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当前共找到 579 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Early autonomous patterning of the anteroposterior axis in gastruloids
2024-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202171
PMID:39552366
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠类胚体中前后轴早期自主模式形成 | 首次揭示了类胚体在无外部信号引导下自主建立前后轴极化的早期分子事件，包括T+和T-群体的细胞状态转变和转录特征，并发现该过程对聚集大小变化具有稳健性 | 尽管类胚体与小鼠胚胎在转录上具有相似性，但初始多能细胞状态差异明显，可能影响早期发育模拟的准确性 | 解析小鼠类胚体中前后轴建立的早期动态过程，特别是外部Wnt刺激前的细胞命运空间限制和转录变化 | 小鼠胚胎干细胞聚集形成的类胚体 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 多个小鼠类胚体样本，未具体说明数量 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2 | 2026-05-15 |
CosGeneGate selects multi-functional and credible biomarkers for single-cell analysis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae626
PMID:39592241
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研究论文 | 提出CosGeneGate模型，用于单细胞分析中选择多功能且可信的生物标志物 | 结合细胞类型分类准确性和标志基因特异性表达模式的优点，选择非冗余且具有细胞类型特异性表达模式的标志基因 | 未明确说明局限性 | 开发更有效的标志基因选择方法，以改善单细胞测序分析中的细胞类型区分 | 人类主要细胞类型和组织 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | CosGeneGate | 基因表达数据 | 使用公开数据集和新测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-08 |
Definition of regulatory elements and transcription factors controlling porcine immune cell gene expression at single cell resolution using single nucleus ATAC-seq
2024-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110944
PMID:39326643
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研究论文 | 使用单核ATAC-seq技术解析猪外周血单个核细胞在单细胞分辨率下的调控元件和转录因子 | 首次通过snATAC-seq全面绘制猪PBMC的开放染色质图谱，揭示了顺式调控元件及其对转录的贡献机制，并预测了控制差异表达基因的转录因子 | 未提及 | 揭示猪PBMC基因表达的顺式调控机制和转录因子调控网络 | 猪外周血单个核细胞 | 机器学习和深度学习（通过聚类分析、TFBM分析和CCAN构建） | NA | snATAC-seq | NA（文中未明确指定具体模型类型，但涉及聚类分析和调控网络构建） | 染色质开放区域测序数据 | 猪外周血单个核细胞样本，具体数量未说明 | 未明确说明，但可能涉及Illumina（文库测序常见平台） | snATAC-seq | NA（未提及具体产品） | NA（未提及具体配置细节） |
| 4 | 2026-05-08 |
Methionine restriction reduced growth performance and exacerbated lipid deposition in hybrid grouper (Epinephelus fuscoguttatus ♀ × E. lanceolatus ♂) under high-lipid diets by suppressing the lipid degradation pathways with the single-cell RNA-seq analysis
2024-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110960
PMID:39536957
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析，研究低蛋氨酸水平对高脂饲料下杂交石斑鱼肝脏脂质代谢的影响 | 首次利用单细胞RNA-seq技术解析蛋氨酸限制如何通过抑制肝脏实质细胞中的脂质降解途径导致杂交石斑鱼在高脂饲料下脂质沉积加剧 | 未提及具体局限性 | 探究蛋氨酸限制在高脂饲料条件下对杂交石斑鱼生长性能和肝脏脂质代谢的影响机制 | 杂交石斑鱼（棕点石斑鱼♀×鞍带石斑鱼♂）的肝脏细胞 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 杂交石斑鱼肝脏组织样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 5 | 2026-05-07 |
Understanding isoform expression by pairing long-read sequencing with single-cell and spatial transcriptomics
2024-11-20, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279640.124
PMID:39567235
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综述 | 本文综述了将长读长测序与单细胞和空间转录组学结合以理解RNA异构体表达的方法、挑战和机遇 | 系统总结了单细胞和空间长读长测序技术的最新进展，并讨论了它们在理解转录本异构体在发育和病理中作用的应用 | 这些技术在实施和数据解释方面存在挑战，且对RNA异构体生物学作用的理解仍然有限 | 概述单细胞和空间长读长测序技术的出现，讨论其挑战和限制，并强调其在理解异构体表达中的潜力 | RNA异构体表达及其在发育和病理中的角色 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-07 |
Characterizing Fibroblast Heterogeneity in Diabetic Wounds Through Single-Cell RNA-Sequencing
2024-Nov-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12112538
PMID:39595104
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术表征糖尿病创面中成纤维细胞的异质性 | 本文系统总结单细胞测序技术革新如何改变成纤维细胞分析策略，并聚焦于表征不同成纤维细胞亚群及其谱系 | 未提及具体局限性 | 探讨单细胞RNA测序在糖尿病创面愈合研究中的应用，特别是成纤维细胞异质性的表征 | 糖尿病创面中的成纤维细胞 | 自然语言处理 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-05-06 |
Integrated analyses of multi-omic data derived from paired primary lung cancer and brain metastasis reveal the metabolic vulnerability as a novel therapeutic target
2024-11-26, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01410-8
PMID:39593114
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研究论文 | 对配对的原发性肺癌和脑转移样本进行多组学整合分析，揭示代谢脆弱性作为新型治疗靶点 | 整合基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和单细胞RNA测序数据，发现脑转移瘤中线粒体特异性代谢激活而免疫微环境抑制，并提出氧化磷酸化靶向联合免疫治疗的新策略 | 未提及明显局限性，但样本规模有限且主要基于回顾性队列 | 揭示肺癌脑转移的分子机制和肿瘤微环境，寻找新的治疗靶点 | 154名患者的配对和未配对原发性肺癌及脑转移样本，涵盖四个已发表和两个新生成的队列 | 数字病理学 | 肺癌 | NGS, RNA-seq, 蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、单细胞RNA测序数据 | 154名患者的配对和未配对样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-05-06 |
Integrated single-cell analysis reveals distinct epigenetic-regulated cancer cell states and a heterogeneity-guided core signature in tamoxifen-resistant breast cancer
2024-11-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01407-3
PMID:39558215
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析，揭示了他莫昔芬耐药乳腺癌中表观遗传调控的癌细胞状态和异质性核心特征 | 首次整合单细胞转录组和染色质可及性分析，全面描绘他莫昔芬耐药乳腺癌的肿瘤异质性，并定义了特定癌细胞状态和异质性核心特征 | 未提及明显的局限性信息 | 探索他莫昔芬耐药乳腺癌中肿瘤异质性的表观遗传调控机制 | 他莫昔芬耐药乳腺癌患者肿瘤组织及正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序， 单细胞ATAC测序， 整合分析 | NA | 单细胞转录组数据， 单细胞染色质可及性数据 | 超过80,000个乳腺组织细胞，来自2个正常组织、3个原发性肿瘤和3个他莫昔芬治疗后复发肿瘤 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序， 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'， 10x Chromium Single Cell ATAC |
| 9 | 2026-05-06 |
Efficacy and safety of novel multiple-chain DAP-CAR-T cells targeting mesothelin in ovarian cancer and mesothelioma: a single-arm, open-label and first-in-human study
2024-11-15, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01405-5
PMID:39548510
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研究论文 | 本研究评估了靶向间皮素的新型多链DAP-CAR-T细胞在卵巢癌和间皮瘤中的安全性和有效性，并进行了首次人体临床试验 | 首次在人体中验证多链DAP-CAR结构（结合NK细胞免疫球蛋白样受体截短体和DAP12）可增强CAR-T细胞对实体瘤的安全性和疗效，并通过单细胞测序揭示治疗过程中免疫细胞动态变化 | 单臂、开放标签设计可能导致偏倚；样本量较小（仅8例患者）；未设对照组；长期疗效和毒性数据尚不充分 | 评估靶向MSLN的多链DAP-CAR-T细胞疗法在MSLN阳性实体瘤（卵巢癌和间皮瘤）中的安全性和抗肿瘤疗效 | 间皮素阳性卵巢癌和间皮瘤患者 | 细胞治疗、肿瘤免疫学 | 卵巢癌、间皮瘤 | CAR-T细胞治疗、单细胞测序 | DAP-CAR-T细胞（多链结构） | 单细胞转录组数据、临床疗效数据 | 8例MSLN表达阳性的患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于分析患者治疗过程中免疫细胞动态 |
| 10 | 2026-04-25 |
[Current applications and translational prospects of omics technologies in urothelial carcinoma]
2024-Nov-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
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综述 | 本文综述了组学技术在尿路上皮癌诊断和治疗中的当前应用与转化前景 | 结合国家关键策略，深入探讨组学技术如何推动尿路上皮癌诊疗的新发展，包括单细胞组学和空间转录组学在细胞异质性和肿瘤微环境中的新见解 | 尚未提及具体局限性 | 探讨组学技术在尿路上皮癌诊疗中的应用和转化前景 | 尿路上皮癌 | 机器学习 | 尿路上皮癌 | 组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-04-22 |
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-11, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03911-3
PMID:38886331
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研究论文 | 本研究采用单细胞RNA测序技术，探讨了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值及其对疾病进展的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRAF和RAS基因在甲状腺乳头状癌中的上调表达模式，并阐明了这些突变与肿瘤微环境中免疫相关通路改变的复杂相互作用 | 未明确说明样本的具体数量及临床随访数据，可能限制了预后评估的统计学效力 | 评估BRAF和RAS突变对甲状腺乳头状癌患者预后的影响，探索其分子机制 | 甲状腺乳头状癌组织样本及正常对照样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-11, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-04-22 |
Annexin A1: a key regulator of T cell function and bone marrow adiposity in aplastic anaemia
2024-11, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP286148
PMID:39373986
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研究论文 | 本研究探讨了Annexin A1（ANXA1）在调节T细胞功能中的作用及其在再生障碍性贫血（AA）中骨髓脂肪化的意义 | 首次通过单细胞测序分析揭示了ANXA1在AA中下调如何驱动CD8 T细胞过度激活，进而通过IFN-γ分泌促进骨髓脂肪化，并证明ANXA1过表达可抑制该过程 | 未明确说明样本量大小，且研究主要基于相关性分析，需要进一步的功能性实验验证ANXA1的治疗效果 | 阐明ANXA1在再生障碍性贫血免疫微环境和骨髓脂肪化中的调控机制 | 再生障碍性贫血患者和健康个体的骨髓组织，重点关注T细胞亚群和骨髓间充质干细胞 | 单细胞测序分析 | 再生障碍性贫血 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-04-22 |
Single-Cell View of Tumor Microenvironment Gradients in Pleural Mesothelioma
2024-Nov-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0017
PMID:38959428
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，首次构建了胸膜间皮瘤肿瘤微环境的全面细胞图谱，并识别出与不良预后相关的癌症内在程序、胎儿样内皮细胞群以及NKG2A:HLA-E相互作用作为新的治疗靶点 | 首次创建胸膜间皮瘤的单细胞RNA测序图谱，发现与生存预测相关的基因程序、新型胎儿样内皮细胞群，并验证NKG2A阻断作为免疫治疗新策略 | NA | 改善对胸膜间皮瘤肿瘤微环境的理解，以提升免疫治疗反应 | 胸膜间皮瘤的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-04-20 |
Single-cell integration reveals metaplasia in inflammatory gut diseases
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07571-1
PMID:39567783
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研究论文 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集，构建了一个健康的胃肠道参考图谱，并揭示了肠道炎症疾病中上皮细胞化生的起源和机制 | 开发了自动化质量控制方法scAutoQC，整合了25个单细胞RNA测序数据集，构建了包含约110万个细胞和136种精细细胞状态的健康参考图谱，并首次发现肠道炎症疾病中干细胞来源的上皮细胞化生与幽门腺和布伦纳腺细胞的转录相似性 | 研究主要基于现有数据集整合，可能受数据异质性和样本来源限制，未涉及所有胃肠道疾病类型 | 构建健康的胃肠道单细胞参考图谱，并探究炎症性肠道疾病中的细胞变化机制 | 健康个体和胃肠道疾病患者（包括胃肠道癌症、乳糜泻、溃疡性结肠炎和克罗恩病）的胃肠道组织样本 | 数字病理学 | 肠道炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 385个样本来自189名健康对照，整合数据集总计约160万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-04-20 |
A spatial human thymus cell atlas mapped to a continuous tissue axis
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07944-6
PMID:39567784
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研究论文 | 本研究通过建立胸腺的皮质-髓质轴形态学框架，结合多模态单细胞图谱、空间转录组学和高分辨率多重成像数据，绘制了人类胸腺在胎儿和早期出生后阶段的空间细胞图谱 | 提出了胸腺的皮质-髓质轴定量形态学框架，并首次将其应用于多模态数据以揭示胸腺细胞发育的时空动态 | 研究主要关注胎儿和早期出生后阶段，可能未涵盖成年或老年胸腺的变化 | 旨在绘制人类胸腺在发育过程中的空间细胞图谱，以深入理解T淋巴细胞发育的微解剖基础 | 人类胸腺组织，包括胸腺细胞和胸腺上皮细胞等细胞类型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，高分辨率多重成像，单细胞分析 | NA | 图像，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-04-19 |
A prenatal skin atlas reveals immune regulation of human skin morphogenesis
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08002-x
PMID:39415002
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研究论文 | 本研究构建了一个全面的人类产前皮肤多组学参考图谱，揭示了先天免疫细胞（如巨噬细胞）通过与皮肤非免疫细胞的相互作用，在皮肤形态发生（如毛囊形成、无瘢痕伤口愈合和血管生成）中发挥关键作用 | 首次系统性地整合单细胞和空间转录组学数据，构建了人类产前皮肤（7-17周）的多组学图谱，明确了巨噬细胞等免疫细胞在皮肤形态发生中的非免疫功能，并通过干细胞来源的皮肤类器官模型验证了巨噬细胞对内皮细胞发育的调控作用 | 皮肤类器官模型缺乏免疫细胞，且内皮细胞的异质性和数量显著减少，限制了其在完整模拟体内皮肤微环境方面的应用 | 探究先天免疫细胞（特别是巨噬细胞）在人类皮肤形态发生中的功能，超越其传统的免疫作用 | 人类产前皮肤（7-17孕周）、人胚胎干细胞和诱导多能干细胞来源的皮肤类器官、成人皮肤 | 单细胞组学与空间转录组学 | 皮肤发育与遗传性毛发/皮肤疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、多组学整合分析 | 皮肤类器官模型 | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 | 人类产前皮肤样本（7-17孕周），具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-18 |
A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06806-x
PMID:38057666
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术，首次在时空维度上详细描绘了人类胚胎肢体的发育过程 | 首次构建了人类胚胎肢体发育的时空细胞图谱，发现了新的细胞群体，揭示了肌肉发育的两波浪潮，并识别出维持肌肉干细胞身份的关键转录抑制因子MSC | 研究主要基于胚胎样本，对更早期或更晚期发育阶段的覆盖可能有限，且跨物种比较仅涉及小鼠 | 深入表征人类胚胎肢体发育的细胞和分子机制 | 人类胚胎肢体组织 | 空间转录组学 | 先天性肢体畸形（如短指症、多并指症） | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据 | 人类胚胎肢体样本（具体数量未明确说明），以及小鼠胚胎肢体样本用于跨物种比较 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Visium | 使用VisiumStitcher工具整合多个解剖学连续的空间转录组样本，以绘制整个胎儿后肢矢状切面的细胞图谱 |
| 19 | 2026-04-18 |
A multi-omic atlas of human embryonic skeletal development
2024-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08189-z
PMID:39567793
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研究论文 | 本研究通过整合转录组、表观遗传和空间转录组数据，构建了人类胚胎骨骼发育的多组学图谱，揭示了骨和关节形成中的细胞状态、调控网络和疾病机制 | 首次应用配对转录和表观遗传分析结合空间转录组学，建立了人类胚胎关节和颅骨发育的多组学图谱，并开发了新工具ISS-Patcher和SNP2Cell用于空间定位和疾病关联分析 | 研究仅覆盖受孕后5至11周的胚胎发育阶段，样本时间范围有限，且依赖于计算模拟预测细胞起源和疾病机制，需要实验验证 | 揭示人类胚胎骨骼发育中细胞命运决定的调控机制，并关联多基因性状如骨关节炎 | 人类胚胎骨骼组织，包括关节和颅骨，涉及约336,000个核滴样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | 轨迹分析, 调控网络建模 | 转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 约336,000个核滴样本，覆盖受孕后5至11周的人类胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-15 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-11, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
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研究论文 | 本研究通过大规模测序数据和CRISPRi实验，揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中广泛存在的转座子失调及其与神经炎症的关联 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统表征了转座子表达数量性状位点，并通过CRISPRi实验验证了特定转座子对C1QTNF4基因表达的神经元特异性抑制作用 | 研究主要基于三个脑库的数据，样本代表性可能有限，且CRISPRi实验仅在iPSC衍生神经元中进行，未涵盖其他脑细胞类型 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座子失调的遗传调控机制及其在疾病中的作用 | 人类阿尔茨海默病患者的衰老脑组织样本及iPSC衍生神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序、全基因组测序、CRISPR干扰 | 数量性状位点分析 | 基因组数据、转录组数据 | 基于三个人类AD脑库的大规模样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全基因组测序 | NA | NA |