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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
Best practices for differential accessibility analysis in single-cell epigenomics
2024-10-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53089-5
PMID:39394227
|
研究论文 | 本文系统评估了单细胞表观基因组学数据中差异可及性分析的统计方法并提出了最佳实践方案 | 首次对单细胞ATAC-seq数据中差异可及性分析的统计方法进行系统性评估，并开发了相应的R软件包 | 评估主要基于匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据，可能存在方法评估的局限性 | 确定单细胞表观基因组学数据差异可及性分析的最佳统计方法 | 单细胞ATAC-seq数据的差异可及性分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 表观基因组学数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the process of CA19-9 production and dynamics of the immune microenvironment between CA19-9 (+) and CA19-9 (-) PDAC
2024-Oct-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003130
PMID:38816396
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌中CA19-9的产生过程及CA19-9阳性与阴性患者免疫微环境的动态差异 | 首次在单细胞分辨率下识别出三种高产生CA19-9的癌细胞亚型，发现CA19-9通过抗原呈递癌症相关成纤维细胞的旁路产生机制，并证实CA19-9促进巨噬细胞M2极化的新功能 | 样本量较小（仅6个PDAC样本和2个癌旁样本），需更大规模研究验证 | 阐明CA19-9在胰腺导管腺癌中的产生机制及其在肿瘤微环境中的作用 | 胰腺导管腺癌患者组织样本（CA19-9阳性和阴性）及体外共培养细胞模型 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，体外共培养 | NA | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像 | 6个PDAC样本（3个CA19-9阳性，3个阴性）+2个癌旁样本+在线数据库补充样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
The integrated molecular and histological analysis defines subtypes of esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53164-x
PMID:39419971
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研究论文 | 通过整合分子和病理学分析定义食管鳞状细胞癌的亚型 | 首次结合基因组-转录组特征和AI辅助病理图像分析对ESCC进行综合分型，发现具有特定分子和病理特征的四种亚型 | 样本量相对有限（120例），仅针对中国人群 | 阐明食管鳞状细胞癌的分子和免疫特征，推动个性化治疗策略发展 | 120例中国食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 基因组学, 转录组学, 免疫组织化学 | 深度学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 病理图像 | 120例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-06 |
Dominant immune tolerance in the intestinal tract imposed by RelB-dependent migratory dendritic cells regulates protective type 2 immunity
2024-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53112-9
PMID:39443450
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研究论文 | 本研究揭示了肠道树突状细胞中RelB表达通过调控DC-Treg细胞相互作用建立免疫耐受机制 | 首次发现RelB在肠道隐窝斑和孤立淋巴滤泡相关树突状细胞分化中的关键作用，并阐明其通过CCL22调控DC-Treg细胞相互作用的机制 | 研究主要关注肠道特定区域的树突状细胞，其他免疫细胞类型和组织部位的作用尚未完全探索 | 探究RelB在肠道树突状细胞介导的免疫耐受和2型免疫应答调控中的作用机制 | 小鼠肠道树突状细胞、调节性T细胞和Heligmosomoides polygyrus bakeri寄生虫感染模型 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
Overloading And unpacKing (OAK) - droplet-based combinatorial indexing for ultra-high throughput single-cell multiomic profiling
2024-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53227-z
PMID:39443484
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研究论文 | 介绍了一种名为OAK的超高通量单细胞多组学分析方法 | 结合液滴微流控和组合索引技术，通过过载和拆包策略提高条形码和试剂利用率 | 未明确说明技术局限，但暗示现有方法存在效率问题 | 开发超高通量单细胞多组学分析技术 | 支气管上皮细胞、视网膜组织、黑色素瘤细胞 | 单细胞测序技术 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、染色质可及性分析 | NA | 单细胞多组学数据 | 超过40万个黑色素瘤细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | 液滴条形码系统结合组合索引 |
| 166 | 2025-10-06 |
IL-1β-induced epithelial cell and fibroblast transdifferentiation promotes neutrophil recruitment in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53307-0
PMID:39438439
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现IL-1β诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞转分化促进慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的中性粒细胞募集 | 首次鉴定出IL-1信号诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞两个细胞亚群，并阐明它们通过释放不同趋化因子促进中性粒细胞募集的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证需要进一步扩展 | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的细胞机制和干预策略 | 人类鼻黏膜组织（下鼻甲、中鼻甲和鼻息肉）和LPS诱导的小鼠CRSwNP模型 | 单细胞生物学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自CRSwNP患者的人类鼻黏膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals immune features of treatment response to neoadjuvant immunochemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52977-0
PMID:39438438
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫特征 | 首次通过单细胞RNA测序结合T细胞受体测序，系统解析了食管鳞癌新辅助免疫化疗响应者与非响应者的肿瘤微环境差异，发现CXCL13+CD8+ Tex细胞可作为治疗响应的预测标志物 | 样本量有限，需要更大规模的研究验证发现 | 探究食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫学机制 | 接受新辅助免疫化疗的食管鳞癌患者组织样本 | 数字病理 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管鳞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
Putting proteins in context
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
|
研究论文 | 介绍了一种名为PINNACLE的几何深度学习方法，通过整合分析蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组数据生成蛋白质的上下文表征 | 首次将蛋白质相互作用与多器官单细胞转录组数据结合，利用几何深度学习方法生成具有生物环境背景的蛋白质表征 | NA | 解决蛋白质表征缺乏生物环境背景的问题 | 蛋白质及其相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 几何深度学习 | 蛋白质相互作用数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
Mouse enteric neurons control intestinal plasmacytoid dendritic cell function via serotonin-HTR7 signaling
2024-10-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53545-2
PMID:39455564
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道神经元通过血清素-HTR7信号通路调控肠道浆细胞样树突状细胞功能的新机制 | 首次发现肠道血清素能神经元通过HTR7信号轴调控pDC功能，并揭示肠道神经元与固有层树突状细胞之间的双向通讯新模式 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；仅针对沙门氏菌感染模型，对其他病原体的适用性未知 | 探究肠道血清素能神经元在免疫稳态调控中的功能 | 小鼠肠道血清素能神经元和浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 肠道感染 | 单细胞RNA测序, 小鼠遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils Skin Cell Specific Antifungal Immune Responses and IL-1Ra- IL-1R Immune Evasion Strategies of Emerging Fungal Pathogen Candida auris
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619653
PMID:39463935
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示新兴真菌病原体耳念珠菌在皮肤感染中的免疫应答和IL-1Ra-IL-1R免疫逃逸机制 | 首次使用单细胞转录组学解析耳念珠菌皮肤感染的细胞特异性免疫反应，发现该真菌通过上调IL-1RN基因表达和独特细胞壁甘露聚糖外层逃逸宿主防御 | 研究基于小鼠模型，人类皮肤环境的差异可能影响结果适用性 | 阐明耳念珠菌在皮肤组织中持续定植的宿主免疫调控因素 | 耳念珠菌感染的小鼠皮肤组织 | 单细胞生物学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of human pancreatic islets reveals genes responsive to glucose exposure over 24 h
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06214-4
PMID:38967666
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了人类胰岛在24小时内对葡萄糖暴露的基因响应特征 | 首次在单细胞分辨率下系统分析人类胰岛六种细胞类型在24小时内对高糖环境的转录组动态响应，并结合遗传学数据鉴定糖尿病相关效应基因 | 仅使用两名供体的胰岛样本，样本量较小；体外实验环境可能与体内实际情况存在差异 | 探索高糖条件对人类胰岛基因表达的影响及其与2型糖尿病发病机制的关系 | 人类胰岛中的六种细胞类型：α细胞、β细胞、γ细胞、δ细胞、导管细胞和腺泡细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), CRISPR干扰, 葡萄糖刺激胰岛素分泌实验 | 离散时间和连续时间统计模型 | 单细胞转录组数据 | 2名人类供体的胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-06 |
OrganogenesisDB: A Comprehensive Database Exploring the Cell-Type Identities and Gene Expression Dynamics during Organogenesis
2024-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301758
PMID:38967205
|
研究论文 | 开发了一个名为OrganogenesisDB的综合数据库，用于探索器官发生过程中的细胞类型鉴定和基因表达动态 | 首个专门针对器官发生过程的综合数据库，整合了超过140万个细胞的单细胞RNA测序数据和3324个细胞标记物 | NA | 解析细胞谱系决定和揭示器官发生的潜在机制 | 人类和小鼠器官发育过程中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过140万个细胞，来自49个已发表数据集，涵盖9个人类器官和4个小鼠器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-06 |
Single Nucleus Total RNA Sequencing of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Gliomas
2024-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301801
PMID:38958078
|
研究论文 | 开发了自动化snRandom-seq平台用于福尔马林固定石蜡包埋胶质瘤样本的单核总RNA测序分析 | 开发了针对FFPE样本优化的高通量单核总RNA测序平台，整合自动化单核分离和液滴条形码系统 | 样本数量相对有限（17个FFPE样本），主要聚焦于胶质瘤 | 探索胶质瘤的分子多样性和肿瘤进化过程 | 各种胶质瘤亚型的FFPE样本，包括罕见临床样本和匹配的原发-复发胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 脑癌/胶质瘤 | 单核总RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 116,492个单核来自17个FFPE样本 | NA | 单细胞RNA测序 | snRandom-seq | 自动化单核总RNA测序平台，整合自动化单核分离和液滴条形码系统，基于随机引物的scRNA-seq化学方法 |
| 174 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies aberrant glomerular angiogenic signalling in the early stages of WT1 kidney disease
2024-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6339
PMID:39177649
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了WT1肾病早期阶段肾小球血管生成信号传导的异常机制 | 揭示了WT1肾病早期阶段肾小球血管生成信号异常的新机制，并发现肾上腺髓质素作为一种促血管生成因子在早期损伤中的上调 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究WT1肾病早期发病机制及细胞间通讯异常 | WT1基因突变小鼠模型及人类WT1肾小球病变活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | WT1突变小鼠模型及人类活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-06 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics of paediatric ovary: Molecular insights into the dysregulated signalling pathways underlying premature ovarian insufficiency in classic galactosemia
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70043
PMID:39440457
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析经典半乳糖血症患儿卵巢组织，揭示早发性卵巢功能不全的分子机制 | 首次构建了经典半乳糖血症患儿卵巢的单核转录组图谱和空间转录组景观，揭示了PTEN/PI3K/AKT信号通路失调、内质网应激和DNA损伤等新机制 | 研究样本量有限，仅针对青春期前女孩，未验证治疗干预效果 | 探究经典半乳糖血症患者早发性卵巢功能不全的分子机制 | 经典半乳糖血症患儿的卵巢组织活检样本 | 数字病理学 | 卵巢功能不全 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | 青春期前女孩卵巢组织活检（含CG患者和对照） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-06 |
Overcoming barriers to single-cell RNA sequencing adoption in low- and middle-income countries
2024-Oct, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-024-01564-4
PMID:38565638
|
观点文章 | 探讨在中低收入国家推广单细胞RNA测序技术面临的障碍及解决方案 | 首次系统分析单细胞测序技术在中低收入国家应用面临的独特挑战，并提出促进全球平等参与的协作框架 | 未提供具体实施案例或定量数据分析 | 促进单细胞测序技术在全球范围内的公平应用和祖先多样性包容 | 中低收入国家的研究人员和捐赠者群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-06 |
Exponential family measurement error models for single-cell CRISPR screens
2024-Oct-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxae010
PMID:38649751
|
研究论文 | 提出GLM-EIV方法解决单细胞CRISPR筛选数据分析中的统计挑战 | 将经典变量误差模型扩展至指数族分布，可处理响应变量和噪声预测变量受相同混杂变量影响的情况 | 未明确说明方法在特定数据类型或规模下的适用性限制 | 开发单细胞CRISPR筛选数据的统计分析方法 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | GLM-EIV（基于广义线性模型的变量误差模型） | 基因表达数据 | 两个大规模单细胞CRISPR筛选数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-06 |
Integrative spatial and genomic analysis of tumor heterogeneity with Tumoroscope
2024-10-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53374-3
PMID:39472583
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研究论文 | 提出首个概率模型Tumoroscope，通过整合病理图像、全外显子组测序和空间转录组数据，在接近单细胞分辨率下推断癌症克隆及其定位 | 首个能够基于体细胞点突变直接定位肿瘤组织中克隆的概率模型，解决了空间转录组位点中克隆比例反卷积的问题 | NA | 研究肿瘤的空间和基因组异质性对癌症进展、治疗和生存的影响 | 前列腺癌和乳腺癌数据集 | 数字病理学 | 前列腺癌,乳腺癌 | 全外显子组测序,空间转录组学 | 概率模型 | 病理图像,基因组测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,全外显子组测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies
2024-Oct-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009983
PMID:39455096
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研究论文 | 本研究揭示了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞作为胃癌转移生物标志物的重要作用 | 首次发现SPI1+CD68+巨噬细胞亚群在胃癌转移中的关键作用及其作为联合治疗策略的生物标志物 | 研究主要基于实验模型，需要进一步临床验证 | 评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用机制 | 胃癌组织和相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术,染色质免疫沉淀 | 小鼠腹膜转移模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-06 |
A spatiotemporal molecular atlas of mouse spinal cord injury identifies a distinct astrocyte subpopulation and therapeutic potential of IGFBP2
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.016
PMID:39029468
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研究论文 | 本研究构建了小鼠脊髓损伤的时空分子图谱，鉴定出表达Igfbp2的星形胶质细胞亚群并揭示其治疗潜力 | 首次在脊髓损伤中识别出从白质迁移至灰质的Astro-GMii星形胶质细胞亚群，并证明IGFBP2蛋白具有促进神经突生长和功能恢复的治疗潜力 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类临床中验证 | 解析脊髓损伤后的时空分子变化机制并探索治疗靶点 | 小鼠脊髓损伤模型 | 空间转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |