单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 659 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-12-01 |
Molecular Signatures of Resilience to Alzheimer's Disease in Neocortical Layer 4 Neurons
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.03.621787
PMID:39574639
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研究论文 | 研究通过单细胞组学技术分析阿尔茨海默病中不同神经元的脆弱性和抗性特征 | 首次通过单核和空间转录组学技术，比较了阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域，识别出在初级视觉皮质层4中表达特定基因的抗性兴奋性神经元群体 | 研究主要集中在初级视觉皮质层4的神经元，未涵盖其他脑区的神经元抗性机制 | 探讨阿尔茨海默病中神经元的抗性机制 | 阿尔茨海默病中不同皮质区域层4神经元的抗性特征 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞组学技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及阿尔茨海默病早期和晚期受影响的皮质区域的神经元样本 |
| 182 | 2024-12-01 |
Exercise Induced Endothelial Mesenchymal Transition (EndMT) Facilitates Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403788
PMID:39344749
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研究论文 | 研究展示了内皮间充质转化（EndMT）在膝关节半月板再生中的作用 | 开发了一种手持式生物打印系统，用于手术中制造多孔半月板支架，并结合术后定期运动刺激，促进了羊模型中半月板纤维软骨组织的再生 | 研究主要在羊模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 开发一种有效的转化策略，促进半月板再生，特别是在广泛损伤或退化的情况下 | 膝关节半月板及其再生 | 生物医学工程 | 关节疾病 | 内皮间充质转化（EndMT）、单细胞RNA测序、免疫荧光共染色 | NA | 组织 | 羊模型 |
| 183 | 2024-11-19 |
General-purpose pre-trained large cellular models for single-cell transcriptomics
2024-Nov, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae340
PMID:39555105
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-12-01 |
Population-Level Cell Trajectory Inference Based on Gaussian Distributions
2024-Nov-01, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111396
PMID:39595573
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研究论文 | 本文介绍了一种基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI，通过高斯混合模型和期望最大化算法优化细胞群体，并结合RNA速度进行高斯过程回归分析 | 提出了一种新的基于高斯分布的细胞轨迹推断方法CPvGTI，该方法在处理高维、高噪声的单细胞数据时表现优异 | NA | 解决现有细胞轨迹推断方法在处理高维、高噪声单细胞数据时的不足 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 四个结构多样的模拟数据集和四个真实数据集 |
| 185 | 2024-12-01 |
Glycoengineered extracellular vesicles released from antibacterial hydrogel facilitate diabetic wound healing by promoting angiogenesis
2024-Nov, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70013
PMID:39600241
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研究论文 | 研究了一种新型水凝胶敷料，通过糖基化工程化的细胞外囊泡促进糖尿病伤口愈合 | 开发了一种包含糖基化工程化细胞外囊泡和抗菌水凝胶的新型敷料，显著提高了糖尿病伤口的愈合效果 | 研究主要在体外和小鼠实验中进行，尚未在临床上验证 | 探索新型水凝胶敷料在治疗感染性糖尿病伤口中的潜力 | 糖尿病伤口、细胞外囊泡、水凝胶敷料 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | RNA | 小鼠实验 |
| 186 | 2024-12-01 |
Downregulation of Notch Signaling-Stimulated Genes in Neurovascular Unit Alterations Induced by Chronic Cerebral Hypoperfusion
2024-Nov, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70082
PMID:39607309
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研究论文 | 研究慢性脑低灌注（CCH）引起的神经血管单元（NVU）变化及其病理机制 | 揭示了CCH引起的NVU变化，特别是神经炎症相关基因的激活和Notch信号通路的下调 | NA | 探讨CCH引起的NVU变化的病理机制 | 小鼠模型中的脑微血管（BMV）和神经血管单元（NVU） | 数字病理学 | 脑血管疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 187 | 2024-12-01 |
Single-cell sequencing reveals cellular landscape alterations in the airway mucosa of patients with pulmonary long COVID
2024-Nov, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01947-2023
PMID:39326914
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组测序揭示了长期COVID患者气道黏膜的细胞景观变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了长期COVID患者气道黏膜中中性粒细胞的独特聚集及其在慢性小气道炎症中的作用 | 样本量较小，且仅限于加拿大温哥华地区的患者 | 阐明长期COVID患者肺部的重要细胞和分子驱动因素 | 长期COVID患者的气道黏膜细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 18名成年患者，其中9名长期COVID患者和9名对照组 |
| 188 | 2024-12-01 |
Distinct Patterns of Smooth Muscle Phenotypic Modulation in Thoracic and Abdominal Aortic Aneurysms
2024-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd11110349
PMID:39590192
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研究论文 | 研究胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调节的差异模式 | 使用单细胞RNA测序技术分析胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞的转录组特征，揭示了细胞组成的差异 | 需要进一步研究揭示特定基因在病理过程中的作用 | 探讨胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞的表型调节差异 | 胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胸主动脉瘤和腹主动脉瘤样本及其对照组 |
| 189 | 2024-11-30 |
Comprehensive Analysis of Sialylation-Related Gene Profiles and Their Impact on the Immune Microenvironment in Periodontitis
2024-Nov-29, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02177-1
PMID:39609348
|
研究论文 | 本研究分析了唾液酸化相关基因在牙周炎中的表达及其对免疫微环境的影响 | 首次系统地鉴定了与牙周炎相关的唾液酸化核心基因，并构建了多基因诊断模型，揭示了这些基因在免疫细胞中的表达及其对细胞发育和通信的影响 | 研究主要基于数据分析和模型构建，缺乏实验验证 | 识别与牙周炎相关的唾液酸化基因，并探讨其对牙周免疫微环境的影响 | 唾液酸化相关基因及其在牙周炎中的表达和功能 | NA | 牙周病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 190 | 2024-11-30 |
Spatiotemporal analysis of lung immune dynamics in lethal Coccidioides posadasii infection
2024-Nov-29, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02562-24
PMID:39611685
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研究论文 | 研究了致命性Coccidioides posadasii感染期间肺部免疫动态的时空分析 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描述了致命性感染期间肺部免疫反应的特征，并识别出可能介导组织重塑和纤维化的单核细胞来源的巨噬细胞 | 研究仅限于致命性感染的情况，未涵盖所有感染类型 | 深入了解致命性Coccidioides posadasii感染期间的免疫反应，并寻找新的治疗靶点 | 致命性Coccidioides posadasii感染期间的肺部免疫动态 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 191 | 2024-11-30 |
Single Cell Data Enables Dissecting Cell Types Present in Bulk Transcriptome Data
2024-Nov-29, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2024.0152
PMID:39611952
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序数据分析和解卷积方法，从批量转录组数据中估计细胞类型比例的流程 | 提出了一种新的流程，利用单细胞RNA测序数据对批量转录组数据进行解卷积，以估计细胞类型比例 | 仅在iPSC衍生的肾脏和脑类器官数据上进行了验证，尚未在其他组织类器官中进行测试 | 开发一种方法，利用单细胞RNA测序数据从批量转录组数据中解析细胞类型 | iPSC衍生的肾脏和脑类器官的批量转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个肾脏单细胞RNA测序数据集和一个脑单细胞RNA测序数据集 |
| 192 | 2024-11-30 |
Dissecting the effect of genetic variants on atherosclerosis: integrating bulk and single-cell transcriptomics
2024-Nov-28, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae489
PMID:39607792
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-11-30 |
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2024-Nov-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn3949
PMID:39607904
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组图谱分析了小鼠不同生命阶段、性别和基因型的细胞群体动态变化 | 本文构建了一个包含超过2000万细胞的单细胞转录组图谱，揭示了3000多个独特的细胞状态和200多个与衰老相关的细胞群体 | NA | 阐明与衰老相关的细胞群体动态变化 | 小鼠不同生命阶段、性别和基因型的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 623个不同生命阶段、性别和基因型的小鼠组织样本，包含超过2000万细胞 |
| 194 | 2024-11-30 |
Genetic variation at 11q23.1 confers colorectal cancer risk by dysregulation of colonic tuft cell transcriptional activator POU2AF2
2024-Nov-28, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332121
PMID:39609081
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研究论文 | 研究11q23.1位点的基因变异如何通过调控POU2AF2基因影响结直肠癌风险 | 首次揭示了rs3087967作为11q23.1位点的主要eQTL变异，并通过POU2AF2基因的失调影响结直肠癌风险 | 复杂的连锁不平衡和相关表达阻碍了对基因变异如何影响结直肠癌风险的机制的阐明 | 探讨11q23.1位点的变异如何影响结直肠癌风险 | 11q23.1位点的基因变异及其对结直肠癌风险的影响 | NA | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 195 | 2024-11-30 |
Single Cell Deletion of the Transcription Factors Trps1 and Sox9 in Astrocytes Reveals Novel Functions in the Adult Cerebral Cortex
2024-Nov-28, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24645
PMID:39610085
|
研究论文 | 研究通过单细胞删除转录因子Trps1和Sox9在成年大脑皮层星形胶质细胞中的定位和功能 | 揭示了Trps1和Sox9在成年星形胶质细胞中的新功能及其与其他胶质细胞和免疫细胞的相互作用 | NA | 探讨转录因子在成年大脑皮层星形胶质细胞中的作用及其与星形胶质细胞异质性的关系 | 成年大脑皮层中的星形胶质细胞及其周围的寡突胶质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | Cas9介导的删除技术，Mokola假型慢病毒递送，单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 成年大脑皮层中的多个星形胶质细胞样本 |
| 196 | 2024-11-30 |
Unveiling FADS3 as a novel prognostic biomarker for tumor immunity in clear cell renal cell carcinoma through comprehensive RNA and single-cell sequencing
2024-Nov-27, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.010
PMID:39609202
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-11-30 |
GDNF family receptor alpha-like (GFRAL) expression is restricted to the caudal brainstem
2024-Nov-26, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.102070
PMID:39608751
|
研究论文 | 研究探讨了GDNF家族受体α样蛋白（GFRAL）在中枢神经系统和外周组织中的表达情况 | 通过高灵敏度和选择性技术，首次全面展示了GFRAL在脑干以外的其他脑区和外周组织中的表达情况 | 研究主要集中在小鼠和人类组织样本上，未涉及其他物种 | 探究GFRAL在外周组织和脑干以外脑区的表达情况 | GFRAL在不同组织中的表达细胞 | 神经科学 | NA | 单分子原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从小鼠和人类组织中收集了12种不同组织的样本 |
| 198 | 2024-11-30 |
Characterization of an orthotopic mouse transplant model reveals early changes in the tumor microenvironment of lung cancer
2024-Nov, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:39044458
|
研究论文 | 研究通过正位小鼠移植模型揭示了肺癌早期肿瘤微环境的细胞和分子变化 | 首次通过单细胞RNA测序分析了携带Kras G12C突变的Lewis肺癌细胞在肿瘤移植早期的细胞景观，并观察到Myc和间充质基因表达的升高 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究肺癌早期阶段的细胞和分子动力学 | Lewis肺癌细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的Lewis肺癌细胞 |
| 199 | 2024-11-29 |
Integrating Prior Knowledge Using Transformer for Gene Regulatory Network Inference
2024-Nov-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409990
PMID:39605181
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研究论文 | 本文提出了一种基于Transformer的基因调控网络推断框架GRNPT，结合大型语言模型嵌入和时间卷积网络自动编码器，从单细胞RNA测序轨迹中捕捉调控模式 | GRNPT通过整合大型语言模型嵌入和深度学习方法，克服了传统基因调控网络推断方法的局限，显著提高了推断性能和泛化能力 | NA | 旨在改进基因调控网络推断方法，提高其在不同细胞类型和未见调控因子上的泛化能力 | 基因调控网络及其在不同细胞类型中的调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 文本 | NA |
| 200 | 2024-11-29 |
Accurate Spatial Heterogeneity Dissection and Gene Regulation Interpretation for Spatial Transcriptomics using Dual Graph Contrastive Learning
2024-Nov-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410081
PMID:39605202
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研究论文 | 本文提出了一种双图对比学习方法stDCL，用于空间转录组学数据的准确空间异质性解析和基因调控解释 | stDCL通过图嵌入自编码器自适应地整合基因表达数据和空间信息，并提出双图对比学习来训练模型，确保潜在嵌入表示与实际空间分布紧密匹配并显示聚类相似性 | NA | 开发一种能够准确捕捉外部空间异质性并解释内部基因调控的方法，以理解组织微环境中的生物学机制 | 空间转录组学数据中的空间域识别和基因调控解释 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 双图对比学习 | 图嵌入自编码器 | 基因表达数据 | 复杂皮质数据集 |