单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
641	2024-09-09	Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells 2024-Oct, Immunology letters IF:3.3Q3 DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904 PMID:39117004	综述	本文综述了单细胞测序技术在正常和肿瘤性胸腺中胸腺上皮细胞分类方面的最新进展	利用单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞更为复杂的分类	NA	探讨单细胞测序技术在胸腺上皮细胞分类中的应用	正常和肿瘤性胸腺中的胸腺上皮细胞	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	细胞	NA
642	2024-09-09	Enhanced cytokine signaling and ferroptosis defense interplay initiates obesity-associated pancreatic ductal adenocarcinoma 2024-Oct-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217162 PMID:39127339	研究论文	研究揭示了肥胖与胰腺导管腺癌之间的机制联系，发现肥胖患者的血清改变了胰腺导管上皮细胞的炎症细胞因子信号和铁死亡防御机制	首次发现肥胖患者的血清通过增强白细胞介素34表达和铁死亡防御之间的相互作用，促进了胰腺导管腺癌的发生	研究主要基于细胞培养和小鼠模型，需要进一步的人体临床验证	探讨肥胖与胰腺导管腺癌之间的分子机制	胰腺导管上皮细胞、肥胖患者血清、小鼠模型	NA	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及不同代谢状态的人类血清样本和肥胖小鼠模型
643	2024-09-09	Survival benefit and spatial properties of tertiary lymphoid structures in esophageal squamous cell carcinoma with neoadjuvant therapies 2024-Oct-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217178 PMID:39142497	研究论文	研究了三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助治疗后的生存益处和空间分布	首次探讨了三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗、新辅助免疫治疗、新辅助放化疗或单独手术后的成熟度和空间分布，并发现成熟的三级淋巴结构是食管鳞状细胞癌的独立预后因素	研究样本仅限于359名食管鳞状细胞癌患者，可能存在样本量不足的问题	探讨三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌患者接受新辅助治疗后的临床相关性和空间分布	食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗、新辅助免疫治疗、新辅助放化疗或单独手术后的三级淋巴结构	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	359名食管鳞状细胞癌患者
644	2024-09-09	Single-cell RNA-seq reveals heterogeneity in metastatic renal cell carcinoma and effect of anti-angiogenesis therapy in the pancreas metastatic lesion 2024-Oct-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217193 PMID:39159881	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了转移性肾细胞癌在胰腺转移灶中的异质性，并评估了抗血管生成治疗的效果	首次通过单细胞RNA测序详细解析了胰腺转移灶的肿瘤微环境，并探讨了抗血管生成治疗的影响	研究样本量有限，可能影响结果的普适性	揭示转移性肾细胞癌在胰腺转移灶中的异质性及其治疗效果	转移性肾细胞癌的胰腺转移灶及其肿瘤微环境	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	包括大量原发和转移性病灶样本
645	2024-09-07	RIPK3 causes mitochondrial dysfunction and albuminuria in diabetic podocytopathy through PGAM5-Drp1 signaling 2024-Oct, Metabolism: clinical and experimental DOI:10.1016/j.metabol.2024.155982 PMID:39089491	研究论文	研究探讨了RIPK3在糖尿病肾病中的作用及其通过PGAM5-Drp1信号通路导致线粒体功能障碍和蛋白尿的机制	首次揭示了RIPK3在糖尿病肾病中通过PGAM5-Drp1信号通路导致线粒体功能障碍和蛋白尿的作用	研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步的人体临床验证	探讨RIPK3在糖尿病肾病中的作用及其机制	糖尿病肾病患者的肾脏和动物模型	NA	糖尿病	ELISA、单细胞RNA测序	NA	RNA	包括糖尿病患者和糖尿病小鼠模型
646	2024-09-05	Single-cell sequencing reveals that specnuezhenide protects against osteoporosis via activation of METTL3 in LEPR+ BMSCs 2024-Oct-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176908 PMID:39154827	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制	首次揭示了specnuezhenide通过激活METTL3在LEPR+ BMSCs中保护骨质疏松的分子机制	NA	阐明骨质疏松发病机制并提出新型治疗药物	骨质疏松和LEPR+ BMSCs	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠骨质疏松模型
647	2024-09-02	Single-cell RNA Sequencing Identifies a Novel Subtype of Microglia with High Cd74 Expression that Facilitates White Matter Inflammation During Chronic Cerebral Hypoperfusion 2024-Oct, Neurochemical research IF:3.7Q2 DOI:10.1007/s11064-024-04206-9 PMID:39012534	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，在慢性脑缺血模型中发现了一种新型高Cd74表达的微胶质细胞亚型，该亚型与白质炎症有关	首次发现并命名了慢性缺血相关微胶质细胞（CIAM），并证实Cd74是其核心分子，可能作为血管性痴呆的新治疗靶点	研究主要基于动物模型，需要进一步的人体研究验证	探讨血管性痴呆中微胶质细胞是否转化为新型亚型	微胶质细胞及其在血管性痴呆中的作用	数字病理学	血管性痴呆	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	使用了慢性脑缺血（CCH）大鼠模型
648	2024-09-02	PPIC-labeled CAFs: Key players in neoadjuvant chemotherapy resistance for gastric cancer 2024-Oct, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102080 PMID:39116799	研究论文	本文研究了胃癌中与新辅助化疗耐药性相关的癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特定亚群，特别是PPIC标记的CAFs。	首次揭示了PPIC标记的CAF亚群在胃癌新辅助化疗耐药性中的关键作用，并探讨了其可能的信号通路机制。	需要进一步研究PPIC标记的CAF在胃癌药物耐药性中的确切机制。	探讨胃癌中新辅助化疗耐药性的机制，特别是与癌症相关成纤维细胞（CAFs）的关系。	胃癌患者的新辅助化疗耐药性和癌症相关成纤维细胞（CAFs）。	数字病理学	胃癌	单细胞测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	109例耐药组和55例敏感组胃癌患者
649	2024-09-01	Comprehensive analysis of single-cell transcriptomics and genetic factors reveals the mechanisms and preventive strategies for the progression from pulmonary fibrosis to lung cancer 2024-Oct-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112803 PMID:39094357	研究论文	本文通过综合分析单细胞转录组学和遗传因素，揭示了从肺纤维化到肺癌进展的机制和预防策略。	本文首次使用孟德尔随机化方法确定肺纤维化诱发的肺癌初期属于小细胞肺癌，并通过伪时间序列分析识别出具有致癌潜力的肺神经内分泌细胞。	NA	研究从肺纤维化到肺癌的进展机制及其预防策略。	肺纤维化细胞、肺神经内分泌细胞及其相互作用，以及肺纤维化微环境中纤维母细胞对免疫细胞的影响。	数字病理学	肺纤维化	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
650	2024-09-01	Alterations in intratumoral and peripheral immune status in recurrent gliomas and their prognostic implications for patients underwent reoperation 2024-Oct-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112797 PMID:39083926	研究论文	本文分析了复发性胶质瘤中肿瘤内和外周免疫状态的特征及其对患者再次手术后生存的预测意义	发现复发性胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的浸润增加，并且TAMs在复发性胶质瘤中表现出显著的表型异质性和代谢重编程	NA	研究复发性胶质瘤中免疫状态的特征及其对患者再次手术后生存的预测意义	复发性胶质瘤患者的肿瘤内和外周免疫状态	数字病理学	脑瘤	免疫组织化学染色、血液学检查、批量和单细胞测序	NA	组织样本、血液样本、测序数据	使用自家的样本和公开来源的数据进行分析
651	2024-09-01	Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptome reveal potential molecular mechanisms of lung cancer brain metastasis 2024-Oct-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112804 PMID:39079345	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了肺癌脑转移的潜在分子机制	首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，识别并验证了早期转移上皮细胞集群（EMEC）及其在肺癌脑转移中的作用	NA	揭示肺癌脑转移的分子机制，为临床检测和治疗提供参考	肺癌脑转移的分子机制	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序，空间转录组学	NA	RNA测序数据	共获得55,763个单细胞，分为9种细胞类型
652	2024-09-01	Enhancing insight into ferroptosis mechanisms in sepsis: A genomic and pharmacological approach integrating single-cell sequencing and Mendelian randomization 2024-Oct-25, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112910 PMID:39121604	研究论文	本研究通过整合单细胞测序和孟德尔随机化方法，利用先进的基因组学和药理学手段，探讨了铁死亡与脓毒症之间的复杂关系	本研究首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，深入探讨了铁死亡相关基因在脓毒症中的作用，并通过计算分子对接预测了潜在的治疗化合物	研究主要基于UK Biobank的数据，可能存在样本选择偏倚；此外，分子对接预测的药物靶点需要进一步的实验验证	探讨铁死亡机制在脓毒症中的作用，并为脓毒症的治疗提供新的策略	铁死亡相关基因及其在脓毒症中的表达和作用	基因组学	脓毒症	单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、基因集富集分析(GSEA)、计算分子对接	NA	基因表达数据	10,154名脓毒症患者和452,764名对照组
653	2024-09-01	Suppression of GATA3 promotes epithelial-mesenchymal transition and simultaneous cellular senescence in human extravillous trophoblasts 2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119768 PMID:38838858	研究论文	本研究利用胎盘类器官模型和胎盘组织的单细胞RNA测序数据，探讨了GATA3在早期妊娠胎盘外绒毛滋养层细胞（EVT）成熟过程中的动态变化及其在妊娠障碍发生中的相关性	本研究首次揭示了GATA3在EVT分化和成熟过程中调控上皮-间质转化（EMT）和细胞衰老的双重作用	研究主要集中在体外细胞模型上，未来需要进一步的体内研究来验证这些发现	探讨GATA3在早期妊娠胎盘EVT分化和成熟过程中的调控机制及其与妊娠障碍的关系	早期妊娠胎盘的外绒毛滋养层细胞（EVT）	NA	妊娠障碍	单细胞RNA测序	NA	RNA	胎盘类器官模型和胎盘组织的单细胞RNA测序数据
654	2024-09-01	Combination of radiotherapy and PD-L1 blockade induces abscopal responses in EGFR-mutated lung cancer through activating CD8+ T cells 2024-Oct, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102074 PMID:39106551	研究论文	研究结合放疗和PD-L1阻断剂在EGFR突变型肺癌中通过激活CD8+ T细胞诱导远隔效应	首次探讨了放疗与免疫检查点抑制剂联合治疗EGFR突变型非小细胞肺癌的效果，并揭示了CD8+ T细胞在其中的作用机制	研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证	探讨放疗与PD-L1阻断剂联合治疗EGFR突变型肺癌的效果及其机制	EGFR突变型非小细胞肺癌中的CD8+ T细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	小鼠模型LLC-19del和LLC-EGFR
655	2024-09-01	Glycyrrhizic acid alleviates concanavalin A-induced acute liver injury by regulating monocyte-derived macrophages 2024-Oct, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.155586 PMID:39159503	研究论文	本研究探讨了甘草中的活性成分甘草酸（GA）通过调节单核细胞衍生的巨噬细胞（MoMFs）减轻刀豆蛋白A（ConA）诱导的急性肝损伤的作用机制	本研究通过CyTOF和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，全面阐释了GA干预后ConA诱导的肝损伤的免疫景观，为GA的作用机制提供了深入理解	研究中的部分单细胞数据仍处于原始状态，需要进一步处理和注释	探究甘草酸在自身免疫性肝炎治疗中的免疫调节机制	甘草酸对刀豆蛋白A诱导的小鼠急性肝损伤的影响及其免疫调节作用	NA	自身免疫性肝炎	CyTOF分析，单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA数据	小鼠模型
656	2024-08-25	Transcriptomic analysis of mouse TRAMP cell lines and tumors provide insights into shared pathways and therapeutic targets 2024-Oct, Cell insight DOI:10.1016/j.cellin.2024.100184 PMID:39175940	研究论文	本研究比较了不同小鼠前列腺癌模型的基因表达谱，重点关注TRAMP转基因模型及其衍生细胞系，并扩展到相关的遗传工程小鼠模型和人类前列腺癌数据集	本研究通过RNA测序分析，揭示了TRAMP模型中细胞周期调控、免疫反应和有丝分裂过程的上调基因，以及TC2和TC2R细胞在ECM组织、组织发育、细胞因子和运动基因表达上的差异	NA	研究旨在通过比较不同前列腺癌小鼠模型的基因表达谱，揭示共同通路和治疗靶点	TRAMP转基因小鼠模型及其衍生细胞系，以及其他遗传工程小鼠模型和人类前列腺癌数据集	数字病理学	前列腺癌	RNA测序	NA	基因表达数据	涉及TRAMP细胞、TC2细胞、TC2R细胞及其肿瘤，以及人类前列腺癌数据集
657	2024-08-24	Identification and experimental validation of immune-related gene PPARG is involved in ulcerative colitis 2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167300 PMID:38880160	研究论文	本研究旨在深入理解溃疡性结肠炎（UC）的免疫学特征，并识别有价值的诊断和治疗生物标志物	通过生物信息学技术，本研究首次确定了PPARG作为UC的关键生物标志物，并验证了其在UC中的作用及其与巨噬细胞浸润的相关性	NA	深入理解溃疡性结肠炎的免疫学特征并识别生物标志物	溃疡性结肠炎及其相关免疫基因PPARG	数字病理学	溃疡性结肠炎	单细胞测序技术	DNN	基因表达数据	UC数据集来自GEO数据库，具体样本数量未详细说明
658	2024-08-20	Integrated metabolomics and proteomics analyses to reveal anticancer mechanism of hemp oil extract in colorectal cancer 2024-Oct-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis IF:3.1Q2 DOI:10.1016/j.jpba.2024.116379 PMID:39059180	研究论文	本研究通过代谢组学和蛋白质组学分析，探讨了大麻油提取物（HOE）在结直肠癌（CRC）治疗中的抗癌机制	首次详细揭示了大麻油提取物通过影响嘌呤代谢途径和下调c-MYC等细胞周期相关蛋白的表达，导致细胞周期在G1期停滞，从而抑制结直肠癌细胞增殖的机制	NA	阐明大麻油提取物在结直肠癌治疗中的具体抗癌机制	大麻油提取物对结直肠癌细胞的影响	数字病理学	结直肠癌	质谱法	NA	代谢组学数据和蛋白质组学数据	NA
659	2024-08-19	HAO2 protects from proximal tubular cells injured in rats with chronic kidney disease by promoting fatty acid metabolic processes 2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167342 PMID:39002705	研究论文	本研究使用单细胞转录组测序技术，对正常对照组和慢性肾脏病（CKD）大鼠的血液和肾脏组织细胞进行测序和分析，重点关注关键细胞群和功能富集，以探索CKD的发病机制	成功建立了CKD大鼠的单细胞转录组图谱，并发现HAO2通过促进脂肪酸代谢过程保护近端小管细胞免受损伤	NA	探索慢性肾脏病的发病机制	慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞	数字病理学	肾脏疾病	单细胞转录组测序技术	NA	细胞	正常对照组和慢性肾脏病大鼠的血液和肾脏组织细胞
660	2024-08-19	Lysine lactylation-based insight to understanding the characterization of cervical cancer 2024-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167356 PMID:39025375	研究论文	本文通过综合蛋白质组学分析，研究了赖氨酸乳酸化（Kla）在宫颈癌中的特征和功能	首次全面分析了Kla在宫颈癌细胞中的分布和功能，并构建了基于Kla的宫颈癌预后模型	研究主要集中在HeLa细胞系，可能需要进一步在更多样化的细胞系和临床样本中验证	探索赖氨酸乳酸化在宫颈癌中的特征和功能，为治疗提供潜在途径	宫颈癌细胞中的赖氨酸乳酸化位点和相关蛋白	数字病理学	宫颈癌	蛋白质组学分析	NA	蛋白质组、转录组和单细胞转录组数据	3633个Kla位点，1637种蛋白质