单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 617 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-02-02 |
Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells
2024-10, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904
PMID:39117004
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综述 | 本文综述了单细胞测序在揭示胸腺上皮细胞分类中的最新见解，包括正常和肿瘤胸腺中的细胞类型 | 利用单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞的更复杂分类，特别是在正常和肿瘤胸腺中的细胞类型 | NA | 探讨单细胞测序在胸腺上皮细胞分类中的应用 | 胸腺上皮细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 62 | 2025-02-01 |
Spatial resolution of the head and neck cancer tumor microenvironment to identify tumor and stromal features associated with therapy response
2024-10, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12811
PMID:39048134
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学技术，解析头颈癌肿瘤微环境中的特征，以识别与治疗反应相关的肿瘤和基质特征 | 首次结合NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler和Akoya PhenoCycler-Fusion技术，对头颈癌肿瘤微环境进行高精度空间转录组和蛋白质组分析，揭示了与免疫治疗反应相关的生物标志物 | 样本量较小，仅包含12名患者的25个肿瘤核心，可能限制结果的普适性 | 识别头颈癌肿瘤微环境中与免疫治疗反应相关的生物标志物 | 头颈癌患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 头颈癌 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler, Akoya PhenoCycler-Fusion | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 12名患者的25个肿瘤核心 |
| 63 | 2025-01-30 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子卵巢在进化过程中的保守性和差异性 | 首次通过单细胞转录组和染色质可及性联合分析，揭示了卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化，并发现了跨物种的共同调控架构 | 研究主要依赖于非人类模型生物，可能无法完全反映人类卵巢的复杂性 | 研究卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化，以理解人类卵巢生理和疾病 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞样本 |
| 64 | 2024-10-28 |
Metabolic Reprogramming Induced by Aging Modifies the Tumor Microenvironment
2024-10-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201721
PMID:39451239
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研究论文 | 研究了衰老引起的代谢重编程如何影响肿瘤微环境（TME）以促进肿瘤发生 | 利用MMPC方法分析了衰老相关癌症类型的代谢可塑性事件，揭示了衰老相关代谢重编程对肿瘤微环境的影响 | NA | 探讨衰老与代谢重编程之间的相互作用如何影响肿瘤微环境 | 衰老相关癌症类型的代谢可塑性事件 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | MMPC（Modeling Metabolic Plasticity by Pathway Pairwise Comparison） | RNA-seq数据 | 17种衰老相关癌症类型的批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 |
| 65 | 2024-10-28 |
Podoplanin Expression in Early-Stage Colorectal Cancer-Associated Fibroblasts and Its Utility as a Diagnostic Marker for Colorectal Lesions
2024-10-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201682
PMID:39451200
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研究论文 | 研究了早期结直肠癌相关成纤维细胞中Podoplanin的表达及其作为诊断标志物的潜力 | 首次详细研究了早期结直肠癌中Podoplanin阳性成纤维细胞的来源和功能 | 研究仅限于免疫组化和单细胞RNA测序，未涉及临床验证 | 探讨Podoplanin在早期结直肠癌相关成纤维细胞中的表达及其作为诊断标志物的潜力 | 早期结直肠癌、腺瘤、神经内分泌肿瘤及其正常邻近组织和非肿瘤性结直肠病变 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 涉及多种类型的结直肠病变样本 |
| 66 | 2025-01-25 |
NBAtlas: A harmonized single-cell transcriptomic reference atlas of human neuroblastoma tumors
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114804
PMID:39368085
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NBAtlas的协调单细胞转录组参考图谱，该图谱整合了七个单细胞或单核数据集，涵盖了61名患者的362,991个细胞，用于解析神经母细胞瘤的转录景观 | 通过整合多个单细胞转录组数据集，创建了一个覆盖广泛样本的协调细胞图谱，揭示了神经母细胞瘤的转录组特征与临床结果之间的关联，并展示了其在数据驱动细胞类型注释中的实用性 | 尽管整合了多个数据集，但样本量仍然相对较小，可能限制了某些结论的普适性 | 解析神经母细胞瘤的转录景观，揭示其与临床结果的关联，并展示该图谱在细胞类型注释中的应用 | 神经母细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61名患者的362,991个细胞 |
| 67 | 2025-01-25 |
PD-L1 restrains PD-1+Nrp1lo Treg cells to suppress inflammation-driven colorectal tumorigenesis
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114819
PMID:39368087
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研究论文 | 本文研究了PD-L1在调节T细胞功能中的作用，特别是在结直肠癌的炎症驱动肿瘤发生中的作用 | 揭示了PD-L1通过抑制PD-1+Nrp1lo Treg细胞和IL-6中性粒细胞来维持CTL激活，从而控制炎症驱动的结直肠肿瘤发生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨PD-L1在结直肠癌炎症驱动肿瘤发生中的调节作用 | 小鼠模型中的T细胞、PD-1+Nrp1lo Treg细胞和IL-6中性粒细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 68 | 2025-01-25 |
Persistent bone marrow hemozoin accumulation confers a survival advantage against bacterial infection via cell-intrinsic Myd88 signaling
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114850
PMID:39392758
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研究论文 | 本文探讨了疟疾中血色素（Hz）在骨髓中的持续沉积如何通过细胞内在的MyD88信号通路增强对细菌感染的生存优势 | 揭示了血色素通过细胞内在的MyD88依赖途径，增加粒细胞-巨噬细胞祖细胞中转录因子的染色质可及性，从而增强单核细胞的杀菌能力 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 研究疟疾中血色素沉积对免疫反应和细菌感染抵抗力的影响 | 小鼠骨髓中的血色素沉积及其对免疫细胞的影响 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 疟疾恢复后的小鼠单核细胞 |
| 69 | 2025-01-25 |
Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.016
PMID:39317200
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研究论文 | 本文探讨了Notch信号在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD/MASH）中调控巨噬细胞介导的炎症的作用 | 揭示了Notch-RBPJ信号通路在单核细胞向巨噬细胞转变中的关键作用，并发现Rbpj缺陷可抑制炎症性巨噬细胞和单核细胞衍生的Kupffer细胞分化，同时促进保护性Ly6C单核细胞的出现 | MASLD/MASH中巨噬细胞分化和功能的机制仍大多未知 | 研究Notch信号在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中调控巨噬细胞介导炎症的机制 | 肝脏巨噬细胞群体，包括常驻Kupffer细胞（KCs）和单核细胞衍生的巨噬细胞 | 生物医学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和命运映射 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 70 | 2025-01-25 |
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024
PMID:39214091
|
研究论文 | 本文研究了在非肥胖糖尿病（NOD）小鼠中，CD4+ T细胞对胰岛素衍生表位的反应动态和致病性，揭示了胰岛抗原特异性T细胞的多样性和XCR1树突状细胞在其激活中的作用 | 首次揭示了InsC-ChgA特异性CD4 T细胞在糖尿病中的独特致病性，并展示了抗InsC-ChgA:IAg7抗体预防自发性糖尿病的潜力 | 研究仅限于NOD小鼠模型，未在人类中进行验证 | 探讨CD4+ T细胞对胰岛素衍生表位的反应在自身免疫性糖尿病中的作用 | 非肥胖糖尿病（NOD）小鼠的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NOD小鼠的胰腺CD4+ T细胞 |
| 71 | 2025-01-24 |
Comparative analysis of rhesus macaque and human placental organoids highlights evolutionary differences in placentation
2024-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.11.617873
PMID:39416122
|
研究论文 | 本研究通过比较恒河猴和人类胎盘类器官，揭示了胎盘在进化过程中的差异 | 开发了恒河猴胎盘类器官模型，并首次进行了恒河猴与人类胎盘类器官的单细胞RNA测序比较分析 | 研究主要关注恒河猴和人类，未涉及其他灵长类动物，可能限制了进化差异的全面理解 | 探索恒河猴与人类胎盘在基因表达和细胞分化轨迹上的异同 | 恒河猴和人类的胎盘类器官 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据 | 恒河猴和人类胎盘类器官样本 |
| 72 | 2025-01-24 |
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-Oct, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.05.010
PMID:38906738
|
综述 | 本文探讨了细胞间相互作用在复杂生物功能中的作用及其在疾病状态中的影响，并介绍了单细胞测序、空间转录组学等新技术在理解细胞间通讯中的应用 | 结合单细胞测序、空间转录组学和生物工程技术，提供了对细胞间通讯影响的深入理解，并开发了计算方法来解析细胞接触如何调控细胞反应 | NA | 探索细胞间相互作用在生物过程中的调控机制及其在疾病中的作用 | 细胞间相互作用及其对基因表达和细胞反应的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 73 | 2025-01-22 |
An Integrative Approach to Precision Pre-implantation Genetic Diagnosis by Investigating Single-cell Sequencing, Polygenic Risk Assessment, Artificial Intelligence-guided Embryo Selection and Genome Editing in Embryos with COL4A1 c.1537G>A Mutation
2024 Oct-Dec, Journal of human reproductive sciences
DOI:10.4103/jhrs.jhrs_145_24
PMID:39831092
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2025-01-22 |
Association between premature vascular smooth muscle cells senescence and vascular inflammation in Takayasu's arteritis
2024-Oct-21, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225630
PMID:38816066
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研究论文 | 本研究探讨了Takayasu动脉炎（TAK）中血管平滑肌细胞（VSMCs）早衰与血管炎症之间的关联 | 首次揭示了IL-6通过非经典线粒体定位的磷酸化STAT3（Tyr705）防止MFN2蛋白降解，从而促进VSMCs早衰的机制 | 研究主要基于体外和离体实验，需要进一步在体内模型中验证 | 研究TAK中VSMCs早衰是否参与血管炎症及其机制 | Takayasu动脉炎患者的血管手术样本 | NA | 心血管疾病 | 组织学检查、bulk RNA-Seq、单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | TAK患者的血管手术样本 |
| 75 | 2025-01-22 |
Single-cell transcriptomics reveal potent extrafollicular B cell response linked with granzyme K+ CD8 T cell activation in lupus kidney
2024-Oct-17, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225876
PMID:39419536
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了狼疮性肾炎患者肾脏中B细胞和T细胞的适应性免疫景观，特别是与GZMK+ CD8 T细胞激活相关的B细胞反应 | 首次在单细胞水平上揭示了狼疮性肾炎患者肾脏中B细胞和T细胞的适应性免疫景观，特别是发现了与GZMK+ CD8 T细胞激活相关的B细胞反应 | 研究样本量有限，且仅针对活动性狼疮性肾炎患者，未涉及其他类型的肾炎或疾病阶段 | 探索活动性狼疮性肾炎患者肾脏中B细胞和T细胞的适应性免疫景观 | 活动性狼疮性肾炎患者的肾脏和配对的外周血样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、B细胞受体（BCR）测序、T细胞受体（TCR）测序、流式细胞术、转座酶可及性测序、多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、BCR/TCR序列数据 | 活动性狼疮性肾炎患者的肾脏和配对的外周血样本，以及匹配的对照组的外周血样本 |
| 76 | 2025-01-22 |
Continuous cell type diversification throughout the embryonic and postnatal mouse visual cortex development
2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616246
PMID:39829740
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和表观基因组学技术，构建了小鼠视觉皮层发育过程中的细胞类型图谱，揭示了细胞类型在不同发育阶段的连续多样化过程 | 提供了迄今为止最详细的动态分子图谱，直接关联到个体细胞类型和特定发育事件，揭示了视觉皮层发育过程中细胞类型身份连续精细化的分子逻辑 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全适用于人类或其他物种 | 研究小鼠视觉皮层发育过程中细胞类型的多样化和分子机制 | 小鼠视觉皮层的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核多组学（Multiome） | NA | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据 | 568,674个高质量单细胞转录组和194,545个高质量单核多组学数据 |
| 77 | 2025-01-20 |
Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice
2024-Oct, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006
PMID:39153545
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人巨细胞病毒（HCMV）感染的人源化小鼠中免疫细胞的深刻反应 | 利用单细胞RNA测序技术，首次在单细胞水平上研究了HCMV感染的人源化小鼠中PBMCs的基因表达变化 | 研究依赖于人源化小鼠模型，可能无法完全模拟人类体内的复杂环境 | 研究HCMV感染与宿主免疫反应之间的相互作用 | 人源化小鼠中的PBMCs | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 78 | 2025-01-19 |
Over Activation of IL-6/STAT3 Signaling Pathway in Juvenile Dermatomyositis
2024-Oct, Rheumatology and therapy
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s40744-024-00699-6
PMID:39073510
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研究论文 | 本研究探讨了IL-6/JAK/STAT3信号通路在青少年皮肌炎（JDM）中的异常激活及其在肌肉损伤中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组化技术揭示了JDM患者中IL-6/JAK/STAT3信号通路的异常激活，并发现IL-6通过触发钙超载和活性氧（ROS）产生参与肌肉损伤的发病机制 | 样本量较小，仅包括72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本 | 阐明IL-6激活JAK/STAT3信号通路的机制及其在JDM发病中的作用 | 青少年皮肌炎（JDM）患者 | 生物医学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR） | NA | 血清样本、肌肉活检样本 | 72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本 |
| 79 | 2025-01-19 |
Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.09.003
PMID:39306240
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估了干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响，特别关注单核吞噬细胞 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析干眼症对结膜免疫细胞的影响，并揭示了单核吞噬细胞在干眼症中的基因表达变化 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本，可能限制了结果的普适性 | 评估干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响 | C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞 | 免疫学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据，单细胞ATAC测序数据 | C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞 |
| 80 | 2025-01-18 |
Tumor editing suppresses innate and adaptive antitumor immunity and is reversed by inhibiting DNA methylation
2024-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01932-8
PMID:39169233
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了乳腺癌基因工程小鼠模型中的基因编辑现象，揭示了肿瘤如何通过编辑基因表达来逃避免疫监视，并探讨了抑制DNA甲基化如何逆转这一过程 | 首次在全基因组范围内研究了早期肿瘤发生过程中的基因编辑现象，并发现抑制DNA甲基化可以逆转肿瘤对免疫基因的抑制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类肿瘤中进行验证 | 探讨肿瘤如何通过基因编辑逃避免疫监视，并寻找逆转这一过程的方法 | 乳腺癌基因工程小鼠模型中的肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型（GEMM） | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及乳腺癌和黑色素瘤的植入肿瘤 |