单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals immune features of treatment response to neoadjuvant immunochemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52977-0
PMID:39438438
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫特征 | 首次通过单细胞RNA测序结合T细胞受体测序，系统解析了食管鳞癌新辅助免疫化疗响应者与非响应者的肿瘤微环境差异，发现CXCL13+CD8+ Tex细胞可作为治疗响应的预测标志物 | 样本量有限，需要更大规模的研究验证发现 | 探究食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫学机制 | 接受新辅助免疫化疗的食管鳞癌患者组织样本 | 数字病理 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管鳞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-06 |
Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-10-17, Viruses
DOI:10.3390/v16101623
PMID:39459954
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研究论文 | 开发了一种用于检测、分选和单细胞RNA测序分析丙型肝炎病毒特异性T细胞的激活诱导标记检测方法 | 建立了不依赖MHC多聚体的高灵敏度抗原特异性T细胞检测方法，并首次应用于HCV特异性T细胞的单细胞RNA测序分析 | 仅在一个研究对象中进行了验证，需要更大规模的队列研究来确认方法的普适性 | 开发能够识别和分离HCV特异性T细胞用于单细胞转录组分析的新方法 | 丙型肝炎病毒特异性CD4和CD8 T细胞 | 免疫学 | 丙型肝炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，流式细胞分选 | NA | 单细胞基因表达数据，TCR序列数据 | 一个研究对象（包含1023个AIM CD4 T细胞克隆型和160个AIM CD8 T细胞克隆型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
Putting proteins in context
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
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研究论文 | 介绍了一种名为PINNACLE的几何深度学习方法，通过整合分析蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组数据生成蛋白质的上下文表征 | 首次将蛋白质相互作用与多器官单细胞转录组数据结合，利用几何深度学习方法生成具有生物环境背景的蛋白质表征 | NA | 解决蛋白质表征缺乏生物环境背景的问题 | 蛋白质及其相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 几何深度学习 | 蛋白质相互作用数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
Mouse enteric neurons control intestinal plasmacytoid dendritic cell function via serotonin-HTR7 signaling
2024-10-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53545-2
PMID:39455564
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道神经元通过血清素-HTR7信号通路调控肠道浆细胞样树突状细胞功能的新机制 | 首次发现肠道血清素能神经元通过HTR7信号轴调控pDC功能，并揭示肠道神经元与固有层树突状细胞之间的双向通讯新模式 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；仅针对沙门氏菌感染模型，对其他病原体的适用性未知 | 探究肠道血清素能神经元在免疫稳态调控中的功能 | 小鼠肠道血清素能神经元和浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 肠道感染 | 单细胞RNA测序, 小鼠遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils Skin Cell Specific Antifungal Immune Responses and IL-1Ra- IL-1R Immune Evasion Strategies of Emerging Fungal Pathogen Candida auris
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619653
PMID:39463935
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示新兴真菌病原体耳念珠菌在皮肤感染中的免疫应答和IL-1Ra-IL-1R免疫逃逸机制 | 首次使用单细胞转录组学解析耳念珠菌皮肤感染的细胞特异性免疫反应，发现该真菌通过上调IL-1RN基因表达和独特细胞壁甘露聚糖外层逃逸宿主防御 | 研究基于小鼠模型，人类皮肤环境的差异可能影响结果适用性 | 阐明耳念珠菌在皮肤组织中持续定植的宿主免疫调控因素 | 耳念珠菌感染的小鼠皮肤组织 | 单细胞生物学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of human pancreatic islets reveals genes responsive to glucose exposure over 24 h
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06214-4
PMID:38967666
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了人类胰岛在24小时内对葡萄糖暴露的基因响应特征 | 首次在单细胞分辨率下系统分析人类胰岛六种细胞类型在24小时内对高糖环境的转录组动态响应，并结合遗传学数据鉴定糖尿病相关效应基因 | 仅使用两名供体的胰岛样本，样本量较小；体外实验环境可能与体内实际情况存在差异 | 探索高糖条件对人类胰岛基因表达的影响及其与2型糖尿病发病机制的关系 | 人类胰岛中的六种细胞类型：α细胞、β细胞、γ细胞、δ细胞、导管细胞和腺泡细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), CRISPR干扰, 葡萄糖刺激胰岛素分泌实验 | 离散时间和连续时间统计模型 | 单细胞转录组数据 | 2名人类供体的胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2025-10-06 |
OrganogenesisDB: A Comprehensive Database Exploring the Cell-Type Identities and Gene Expression Dynamics during Organogenesis
2024-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301758
PMID:38967205
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研究论文 | 开发了一个名为OrganogenesisDB的综合数据库，用于探索器官发生过程中的细胞类型鉴定和基因表达动态 | 首个专门针对器官发生过程的综合数据库，整合了超过140万个细胞的单细胞RNA测序数据和3324个细胞标记物 | NA | 解析细胞谱系决定和揭示器官发生的潜在机制 | 人类和小鼠器官发育过程中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过140万个细胞，来自49个已发表数据集，涵盖9个人类器官和4个小鼠器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Single Nucleus Total RNA Sequencing of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Gliomas
2024-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301801
PMID:38958078
|
研究论文 | 开发了自动化snRandom-seq平台用于福尔马林固定石蜡包埋胶质瘤样本的单核总RNA测序分析 | 开发了针对FFPE样本优化的高通量单核总RNA测序平台，整合自动化单核分离和液滴条形码系统 | 样本数量相对有限（17个FFPE样本），主要聚焦于胶质瘤 | 探索胶质瘤的分子多样性和肿瘤进化过程 | 各种胶质瘤亚型的FFPE样本，包括罕见临床样本和匹配的原发-复发胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 脑癌/胶质瘤 | 单核总RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 116,492个单核来自17个FFPE样本 | NA | 单细胞RNA测序 | snRandom-seq | 自动化单核总RNA测序平台，整合自动化单核分离和液滴条形码系统，基于随机引物的scRNA-seq化学方法 |
| 129 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies aberrant glomerular angiogenic signalling in the early stages of WT1 kidney disease
2024-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6339
PMID:39177649
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了WT1肾病早期阶段肾小球血管生成信号传导的异常机制 | 揭示了WT1肾病早期阶段肾小球血管生成信号异常的新机制，并发现肾上腺髓质素作为一种促血管生成因子在早期损伤中的上调 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究WT1肾病早期发病机制及细胞间通讯异常 | WT1基因突变小鼠模型及人类WT1肾小球病变活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | WT1突变小鼠模型及人类活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics of paediatric ovary: Molecular insights into the dysregulated signalling pathways underlying premature ovarian insufficiency in classic galactosemia
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70043
PMID:39440457
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析经典半乳糖血症患儿卵巢组织，揭示早发性卵巢功能不全的分子机制 | 首次构建了经典半乳糖血症患儿卵巢的单核转录组图谱和空间转录组景观，揭示了PTEN/PI3K/AKT信号通路失调、内质网应激和DNA损伤等新机制 | 研究样本量有限，仅针对青春期前女孩，未验证治疗干预效果 | 探究经典半乳糖血症患者早发性卵巢功能不全的分子机制 | 经典半乳糖血症患儿的卵巢组织活检样本 | 数字病理学 | 卵巢功能不全 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | 青春期前女孩卵巢组织活检（含CG患者和对照） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-06 |
Overcoming barriers to single-cell RNA sequencing adoption in low- and middle-income countries
2024-Oct, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-024-01564-4
PMID:38565638
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观点文章 | 探讨在中低收入国家推广单细胞RNA测序技术面临的障碍及解决方案 | 首次系统分析单细胞测序技术在中低收入国家应用面临的独特挑战，并提出促进全球平等参与的协作框架 | 未提供具体实施案例或定量数据分析 | 促进单细胞测序技术在全球范围内的公平应用和祖先多样性包容 | 中低收入国家的研究人员和捐赠者群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Exponential family measurement error models for single-cell CRISPR screens
2024-Oct-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxae010
PMID:38649751
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研究论文 | 提出GLM-EIV方法解决单细胞CRISPR筛选数据分析中的统计挑战 | 将经典变量误差模型扩展至指数族分布，可处理响应变量和噪声预测变量受相同混杂变量影响的情况 | 未明确说明方法在特定数据类型或规模下的适用性限制 | 开发单细胞CRISPR筛选数据的统计分析方法 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | GLM-EIV（基于广义线性模型的变量误差模型） | 基因表达数据 | 两个大规模单细胞CRISPR筛选数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
Integrative spatial and genomic analysis of tumor heterogeneity with Tumoroscope
2024-10-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53374-3
PMID:39472583
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研究论文 | 提出首个概率模型Tumoroscope，通过整合病理图像、全外显子组测序和空间转录组数据，在接近单细胞分辨率下推断癌症克隆及其定位 | 首个能够基于体细胞点突变直接定位肿瘤组织中克隆的概率模型，解决了空间转录组位点中克隆比例反卷积的问题 | NA | 研究肿瘤的空间和基因组异质性对癌症进展、治疗和生存的影响 | 前列腺癌和乳腺癌数据集 | 数字病理学 | 前列腺癌,乳腺癌 | 全外显子组测序,空间转录组学 | 概率模型 | 病理图像,基因组测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,全外显子组测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies
2024-Oct-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009983
PMID:39455096
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研究论文 | 本研究揭示了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞作为胃癌转移生物标志物的重要作用 | 首次发现SPI1+CD68+巨噬细胞亚群在胃癌转移中的关键作用及其作为联合治疗策略的生物标志物 | 研究主要基于实验模型，需要进一步临床验证 | 评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用机制 | 胃癌组织和相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术,染色质免疫沉淀 | 小鼠腹膜转移模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
A spatiotemporal molecular atlas of mouse spinal cord injury identifies a distinct astrocyte subpopulation and therapeutic potential of IGFBP2
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.016
PMID:39029468
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研究论文 | 本研究构建了小鼠脊髓损伤的时空分子图谱，鉴定出表达Igfbp2的星形胶质细胞亚群并揭示其治疗潜力 | 首次在脊髓损伤中识别出从白质迁移至灰质的Astro-GMii星形胶质细胞亚群，并证明IGFBP2蛋白具有促进神经突生长和功能恢复的治疗潜力 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类临床中验证 | 解析脊髓损伤后的时空分子变化机制并探索治疗靶点 | 小鼠脊髓损伤模型 | 空间转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
DNA methylation memory of pancreatic acinar-ductal metaplasia transition state altering Kras-downstream PI3K and Rho GTPase signaling in the absence of Kras mutation
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.26.620414
PMID:39553977
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研究论文 | 本研究探讨胰腺腺泡-导管化生（ADM）过渡状态在无KRAS突变情况下通过DNA甲基化记忆影响下游信号通路的机制 | 首次发现在无致癌基因突变情况下，ADM过渡状态细胞能通过DNA甲基化记忆持续改变KRAS下游信号通路 | 研究主要关注DNA甲基化机制，未全面探讨其他表观遗传修饰的潜在作用 | 探究胰腺腺泡-导管化生过渡状态的表观遗传记忆机制及其在肿瘤发生中的作用 | 胰腺腺泡细胞、ADM过渡状态细胞、人类胰腺上皮内瘤变样本 | 表观遗传学 | 胰腺癌 | DNA甲基化分析、单细胞空间转录组学、基因表达分析 | NA | 表观遗传数据、基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
The small inhibitor WM-1119 effectively targets KAT6A-rearranged AML, but not KMT2A-rearranged AML, despite shared KAT6 genetic dependency
2024-10-08, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01610-0
PMID:39380002
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研究论文 | 评估KAT6A抑制剂WM-1119对KAT6A重排和KMT2A重排急性髓系白血病的治疗效果差异 | 首次发现KAT6A催化活性抑制剂对KAT6A重排AML有效，但对KMT2A重排AML需靶向降解整个KAT6A蛋白 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 评估不同KAT6A靶向治疗策略对KAT6A和KMT2A重排AML的治疗潜力 | KAT6A重排和KMT2A重排急性髓系白血病细胞 | 血液肿瘤研究 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术,集落形成实验,shRNA敲低,CRISPR敲除,单细胞RNA-seq,ChIP-seq | 遗传修饰小鼠模型 | 基因表达数据,表观遗传数据,细胞功能数据 | 人类AML细胞系和原代患者AML样本 | NA | 单细胞RNA-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
Early transcriptional similarities between two distinct neural lineages during ascidian embryogenesis
2024-10, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.06.005
PMID:38878991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海鞘胚胎中两种不同神经谱系在发育早期的转录组动态 | 首次以高时间分辨率比较两种不同发育起源神经前体细胞的转录组特征，发现神经板阶段存在早期转录相似性 | 转录因子结合位点富集分析显示两种神经谱系间共享转录调控的证据有限 | 探究不同神经谱系在谱系限制过程中的转录状态相似性程度 | 海鞘胚胎中两种不同发育起源的神经前体细胞及其姐妹细胞谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | PCA分析, 层次聚类 | 单细胞转录组数据 | 从16细胞期到神经板阶段连续五个细胞周期的手工分离神经前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the gene expression profile and cellular communication in human fetal heart development
2024-10, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.06.004
PMID:38876166
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类胎儿心脏发育过程中的基因表达谱和细胞通讯 | 首次在人类胎儿心脏发育的四个时间点（GW8、GW10、GW11、GW17）系统描绘单细胞基因表达图谱，并发现关键信号通路随发育时间的动态变化 | 仅分析了四个发育时间点，样本时间跨度有限；未验证功能机制 | 解析人类胎儿心脏发育过程中的细胞分化和细胞通讯机制 | 人类胎儿心脏组织 | 单细胞组学 | 心脏发育 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4个时间点（GW8、GW10、GW11、GW17）的胎儿心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Understanding the development of enzalutamide resistance based on a functional single-cell approach
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619319
PMID:39484437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的机制 | 首次在单细胞水平揭示AR低表达细胞亚群是恩杂鲁胺耐药的前体细胞 | 研究基于LNCaP细胞系，需要在更多模型和临床样本中验证 | 探索前列腺癌恩杂鲁胺耐药机制并寻找潜在治疗策略 | LNCaP前列腺癌细胞系 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LNCaP细胞系单细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |