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当前共找到 579 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
Single-cell eQTL mapping in yeast reveals a tradeoff between growth and reproduction
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.07.570640
PMID:38106186
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研究论文 | 本研究开发了一种单细胞eQTL定位方法，在酵母中揭示了生长与繁殖之间的权衡关系 | 开发了'一锅法'单细胞eQTL定位方法，首次在单细胞水平系统识别eQTL与细胞周期阶段的互作效应 | 研究仅限于酵母模型，尚未在更复杂生物系统中验证 | 探索遗传变异在单细胞水平对基因表达和性状影响的精细机制 | 酵母单细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | eQTL定位模型 | 单细胞基因表达数据 | 超过100,000个单细胞，来自三个杂交组合 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
Gastroduodenal injury and repair mechanisms
2024-Nov-01, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000001049
PMID:38935320
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综述 | 本文综述了胃十二指肠黏膜损伤与修复机制的最新研究进展 | 揭示了成熟上皮细胞或定向干细胞去分化、重编程、增殖和再生黏膜的新机制，以及腺病毒疗法、植物基化合物递送系统和RNA技术在黏膜修复中的应用 | 关于急性浅表性病变的研究在过去一年中较为稀疏 | 探讨胃十二指肠黏膜损伤后的修复机制 | 胃十二指肠黏膜组织 | NA | 胃十二指肠疾病 | 单细胞RNA测序, 腺病毒疗法, 纳米颗粒技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-06 |
Construction of a Prognostic Model for Mitochondria and Macrophage Polarization Correlation in Glioma Based on Single-Cell and Transcriptome Sequencing
2024-11, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70083
PMID:39491527
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研究论文 | 基于单细胞和转录组测序构建胶质瘤中线粒体与巨噬细胞极化相关性的预后模型 | 首次整合线粒体相关基因和巨噬细胞极化相关基因构建胶质瘤预后模型，并通过单细胞RNA测序在细胞水平验证基因表达 | 研究基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探讨线粒体相关基因和巨噬细胞极化相关基因与胶质瘤预后的关系 | 胶质瘤患者数据集和组织样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,转录组测序,WGCNA | 风险模型,列线图 | 基因表达数据 | 多个胶质瘤数据集(TCGA-GBMLGG, mRNA-seq-325, mRNA-seq-693, GSE16011, GSE4290, GSE138794) | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-06 |
Identification of transcriptional signature change and critical transcription factors involved during the differentiation of mouse trophoblast stem cell into maternal blood vessel associated trophoblast giant cell
2024-11, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111359
PMID:39179089
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析小鼠滋养层干细胞分化为滋养层巨细胞过程中的转录特征变化，并识别关键转录因子 | 首次发现体外分化的滋养层巨细胞与体内母体血管相关滋养层巨细胞亚型的相似性，并鉴定出ZMAT1、EGR1和MITF等关键转录因子 | 研究仅基于小鼠模型，人类胎盘可能存在差异；体外分化系统可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究滋养层干细胞分化为滋养层巨细胞的分子机制及其与胎盘功能的关系 | 小鼠滋养层干细胞和分化的滋养层巨细胞 | 发育生物学 | 胎盘功能相关疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠滋养层干细胞和分化细胞 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
A prognostic biomarker of disulfidptosis constructed by machine learning framework model as potential reporters of pancreatic adenocarcinoma
2024-11, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111371
PMID:39209222
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研究论文 | 通过机器学习框架构建二硫死亡相关预后生物标志物，探索其在胰腺腺癌中的免疫浸润和治疗潜力 | 首次将新发现的细胞死亡方式二硫死亡与胰腺腺癌预后模型结合，并验证MET基因在二硫死亡中的作用机制 | 样本量较小（仅16个单细胞样本），需要更多独立队列验证模型的普适性 | 构建胰腺腺癌的二硫死亡相关预后生物标志物并探索其临床意义 | 胰腺腺癌患者样本和细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，LASSO回归，WGCNA分析，细胞实验 | LASSO回归，机器学习框架模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 16个PAAD样本（GSE154778数据集）+ TCGA-PAAD数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-10-06 |
Exposure to BaA inhibits trophoblast cell invasion and induces miscarriage by regulating the DEC1/ARHGAP5 axis and promoting ubiquitination-mediated degradation of MMP2
2024-11-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.135594
PMID:39191013
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研究论文 | 本研究揭示了苯并[a]蒽通过调控DEC1/ARHGAP5轴和促进MMP2泛素化降解抑制滋养层细胞侵袭导致流产的机制 | 首次发现BaA通过表观遗传调控DEC1表达并鉴定ARHGAP5为DEC1直接靶基因，同时揭示BaA通过AhR激活MID1介导的MMP2泛素化降解新机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，人类样本验证仍需扩大样本量 | 探究BaA暴露导致复发性流产的分子机制 | 人绒毛外滋养层细胞(EVTs)和小鼠模型 | 生殖毒理学 | 复发性流产 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 人类绒毛组织和原代滋养层细胞，小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-06 |
Transcriptome Assembly at Single-Cell Resolution with Beaver
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621958
PMID:39574665
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图结构，开发了高效的动态规划算法，并整合了两个基于51个精心设计特征的随机森林模型来准确估计候选转录本在单个细胞中表达的可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计，未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 开发能够在单细胞分辨率下准确重建全长转录本的组装方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林, 动态规划算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 188 | 2025-10-06 |
OneSC: a computational platform for recapitulating cell state transitions
2024-11-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae703
PMID:39570626
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为OneSC的计算平台，用于模拟细胞状态转换过程 | 提出了一种基于随机微分方程系统和核心转录因子调控网络的细胞状态转换模拟方法，优先生成能够产生忠实细胞状态转换的布尔网络 | NA | 开发计算模型以在计算机中模拟细胞状态转换过程 | 小鼠骨髓祖细胞及其分化轨迹 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机微分方程系统、布尔网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-10-06 |
Human single cell RNA-sequencing reveals a targetable CD8+ exhausted T cell population that maintains mouse low-grade glioma growth
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54569-4
PMID:39609412
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现CD8+耗竭T细胞在低级别胶质瘤中维持肿瘤生长的特殊功能 | 首次揭示CD8+耗竭T细胞在低级别胶质瘤中作为肿瘤生长调节因子的新功能，而非传统认知的细胞毒性效应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究低级别胶质瘤中T细胞的功能特性和免疫治疗机制 | 人类和小鼠的低级别胶质瘤组织样本 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-06 |
Endogenous antigens shape the transcriptome and TCR repertoire in an autoimmune arthritis model
2024-Nov-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174647
PMID:39589811
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了内源性抗原如何影响自身免疫性关节炎模型中T细胞的转录组和TCR受体库 | 首次在Zap70信号缺陷的自身免疫性关节炎模型中，结合单细胞RNA测序和TCR测序，揭示了内源性逆转录病毒通过超抗原反应破坏外周耐受的新机制 | 研究仅使用SKG小鼠模型，结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究信号通路缺陷条件下致病性自身反应性CD4+ T细胞的发育和活化机制 | BALB/c-Zap70*W163C (SKG)小鼠中高度致关节炎的初始CD4+ T细胞亚群 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | bulk RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | SKG小鼠和野生型小鼠的CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-06 |
Cell-specific priors rescue differential gene expression in spatial spot-based technologies
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae621
PMID:39679437
|
研究论文 | 本研究评估了传统差异表达基因分析方法在空间转录组数据中的适用性，并提出了一种基于细胞类型特异性先验知识的改进方案 | 开发了空间转录组数据模拟器验证传统DEG方法的局限性，并提出基于细胞特异性先验的简单基因选择方案，显著提高了DEG识别的准确性 | 研究主要基于计算机模拟数据，需要在实际生物样本中进一步验证方法的有效性 | 评估和改进空间转录组数据中差异表达基因的分析方法 | 空间转录组数据，特别是基于spot的技术平台如Visium产生的数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | 计算机模拟器，基因选择算法 | 基因表达数据，空间位置信息 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | 基于spot的空间转录组技术平台 |
| 192 | 2025-10-06 |
ETV2 transcriptionally activates Rig1 gene expression and promotes reprogramming of the endothelial lineage
2024-11-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78115-w
PMID:39562637
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研究论文 | 本研究揭示了ETV2通过直接激活Rig1基因表达促进成纤维细胞重编程为内皮细胞的分子机制 | 首次发现ETV2是Rig1基因的直接上游激活因子，并证明RIG1和NFκB1在ETV2介导的内皮细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠胚胎成纤维细胞，在人类细胞中的适用性需要进一步验证 | 阐明ETV2介导的细胞重编程分子机制 | 小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)和内皮细胞 | 细胞重编程 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 电泳迁移率实验, 转录分析, shRNA敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质-DNA相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
Multiomics reveals age-dependent metabolic reprogramming of macrophages by wound bed niche secreted signals
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.30.621159
PMID:39553941
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了伤口床微环境中巨噬细胞代谢重编程的年龄依赖性机制 | 发现早期伤口巨噬细胞代谢基因表达而非经典极化标志物定义其群体特征，并揭示年龄依赖性代谢重编程机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 探究组织微环境信号如何调控巨噬细胞代谢及其年龄依赖性变化 | 小鼠早期伤口中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞分泌组学, 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
Tracking Rare Single Donor and Recipient Immune and Leukemia Cells after Allogeneic Hematopoietic Cell Transplantation Using Mitochondrial DNA Mutations
2024-Nov-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0138
PMID:39236287
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研究论文 | 本研究利用线粒体DNA突变追踪异基因造血干细胞移植后供体和受体免疫细胞及白血病细胞的动态变化 | 首次将线粒体DNA突变与单细胞ATAC-seq技术(ASAP-seq)结合，实现0.1%-1%频率水平的供体/受体细胞鉴定和表型分析 | 通量限制，需要未来技术发展来提升监测能力 | 开发移植后白血病复发的单细胞监测方法 | 异基因造血干细胞移植后的供体和受体免疫细胞及白血病细胞 | 单细胞测序 | 白血病 | 线粒体DNA突变分析，ASAP-seq，染色质可及性分析 | NA | 单细胞测序数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | ASAP-seq（带选择性抗原测序分析的转座酶可及染色质单细胞检测） |
| 195 | 2025-10-06 |
The neuroendocrine transition in prostate cancer is dynamic and dependent on ASCL1
2024-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00838-6
PMID:39394434
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研究论文 | 本研究通过建立前列腺癌神经内分泌转化的动态模型，揭示了ASCL1在谱系可塑性中的关键作用 | 开发了能够动态追踪前列腺癌神经内分泌转化的体内平台，首次证明ASCL1是神经内分泌转化的必需因子 | 体内微环境依赖性限制了传统类器官培养的应用，模型仍需进一步验证 | 探究前列腺癌神经内分泌转化的机制和动态过程 | 移植的小鼠前列腺类器官和神经内分泌前列腺癌模型 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 多重免疫荧光，空间转录组学 | NA | 图像，空间转录组数据 | 具有Rb1; Trp53; cMyc或Pten; Trp53; cMyc突变的小鼠前列腺类器官 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-06 |
Oncogenic role of PMEPA1 and its association with immune exhaustion and TGF-β activation in HCC
2024-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101212
PMID:39524206
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研究论文 | 本研究首次证明PMEPA1在肝细胞癌中的致癌作用及其与TGF-β激活和免疫耗竭的关联 | 首次在体内实验中证实PMEPA1的致癌功能，并揭示其与TGF-β信号协同促进免疫耗竭的新机制 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要进一步前瞻性研究验证 | 探索PMEPA1在肝细胞癌中的作用及其与TGF-β信号和免疫耗竭的关系 | 肝细胞癌患者肿瘤样本和基因工程小鼠模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | qPCR, 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因组数据, 基因表达数据, 临床病理数据 | 1097例HCC肿瘤样本（包括228例发现队列和361例验证队列），54例单细胞水平样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2024-Nov-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.11.18.24317499
PMID:39606364
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，增强了阿尔茨海默病相关表型的空间信息细胞类型特异性差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组学与单核RNA测序数据整合，实现了皮质层特异性和细胞类型特异性的差异基因表达分析 | 研究依赖于深度学习工具CelEry推断的空间位置信息，可能存在推断误差 | 提升阿尔茨海默病相关表型的空间信息细胞类型特异性差异基因表达分析效能 | 436例死后大脑的背外侧前额叶皮层组织 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单核RNA测序，深度学习 | 线性混合回归模型，CelEry深度学习工具 | 基因表达数据，空间位置数据 | 约150万个细胞，来自436个死后大脑样本 | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET
2024-Nov-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05821-4
PMID:39548496
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤的基因表达特征与临床病理特征的关联 | 首次在单细胞水平系统比较促性腺激素细胞和泌乳素细胞PitNET的肿瘤微环境差异，发现SPP1+巨噬细胞和增殖性淋巴细胞等新型细胞亚群与肿瘤侵袭性的关联 | 样本量相对有限（7例促性腺激素细胞和3例泌乳素细胞肿瘤），需更大规模验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤微环境细胞组成与肿瘤侵袭行为的关系 | 促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤患者 | 单细胞转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，免疫组织化学染色 | 差异表达分析，基因表达程序识别 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，组织切片图像 | 10例单细胞测序样本（7例促性腺激素细胞+3例泌乳素细胞），134例批量RNA-seq验证队列 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics in focal cortical dysplasia type IIb
2024-11-30, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01897-7
PMID:39614299
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术探索了局灶性皮质发育不良IIb型中畸形神经元和气球细胞区域的转录组变化 | 首次在FCD IIb患者新鲜冷冻脑样本中应用空间转录组学技术，构建了畸形神经元和气球细胞区域的空间转录图谱 | 样本量较小（仅3例患者），需要更大样本验证研究结果 | 研究FCD IIb病变中关键细胞区域的转录组特征及其在癫痫发生中的作用 | 局灶性皮质发育不良IIb型患者的脑组织样本 | 空间转录组学 | 癫痫 | 空间转录组学，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，蛋白质表达数据 | 3例FCD IIb患者的新鲜冷冻脑样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
Monoclonal antibodies that block Roundabout 1 and 2 signaling target pathological ocular neovascularization through myeloid cells
2024-11-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn8388
PMID:39565875
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研究论文 | 开发靶向ROBO1和ROBO2胞外域的单克隆抗体，通过抑制SLIT-ROBO信号通路治疗病理性眼新生血管 | 首次开发能同时阻断ROBO1和ROBO2信号传导的人源单克隆抗体，并证明其通过调节髓系细胞功能抑制眼新生血管 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证疗效和安全性 | 开发靶向SLIT-ROBO信号通路的治疗性抗体，抑制病理性眼新生血管 | ROBO1和ROBO2受体、SLIT配体、髓系细胞（小胶质细胞/巨噬细胞） | 生物医学研究 | 眼血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除，抗体开发 | NA | 基因表达数据，成像数据 | 氧诱导视网膜病变和激光诱导角膜新生血管小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |