菌株(Haecon-5)的完整基因组分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 207 | 2025-10-06 |
Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment
2024-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189178
PMID:39241895
|
综述 | 本文系统回顾了肿瘤微环境中基质组的研究进展，涵盖多组学方法和新技术应用 | 首次整合多组学水平（表观基因组学、基因组学、转录组学、蛋白质组学）和新兴测序技术研究肿瘤基质组 | 肿瘤基质组的具体机制和临床应用尚未完全阐明 | 探索肿瘤微环境中基质组的表达模式和功能作用 | 肿瘤组织中的基质组蛋白及其相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-06 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-11, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类胚胎造血过程中不同血细胞谱系对缺氧和氧化应激的特异性反应 | 首次在单细胞水平描述不同造血谱系对缺氧的转录反应，发现红细胞对氧化应激的特殊敏感性及代谢途径差异 | 研究主要基于体外模型，体内验证仍需进一步研究 | 探究缺氧对人类内皮-造血转变及后续造血过程的影响 | 人造血内皮细胞衍生的不同血细胞谱系 | 单细胞生物学 | 血液发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 209 | 2025-10-06 |
A modified model of PANoptosisto identify prognosis and immunotherapy response in bladder cancer
2024-11, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2024.106672
PMID:39368544
|
研究论文 | 本研究通过构建PANoptosis相关风险模型来识别膀胱癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次将PANoptosis概念应用于膀胱癌研究，并构建了包含五个关键基因的风险评分模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探究PANoptosis相关修饰模式在膀胱癌中的作用机制 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组测序, 单细胞测序 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据, 临床数据 | 膀胱癌患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 210 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Revealing Host Response Differences Triggered by Mutated Virus in Severe Dengue
2024-11-15, Viruses
DOI:10.3390/v16111779
PMID:39599894
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组技术揭示突变登革热病毒引发严重宿主反应差异的分子机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组技术分析突变登革热病毒在肝脏组织中的宿主反应差异，并鉴定出NRG/ErbB信号通路的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究突变登革热病毒引发严重宿主反应的分子机制 | 小鼠肝脏组织（未感染组、轻度感染NGC组、严重感染N10组） | 空间转录组学 | 登革热 | 单核RNA测序, 空间RNA测序, 计算机分子建模分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 小鼠肝脏组织样本（未感染、轻度感染、严重感染三组） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 211 | 2025-10-06 |
Validation of non-destructive morphology-based selection of cerebral cortical organoids by paired morphological and single-cell RNA-seq analyses
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.09.005
PMID:39393360
|
研究论文 | 通过配对形态学和单细胞RNA测序分析验证基于非破坏性形态学的脑皮质类器官筛选方法 | 首次证明非破坏性形态分析可准确区分由脑皮质组织构成的类器官与其他脑组织类器官 | NA | 评估脑类器官分化培养中形成的类器官形态与其细胞组成的关系 | 脑类器官 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 形态学图像,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2025-10-06 |
Lineage-specific dynamics of loss of X upregulation during inactive-X reactivation
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.001
PMID:39486405
|
研究论文 | 本研究探讨了失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的变化规律 | 首次揭示了Xi重新激活与Xa上调状态丢失在不同细胞类型中的非同步性现象 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞数据相对有限 | 探究失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的动态变化 | 小鼠胚胎外胚层、诱导多能干细胞、生殖细胞、胚胎外内胚层干细胞和人类B细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型，具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional analysis of murine norovirus infection in a human intestinal cell line
2024-Nov-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01617-24
PMID:39475272
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探索了鼠诺如病毒在人肠道细胞系中的感染机制和宿主反应 | 建立了表达鼠诺如病毒受体的人肠道细胞系，首次在单细胞分辨率下分析了鼠诺如病毒感染的人细胞宿主反应 | 研究使用的是鼠诺如病毒而非人诺如病毒，且仅在工程化细胞系中进行 | 探索诺如病毒复制的宿主细胞需求及感染机制 | 表达鼠CD300lf受体的人肠道细胞系(mCD300lf-hCaco2)和鼠诺如病毒(MNV) | 单细胞生物学 | 急性胃肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2025-10-06 |
Safety and reactogenicity of a controlled human infection model of sand fly-transmitted cutaneous leishmaniasis
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03146-9
PMID:39095597
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研究论文 | 本研究建立了首个沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型，评估了其安全性和有效性 | 首次建立沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型，并提供了人类CL病变中免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达的全面图谱 | 样本量较小（14名参与者），CL病变和活检程序导致的瘢痕形成明显 | 开发皮肤利什曼病疫苗并建立有效的临床前评估模型 | 健康人类参与者暴露于感染利什曼原虫的沙蝇 | 传染病学 | 皮肤利什曼病 | 空间转录组学，免疫组织化学 | 受控人类感染模型 | 临床数据，分子数据，影像数据 | 14名参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 215 | 2024-10-25 |
Spatial Transcriptomics: A New Frontier in Atherosclerosis Research?
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321652
PMID:39441914
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2025-10-06 |
Multi-site Ultrasound-guided Fine Needle Aspiration to Study Cells and Soluble Factors From Human Lymph Nodes
2024-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70063
PMID:39579041
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研究论文 | 介绍应用超声引导细针穿刺技术从人类淋巴结采集样本的方法 | 采用多部位超声引导细针穿刺技术同时获取淋巴结免疫细胞和无细胞材料 | NA | 开发人类淋巴结采样技术以研究免疫反应和神经免疫疾病 | 人类头颈部宫颈淋巴结 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 超声引导细针穿刺, 单细胞转录组测序, 流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | 细胞样本, 无细胞上清液 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺素E2通过EP2/EP4受体信号通路损害肿瘤浸润免疫细胞的生物能量和核糖体生物合成，导致免疫抑制的机制 | 首次在人类癌症中系统阐明PGE2-EP2/EP4信号通路通过下调c-Myc和PGC-1，损害免疫细胞的氧化磷酸化、糖酵解和核糖体蛋白合成，从而抑制抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在更多人类癌症类型中验证；机制研究尚未完全揭示所有下游信号通路 | 探究前列腺素E2在肿瘤微环境中诱导免疫抑制的具体分子机制 | 人类癌症和雌性小鼠同系肿瘤中浸润的免疫细胞，包括CD8 T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类癌症和雌性小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2025-10-06 |
Controlling human stem cell-derived islet composition using magnetic sorting
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.19.624394
PMID:39605713
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研究论文 | 本研究开发了一种通过磁性分选控制干细胞来源胰岛细胞组成的方法 | 首次使用基于CD49a标记的磁性激活细胞分选技术来富集功能性β细胞 | 未提及研究的局限性 | 改善干细胞来源胰岛的细胞组成和功能，用于1型糖尿病治疗 | 人类多能干细胞来源的胰岛细胞 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | 磁性激活细胞分选, 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-10-06 |
Reconstructing the regulatory programs underlying the phenotypic plasticity of neural cancers
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53954-3
PMID:39516198
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研究论文 | 开发了一种名为scregclust的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据重建细胞调控程序 | 提出单细胞调控驱动聚类方法，能高效划分基因模块并预测关键转录因子和激酶 | 对细胞状态调控机制的理解仍有限 | 研究神经系统癌症的表型可塑性调控程序 | 成人和儿童脑癌肿瘤样本及发育组织 | 生物信息学 | 神经系统癌症 | 单细胞RNA测序 | scregclust算法 | 单细胞RNA测序数据 | 15种肿瘤类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2025-10-06 |
Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54005-7
PMID:39521797
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研究论文 | 开发名为ELATUS的计算框架，通过单细胞RNA测序数据增强功能性长链非编码RNA的检测能力 | 结合伪比对工具Kallisto和选择性功能过滤，创建专门针对lncRNAs的单细胞RNA测序分析流程，在参考注释不准确的情况下表现更优 | 未提及具体样本数量和研究规模，主要关注方法学比较 | 开发优化单细胞RNA测序数据分析方法，提高功能性长链非编码RNA的检测准确性 | 长链非编码RNA（lncRNAs）在单细胞水平的表达分析 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞多组学测序（single-cell multiome），ATAC-seq | 计算框架ELATUS，基于Kallisto伪比对工具 | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学测序 | NA | NA |