单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
101	2025-10-06	Identifying genetic variants that influence the abundance of cell states in single-cell data 2024-Oct, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-024-01909-1 PMID:39327486	研究论文	开发了一种名为GeNA的统计工具，用于识别单细胞数据中细胞状态丰度的数量性状位点	无需预定义细胞状态，灵活识别与遗传变异最相关的细胞状态丰度变化	仅基于969名个体的外周血单细胞RNA测序数据，样本规模相对有限	识别影响单细胞数据中细胞状态丰度的遗传变异	人类免疫细胞状态	生物信息学	自身免疫疾病	单细胞RNA测序	统计模型	单细胞RNA测序数据	969名个体的外周血样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
102	2025-10-06	Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea 2024-10-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52946-7 PMID:39384741	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示酒渣鼻患者皮肤中异常细胞群，并发现成纤维细胞是疾病发展的关键决定因素	首次构建酒渣鼻面部皮肤单细胞图谱，识别出特征性IFNγ介导的角质形成细胞亚群，并证实成纤维细胞是产生促炎和血管舒张信号的主要细胞类型	研究仅针对女性患者，样本来源局限于面部皮肤	解析酒渣鼻的细胞和分子机制	女性酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本	单细胞组学	酒渣鼻	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
103	2025-10-06	Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis 2024-10-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53104-9 PMID:39375367	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用	首次在PBC患者和鼠类模型中鉴定出具有JAK-STAT通路活化的肝脏驻留Th1样细胞群，并证明阻断该通路可缓解肝脏炎症	传统检测方法的局限性导致对PBC局部肝脏免疫发病机制的认识不完整	解析原发性胆汁性胆管炎的免疫细胞图谱和分子机制	原发性胆汁性胆管炎患者和鼠类PBC模型	单细胞组学	原发性胆汁性胆管炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	PBC患者和鼠类PBC模型	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
104	2025-10-06	Distinctive CD39+CD9+ lung interstitial macrophages suppress IL-23/Th17-mediated neutrophilic asthma by inhibiting NETosis 2024-10-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53038-2 PMID:39366998	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现CD39+CD9+肺间质巨噬细胞亚群可通过抑制NETosis和Th17细胞活化来抑制中性粒细胞性哮喘	首次发现CD39+CD9+肺间质巨噬细胞亚群通过CD9依赖性附着和CD39依赖性ATP清除机制抑制NETosis和中性粒细胞炎症	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探索抑制中性粒细胞性哮喘的潜在通路和治疗靶点	肺间质巨噬细胞、中性粒细胞、Th17细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	哮喘患者样本和小鼠NDA模型	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
105	2025-10-06	GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish 2024-Oct-30, Endocrinology IF:3.8Q2 DOI:10.1210/endocr/bqae151 PMID:39499852	研究论文	通过斑马鱼垂体单细胞转录组分析揭示GnRH与促性腺激素细胞间的相互作用机制	首次在斑马鱼中通过单细胞RNA测序揭示LH和FSH促性腺激素细胞中促性腺激素β亚基的表达比例及GnRH受体的差异表达模式	Gnrh3与促性腺激素细胞相互作用的具体结果仍不明确	阐明下丘脑Gnrh3及其他机制调控垂体促性腺激素细胞的作用	野生型和gnrh3基因敲除成年雌性斑马鱼的垂体细胞	单细胞转录组学	生殖内分泌疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞基因表达数据	野生型和gnrh3-/-成年雌性斑马鱼的所有垂体细胞	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
106	2025-10-06	Spatial transcriptomics of a parasitic flatworm provides a molecular map of drug targets and drug resistance genes 2024-10-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53215-3 PMID:39414795	研究论文	本研究通过空间转录组技术构建了肝片吸虫的分子图谱，识别了组织特异性基因表达模式	首次提供了寄生虫肝片吸虫的空间转录组图谱，揭示了药物靶点和耐药基因的组织特异性表达	NA	构建寄生虫肝片吸虫的空间转录组图谱，识别组织特异性基因表达和药物靶点	肝片吸虫（Fasciola hepatica）寄生虫	空间转录组学	寄生虫感染	空间转录组学，原位杂交	NA	空间转录组数据，基因表达数据	NA	NA	空间转录组学	NA	NA
107	2025-10-06	TGF-β-mediated crosstalk between TIGIT+ Tregs and CD226+CD8+ T cells in the progression and remission of type 1 diabetes 2024-10-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53264-8 PMID:39406740	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病进展和缓解过程中TIGIT+ Tregs与CD226+CD8+ T细胞之间的相互作用机制	首次发现TIGIT+CCR7+ Tregs和CD226+CCR7+CD8+ T细胞在糖尿病缓解期的动态变化，并证实它们通过TGF-β信号通路相互作用	研究样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异	探索1型糖尿病免疫调节机制并寻找生物标志物	1型糖尿病患者和糖尿病小鼠模型的免疫细胞	免疫学	1型糖尿病	单细胞RNA测序，机器学习，细胞通讯分析，体外功能实验	机器学习算法	单细胞转录组数据	不同疾病阶段的1型糖尿病患者队列	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
108	2025-10-06	Non-homogenous intratumor ionizing radiation doses synergize with PD1 and CXCR2 blockade 2024-10-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53015-9 PMID:39397001	研究论文	本研究探索了非均匀肿瘤内电离辐射剂量与PD1和CXCR2阻断联合治疗的协同效应	首次提出在同一个肿瘤内结合低剂量放疗的免疫刺激特性和高剂量放疗的细胞杀伤特性，并与免疫调节剂联合使用	研究仅限于小鼠模型中的结直肠癌和乳腺癌，尚未在人体验证	提高放疗疗效同时减少毒性，改善放疗与免疫检查点联合治疗的治疗指数	免疫活性雌性小鼠的结直肠癌和乳腺癌模型	肿瘤免疫学	结直肠癌, 乳腺癌	流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序	NA	基因表达数据, 细胞表型数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
109	2025-10-06	Cell type and regulatory analysis in amphioxus illuminates evolutionary origin of the vertebrate head 2024-10-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52938-7 PMID:39402029	研究论文	本研究通过整合单细胞转录组学、信号通路扰动和顺式调控分析，揭示了脊椎动物头部特征的进化起源	首次在文昌鱼中鉴定出前索板样和神经嵴样细胞群体，并证明其发育调控机制在脊椎动物中具有保守性	研究主要基于模式生物文昌鱼，需要更多物种验证来确认进化保守性	探索脊椎动物头部特征的进化起源	文昌鱼胚胎发育过程中的细胞类型	发育生物学	NA	单细胞转录组学、信号通路扰动、顺式调控分析、跨物种转基因实验	NA	单细胞转录组数据	文昌鱼胚胎发育样本	NA	single-cell RNA-seq	NA	NA
110	2025-10-06	Best practices for differential accessibility analysis in single-cell epigenomics 2024-10-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53089-5 PMID:39394227	研究论文	本文系统评估了单细胞表观基因组学数据中差异可及性分析的统计方法并提出了最佳实践方案	首次对单细胞ATAC-seq数据中差异可及性分析的统计方法进行系统性评估，并开发了相应的R软件包	评估主要基于匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据，可能存在方法评估的局限性	确定单细胞表观基因组学数据差异可及性分析的最佳统计方法	单细胞ATAC-seq数据的差异可及性分析方法	生物信息学	NA	单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq	NA	表观基因组学数据	NA	NA	单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq	NA	NA
111	2025-10-06	Single-cell RNA sequencing reveals the process of CA19-9 production and dynamics of the immune microenvironment between CA19-9 (+) and CA19-9 (-) PDAC 2024-Oct-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003130 PMID:38816396	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌中CA19-9的产生过程及CA19-9阳性与阴性患者免疫微环境的动态差异	首次在单细胞分辨率下识别出三种高产生CA19-9的癌细胞亚型，发现CA19-9通过抗原呈递癌症相关成纤维细胞的旁路产生机制，并证实CA19-9促进巨噬细胞M2极化的新功能	样本量较小（仅6个PDAC样本和2个癌旁样本），需更大规模研究验证	阐明CA19-9在胰腺导管腺癌中的产生机制及其在肿瘤微环境中的作用	胰腺导管腺癌患者组织样本（CA19-9阳性和阴性）及体外共培养细胞模型	单细胞组学	胰腺癌	单细胞RNA测序，免疫荧光，体外共培养	NA	单细胞转录组数据，免疫荧光图像	6个PDAC样本（3个CA19-9阳性，3个阴性）+2个癌旁样本+在线数据库补充样本	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
112	2025-10-06	The integrated molecular and histological analysis defines subtypes of esophageal squamous cell carcinoma 2024-10-18, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53164-x PMID:39419971	研究论文	通过整合分子和病理学分析定义食管鳞状细胞癌的亚型	首次结合基因组-转录组特征和AI辅助病理图像分析对ESCC进行综合分型，发现具有特定分子和病理特征的四种亚型	样本量相对有限（120例），仅针对中国人群	阐明食管鳞状细胞癌的分子和免疫特征，推动个性化治疗策略发展	120例中国食管鳞状细胞癌患者	数字病理学	食管癌	bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 基因组学, 转录组学, 免疫组织化学	深度学习模型	基因组数据, 转录组数据, 病理图像	120例	NA	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	NA	NA
113	2025-10-06	Dominant immune tolerance in the intestinal tract imposed by RelB-dependent migratory dendritic cells regulates protective type 2 immunity 2024-10-23, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53112-9 PMID:39443450	研究论文	本研究揭示了肠道树突状细胞中RelB表达通过调控DC-Treg细胞相互作用建立免疫耐受机制	首次发现RelB在肠道隐窝斑和孤立淋巴滤泡相关树突状细胞分化中的关键作用，并阐明其通过CCL22调控DC-Treg细胞相互作用的机制	研究主要关注肠道特定区域的树突状细胞，其他免疫细胞类型和组织部位的作用尚未完全探索	探究RelB在肠道树突状细胞介导的免疫耐受和2型免疫应答调控中的作用机制	小鼠肠道树突状细胞、调节性T细胞和Heligmosomoides polygyrus bakeri寄生虫感染模型	免疫学	寄生虫感染	单细胞RNA测序	基因敲除动物模型	基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
114	2025-10-06	Overloading And unpacKing (OAK) - droplet-based combinatorial indexing for ultra-high throughput single-cell multiomic profiling 2024-10-23, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53227-z PMID:39443484	研究论文	介绍了一种名为OAK的超高通量单细胞多组学分析方法	结合液滴微流控和组合索引技术，通过过载和拆包策略提高条形码和试剂利用率	未明确说明技术局限，但暗示现有方法存在效率问题	开发超高通量单细胞多组学分析技术	支气管上皮细胞、视网膜组织、黑色素瘤细胞	单细胞测序技术	黑色素瘤	单细胞RNA测序、单核RNA测序、染色质可及性分析	NA	单细胞多组学数据	超过40万个黑色素瘤细胞	NA	单细胞RNA-seq, 单细胞多组学	NA	液滴条形码系统结合组合索引
115	2025-10-06	IL-1β-induced epithelial cell and fibroblast transdifferentiation promotes neutrophil recruitment in chronic rhinosinusitis with nasal polyps 2024-10-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53307-0 PMID:39438439	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现IL-1β诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞转分化促进慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的中性粒细胞募集	首次鉴定出IL-1信号诱导的LY6D俱乐部细胞和IDO1成纤维细胞两个细胞亚群，并阐明它们通过释放不同趋化因子促进中性粒细胞募集的机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证需要进一步扩展	探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的细胞机制和干预策略	人类鼻黏膜组织（下鼻甲、中鼻甲和鼻息肉）和LPS诱导的小鼠CRSwNP模型	单细胞生物学	慢性鼻窦炎伴鼻息肉	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	来自CRSwNP患者的人类鼻黏膜组织	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
116	2025-10-06	Single-cell sequencing reveals immune features of treatment response to neoadjuvant immunochemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma 2024-10-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52977-0 PMID:39438438	研究论文	通过单细胞测序揭示食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫特征	首次通过单细胞RNA测序结合T细胞受体测序，系统解析了食管鳞癌新辅助免疫化疗响应者与非响应者的肿瘤微环境差异，发现CXCL13+CD8+ Tex细胞可作为治疗响应的预测标志物	样本量有限，需要更大规模的研究验证发现	探究食管鳞癌新辅助免疫化疗治疗反应的免疫学机制	接受新辅助免疫化疗的食管鳞癌患者组织样本	数字病理	食管鳞癌	单细胞RNA测序, T细胞受体测序	NA	单细胞转录组数据	食管鳞癌患者组织样本	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
117	2025-10-06	Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis 2024-10-17, Viruses DOI:10.3390/v16101623 PMID:39459954	研究论文	开发了一种用于检测、分选和单细胞RNA测序分析丙型肝炎病毒特异性T细胞的激活诱导标记检测方法	建立了不依赖MHC多聚体的高灵敏度抗原特异性T细胞检测方法，并首次应用于HCV特异性T细胞的单细胞RNA测序分析	仅在一个研究对象中进行了验证，需要更大规模的队列研究来确认方法的普适性	开发能够识别和分离HCV特异性T细胞用于单细胞转录组分析的新方法	丙型肝炎病毒特异性CD4和CD8 T细胞	免疫学	丙型肝炎	单细胞RNA测序，T细胞受体分析，流式细胞分选	NA	单细胞基因表达数据，TCR序列数据	一个研究对象（包含1023个AIM CD4 T细胞克隆型和160个AIM CD8 T细胞克隆型）	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
118	2025-10-06	Putting proteins in context 2024-Oct-16, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009 PMID:39418999	研究论文	介绍了一种名为PINNACLE的几何深度学习方法，通过整合分析蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组数据生成蛋白质的上下文表征	首次将蛋白质相互作用与多器官单细胞转录组数据结合，利用几何深度学习方法生成具有生物环境背景的蛋白质表征	NA	解决蛋白质表征缺乏生物环境背景的问题	蛋白质及其相互作用	机器学习	NA	单细胞转录组测序	几何深度学习	蛋白质相互作用数据，单细胞转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
119	2025-10-06	Mouse enteric neurons control intestinal plasmacytoid dendritic cell function via serotonin-HTR7 signaling 2024-10-25, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53545-2 PMID:39455564	研究论文	本研究揭示了小鼠肠道神经元通过血清素-HTR7信号通路调控肠道浆细胞样树突状细胞功能的新机制	首次发现肠道血清素能神经元通过HTR7信号轴调控pDC功能，并揭示肠道神经元与固有层树突状细胞之间的双向通讯新模式	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；仅针对沙门氏菌感染模型，对其他病原体的适用性未知	探究肠道血清素能神经元在免疫稳态调控中的功能	小鼠肠道血清素能神经元和浆细胞样树突状细胞	免疫学	肠道感染	单细胞RNA测序, 小鼠遗传学	NA	基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
120	2025-10-06	Single-Cell Transcriptomics Unveils Skin Cell Specific Antifungal Immune Responses and IL-1Ra- IL-1R Immune Evasion Strategies of Emerging Fungal Pathogen Candida auris 2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.22.619653 PMID:39463935	研究论文	通过单细胞转录组学揭示新兴真菌病原体耳念珠菌在皮肤感染中的免疫应答和IL-1Ra-IL-1R免疫逃逸机制	首次使用单细胞转录组学解析耳念珠菌皮肤感染的细胞特异性免疫反应，发现该真菌通过上调IL-1RN基因表达和独特细胞壁甘露聚糖外层逃逸宿主防御	研究基于小鼠模型，人类皮肤环境的差异可能影响结果适用性	阐明耳念珠菌在皮肤组织中持续定植的宿主免疫调控因素	耳念珠菌感染的小鼠皮肤组织	单细胞生物学	真菌感染	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	小鼠皮肤感染模型	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA