单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！

如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可发布，欢迎下载源码自行修改使用。如觉得不错，还请不吝给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！

添加微信请说明来意

微信赞赏

除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件： [分区不过滤]

[IF不过滤]

[发表日期：202410-202410]

[清除筛选条件]

当前共找到 580 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
41	2026-05-06	Multidimensional profiling of human T cells reveals high CD38 expression, marking recent thymic emigrants and age-related naive T cell remodeling 2024-10-08, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.019 PMID:39321807	研究论文	通过多维分析人类T细胞，揭示CD38高表达标志着近期胸腺迁出细胞和与年龄相关的初始T细胞重塑	首次通过单细胞RNA-seq/ATAC-seq数据结合CD38蛋白表达精确定义人类近期胸腺迁出细胞（RTE），并揭示CD38作为通用表面标志物的作用	未说明	明确人类近期胸腺迁出细胞的精确定义及其表面标志物，并研究初始T细胞随年龄的动态变化	人类T细胞，包括CD8和CD4近期胸腺迁出细胞及成熟细胞	机器学习	未指定	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 光谱细胞术	未指定	单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 免疫表型数据	158名个体的队列	未说明	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq	未说明	未说明
42	2026-05-01	YY1 knockout in pro-B cells impairs lineage commitment, enabling unusual hematopoietic lineage plasticity 2024-10-16, Genes & development IF:7.5Q1 DOI:10.1101/gad.351734.124 PMID:39362773	研究论文	本研究揭示YY1转录因子在pro-B细胞中敲除后导致B细胞谱系承诺丧失，赋予细胞异常的造血谱系可塑性	首次发现YY1在pro-B细胞阶段敲除可完全消除B细胞谱系承诺，并使细胞重获向T细胞等多谱系分化的能力，揭示了YY1在造血谱系决定中的关键调控作用	未明确说明研究限制	探究YY1转录因子在B细胞发育中pro-B细胞阶段对谱系承诺的调控作用	YY1敲除的pro-B细胞及其分化后的T细胞样细胞	机器学习	血液系统疾病	单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序、单细胞ATAC测序	NA	基因表达数据、染色质可及性数据	未明确说明样本量	NA	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq	NA	NA
43	2026-05-01	Exploring the impact of PDGFD in osteosarcoma metastasis through single-cell sequencing analysis 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00949-3 PMID:38652223	研究论文	通过单细胞RNA测序分析探究PDGFD在骨肉瘤转移中的作用	首次利用单细胞RNA测序技术揭示非转移性骨肉瘤原发灶中PDGF信号通路激活，并发现PDGFD通过抑制EMT信号通路发挥抑制骨肉瘤转移的作用	仅纳入两例原发骨肉瘤样本（1例非转移性和1例转移性），样本量较小；机制研究主要基于体外实验，缺乏体内验证	验证非转移性与转移性骨肉瘤之间的差异表达基因和信号通路，加深对转移机制的理解并发现潜在治疗靶点	两例原发骨肉瘤病变（1例非转移性和1例转移性）	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	2例原发骨肉瘤病变（1例非转移性和1例转移性）	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
44	2026-04-01	Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals immune suppression subtypes and establishes a novel signature for determining the prognosis in lung adenocarcinoma 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00948-4 PMID:38616208	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型，并建立了一个新的预后特征	结合单细胞和bulk RNA测序进行多组学聚类，识别出与不良生存相关的免疫抑制亚型，并发现CDC25C基因作为新的预后生物标志物	样本量较小（仅6对配对组织），且未明确说明单细胞测序平台的具体技术细节	探索肺腺癌的生物学特性，识别新的生物标志物和治疗靶点	肺腺癌（LUAD）患者组织样本	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、bulk RNA测序、全外显子组测序	NA	RNA测序数据	6对配对的原发性和邻近肺腺癌组织	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
45	2026-05-01	Machine-learning and scRNA-Seq-based diagnostic and prognostic models illustrating survival and therapy response of lung adenocarcinoma 2024-10, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-024-00289-0 PMID:39075270	研究论文	通过机器学习与单细胞RNA测序数据构建肺腺癌诊断和预后模型，以提高生存预测和治疗反应评估的准确性	利用阶段特异性肿瘤细胞标志物开发了高度灵敏和特异的诊断与预后模型，诊断模型准确率达96.4%，AUC达0.993，预后模型能有效预测总生存期，并揭示了风险评分与癌症相关成纤维细胞比例及免疫逃逸的关联	模型可能依赖于特定数据集，需在更多独立队列中验证其泛化能力	开发基于单细胞RNA测序数据的肺腺癌精确诊断与预后模型，以优化临床决策	肺腺癌肿瘤微环境中的细胞和分子特征	机器学习	肺腺癌	单细胞RNA测序	随机森林, Cox回归	单细胞RNA测序数据	涉及多个独立队列，具体样本量未明确	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	NA
46	2026-05-01	Deciphering the molecular landscape: evolutionary progression from gynecomastia to aggressive male breast cancer 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00964-4 PMID:38888848	研究论文	利用单细胞RNA测序解析男性乳腺增生到男性乳腺癌的进化过程及分子机制	首次在单细胞分辨率下揭示男性乳腺增生向男性乳腺癌演进的潜在致癌机制，发现共享突变特征（18p+和18q+）及CD13在驱动这一转变中的关键作用	未提及明确的局限性	阐明从男性乳腺增生到男性乳腺癌的进化进展及潜在分子机制	男性乳腺增生组织和男性乳腺癌细胞	数字病理	男性乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确提及具体样本数量	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
47	2026-05-01	Epigenetic reprogramming of CAR T cells for in vivo functional persistence against solid tumors 2024-10, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-024-00262-x PMID:38388813	研究论文	通过在CAR T细胞中敲除SUV39H1基因，实现表观遗传重编程，增强其在实体瘤中的持续功能	首次证明通过抑制SUV39H1甲基转移酶活性可重编程CAR T细胞表型，使其获得自我更新和干细胞样特性，显著提升抗实体瘤持久性	主要基于体外和动物模型验证，尚需临床前安全性验证及大规模生产可行性评估，且实体瘤微环境其他免疫抑制机制可能影响实际疗效	探究通过表观遗传修饰增强CAR T细胞治疗实体瘤功能持久性的方法	SUV39H1基因敲除的人源CAR T细胞及肿瘤浸润CAR T细胞	数字病理学	实体瘤	单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序	NA	基因表达数据，染色质开放性数据	人源CAR T细胞样本（具体数量未提及）及肿瘤浸润样本（具体数量未提及）	10x Genomics	单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞基因表达与染色质可及性联合分析平台
48	2026-05-01	Disrupting YAP1-mediated glutamine metabolism induces synthetic lethality alongside ODC1 inhibition in osteosarcoma 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00967-1 PMID:39115605	研究论文	本研究探讨了在骨肉瘤中，破坏YAP1介导的谷氨酰胺代谢与ODC1抑制联合诱导合成致死性的机制	首次揭示YAP1介导的谷氨酰胺代谢作为多胺代谢抑制后DFMO的重要旁路机制，并提出DFMO与YAP1抑制剂CIL56联合治疗的“一记重拳”策略	NA	发现转移性和复发性骨肉瘤的新型治疗靶点	骨肉瘤细胞、PDX和CDX模型、复发与非复发患者组织	机器学习和转录组学分析	骨肉瘤	单细胞转录组测序、转录组测序、高通量药物筛选、RNA-seq、代谢组学	NA	单细胞转录组数据、转录组测序数据、代谢组数据	包括单细胞RNA-seq数据、复发和非复发患者组织样本	NA	单细胞RNA-seq, 转录组测序, 代谢组学	NA	NA
49	2026-05-01	Single-cell RNA transcriptomic analyses of tumor microenvironment of ovarian metastasis in gastric cancer 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00974-2 PMID:39162990	研究论文	通过单细胞RNA测序分析胃癌卵巢转移的肿瘤免疫微环境	首次对胃癌卵巢转移配对临床标本进行单细胞RNA测序分析，揭示免疫微环境异质性及特定肿瘤相关成纤维细胞亚群	样本量较小，仅涉及两对配对临床标本，且缺乏功能验证实验	阐明胃癌卵巢转移的免疫微环境特征，为治疗策略开发提供基础	胃癌卵巢转移组织、原发肿瘤组织及配对的非肿瘤邻近组织	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	2对配对临床标本（原发肿瘤与卵巢转移组织）	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
50	2026-05-01	Integrated analysis reveals NLRC4 as a potential biomarker in sepsis pathogenesis 2024-10, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-024-00293-4 PMID:39181981	研究论文	综合运用多种技术分析发现NLRC4作为脓毒症发病机制中的潜在生物标志物	首次通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和ELISA等多种技术，系统鉴定NLRC4在脓毒症中的表达升高及其在单核细胞和中性粒细胞中的变化，并利用pySCENIC识别调控NLRC4的上游转录因子	NA	揭示脓毒症免疫应答的分子机制并鉴定潜在生物标志物	脓毒症患者和健康个体的外周血样本	机器学习	脓毒症	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ELISA, WGCNA, PPI, pySCENIC	NA	基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据	包含新诊断脓毒症、脓毒症诊断6小时后及健康样本	NA	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq	NA	NA
51	2026-05-01	Integrated analyses reveal CST7 and DUSP5 regulate Th2 cells differentiation to promote chronic HBV infection 2024-10, Genes and immunity IF:5.0Q2 DOI:10.1038/s41435-024-00296-1 PMID:39237681	研究论文	通过整合分析揭示CST7和DUSP5调节Th2细胞分化促进慢性HBV感染的机制	首次发现CST7和DUSP5在慢性乙型肝炎中高表达，并通过调控Th2细胞分化促进感染慢性化，为免疫治疗提供新靶点	未提及	探究慢性HBV感染中关键基因和免疫细胞的作用机制	慢性乙型肝炎患者肝组织样本（来自GSE83148、GSE84044和GSE182159数据集）	机器学习	慢性乙型肝炎	RNA-seq, scRNA-seq	加权基因共表达网络分析（WGCNA）	bulk RNA-seq数据, scRNA-seq数据	GSE83148和GSE84044的bulk表达数据集，GSE182159的scRNA-seq数据（具体样本数量未提及）	NA	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq	NA	NA
52	2026-04-30	Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws 2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.19.590370 PMID:38895328	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了酵母和细菌中单细胞核糖体含量的异质性及其对生长法则的影响	首次在单细胞水平上研究生长法则，发现单细胞核糖体含量与生长速率并不紧密相关，挑战了传统群体平均水平下的生长法则模型	仅研究了两种微生物，可能不适用于所有物种；未深入探讨引起单细胞核糖体含量变异的分子机制	探究单细胞水平的核糖体含量异质性及其与生长速率的关系，评估生长法则在单细胞层面的适用性	酿酒酵母（真核单细胞生物）与细菌（原核生物）中的单细胞	机器学习和生物信息学	不适用	单细胞RNA测序	高斯过程模型	转录组数据	来自多种条件、重复和物种的数千个单细胞	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞RNA测序平台
53	2026-04-29	Analysis of the heterogeneity and complexity of murine extraorbital lacrimal gland via single-cell RNA sequencing 2024-10, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2024.06.005 PMID:38945476	研究论文	利用单细胞RNA测序分析小鼠泪腺的细胞异质性和复杂性	首次通过单细胞RNA测序对小鼠泪腺细胞类型进行无偏分类，并构建了全面的细胞图谱	研究仅限于小鼠模型，未涉及人体样本	揭示健康泪腺的细胞类型及其异质性	C57BL/6J小鼠的泪腺细胞	机器学习和单细胞组学	不适用	单细胞RNA测序	不适用	单细胞转录组数据	43,850个高质量细胞	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞RNA测序系统
54	2026-04-29	The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics 2024-10, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2024.08.005 PMID:39122180	研究论文	利用单细胞和空间转录组学探究年龄和功能障碍对睑板腺细胞群体动态变化的影响	首次通过单细胞和空间转录组学技术，揭示睑板腺细胞分化过程中脂质生成基因的分层表达模式，以及年龄相关腺体萎缩和免疫细胞浸润的新机制	未明确提及限制条件，可能包括小鼠模型与人类差异、样本量较小或功能验证不足	研究睑板腺功能障碍（MGD）的细胞分化、脂质合成及腺体萎缩机制	年轻（6月龄）和年老（22月龄）野生型C57Bl/6小鼠，以及年轻（3月龄）和年老（13月龄）Awat2敲除小鼠的睑板腺组织	数字病理学	干眼病（睑板腺功能障碍）	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据	涉及两种基因型（野生型和Awat2敲除）及不同年龄段（3-22月龄）的小鼠，具体样本数量未说明	Resolve Biosciences	单细胞RNA测序、空间转录组学	Resolve Biosciences Molecular Cartography panel	使用含100个睑板腺特异性基因的Molecular Cartography panel进行空间转录组分析
55	2026-04-28	Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye 2024-10, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2024.09.003 PMID:39306240	研究论文	评估干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响，重点关注单核吞噬细胞的变化	首次通过单细胞RNA测序揭示干眼症诱导结膜单核吞噬细胞中TLF+调节性巨噬细胞和CCR2+炎性细胞的差异化基因表达模式，并证实调节性巨噬细胞对抑制炎症和杯状细胞丢失的关键作用	主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证；调节性巨噬细胞耗竭实验依赖甘露糖化氯膦酸盐脂质体，可能存在非特异性效应	阐明干眼症条件下结膜免疫细胞的动态变化及调节性巨噬细胞的免疫抑制功能	C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞	数字病理学	干眼症	单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq	Monocle 3细胞轨迹模型	单细胞转录组数据、染色质开放性数据	非应激和干燥应激处理的C57BL/6小鼠	NA	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq	NA	对分选的结膜免疫细胞进行单细胞RNA测序和scATAC-seq分析
56	2026-04-28	Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space 2024-10, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-08087-4 PMID:39478210	研究论文	通过空间转录组学分析了来自6种癌症类型的131个肿瘤切片，结合单核RNA测序和CODEX数据，研究了肿瘤在二维和三维空间中的演化及其与微环境的相互作用	首次大规模结合Visium空间转录组学、单核RNA测序和CODEX多模态数据，定义了肿瘤微区域和空间亚克隆，并利用深度学习算法重建三维肿瘤结构，揭示了免疫热区和冷区的空间分布	样本量有限且仅涵盖6种癌症类型；三维重构基于连续切片可能引入对齐误差；深度学习算法依赖未监督学习，需进一步验证其生物学意义	研究肿瘤细胞与非癌细胞在二维和三维空间中的空间相互作用和演化机制	来自78例病例的131个肿瘤切片，涵盖6种癌症类型	数字病理学	多种癌症	空间转录组学, 单核RNA测序, CODEX多重免疫荧光	无监督深度学习	空间转录组数据, 单核RNA测序数据, CODEX多重成像数据	131个肿瘤切片（78例患者，6种癌症类型），48例匹配的单核RNA测序样本，22例匹配的CODEX样本	10x Genomics	空间转录组学, 单核RNA测序	10x Visium	Visium空间转录组学平台，结合10x单核RNA测序和CODEX多重免疫荧光技术
57	2026-04-25	Single-cell transcriptomics of rectal organoids from individuals with perianal fistulizing Crohn's disease reveals patient-specific signatures 2024-10-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-75947-4 PMID:39477985	研究论文	通过对肛周瘘管型克罗恩病患者直肠类器官进行单细胞转录组测序，揭示了患者特异性基因表达特征	首次利用单细胞转录组技术对直肠类器官进行分析，发现了与疾病、性别和祖源相关的基因表达特征，并确认类器官保留了干细胞和扩增区的疾病信号	类器官缺乏在病变粘膜上皮细胞中观察到的许多炎症信号，可能限制了其模拟炎症微环境的能力	探讨肛周瘘管型克罗恩病患者直肠上皮干细胞区室在转录水平上的病理决定因素	肛周瘘管型克罗恩病患者和健康对照的直肠类器官与粘膜上皮细胞	单细胞转录组学	克罗恩病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	13例患者（8例CD、5例对照）提供77,044个类器官细胞；29例患者（18例CD、11例对照）提供141,367个粘膜上皮细胞	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞3'测序平台
58	2026-04-25	Characterization of cell states in biliary tract cancers identifies mechanisms of therapeutic resistance in a phase II trial of DKN-01/nivolumab 2024-Oct-08, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.10.08.24315092 PMID:39417106	临床试验/研究论文	通过单细胞RNA测序分析胆道癌患者在接受DKN-01联合纳武利尤单抗治疗前后的细胞状态，揭示治疗耐药机制	首次系统分类胆道癌恶性细胞状态（包括此前未描述的神经样和内皮样状态），并阐明联合免疫治疗的耐药机制	单臂II期试验未观察到客观缓解，样本量有限，需进一步验证细胞状态分类的普适性	探索胆道癌对DKN-01/纳武利尤单抗联合治疗的耐药机制	晚期胆道癌患者配对的治疗前和治疗中活检样本	数字病理学	胆道癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	晚期胆道癌患者（具体数量未在摘要中提及）	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
59	2026-04-25	A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis 2024-Oct-01, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3257 PMID:39350665	研究论文	通过初免-加强疫苗接种策略诱导源自中央记忆T细胞的肺部常驻记忆CD8+ T细胞，从而预防肿瘤肺转移	发现通过肌肉注射DNA疫苗初免后鼻腔喷注减毒流感病毒载体疫苗加强的免疫策略，能高效诱导肺部CD8+常驻记忆T细胞，并证实这些细胞来源于DNA疫苗诱导的中央记忆T细胞，且通过单细胞RNA测序揭示了其转录组重编程过程	未提及具体限制	探究疫苗诱导的肺部常驻记忆T细胞的来源及其在预防肿瘤肺转移中的作用	小鼠模型中的中央记忆T细胞、肺部常驻记忆T细胞及转移性黑色素瘤和间皮瘤	免疫学	黑色素瘤、间皮瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠样本，具体数量未提及	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞RNA测序平台
60	2026-04-20	Single-cell transcriptome analysis reveals the regulatory functions of islet exocrine cells after short-time obesogenic diet 2024-10, Endocrine IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s12020-024-03883-4 PMID:38806892	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，探讨了高脂饮食诱导的肥胖早期阶段胰岛外分泌细胞亚型的调控功能及其在胰岛素抵抗发展中的作用	首次在肥胖早期阶段利用单细胞RNA测序数据，系统分析了胰岛外分泌细胞亚型的差异功能和细胞间相互作用变化，特别是导管细胞在胰岛素抵抗中的潜在调控机制	研究基于已发表的单细胞RNA测序数据集，缺乏实验验证；样本量可能有限，且仅关注短期高脂饮食干预，长期效应未知	研究高脂饮食诱导的肥胖早期阶段胰岛外分泌细胞亚型的功能及其在胰岛素抵抗发展中的调控作用	高脂饮食和低脂饮食喂养的小鼠胰岛细胞	单细胞转录组学	肥胖与胰岛素抵抗	单细胞RNA测序	生物信息学分析工具（如findMarkers、Cellchat、KEGG、GO）	单细胞RNA测序数据	未明确指定样本数量，但基于已发表数据集，涉及高脂饮食和低脂饮食组的小鼠胰岛细胞	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA