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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-07 |
Small Molecule Hydrogels Loading Small Molecule Drugs from Chinese Medicine for the Enhanced Treatment of Traumatic Brain Injury
2024-10-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c09097
PMID:39383335
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研究论文 | 开发了一种负载中药小分子药物的自组装水凝胶用于创伤性脑损伤的增强治疗 | 无需额外载药或添加非活性成分,仅利用源自中药的小分子药物在生理条件下自组装形成水凝胶 | 未提及临床转化面临的具体挑战和长期安全性数据 | 开发一种新型创伤性脑损伤治疗策略 | 创伤性脑损伤模型 | 生物医学工程 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-07 |
Arabidopsis uses a molecular grounding mechanism and a biophysical circuit breaker to limit floral abscission signaling
2024-Oct-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405806121
PMID:39453742
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥花器官脱落信号通路的分子调控机制 | 发现MKP1作为负调控因子建立脱落信号阈值,并鉴定IDA肽家族形成生物物理断路器机制 | 研究仅限于拟南芥模型,未验证其他植物物种的普适性 | 解析植物花器官脱落信号通路的调控机制 | 拟南芥花器官脱落区细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-10-07 |
Scm6A: A Fast and Low-cost Method for Quantifying m6A Modifications at the Single-cell Level
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae039
PMID:39436235
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研究论文 | 开发了一种基于机器学习的单细胞m6A定量方法Scm6A,用于快速低成本检测单细胞水平的m6A修饰 | 首次提出基于机器学习的方法实现单细胞水平m6A定量,解决了现有方法难以检测m6A细胞间异质性的问题 | NA | 开发可靠的单细胞m6A定量方法并验证其在不同疾病研究中的应用 | 外周血单个核细胞、CD4+和CD8+T细胞、肺癌组织、COVID-19患者血液样本 | 机器学习 | 肺癌, COVID-19 | 单细胞RNA测序, m6A测序, 磁激活细胞分选 | 机器学习 | 基因表达数据, 序列特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, m6A-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-04-25 |
Transcriptional profiles of murine oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620502
PMID:39554158
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术,探究了小鼠少突胶质前体细胞(OPCs)在整个生命周期中的转录组变化 | 创建了一种新型转基因小鼠系,用于高分辨率解析OPCs从静止到增殖和分化的关键转变过程中的转录变化 | 研究仅针对小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老如何影响少突胶质前体细胞(OPCs)的转录组特征及其功能 | 小鼠少突胶质前体细胞(OPCs) | 生物医学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | RNA-seq数据 | 30至720天龄的小鼠OPCs | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
Retinoic acid induces human gastruloids with posterior embryo-like structures
2024-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01487-8
PMID:39164488
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研究论文 | 本研究开发了一种通过视黄酸诱导产生具有后部胚胎样结构的人类类原肠胚模型 | 首次发现早期视黄酸脉冲联合后期Matrigel能诱导人类类原肠胚形成包含神经管、体节分段和多种细胞类型的后部胚胎样结构 | 该模型仍为体外培养系统,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂性 | 开发更接近真实人类胚胎发育的体外模型 | 人类类原肠胚 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
Astrocyte-induced Cdk5 expedites breast cancer brain metastasis by suppressing MHC-I expression to evade immune recognition
2024-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01509-5
PMID:39304713
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研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过诱导乳腺癌脑转移瘤中Cdk5过表达,抑制MHC-I表达从而逃避免疫识别的机制 | 首次发现星形胶质细胞诱导的Cdk5过表达通过Irf2bp1-Stat1-importin α-Nlrc5通路抑制MHC-I表达,促进乳腺癌脑转移的免疫逃逸 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究乳腺癌脑转移瘤免疫逃逸的分子机制 | 乳腺癌脑转移瘤、星形胶质细胞、T细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、功能研究 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
Accurate and Flexible Single Cell to Spatial Transcriptome Mapping with Celloc
2024-Oct, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400139
PMID:40212250
|
研究论文 | 开发了一种名为Celloc的新方法,用于实现单细胞RNA测序与空间转录组数据之间的精确映射 | 结合图注意力自编码器和综合损失函数,实现灵活的单细胞到空间位点映射,既能解析每个位点内的细胞组成,也能为scRNA-seq数据中的每个细胞分配空间位置 | NA | 解决单细胞RNA测序数据缺乏空间信息和空间转录组数据分辨率有限的问题 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 148 | 2025-04-10 |
Investigating the mechanisms of inflammation and immune alterations in Parkinson's disease using spatial transcriptomics techniques
2024-10-15, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究帕金森病中炎症和免疫改变的机制 | 首次在MPTP诱导的帕金森病小鼠模型中应用空间转录组学技术,揭示了中脑黑质区域的病理变化与铁死亡之间的关联 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究帕金森病中炎症和免疫改变的分子机制 | MPTP诱导的帕金森病小鼠模型 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组测序 | MPTP诱导的小鼠模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
Multidimensional profiling of human T cells reveals high CD38 expression, marking recent thymic emigrants and age-related naive T cell remodeling
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.019
PMID:39321807
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析鉴定人类近期胸腺迁出细胞并揭示年龄相关的幼稚T细胞重塑动态 | 首次通过单细胞RNA-seq/ATAC-seq联合分析确定SOX4、IKZF2、TOX和CD38作为人类RTEs的分子标志物,并发现CD38表面表达可普遍识别CD8和CD4 RTEs | 研究队列规模有限(158名个体),需要更大样本验证 | 阐明人类近期胸腺迁出细胞的分子特征及其在免疫衰老过程中的动态变化 | 人类T细胞,特别是幼稚T细胞和近期胸腺迁出细胞 | 免疫学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据,流式细胞数据 | 158名个体 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 150 | 2025-10-07 |
Enhancing Endogenous Hyaluronic Acid in Osteoarthritic Joints with an Anti-Inflammatory Supramolecular Nanofiber Hydrogel Delivering HAS2 Lentivirus
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400542
PMID:38593309
|
研究论文 | 开发了一种超分子纳米纤维水凝胶用于递送HAS2慢病毒,以增强骨关节炎关节内源性透明质酸产生 | 首次使用地塞米松磷酸钠作为载体构建超分子纳米纤维水凝胶递送HAS2慢病毒,实现内源性HA增强和滑膜炎症抑制的双重功能 | 研究仅在前交叉韧带横断诱导的OA小鼠模型中进行,尚未在更大型动物或临床环境中验证 | 开发新型骨关节炎治疗策略,通过增强内源性透明质酸产生和抑制炎症来延缓疾病进展 | 骨关节炎小鼠模型和滑膜组织细胞 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,慢病毒递送技术 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 前交叉韧带横断诱导的OA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-07 |
Dynamic dysregulation of retrotransposons in neurodegenerative diseases at the single-cell level
2024-Oct-29, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279363.124
PMID:39424325
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了逆转录转座子在神经退行性疾病中的动态失调机制 | 首次在单细胞水平系统研究神经退行性疾病中逆转录转座子的动态调控,并开发了专门分析工具scARE | 研究仅基于12个单细胞转录组数据集,样本量相对有限 | 探索逆转录转座子在神经退行性疾病中的细胞异质性和动态调控机制 | 阿尔茨海默病、帕金森病和多发性硬化症患者脑组织细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 12个单细胞转录组数据集,涵盖三种神经退行性疾病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2025-10-07 |
Employing single-cell RNA sequencing coupled with an array of bioinformatics approaches to ascertain the shared genetic characteristics between osteoporosis and obesity
2024-Oct-16, Bone & joint research
IF:4.7Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学方法研究骨质疏松与肥胖的共享遗传特征 | 首次结合单细胞RNA测序与多种生物信息学方法系统揭示TLR2在骨质疏松和肥胖中的关键桥梁作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 识别骨质疏松和肥胖的共享遗传标记和分子机制,为同时治疗两种疾病提供靶点 | 骨质疏松和肥胖相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 骨质疏松, 肥胖 | 单细胞RNA测序, WGCNA, KEGG通路富集, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 机器学习, ELISA, 蛋白印迹, 细胞染色 | 机器学习 | 基因表达数据 | GEO数据库中的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in health and disease
2024-Oct, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-024-00841-1
PMID:38719971
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综述 | 本文综述了空间转录组技术在健康和疾病研究中的方法、应用及挑战 | 整合空间转录组与其他组学方法,推动全面分子图谱的构建 | 未具体说明技术应用的局限性 | 探讨空间转录组技术在生物医学研究中的应用前景 | 临床前模型和人类样本 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞测序, 蛋白质组学, 空间表观遗传学 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-07 |
Recessive variants in MYO1C as a potential novel cause of proteinuric kidney disease
2024-Oct, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-024-06426-1
PMID:38904753
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研究论文 | 本研究通过外显子测序发现MYO1C基因隐性变异是儿童肾病综合征的潜在新病因 | 首次发现MYO1C基因隐性变异与肾病综合征的关联,并通过结构建模揭示了变异对蛋白质功能的破坏机制 | 仅在两名无关儿童中观察到该变异,样本量较小,需要进一步验证 | 探索肾病综合征的新单基因病因 | 1649名全球儿科肾病综合征患者队列 | 遗传学 | 肾病综合征 | 外显子测序, 纯合子定位, 单细胞RNA测序, 结构建模 | PyMol结构建模 | 基因组数据, 转录组数据, 结构数据 | 1649名儿科患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 外显子测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-07 |
Defining heritability, plasticity, and transition dynamics of cellular phenotypes in somatic evolution
2024-Oct, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01920-6
PMID:39317739
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研究论文 | 提出PATH框架用于量化细胞状态的可遗传性与可塑性,并推断细胞状态转换和增殖动态 | 开发了PATH框架,首次能够从单细胞谱系追踪数据中量化细胞状态的可遗传性与可塑性,取代了传统的定性概念 | 方法依赖于单细胞谱系追踪数据的可用性,在不同组织类型中的普适性需要进一步验证 | 研究体细胞进化中细胞表型的可遗传性、可塑性和转换动态 | 胰腺癌小鼠模型、原发性胶质母细胞瘤、B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞生物学 | 胰腺癌, 胶质母细胞瘤, 白血病 | 单细胞谱系追踪, 单细胞全基因组测序 | 系统发育分析框架 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞谱系追踪, 单细胞全基因组测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptomics reveals dysregulated immnue homeostasis in different stages in HPV-induced cutaneous squamous cell carcinoma
2024-Oct, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15178
PMID:39385326
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HPV诱导的皮肤鳞状细胞癌不同阶段免疫稳态失调的动态变化 | 首次在HPV诱导的cSCC中应用单细胞RNA测序技术,首次从不同感染阶段研究肿瘤发展过程 | 仅基于单一罕见病例研究,样本量有限 | 探索免疫稳态失调对HPV诱导的皮肤鳞状细胞癌发生发展的影响 | HPV诱导的皮肤鳞状细胞癌患者皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光实验 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 1例罕见HPV诱导cSCC患者的4种不同皮肤状态组织,共11379个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-07 |
B-cell depletion limits HTLV-1-infected T-cell expansion and ameliorate HTLV-1-associated myelopathy
2024-Oct, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52190
PMID:39186315
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和临床试验证明B细胞耗竭可限制HTLV-1感染T细胞的扩增并改善HTLV-1相关脊髓病 | 首次提出通过靶向B细胞治疗HAM的创新策略,揭示了HTLV-1感染B细胞并促进T细胞增殖的新机制 | 样本量有限(14例临床试验患者),需要更大规模研究验证疗效 | 探索HAM的发病机制并评估利妥昔单抗治疗HAM患者的疗效 | HTLV-1相关脊髓病患者的外周血单个核细胞和临床病例 | 单细胞测序分析 | HTLV-1相关脊髓病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 14例HAM患者参与临床试验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-07 |
Single-Cell Proteomic and Transcriptomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619905
PMID:39553982
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研究论文 | 通过单细胞蛋白质组学和转录组学技术表征耐药前列腺癌细胞的分子特征及其与形态变化的关联 | 开发了优化的高通量DIA方法实现单细胞水平蛋白质定量,并首次整合单细胞蛋白质组和转录组数据揭示耐药细胞的分子异质性 | 研究主要基于PC3细胞系,未在更多细胞系或临床样本中验证 | 揭示前列腺癌耐药细胞的蛋白质组学特征和分子机制 | 前列腺癌PC3细胞系及其衍生的耐药细胞 | 单细胞多组学 | 前列腺癌 | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 数据非依赖性采集 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 优化高通量DIA方法(通量60样本/天) |
| 159 | 2025-10-07 |
The SWI/SNF chromatin remodelling complex regulates pancreatic endocrine cell expansion and differentiation in mice in vivo
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06211-7
PMID:38958700
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研究论文 | 本研究探讨SWI/SNF染色质重塑复合物在小鼠胰腺内分泌细胞发育和分化中的调控作用 | 首次在体内模型中系统研究BRG1和BRM ATPase亚基对内分泌细胞发育的协同调控机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明SWI/SNF染色质重塑复合物在内分泌细胞发育中的分子机制 | 小鼠胰腺内分泌祖细胞和分化细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 定量PCR, 组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 代谢表型数据, 组织学图像 | 胚胎期15.5天和出生后不同发育阶段的小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2025-10-07 |
Association between biological ageing and periodontitis: Evidence from a cross-sectional survey and multi-omics Mendelian randomization analysis
2024-10, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14040
PMID:38956929
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研究论文 | 通过横断面调查和多组学孟德尔随机化分析探讨生物衰老与牙周炎之间的关联及潜在因果关系 | 首次结合横断面调查、孟德尔随机化分析和多组学整合方法系统研究生物衰老与牙周炎的因果关系及分子机制 | 基于观察性数据和遗传数据,无法完全排除残余混杂因素的影响 | 探究生物衰老与牙周炎之间的关系及潜在因果机制 | 3189名NHANES参与者和GWAS汇总统计数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序, GWAS, 孟德尔随机化分析, 多组学整合分析 | 多元回归分析, 两步MR中介分析 | 基因组数据, 调查数据, 单细胞测序数据 | 3189名NHANES参与者 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |