单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 600 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-12-07 |
Hexokinase 2 expression in apical enterocytes correlates with inflammation severity in patients with inflammatory bowel disease
2024-10-23, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03710-7
PMID:39444028
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研究论文 | 研究了炎症性肠病患者中顶端肠上皮细胞的己糖激酶2表达与炎症严重程度的关系 | 首次系统研究了己糖激酶2表达与炎症性肠病活动性的关系，并提出了靶向己糖激酶2抑制作为潜在治疗途径 | 研究基于两个独立队列的数据，但样本量和队列数量有限 | 探讨己糖激酶2表达与炎症性肠病炎症严重程度的关系 | 炎症性肠病患者的顶端肠上皮细胞 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 两个独立队列的炎症性肠病患者，包括克罗恩病和溃疡性结肠炎患者 |
| 162 | 2024-12-07 |
Integrative bioinformatics analysis for identifying the mitochondrial-related gene signature associated with immune infiltration in premature ovarian insufficiency
2024-10-08, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03675-7
PMID:39379953
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，识别与早发性卵巢功能不全（POI）相关的线粒体基因特征及其与免疫浸润的关系 | 首次揭示了线粒体功能与免疫反应在POI发展中的相互作用，并识别出可能的生物标志物和治疗药物 | 研究主要基于转录组数据和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨线粒体功能与免疫反应在早发性卵巢功能不全中的相互作用 | 早发性卵巢功能不全（POI）及其相关的线粒体基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 生殖疾病 | 转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括POI模型和人类颗粒细胞（GCs）在内的多种细胞类型 |
| 163 | 2024-12-06 |
An integrative single-cell atlas for exploring the cellular and temporal specificity of genes related to neurological disorders during human brain development
2024-Oct, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01328-6
PMID:39363111
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研究论文 | 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集，构建了一个全面的人类大脑发育单细胞图谱，揭示了与神经系统疾病相关的基因在不同发育阶段的表达模式 | 本文首次整合了多个单细胞RNA测序数据集，构建了一个全面的人类大脑发育单细胞图谱，揭示了与神经系统疾病相关的基因在不同发育阶段的表达模式 | 本文主要依赖于单细胞RNA测序数据，可能无法全面反映基因表达的复杂性 | 揭示与神经系统疾病相关的基因在人类大脑发育过程中的细胞和时间特异性 | 人类大脑发育过程中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 393,060个单细胞 |
| 164 | 2024-12-06 |
Characteristics of blood-brain barrier heterogeneity between brain regions revealed by profiling vascular and perivascular cells
2024-Oct, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01743-y
PMID:39210068
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研究论文 | 研究通过单细胞和空间转录组学技术，比较了小鼠中脑室旁器官与皮质的血脑屏障特性，揭示了不同脑区血脑屏障异质性的分子和解剖学基础 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术，系统比较了不同脑区血脑屏障的异质性，并揭示了内皮细胞与周围细胞的分子特异性及其相互作用模式 | 研究仅限于小鼠中脑室旁器官与皮质，未涵盖其他脑区 | 探究不同脑区血脑屏障异质性的分子和解剖学基础 | 小鼠中脑室旁器官与皮质的内皮细胞及周围细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、电子显微镜、水基组织清除法 | NA | 转录组数据 | 小鼠中脑室旁器官与皮质样本 |
| 165 | 2024-12-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals dynamic activation of cellular signaling pathways regulating beige adipogenesis
2024-Oct, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01252-9
PMID:39465352
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了调节米色脂肪生成的细胞信号通路的动态激活 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PDGFRA+细胞在米色脂肪生成过程中的分子异质性，并发现了DPP4+细胞在饮食诱导肥胖中的潜在作用 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小 | 阐明脂肪干细胞在米色脂肪生成中的分子异质性及其在饮食诱导肥胖中的作用 | PDGFRA+细胞及其在米色脂肪生成中的分子机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠的腹股沟白色脂肪组织（iWAT）样本 |
| 166 | 2024-12-01 |
Metabolic Transcriptional Activation in Ulcerative Colitis Identified Through scRNA-seq Analysis
2024-Oct-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111412
PMID:39596612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了溃疡性结肠炎中的代谢转录激活 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了溃疡性结肠炎中代谢酶的差异表达，并建立了代谢表达评分模型 | 研究仅基于两个独立的数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨溃疡性结肠炎中代谢酶的表达变化及其对疾病的影响 | 溃疡性结肠炎患者的结肠组织 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | Elastic Net模型 | 转录组数据 | 两个独立数据集，共涉及溃疡性结肠炎和正常对照样本 |
| 167 | 2024-12-01 |
Stratified analysis identifies HIF-2α as a therapeutic target for highly immune-infiltrated melanomas
2024-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620300
PMID:39554029
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研究论文 | 本文通过分层分析识别出HIF-2α作为高免疫浸润黑色素瘤的治疗靶点 | 发现高免疫浸润是联合免疫检查点阻断（ICB）反应的生物标志物，而不是单独使用抗PD-1；识别出HIF-2α作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于预临床模型，需要在临床试验中进一步验证 | 识别新的治疗靶点以提高黑色素瘤患者的治疗效果 | 高免疫浸润的黑色素瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 290例接受抗PD-1治疗的患者，175例接受抗CTLA-4治疗的患者，51例接受联合抗PD-1/抗CTLA-4治疗的患者 |
| 168 | 2024-11-29 |
Identification of a Novel Signature Based on Ferritinophagy-Related Genes to Predict Prognosis in Lung Adenocarcinoma: Focus on AHNAK2
2024-Oct-26, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering11111070
PMID:39593730
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研究论文 | 研究构建了一个基于铁蛋白自噬相关基因的预测模型，用于预测肺腺癌的预后，并重点研究了AHNAK2的作用 | 首次提出基于铁蛋白自噬相关基因的预测模型，并发现AHNAK2在肺腺癌中的新调控作用 | 研究主要集中在体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索铁蛋白自噬相关基因在肺腺癌预后预测中的潜力 | 肺腺癌患者的预后预测及AHNAK2在肺腺癌中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 三个独立基因表达数据集 |
| 169 | 2024-11-29 |
Single‑cell RNA sequencing reveals heterogeneity in ovarian cancer and constructs a prognostic signature for prognostic prediction and immunotherapy
2024-Oct-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112855
PMID:39133955
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示卵巢癌的异质性，并构建了一个用于预测预后和免疫治疗的预后标志物 | 本研究首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个包含16个基因的GRG签名，为卵巢癌的预后预测和治疗策略提供了新的视角 | NA | 识别卵巢癌恶性上皮细胞的异质性，并构建有效的预后标志物以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者及其恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 (bulk RNA-seq) | COX回归和最小绝对收缩与选择算子 (LASSO) 回归 | RNA数据 | NA |
| 170 | 2024-11-29 |
Single-Cell Analysis Reveals the Cellular and Molecular Changes of Liver Injury and Fibrosis in Mice During the Progression of Schistosoma japonicum Infection
2024-Oct-23, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46110707
PMID:39590301
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了血吸虫感染小鼠肝脏在感染进展过程中的细胞和分子变化 | 首次提供了血吸虫感染小鼠肝脏在感染进展过程中的全面单细胞转录组图谱，并揭示了关键的细胞和分子事件 | NA | 阐明血吸虫感染进展过程中的致病机制 | 血吸虫感染小鼠的肝脏细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 31,847个肝脏细胞 |
| 171 | 2024-11-27 |
Regulation of Diseases-Associated Microglia in the Optic Nerve by Lipoxin B4 and Ocular Hypertension
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585452
PMID:38562864
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研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压升高对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用，并发现其在眼压升高诱导的神经退行性变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨脂氧素B4在眼压升高诱导的视神经退行性变中的作用及其对小胶质细胞的调控机制 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼内注射硅油诱导持续稳定的眼压升高 |
| 172 | 2024-11-26 |
Mapping intratumoral myeloid-T cell interactomes at single-cell resolution reveals targets for overcoming checkpoint inhibitor resistance
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620093
PMID:39554094
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）衍生的单细胞分辨率细胞间相互作用图谱，并应用于研究CD40激动剂（CD40ag）如何改变免疫细胞间的对话，特别是在肿瘤模型中与免疫检查点阻断（ICB）联合使用时 | 本文创新性地开发了一种计算方法，能够有效分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，并揭示了CD40ag在改善ICB反应中的作用 | 本文未详细讨论该计算方法在其他类型肿瘤或不同数据集上的适用性和泛化能力 | 研究如何通过分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，揭示CD40ag在克服免疫检查点抑制剂耐药性中的作用 | 研究对象包括肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞，以及它们在CD40ag和ICB治疗下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 173 | 2024-11-26 |
Cell2Sentence: Teaching Large Language Models the Language of Biology
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557287
PMID:39554079
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研究论文 | 介绍了一种名为Cell2Sentence的新方法，将大型语言模型直接适应于生物学背景，特别是单细胞转录组学 | 通过将基因表达数据转化为“细胞句子”，Cell2Sentence方法填补了自然语言处理与生物学之间的空白 | NA | 探索如何将大型语言模型应用于生物学领域，特别是单细胞转录组学 | 单细胞转录组学数据和大型语言模型 | 自然语言处理 | NA | NA | GPT-2 | 基因表达数据 | NA |
| 174 | 2024-11-23 |
The spatial impact of a Western diet in enriching Galectin-1-regulated Rho, ECM, and SASP signaling in a novel MASH-HCC mouse model
2024-Oct-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00660-3
PMID:39402682
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研究论文 | 研究西方饮食对Galectin-1调控的Rho、ECM和SASP信号在新型MASH-HCC小鼠模型中的空间影响 | 开发了一种新型MASH-HCC小鼠模型，并使用空间转录组学和多重免疫组化技术研究了西方饮食对Galectin-1信号的影响 | NA | 探讨西方饮食对Galectin-1信号在MASH向HCC进展中的影响 | MASH-HCC小鼠模型中的Galectin-1信号 | NA | 肝细胞癌 | 空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、免疫组化数据 | 小鼠样本 |
| 175 | 2024-11-23 |
Transcriptomic mapping of the 5-HT receptor landscape
2024-Oct-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.101048
PMID:39569210
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和多重荧光原位杂交技术，对成年小鼠大脑中的5-HT受体进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞水平上揭示了5-HT受体的多样性分布和共转录现象 | NA | 研究5-HT受体在小鼠大脑中的转录模式和空间分布 | 5-HT受体及其在小鼠大脑中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 转录组数据 | 约400万细胞（scRNA-seq）和约1000万细胞（MERFISH） |
| 176 | 2024-11-22 |
Recovering single-cell expression profiles from spatial transcriptomics with scResolve
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100864
PMID:39326411
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scResolve的方法，用于从空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱 | scResolve能够准确恢复单细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型反卷积无法实现的 | NA | 开发一种方法以从空间转录组学数据中恢复单细胞表达谱 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类乳腺癌和肺部疾病数据 |
| 177 | 2024-11-22 |
Generation, expansion, gene delivery, and single-cell profiling in rhesus macaque plasma B cells
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100878
PMID:39406231
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研究论文 | 本文开发了在食蟹猴血浆B细胞中进行细胞生成、扩增、基因递送和单细胞分析的方法 | 首次在非人灵长类（食蟹猴）B细胞中实现了高效的细胞扩增、分化和基因递送，并发现了与人类细胞不同的免疫检查点分子和主要组织相容性复合物分子的上调 | NA | 开发用于治疗目的的工程化B细胞在免疫健全的大型动物模型中的评估方法 | 食蟹猴血浆B细胞 | NA | NA | 单细胞测序、流式细胞术、腺相关病毒（AAV）递送 | NA | 转录组数据 | NA |
| 178 | 2024-11-22 |
Characterization of the single cell landscape in normal and osteoarthritic equine joints
2024-Oct-20, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-24-40
PMID:39507442
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了正常和骨关节炎马关节滑液中的细胞组成，揭示了骨关节炎免疫病理发生中的关键细胞类型和相互作用 | 首次在马关节滑液和滑膜中进行了单细胞RNA测序，识别了多种免疫细胞亚群及其在骨关节炎中的变化，为未来研究提供了马特异性细胞类型基因签名 | 样本量较小，仅包括三只正常马和三只骨关节炎马的关节滑液，以及一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 | 通过分析骨关节炎关节中的转录组反应，加深对骨关节炎免疫病理发生的理解，促进靶向疗法的开发 | 正常和骨关节炎马的关节滑液和滑膜中的免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,639个细胞来自正常和骨关节炎马的关节滑液，17,690个细胞来自一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 |
| 179 | 2024-11-22 |
Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.19.590370
PMID:38895328
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研究论文 | 研究了单细胞水平上核糖体含量与生长规律的关系 | 首次在单细胞水平上研究了核糖体含量与生长规律的关系，发现单细胞核糖体水平并不精确匹配群体生长速率或营养可用性 | 研究仅限于两种微生物，结果可能不适用于所有物种 | 探讨单细胞核糖体含量与生长规律的关系 | 单细胞酵母和细菌的核糖体含量 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯过程模型 | 转录组数据 | 数千个单细胞样本，来自多种条件、重复和物种 |
| 180 | 2024-11-21 |
Sex-Based Differences in Thyroid Plasma B Cell Infiltration: Implications for Autoimmune Disease Susceptibility
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae148
PMID:39487734
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研究论文 | 研究探讨了甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 首次研究了女性甲状腺中浆细胞的浸润情况，并揭示了CXCL13-CXCR5信号轴在浆细胞招募和组织中的关键作用 | 研究仅限于女性甲状腺，未涉及男性甲状腺的对比分析 | 探讨甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 女性甲状腺中的浆细胞浸润情况 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |