单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-07-20	Preventive Treatment with a CD73 Small Molecule Inhibitor Enhances Immune Surveillance in K-Ras Mutant Pancreatic Intraepithelial Neoplasia 2024-Oct-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.) DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-24-0200 PMID:39099209	research paper	该研究探讨了CD73小分子抑制剂AB-680在K-Ras突变胰腺上皮内瘤变（PanIN）中的免疫预防作用	首次证明CD73抑制剂AB-680可增强免疫监视，减少PanIN进展，并改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成	研究仅在KrasG12D; PdxCre1基因工程小鼠模型中进行，尚未在人体试验验证	探索CD73抑制作为胰腺导管腺癌（PDAC）免疫预防新策略的潜力	KrasG12D; PdxCre1基因工程小鼠模型中的胰腺上皮内瘤变（PanIN）	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	KrasG12D; PdxCre1（KC）基因工程小鼠模型	基因表达数据	KC小鼠模型（具体数量未明确说明）
42	2025-07-20	Therapeutic single-cell landscape: methotrexate exacerbates interstitial lung disease by compromising the stemness of alveolar epithelial cells under systemic inflammation 2024-Oct, EBioMedicine IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105339 PMID:39303666	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了甲氨蝶呤（MTX）和TNF抑制剂对类风湿关节炎相关间质性肺病（RA-ILD）的影响	揭示了MTX通过促进免疫细胞浸润、Th17激活和纤维化加剧肺炎症，而TNF抑制剂则改善这些特征并抑制ILD进展	研究主要基于SKG小鼠模型，人类队列数据仍需进一步验证	评估MTX和TNF抑制剂对RA-ILD的影响	SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列	单细胞转录组学	间质性肺病	单细胞转录组学	SKG小鼠模型	转录组数据	NA
43	2025-07-19	Single-cell RNA sequencing reveals vascularization-associated cell subpopulations in dental pulp: PDGFRβ+ DPSCs with activated PI3K/AKT pathway 2024-10-09, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxae051 PMID:39167061	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓中与血管化相关的细胞亚群PDGFRβ+ DPSCs，并探讨了其在牙髓再生治疗中的潜力	发现了一个新的牙髓干细胞亚群PDGFRβ+ DPSCs，证实其具有显著的促血管生成能力，并揭示了PDGFR/PI3K/AKT信号通路的关键作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未进行人体临床试验	解决牙髓再生治疗中的干细胞异质性挑战	牙髓干细胞(DPSCs)，特别是PDGFRβ+ DPSCs亚群	干细胞生物学	牙科疾病	单细胞RNA测序，流式细胞术，转录组测序	基因编辑小鼠模型	单细胞测序数据，转录组数据	未明确说明样本数量，但使用了人牙髓干细胞和小鼠模型
44	2025-07-18	Spatial analysis reveals targetable macrophage-mediated mechanisms of immune evasion in hepatocellular carcinoma minimal residual disease 2024-Oct, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-024-00828-8 PMID:39304772	研究论文	通过空间分析揭示了肝癌微小残留病中可靶向的巨噬细胞介导的免疫逃逸机制	发现了PD-L1+M2样巨噬细胞与干细胞样肿瘤细胞的空间相互作用及其通过TGFβ1介导的肿瘤细胞持续存在机制	研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，临床转化仍需进一步验证	探索肝癌微小残留病中肿瘤细胞持续存在的机制并寻找潜在治疗靶点	肝癌微小残留病中的肿瘤细胞和免疫微环境	数字病理学	肝癌	单细胞高维度细胞成像、空间转录组学	转基因小鼠模型、同源原位模型	图像、转录组数据	108名患者，107万个细胞，两种小鼠模型
45	2024-09-25	Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics 2024-10, Stroke IF:7.8Q1 DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907 PMID:39206540	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
46	2025-07-12	The generation of stable microvessels in ischemia is mediated by endothelial cell derived TRAIL 2024-10-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adn8760 PMID:39365855	research paper	本文揭示了内皮细胞衍生的TRAIL在缺血条件下稳定微血管生成中的作用	发现了TRAIL在促进新生血管形成和血管稳定中的新作用，并提出了重新利用TRAIL-R2激动剂治疗缺血性疾病的潜力	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床应用的可行性和安全性需要进一步验证	探究TRAIL在缺血条件下微血管生成和稳定中的作用机制	内皮细胞、周细胞及其相互作用	血管生物学	外周动脉疾病(PAD)	单细胞RNA测序	小鼠缺血模型	基因表达数据	小鼠模型和患者动脉样本
47	2025-07-11	Understanding disease-associated metabolic changes in human colon epithelial cells using i ColonEpithelium metabolic reconstruction 2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.22.619644 PMID:39484551	研究论文	本研究通过构建首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，揭示了与炎症性肠病相关的代谢变化	首次构建了人类结肠上皮细胞的特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，并整合单细胞RNA测序数据预测疾病相关代谢特征	模型预测结果需要进一步实验验证，且目前仅关注结肠上皮细胞，未全面考虑其他细胞类型的影响	解析人类结肠上皮细胞的代谢活动及其在疾病状态下的变化	人类结肠上皮细胞及其在炎症性肠病(克罗恩病和溃疡性结肠炎)中的代谢特征	系统生物学	炎症性肠病(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎)	基因组尺度代谢模型(GEM)、单细胞RNA测序	iColonEpithelium代谢网络模型	基因组数据、转录组数据	NA
48	2025-07-10	The G4 resolvase Dhx36 modulates cardiomyocyte differentiation and ventricular conduction system development 2024-10-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52809-1 PMID:39366945	研究论文	本研究揭示了Dhx36解旋酶在心肌细胞分化和心室传导系统发育中的关键作用	首次发现Dhx36通过调控启动子G-四链体结构影响心肌细胞基因网络和传导系统发育	研究仅限于小鼠模型，人类心脏发育的适用性尚需验证	探索心脏传导系统发育和心肌细胞分化的转录调控机制	胚胎期和新生期小鼠心脏	发育生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序(snRNA-seq)，单细胞ATAC测序(snATAC-seq)	基因敲除小鼠模型	单细胞转录组和表观基因组数据	Dhx36敲除小鼠胚胎和新生心脏样本
49	2025-06-27	Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma 2024-Oct-31, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom14111394 PMID:39595571	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序分析，将DNMT3B和PFKFB4的转录谱与肝母细胞瘤的转移特性联系起来	发现DNMT3B和PFKFB4的双重过表达与肝母细胞瘤患者的转移风险相关，并开发了一个代谢评分作为独立的转移预测指标	研究样本可能有限，且未在独立队列中进行验证	探索肝母细胞瘤中代谢酶的过表达与转移风险的关系	肝母细胞瘤患者和非癌肝组织	数字病理学	肝母细胞瘤	单细胞RNA测序	ElasticNet, 逻辑回归	转录组数据	GSE131329转录组数据集中的样本
50	2025-06-18	Polybacterial Intracellular Macromolecules Shape Single-Cell Epikine Profiles in Upper Airway Mucosa 2024-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.08.617279 PMID:39416216	研究论文	本文研究了上呼吸道黏膜中多细菌细胞内大分子对单细胞表观因子谱的影响	揭示了多细菌细胞内大分子（PIMs）在黏膜上皮细胞中的持久存在及其对细胞因子表达和药物反应的线性驱动作用	研究主要基于人类口腔黏膜数据，可能不适用于其他黏膜部位	探究宿主与微生物在黏膜上皮细胞类型中的相互作用	人类口腔黏膜上皮细胞和基质细胞	单细胞RNA测序	慢性炎症性疾病	单细胞RNA测序、杂交、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、图像数据	人类口腔角质形成细胞（HOKs）
51	2025-06-13	Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction 2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.07.617070 PMID:39416184	research paper	该研究探讨了抗体Fab和Fc特性在促进结核分枝杆菌限制中的作用	通过Fc交换优化保护性抗体，揭示了Fc效应功能在结核分枝杆菌限制中的关键作用，并发现抗体介导的限制与组织水平免疫反应的重组相关	研究主要基于小鼠模型，未涉及人类临床试验	探究抗体在结核分枝杆菌限制中的机制	结核分枝杆菌和单克隆抗体	免疫学	结核病	单细胞转录组学	NA	NA	NA
52	2025-06-13	The frequency of CD38+ alveolar macrophages correlates with early control of M. tuberculosis in the murine lung 2024-10-02, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52846-w PMID:39358361	研究论文	本文通过多模态单细胞RNA测序在小鼠模型中展示了不同肺泡巨噬细胞亚群在结核病进展或控制中的不同作用	揭示了CD38阳性和阴性肺泡巨噬细胞在结核病控制中的动态作用及其表观遗传预激活机制	研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性有待验证	探究肺泡巨噬细胞亚群在结核病控制中的作用机制	小鼠模型中的肺泡巨噬细胞	免疫学	结核病	多模态单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
53	2025-06-12	Concerted transcriptional regulation of the morphogenesis of hypothalamic neurons by ONECUT3 2024-10-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52762-z PMID:39366958	研究论文	研究ONECUT3转录因子在下丘脑神经元形态发生中的调控作用	发现ONECUT3通过调控NAV2影响下丘脑神经元的极化和形态发生，这一机制在不同神经元亚型和多个物种中保守	研究主要基于小鼠和线虫模型，人类神经元中的具体机制尚需进一步验证	探究转录因子ONECUT3在神经元分化过程中的作用机制	下丘脑GABA能多巴胺神经元和促甲状腺激素释放激素(TRH)谷氨酸能神经元	神经生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能获得性实验、siRNA敲降	NA	基因表达数据	小鼠和线虫模型
54	2025-06-12	The lncRNA SNHG26 drives the inflammatory-to-proliferative state transition of keratinocyte progenitor cells during wound healing 2024-10-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52783-8 PMID:39366968	研究论文	该研究揭示了长链非编码RNA SNHG26在皮肤伤口愈合过程中调控角质形成细胞祖细胞从炎症状态向增殖状态转变的关键作用	首次发现SNHG26通过调控转录因子ILF2的基因组定位来促进角质形成细胞祖细胞的炎症-增殖状态转变	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性需要进一步验证	探索伤口愈合过程中炎症相向增殖相转变的分子机制	角质形成细胞祖细胞	分子生物学	皮肤创伤	单细胞转录组分析、功能获得和功能缺失实验	小鼠模型	RNA-seq数据	未明确说明样本数量，使用Snhg26缺陷小鼠和体外培养细胞
55	2025-06-12	Trophoblast Side-Population Markers are Dysregulated in Preeclampsia and Fetal Growth Restriction 2024-10, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s12015-024-10764-w PMID:39028417	research paper	该研究描述了人类胎盘中滋养层侧群标记物的特征及其在先兆子痫和胎儿生长受限中的异常表达	首次在胎盘功能不全疾病中表征了滋养层侧群标记物的表达模式，并揭示了这些标记物在滋养层细胞分化过程中的动态变化	样本量相对较小（n=3用于定位研究，n=78/30/18用于mRNA测量），且SERPINE3在体外验证中未被检测到	探究滋养层侧群标记物在胎盘发育和胎盘功能不全疾病中的作用	人类胎盘组织、先兆子痫和胎儿生长受限患者的胎盘样本	生殖医学	先兆子痫和胎儿生长受限	单细胞转录组学、体外细胞分化模型、mRNA定量分析	人滋养层干细胞(hTSC)向绒毛外滋养层(EVT)分化模型	基因表达数据、组织切片	定位研究n=3，mRNA测量n=78先兆子痫/30FGR/18对照，体外验证n=5
56	2025-06-12	Suppression of GATA3 promotes epithelial-mesenchymal transition and simultaneous cellular senescence in human extravillous trophoblasts 2024-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119768 PMID:38838858	研究论文	本研究探讨了转录因子GATA3在早期妊娠胎盘中外绒毛滋养细胞(EVT)分化和成熟过程中的调控机制及其与妊娠障碍发生的关联	揭示了GATA3在EVT分化过程中对上皮-间质转化(EMT)和细胞衰老的双重调控作用，并发现其在复发性流产(RM)中的异常定位	研究主要基于细胞系和有限的临床样本，需要在更大规模的临床队列中验证	阐明GATA3在EVT分化和成熟过程中的调控机制及其与妊娠障碍的关系	人外绒毛滋养细胞(EVT)、JEG3和HTR8/SVneo细胞系	生殖医学	妊娠障碍	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	胎盘类器官模型和胎盘组织样本
57	2025-06-08	Identifying genetic variants that influence the abundance of cell states in single-cell data 2024-Oct, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-024-01909-1 PMID:39327486	研究论文	本文介绍了一种名为Genotype-Neighborhood Associations (GeNA)的统计工具，用于在高维单细胞数据中识别影响细胞状态丰度的遗传变异	GeNA工具无需预定义细胞状态，灵活识别与遗传变异最相关的细胞状态丰度	研究仅基于969名个体的外周血单细胞RNA测序数据，可能需要更大样本量验证	识别影响单细胞数据中细胞状态丰度的遗传变异	单细胞RNA测序数据中的免疫细胞状态	生物信息学	自身免疫疾病	单细胞RNA测序	GeNA统计模型	单细胞RNA测序数据	969名个体的外周血样本
58	2025-06-06	Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea 2024-10-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52946-7 PMID:39384741	research paper	该研究通过单细胞转录组学揭示了酒渣鼻患者面部皮肤中异常的细胞群，并发现成纤维细胞在酒渣鼻发展中起关键作用	首次构建了酒渣鼻患者面部皮肤的单细胞图谱，并鉴定出成纤维细胞作为酒渣鼻发展的关键决定因素	研究样本仅来自女性患者，可能限制了结果的普适性	探究酒渣鼻的细胞和分子机制	酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤细胞	digital pathology	rosacea	single-cell transcriptomics	NA	transcriptomic data	女性酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本
59	2025-06-06	Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis 2024-10-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53104-9 PMID:39375367	研究论文	利用单细胞RNA测序技术揭示原发性胆汁性胆管炎（PBC）中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用	首次在PBC患者和小鼠PBC模型中鉴定出具有JAK-STAT激活的肝脏驻留Th1样细胞群，并通过阻断JAK-STAT通路减轻肝脏炎症	传统检测方法的局限性导致PBC的局部肝脏免疫发病机制尚未完全阐明	揭示PBC的免疫细胞景观和分子机制	PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏细胞	单细胞转录组学	原发性胆汁性胆管炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏样本
60	2025-06-06	Distinctive CD39+CD9+ lung interstitial macrophages suppress IL-23/Th17-mediated neutrophilic asthma by inhibiting NETosis 2024-10-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53038-2 PMID:39366998	研究论文	本文发现了一类独特的CD39+CD9+肺间质巨噬细胞，能够通过抑制NETosis来抑制IL-23/Th17介导的中性粒细胞性哮喘	首次揭示了CD39+CD9+间质巨噬细胞通过CD9依赖的附着和CD39依赖的ATP清除机制抑制NETosis和Th17细胞激活	研究主要基于小鼠模型，人类患者数据仅作为验证	探索中性粒细胞性哮喘的免疫调节机制	CD39+CD9+肺间质巨噬细胞和中性粒细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型和哮喘患者样本