单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 617 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-11-27 |
GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae151
PMID:39499852
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研究论文 | 通过单细胞转录组学研究斑马鱼垂体细胞中GnRH与促性腺激素细胞的相互作用 | 揭示了GnRH3基因在斑马鱼垂体中的直接作用及其对促性腺激素细胞的影响 | GnRH3与LH促性腺激素细胞通过Gnrhr2相互作用的最终结果仍未知 | 阐明GnRH3和其他机制在调节斑马鱼垂体促性腺激素细胞中的作用 | 野生型和Gnrh3基因敲除的成年雌性斑马鱼的垂体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和Gnrh3基因敲除的成年雌性斑马鱼 |
| 122 | 2024-11-27 |
Regulation of Diseases-Associated Microglia in the Optic Nerve by Lipoxin B4 and Ocular Hypertension
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585452
PMID:38562864
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研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压升高对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用，并发现其在眼压升高诱导的神经退行性变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨脂氧素B4在眼压升高诱导的视神经退行性变中的作用及其对小胶质细胞的调控机制 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼内注射硅油诱导持续稳定的眼压升高 |
| 123 | 2024-11-26 |
Mapping intratumoral myeloid-T cell interactomes at single-cell resolution reveals targets for overcoming checkpoint inhibitor resistance
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620093
PMID:39554094
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）衍生的单细胞分辨率细胞间相互作用图谱，并应用于研究CD40激动剂（CD40ag）如何改变免疫细胞间的对话，特别是在肿瘤模型中与免疫检查点阻断（ICB）联合使用时 | 本文创新性地开发了一种计算方法，能够有效分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，并揭示了CD40ag在改善ICB反应中的作用 | 本文未详细讨论该计算方法在其他类型肿瘤或不同数据集上的适用性和泛化能力 | 研究如何通过分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，揭示CD40ag在克服免疫检查点抑制剂耐药性中的作用 | 研究对象包括肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞，以及它们在CD40ag和ICB治疗下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 124 | 2024-11-26 |
Cell2Sentence: Teaching Large Language Models the Language of Biology
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557287
PMID:39554079
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研究论文 | 介绍了一种名为Cell2Sentence的新方法，将大型语言模型直接适应于生物学背景，特别是单细胞转录组学 | 通过将基因表达数据转化为“细胞句子”，Cell2Sentence方法填补了自然语言处理与生物学之间的空白 | NA | 探索如何将大型语言模型应用于生物学领域，特别是单细胞转录组学 | 单细胞转录组学数据和大型语言模型 | 自然语言处理 | NA | NA | GPT-2 | 基因表达数据 | NA |
| 125 | 2024-11-26 |
Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619910
PMID:39554174
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研究论文 | 研究探讨了一种细胞因子混合物对人类巨噬细胞进行阿尔茨海默病相关分子和细胞表型的体外重编程能力 | 首次使用细胞因子混合物成功诱导人类巨噬细胞向阿尔茨海默病相关表型转变 | 研究仅限于体外实验，尚未在体内验证其效果 | 研究细胞因子对人类巨噬细胞重编程的能力，以模拟阿尔茨海默病相关表型 | 人类THP-1巨噬细胞 | 细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了细胞因子混合物处理的THP-1巨噬细胞样本 |
| 126 | 2024-11-26 |
Transcriptional profiles of murine oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620502
PMID:39554158
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研究论文 | 研究了小鼠少突胶质前体细胞在不同生命阶段的转录组特征 | 开发了一种新的转基因小鼠模型，并进行了高通量单细胞RNA测序，揭示了不同年龄段少突胶质前体细胞的转录组变化 | NA | 探讨衰老对少突胶质前体细胞的影响 | 小鼠少突胶质前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从30天到720天的小鼠中分离的少突胶质前体细胞 |
| 127 | 2024-11-26 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils Skin Cell Specific Antifungal Immune Responses and IL-1Ra- IL-1R Immune Evasion Strategies of Emerging Fungal Pathogen Candida auris
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619653
PMID:39463935
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研究论文 | 研究揭示了新兴真菌病原体白色念珠菌在皮肤组织中的细胞特异性抗真菌免疫反应和IL-1Ra-IL-1R免疫逃避策略 | 首次通过单细胞转录组学揭示了白色念珠菌在皮肤感染中的细胞特异性免疫反应和免疫逃避机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类免疫反应存在差异 | 探讨白色念珠菌在皮肤感染中的免疫反应和免疫逃避机制 | 白色念珠菌感染的小鼠皮肤组织中的免疫细胞和非免疫细胞 | 数字病理学 | 真菌感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤组织样本 |
| 128 | 2024-11-23 |
Mouse enteric neurons control intestinal plasmacytoid dendritic cell function via serotonin-HTR7 signaling
2024-Oct-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53545-2
PMID:39455564
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研究论文 | 研究了肠道血清素能神经元通过血清素-HTR7信号通路调控肠道浆细胞样树突状细胞功能 | 揭示了肠道血清素能神经元与肠道免疫稳态之间的紧密相互作用，增强了黏膜防御 | NA | 探讨肠道血清素能神经元在免疫反应调控中的作用 | 肠道血清素能神经元、肠道浆细胞样树突状细胞、IgA B细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 129 | 2024-11-23 |
The spatial impact of a Western diet in enriching Galectin-1-regulated Rho, ECM, and SASP signaling in a novel MASH-HCC mouse model
2024-Oct-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00660-3
PMID:39402682
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研究论文 | 研究西方饮食对Galectin-1调控的Rho、ECM和SASP信号在新型MASH-HCC小鼠模型中的空间影响 | 开发了一种新型MASH-HCC小鼠模型，并使用空间转录组学和多重免疫组化技术研究了西方饮食对Galectin-1信号的影响 | NA | 探讨西方饮食对Galectin-1信号在MASH向HCC进展中的影响 | MASH-HCC小鼠模型中的Galectin-1信号 | NA | 肝细胞癌 | 空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、免疫组化数据 | 小鼠样本 |
| 130 | 2024-11-23 |
Transcriptomic mapping of the 5-HT receptor landscape
2024-Oct-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.101048
PMID:39569210
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和多重荧光原位杂交技术，对成年小鼠大脑中的5-HT受体进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞水平上揭示了5-HT受体的多样性分布和共转录现象 | NA | 研究5-HT受体在小鼠大脑中的转录模式和空间分布 | 5-HT受体及其在小鼠大脑中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 转录组数据 | 约400万细胞（scRNA-seq）和约1000万细胞（MERFISH） |
| 131 | 2024-11-22 |
Recovering single-cell expression profiles from spatial transcriptomics with scResolve
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100864
PMID:39326411
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scResolve的方法，用于从空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱 | scResolve能够准确恢复单细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型反卷积无法实现的 | NA | 开发一种方法以从空间转录组学数据中恢复单细胞表达谱 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类乳腺癌和肺部疾病数据 |
| 132 | 2024-11-22 |
Generation, expansion, gene delivery, and single-cell profiling in rhesus macaque plasma B cells
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100878
PMID:39406231
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研究论文 | 本文开发了在食蟹猴血浆B细胞中进行细胞生成、扩增、基因递送和单细胞分析的方法 | 首次在非人灵长类（食蟹猴）B细胞中实现了高效的细胞扩增、分化和基因递送，并发现了与人类细胞不同的免疫检查点分子和主要组织相容性复合物分子的上调 | NA | 开发用于治疗目的的工程化B细胞在免疫健全的大型动物模型中的评估方法 | 食蟹猴血浆B细胞 | NA | NA | 单细胞测序、流式细胞术、腺相关病毒（AAV）递送 | NA | 转录组数据 | NA |
| 133 | 2024-11-22 |
Characterization of the single cell landscape in normal and osteoarthritic equine joints
2024-Oct-20, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-24-40
PMID:39507442
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了正常和骨关节炎马关节滑液中的细胞组成，揭示了骨关节炎免疫病理发生中的关键细胞类型和相互作用 | 首次在马关节滑液和滑膜中进行了单细胞RNA测序，识别了多种免疫细胞亚群及其在骨关节炎中的变化，为未来研究提供了马特异性细胞类型基因签名 | 样本量较小，仅包括三只正常马和三只骨关节炎马的关节滑液，以及一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 | 通过分析骨关节炎关节中的转录组反应，加深对骨关节炎免疫病理发生的理解，促进靶向疗法的开发 | 正常和骨关节炎马的关节滑液和滑膜中的免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,639个细胞来自正常和骨关节炎马的关节滑液，17,690个细胞来自一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 |
| 134 | 2024-11-22 |
Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.19.590370
PMID:38895328
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研究论文 | 研究了单细胞水平上核糖体含量与生长规律的关系 | 首次在单细胞水平上研究了核糖体含量与生长规律的关系，发现单细胞核糖体水平并不精确匹配群体生长速率或营养可用性 | 研究仅限于两种微生物，结果可能不适用于所有物种 | 探讨单细胞核糖体含量与生长规律的关系 | 单细胞酵母和细菌的核糖体含量 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯过程模型 | 转录组数据 | 数千个单细胞样本，来自多种条件、重复和物种 |
| 135 | 2024-11-21 |
Sex-Based Differences in Thyroid Plasma B Cell Infiltration: Implications for Autoimmune Disease Susceptibility
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae148
PMID:39487734
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研究论文 | 研究探讨了甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 首次研究了女性甲状腺中浆细胞的浸润情况，并揭示了CXCL13-CXCR5信号轴在浆细胞招募和组织中的关键作用 | 研究仅限于女性甲状腺，未涉及男性甲状腺的对比分析 | 探讨甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 女性甲状腺中的浆细胞浸润情况 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 136 | 2024-11-21 |
New insight into the development of synpolydactyly caused by expansion of HOXD13 polyalanine based on weighted gene co-expression network analysis
2024-10-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01974-9
PMID:39472920
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨了HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形（SPD）的分子机制 | 首次通过WGCNA分析揭示了HOXD13多聚丙氨酸扩展对免疫反应、破骨细胞分化和DNA复制的调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探讨HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形的分子机制 | HOXD13多聚丙氨酸扩展小鼠模型的肢芽细胞 | NA | 先天性畸形 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 单细胞RNA测序数据 | HOXD13+7A杂合子并指多指畸形小鼠模型的肢芽细胞 |
| 137 | 2024-11-21 |
Synergic activity of FGFR2 and MEK inhibitors in the treatment of FGFR2-amplified cancers of unknown primary
2024-Oct-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.07.011
PMID:39033323
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研究论文 | 研究探讨了FGFR2和MEK抑制剂在治疗FGFR2扩增的未知原发癌中的协同作用 | 首次在未知原发癌模型中验证了FGFR2和MEK抑制剂的协同治疗效果 | 研究仅限于两个CUP细胞系和相应的患者来源的异种移植模型 | 探索FGFR2和MEK抑制剂在治疗FGFR2扩增的未知原发癌中的潜在疗效 | 未知原发癌的细胞系和患者来源的异种移植模型 | 癌症研究 | 未知原发癌 | 荧光原位杂交分析 | NA | 基因表达数据 | 两个CUP细胞系和相应的患者来源的异种移植模型 |
| 138 | 2024-11-21 |
Stiff Hydrogel Encapsulation Retains Mesenchymal Stem Cell Stemness for Regenerative Medicine
2024-Oct-02, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.05.041
PMID:39553898
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研究论文 | 研究通过微流控技术制备薄壳海藻酸盐水凝胶微胶囊，探讨其对间充质干细胞（MSC）增殖和干性的影响 | 首次通过调整海藻酸分子量控制水凝胶壳的机械性能，发现较硬的水凝胶壳能促进MSC的增殖和干性维持 | 未详细探讨不同机械性能水凝胶对MSC亚群的具体影响机制 | 探讨水凝胶封装对MSC在再生医学中应用的潜力 | 间充质干细胞（MSC）和水凝胶封装技术 | 再生医学 | NA | 微流控技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 139 | 2024-11-21 |
Non-genetic differences underlie variability in proliferation among esophageal epithelial clones
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012360
PMID:39466790
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研究论文 | 研究了食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性，发现非遗传因素在不同克隆的增殖能力中起重要作用 | 通过成像和细胞条形码技术追踪克隆，结合单细胞RNA测序，揭示了与高增殖克隆相关的细胞状态和基因通路 | 研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响 | 探讨食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性和相关细胞状态 | 食管上皮细胞（EPC2-hTERT）的克隆增殖行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学模型 | 图像数据和基因表达数据 | 涉及约10%的指数增长克隆和其余的非增殖克隆 |
| 140 | 2024-11-20 |
Identifying a CD8T cell signature in the tumor microenvironment to forecast gastric cancer outcomes from sequencing data
2024-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-603
PMID:39554559
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研究论文 | 研究通过分析肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因，预测胃癌患者的预后 | 首次利用CD8T细胞相关基因构建胃癌预后预测模型 | 研究仅基于TCGA数据库的数据，样本量有限 | 探索肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因在胃癌预后预测中的作用 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8T细胞相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞mRNA测序 | Cox回归模型 | 基因数据 | TCGA数据库中的胃癌患者数据 |