单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 583 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-02-09 |
ITGA5+ synovial fibroblasts orchestrate proinflammatory niche formation by remodelling the local immune microenvironment in rheumatoid arthritis
2024-Nov-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225778
PMID:39486872
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研究论文 | 本研究探讨了类风湿性关节炎（RA）中组织驻留滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在炎症反应中的作用 | 发现了一种新型的组织重塑CD45-CD31-PDPN+ITGA5+滑膜成纤维细胞亚群，并揭示了其在RA进展中的调控机制 | 研究主要依赖于单细胞和空间转录组学技术，可能受限于样本量和技术的分辨率 | 研究类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在炎症反应中的作用 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织和滑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光、流式细胞术、细胞共培养、RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 两个队列（PEAC和R4RA）的类风湿性关节炎患者样本 |
| 182 | 2025-02-08 |
The MRAP2 accessory protein directly interacts with melanocortin-3 receptor to enhance signaling
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.06.622243
PMID:39574659
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研究论文 | 本文研究了MRAP2蛋白如何通过与MC3R受体直接相互作用来增强信号传导，揭示了MRAP2在能量稳态中的关键作用 | 首次使用单分子下拉技术（SiMPull）确认MC3R和MRAP2在HEK293细胞中的相互作用，并通过荧光漂白步骤分析显示它们以1:1的化学计量比形成异二聚体 | 研究主要在HEK293细胞中进行，未在更复杂的生物体模型中验证结果 | 探讨MRAP2如何调节MC3R的功能及其在能量稳态中的作用 | MC3R受体和MRAP2蛋白 | 分子生物学 | 肥胖症 | 单分子下拉技术（SiMPull）、荧光漂白步骤分析、单核和空间转录组学 | NA | 细胞实验数据、转录组数据 | HEK293细胞 |
| 183 | 2025-02-08 |
Single-cell RNA transcriptomics in mice reveals embryonic origin of fibrosis due to maternal obesity
2024-Nov, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105421
PMID:39476533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了母体肥胖导致后代纤维化的胚胎起源 | 首次在胚胎水平上揭示了母体肥胖导致后代纤维化的细胞机制，并提出了AMPK作为潜在的治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究母体肥胖对后代纤维化的影响及其机制 | C57BL/6J雌性小鼠及其胚胎 | 单细胞RNA测序 | 纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | RNA测序数据 | C57BL/6J雌性小鼠及其胚胎（E9.5, E11.5, E13.5） |
| 184 | 2025-02-07 |
STCGAN: a novel cycle-consistent generative adversarial network for spatial transcriptomics cellular deconvolution
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae670
PMID:39715685
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研究论文 | 本文提出了一种名为STCGAN的新型循环一致性生成对抗网络，用于空间转录组学中的细胞去卷积 | STCGAN首次采用循环一致性生成对抗网络（CGAN）在空间转录组数据上进行预训练，确保从ST数据到潜在空间的映射及其反向映射的一致性，从而捕捉复杂的空间基因表达模式并学习鲁棒的潜在表示 | 尽管STCGAN在模拟和真实数据集上表现出色，但其在更广泛的组织类型和更复杂的组织架构中的适用性仍需进一步验证 | 提高空间转录组数据中细胞类型去卷积的准确性，以更精确地描绘组织架构 | 空间转录组数据（ST数据）和单细胞RNA测序数据（scRNA-seq数据） | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | CGAN（循环一致性生成对抗网络） | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 五个模拟和真实数据集 |
| 185 | 2025-02-05 |
Correction to: STCGAN: a novel cycle-consistent generative adversarial network for spatial transcriptomics cellular deconvolution
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf064
PMID:39902583
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-11-15 |
Correction: Study on the mechanism of heterogeneous tumor-associated macrophages in three subtypes of breast cancer through the integration of single-cell RNA sequencing and in vitro experiments
2024-Nov-08, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-10053-2
PMID:39514125
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2025-02-06 |
ScRNA-seq and bulk RNA-seq identified NUPR1 as novel biomarkers related to CD4 + T cells infiltration for abdominal aortic aneurysm
2024-Nov-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-10050-5
PMID:39508893
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了与腹主动脉瘤（AAA）中CD4+ T细胞浸润相关的生物标志物，特别是NUPR1基因 | 首次将NUPR1基因与AAA中CD4+ T细胞浸润联系起来，并验证了其在血管平滑肌细胞中的表达及其对AAA直径的影响 | 研究主要依赖于GEO数据库的现有数据，且实验验证部分样本量可能有限 | 识别与AAA中CD4+ T细胞浸润相关的分子标志物，以提高AAA的诊断和治疗策略 | 腹主动脉瘤（AAA）患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），qPCR，免疫组化，免疫荧光 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 188 | 2025-02-06 |
Ly6E on tumor cells impairs anti-tumor T-cell responses: a novel mechanism of tumor-induced immune exclusion
2024-Nov-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03851-x
PMID:39487896
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研究论文 | 本文研究了肿瘤细胞上的Ly6E如何通过影响肿瘤微环境中的M2巨噬细胞来抑制抗肿瘤T细胞反应 | 首次揭示了Ly6E通过促进M2巨噬细胞在肿瘤微环境中的积累，导致CD8+ T细胞排斥的免疫调节机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探讨Ly6E在肿瘤微环境中的免疫调节机制及其对癌症免疫治疗的影响 | 人类乳腺癌组织和肿瘤细胞系，以及小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 人类乳腺癌组织样本、肿瘤细胞系、小鼠肿瘤模型 |
| 189 | 2025-02-05 |
A single-cell atlas of the Culex tarsalis midgut during West Nile virus infection
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.603613
PMID:39091762
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了库蚊中肠在西尼罗河病毒感染期间的细胞类型及其对病毒的易感性 | 首次构建了库蚊中肠的单细胞图谱，并揭示了特定细胞类型对西尼罗河病毒感染的增强或限制作用 | 未在全中肠水平检测到显著的西尼罗河病毒感染诱导的典型蚊虫抗病毒免疫基因上调 | 研究库蚊中肠在西尼罗河病毒感染期间的细胞类型及其对病毒的易感性 | 库蚊中肠细胞 | 单细胞测序 | 西尼罗河病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 190 | 2025-02-05 |
Graph contrastive learning of subcellular-resolution spatial transcriptomics improves cell type annotation and reveals critical molecular pathways
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf020
PMID:39883515
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Focus的半监督图对比学习方法，用于改进基于成像的空间转录组学（iST）中的细胞类型注释，并揭示关键的分子通路 | 首次明确建模RNA的亚细胞分布和社区结构，以改进细胞类型注释，并在多个空间转录组学平台上显著优于现有算法 | 当前方法主要依赖于基因表达信息，而忽略了RNA在细胞内的空间分布 | 改进细胞类型注释并揭示细胞类型特有的亚细胞调控机制 | 基于成像的空间转录组学（iST）数据 | 数字病理学 | NA | MERFISH, CosMx SMI, Xenium | 图对比学习 | 空间转录组学数据 | NA |
| 191 | 2025-02-02 |
Beyond the Heartbeat: Single-Cell Omics Redefining Cardiovascular Research
2024-Nov, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-024-02117-3
PMID:39158785
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综述 | 本文探讨了单细胞组学技术在人类心脏不同区域的应用，揭示了细胞多样性、调控网络和疾病机制 | 强调了单细胞组学技术在心脏研究中的革命性应用，特别是在心脏再生、疾病建模和精准医学方面的潜力 | NA | 探索单细胞组学技术在心血管研究中的应用，以揭示心脏的细胞组成和分子动态 | 人类心脏的不同区域 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、基因组学、蛋白质组学、表观基因组学、空间转录组学 | NA | 单细胞组学数据 | NA |
| 192 | 2025-01-31 |
Deciphering cell states and the cellular ecosystem to improve risk stratification in acute myeloid leukemia
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf028
PMID:39865982
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研究论文 | 本文通过构建急性髓性白血病（AML）单细胞转录组图谱，提出sciNMF工作流程，系统解析细胞异质性，并开发了ACE特征（ACEsig）以预测AML预后 | 提出了sciNMF工作流程，识别了26种与临床变量、突变和预后相关的白血病和免疫细胞状态，并开发了ACE特征（ACEsig）以预测AML预后 | NA | 提高急性髓性白血病（AML）的风险分层精度 | 急性髓性白血病（AML）患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | sciNMF | 单细胞转录组数据 | 公共RNA-seq队列 |
| 193 | 2025-01-31 |
A prenatal skin atlas reveals immune regulation of human skin morphogenesis
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08002-x
PMID:39415002
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研究论文 | 本文构建了一个全面的产前人类皮肤多组学参考图谱，揭示了非免疫细胞与免疫细胞之间的相互作用在皮肤形态发生中的关键作用 | 首次构建了产前人类皮肤的多组学参考图谱，揭示了免疫细胞在皮肤形态发生中的非传统功能 | 皮肤器官模型缺乏免疫细胞，且内皮细胞异质性和数量显著减少 | 研究产前人类皮肤的形态发生机制，特别是免疫细胞在其中的作用 | 产前人类皮肤（7-17周）和皮肤器官模型 | 生物医学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 皮肤器官模型（SkO） | 单细胞和空间转录组数据 | 产前人类皮肤（7-17周）和皮肤器官模型 |
| 194 | 2025-01-31 |
Construction and Validation of a Novel T/NK-Cell Prognostic Signature for Pancreatic Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Nov, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2024.2424328
PMID:39523741
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研究论文 | 本文基于单细胞RNA测序数据，构建并验证了一种新的胰腺癌T/NK细胞预后特征模型 | 首次利用单细胞RNA测序技术，识别出胰腺癌原发肿瘤与肝转移之间的T/NK细胞亚群差异，并构建了基于6个特定基因的预后模型 | 样本量较小，仅包括3名胰腺癌患者的配对原发和转移肿瘤组织 | 研究胰腺癌原发肿瘤与转移肿瘤之间的差异，并构建预后模型 | 胰腺癌患者的原发和转移肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 3名胰腺癌患者的配对原发和转移肿瘤组织 |
| 195 | 2025-01-28 |
Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
2024-11-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.09.007
PMID:39395421
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研究论文 | 本文研究了儿童高级别胶质瘤（pHGGs）中髓系细胞的作用及其受组蛋白突变影响的转录特征 | 揭示了髓系细胞在儿童高级别胶质瘤中的肿瘤促进作用，并提出了针对这些细胞的潜在治疗机会 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的应用仍需进一步验证 | 探讨髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的作用及其受组蛋白突变影响的机制 | 儿童高级别胶质瘤（pHGGs）和弥漫性中线胶质瘤（DMGs） | 肿瘤学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫组织化学 | 小鼠模型 | RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据 | 小鼠模型和人类pHGG样本 |
| 196 | 2025-01-28 |
Progressive polyadenylation and m6A modification of Ighg1 mRNA maintain IgG1 antibody homeostasis in antibody-secreting cells
2024-11-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.10.004
PMID:39476842
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研究论文 | 本文探讨了mRNA多聚腺苷化和N6-甲基腺苷（m6A）修饰如何维持抗体分泌细胞（ASCs）中IgG1抗体的产生 | 揭示了m6A修饰和YTHDF1在维持IgG1抗体转录本稳态中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和系统性红斑狼疮患者，可能不适用于其他疾病或物种 | 研究RNA转录后修饰对抗体稳态的影响 | 抗体分泌细胞（ASCs）和IgG1抗体 | 分子生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | 系统性红斑狼疮患者和小鼠模型 |
| 197 | 2025-01-28 |
Overcoming tyrosine kinase inhibitor resistance in lung cancer brain metastasis with CTLA4 blockade
2024-Nov-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.012
PMID:39423817
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析揭示了肺癌脑转移中酪氨酸激酶抑制剂（TKI）耐药的机制，并探讨了CTLA4阻断在克服TKI耐药中的潜力 | 研究发现TKI治疗提高了T细胞中免疫检查点CTLA4的表达，揭示了肿瘤源性HMGB1在TKI响应中的免疫调节作用，并展示了CTLA4阻断与TKI联合治疗在TKI耐药模型中的增强效果 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本，需要进一步的大规模临床试验验证 | 探讨肺癌脑转移中TKI耐药的机制，并寻找克服耐药的治疗策略 | 肺癌脑转移患者和小鼠模型 | 癌症研究 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多样遗传背景和TKI治疗历史的肺癌脑转移样本 |
| 198 | 2025-01-22 |
CH6824025, Potent and Selective Discoidin Domain Receptor 1 Inhibitor, Reduces Kidney Fibrosis in Unilateral Ureteral Obstruction Mice
2024-Nov-19, The Journal of pharmacology and experimental therapeutics
IF:3.1Q2
DOI:10.1124/jpet.124.002330
PMID:39379147
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研究论文 | 本研究探讨了新型DDR1抑制剂CH6824025在单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠模型中改善肾纤维化的效果 | 首次开发并验证了CH6824025作为强效选择性DDR1磷酸化抑制剂在肾纤维化治疗中的潜力 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 研究CH6824025对肾纤维化的治疗效果及其机制 | 单侧输尿管梗阻（UUO）小鼠 | 生物医学 | 肾纤维化 | 10x Visium空间转录组学分析 | NA | mRNA表达数据 | UUO小鼠模型 |
| 199 | 2025-01-22 |
Longitudinal analysis of genetic and epigenetic changes in human pluripotent stem cells in the landscape of culture-induced abnormality
2024-Nov, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01334-8
PMID:39482531
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研究论文 | 本文通过对人类胚胎干细胞（hESCs）在体外培养过程中遗传和表观遗传变化的纵向分析，揭示了培养诱导异常的表型获得机制 | 首次全面分析了hESCs在体外培养过程中遗传和表观遗传的变化，揭示了20q11.21拷贝数增加和表观遗传变化在培养适应表型表达中的必要性 | 研究主要基于同基因hESC模型，可能无法完全反映不同遗传背景下的变化 | 探究hESCs在体外培养过程中遗传和表观遗传变化的分子机制 | 人类胚胎干细胞（hESCs） | 干细胞研究 | NA | 基因组分析、单细胞转录组分析、单细胞ATAC-seq分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | NA |
| 200 | 2025-01-16 |
The Functional Role and Prognostic Significance of TIM-3 Expression on NK Cells in the Diagnostic Bone Marrows in Acute Myeloid Leukemia
2024-Nov-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12122717
PMID:39767624
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研究论文 | 本研究探讨了TIM-3在急性髓性白血病（AML）患者骨髓中自然杀伤（NK）细胞上的功能作用和预后意义 | 首次系统评估了TIM-3在AML患者NK细胞上的表达与其细胞毒性和杀伤能力的关系，并探讨了其预后意义 | TIM-3表达水平与NK细胞杀伤活性无直接关系，且TIM-3高表达并非独立的预后因素 | 评估TIM-3在AML患者NK细胞上的表达对其细胞毒性和杀伤能力的影响，并探讨其预后意义 | AML患者和健康捐赠者的骨髓NK细胞 | 免疫学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、多参数流式细胞术（MFC） | NA | RNA测序数据、流式细胞术数据 | 105名新诊断的AML成年患者和7名健康捐赠者 |