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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.09.003
PMID:39306240
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序评估干眼症对结膜免疫细胞特别是单核吞噬细胞的影响 | 首次在干燥应激诱导的干眼模型中系统分析结膜单核吞噬细胞的转录谱和调控机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 研究干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响 | C57BL/6小鼠结膜免疫细胞 | 单细胞组学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序, scATAC-seq, Monocle 3轨迹分析, IPA通路分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量的小鼠结膜免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-05 |
No Evidence for Persistent Enteroviral B Infection of Pancreatic Islets in Patients With Type 1 Diabetes and Prediabetes From RNA Sequencing Data
2024-Oct-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0076
PMID:39083653
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研究论文 | 通过分析RNA测序数据评估1型糖尿病和糖尿病前期患者胰腺中是否存在持续性肠道病毒B感染 | 首次利用大规模bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统评估肠道病毒B在1型糖尿病胰腺中的存在情况 | 无法排除极低水平持续性肠道病毒B感染的可能性 | 验证持续性肠道病毒B感染是否与1型糖尿病病因相关 | 1型糖尿病和糖尿病前期患者的胰腺细胞 | 生物信息学 | 糖尿病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | Kraken2, STAR aligner | RNA测序数据 | 243个bulk RNA文库和79个单细胞RNA文库 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-05 |
Laminin Beta 2 Is Localized at the Sites of Blood-Brain Barrier and Its Disruption Is Associated With Increased Vascular Permeability, Histochemical, and Transcriptomic Study
2024-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554241281896
PMID:39340425
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研究论文 | 本研究定位层粘连蛋白β2在血脑屏障的位置,并探讨其破坏与血管通透性增加的关系 | 首次明确层粘连蛋白β2在血脑屏障微血管的定位,并发现其在病理条件下的表达变化规律 | 研究主要基于组织化学和转录组分析,缺乏功能性验证实验 | 探究层粘连蛋白β2在血脑屏障中的作用及其与血管通透性的关系 | 正常脑组织和高级别胶质瘤的微血管系统 | 神经科学 | 脑胶质瘤 | 组织化学、单细胞RNA测序、磁共振成像 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-05 |
Intestinal Tuft Cells Are Enriched With Protocadherins
2024-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554241287267
PMID:39360911
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研究论文 | 本研究揭示了原钙粘蛋白在肠道簇细胞中的富集现象及其在微绒毛结构中的潜在作用 | 首次发现CDHR2和CDHR5等原钙粘蛋白在人和小鼠肠道簇细胞中特异性富集,揭示了这些蛋白在簇细胞微绒毛组织中的新功能 | 未完全阐明原钙粘蛋白在簇细胞中的具体分子机制和功能意义 | 探究肠道簇细胞中微绒毛间粘附复合体(IMACs)的组成和分布特征 | 小鼠和人类肠道组织中的肠道簇细胞 | 细胞生物学 | NA | 免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、基因表达数据 | 小鼠肠道组织、人类肠道组织单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-05 |
An aberrant immune-epithelial progenitor niche drives viral lung sequelae
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07926-8
PMID:39232171
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠模型揭示了病毒性肺后遗症中异常免疫-上皮祖细胞生态位驱动纤维化的机制 | 首次发现肺驻留CD8 T细胞-巨噬细胞相互作用通过IFNγ+TNF-IL-1β轴损害肺泡再生并驱动纤维化后遗症 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者样本验证仍需进一步扩展 | 阐明呼吸道病毒后遗症(PASC)的细胞分子机制 | 三个呼吸道PASC患者队列和病毒后肺病小鼠模型 | 空间转录组学 | COVID-19后遗症 | 空间转录组学、成像技术 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据、图像数据 | 三个患者队列和相应小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-05 |
Preventive Treatment with a CD73 Small Molecule Inhibitor Enhances Immune Surveillance in K-Ras Mutant Pancreatic Intraepithelial Neoplasia
2024-Oct-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-24-0200
PMID:39099209
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研究论文 | 本研究探讨CD73小分子抑制剂AB-680在K-Ras突变胰腺上皮内瘤变(PanIN)中的免疫预防作用 | 首次证明CD73抑制剂可通过增强免疫监视机制预防PanIN进展,并发现其能扩增TCR和BCR独特克隆型 | 研究仅使用基因工程小鼠模型,尚未在人体验证;观察时间有限(3个月治疗期) | 评估CD73抑制剂在胰腺癌前病变中的免疫预防效果 | KrasG12D; PdxCre1 (KC)基因工程小鼠模型的胰腺组织 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | KC基因工程小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-05 |
Inducible pluripotent stem cells to study human mast cell trajectories
2024-Oct, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.07.003
PMID:39038754
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研究论文 | 本研究开发了一种从诱导多能干细胞分化人类肥大细胞的体外模型,用于研究人类肥大细胞的分化轨迹 | 首次建立了基于iPSC的人类肥大细胞分化模型,通过单细胞RNA测序揭示了肥大细胞前体亚型和成熟状态的转录特征 | 研究仅限于体外模型系统,可能无法完全模拟体内肥大细胞发育的复杂性 | 研究人类肥大细胞的分化轨迹和亚型特征 | 人类诱导多能干细胞分化的肥大细胞及其前体细胞 | 细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞学分析 | 体外细胞分化模型 | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 2050个单细胞(来自第4周MCFC培养物) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-10-05 |
Spatial analysis reveals targetable macrophage-mediated mechanisms of immune evasion in hepatocellular carcinoma minimal residual disease
2024-Oct, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00828-8
PMID:39304772
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研究论文 | 通过空间分析揭示肝细胞癌微小残留病中巨噬细胞介导的免疫逃逸机制 | 首次通过单细胞高plex细胞成像和空间转录组学识别PD-L1+M2样巨噬细胞与干细胞样肿瘤细胞的空间互作机制 | 研究样本量相对有限(108例患者),且主要基于小鼠模型验证 | 探索肝细胞癌微小残留病的免疫逃逸机制及治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本(108例,107万个细胞)和转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞高plex细胞成像,空间转录组学 | 转基因小鼠模型,同源原位移植模型 | 空间成像数据,转录组数据 | 108例患者,107万个细胞 | NA | 单细胞成像,空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-05 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569014
PMID:38168452
|
研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽通过加速细胞周期和细胞重编程在植物再生中的关键作用 | 首次发现损伤附近细胞通过缩短G1期显著提高分裂速率,并鉴定出G1期存在短暂的谷胱甘肽核内峰值 | 研究主要基于拟南芥根系,在其他植物系统中的普适性有待验证 | 探究细胞重编程过程中的细胞周期动态 | 拟南芥根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-10-05 |
Learning antibody sequence constraints from allelic inclusion
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619760
PMID:39484623
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研究论文 | 本研究利用等位基因包含现象学习抗体序列约束,通过单细胞测序数据识别异常序列并训练机器学习模型 | 首次大规模发现等位基因包含的幼稚B细胞,并利用这些细胞学习抗体序列约束,模型性能优于现有方法 | 研究主要关注轻链,对重链的研究仅限于小鼠模型 | 探索抗体序列的约束机制及其与抗体功能特性的关系 | 人类和小鼠的B细胞及其表达的抗体序列 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | 数千个幼稚B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-05 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.12.618004
PMID:39416197
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了脂肪组织巨噬细胞在衰老过程中的多样性变化,发现神经相关巨噬细胞控制脂肪稳态并抑制年龄相关炎症 | 首次使用血管内标记排除循环髓系细胞,结合单细胞测序和正交验证,定义了寿命周期内驻留脂肪组织巨噬细胞的多样性变化,并发现CD169+神经相关巨噬细胞的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类脂肪组织巨噬细胞的变化模式可能有所不同 | 探究脂肪组织巨噬细胞如何控制年龄相关炎症和脂肪稳态 | 小鼠内脏白色脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 年龄相关疾病 | 单细胞测序,血管内标记,正交验证 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-05 |
Proximity-dependent labeling identifies dendritic cells that drive the tumor-specific CD4+ T cell response
2024-10-04, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adq8843
PMID:39365874
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研究论文 | 本研究通过邻近标记技术识别了驱动肿瘤特异性CD4+ T细胞反应的树突状细胞 | 首次使用LIPSTIC单细胞转录组学技术追踪树突状细胞与T细胞的相互作用,揭示了肿瘤引流淋巴结和肿瘤微环境中少数超活化树突状细胞的关键作用 | 未明确说明样本规模和研究模型的具体限制 | 探究树突状细胞在肿瘤免疫应答中的具体作用机制 | 树突状细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 肿瘤免疫 | LIPSTIC邻近标记、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-05 |
Modeling Glioma Intratumoral Heterogeneity with Primary Human Neural Stem and Progenitor Cells
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619254
PMID:39484434
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研究论文 | 利用人类神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型研究肿瘤内异质性 | 首次使用从胎儿脑组织纯化的同源神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型,系统研究细胞起源对肿瘤异质性的影响 | 使用免疫缺陷小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 探究细胞起源如何塑造胶质瘤的肿瘤内异质性 | 人类神经干细胞、胶质祖细胞和少突胶质前体细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种同源神经细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Stratified analysis identifies HIF-2α as a therapeutic target for highly immune-infiltrated melanomas
2024-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.29.620300
PMID:39554029
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研究论文 | 本研究通过分层分析发现HIF-2α是高度免疫浸润黑色素瘤的潜在治疗靶点 | 首次通过标准化荟萃分析揭示免疫浸润程度与ICB疗效的关系,并发现HIF-2α在特定细胞类型中的特异性表达 | 样本量相对有限,且主要基于回顾性队列分析 | 探索黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物和联合治疗新靶点 | 转移性黑色素瘤患者和临床前模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,荟萃分析 | NA | RNA测序数据,临床数据 | 516例患者(抗PD-1治疗290例,抗CTLA-4治疗175例,联合治疗51例) | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Identification of gene and protein signatures associated with long-term effects of COVID-19 on the immune system after patient recovery by analyzing single-cell multi-omics data using a machine learning approach
2024-10-03, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2024.126253
PMID:39182316
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研究论文 | 通过机器学习方法分析单细胞多组学数据,识别与COVID-19康复患者免疫系统长期影响相关的基因和蛋白特征 | 首次结合五种特征排序算法和两种分类算法分析COVID-19康复患者的单细胞多组学数据,识别出特定的分子标志物 | 研究仅限于特定免疫细胞亚型,样本来源和规模未明确说明 | 研究COVID-19康复患者免疫系统的持久性改变和次级免疫反应 | COVID-19康复患者和健康对照组的免疫细胞 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞多组学测序 | LASSO, MCFS, RF, CATBoost, XGBoost, 决策树, K近邻 | 单细胞多组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 包含scRNA-seq、HTO、CITE-seq和SCT多种检测技术 |
| 76 | 2025-10-06 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
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研究论文 | 本研究探讨树突状细胞来源的CXCL10通过激活细胞毒性T淋巴细胞抑制卵巢癌的机制 | 首次揭示CXCL10在卵巢癌微环境中作为树突状细胞与细胞毒性T淋巴细胞相互作用的关键调节因子 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证 | 阐明树突状细胞及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中的作用机制 | 卵巢癌微环境中的树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫浸润分析, 体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
A tumorigenicity evaluation platform for cell therapies based on brain organoids
2024-10-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-024-00446-5
PMID:39472972
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研究论文 | 开发基于脑类器官的细胞疗法致瘤性评估平台 | 首次利用胶质母细胞瘤样类器官模型增强对潜在致瘤细胞的检测灵敏度 | 需要进一步验证该平台在更广泛细胞类型中的适用性 | 建立新型致瘤性评估方法以改进干细胞疗法的安全性监测 | 人多能干细胞来源的脑类器官和细胞治疗产品 | 干细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型(mDA细胞、hPSCs等)的体外和体内比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal diverging pathobiology and opportunities for precision targeting in scleroderma-associated versus idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.25.620225
PMID:39484590
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较硬皮病相关性与特发性肺动脉高压的病理差异 | 首次在单细胞水平揭示SSc-PAH与IPAH的分子病理差异,并识别出针对SSc-PAH的潜在精准治疗靶点 | 样本量较小(仅12例),需要临床验证识别出的治疗靶点 | 探究不同类型肺动脉高压的分子机制差异并寻找精准治疗机会 | 肺动脉高压患者的肺组织样本 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 12例(4例SSc-PAH,4例IPAH,4例供体对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium Flex平台 |
| 79 | 2025-10-06 |
Endothelial pyroptosis-driven microglial activation in choroid plexus mediates neuronal apoptosis in hemorrhagic stroke rats
2024-10-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106695
PMID:39370051
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研究论文 | 本研究揭示了出血性中风后脉络丛中内皮细胞焦亡驱动小胶质细胞活化并通过Lcn2-SLC22A17通路介导神经元凋亡的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在出血性中风的三个关键时间点系统解析了细胞因子风暴的细胞来源和作用机制 | 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证;干预措施VX-765的特异性需要进一步确认 | 阐明出血性中风后炎症反应的细胞来源和分子机制 | 出血性中风大鼠模型,重点关注脉络丛中的内皮细胞、小胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 出血性中风 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Luminex细胞因子检测 | 动物模型 | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞因子浓度数据 | 出血性中风大鼠模型在超急性期、急性期和亚急性期三个时间点 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the predictive value of IGF2BP3/SPHK1 signaling in cancer stem cells for prognosis and immunotherapeutic response in muscle-invasive bladder cancer
2024-Oct-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05685-8
PMID:39367493
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了IGF2BP3/SPHK1信号通路在肌肉浸润性膀胱癌干细胞中的预后和免疫治疗反应预测价值 | 首次发现IGF2BP3通过m6A依赖方式调控SPHK1表达,并揭示了IGF2BP3+SPHK1+膀胱癌细胞与耗竭CD8+T细胞的空间邻近关系 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索肌肉浸润性膀胱癌中癌症干细胞与免疫治疗反应的关系 | 肌肉浸润性膀胱癌组织和患者来源的类器官 | 单细胞多组学分析 | 膀胱癌 | 单细胞质谱流式,RNA测序,甲基化RNA免疫沉淀测序,单核RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,CODEX多重成像 | NA | 单细胞数据,RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 38例MIBC组织(179,483个单细胞),25例MIBC组织(67,988个细胞),患者来源类器官 | NA | 单细胞质谱流式,单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,多重蛋白质成像 | NA | NA |