单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 617 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-11-15 |
Mcadet: A feature selection method for fine-resolution single-cell RNA-seq data based on multiple correspondence analysis and community detection
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012560
PMID:39466833
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研究论文 | 提出了一种名为Mcadet的新特征选择方法，用于高分辨率单细胞RNA测序数据 | Mcadet结合了多重对应分析、基于图的社区检测和一种新的统计测试方法，显著提高了在高分辨率单细胞RNA测序数据和少数细胞类型数据中选择高变异基因的性能 | 高变异基因选择对不同下游分析的影响需要进一步研究 | 解决现有特征选择方法在高分辨率单细胞RNA测序数据中的局限性 | 高分辨率单细胞RNA测序数据和少数细胞类型数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 162 | 2024-11-15 |
Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08087-4
PMID:39478210
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研究论文 | 研究肿瘤细胞与非肿瘤细胞在2D和3D空间中的相互作用 | 通过Visium空间转录组学和单核RNA测序结合CODEX技术，定义了肿瘤微区域和空间亚克隆，并重建了3D肿瘤结构 | 样本量相对较小，且仅涵盖6种癌症类型 | 研究肿瘤细胞与微环境在2D和3D空间中的相互作用 | 131个肿瘤切片，48个单核RNA测序样本和22个CODEX样本 | 数字病理学 | NA | Visium空间转录组学，单核RNA测序，CODEX | 深度学习算法 | 转录组数据，图像数据 | 131个肿瘤切片，48个单核RNA测序样本，22个CODEX样本 |
| 163 | 2024-11-14 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 研究探讨了在空间转录组数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提高细胞类型聚类性能 | 首次研究了将高变异基因与空间变异基因结合对细胞类型聚类性能的影响 | 仅在50个真实空间转录组数据集上进行了测试，可能需要更多数据集验证 | 探讨在空间转录组数据中，结合高变异基因与空间变异基因对细胞类型聚类性能的影响 | 空间转录组数据中的高变异基因和空间变异基因 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 50个真实空间转录组数据集 |
| 164 | 2024-11-14 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-Oct-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
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研究论文 | 研究使用单细胞测序技术分析急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探讨急性T淋巴母细胞白血病中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病过程中的作用 | 急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 来自公共数据库的单细胞测序数据 |
| 165 | 2024-11-14 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
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研究论文 | 研究了抗体Fab和Fc特征在限制结核分枝杆菌中的作用 | 通过Fc交换优化了保护性脂阿拉伯甘露聚糖特异性单克隆抗体，并揭示了Fc效应功能在限制中的关键作用 | NA | 探讨抗体在控制结核分枝杆菌中的机制 | 结核分枝杆菌、单克隆抗体、Fc变体 | NA | 结核病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 166 | 2024-11-13 |
The multifaceted role of mitochondria in cardiac function: insights and approaches
2024-Oct-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01899-x
PMID:39472951
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综述 | 本文综述了线粒体在心脏功能中的多方面作用及其在心血管疾病中的重要性 | 讨论了线粒体异质性和亚群在维持心脏功能和疾病相关重塑中的作用，并强调了线粒体与核的逆向通讯 | 未提供具体的研究数据或实验结果 | 探讨线粒体在心脏功能中的作用及其在心血管疾病中的潜在治疗策略 | 线粒体及其在心脏功能和疾病中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究 (GWAS) | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-11-12 |
Single-cell transcriptomics reveal diverging pathobiology and opportunities for precision targeting in scleroderma-associated versus idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.25.620225
PMID:39484590
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了硬皮病相关肺动脉高压与特发性肺动脉高压在病理生物学上的差异，并探讨了精准靶向治疗的机会 | 首次通过单细胞RNA测序技术比较了硬皮病相关肺动脉高压与特发性肺动脉高压的基因表达差异，揭示了潜在的治疗靶点 | 研究样本量较小，需要进一步的临床验证 | 探讨硬皮病相关肺动脉高压与特发性肺动脉高压的分子机制差异，寻找新的治疗靶点 | 硬皮病相关肺动脉高压和特发性肺动脉高压患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个肺组织样本，包括4个硬皮病相关肺动脉高压、4个特发性肺动脉高压和4个失败供体样本 |
| 168 | 2024-11-12 |
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619529
PMID:39484491
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研究论文 | 本文通过整合高分辨率空间转录组学和进化谱系追踪技术，研究了肺腺癌小鼠模型中肿瘤扩展、可塑性和转移与微环境重塑的共进化关系 | 本文创新性地整合了高分辨率空间转录组学和进化谱系追踪技术，揭示了肿瘤扩展、可塑性和转移与微环境重塑的动态关系 | NA | 研究肿瘤进展过程中癌细胞与微环境之间的动态相互作用 | 肺腺癌小鼠模型中的肿瘤扩展、可塑性和转移 | 数字病理学 | 肺癌 | 高分辨率空间转录组学 | NA | 空间数据 | 小鼠模型 |
| 169 | 2024-11-12 |
Gene expression landscape of cutaneous squamous cell carcinoma progression
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae249
PMID:38867481
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研究论文 | 本文通过元分析公开的RNA-Seq样本，定义了从正常皮肤到皮肤鳞状细胞癌（cSCC）不同阶段的转录组景观 | 本文通过整合多个研究的数据，定义了cSCC进展过程中不同阶段的差异表达基因（DEGs），并使用单细胞RNA-Seq数据验证了这些基因的表达情况 | 由于样本量较小和分析协议的多样性，研究结果的可转移性可能有限 | 定义皮肤鳞状细胞癌进展过程中不同阶段的转录组景观 | 正常皮肤、光化性角化病、原位鳞状细胞癌、角化棘皮瘤和皮肤鳞状细胞癌的RNA-Seq样本 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 共分析了73个正常皮肤样本、46个光化性角化病样本、16个原位鳞状细胞癌样本、13个角化棘皮瘤样本和147个皮肤鳞状细胞癌样本 |
| 170 | 2024-11-12 |
COL10A1 expression distinguishes a subset of cancer-associated fibroblasts present in the stroma of high-risk basal cell carcinoma
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae258
PMID:38916477
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研究论文 | 研究探讨了基底细胞癌（BCC）不同亚型间基质中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，特别是COL10A1的表达 | 首次发现COL10A1作为高风险BCC的标志物，特别是在硬化/浸润性和基底鳞状亚型中 | 研究样本量有限，且仅限于特定亚型的BCC | 研究BCC不同亚型基质中CAFs的特征，以寻找新的治疗靶点和预后生物标志物 | 基底细胞癌的不同亚型及其基质中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA测序（RNA-Seq）、激光捕获显微切割（LCM）、免疫组织化学（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 15个BCC样本（来自5种不同纯亚型，每种3个样本），6个健康皮肤样本，93个不同BCC样本和13个健康皮肤样本 |
| 171 | 2024-11-12 |
Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia
2024-Oct-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5045715/v1
PMID:39483903
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研究论文 | 本文通过整合单细胞和空间转录组学数据，研究了阿尔茨海默病大脑和诱导多能干细胞衍生的微胶质细胞的细胞异质性 | 本文首次整合了单细胞和空间转录组学数据，揭示了微胶质细胞在阿尔茨海默病中的多样性和空间分布特征 | 本文未详细讨论微胶质细胞异质性对阿尔茨海默病进展的具体影响 | 揭示微胶质细胞在阿尔茨海默病中的转录状态多样性和空间分布特征 | 阿尔茨海默病大脑和诱导多能干细胞衍生的微胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个队列和脑区的微胶质细胞样本 |
| 172 | 2024-11-11 |
Inhibition of PNCK inflames tumor microenvironment and sensitizes head and neck squamous cell carcinoma to immune checkpoint inhibitors
2024-Oct-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009893
PMID:39395840
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研究论文 | 研究探讨了PNCK在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用及其与免疫检查点抑制剂的关系 | 首次揭示了PNCK在调节肿瘤微环境（TME）和增强免疫检查点抑制剂敏感性中的关键作用 | 研究主要基于体外和体内实验，需要进一步的临床验证 | 探讨PNCK在HNSCC中的作用及其对免疫治疗的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其肿瘤微环境 | 癌症研究 | 头颈部鳞状细胞癌 | 测序技术、单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 包括体外细胞实验、体内动物模型和公共数据库数据 |
| 173 | 2024-11-11 |
Single-Cell RNA Profiling of Ocular Adnexal Sebaceous Carcinoma Reveals a Complex Tumor Microenvironment and Identifies New Biomarkers
2024-Oct-10, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.10.001
PMID:39393421
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研究论文 | 本文首次对眼附属器皮脂腺癌进行了单细胞分辨率的转录组分析，揭示了复杂的肿瘤微环境并鉴定了新的生物标志物 | 首次对眼附属器皮脂腺癌进行单细胞分辨率的转录组分析，揭示了肿瘤微环境的复杂性和新的生物标志物 | 研究样本量较小，仅包括六个患者样本 | 揭示眼附属器皮脂腺癌的肿瘤组成和转录组特征，发现潜在的免疫疗法、靶向疗法和生物标志物 | 眼附属器皮脂腺癌的肿瘤微环境和生物标志物 | 数字病理学 | 眼附属器皮脂腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六个患者样本，包括三个原发肿瘤、两个伴有Pagetoid扩散的肿瘤和一个正常睑板样本 |
| 174 | 2024-11-10 |
Copper drives remodeling of metabolic state and progression of clear cell renal cell carcinoma
2024-Oct-31, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0187
PMID:39476412
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研究论文 | 研究揭示了铜在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的积累及其对代谢状态和肿瘤进展的影响 | 首次系统性地探讨了铜在ccRCC中的作用，揭示了铜通过促进CuCOX生物合成来增强肿瘤生长，并提出了新的治疗靶点 | NA | 探讨铜在透明细胞肾细胞癌中的作用及其对肿瘤代谢和进展的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | NA | 肾癌 | 代谢组学、脂质组学、同位素标记葡萄糖和谷氨酰胺通量分析、转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据、代谢数据 | 肿瘤样本、细胞系、异种移植模型、PDX模型 |
| 175 | 2024-11-09 |
Single-cell transcriptomics reveal individual and synergistic effects of Trisomy 21 and GATA1s on hematopoiesis
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595827
PMID:38826323
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组测序分析唐氏综合症和GATA1s对造血作用的个体和协同效应 | 首次使用同基因人诱导多能干细胞研究唐氏综合症和GATA1s对造血祖细胞的个体和协同效应 | 研究仅限于同基因人诱导多能干细胞，未涉及临床样本 | 探讨唐氏综合症和GATA1s对造血作用的个体和协同效应 | 造血祖细胞 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 同基因人诱导多能干细胞的造血祖细胞 |
| 176 | 2024-11-09 |
Multi-omics revealed that ELAVL3 regulates MYCN in neuroblastoma via immunogenic cell death: Risk stratification and experimental research
2024-Oct-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.137045
PMID:39486730
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了ELAVL3通过免疫原性细胞死亡调节神经母细胞瘤中的MYCN，并进行了风险分层和实验研究 | 首次报道了免疫原性细胞死亡相关指数（ICDR-Index），并发现ELAVL3在神经母细胞瘤中的关键作用 | 研究主要基于批量转录组数据和单细胞RNA测序数据，未涉及临床试验 | 研究神经母细胞瘤的风险分层和免疫原性细胞死亡机制 | 神经母细胞瘤患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 1244个神经母细胞瘤样本和16个单细胞RNA测序数据集 |
| 177 | 2024-11-09 |
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619760
PMID:39484623
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研究论文 | 本文研究了从等位基因包含现象中学习抗体序列约束的方法 | 利用大规模单细胞测序数据，发现数千个幼稚B细胞中的轻链等位基因包含现象，并训练机器学习模型识别这些异常序列，结果模型与未训练的抗体特性（如多反应性、表面表达和亲和力成熟中的突变使用）相关性更高 | NA | 研究抗体序列约束 | 抗体和B细胞受体（BCR）的序列约束 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | 数千个幼稚B细胞 |
| 178 | 2024-11-09 |
FlyRNAi.org 2025 update-expanded resources for new technologies and species
2024-Oct-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae917
PMID:39435987
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研究论文 | 本文介绍了FlyRNAi.org数据库2025年的更新，扩展了支持新技术和物种的资源 | 扩展了数据库以包括新的数据中心资源，支持单细胞转录组学的挖掘和分析，并将CRISPR试剂和基因中心生物信息学方法应用于Drosophila和其他节肢动物病媒 | NA | 推进生物学和生物医学理解的'omics研究设计、分析和挖掘 | Drosophila和其他节肢动物的功能基因组学研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学、CRISPR | NA | 基因组数据 | NA |
| 179 | 2024-11-09 |
Heterotypic macrophages/microglia differentially contribute to retinal ischaemia and neovascularisation
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06215-3
PMID:38977459
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研究论文 | 研究了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用 | 揭示了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用，为针对特定细胞的治疗方法提供了新的基础 | NA | 阐明巨噬细胞/小胶质细胞在增生性缺血性视网膜病变发病机制中的不同作用 | 巨噬细胞和小胶质细胞在糖尿病视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 免疫染色、定量实时RT-PCR、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 180 | 2024-11-08 |
Case report: Single-cell RNA sequencing of PBMCs highlights monocyte gene expression alterations in a type A HBV-ACLF patient
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38344
PMID:39502220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化及其M1/M2极化状态的动态变化 | 单细胞RNA测序技术耗时且难以在日常临床实践中应用 | 探究HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化及其在疾病发展中的作用 | HBV-ACLF患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 64名患者（包括15名正常对照、10名肝硬化患者、10名慢性乙型肝炎感染者、10名慢性肝功能障碍患者和20名HBV-ACLF患者） |