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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Constructing a disulfidptosis-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01968-z
PMID:38760515
|
研究论文 | 基于单细胞测序和加权共表达网络分析构建肝细胞癌的二硫下垂症相关预后特征 | 首次将新发现的二硫下垂症细胞死亡机制与肝细胞癌预后模型相结合,通过单细胞和批量多组学数据分析构建预后特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索二硫下垂症相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征 | 肝细胞癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 加权共表达网络分析, 多组学测序 | COX回归, Lasso回归, 诺莫图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和GSE14520数据集中的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Loss of AR-regulated AFF3 contributes to prostate cancer progression and reduces ferroptosis sensitivity by downregulating ACSL4 based on single-cell sequencing analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01941-w
PMID:38478171
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研究论文 | 通过单细胞测序分析发现AR调控的AFF3基因在去势抵抗性前列腺癌中下调,并通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性 | 首次揭示AFF3在前列腺癌中的抑癌作用及其通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性的新机制 | 研究主要基于细胞系实验,需要进一步在动物模型和临床样本中验证 | 探索去势抵抗性前列腺癌耐药机制及新的治疗靶点 | 前列腺癌细胞系及单细胞测序数据 | 单细胞测序分析 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, GSVA, GSEA | NA | 单细胞测序数据, 批量细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Metabolic Heterogeneity and Potential Immunotherapeutic Responses Revealed by Single-Cell Transcriptomics of Breast Cancer
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01952-7
PMID:38578322
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示乳腺癌代谢异质性及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在单细胞水平系统揭示乳腺癌代谢异质性特征及其与化疗耐药性的关联 | 样本量较小(14例患者),需更大规模研究验证 | 解析乳腺癌单细胞转录组异质性及其临床意义 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 14例乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF/ACKR3 receptor-ligand interaction between neutrophils and nucleus pulposus cells in intervertebral disc degeneration
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.011
PMID:38823438
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞与髓核细胞通过MIF/ACKR3受体-配体相互作用促进椎间盘退变的机制 | 首次在椎间盘退变中发现表达MIF的ECMO中性粒细胞亚群及其通过MIF/ACKR3轴与效应NPCs的相互作用机制 | 样本量相对有限(5个对照和9个退变样本),需进一步验证临床治疗潜力 | 解析椎间盘退变微环境中中性粒细胞的异质性和功能 | 椎间盘组织和其中的中性粒细胞与髓核细胞 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 71520个单细胞,来自5个对照和9个退变椎间盘样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Potential applications of dual haptoglobin expression in the reclassification and treatment of hepatocellular carcinoma
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.008
PMID:38815898
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示HP基因在肝细胞癌恶性细胞亚群中的关键作用及其通过C3/C3AR1轴促进Th1型免疫应答的机制 | 首次发现HP基因在HCC恶性细胞中的双重表达模式,并建立基于HP和C3表达的Th1反应重分类基因集及四种新辅助治疗预测模型 | 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步实验验证HP基因的具体作用机制 | 探索HP基因在肝细胞癌重新分类和治疗中的潜在应用价值 | 肝细胞癌恶性细胞亚群和T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 基因表达分析模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Hsp90aa1/JUN/Ccl2 regulatory axis mediates migration and differentiation of NSPCs, promoting the onset and progression of early post-ischemic stroke epilepsy
2024-10-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106635
PMID:39128813
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和生物信息学分析揭示了Hsp90aa1/JUN/Ccl2调控轴在神经干/祖细胞迁移和分化中的作用,及其对缺血性卒中后早期癫痫发生发展的影响 | 首次发现Hsp90aa1/JUN/Ccl2调控轴在调节神经干/祖细胞迁移和分化中的关键作用,并阐明其在缺血性卒中后早期癫痫发病机制中的功能 | NA | 探究缺血性卒中后早期癫痫的发病机制,特别是神经干/祖细胞在疾病过程中的调控机制 | 神经干/祖细胞(NSPCs) | 生物信息学 | 缺血性卒中后癫痫 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析,体外实验,体内实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Microglia regulate GABAergic neurogenesis in prenatal human brain through IGF1
2024-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.19.619180
PMID:39464051
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞通过分泌IGF1调控人类胚胎期大脑中GABA能神经元的生成 | 首次发现小胶质细胞通过IGF1信号通路调控人类胚胎期GABA能神经前体细胞的持续增殖 | 研究主要基于体外类器官模型,需进一步验证在体情况 | 探索人类大脑中GABA能神经元扩展发育的机制 | 人类胚胎期大脑内侧神经节隆起(hMGE)的GABA能神经元前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序, 生物信息学分析, 组织学分析 | 神经免疫hMGE类器官模型 | 单细胞RNA测序数据, 组织学图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal individual and synergistic effects of Trisomy 21 and GATA1s on hematopoiesis
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595827
PMID:38826323
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析21三体综合征和GATA1s对造血过程的个体和协同效应 | 首次使用同源人类诱导多能干细胞模型分离21三体综合征和GATA1s的个体发育影响 | 研究基于体外干细胞模型,可能无法完全反映体内造血微环境 | 解析21三体综合征和GATA1s对造血过程的独立和协同作用机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的造血祖细胞 | 单细胞生物学 | 唐氏综合征相关血液疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 同源人类诱导多能干细胞系(差异仅在于21号染色体和GATA1状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
A versatile tissue-rolling technique for spatial-omics analyses of the entire murine gastrointestinal tract
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01001-2
PMID:38906985
|
研究论文 | 开发一种组织卷曲技术用于小鼠整个胃肠道的空间组学分析 | 提出简单易行的组织包埋技术,可在单张玻片上分析从口腔到直肠的完整胃肠道 | 需要具备小鼠手术技能和标准组织学方法的研究人员操作 | 开发最大化组织分析面积的空间组学技术 | 小鼠胃肠道组织 | 空间组学 | NA | 组织染色、免疫组织化学、原位杂交、多重抗体染色、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组学 |
| 90 | 2025-10-06 |
High-throughput single-cell transcriptomics of bacteria using combinatorial barcoding
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01007-w
PMID:38886529
|
研究论文 | 开发了一种名为microSPLiT的高通量细菌单细胞转录组测序方法 | 通过四轮组合条形码标记,无需专用设备即可在单次实验中分析数十万革兰氏阴性和阳性细菌的转录状态 | 需要基础分子生物学技术经验、细菌样本处理能力和DNA文库制备知识;数据分析需要计算资源、Unix命令行熟悉度及Python或R基础 | 开发适用于细菌的高通量单细胞转录组测序技术 | 革兰氏阴性和阳性细菌 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序,组合条形码标记 | NA | 转录组数据 | 单次实验最多100万个细菌细胞和96个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | microSPLiT | 微生物分裂池连接转录组学技术,采用96孔板进行四轮组合条形码标记 |
| 91 | 2025-10-06 |
All-optical voltage imaging-guided postsynaptic single-cell transcriptome profiling with Voltage-Seq
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01005-y
PMID:38834919
|
研究论文 | 开发了一种结合全光学电压成像和单细胞转录组测序的新方法Voltage-Seq,用于靶向特定突触后反应类型的神经元分析 | 首次将基因编码电压指示器Voltron与单细胞RNA测序结合,实现基于特定突触后反应类型的神经元靶向采集和转录组分析 | 需要6周完成工作流程,包括4-5周的病毒传感器表达时间,且需要操作者具备微操作技能和分子生物学、生物信息学经验 | 开发高通量方法研究突触后神经元的连接特性和转录组特征 | 小鼠急性脑切片中的突触后神经元 | 神经科学 | NA | 全光学电压成像,单细胞RNA测序 | 分类器 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
ProBac-seq, a bacterial single-cell RNA sequencing methodology using droplet microfluidics and large oligonucleotide probe sets
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01002-1
PMID:38769144
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研究论文 | 介绍ProBac-seq细菌单细胞RNA测序方法,利用液滴微流控和大规模寡核苷酸探针组解决细菌单细胞转录组分析的技术难题 | 开发了专门针对细菌的mRNA特异性探针方法,克服了细菌mRNA缺乏polyA尾、转录本不稳定和细胞形态不兼容等传统单细胞RNA测序技术的关键限制 | 协议完成时间较长(约7天),且需要针对不同生物体设计特异性探针组 | 建立适用于细菌的单细胞RNA测序方法 | 细菌细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序、液滴微流控、原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 数千个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴微流控的单细胞封装技术 |
| 93 | 2025-10-06 |
Single-Cell Antigen Receptor Sequencing in Pigs with Influenza
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.13.617920
PMID:39464079
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研究论文 | 本研究开发了适用于猪的单细胞抗原受体测序方法,用于分析流感感染后猪肺部的T细胞和B细胞受体谱系 | 首次在猪中实现了单细胞RNA测序与配对的T细胞受体α/β链和B细胞受体重链/轻链的联合分析 | 研究样本数量有限,且仅针对流感病毒感染模型 | 研究自然杀伤T细胞是否改变肺部T细胞和B细胞受体谱系选择 | 猪肺部T细胞和B细胞 | 单细胞测序 | 流感 | 单细胞RNA测序,VDJ测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,抗原受体序列数据 | 冷冻保存的猪肺细胞,流式分选的T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,VDJ测序 | 10x Chromium | 10x Genomics VDJ测序方案 |
| 94 | 2025-10-06 |
Integrated immuno-transcriptomic analysis of ovarian cancer identifies a four-chemokine-dominated subtype with antitumor immune-active phenotype and favorable prognosis
2024-Oct, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02803-7
PMID:39095528
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研究论文 | 通过整合免疫转录组分析识别卵巢癌中由四种趋化因子主导的免疫活性亚型 | 首次在卵巢癌中发现由CXCL9、CXCL10、CXCL11和CXCL13四种趋化因子主导的免疫活性亚型,并揭示其与良好预后的关联 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证;样本来源多样可能存在批次效应 | 探索卵巢癌中Th-1免疫反应与临床预后的关系,识别免疫活性亚型 | 卵巢癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 免疫特征分类模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据,病理图像数据 | 2850个卵巢癌样本(来自19个数据集),39个单细胞测序样本,39个免疫组化验证样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析,免疫组织化学 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Characteristics of blood-brain barrier heterogeneity between brain regions revealed by profiling vascular and perivascular cells
2024-Oct, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01743-y
PMID:39210068
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示不同脑区血脑屏障异质性的分子特征 | 首次系统比较具有天然渗漏血管的脑区与正常脑区的血脑屏障分子差异,发现内皮细胞与周细胞相互作用的区域特异性 | 研究仅针对小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究不同脑区血脑屏障功能异质性的形成机制 | 小鼠正中隆起和大脑皮层区域的血管内皮细胞和周细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 电子显微镜, 组织透明化技术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 显微图像 | 小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 通过整合分析批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型并开发了CDR评分系统 | 首次探索膀胱癌中细胞分化相关基因的分子亚型及其预后意义,开发了基于9个基因的CDR评分系统 | 研究基于GEO数据库,样本来源有限,需要进一步临床验证 | 探索膀胱癌中细胞分化相关基因的分子亚型及其临床预后意义 | 膀胱癌患者样本数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, Lasso回归, Cox回归 | NA | 基因表达数据 | 两个GEO单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Glutaminase inhibition in combination with azacytidine in myelodysplastic syndromes: a phase 1b/2 clinical trial and correlative analyses
2024-Oct, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00811-3
PMID:39300320
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临床研究论文 | 评估telaglenastat(CB-839)联合阿扎胞苷在晚期骨髓增生异常综合征患者中的安全性和疗效 | 首次将选择性谷氨酰胺酶抑制剂与去甲基化药物联合应用于MDS治疗,并通过单细胞RNA测序验证疗效机制 | 单臂开放标签研究设计,样本量有限(共30名参与者) | 开发骨髓增生异常综合征的代谢和表观遗传联合治疗方法 | 晚期骨髓增生异常综合征患者 | 临床医学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 30名参与者(6名剂量递增研究,24名剂量扩展研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Mechanism exploration and model construction for small cell transformation in EGFR-mutant lung adenocarcinomas
2024-10-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01981-3
PMID:39353908
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研究论文 | 探索EGFR突变肺腺癌小细胞转化的分子机制并构建预测模型 | 首次系统比较转化前后肿瘤的转录组特征,发现表观遗传改变驱动转化过程,并构建了高准确度的4标志物预测模型 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 阐明EGFR突变肺腺癌小细胞转化的分子机制并开发预测方法 | 肺腺癌患者样本(包括未转化、转化前和转化后)以及原发性小细胞肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析,多重免疫荧光 | 预测模型 | 转录组数据,免疫组织化学数据 | 训练队列和测试队列(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Interaction between CCL19+ Inflammatory Keratinocytes and CCR7+ Dendritic Cells and B Cells in Pemphigus
2024-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.03.016
PMID:38537931
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-09-07 |
Bridging gaps: a neural network approach for cross-species scRNA-seq analysis in COVID-19
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105324
PMID:39236555
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |