单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 668 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-11-07 |
Epigenetic agents plus anti-PD-1 reprogram the tumor microenvironment and restore antitumor efficacy in Hodgkin lymphoma
2024-10-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024487
PMID:39093981
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研究论文 | 研究评估了三联疗法（组蛋白去乙酰化酶抑制剂、DNA甲基转移酶抑制剂和抗PD-1抗体）在复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤中的疗效和安全性 | 首次评估了三联疗法在先前接受过DP疗法的患者中的疗效，并揭示了该疗法通过调节肿瘤微环境克服免疫疗法抵抗的机制 | 研究样本量较小，且仅限于先前接受过DP疗法的患者 | 评估三联疗法在复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤中的疗效和安全性，并探讨其克服免疫疗法抵抗的机制 | 复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 52名患者 |
| 122 | 2024-11-07 |
GraphCVAE: Uncovering cell heterogeneity and therapeutic target discovery through residual and contrastive learning
2024-Oct-31, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123208
PMID:39488267
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GraphCVAE的模型，通过结合空间和形态信息、纠正批次效应和管理异质数据，增强空间域识别能力 | GraphCVAE结合了多层图卷积网络和变分自编码器，通过对比学习捕捉细胞类型和状态的细微差异，显著提高了空间信息表示和整合的准确性 | NA | 提高空间转录组学中空间域识别的准确性，揭示细胞异质性和治疗靶点 | 空间转录组学数据，特别是前额叶皮质和胶质母细胞瘤等疾病数据 | 机器学习 | NA | 图卷积网络（GCN），变分自编码器（VAE），对比学习 | 图卷积网络（GCN），变分自编码器（VAE） | 空间转录组学数据 | 涉及多种空间转录组学数据集，包括前额叶皮质和胶质母细胞瘤等 |
| 123 | 2024-11-07 |
Exogenous IL-33 promotes tumor immunity via macroscopic regulation of ILC2s
2024-10-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77751-6
PMID:39478174
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研究论文 | 研究探讨了外源性IL-33通过宏观调控ILC2s促进肿瘤免疫的作用 | 首次揭示了外源性IL-33通过减少中性粒细胞积累和增加ILC2s比例来改善肿瘤免疫微环境，并促进抗肿瘤免疫反应 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类中验证其效果 | 探讨外源性IL-33对肿瘤免疫微环境的影响及其机制 | 外源性IL-33、ILC2s、中性粒细胞、肿瘤免疫微环境 | NA | 黑色素瘤 | scRNA-seq、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞比例数据 | Il7rArg1小鼠 |
| 124 | 2024-11-07 |
The critical involvement of monocytes/macrophages in the pathogenesis of primary Sjögren's syndrome: New evidence from Mendelian randomization and single-cell sequencing
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39130
PMID:39497977
|
研究论文 | 本文探讨了单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征（pSS）发病机制中的关键作用 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，全面揭示了单核细胞/巨噬细胞在pSS复杂发病机制中的贡献 | NA | 揭示单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征发病机制中的作用 | 单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征中的基因表达和信号通路变化 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 1434个差异表达基因，其中60个与pSS发生密切相关 |
| 125 | 2024-11-07 |
Novel mechanisms of intestinal flora regulation in high-altitude hypoxia
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38220
PMID:39498080
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研究论文 | 研究探讨了在高海拔低氧环境下，厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程的分子机制 | 揭示了厚壁菌门通过抑制HIF-1α/糖酵解途径来缓解高海拔低氧引起的肠道黏膜屏障损伤 | NA | 探究高海拔低氧环境下肠道菌群调节的分子机制 | 厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程 | NA | NA | 单细胞转录组测序、蛋白质组分析、代谢组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA |
| 126 | 2024-11-07 |
Deciphering STAT3's negative regulation of LHPP in ESCC progression through single-cell transcriptomics analysis
2024-Oct-28, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00962-0
PMID:39468431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了STAT3对LHPP在食管鳞状细胞癌进展中的负调控作用 | 发现了STAT3对LHPP表达的显著调控作用，揭示了食管鳞状细胞癌发病机制的新方面 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌中的细胞动力学和分子机制，特别是STAT3与LHPP的转录相互作用 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤和邻近正常组织细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 44,206个细胞样本，包括21名食管鳞状细胞癌患者的临床样本 |
| 127 | 2024-11-07 |
Metabolic reprogramming landscape of pan-cancer by single-cell transcriptome data integration
2024-Oct-24, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.10.026
PMID:39500689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-11-07 |
CXCL9, CXCL10, and CCL19 synergistically recruit T lymphocytes to skin in lichen planus
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179899
PMID:39190494
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和体外迁移实验，揭示了扁平苔藓中CXCL9、CXCL10和CCL19协同招募T淋巴细胞到皮肤的机制 | 首次发现扁平苔藓角质形成细胞和成纤维细胞特异性分泌CXCL9、CXCL10和CCL19，并证明这些细胞因子协同增强CD8+ T细胞的招募 | 研究样本量较小，仅涉及7名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨扁平苔藓的分子发病机制并寻找新的治疗靶点 | 扁平苔藓患者的皮肤和血液样本 | 免疫学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名扁平苔藓患者及其健康对照者的皮肤和血液样本 |
| 129 | 2024-11-07 |
Protocol for mapping T cell activation using single-cell RNA-seq
2024-Oct-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103409
PMID:39427308
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于抗CD3/CD28珠刺激和单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究T细胞激活的实验方案 | 提出了使用抗CD3/CD28珠刺激和scRNA-seq技术来研究T细胞激活的完整实验方案 | NA | 研究T细胞激活的机制 | 人类外周血单个核细胞（PBMCs）和CD4 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 130 | 2024-11-07 |
Single-cell transcriptomics of pediatric Burkitt lymphoma reveals intra-tumor heterogeneity and markers of therapy resistance
2024-Oct-18, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02431-3
PMID:39424708
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析儿童伯基特淋巴瘤的肿瘤内异质性和治疗抵抗标志物 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了儿童伯基特淋巴瘤的肿瘤内异质性，并识别出与治疗抵抗相关的候选生物标志物 | 研究仅分析了EBV阴性的伯基特淋巴瘤样本，可能无法完全代表所有病例 | 探讨儿童伯基特淋巴瘤的异质性及治疗反应与非反应者的特征差异 | 儿童伯基特淋巴瘤患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个诊断时的EBV阴性伯基特淋巴瘤样本 |
| 131 | 2024-11-07 |
Characterization of EpCAM-Positive and EpCAM-Negative Tumor Cells in Early-Stage Breast Cancer
2024-Oct-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252011109
PMID:39456890
|
研究论文 | 研究早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征 | 强调了EpCAM阴性CTC的存在，并评估了不同亚群中的干细胞标志物和EMT标志物 | 需要进一步研究以阐明EpCAM阴性和阳性CTC的预后意义 | 探讨早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征及其预后意义 | 早期乳腺癌中的EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 涉及早期乳腺癌患者的CTC和原发肿瘤样本 |
| 132 | 2024-11-07 |
Microglia Signatures: A Cause or Consequence of Microglia-Related Brain Disorders?
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010951
PMID:39456734
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研究论文 | 本文探讨了小胶质细胞特征与相关脑部疾病之间的关系 | 利用单细胞RNA测序技术，详细研究了小胶质细胞在不同功能状态下的独特基因表达模式 | NA | 探讨小胶质细胞特征与神经退行性疾病和其他脑部疾病之间的关联 | 小胶质细胞的基因表达特征及其在不同病理条件下的变化 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 133 | 2024-11-07 |
Deubiquitinase USP18 inhibits hepatic stellate cells activation and alleviates liver fibrosis via regulation of TAK1 activity
2024-Oct-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114235
PMID:39236989
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研究论文 | 研究揭示了去泛素化酶USP18通过调节TAK1活性抑制肝星状细胞活化和减轻肝纤维化的机制 | 首次揭示了USP18在肝星状细胞活化中的作用及其通过调节TAK1活性减轻肝纤维化的机制 | NA | 揭示肝星状细胞活化的分子机制，寻找抑制肝纤维化的有效靶点 | 肝星状细胞（HSCs）和去泛素化酶USP18 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠原代肝星状细胞和CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型 |
| 134 | 2024-11-06 |
Seq-Scope: repurposing Illumina sequencing flow cells for high-resolution spatial transcriptomics
2024-Oct-31, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01065-0
PMID:39482362
|
研究论文 | Seq-Scope利用Illumina测序平台进行高分辨率、高内容的空间转录组分析 | Seq-Scope通过重新利用Illumina测序平台，克服了传统空间转录组技术的低分辨率、有限转录覆盖、复杂流程、可扩展性差和高成本等问题，提供亚微米级分辨率、高捕获效率、快速周转时间和精确的组织病理学注释 | NA | 开发一种高分辨率、高内容的空间转录组分析方法 | 组织切片的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 多个组织切片，面积为7 mm × 7 mm或更大 |
| 135 | 2024-11-06 |
Identification of immune feature genes and intercellular profiles in diabetic cardiomyopathy
2024-Oct-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v15.i10.2093
PMID:39493556
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研究论文 | 研究探讨了糖尿病心肌病（DCM）中的免疫分子机制，并基于免疫特征基因构建了诊断和预后模型 | 首次识别出Proenkephalin（Penk）和retinol binding protein 7（Rbp7）作为潜在的DCM生物标志物，并揭示了间质细胞与免疫细胞之间的异常表型转换和信号交流 | NA | 探讨糖尿病心肌病中的免疫分子机制并构建诊断和预后模型 | 糖尿病心肌病患者的免疫特征基因和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序（RNA-seq）、单样本基因集富集分析（ssGSEA）、实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹技术 | 机器学习 | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 验证队列中的样本数量未明确提及 |
| 136 | 2024-11-06 |
Loss of Smek1 Induces Tauopathy and Triggers Neurodegeneration by Regulating Microtubule Stability
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400584
PMID:39206808
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研究论文 | 研究探讨了Smek1在tauopathy中防止神经退行性变的作用 | 首次证明Smek1缺乏通过加剧tau病理和线粒体功能障碍以年龄依赖性方式逐渐诱导神经退行性变 | NA | 研究Smek1在tauopathy和神经退行性变中的生理和病理作用 | Smek1在tauopathy中的作用及其对神经退行性变的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质相互作用分析 | Smek1敲除小鼠和shSmek1细胞 |
| 137 | 2024-11-06 |
Myeloid Cells and Sensory Nerves Mediate Peritendinous Adhesion Formation via Prostaglandin E2
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405367
PMID:39207041
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研究论文 | 研究探讨了骨髓细胞和感觉神经通过前列腺素E2介导腱周粘连形成的机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析结合条件性敲除小鼠模型，揭示了COX2在骨髓细胞和EP4基因在感觉神经中的作用，以及PGE2在腱修复中的复杂作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞RNA测序，可能无法完全反映人类临床情况 | 阐明前列腺素E2在腱周粘连形成和腱修复中的复杂作用 | 骨髓细胞、感觉神经、腱周粘连、腱修复 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠样本，以及八种条件性敲除小鼠 |
| 138 | 2024-11-06 |
Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405421
PMID:39207055
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研究论文 | 研究揭示了缺氧环境下IER2上调通过靶向ITGB1促进脊索瘤进展的分子机制 | 首次阐明了缺氧微环境通过IER2上调促进脊索瘤进展的分子机制，并揭示了ERS-CAF通过IER2/GMFG/ITGB1轴调节SPP1巨噬细胞加剧脊索瘤进展 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 揭示脊索瘤中ERS-CAF亚群的致癌机制 | 脊索瘤中的ERS-CAF亚群及其在肿瘤进展中的作用 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析仪、数据独立采集蛋白质组学、批量RNA测序、多重定量免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 多个脊索瘤样本 |
| 139 | 2024-11-04 |
SPP1+ macrophages and FAP+ fibroblasts promote the progression of pMMR gastric cancer
2024-Oct-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76298-w
PMID:39482333
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研究论文 | 研究了错配修复状态对胃癌肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示了pMMR胃癌中GC2细胞、SPP1+巨噬细胞和FAP+成纤维细胞在促进肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小，且仅限于特定类型的胃癌患者 | 探讨错配修复状态对胃癌肿瘤免疫微环境的影响 | 胃癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 33个新鲜组织样本，来自25名患者，包括10个正常组织、6个dMMR肿瘤组织和17个pMMR肿瘤组织 |
| 140 | 2024-11-04 |
Hyperuricemia suppresses lumican, exacerbating adverse remodeling after myocardial infarction by promoting fibroblast phenotype transition
2024-Oct-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05778-4
PMID:39482719
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研究论文 | 研究尿酸血症通过抑制lumican表达加剧心肌梗死后不良重塑的机制 | 首次揭示了尿酸血症通过减少lumican表达促进心肌梗死后纤维母细胞表型转变，从而加剧不良心脏重塑 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在临床患者中验证 | 探讨尿酸血症在心肌梗死病理过程中的作用及其机制 | 尿酸血症对心肌梗死后心脏重塑的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 酶联免疫吸附测定、免疫荧光、单细胞RNA测序、Western blotting、实时定量PCR | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 痛风患者、心衰患者和小鼠模型的数据 |