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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Revealing Host Response Differences Triggered by Mutated Virus in Severe Dengue
2024-11-15, Viruses
DOI:10.3390/v16111779
PMID:39599894
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研究论文 | 通过单核和空间转录组技术揭示突变登革热病毒引发严重宿主反应差异的分子机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组技术分析突变登革热病毒在肝脏组织中的宿主反应差异,并鉴定出NRG/ErbB信号通路的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究突变登革热病毒引发严重宿主反应的分子机制 | 小鼠肝脏组织(未感染组、轻度感染NGC组、严重感染N10组) | 空间转录组学 | 登革热 | 单核RNA测序, 空间RNA测序, 计算机分子建模分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 小鼠肝脏组织样本(未感染、轻度感染、严重感染三组) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
Validation of non-destructive morphology-based selection of cerebral cortical organoids by paired morphological and single-cell RNA-seq analyses
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.09.005
PMID:39393360
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研究论文 | 通过配对形态学和单细胞RNA测序分析验证基于非破坏性形态学的脑皮质类器官筛选方法 | 首次证明非破坏性形态分析可准确区分由脑皮质组织构成的类器官与其他脑组织类器官 | NA | 评估脑类器官分化培养中形成的类器官形态与其细胞组成的关系 | 脑类器官 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 形态学图像,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2025-10-06 |
Lineage-specific dynamics of loss of X upregulation during inactive-X reactivation
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.001
PMID:39486405
|
研究论文 | 本研究探讨了失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的变化规律 | 首次揭示了Xi重新激活与Xa上调状态丢失在不同细胞类型中的非同步性现象 | 研究主要基于小鼠模型,人类细胞数据相对有限 | 探究失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的动态变化 | 小鼠胚胎外胚层、诱导多能干细胞、生殖细胞、胚胎外内胚层干细胞和人类B细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型,具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional analysis of murine norovirus infection in a human intestinal cell line
2024-Nov-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01617-24
PMID:39475272
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探索了鼠诺如病毒在人肠道细胞系中的感染机制和宿主反应 | 建立了表达鼠诺如病毒受体的人肠道细胞系,首次在单细胞分辨率下分析了鼠诺如病毒感染的人细胞宿主反应 | 研究使用的是鼠诺如病毒而非人诺如病毒,且仅在工程化细胞系中进行 | 探索诺如病毒复制的宿主细胞需求及感染机制 | 表达鼠CD300lf受体的人肠道细胞系(mCD300lf-hCaco2)和鼠诺如病毒(MNV) | 单细胞生物学 | 急性胃肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
PTEN Loss Shapes Macrophage Dynamics in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2024-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3890
PMID:39186679
|
研究论文 | 本研究揭示PTEN缺失通过IL33诱导HMOX1高表达巨噬细胞促进高级别浆液性卵巢癌进展的机制 | 首次发现PTEN缺失通过IL33诱导HMOX1hi巨噬细胞形成,并证明靶向该巨噬细胞可抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索PTEN缺失对高级别浆液性卵巢癌免疫微环境的影响及治疗靶点 | 小鼠模型和人类高级别浆液性卵巢癌样本 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RNA测序 | NA | 基因表达数据,流式细胞数据 | 小鼠模型和人类HGSC肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-06 |
Safety and reactogenicity of a controlled human infection model of sand fly-transmitted cutaneous leishmaniasis
2024-Nov, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03146-9
PMID:39095597
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研究论文 | 本研究建立了首个沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型,评估了其安全性和有效性 | 首次建立沙蝇传播皮肤利什曼病的受控人类感染模型,并提供了人类CL病变中免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达的全面图谱 | 样本量较小(14名参与者),CL病变和活检程序导致的瘢痕形成明显 | 开发皮肤利什曼病疫苗并建立有效的临床前评估模型 | 健康人类参与者暴露于感染利什曼原虫的沙蝇 | 传染病学 | 皮肤利什曼病 | 空间转录组学,免疫组织化学 | 受控人类感染模型 | 临床数据,分子数据,影像数据 | 14名参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2024-10-25 |
Spatial Transcriptomics: A New Frontier in Atherosclerosis Research?
2024-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321652
PMID:39441914
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2025-10-06 |
Multi-site Ultrasound-guided Fine Needle Aspiration to Study Cells and Soluble Factors From Human Lymph Nodes
2024-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70063
PMID:39579041
|
研究论文 | 介绍应用超声引导细针穿刺技术从人类淋巴结采集样本的方法 | 采用多部位超声引导细针穿刺技术同时获取淋巴结免疫细胞和无细胞材料 | NA | 开发人类淋巴结采样技术以研究免疫反应和神经免疫疾病 | 人类头颈部宫颈淋巴结 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 超声引导细针穿刺, 单细胞转录组测序, 流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | 细胞样本, 无细胞上清液 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-06 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces immunosuppression in human cancer by impairing bioenergetics and ribosome biogenesis in immune cells
2024-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53706-3
PMID:39487111
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺素E2通过EP2/EP4受体信号通路损害肿瘤浸润免疫细胞的生物能量和核糖体生物合成,导致免疫抑制的机制 | 首次在人类癌症中系统阐明PGE2-EP2/EP4信号通路通过下调c-Myc和PGC-1,损害免疫细胞的氧化磷酸化、糖酵解和核糖体蛋白合成,从而抑制抗肿瘤免疫的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,需要在更多人类癌症类型中验证;机制研究尚未完全揭示所有下游信号通路 | 探究前列腺素E2在肿瘤微环境中诱导免疫抑制的具体分子机制 | 人类癌症和雌性小鼠同系肿瘤中浸润的免疫细胞,包括CD8 T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类癌症和雌性小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-06 |
Controlling human stem cell-derived islet composition using magnetic sorting
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.19.624394
PMID:39605713
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过磁性分选控制干细胞来源胰岛细胞组成的方法 | 首次使用基于CD49a标记的磁性激活细胞分选技术来富集功能性β细胞 | 未提及研究的局限性 | 改善干细胞来源胰岛的细胞组成和功能,用于1型糖尿病治疗 | 人类多能干细胞来源的胰岛细胞 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | 磁性激活细胞分选, 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-06 |
Reconstructing the regulatory programs underlying the phenotypic plasticity of neural cancers
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53954-3
PMID:39516198
|
研究论文 | 开发了一种名为scregclust的计算方法,用于从单细胞RNA测序数据重建细胞调控程序 | 提出单细胞调控驱动聚类方法,能高效划分基因模块并预测关键转录因子和激酶 | 对细胞状态调控机制的理解仍有限 | 研究神经系统癌症的表型可塑性调控程序 | 成人和儿童脑癌肿瘤样本及发育组织 | 生物信息学 | 神经系统癌症 | 单细胞RNA测序 | scregclust算法 | 单细胞RNA测序数据 | 15种肿瘤类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-10-06 |
Uncovering functional lncRNAs by scRNA-seq with ELATUS
2024-11-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54005-7
PMID:39521797
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研究论文 | 开发名为ELATUS的计算框架,通过单细胞RNA测序数据增强功能性长链非编码RNA的检测能力 | 结合伪比对工具Kallisto和选择性功能过滤,创建专门针对lncRNAs的单细胞RNA测序分析流程,在参考注释不准确的情况下表现更优 | 未提及具体样本数量和研究规模,主要关注方法学比较 | 开发优化单细胞RNA测序数据分析方法,提高功能性长链非编码RNA的检测准确性 | 长链非编码RNA(lncRNAs)在单细胞水平的表达分析 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞多组学测序(single-cell multiome),ATAC-seq | 计算框架ELATUS,基于Kallisto伪比对工具 | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
Divergent WNT signaling and drug sensitivity profiles within hepatoblastoma tumors and organoids
2024-11-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52757-w
PMID:39567475
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝母细胞瘤的分子异质性和药物敏感性特征 | 首次在肝母细胞瘤中识别出两种具有不同WNT信号模式的肿瘤上皮亚型,并发现它们对特定靶向药物的敏感性差异 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 | 表征肝母细胞瘤的分子异质性并识别新的靶向治疗策略 | 肝母细胞瘤组织和肿瘤来源的类器官 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 高通量药物筛选 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据, 药物反应数据 | 肝母细胞瘤组织和肿瘤类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
Molecular profiles, sources and lineage restrictions of stem cells in an annelid regeneration model
2024-11-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54041-3
PMID:39557833
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和嵌合转基因技术研究海洋环节动物后部再生过程中的细胞谱系和分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序和新型嵌合转基因技术揭示环节动物再生过程中多种细胞群重新出现干细胞特征 | 研究仅限于海洋环节动物模型,结论在其他动物门类的普适性仍需验证 | 探索动物再生能力的分子和细胞机制 | 海洋环节动物Platynereis dumerilii的后部再生过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 嵌合转基因技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-06 |
Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer
2024-11-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54364-1
PMID:39550375
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了前列腺癌中club-like细胞与免疫抑制性髓系细胞的相互作用机制 | 首次在前列腺癌中发现club-like细胞作为上皮细胞亚型在肿瘤微环境中的关键作用,并揭示其与髓源性抑制细胞的关联 | 研究样本量相对有限,机制研究仍需进一步功能验证 | 探索前列腺癌治疗抵抗的肿瘤微环境机制 | 前列腺癌患者肿瘤微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 120名患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-06 |
GPRC5A promotes lung colonization of esophageal squamous cell carcinoma
2024-11-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54251-9
PMID:39550386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现GPRC5A通过调控YAP1信号通路促进食管鳞癌肺转移 | 首次揭示早期播散癌细胞具有滋养层样'肿瘤植入'表型,并发现GPRC5A/WWP1/LATS1/YAP1这一新的转移调控通路 | 机制研究仍需进一步验证,临床样本量有限 | 探索食管鳞癌肺转移的分子机制 | 食管鳞癌细胞和148例ESCC患者 | 癌症生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 148例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
Defective germinal center selection results in persistence of self-reactive B cells from the primary to the secondary repertoire in Primary Antiphospholipid Syndrome
2024-11-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54228-8
PMID:39548093
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术解析原发性抗磷脂综合征中自身反应性B细胞的起源和存活机制 | 首次在人类PAPS中系统追踪自身反应性B细胞从初始到记忆和长寿命浆细胞阶段的全过程,揭示其通过缺陷的生发中心选择而持续存在 | 样本来源仅限于外周血和骨髓,未涉及其他淋巴器官;研究人群为三重阳性PAPS患者,结果可能不适用于所有PAPS亚型 | 阐明原发性抗磷脂综合征中自身反应性B细胞的起源和存活机制 | 原发性抗磷脂综合征患者的B细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, CITEseq, 单细胞永生化 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, BCR序列数据 | 三重阳性PAPS患者的外周血和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
Multi-omics with dynamic network biomarker algorithm prefigures organ-specific metastasis of lung adenocarcinoma
2024-11-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53849-3
PMID:39543109
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研究论文 | 本研究通过动态网络生物标志物算法和多组学数据预测肺腺癌器官特异性转移 | 首次结合动态网络生物标志物算法、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学数据定位肺腺癌转移前状态 | 研究仅基于两个临床队列,需要更大样本验证 | 早期检测肺腺癌器官特异性转移 | 肺腺癌患者原发性病灶和血清样本 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 液相色谱-质谱联用 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据, 质谱数据 | 两个临床队列,包含四种主要肺腺癌远处转移类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq
2024-11-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54202-4
PMID:39543112
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Dyna-vivo-seq的新策略,通过体内代谢RNA标记的单细胞RNA测序技术揭示急性肾损伤过程中的细胞RNA动态变化 | 首次实现了在活体动物中进行基于代谢RNA标记的时间分辨动态转录分析,突破了该技术仅限于体外模型的限制 | 研究仅在雌性小鼠中进行,未涉及其他性别或物种 | 开发能够在活体生物单细胞水平表征动态转录组的方法 | 雌性小鼠急性肾损伤模型中的近端肾小管细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 代谢RNA标记,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals substantial heterogeneity in triple-negative breast cancer with potential clinical implications
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54145-w
PMID:39592577
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义 | 首次系统性地描绘TNBC的空间组织结构,识别出9种空间原型,并发现与免疫治疗反应相关的基因特征 | 样本量相对有限(92例患者),需要在更大队列中进一步验证 | 探索三阴性乳腺癌的肿瘤空间结构和微环境特征 | 92例三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 逐步聚类分析 | 空间转录组数据、组织形态学数据 | 92例TNBC患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |