单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 580 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Intraocular Immune Response in Human Uveitis: Time to Look Beyond Animal Models
2024-Oct, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.04.026
PMID:38703799
|
综述 | 探讨研究人类葡萄膜炎眼内免疫反应的现有及未来方法 | 提出超越动物模型的研究策略，强调单细胞RNA测序技术在人眼内免疫细胞分析中的优势 | 当前技术成本高且操作复杂，人眼研究样本获取受限 | 比较人类与动物模型在葡萄膜炎免疫反应研究中的优劣 | 葡萄膜炎患者的眼内组织和液体样本 | 免疫学 | 葡萄膜炎 | 组织病理学分析, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 液体样本, 血液样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Recovering single-cell expression profiles from spatial transcriptomics with scResolve
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100864
PMID:39326411
|
研究论文 | 开发了一种从多细胞分辨率空间转录组数据中恢复单细胞表达谱的方法 | 能够从空间转录组多细胞测量中准确恢复单个细胞在其位置上的表达谱，这是细胞类型反卷积无法实现的 | NA | 解决空间转录组技术缺乏单细胞分辨率的问题 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 肺部疾病 | 空间转录组学 | scResolve | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
HIV persists in late coronary atheroma and is associated with increased local inflammation and disease progression
2024-Oct-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5125826/v1
PMID:39483879
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了HIV在晚期冠状动脉粥样斑块中的持续存在及其与局部炎症加剧和疾病进展的关联 | 首次在人类晚期冠状动脉粥样斑块中检测到HIV病毒拷贝，并发现其与局部炎症程度正相关 | 样本来源于遗体捐赠者，无法进行纵向追踪研究；临床队列验证仍需进一步扩大 | 探究HIV感染者动脉粥样硬化进展的免疫机制 | HIV感染者与无HIV对照组的冠状动脉和主动脉组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | DNA/RNA检测, 空间转录组学, 高分辨率质谱分析 | NA | 组织样本, 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 遗体捐赠者的冠状动脉和主动脉组织（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Sympathetic neuropeptide Y protects from obesity by sustaining thermogenic fat
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07863-6
PMID:39198648
|
研究论文 | 本研究揭示了交感神经元中神经肽Y通过维持血管周细胞增殖来保护机体免受肥胖的机制 | 首次发现交感神经元来源的NPY通过维持血管周细胞增殖来促进产热脂肪生成，与中枢NPY对体重的调节作用相反 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证 | 探究交感神经元中神经肽Y在肥胖发生中的作用机制 | 小鼠棕色和白色脂肪组织、交感神经元、血管周细胞 | 代谢研究 | 肥胖症 | 组织透明化成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08087-4
PMID:39478210
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞测序技术研究肿瘤在2D和3D空间中的进化与微环境相互作用 | 首次在多种癌症类型中定义'肿瘤微区域'和'空间亚克隆'概念，并通过3D重建揭示肿瘤空间组织结构 | 样本量相对有限，仅包含6种癌症类型的78个病例 | 探究肿瘤细胞与非癌细胞之间的空间相互作用及肿瘤进化机制 | 131个肿瘤切片来自78个病例，涵盖6种癌症类型 | 空间转录组学 | 多种癌症 | 空间转录组学, 单核RNA测序, CODEX共检测技术 | 无监督深度学习算法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质共定位数据 | 131个肿瘤切片(78个病例), 48个匹配单核RNA测序样本, 22个匹配CODEX样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | Visium空间转录组学技术 |
| 86 | 2025-10-06 |
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76722-1
PMID:39463434
|
研究论文 | 本研究探讨囊性纤维化相关糖尿病中胰岛GLP-1受体表达降低及细胞特异性转录程序紊乱的机制 | 首次结合空间转录组学和免疫组化揭示CFRD中GLP-1信号通路异常及胰岛细胞特异性基因表达失调 | 样本量有限，未涉及GLP-1R表达降低的具体分子机制 | 探究囊性纤维化相关糖尿病的胰腺病理机制 | 人类胰腺组织（CFRD患者与非CF/非糖尿病对照组） | 空间转录组学 | 囊性纤维化相关糖尿病 | 免疫组织化学，空间转录组学，基因集富集分析 | NA | 组织图像，基因表达数据 | 人类胰腺组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2024-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52990-3
PMID:39379371
|
研究论文 | 通过单细胞多组学测序技术分析Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症患者的组织特异性免疫反应 | 首次对SJS/TEN患者进行单细胞转录组、表面蛋白质组和T细胞受体测序的综合分析，识别出组织特异性细胞亚群和致病机制 | 样本量相对较小（15例患者），为罕见疾病研究 | 阐明SJS/TEN疾病的细胞免疫发病机制 | 15名SJS/TEN患者的未受累皮肤、受累皮肤和水疱液 | 单细胞多组学 | Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 15例患者，共109,888个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals vascularization-associated cell subpopulations in dental pulp: PDGFRβ+ DPSCs with activated PI3K/AKT pathway
2024-10-09, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae051
PMID:39167061
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出牙髓中与血管化相关的PDGFRβ+ DPSCs细胞亚群，并揭示其通过PI3K/AKT通路发挥促血管生成功能 | 首次在牙髓发育过程中鉴定出具有显著促血管生成能力的PDGFRβ+ DPSCs新亚群，并阐明其通过PDGFR/PI3K/AKT信号通路发挥作用 | NA | 解决牙髓再生治疗中的挑战，特别是针对不同年龄和条件供体来源的干细胞移植问题 | 牙髓干细胞(DPSCs)、人脐静脉内皮细胞(HUVEC)、基因编辑小鼠模型 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学、假时序分析、转录组测序、基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2024-09-25 |
Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics
2024-10, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907
PMID:39206540
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
The generation of stable microvessels in ischemia is mediated by endothelial cell derived TRAIL
2024-10-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8760
PMID:39365855
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞来源的TRAIL在介导缺血条件下稳定微血管生成中的关键作用 | 首次发现内皮细胞来源的TRAIL在促进新生血管形成和血管稳定中的新功能，并证明TRAIL-R2激动剂在治疗缺血中的潜力 | 研究主要基于动物模型和体外实验，临床转化仍需进一步验证 | 探究TRAIL在缺血条件下介导新生血管形成和血管稳定的分子机制 | 内皮细胞、周细胞、小鼠模型、患者动脉样本 | 血管生物学 | 外周动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colon epithelial cells using i ColonEpithelium metabolic reconstruction
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619644
PMID:39484551
|
研究论文 | 本研究构建了首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，用于探索炎症性肠病相关的代谢变化 | 开发了首个人类结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型，包含独特的转运反应区室用于模拟与肠道微生物组的代谢相互作用 | 模型基于稳态假设，可能无法完全反映体内动态代谢过程 | 解析人类结肠上皮细胞的代谢活动，识别炎症性肠病相关的代谢特征 | 人类结肠上皮细胞 | 代谢组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，基因组尺度代谢模型 | 基因组尺度代谢模型 | 基因表达数据 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者样本及健康对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
The G4 resolvase Dhx36 modulates cardiomyocyte differentiation and ventricular conduction system development
2024-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52809-1
PMID:39366945
|
研究论文 | 本研究揭示了Dhx36解旋酶通过调控启动子G-四链体结构在心肌细胞分化和心室传导系统发育中的关键作用 | 首次发现Dhx36通过解析启动子G-四链体结构调控关键心脏基因网络，影响心室传导系统发育和心肌细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Dhx36在心脏传导系统发育和心肌细胞分化中的分子机制 | 胚胎期和新生期小鼠心脏组织 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
In vivo CRISPRi screen identified lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.16.618774
PMID:39464078
|
研究论文 | 通过CRISPRi筛选和单细胞测序分析鉴定出调控皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长的关键lncRNA组合 | 首次通过整合单细胞测序分析和体内外CRISPRi筛选系统鉴定lncRNA在cSCC中的功能，发现LINC00704和LINC01116等新型调控因子 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，需要在更多临床样本中验证 | 探索长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的作用机制 | 人类正常和cSCC皮肤组织、角质形成细胞亚群、cSCC癌细胞系 | 功能基因组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序、CRISPR干扰筛选、假性批量分析、异种移植模型 | CRISPRi、xenograft | 单细胞测序数据、功能验证数据 | 正常和cSCC人类皮肤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Polybacterial Intracellular Macromolecules Shape Single-Cell Epikine Profiles in Upper Airway Mucosa
2024-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617279
PMID:39416216
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了上呼吸道黏膜上皮细胞中多菌种胞内大分子(PIMs)的存在及其对细胞因子表达和药物反应的影响 | 首次在单细胞水平发现多菌种胞内大分子(PIMs)持续存在于黏膜上皮细胞中，并线性驱动效应细胞因子表达 | 研究主要关注口腔黏膜，结果在其他黏膜部位的普适性需要进一步验证 | 探究宿主-微生物相互作用在黏膜上皮细胞类型中的机制 | 人类口腔黏膜上皮细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 人类口腔黏膜单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
|
研究论文 | 本研究通过构建结核分枝杆菌单克隆抗体库并筛选具有限制细菌能力的抗体，揭示了抗体Fab和Fc区域在结核病免疫防御中的协同作用机制 | 首次系统性地通过Fc区域交换技术优化保护性抗体，并利用单细胞转录组学揭示了抗体介导的结核分枝杆菌限制依赖于中性粒细胞的早期激活 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；抗体作用机制仍需进一步深入探索 | 探究抗体介导的结核分枝杆菌限制机制 | 结核分枝杆菌单克隆抗体及其Fc变异体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学，Fc区域交换技术，单克隆抗体筛选 | NA | 转录组数据，免疫学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
The frequency of CD38+ alveolar macrophages correlates with early control of M. tuberculosis in the murine lung
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52846-w
PMID:39358361
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CD38+肺泡巨噬细胞在控制结核分枝杆菌感染中的关键作用 | 首次发现CD38+肺泡巨噬细胞亚群在结核感染控制中的动态作用及其表观遗传预激活特征 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究肺泡巨噬细胞亚群在结核病控制中的作用机制 | 小鼠肺泡巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Concerted transcriptional regulation of the morphogenesis of hypothalamic neurons by ONECUT3
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52762-z
PMID:39366958
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子ONECUT3通过调控NAV2基因影响下丘脑神经元极化和形态发生的分子机制 | 首次发现ONECUT3在脊椎动物下丘脑神经元分化中的作用，并证明其通过NAV2调控神经元形态发生的保守机制 | 研究主要聚焦于特定神经元亚型，机制在其他神经元类型中的普适性需要进一步验证 | 探究ONECUT3转录因子在下丘脑神经元形态发生中的调控作用 | 脊椎动物下丘脑神经元、C. elegans神经系统 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 功能获得实验, siRNA敲低, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠, C. elegans模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
The lncRNA SNHG26 drives the inflammatory-to-proliferative state transition of keratinocyte progenitor cells during wound healing
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52783-8
PMID:39366968
|
研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA SNHG26在皮肤伤口愈合过程中驱动角质形成细胞前体细胞从炎症状态向增殖状态转变的关键作用 | 首次发现SNHG26通过调控转录因子ILF2的基因组定位，促进角质形成细胞前体细胞的炎症-增殖状态转换 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类临床验证方面仍需进一步研究 | 探索皮肤伤口愈合过程中炎症相向增殖相转变的分子机制 | 角质形成细胞前体细胞 | 分子生物学 | 皮肤创伤 | 单细胞转录组分析、功能获得和功能缺失实验 | NA | 转录组数据 | Snhg26缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Trophoblast Side-Population Markers are Dysregulated in Preeclampsia and Fetal Growth Restriction
2024-10, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10764-w
PMID:39028417
|
研究论文 | 本研究表征了人类胎盘中滋养细胞侧群标志物在先兆子痫和胎儿生长受限中的表达特征 | 首次在胎盘功能不全疾病中系统表征了8个滋养细胞侧群标志物的表达模式及其在滋养细胞分化过程中的动态变化 | 样本量相对有限，部分标志物在体外分化模型中表达水平较低或无法检测 | 探讨滋养细胞侧群标志物在胎盘功能不全疾病中的表达异常及其病理意义 | 人类胎盘组织、滋养细胞干细胞分化模型 | 发育生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组测序、免疫组织化学、实时荧光定量PCR | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 胎盘组织切片n=3，体外分化实验n=5，临床胎盘样本n=126（先兆子痫78例，FGR 30例，对照组18例） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Suppression of GATA3 promotes epithelial-mesenchymal transition and simultaneous cellular senescence in human extravillous trophoblasts
2024-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119768
PMID:38838858
|
研究论文 | 本研究探讨转录因子GATA3在早期妊娠胎盘绒毛外滋养细胞分化成熟过程中的调控机制及其与妊娠疾病的关系 | 首次揭示GATA3在调控上皮-间质转化和细胞衰老中的双重作用，并发现复发性流产患者中GATA3定位异常 | 研究主要基于细胞系模型，需要更多原代细胞和体内实验验证 | 阐明GATA3在绒毛外滋养细胞分化成熟过程中的调控机制 | 人类绒毛外滋养细胞、JEG3和HTR8/SVneo细胞系、胎盘类器官模型 | 单细胞生物学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种细胞模型和胎盘组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |