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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
|
研究论文 | 本研究探讨树突状细胞来源的CXCL10通过激活细胞毒性T淋巴细胞抑制卵巢癌的机制 | 首次揭示CXCL10在卵巢癌微环境中作为树突状细胞与细胞毒性T淋巴细胞相互作用的关键调节因子 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床验证 | 阐明树突状细胞及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中的作用机制 | 卵巢癌微环境中的树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫浸润分析, 体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
A tumorigenicity evaluation platform for cell therapies based on brain organoids
2024-10-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-024-00446-5
PMID:39472972
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研究论文 | 开发基于脑类器官的细胞疗法致瘤性评估平台 | 首次利用胶质母细胞瘤样类器官模型增强对潜在致瘤细胞的检测灵敏度 | 需要进一步验证该平台在更广泛细胞类型中的适用性 | 建立新型致瘤性评估方法以改进干细胞疗法的安全性监测 | 人多能干细胞来源的脑类器官和细胞治疗产品 | 干细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型(mDA细胞、hPSCs等)的体外和体内比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal diverging pathobiology and opportunities for precision targeting in scleroderma-associated versus idiopathic pulmonary arterial hypertension
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.25.620225
PMID:39484590
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较硬皮病相关性与特发性肺动脉高压的病理差异 | 首次在单细胞水平揭示SSc-PAH与IPAH的分子病理差异,并识别出针对SSc-PAH的潜在精准治疗靶点 | 样本量较小(仅12例),需要临床验证识别出的治疗靶点 | 探究不同类型肺动脉高压的分子机制差异并寻找精准治疗机会 | 肺动脉高压患者的肺组织样本 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 12例(4例SSc-PAH,4例IPAH,4例供体对照) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium Flex平台 |
| 44 | 2025-10-06 |
Endothelial pyroptosis-driven microglial activation in choroid plexus mediates neuronal apoptosis in hemorrhagic stroke rats
2024-10-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106695
PMID:39370051
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研究论文 | 本研究揭示了出血性中风后脉络丛中内皮细胞焦亡驱动小胶质细胞活化并通过Lcn2-SLC22A17通路介导神经元凋亡的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在出血性中风的三个关键时间点系统解析了细胞因子风暴的细胞来源和作用机制 | 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证;干预措施VX-765的特异性需要进一步确认 | 阐明出血性中风后炎症反应的细胞来源和分子机制 | 出血性中风大鼠模型,重点关注脉络丛中的内皮细胞、小胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 出血性中风 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Luminex细胞因子检测 | 动物模型 | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞因子浓度数据 | 出血性中风大鼠模型在超急性期、急性期和亚急性期三个时间点 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the predictive value of IGF2BP3/SPHK1 signaling in cancer stem cells for prognosis and immunotherapeutic response in muscle-invasive bladder cancer
2024-Oct-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05685-8
PMID:39367493
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了IGF2BP3/SPHK1信号通路在肌肉浸润性膀胱癌干细胞中的预后和免疫治疗反应预测价值 | 首次发现IGF2BP3通过m6A依赖方式调控SPHK1表达,并揭示了IGF2BP3+SPHK1+膀胱癌细胞与耗竭CD8+T细胞的空间邻近关系 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索肌肉浸润性膀胱癌中癌症干细胞与免疫治疗反应的关系 | 肌肉浸润性膀胱癌组织和患者来源的类器官 | 单细胞多组学分析 | 膀胱癌 | 单细胞质谱流式,RNA测序,甲基化RNA免疫沉淀测序,单核RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,CODEX多重成像 | NA | 单细胞数据,RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 38例MIBC组织(179,483个单细胞),25例MIBC组织(67,988个细胞),患者来源类器官 | NA | 单细胞质谱流式,单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,多重蛋白质成像 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Constructing a disulfidptosis-related prognostic signature of hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and weighted co-expression network analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01968-z
PMID:38760515
|
研究论文 | 基于单细胞测序和加权共表达网络分析构建肝细胞癌的二硫下垂症相关预后特征 | 首次将新发现的二硫下垂症细胞死亡机制与肝细胞癌预后模型相结合,通过单细胞和批量多组学数据分析构建预后特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索二硫下垂症相关基因在肝细胞癌中的临床预后特征 | 肝细胞癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 加权共表达网络分析, 多组学测序 | COX回归, Lasso回归, 诺莫图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和GSE14520数据集中的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Loss of AR-regulated AFF3 contributes to prostate cancer progression and reduces ferroptosis sensitivity by downregulating ACSL4 based on single-cell sequencing analysis
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01941-w
PMID:38478171
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析发现AR调控的AFF3基因在去势抵抗性前列腺癌中下调,并通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性 | 首次揭示AFF3在前列腺癌中的抑癌作用及其通过调控ACSL4影响铁死亡敏感性的新机制 | 研究主要基于细胞系实验,需要进一步在动物模型和临床样本中验证 | 探索去势抵抗性前列腺癌耐药机制及新的治疗靶点 | 前列腺癌细胞系及单细胞测序数据 | 单细胞测序分析 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 流式细胞术, GSVA, GSEA | NA | 单细胞测序数据, 批量细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Metabolic Heterogeneity and Potential Immunotherapeutic Responses Revealed by Single-Cell Transcriptomics of Breast Cancer
2024-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01952-7
PMID:38578322
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示乳腺癌代谢异质性及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在单细胞水平系统揭示乳腺癌代谢异质性特征及其与化疗耐药性的关联 | 样本量较小(14例患者),需更大规模研究验证 | 解析乳腺癌单细胞转录组异质性及其临床意义 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 14例乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF/ACKR3 receptor-ligand interaction between neutrophils and nucleus pulposus cells in intervertebral disc degeneration
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.011
PMID:38823438
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示中性粒细胞与髓核细胞通过MIF/ACKR3受体-配体相互作用促进椎间盘退变的机制 | 首次在椎间盘退变中发现表达MIF的ECMO中性粒细胞亚群及其通过MIF/ACKR3轴与效应NPCs的相互作用机制 | 样本量相对有限(5个对照和9个退变样本),需进一步验证临床治疗潜力 | 解析椎间盘退变微环境中中性粒细胞的异质性和功能 | 椎间盘组织和其中的中性粒细胞与髓核细胞 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 71520个单细胞,来自5个对照和9个退变椎间盘样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Potential applications of dual haptoglobin expression in the reclassification and treatment of hepatocellular carcinoma
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.008
PMID:38815898
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示HP基因在肝细胞癌恶性细胞亚群中的关键作用及其通过C3/C3AR1轴促进Th1型免疫应答的机制 | 首次发现HP基因在HCC恶性细胞中的双重表达模式,并建立基于HP和C3表达的Th1反应重分类基因集及四种新辅助治疗预测模型 | 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步实验验证HP基因的具体作用机制 | 探索HP基因在肝细胞癌重新分类和治疗中的潜在应用价值 | 肝细胞癌恶性细胞亚群和T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 基因表达分析模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Hsp90aa1/JUN/Ccl2 regulatory axis mediates migration and differentiation of NSPCs, promoting the onset and progression of early post-ischemic stroke epilepsy
2024-10-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106635
PMID:39128813
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和生物信息学分析揭示了Hsp90aa1/JUN/Ccl2调控轴在神经干/祖细胞迁移和分化中的作用,及其对缺血性卒中后早期癫痫发生发展的影响 | 首次发现Hsp90aa1/JUN/Ccl2调控轴在调节神经干/祖细胞迁移和分化中的关键作用,并阐明其在缺血性卒中后早期癫痫发病机制中的功能 | NA | 探究缺血性卒中后早期癫痫的发病机制,特别是神经干/祖细胞在疾病过程中的调控机制 | 神经干/祖细胞(NSPCs) | 生物信息学 | 缺血性卒中后癫痫 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析,体外实验,体内实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
Microglia regulate GABAergic neurogenesis in prenatal human brain through IGF1
2024-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.19.619180
PMID:39464051
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞通过分泌IGF1调控人类胚胎期大脑中GABA能神经元的生成 | 首次发现小胶质细胞通过IGF1信号通路调控人类胚胎期GABA能神经前体细胞的持续增殖 | 研究主要基于体外类器官模型,需进一步验证在体情况 | 探索人类大脑中GABA能神经元扩展发育的机制 | 人类胚胎期大脑内侧神经节隆起(hMGE)的GABA能神经元前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序, 生物信息学分析, 组织学分析 | 神经免疫hMGE类器官模型 | 单细胞RNA测序数据, 组织学图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal individual and synergistic effects of Trisomy 21 and GATA1s on hematopoiesis
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595827
PMID:38826323
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析21三体综合征和GATA1s对造血过程的个体和协同效应 | 首次使用同源人类诱导多能干细胞模型分离21三体综合征和GATA1s的个体发育影响 | 研究基于体外干细胞模型,可能无法完全反映体内造血微环境 | 解析21三体综合征和GATA1s对造血过程的独立和协同作用机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的造血祖细胞 | 单细胞生物学 | 唐氏综合征相关血液疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 同源人类诱导多能干细胞系(差异仅在于21号染色体和GATA1状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
A versatile tissue-rolling technique for spatial-omics analyses of the entire murine gastrointestinal tract
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01001-2
PMID:38906985
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研究论文 | 开发一种组织卷曲技术用于小鼠整个胃肠道的空间组学分析 | 提出简单易行的组织包埋技术,可在单张玻片上分析从口腔到直肠的完整胃肠道 | 需要具备小鼠手术技能和标准组织学方法的研究人员操作 | 开发最大化组织分析面积的空间组学技术 | 小鼠胃肠道组织 | 空间组学 | NA | 组织染色、免疫组织化学、原位杂交、多重抗体染色、空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组学 |
| 55 | 2025-10-06 |
High-throughput single-cell transcriptomics of bacteria using combinatorial barcoding
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01007-w
PMID:38886529
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研究论文 | 开发了一种名为microSPLiT的高通量细菌单细胞转录组测序方法 | 通过四轮组合条形码标记,无需专用设备即可在单次实验中分析数十万革兰氏阴性和阳性细菌的转录状态 | 需要基础分子生物学技术经验、细菌样本处理能力和DNA文库制备知识;数据分析需要计算资源、Unix命令行熟悉度及Python或R基础 | 开发适用于细菌的高通量单细胞转录组测序技术 | 革兰氏阴性和阳性细菌 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序,组合条形码标记 | NA | 转录组数据 | 单次实验最多100万个细菌细胞和96个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | microSPLiT | 微生物分裂池连接转录组学技术,采用96孔板进行四轮组合条形码标记 |
| 56 | 2025-10-06 |
All-optical voltage imaging-guided postsynaptic single-cell transcriptome profiling with Voltage-Seq
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01005-y
PMID:38834919
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研究论文 | 开发了一种结合全光学电压成像和单细胞转录组测序的新方法Voltage-Seq,用于靶向特定突触后反应类型的神经元分析 | 首次将基因编码电压指示器Voltron与单细胞RNA测序结合,实现基于特定突触后反应类型的神经元靶向采集和转录组分析 | 需要6周完成工作流程,包括4-5周的病毒传感器表达时间,且需要操作者具备微操作技能和分子生物学、生物信息学经验 | 开发高通量方法研究突触后神经元的连接特性和转录组特征 | 小鼠急性脑切片中的突触后神经元 | 神经科学 | NA | 全光学电压成像,单细胞RNA测序 | 分类器 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
ProBac-seq, a bacterial single-cell RNA sequencing methodology using droplet microfluidics and large oligonucleotide probe sets
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01002-1
PMID:38769144
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研究论文 | 介绍ProBac-seq细菌单细胞RNA测序方法,利用液滴微流控和大规模寡核苷酸探针组解决细菌单细胞转录组分析的技术难题 | 开发了专门针对细菌的mRNA特异性探针方法,克服了细菌mRNA缺乏polyA尾、转录本不稳定和细胞形态不兼容等传统单细胞RNA测序技术的关键限制 | 协议完成时间较长(约7天),且需要针对不同生物体设计特异性探针组 | 建立适用于细菌的单细胞RNA测序方法 | 细菌细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序、液滴微流控、原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 数千个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴微流控的单细胞封装技术 |
| 58 | 2025-10-06 |
Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia
2024-Oct-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5045715/v1
PMID:39483903
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据,构建了阿尔茨海默病大脑和小胶质细胞的详细图谱 | 首次整合多个队列和脑区的单细胞与空间转录组数据,揭示了小胶质细胞状态的区域和病理特异性 | NA | 阐明阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性和空间分布特征 | 实验模型和人类大脑中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 多个队列和脑区域样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
Engineered extracellular vesicles enable high-efficient delivery of intracellular therapeutic proteins
2024-Oct-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae015
PMID:38518087
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研究论文 | 开发了一种基于细胞外囊泡的高效细胞内治疗蛋白递送系统 | 提出无需支架蛋白即可高效包装和递送天然蛋白的IDEA方法 | NA | 开发高效的细胞内蛋白递送系统以扩展蛋白治疗应用 | 细胞外囊泡和环状GMP-AMP合酶(cGAS) | 生物医学工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个同系肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Biologically informed machine learning modeling of immune cells to reveal physiological and pathological aging process
2024-Oct-24, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00479-4
PMID:39449067
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研究论文 | 本研究构建了涵盖人类生命周期的免疫细胞转录组图谱,开发了新型生物年龄预测模型PHARE,揭示了免疫细胞在生理和病理衰老过程中的变化 | 构建了首个涵盖从新生儿到超百岁老人的人类生命周期免疫细胞转录组图谱,开发了适用于单细胞和批量RNA-seq数据的生物年龄预测模型PHARE | NA | 研究衰老如何塑造免疫细胞功能,为不同生命阶段患者的精准治疗提供依据 | 人类免疫细胞,涵盖从新生儿到超百岁老人的不同年龄群体,以及COVID-19、川崎病和冠状动脉疾病患者 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | 涵盖从新生儿到超百岁老人的人类生命周期样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |