单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202411-202411] [清除筛选条件]
当前共找到 577 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-07
N-CADHERIN+/CD168- subpopulation determines therapeutic variations of UC-MSCs for cardiac repair after myocardial infarction
2024-11-13, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,鉴定了脐带间充质干细胞中N-CADHERIN+/CD168-亚群在心肌梗死后心脏修复中的关键作用,并揭示了其与治疗疗效差异的关联 首次利用单细胞RNA测序技术识别出UC-MSCs中N-CADHERIN+/CD168-亚群作为促进血管生成的功能亚群,并证实其比例与治疗心肌梗死的疗效正相关 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证;样本量相对有限,且仅针对脐带来源的MSCs 探究间充质干细胞治疗心肌梗死疗效不一致的机制,并筛选出关键功能亚群以提高治疗效果 脐带来源的间充质干细胞(UC-MSCs)及其亚群,以及心肌梗死小鼠模型 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、GSEA分析、Scissor分析、管形成实验、迁移和增殖实验 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质分泌数据、细胞功能实验数据 10,463个UC-MSCs进行单细胞RNA测序,使用不同供体的UC-MSCs治疗心肌梗死小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-02-07
Phenotypic and transcriptomic profiling of induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived NK cells and their cytotoxicity against cancers
2024-11-13, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究开发了一种高效、无饲养层的单层分化方案,从诱导多能干细胞生成自然杀伤细胞,并评估了其表型、转录组特征及对胆管癌和乳腺癌细胞的细胞毒性 开发了一种新的、更高效的无饲养层单层分化方案来生成iNK细胞,避免了传统胚状体培养方案的劳动密集性和异质性,并通过单细胞RNA测序证实了其转录组特征与PB-NK细胞高度相似 NA 开发一种更高效、均一的iPSC来源NK细胞生成方法,并评估其作为'现货'免疫治疗产品的潜力 诱导多能干细胞来源的自然杀伤细胞 NA 胆管癌, 乳腺癌 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 转录组数据, 表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-02-07
High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis
2024-11-10, Statistics in medicine IF:1.8Q1
研究论文 本文提出了一种用于高维非线性因子分析的过离散广义因子模型(OverGFM),以处理过离散混合类型数据,并应用于单细胞测序数据分析 引入额外误差项以捕获因子无法解释的过离散性,并开发了一种结合拉普拉斯和泰勒近似的新型变分EM算法,解决了高维非线性模型中的计算挑战 未明确讨论模型在极端过离散或稀疏数据场景下的鲁棒性,且应用仅限于基因组学领域 开发一种能够处理高维过离散混合类型数据的非线性因子分析方法 过离散混合类型数据,特别是单细胞测序数据 机器学习 NA 单细胞测序 过离散广义因子模型(OverGFM) 混合类型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-01-28
UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma
2024-11-08, ACS infectious diseases IF:4.0Q1
研究论文 本研究揭示了E3泛素连接酶UBR7通过泛素化Sp110蛋白,抑制I型干扰素信号通路,从而促进乙型肝炎病毒(HBV)持续感染和HBV诱导的肝细胞癌(HCC)发生的新机制 首次发现UBR7在非组蛋白(Sp110)泛素化中的新功能,并阐明其通过下调I型干扰素反应促进HBV持续感染和HCC发生的分子机制 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析,缺乏体内动物模型验证;UBR7-Sp110轴在HCC发生发展中的具体调控网络仍需进一步探索 探究UBR7在HBV诱导的肝细胞癌发生中的作用机制 乙型肝炎病毒(HBV)、肝细胞癌(HCC)细胞、HCC患者样本 分子生物学与肿瘤免疫学 肝细胞癌 RNA-Seq、单细胞RNA-Seq、转录组学分析、基因敲低 NA 转录组数据、单细胞转录组数据 HCC患者样本(具体数量未明确说明) NA RNA-Seq、单细胞RNA-Seq NA NA
5 2026-01-28
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集,构建了一个元图谱,旨在识别新的细胞类型、共享标记基因,并达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识 首次系统整合多个独立的小鼠肠道神经系统scRNA-seq数据集,生成共识元图谱,以改善罕见神经元类别的分辨率,并连接转录组谱与历史分类系统 数据集依赖于不同的细胞分离和文库生成方法,可能导致细胞类型检测差异;未来研究需将深度转录组谱与历史分类系统更紧密连接 通过整合scRNA-seq数据集,达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识,并提高罕见神经元类别的检测能力 小鼠肠道神经系统中的神经元 单细胞转录组学 肠道动力障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 多个独立数据集,涉及数百至数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-01-24
Bulk and single-cell RNA-seq analyses reveal canonical RNA editing associated with microglia homeostasis and its role in sepsis-associated encephalopathy
2024-11-12, Neuroscience IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过分析小鼠大脑的bulk和单细胞RNA-seq数据,揭示了与稳态小胶质细胞相关的典型RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的潜在作用 首次将稳态小胶质细胞与RNA编辑联系起来,并探索了其在脓毒症相关脑病中的作用,揭示了不同小胶质细胞亚群间RNA编辑的异质性及其对脂多糖的不同反应 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性有待验证;样本量相对有限(107个样本) 探索稳态小胶质细胞相关的典型RNA编辑及其在脓毒症相关脑病中的潜在作用 小鼠大脑组织和小胶质细胞 生物信息学 脓毒症相关脑病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 107个小鼠大脑组织和小胶质细胞样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
7 2026-01-23
Neuron-glia crosstalk and inflammatory mediators in migraine pathophysiology
2024-11-12, Neuroscience IF:2.9Q2
综述 本文综述了偏头痛病理生理学中神经胶质细胞相互作用和炎症介质的作用机制 整合了细胞和分子层面的神经炎症机制,并强调了如PBR28靶向成像和单细胞测序等新技术在理解偏头痛神经炎症中的突破性应用 作为一篇综述文章,未进行原始研究,主要基于现有文献总结,可能未涵盖所有最新进展 概述偏头痛中神经炎症的机制,并探讨其治疗靶点 偏头痛的神经炎症过程,涉及中枢和外周神经系统的胶质细胞及炎症介质 神经科学 偏头痛 单细胞测序,靶向成像 NA 文献数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-01-21
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了DBiTplus,一种整合成像和测序的空间组学方法,用于在同一组织切片上同时进行空间转录组学和蛋白质谱分析 DBiTplus通过微流体DNA寡核苷酸递送和RNaseH处理,首次实现了测序基空间转录组学与成像基高复用蛋白质谱在同一组织切片上的整合,支持单细胞分辨率细胞分型和基因组尺度生物通路探索 在应用示例中,小鼠胚胎研究使用了有限的蛋白质标记物,可能影响蛋白质谱的全面性 开发一种多模态空间组学方法,以整合空间转录组学和蛋白质谱,促进对异质性细胞过程的理解 小鼠胚胎、正常人淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织 空间组学 淋巴瘤 空间转录组学、空间蛋白质谱、微流体技术、RNaseH处理 NA 空间转录组数据、蛋白质成像数据 包括小鼠胚胎、正常人淋巴结和人类淋巴瘤FFPE组织,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞空间转录组学、空间蛋白质谱 DBiTplus、CODEX DBiTplus结合了测序基空间转录组学和CODEX高复用蛋白质成像技术,使用微流体DNA寡核苷酸进行空间条形码编码
9 2026-01-16
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-11, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1
综述 本文综述了单细胞等位基因特异性表达(ASE)数据的计算处理方法,包括从原始读取到统计分析的完整流程 系统总结了单细胞ASE分析的计算方法,并强调了集成优化生物信息学流程和统计方法进一步发展的需求 作为综述文章,未提出新的实验数据或算法,主要基于现有文献进行归纳 综述单细胞等位基因特异性表达的计算分析方法及其在生物学问题中的应用 单细胞RNA测序数据中的等位基因特异性表达 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-01-15
Single-cell spatial transcriptomics of fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发并优化了一种基于成像的单细胞空间转录组学框架,用于分析存档的福尔马林固定石蜡包埋活检样本,以揭示结肠炎相关的细胞网络 首次对三种能够分析FFPE样本的单细胞空间转录组学平台进行全面基准比较,并开发了一个统一的处理流程,成功应用于长达5年历史的临床存档样本 研究样本量相对有限(n=57),且仅针对炎症性肠病,可能限制了结果的普遍适用性 开发一个稳健的框架,将基于成像的单细胞空间转录组学应用于存档的临床FFPE黏膜活检样本,以研究炎症性肠病的细胞网络 来自非IBD对照和溃疡性结肠炎患者的FFPE黏膜活检样本 数字病理学 炎症性肠病 单细胞空间转录组学 NA 空间转录组数据 57例FFPE黏膜活检样本(包括9例非IBD对照和11例溃疡性结肠炎患者) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium 自定义290-plex Xenium基因面板
11 2026-01-14
Wnt 3a-Modified Scaffolds Improve Nerve Regeneration by Boosting Schwann Cell Function
2024-11-20, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析发现Wnt信号通路可促进修复型雪旺细胞转化,并开发了一种负载Wnt3a蛋白的聚合物支架,在大鼠坐骨神经缺损模型中验证了其优异的神经修复效果 首次结合单细胞测序技术阐明Wnt通路在周围神经再生中的作用机制,并创新性地将Wnt3a蛋白整合到电纺纤维支架表面 研究仅在大鼠动物模型中进行验证,尚未开展临床转化研究 探索通过调控雪旺细胞功能促进周围神经再生的新策略 雪旺细胞、大鼠坐骨神经缺损模型 组织工程与再生医学 周围神经损伤 单细胞测序、电纺丝技术、动物模型实验 NA 测序数据、组织学数据、电生理数据 大鼠坐骨神经缺损模型(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-01-14
Actin Dysregulation Induces Neuroendocrine Plasticity and Immune Evasion: A Vulnerability of Small Cell Lung Cancer
2024-Nov-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了CRACD作为肿瘤抑制因子,通过调控肌动蛋白聚合来限制小细胞肺癌的神经内分泌可塑性和免疫逃逸,并提出EZH2阻断作为潜在治疗策略 首次将CRACD与SCLC的神经内分泌可塑性和免疫逃逸机制联系起来,并通过单细胞转录组学验证了其在患者肿瘤中的临床相关性 研究主要基于基因敲除模型和体外实验,临床样本验证和体内治疗效果的长期数据可能有限 探究小细胞肺癌中肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的分子机制 小细胞肺癌肿瘤细胞、CRACD基因、NOTCH1信号通路、EZH2介导的组蛋白修饰 癌症生物学 肺癌 单细胞转录组学、基因敲除、药理学阻断 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-01-10
Neuroepithelial cell transforming 1 as a key regulator in non-small cell lung cancer: unveiling causal links and therapeutic potentials
2024-Nov-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验室实验,探索了神经上皮细胞转化基因1(NET1)在非小细胞肺癌(NSCLC)进展中的关键调控作用及其治疗潜力 结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和孟德尔随机化(MR)算法,首次揭示了NET1与NSCLC之间的因果关系,并验证了其在细胞增殖和抑制铁死亡中的作用,同时通过分子对接分析识别了潜在治疗化合物 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证,且分子对接结果需实验确认 揭示NSCLC进展的分子机制,并探索潜在的治疗靶点和药物 非小细胞肺癌(NSCLC)相关基因和细胞过程 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)、qRT-PCR、细胞活力测定、MDA检测、分子对接 NA 基因表达数据、细胞实验数据 未明确指定样本数量,但涉及非恶性肺组织和肿瘤的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2025-12-24
Spatial, transcriptomic, and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-11-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过多物种方法,结合空间转录组学和表观基因组学分析,揭示了背角神经元在慢性疼痛遗传易感性中的作用 首次整合了猕猴、人类和小鼠的单核RNA测序数据,构建了物种保守的神经元亚型图谱,并利用空间转录组学确定了神经元亚型的精确层状位置,同时通过单核开放染色质图谱将慢性疼痛GWAS变异与神经元亚型特异性调控区域联系起来 研究主要基于动物模型(猕猴和小鼠),在人类样本中的直接验证有限,且慢性疼痛的遗传机制可能涉及更复杂的调控网络 探究慢性疼痛遗传易感性变异是否影响背角神经元的调控基因组学 背角神经元 数字病理学 慢性疼痛 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学、单核开放染色质分析 NA 转录组数据、表观基因组数据、空间转录组数据 涉及猕猴、人类和小鼠的多物种数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单核RNA-seq、空间转录组学、单核开放染色质分析 NA NA
15 2025-12-24
The MRAP2 accessory protein directly interacts with melanocortin-3 receptor to enhance signaling
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单分子下拉技术证实了MC3R与MRAP2的相互作用,并揭示了MRAP2如何增强MC3R信号传导,从而在能量稳态中发挥关键作用 首次使用单分子下拉技术确认MC3R与MRAP2的相互作用,并发现它们以1:1化学计量形成异二聚体,同时通过结构模型和突变分析揭示了关键相互作用残基 研究主要在HEK293细胞中进行,可能无法完全反映体内复杂环境,且功能分析集中于cAMP信号通路,其他信号途径的影响未全面探讨 探究MRAP2对MC3R信号传导的调节机制及其在能量稳态中的作用 MC3R受体、MRAP2辅助蛋白及其在HEK293细胞和人类下丘脑神经元中的相互作用 分子生物学 肥胖症 单分子下拉技术、荧光光漂白分析、单核转录组学、空间转录组学、结构同源建模、丙氨酸诱变 NA 细胞实验数据、转录组数据、结构模型数据 HEK293细胞系及人类下丘脑神经元样本 NA 单核转录组学, 空间转录组学 NA NA
16 2025-12-11
A deep neural network to de-noise single-cell RNA sequencing data
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为ZiPo的深度人工神经网络,用于估计单细胞RNA测序数据中的零膨胀率和预测文库大小,以解决测量丢失问题 ZiPo引入了可调节的零膨胀分布来捕获丢失事件,并采用尺度不变损失项使权重稀疏,从而提高模型的生物可解释性 处理时间与细胞数量成正比,可能在大规模数据集上存在计算效率限制 开发一种深度神经网络来去噪单细胞RNA测序数据,改善数据分析和细胞类型发现 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度人工神经网络,深度自编码器 基因表达数据 三个数据集(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2025-12-09
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究探讨了通过靶向CD28H特异性表位来激活NK细胞,增强其对肿瘤细胞的杀伤活性,并克服HHLA2和HLA-E的抑制信号 揭示了靶向CD28H特定表位的单克隆抗体能强烈激活NK细胞的钙流和细胞活性,并首次在透明细胞肾癌中通过scRNA-seq分析发现CD28H NK细胞浸润HHLA2阳性肿瘤 研究主要基于体外实验和细胞系模型,缺乏体内动物模型验证;样本量有限,仅涉及透明细胞肾癌的scRNA-seq分析 探索CD28H作为NK细胞新型激活靶点在抗肿瘤免疫治疗中的潜力 NK细胞、造血细胞系、透明细胞肾癌细胞 免疫学 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及透明细胞肾癌细胞的scRNA-seq分析 NA 单细胞RNA测序 NA NA
18 2025-11-29
Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling
2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
综述 本文总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的现状,探讨了技术挑战、现有研究成果和未来研究方向 首次系统性地总结了嗜酸性粒细胞转录谱研究的各种方法,提出了统一技术标准和跨研究比较的重要性 嗜酸性粒细胞存在细胞脆弱性和RNA提取困难等技术挑战,人类样本研究相对有限 建立统一的嗜酸性粒细胞转录特征,提高嗜酸性粒细胞相关疾病的诊断和治疗精准度 小鼠和人类嗜酸性粒细胞 单细胞组学 嗜酸性粒细胞相关疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
19 2025-11-29
Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2024-11-27, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过空间转录组学技术构建儿童狼疮性肾炎肾脏组织的单细胞分辨率图谱,揭示肾脏基质细胞与浸润免疫细胞间的复杂相互作用 首次在单细胞分辨率下结合空间信息分析儿童狼疮性肾炎肾脏组织,发现了免疫细胞特异性定位模式和基因表达的空间依赖性 样本量较小(8例患者和4例对照),组织学评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱 解析儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 儿童狼疮性肾炎患者和对照个体的肾脏组织 空间转录组学 狼疮性肾炎 空间转录组学,单细胞转录组学 NA 空间转录组数据,单细胞转录组数据 8例儿童狼疮性肾炎患者,4例对照个体 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
20 2025-11-17
Lung Tissue Multilayer Network Analysis Uncovers the Molecular Heterogeneity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Nov-15, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 通过多层网络分析整合肺组织多组学数据,揭示慢性阻塞性肺疾病的分子异质性 首次采用多层网络方法整合mRNA、microRNA和甲基化组数据,识别出具有不同分子特征但临床表现相似的COPD患者亚群 研究样本仅包含135名前吸烟COPD患者,需要更大规模验证 揭示COPD的分子异质性及其与临床特征的关系 135名前吸烟COPD患者的肺组织样本 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 mRNA测序,microRNA测序,甲基化测序,空间转录组学 机器学习模型,多层网络分析 分子组学数据,临床数据 135名前吸烟COPD患者 NA 空间转录组学,单组学分析 NA NA
回到顶部