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当前共找到 579 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-11-18 |
Preexisting senescent fibroblasts in the aged bladder create a tumor-permissive niche through CXCL12 secretion
2024-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00704-1
PMID:39251867
|
研究论文 | 研究揭示了衰老膀胱中预先存在的衰老成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 首次揭示了衰老膀胱中p16-sn成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于基因修饰小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨衰老如何通过特定机制促进膀胱癌的发生 | 衰老膀胱中的成纤维细胞及其在膀胱癌中的作用 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因修饰小鼠模型中的成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-10-07 |
Brain-wide alterations revealed by spatial transcriptomics and proteomics in COVID-19 infection
2024-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00730-z
PMID:39543407
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研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学分析COVID-19感染后全脑范围的分子改变 | 首次结合多种实验和分析方法揭示COVID-19对全脑范围的影响，发现与年龄相关神经退行性疾病重叠的分子通路改变 | 样本量相对有限（总计42例），仅研究严重急性/亚急性COVID-19病例 | 探究SARS-CoV2感染后神经系统症状的病理生理机制 | COVID-19患者和匹配肺部病理对照的尸检脑组织 | 空间生物学 | COVID-19神经系统并发症 | 空间转录组学, 批量基因表达分析, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 42例尸检脑组织（COVID-19患者和对照） | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-05 |
Egfl6 promotes ovarian cancer progression by enhancing the immunosuppressive functions of tumor-associated myeloid cells
2024-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175147
PMID:39312740
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研究论文 | 发现Egfl6通过与β3整合素结合并激活p38和SYK信号，作为趋化因子促进髓系细胞迁移并使其分化至免疫抑制状态，从而推动卵巢癌进展 | 首次鉴定Egfl6作为髓系细胞功能的调节因子，阐明其通过β3整合素-p38/SYK信号轴促进肿瘤免疫抑制的机制，并证明Egfl6中和抗体可恢复抗PD-L1疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本，需进一步验证Egfl6在其他癌症类型中的作用及临床转化潜力 | 研究Egfl6在卵巢癌中调节肿瘤相关髓系细胞免疫抑制功能的机制 | 卵巢癌小鼠模型及人类卵巢癌组织样本 | 机器学 | 卵巢癌 | NA | NA | NA | 人类卵巢癌组织样本（未明确数量）及小鼠模型（同基因型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-04 |
Insulin-like growth factor 2 drives fibroblast-mediated tumor immunoevasion and confers resistance to immunotherapy
2024-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183366
PMID:39545420
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研究论文 | 揭示胰岛素样生长因子2驱动成纤维细胞介导的肿瘤免疫逃逸并导致免疫治疗耐药性 | 首次揭示IGF2在免疫排斥肿瘤中主要由癌症相关成纤维细胞分泌，并通过CXCL12和PD-L1促进CAF与T细胞相互作用，证明IGF2缺陷可增强CD8+ T细胞浸润和细胞毒性 | 未明确说明 | 研究胰岛素样生长因子2在肿瘤免疫排斥和免疫治疗耐药中的作用机制 | 免疫排斥肿瘤中癌症相关成纤维细胞和T细胞 | 机器学习 | 泛癌种 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 不适用 | 空间和单细胞转录组数据 | 使用系统性或成纤维细胞特异性IGF2敲除小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组学，10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 5 | 2026-07-03 |
Lung Tissue Multilayer Network Analysis Uncovers the Molecular Heterogeneity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0500OC
PMID:38626356
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研究论文 | 利用新型多层网络分析方法整合COPD患者肺组织的mRNA、microRNA和甲基化组数据，揭示了与临床特征相关的分子异质性 | 首次采用多层网络模型整合多组学数据识别COPD患者亚群，并结合空间转录组学验证不同亚群的小气道分子差异 | 样本仅限于既往吸烟的COPD患者，可能无法代表所有COPD亚型；需在更大独立队列中验证结果 | 通过无偏整合多组学数据揭示COPD的分子异质性及其与临床特征的关系 | 135名既往吸烟的COPD患者的肺组织样本 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | mRNA测序、microRNA测序、甲基化测序、空间转录组学 | 多层网络优化、机器学习分类器 | 基因表达、microRNA表达、甲基化数据、空间转录组学数据 | 135名COPD患者（主队列）及独立验证队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-07-03 |
SpottedPy quantifies relationships between spatial transcriptomic hotspots and uncovers environmental cues of epithelial-mesenchymal plasticity in breast cancer
2024-11-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03428-y
PMID:39529126
|
研究论文 | SpottedPy量化空间转录组热点关系并揭示乳腺癌上皮-间质可塑性的环境线索 | 开发了Python包SpottedPy，用于识别肿瘤热点并绘制癌症生态系统内的空间相互作用，为探索组织内异质性提供了灵活的工具 | 未提及 | 量化空间转录组热点关系并揭示肿瘤微环境动态 | 乳腺癌肿瘤热点及上皮-间质可塑性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-07-03 |
IAMSAM: image-based analysis of molecular signatures using the Segment Anything Model
2024-11-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03380-x
PMID:39529142
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研究论文 | IAMSAM是一个基于网页的工具，利用Segment Anything Model分析空间转录组学数据，专注于形态学特征 | 首次将Segment Anything Model应用于空间转录组学图像分割，实现基于形态学特征的半自动感兴趣区域选择，并整合下游分析功能 | 未提及 | 开发用户友好的工具，用于空间转录组学数据的形态学特征分析和解释 | 空间转录组学数据中的组织图像和基因表达信息 | 计算机视觉,数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | Segment Anything Model（SAM） | 图像,基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 8 | 2026-07-03 |
Adenine base editors induce off-target structure variations in mouse embryos and primary human T cells
2024-11-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03434-0
PMID:39529170
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序和单细胞RNA-seq分析，探讨了腺嘌呤碱基编辑器在小鼠胚胎和原代人T细胞中诱导脱靶结构变异的情况 | 首次发现腺嘌呤碱基编辑器在小鼠胚胎和原代人T细胞中诱导脱靶结构变异，且脱靶现象在多种细胞类型中普遍存在 | 未对脱靶结构变异的具体分子机制进行深入探讨，且高保真ABE变体的长期安全性仍需进一步验证 | 评估CRISPR/Cas9、腺嘌呤碱基编辑器和胞嘧啶碱基编辑器在基因编辑中的脱靶结构变异风险 | 小鼠胚胎和原代人T细胞 | 机器学习 | NA | 全基因组测序，单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据，转录组数据 | 涉及小鼠胚胎和原代人T细胞，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA-seq，Illumina NovaSeq全基因组测序 |
| 9 | 2026-07-03 |
scDOT: optimal transport for mapping senescent cells in spatial transcriptomics
2024-11-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03426-0
PMID:39516853
|
研究论文 | scDOT利用最优传输将空间转录组数据和单细胞RNA测序数据结合，以构建单细胞分辨率的空间图谱并识别衰老细胞 | 提出scDOT方法，整合最优传输与表达解卷积技术，学习细胞与空间点之间的非线性耦合，用于推断细胞位置 | 未明确提及 | 提高空间转录组数据的单细胞分辨率，识别衰老细胞及其空间组织 | 肺空间转录组数据中的衰老细胞及其邻近细胞 | 计算机视觉 | 肺部疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 最优传输模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-07-03 |
GraphPCA: a fast and interpretable dimension reduction algorithm for spatial transcriptomics data
2024-11-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03429-x
PMID:39511664
|
研究论文 | 提出GraphPCA算法，一种用于空间转录组数据快速可解释降维的准线性方法 | 结合图正则化和主成分分析，开发出可解释且高效的准线性降维算法 | 未明确说明局限 | 解决空间转录组数据高维度和噪声问题，提升下游分析性能 | 模拟和多种平台生成的多分辨率空间转录组数据集 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 图正则化PCA | 基因表达数据 | 模拟及多平台多分辨率空间转录组数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-07-03 |
Genomic insights into the contribution of de novo lipogenesis to intramuscular fat deposition in chicken
2024-11, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.003
PMID:38065407
|
研究论文 | 通过基因组学揭示从头脂肪生成对鸡肌内脂肪沉积的贡献 | 首次通过大规模基因组分析和单细胞RNA测序证实从头脂肪生成是鸡肌内脂肪沉积的重要途径，并鉴定FASN基因为关键调控基因 | 样本仅限于特定品种和性别，可能不能代表所有鸡品种；肌内脂肪沉积的完整调控机制仍有待进一步阐明 | 阐明鸡肌内脂肪沉积的调控机制，为改善鸡肉品质提供策略 | 516只黄羽鸡和3只63日龄雌性JXY鸡的胸肌组织 | 基因组学 | NA | 全基因组重测序、单细胞RNA测序、转录组测序、13C同位素示踪 | NA | 基因组序列、转录组数据、同位素示踪数据 | 516只鸡（全基因组重测序）、3只鸡（单细胞RNA测序）、JXY鸡不同发育阶段胸肌组织（转录组测序） | Illumina | 全基因组测序、单细胞RNA测序、转录组测序 | Illumina NovaSeq | 全基因组重测序、单细胞RNA测序、转录组测序 |
| 12 | 2026-06-30 |
Beyond the Heartbeat: Single-Cell Omics Redefining Cardiovascular Research
2024-11, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-024-02117-3
PMID:39158785
|
综述 | 综述单细胞组学技术在人类心脏各区域的应用进展，揭示细胞多样性、调控网络和疾病机制 | 系统整合单细胞转录组学、基因组学、蛋白质组学、表观基因组学和空间转录组学在心脏研究中的贡献，强调整合单细胞组学在心脏再生、疾病建模和精准医学中的转化潜力 | 未明确说明局限性 | 探索单细胞组学技术在人类心脏研究中的应用，阐明细胞组成、异质性和分子动态 | 人类心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞组学 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 单细胞基因组学, 单细胞蛋白质组学, 单细胞表观基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-26 |
TNFR2 blockade promotes antitumoral immune response in PDAC by targeting activated Treg and reducing T cell exhaustion
2024-11-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008898
PMID:39562007
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研究论文 | 通过阻断TNFR2靶向活化Treg并减少T细胞耗竭，促进胰腺导管腺癌的抗肿瘤免疫应答 | 首次在胰腺导管腺癌中利用单细胞分析揭示TNFR2在Treg、髓系细胞和内皮细胞的表达特征，并发现抗TNFR2单抗选择性靶向活化肿瘤浸润Treg，联合CD40激动剂可增强抗肿瘤效果 | 抗TNFR2单药治疗对CD8+ T细胞激活效果有限，仅轻微抑制肿瘤生长；研究主要在动物模型中进行，临床转化需进一步验证 | 探究TNFR2阻断抗体是否能改变胰腺导管腺癌中Treg与效应T细胞的平衡，从而增强抗肿瘤反应 | 胰腺导管腺癌患者（24例）及原位免疫小鼠模型 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 24例患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 公开单细胞分析数据 |
| 14 | 2026-06-26 |
Bendamustine-rituximab elicits dual tumoricidal and immunomodulatory responses via cGAS-STING activation in diffuse large B-cell lymphoma
2024-11-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009212
PMID:39521616
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研究论文 | 本研究揭示苯达莫司汀-利妥昔单抗通过cGAS-STING通路激活在弥漫大B细胞淋巴瘤中发挥双重肿瘤杀伤和免疫调节作用 | 首次阐明BR疗法通过cGAS-STING依赖途径诱导DLBCL细胞焦亡，并揭示其双重机制——直接杀伤肿瘤与重塑免疫微环境 | 未提及具体局限性 | 探究苯达莫司汀-利妥昔单抗治疗弥漫大B细胞淋巴瘤的分子机制 | 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系及患者样本 | 机器学习 | 淋巴瘤 | RNA-seq, Western blot, Crispr-Cas9, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 未明确说明样本量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-06-26 |
Inhibition of Bruton's tyrosine kinase with PD-1 blockade modulates T cell activation in solid tumors
2024-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169927
PMID:39513363
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研究论文 | 探索布鲁顿酪氨酸激酶抑制剂伊布替尼与PD-1抑制剂纳武单抗联合治疗转移性实体瘤的效果及对T细胞活化的调节作用 | 首次在转移性实体瘤患者中测试伊布替尼与纳武单抗联合治疗，并通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序揭示BTK抑制对髓源性抑制细胞和T细胞功能的调控机制 | 样本量较小（16例），且为探索性分析，缺乏对照组，结果需进一步验证 | 评估伊布替尼与纳武单抗联合治疗转移性实体瘤的安全性和有效性，并探讨其对免疫微环境的影响 | 16例转移性实体瘤患者 | 机器学习 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据、免疫细胞测序数据 | 16例转移性实体瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和T细胞受体测序 |
| 16 | 2026-06-26 |
Preclinical lentiviral hematopoietic stem cell gene therapy corrects Pompe disease-related muscle and neurological manifestations
2024-11-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.09.024
PMID:39295144
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研究论文 | 本研究表明慢病毒载体介导的造血干细胞基因治疗能纠正庞贝病相关肌肉和神经系统病变 | 首次在临床前小鼠模型中证明慢病毒造血干细胞基因治疗可逆转庞贝病的病理效应，并结合整合位点分析和单细胞RNA测序揭示表型纠正机制 | 目前研究仅在临床前小鼠模型中进行，需进一步验证在人体中的安全性和有效性 | 评估慢病毒载体介导的造血干细胞基因治疗在庞贝病临床前模型中的疗效和安全性 | 庞贝病小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 慢病毒载体,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 17 | 2026-06-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals anti-tumor potency of CD56+ NK cells and CD8+ T cells in humanized mice via PD-1 and TIGIT co-targeting
2024-11-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.09.025
PMID:39318093
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研究论文 | 利用改进的人源化小鼠模型结合单细胞RNA测序，揭示通过PD-1和TIGIT双靶向增强CD56+ NK细胞和CD8+ T细胞抗肿瘤效力的机制 | 首次通过构建具有NK细胞重建和浸润能力的人源化小鼠HCC-PDX模型，结合scRNA-seq鉴定胰腺癌潜在治疗靶点，并验证PD-1和TIGIT联合抗体的治疗效力 | 联合治疗后肿瘤转录组发生显著变化，可能产生进一步耐药性，需更多研究验证 | 探究免疫抑制肿瘤微环境中NK细胞和CD8+ T细胞的功能，并验证PD-1和TIGIT联合靶向治疗肝细胞癌的效力 | 人源化小鼠肝细胞癌患者来源异种移植（HCC-PDX）模型中的NK细胞和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源化小鼠模型（具体样本数未提供） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析，Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 18 | 2026-06-26 |
Cancer-associated fibroblasts shape early myeloid cell response to chemotherapy-induced immunogenic signals in next generation tumor organoid cultures
2024-11-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009494
PMID:39500527
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研究论文 | 本研究通过构建包含肿瘤类器官、癌症相关成纤维细胞和单核细胞的下一代肿瘤类器官共培养体系，揭示了CAFs在化疗诱导免疫原性信号后塑造早期髓系细胞应答的机制 | 首次建立了包含原代PDO、患者匹配CAF和单核细胞的复杂共培养系统，能体外模拟TAM样表型，并发现CAFs能增强化疗诱导的肿瘤细胞吞噬活性 | 尚未提及在体动物实验验证，以及共培养体系长期稳定性和临床转化可行性 | 研究癌症相关成纤维细胞在化疗诱导免疫原性信号后对早期髓系细胞应答的调控作用 | 结直肠癌患者来源的原代肿瘤类器官、癌症相关成纤维细胞和单核/巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 结直肠癌患者手术切除标本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 19 | 2026-06-20 |
The advance of single cell transcriptome to study kidney immune cells in diabetic kidney disease
2024-11-16, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03853-y
PMID:39550562
|
综述 | 本文讨论了单细胞转录组学在糖尿病肾病研究中的应用，重点分析了免疫细胞在疾病进展中的作用 | 通过整合单细胞RNA测序研究，提供了对糖尿病肾病中免疫细胞（包括巨噬细胞、T细胞、B细胞等）作用的新视角，为发病机制和免疫治疗策略提供了新见解 | 肾脏结构和功能复杂且异质性高，研究每个细胞类型在病理生理中的功能仍然具有挑战性 | 探讨单细胞转录组学在糖尿病肾病领域的应用，并突出免疫细胞在该疾病中的重要作用 | 糖尿病肾病患者的肾脏活检和尿液样本中的免疫细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-06-19 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the retina under acute high intraocular pressure
2024-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.389363
PMID:38526288
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析急性高眼压下视网膜的细胞组成和分子特征 | 首次揭示高眼压下视网膜的分子变化和细胞间相互作用 | NA | 阐明高眼压下视网膜细胞的分子特征和损伤机制 | 大鼠急性高眼压模型的视网膜细胞 | 机器学习 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |