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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
SDePER: a hybrid machine learning and regression method for cell-type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2024-Oct-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03416-2
PMID:39402626
|
研究论文 | 开发了一种结合机器学习和回归的混合方法SDePER，用于空间条形码转录组数据的细胞类型解卷积 | 提出混合机器学习和回归方法，解决ST与scRNA-seq数据间的平台效应，同时处理稀疏性和空间相关性 | NA | 开发空间转录组数据细胞类型解卷积方法 | 空间条形码转录组数据和参考单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 混合机器学习与回归模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 模拟数据和四个真实数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
Characterization of HPV6/11-reactive T-cell subsets in papillomas of patients with juvenile-onset recurrent respiratory papillomatosis and identification of HPV11 E7-specific candidate TCR clonotypes
2024-Oct-22, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00677-24
PMID:39258910
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和RNA微阵列技术，表征了青少年发病型复发性呼吸道乳头状瘤病(JORRP)患者乳头状瘤中HPV6/11反应性T细胞亚群，并鉴定了HPV11 E7特异性候选TCR克隆型 | 首次发现IFN-γ+ CD8+组织驻留记忆T细胞在JORRP乳头状瘤中扩增并与疾病严重程度负相关，并成功鉴定出HPV11 E7特异性候选TCR克隆型 | 研究样本量有限，主要聚焦于HPV11 E7抗原，未涵盖所有HPV6/11抗原表位 | 阐明JORRP患者乳头状瘤中HPV特异性T细胞免疫应答机制 | 青少年发病型复发性呼吸道乳头状瘤病(JORRP)患者的乳头状瘤组织 | 免疫学 | 呼吸道乳头状瘤病 | 单细胞RNA测序, RNA微阵列, T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | JORRP患者乳头状瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达谱分析 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-07 |
Comprehensive multi-omics integration uncovers mitochondrial gene signatures for prognosis and personalized therapy in lung adenocarcinoma
2024-Oct-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05754-y
PMID:39434164
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研究论文 | 通过整合多组学数据开发基于线粒体相关基因的预后模型，用于肺腺癌的预后评估和个性化治疗 | 首次将单细胞RNA测序与转录组数据结合，聚焦线粒体相关基因，开发AI驱动的预后特征模型 | 基于公开数据库的回顾性分析，需要前瞻性研究验证 | 阐明线粒体相关基因在肺腺癌中的预后价值并开发个性化治疗策略 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | 集成机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | TCGA-LUAD数据集及多个独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.08.005
PMID:39122180
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学探索小鼠睑板腺功能障碍中细胞组成、分化和基因表达的变化 | 首次结合单细胞和空间转录组学揭示睑板腺细胞分化过程中脂质生成基因的层次表达模式，以及年龄和Awat2基因缺失对腺体功能的影响 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探究年龄和功能障碍对睑板腺群体动态的影响机制 | 野生型C57Bl/6小鼠和Awat2基因敲除小鼠的睑板腺组织 | 空间转录组学 | 睑板腺功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 年轻(6月)和老年(22月)野生型小鼠，年轻(3月)和老年(13月)Awat2 KO小鼠 | Resolve Biosciences | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Molecular Cartography | 100基因睑板腺特异性Molecular Cartography面板 |
| 165 | 2025-10-07 |
YY1 knockout in pro-B cells impairs lineage commitment, enabling unusual hematopoietic lineage plasticity
2024-Oct-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351734.124
PMID:39362773
|
研究论文 | 本研究通过敲除YY1转录因子，揭示了其在B细胞谱系定向中的关键作用及其缺失导致的异常造血谱系可塑性 | 首次发现YY1敲除可消除B细胞谱系定向，使前B细胞获得生成T细胞等多系造血细胞的能力 | 研究主要基于小鼠模型，在人类细胞中的适用性尚需验证 | 探究YY1转录因子在B细胞谱系定向和造血发育中的调控机制 | 小鼠前B细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 基因敲除，单细胞RNA测序，ChIP-seq，scATAC-seq | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，scATAC-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-03-01 |
Single-cell RNA sequencing data identify a conserved population of metallothionein-expressing macrophages that may be ubiquitous in vital human organs
2024-Oct, Clinical and translational discovery
DOI:10.1002/ctd2.348
PMID:40018369
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2025-10-07 |
MCAM is a prognostic biomarker in patients with liver cirrhosis and HCC
2024-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000532
PMID:39992088
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研究论文 | 本研究评估了可溶性黑色素瘤细胞粘附分子(sMCAM)作为肝硬化和肝细胞癌患者预后血液生物标志物的潜力 | 首次发现sMCAM在肝纤维化和HCC患者血液中水平升高，并证明其作为预后生物标志物的价值 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 评估sMCAM作为肝硬化和HCC患者预后血液生物标志物的临床应用价值 | 健康对照者、慢性肝病患者、肝硬化患者和肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 组织图像, 血液样本 | 健康对照8例, 慢性肝病66例, 肝硬化236例, 肝细胞癌72例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-07 |
Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer
2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06010-y
PMID:39460820
|
研究论文 | 通过遗传推断和单细胞表达分析探索心力衰竭与乳腺癌的潜在遗传靶点 | 整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，首次系统揭示ITM2B基因在乳腺癌中的功能作用 | 研究样本量未明确说明，体外实验仅针对MCF7细胞系，缺乏体内验证 | 探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点并验证其因果关系 | 心力衰竭和乳腺癌相关的遗传变异及ITM2B基因 | 生物信息学 | 乳腺癌,心血管疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2025-02-21 |
Microfluidic Chip-Based Automatic System for Sequencing Patient-Derived Organoids at the Single-Cell Level
2024-10-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05111
PMID:39399894
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于微流控芯片的自动系统MASSO，用于在单细胞水平上对患者来源的类器官进行测序 | MASSO系统通过在单一微流控芯片上执行所有必要步骤，避免了珍贵PDO的损失，并确保了单PDO细胞的全基因组扩增的高质量，自动化操作过程消除了人为错误，提高了数据重复性 | NA | 解决现有单细胞测序技术在处理临床组织样本来源的PDO时效率低下的问题 | 患者来源的类器官（PDOs） | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2025-02-21 |
DEPICT-seq: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Rare Cell Subsets Isolated via Nucleic Acid Cytometry
2024-10-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03075
PMID:39287475
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DEPICT-seq的高通量液滴核酸细胞计数方法，用于分离和分析基于核酸标记的稀有细胞亚群 | DEPICT-seq方法结合了批量细胞固定、双乳液数字PCR细胞分选和单细胞分辨率下的全长转录组分析，能够针对感兴趣的核酸标记进行细胞分选和转录组分析 | NA | 开发一种能够深入分析稀有细胞亚群的方法，以理解组织生理学和病理学 | 稀有细胞亚群，特别是T细胞受体（TCR）工程化的T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 双乳液数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2025-10-07 |
CBX1 is involved in hepatocellular carcinoma progression and resistance to sorafenib and lenvatinib via IGF-1R/AKT/SNAIL signaling pathway
2024-Oct, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-024-10696-0
PMID:38769286
|
研究论文 | 本研究探讨CBX1在肝细胞癌进展及对索拉非尼和乐伐替尼耐药性中的作用机制 | 首次揭示CBX1通过IGF-1R/AKT/SNAIL信号通路促进肝细胞癌进展和酪氨酸激酶抑制剂耐药性的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，需要进一步临床验证 | 探究CBX1在泛癌及肝细胞癌中的表达特征、功能作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织、癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western Blotting、免疫组化、组织芯片、CCK-8、集落形成、Transwell侵袭、划痕实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 肝细胞癌组织及癌旁组织、多种癌细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-10-07 |
Association between premature vascular smooth muscle cells senescence and vascular inflammation in Takayasu's arteritis
2024-Oct-21, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225630
PMID:38816066
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研究论文 | 本研究探讨高安氏动脉炎中血管平滑肌细胞早衰与血管炎症之间的关联 | 首次揭示IL-6-线粒体STAT3-MFN2信号通路驱动血管平滑肌细胞衰老的分子机制 | 样本来源于手术患者，可能存在选择偏倚；体外实验结果需在更大样本中验证 | 探究高安氏动脉炎中血管平滑肌细胞衰老是否参与血管炎症过程 | 高安氏动脉炎患者的血管手术样本和原代血管平滑肌细胞 | 分子病理学 | 高安氏动脉炎 | 组织学检测、bulk RNA-Seq、单细胞RNA-seq、体外实验、离体实验 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 高安氏动脉炎患者血管手术样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal potent extrafollicular B cell response linked with granzyme K+ CD8 T cell activation in lupus kidney
2024-Oct-17, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225876
PMID:39419536
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了狼疮性肾炎肾脏中滤泡外B细胞反应与GZMK+ CD8 T细胞活化的关联机制 | 首次在单细胞水平系统描绘狼疮性肾炎肾脏适应性免疫景观，发现肾脏特异性IGHG4-59克隆扩增和GZMK+ CD8 T细胞与ABCs通过II型干扰素通路的相互作用 | 样本量有限，主要基于相关性分析，功能验证需要进一步深入 | 探索活动性狼疮性肾炎患者肾脏特异性适应性免疫景观 | 狼疮性肾炎患者的肾脏和配对外周血B、T细胞，以及匹配对照的外周血细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA/BCR/TCR测序，流式细胞术，ATAC-seq，多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据，BCR/TCR序列数据，表观遗传数据，蛋白质表达数据 | 活动性狼疮性肾炎患者肾脏和外周血样本，匹配对照外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞BCR/TCR测序，ATAC-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic revealed intratumor heterogeneity and cancer stem cell enrichment in colorectal cancer metastasis
2024-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217181
PMID:39159882
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研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示结直肠癌原发灶和肝转移灶的瘤内异质性及癌症干细胞富集机制 | 首次利用空间转录组技术系统揭示结直肠癌转移过程中的瘤内异质性特征，发现FOXD1作为新型转移性癌症干细胞标志物 | 仅分析两对原发灶与匹配转移灶样本，样本量有限 | 探索结直肠癌转移的细胞机制和癌症干细胞作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤组织及匹配的肝转移组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 轨迹分析、伪时间分析、CellphoneDB互作分析 | 空间RNA转录组数据 | 2例原发结直肠癌组织及其匹配的肝转移组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 175 | 2025-10-07 |
Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02380-w
PMID:39187683
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研究论文 | 提出FlowSig方法，从单细胞和空间转录组数据推断细胞间通讯驱动的信息流 | 首次结合图形因果建模和条件独立性分析，揭示细胞间通讯与细胞内基因模块之间的耦合关系 | 方法依赖于因果推断假设，需要实验验证其生物学意义 | 开发从单细胞和空间转录组数据推断细胞间信息流的方法 | 皮质类器官、胰腺胰岛、COVID-19患者样本、小鼠胚胎 | 生物信息学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图形因果模型 | 基因表达数据 | 多种实验数据集和合成数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-07 |
Influence of Vitamin D Receptor Signalling and Vitamin D on Colonic Epithelial Cell Fate Decisions in Ulcerative Colitis
2024-Oct-15, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjae074
PMID:38747639
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研究论文 | 本研究探讨维生素D受体信号传导和维生素D对溃疡性结肠炎患者结肠上皮细胞命运决定的影响 | 首次在人类结肠类器官模型中系统研究维生素D-VDR轴对上皮细胞分化的调控机制，并利用CRISPR/Cas9技术验证VDR依赖性 | 研究主要基于体外类器官模型，需要进一步在体实验验证 | 阐明维生素D-VDR信号轴在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康个体的结肠活检样本及患者来源的结肠类器官 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 免疫组织化学, RNA表达阵列, 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因敲除 | NA | 图像, 文本(基因表达数据) | 来自UC患者和健康个体的结肠活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
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研究论文 | 本研究通过整合分析构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的风险特征，用于三阴性乳腺癌的预后预测和免疫特征分析 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别TAM簇并构建8基因风险特征，开发了整合分期和TAM风险特征的新型列线图 | NA | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特征，构建预后风险特征并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，逆转录聚合酶链反应，Western blot，免疫组织化学 | LASSO回归，单变量Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-07 |
Cell and transcriptomic diversity of infrapatellar fat pad during knee osteoarthritis
2024-Oct-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225928
PMID:39375009
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了膝关节骨关节炎中髌下脂肪垫的细胞和转录组多样性 | 首次提供了人类髌下脂肪垫的全面细胞和转录组图谱，确定了与膝关节骨关节炎、性别和肥胖状态相关的成纤维细胞关键作用 | 样本量相对有限（21个样本），需要进一步验证 | 确定髌下脂肪垫在膝关节骨关节炎中的作用及其与性别和肥胖状态的关系 | 人类髌下脂肪垫组织 | 单细胞生物学 | 膝关节骨关节炎 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 21个髌下脂肪垫样本（6个健康对照，15个膝关节骨关节炎供体），共82,924个细胞核 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-07 |
NME4 suppresses NFκB2-CCL5 axis, restricting CD8+ T cell tumour infiltration in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-10, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13838
PMID:39016535
|
研究论文 | 本研究揭示了NME4通过调控NFκB2-CCL5轴抑制CD8+ T细胞在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中浸润的机制 | 首次发现NME4在肿瘤微环境中的免疫调节功能，并阐明其通过NFκB2-CCL5轴调控CD8+ T细胞浸润的新机制 | 临床样本中NME4表达与临床病理和预后的相关性有限，主要机制研究基于小鼠模型 | 探究NME4在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫学作用及其分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本、C57BL/6小鼠同源肿瘤模型、AKR小鼠ESCC细胞系 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、蛋白质微阵列筛选 | 同源肿瘤小鼠模型 | 组织切片图像、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 | 食管鳞状细胞癌患者样本和小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-07 |
FANCD2 as a ferroptosis-related target for recurrent implantation failure by integrated bioinformatics and Mendelian randomization analysis
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70119
PMID:39400935
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研究论文 | 通过整合生物信息学和孟德尔随机化分析，研究铁死亡相关基因在复发性种植失败中的作用 | 首次结合生物信息学分析和孟德尔随机化方法系统研究DEFRGs在RIF中的表达和意义，发现FANCD2通过非经典铁死亡依赖途径参与RIF发病机制 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证基因功能机制 | 探究铁死亡相关基因在复发性种植失败发病机制中的作用 | 复发性种植失败患者和健康个体的子宫内膜组织 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 生物信息学分析，孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |