单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 578 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-21
Olfr2-positive macrophages originate from monocytes proliferate in situ and present a pro-inflammatory foamy-like phenotype
2024-11-05, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了在动脉粥样硬化中表达嗅觉受体2(Olfr2)的血管巨噬细胞的功能表型和起源 首次系统研究了Olfr2+巨噬细胞在动脉粥样硬化中的起源、增殖能力和促炎表型,并揭示了其与泡沫样巨噬细胞亚群的关系 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序数据为二次分析,非原始实验数据 探究Olfr2+血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的功能表型、细胞起源及其在疾病进展中的作用 Apoe-/-小鼠的主动脉巨噬细胞、单核细胞、动脉粥样硬化斑块 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、质谱流式细胞术(CyTOF)、流式细胞术、过继转移实验、BrdU掺入实验 NA 基因表达数据、细胞表型数据 Apoe-/-小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2 2026-03-17
Multi-sample non-negative spatial factorization
2024-Nov-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种用于分析多样本空间转录组数据的无对齐框架mNSF,通过模拟和真实数据验证了其有效性 将单样本空间因子分解扩展至多样本数据集,无需空间对齐,并整合了样本特异性空间相关性建模 未明确提及具体局限性,但暗示在空间对齐可行时性能与基于对齐的方法相当 开发一种用于多样本空间转录组数据分析的稳健方法 多样本空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 非负空间因子分解 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3 2026-03-13
[Revealing research progress for immunological characteristics of chronic hepatitis B applying single-cell RNA sequencing technology]
2024-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
综述 本文综述了应用单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎免疫学特征的最新进展 系统总结了新兴的单细胞RNA测序技术在揭示慢性乙型肝炎免疫细胞转录组细微变化方面的应用进展 NA 探索慢性乙型肝炎的免疫发病机制及潜在治疗靶点 慢性乙型肝炎患者的免疫细胞 数字病理学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-03-13
Dynamically visualizing profibrotic maladaptive repair after acute kidney injury by fibroblast activation protein imaging
2024-11, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文通过成纤维细胞激活蛋白(FAP)成像技术,动态可视化急性肾损伤后的促纤维化适应性不良修复过程 首次将FAP特异性PET/CT成像用于非侵入性动态评估急性肾损伤后的适应性不良修复,并预测肾纤维化 研究主要基于动物模型和有限患者样本,临床广泛应用前需进一步验证 开发非侵入性工具以评估器官损伤后的促纤维化适应性不良修复过程 急性肾损伤(AKI)患者和AKI小鼠模型 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序、免疫染色分析、PET/CT扫描 NA 图像、序列数据 患者活检样本和AKI小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、PET/CT成像 NA NA
5 2026-03-10
PRMT5/WDR77 Enhances the Proliferation of Squamous Cell Carcinoma via the ΔNp63α-p21 Axis
2024-Nov-11, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了PRMT5及其结合伴侣WDR77通过稳定ΔNp63α蛋白并抑制p21,从而促进鳞状细胞癌增殖的新机制 首次发现PRMT5与WDR77协同通过ΔNp63α-p21轴促进鳞状细胞癌增殖,为该类癌症提供了新的治疗靶点 NA 探究PRMT5在鳞状细胞癌增殖中的作用及其分子机制 鳞状细胞癌患者数据、癌细胞系、小鼠模型 肿瘤生物学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blot, 流式细胞术, MTT法 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞增殖数据 来自TCGA和DepMap的鳞状细胞癌患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-03-10
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为spoon的统计框架,用于解决空间转录组学数据中的均值-方差关系偏差,以更准确地识别空间可变基因 首次在空间转录组学数据中证明并处理均值-方差关系偏差,采用经验贝叶斯技术进行校正 未在摘要中明确说明,可能涉及方法在特定数据类型或条件下的适用性限制 改进空间转录组学数据分析中空间可变基因的识别准确性 空间转录组学数据中的基因表达模式 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 经验贝叶斯统计模型 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
7 2026-03-10
Distinct Patterns of Smooth Muscle Phenotypic Modulation in Thoracic and Abdominal Aortic Aneurysms
2024-Nov-01, Journal of cardiovascular development and disease IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调制的独特模式 首次在单细胞水平上比较了胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞的转录组差异,并识别出独特的SMCmod细胞群 研究主要基于小鼠模型数据,人类样本验证有限,未来需要更多研究来揭示具体的致病通路 探究胸主动脉瘤和腹主动脉瘤中平滑肌细胞表型调制的差异及其在疾病发病机制中的作用 小鼠和人类的胸主动脉瘤及腹主动脉瘤组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,免疫染色 NA RNA测序数据,图像数据 来自GEO数据库的小鼠TAA数据集(GSE153534)和AAA数据集(GSE164678, GSE152583)及对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-03-06
Exercise Induced Endothelial Mesenchymal Transition (EndMT) Facilitates Meniscal Fibrocartilage Regeneration
2024-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了运动诱导的内皮间质转化(EndMT)在促进半月板纤维软骨再生中的作用,并开发了一种手持式生物打印系统用于术中制造多孔半月板支架 首次证明EndMT在半月板再生中的贡献,并开发了结合术后规律运动刺激的多孔支架移植策略,简化了支架制造过程 研究基于绵羊模型,临床转化效果需进一步验证,且未详细探讨长期安全性和潜在副作用 开发一种有效的半月板再生转化策略,以改善半月板切除后的治疗 半月板纤维软骨组织,绵羊模型中的半月板再生过程 组织工程与再生医学 骨科疾病(半月板损伤) 单细胞RNA测序,免疫荧光共染色分析 NA 基因表达数据,图像数据 绵羊模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-03-05
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文建立了一种用于小鼠视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序样本多重标记方法,以解决稀有细胞群体表征的挑战 利用胆固醇修饰的寡核苷酸进行样本多重标记,提高了数据精度,并展示了该方法在识别非标记样本中的多重细胞方面的应用 未明确说明样本大小或技术适用范围,可能仅限于小鼠视网膜神经节细胞研究 开发单细胞RNA测序样本多重标记方法,以高效表征稀有细胞群体并解析样本来源 小鼠视网膜神经节细胞 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-03-04
Single-Cell Transcriptomic Dataset of RPGR-associated Retinitis Pigmentosa Patient-Derived Retinal Organoids
2024-11-26, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究利用源自正常和RPGR突变人诱导多能干细胞(hiPSC)的视网膜类器官,通过单细胞RNA测序技术,构建了RPGR相关视网膜色素变性(XLRP)的单细胞转录组数据集,旨在探索疾病机制并为靶向治疗开发提供数据支持 首次在RPGR相关XLRP中,利用患者来源的视网膜类器官在四个关键发育时间点(40、90、150、200天)进行大规模单细胞转录组测序,生成了高质量、可靠的细胞类型注释数据集 研究主要基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境;样本数量相对有限,且仅针对RPGR一种突变类型 探索RPGR基因突变导致光感受器功能障碍的分子机制,并为X连锁视网膜色素变性的靶向治疗开发提供数据资源和参考 源自正常和RPGR突变人诱导多能干细胞(hiPSC)的视网膜类器官 单细胞组学 视网膜色素变性 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 71,096个细胞(对照组33,839个,RPGR突变组37,257个),覆盖四个发育时间点(40、90、150、200天) NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-03-04
Temporal single-cell RNA sequencing dataset of gastroesophagus development from embryonic to post-natal stages
2024-11-16, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本文提供了一个小鼠从胚胎到出生后阶段的胃食管发育时间序列单细胞RNA测序数据集,用于研究胃食管鳞柱状交界处的转录动态 首次提供了覆盖胃食管发育全过程的全面单细胞RNA测序数据集,整合了外部数据集并通过类器官和动物模型验证,揭示了组织微环境中的发育模式和信号网络 数据集仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类胃食管疾病的复杂性,且未直接应用于癌症干预策略的开发 研究胃食管鳞柱状交界处的发育动态和稳态失调,以阐明癌症发病机制 小鼠的食管、胃和胃食管鳞柱状交界处在胚胎、新生儿和成年阶段的细胞 单细胞组学 食管腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠从胚胎到成年多个发育阶段的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-03-03
Single-cell and spatial transcriptomics identify COL6A3 as a prognostic biomarker in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2024-Nov-15, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,鉴定COL6A3作为未分化多形性肉瘤的预后生物标志物 首次结合单细胞和空间转录组学分析未分化多形性肉瘤及其亚型,发现COL6A3和BGN基因能预测生存和转移,且COL6A3优于现有肉瘤预后基因组合 样本量较小(单细胞分析仅5个活检样本和1个切除样本),需在更大队列中验证 更好表征未分化多形性肉瘤及其亚型(如非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤),并识别预后生物标志物 未分化多形性肉瘤、非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤的肿瘤样本 数字病理学 软组织肉瘤 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 5个活检样本(AFX和PDS)和1个切除样本(PDS),另加独立队列46个和38个UPS肿瘤 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
13 2026-03-02
Loss of PADI2 and PADI4 ameliorates sepsis-induced acute lung injury by suppressing NLRP3+ macrophages
2024-Nov-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了PADI2和PADI4缺失通过抑制NLRP3+巨噬细胞,改善脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 首次发现PADI2和PADI4双敲除通过调控NLRP3/Ym1轴,促进抗炎巨噬细胞分化,为脓毒症治疗提供新靶点 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 探究PADI2和PADI4在脓毒症诱导急性肺损伤中的具体功能及机制 铜绿假单胞菌肺炎诱导的脓毒症小鼠模型 单细胞转录组学 脓毒症诱导的急性肺损伤 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及Padi2-/- Padi4-/-双敲除小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-02
Identification of LRP1+CD13+ human periosteal stem cells that require LRP1 for bone repair
2024-Nov-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术鉴定了人类骨膜中表达LRP1和CD13的骨膜干细胞,并揭示了LRP1在骨修复中的关键调控作用 首次在人类骨膜中鉴定出LRP1+CD13+干细胞亚群,并证明LRP1是调控这些干细胞功能和骨修复的关键因子 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证和临床应用潜力仍需进一步探索 鉴定人类骨膜干细胞的特异性标记物并探究其在骨修复中的调控机制 人类和小鼠的骨膜组织及其中包含的干细胞 单细胞测序 骨疾病 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,涉及人类和小鼠骨膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-02
New Window Into Hepatitis B in Africa: Liver Sampling Combined With Single-Cell Omics Enables Deep and Longitudinal Assessment of Intrahepatic Immunity in Zambia
2024-Nov-15, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究在赞比亚引入肝脏细针穿刺活检,结合单细胞组学技术,对慢性及急性乙肝病毒感染者的肝内免疫反应进行了深度纵向评估 首次在非洲地区将肝脏细针穿刺活检与单细胞RNA测序技术结合,用于研究乙肝病毒感染的肝内免疫反应,为乙肝治愈策略提供新见解 样本量相对有限(共164份FNAB样本),且仅对部分样本进行了单细胞RNA测序分析 评估乙肝病毒感染者的肝内免疫反应,为乙肝治愈策略提供依据,并增进对非洲地区乙肝自然史的理解 未接受过治疗的慢性乙肝病毒感染者(包括HIV共感染者)以及急性乙肝病毒感染者 单细胞组学 乙肝病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 117份入组样本和47份纵向随访样本(共164份肝脏细针穿刺活检样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2026-03-02
Preparation of Frozen Non-Human Primate Fetal Islets for Combined Single Nuclei RNA-Sequencing and ATAC-Sequencing, and Bulk Metabolomics
2024-Nov-08, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提出了一种方法,用于从冷冻的非人灵长类胎儿胰岛组织中同时进行单核RNA测序、ATAC测序和批量代谢组学分析 开发了一种整合单核RNA测序、ATAC测序和批量代谢组学的多组学方法,适用于稀缺样本,并避免了批次效应 方法主要针对冷冻组织,可能不适用于新鲜样本,且具体应用限于非人灵长类胎儿胰岛 研究如何从稀缺样本中最大化提取多组学信息,以探索代谢物在细胞身份建立中的作用 冷冻的非人灵长类胎儿胰岛组织 多组学分析 NA 单核RNA测序, ATAC测序, 毛细管电泳-质谱 NA 序列数据, 代谢物数据 在两年内收集的多个队列的冷冻非人灵长类胎儿胰岛样本 NA 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 批量代谢组学 NA NA
17 2026-03-02
scRNA-seq profiling of human granulocytes reveals expansion of developmentally flexible neutrophil precursors with mixed neutrophil and eosinophil properties in asthma
2024-Nov-04, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了人类哮喘患者中发育灵活的粒细胞前体细胞的扩张,这些细胞表现出中性粒细胞和嗜酸性粒细胞的混合特性 首次在人类中证实了粒细胞发育的灵活性,并展示了在严重哮喘炎症中,未成熟中性粒细胞表达嗜酸性粒细胞标记物的现象,以及白细胞介素-5促进其向嗜酸性粒细胞表型分化的机制 研究主要基于单细胞测序数据,缺乏体内功能验证实验,且样本可能未涵盖所有哮喘亚型或疾病阶段 探究人类粒细胞是否存在造血灵活性,并评估中性粒细胞可塑性在哮喘炎症中的作用 人类骨髓和循环中的中性粒细胞与嗜酸性粒细胞,在不同分化阶段 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序,细胞转录组和表位索引测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
18 2026-03-02
Macrophage-mediated heart repair and remodeling: A promising therapeutic target for post-myocardial infarction heart failure
2024-11, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
综述 本文综述了巨噬细胞在心肌梗死后心力衰竭修复与重塑中的时空动态、功能、机制及信号通路,并探讨了靶向巨噬细胞的生物材料和潜在治疗药物 整合单细胞测序技术对巨噬细胞在心肌梗死中作用的最新深入理解,并讨论基于生物材料的巨噬细胞靶向治疗新策略 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行综合评述 揭示心肌梗死后心力衰竭的机制并探索靶向巨噬细胞的治疗策略 心肌梗死后心力衰竭患者及巨噬细胞在心脏修复与重塑中的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
19 2026-03-02
Bone-marrow macrophage-derived GPNMB protein binds to orphan receptor GPR39 and plays a critical role in cardiac repair
2024-Nov, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本文揭示了骨髓来源巨噬细胞产生的GPNMB蛋白通过与孤儿受体GPR39结合,在心肌梗死后心脏修复中发挥关键作用 首次鉴定GPR39为循环GPNMB的受体,并阐明巨噬细胞来源GPNMB通过GPR39信号通路促进心肌细胞收缩、抑制成纤维细胞活化的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化价值需进一步验证;GPNMB-GPR39信号通路的具体下游效应分子尚未完全阐明 探究GPNMB在心脏损伤修复中的功能机制 心肌梗死小鼠模型、人类衰竭心脏组织、骨髓来源巨噬细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞转录组测序、谱系追踪、骨髓移植、基因功能缺失模型 遗传学功能缺失模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 未明确样本数量,但涉及人类和小鼠心脏组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
20 2026-02-28
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Nov-14, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析先天免疫系统在肝脏中形成肉芽肿过程中的趋化因子表达谱 首次在先天免疫肉芽肿模型中系统研究CC和CXC趋化因子及其受体的时空动态表达模式 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;仅关注CCR2在单核细胞来源巨噬细胞中的作用,未全面探讨其他趋化因子受体 阐明先天免疫肉芽肿形成过程中趋化因子如何指导免疫细胞分层聚集 小鼠肝脏中的先天免疫肉芽肿 空间转录组学 感染性疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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