单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 541 | 2024-09-28 |
The miR-203/ZBTB20/MAFA Axis Orchestrates Pancreatic β-Cell Maturation and Identity During Weaning and Diabetes
2024-Oct-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0604
PMID:39058664
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研究论文 | 研究报告了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在断奶和糖尿病期间调控胰腺β细胞成熟和身份的机制 | 揭示了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在营养过渡期间调控β细胞成熟的新机制，并提出了一种通过操纵该轴来增加功能性β细胞数量以缓解糖尿病的新策略 | NA | 探讨营养过渡与β细胞成熟之间的分子机制 | 胰腺β细胞的成熟过程 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 542 | 2024-09-28 |
Interactions between fibroblasts and monocyte-derived cells in chronic lung injuries induced by real-ambient particulate matter exposure
2024-Oct, Mutation research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis
DOI:10.1016/j.mrgentox.2024.503807
PMID:39326935
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研究论文 | 研究长期暴露于细颗粒物（PM）引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的相互作用 | 揭示了特定成纤维细胞和单核细胞来源细胞亚群在长期PM暴露下的显著增加及其促炎和促纤维化功能 | 仅在C57BL/6 J雄性小鼠中进行了实验，结果的普适性有待验证 | 探讨长期暴露于细颗粒物（PM）引起的慢性肺损伤中成纤维细胞和单核细胞来源细胞的多样性和功能 | 成纤维细胞、髓源抑制细胞（MDSCs）和间质巨噬细胞（IMs） | NA | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 16周暴露于石家庄市真实环境PM的C57BL/6 J雄性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 543 | 2024-09-27 |
Practical Compass of Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-Oct, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00840-4
PMID:38019344
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综述 | 本文提供了从处理fastq数据集到绘制图表和绘制轨迹的基本过程的逐步指导 | 本文介绍了用户友好的scRNA-seq包，用于配体-受体相互作用和轨迹分析 | 更新最新信息对许多研究人员来说很困难 | 提供单细胞RNA-seq数据分析的实用指南 | 单细胞RNA-seq数据分析的基本过程和工具 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 544 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid: Insights into pathogenesis and therapy on bullous formation
2024-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19924
PMID:38433529
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 545 | 2024-09-26 |
Deciphering cuproptosis-related signatures in pediatric allergic asthma using integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq analysis
2024-Oct, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2024.2349596
PMID:38687912
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，揭示了儿童过敏性哮喘中铜死亡相关基因的特征 | 首次通过机器学习模型筛选出五个重要变量，用于预测儿童过敏性哮喘 | 研究样本量较小，需要进一步验证模型的泛化能力 | 探讨铜失衡是否会导致儿童过敏性哮喘中的铜死亡现象 | 儿童过敏性哮喘患者的铜死亡相关基因和免疫细胞浸润情况 | 生物信息学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | 涉及两个数据集（GSE40732和GSE40888）和单细胞RNA测序数据（GSE193816） | NA | NA | NA | NA |
| 546 | 2024-09-25 |
Single-cell RNA sequencing analysis provides novel insights into the role of apoptosis-related genes in muscle aging
2024-10, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2024.105499
PMID:38852373
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了细胞凋亡相关基因在肌肉衰老中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术识别了22个与肌肉衰老相关的凋亡相关基因，并评估了它们的诊断价值 | 本研究仅基于GSE143704数据集，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探讨细胞凋亡相关基因在肌肉衰老中的作用及其潜在的诊断价值 | 肌肉衰老患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肌肉衰老患者和年轻对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 547 | 2024-09-25 |
Mechanisms of radiation-induced tissue damage and response
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.725
PMID:39309694
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综述 | 本文综述了辐射诱导组织损伤（RITI）的分子机制，并探讨了单细胞测序（Sc-seq）在揭示RITI分子机制和识别潜在预防靶点中的应用 | 利用单细胞测序技术深入解析了RITI的分子机制，并提出了基于Sc-seq的个性化治疗策略 | NA | 揭示辐射诱导组织损伤的分子机制，并探讨相应的预防和治疗策略 | 辐射诱导组织损伤及其分子机制 | NA | NA | 单细胞测序（Sc-seq） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2024-09-23 |
Spatiotemporal single-cell RNA sequencing reveals the role of steroid hormone pathway during chicken primordial follicle formation
2024-Oct, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104090
PMID:39096826
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研究论文 | 研究通过时空单细胞RNA测序揭示了鸡原始卵泡形成过程中类固醇激素通路的作用 | 首次通过单细胞mRNA测序和空间转录组分析探索了鸡原始卵泡形成过程中的卵巢微环境和调控通路 | 研究仅限于鸡的卵巢组织，未涉及其他物种 | 揭示鸡原始卵泡形成过程中的分子调控机制 | 鸡的卵巢组织和原始卵泡形成过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 收集了2天、5.5天和10.5天孵化的鸡的左侧卵巢组织 | NA | NA | NA | NA |
| 549 | 2024-08-07 |
B-cell repertoire and functions in idiopathic nephrotic syndrome: what to learn from single-cell RNA sequencing?
2024-Oct, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.05.032
PMID:38977075
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 550 | 2024-09-19 |
A novel study on CXXC5: unraveling its regulatory mechanisms in hematopoietic stem cell biology through proteomics and gene editing
2024-Oct, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01540-8
PMID:39150611
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研究论文 | 本研究探讨了CXXC5在造血干细胞自我更新和分化中的调控机制 | 通过单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑和蛋白质组学分析，揭示了CXXC5在造血干细胞生物学中的重要作用 | NA | 研究CXXC5在造血干细胞自我更新和分化中的调控机制 | 造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9、蛋白质组学分析 | NA | RNA、蛋白质 | 从骨髓样本中分离的造血干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 551 | 2024-09-19 |
The interaction of innate immune and adaptive immune system
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.714
PMID:39286776
|
综述 | 本文详细剖析了先天免疫系统和适应性免疫系统的组成和功能，强调了它们在生理和病理环境中的协同作用 | 揭示了先天免疫和适应性免疫之间更复杂的相互作用，并提供了新的见解 | NA | 增强对先天免疫和适应性免疫复杂相互作用的理解，并提供新的视角 | 先天免疫系统和适应性免疫系统的相互作用 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 552 | 2024-09-15 |
Biomarker discovery in hepatocellular carcinoma (HCC) for personalized treatment and enhanced prognosis
2024-Oct, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2024.08.006
PMID:39191624
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研究论文 | 本文探讨了肝细胞癌（HCC）中生物标志物的发现及其在个性化治疗和预后改善中的应用 | 本文介绍了下一代测序（NGS）、质谱分析和液体活检等先进技术在HCC分子景观研究中的应用，并强调了免疫标志物如PD-L1表达和肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）在指导免疫治疗中的作用 | 本文指出生物标志物验证、标准化、临床实践整合和成本相关障碍等挑战 | 本文旨在通过发现生物标志物来解决HCC诊断和治疗中的挑战，以实现早期检测、精确诊断和个性化治疗 | 本文主要研究肝细胞癌（HCC）及其相关生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 下一代测序（NGS）、质谱分析、液体活检 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2024-09-14 |
S100A9-TLR4 axis aggravates dry eye through the blockage of autophagy
2024-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110052
PMID:39151778
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研究论文 | 研究探讨了S100A9上调如何通过阻断自噬加剧干眼症的发病机制，并评估了S100A9作为干眼症治疗靶点的潜力 | 首次揭示了S100A9-TLR4-自噬阻断途径在干眼症发病机制中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨S100A9在干眼症发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 干眼症及其相关生物标志物 | NA | 干眼症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠干眼症模型 | NA | NA | NA | NA |
| 554 | 2024-09-14 |
Single-cell transcriptome landscape of the kidney reveals potential innate immune regulation mechanisms in hybrid yellow catfish after Aeromonas hydrophila infection
2024-Oct, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109866
PMID:39214264
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了感染嗜水气单胞菌后杂交黄颡鱼肾脏的转录组图谱，揭示了潜在的先天免疫调节机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了杂交黄颡鱼肾脏在感染嗜水气单胞菌后的细胞组成和免疫调节机制 | 研究仅限于杂交黄颡鱼肾脏的单细胞RNA测序分析，未涉及其他器官或物种 | 探讨杂交黄颡鱼肾脏在感染嗜水气单胞菌后的先天免疫调节机制 | 杂交黄颡鱼肾脏细胞及其在感染嗜水气单胞菌后的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 杂交黄颡鱼肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 555 | 2024-09-13 |
STPDA: Leveraging spatial-temporal patterns for downstream analysis in spatial transcriptomic data
2024-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为STPDA的计算框架，用于空间转录组数据中的时空模式分析 | STPDA通过整合时空模式，提供了一种新的空间转录组数据分析方法，超越了现有的最先进方法 | NA | 开发一种新的计算框架，以更深入地理解空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组数据中的时空基因表达模式 | 数字病理学 | NA | NA | LSTM | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 556 | 2024-09-13 |
Single-cell transcriptome sequencing revealed the metabolic changes and microenvironment changes of cardiomyocytes induced by diabetes
2024-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了糖尿病诱导的心肌细胞代谢变化和微环境变化 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了糖尿病对心肌细胞异质性和细胞间通讯的影响 | 研究仅基于小鼠模型，结果的临床相关性有待进一步验证 | 分析糖尿病对心肌细胞异质性和细胞间通讯的影响 | 糖尿病诱导的心肌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 557 | 2024-09-11 |
6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells
2024-Oct-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217177
PMID:39179096
|
研究论文 | 研究探讨了6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶（PGD）在肺腺癌（LUAD）细胞中的作用及其机制 | 首次揭示了IQGAP1是PGD的新型相互作用蛋白，并阐明了PGD通过竞争性结合IQGAP1的IQ域来降低p-AMPK水平，从而促进糖酵解和脂肪酸合成的机制 | NA | 探讨PGD在肺腺癌中的功能及其分子机制 | 肺腺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、免疫沉淀-质谱（IP-MS） | NA | 组织微阵列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 558 | 2024-09-11 |
XgCPred: Cell type classification using XGBoost-CNN integration and exploiting gene expression imaging in single-cell RNAseq data
2024-Oct, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109066
PMID:39180857
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研究论文 | 本文介绍了一种名为XgCPred的新方法，结合XGBoost和卷积神经网络（CNN）进行单细胞RNA测序数据的细胞类型分类 | XgCPred通过结合XGBoost和CNN，利用基因表达图像的层次结构，提高了细胞类型分类的准确性 | NA | 开发一种高效且准确的细胞类型分类方法，以应对单细胞RNA测序数据中的复杂性和多样性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | XGBoost和CNN | 基因表达图像 | 多个单细胞RNA测序数据集，每个数据集具有不同的细胞数量、基因表达多样性和细胞异质性 | NA | NA | NA | NA |
| 559 | 2024-09-11 |
Up-regulated DSG2 promotes tumor growth and reduces immune infiltration in cervical cancer
2024-Oct, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2024.155554
PMID:39226803
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研究论文 | 本文探讨了DSG2在宫颈癌中的功能机制及其对肿瘤生长和免疫浸润的影响 | 首次全面探索DSG2在宫颈癌中的功能机制，发现其上调与不良预后和免疫细胞浸润减少相关 | 实验主要在体外进行，缺乏体内实验验证 | 探究DSG2在宫颈癌中的功能机制及其对肿瘤生长和免疫浸润的影响 | DSG2在宫颈癌中的表达、预后、基因突变及潜在信号通路 | NA | 宫颈癌 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 收集的宫颈癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 560 | 2024-09-09 |
Enhanced cytokine signaling and ferroptosis defense interplay initiates obesity-associated pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Oct-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217162
PMID:39127339
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研究论文 | 研究揭示了肥胖与胰腺导管腺癌之间的机制联系，发现肥胖患者的血清改变了胰腺导管上皮细胞的炎症细胞因子信号和铁死亡防御机制 | 首次发现肥胖患者的血清通过增强白细胞介素34表达和铁死亡防御之间的相互作用，促进了胰腺导管腺癌的发生 | 研究主要基于细胞培养和小鼠模型，需要进一步的人体临床验证 | 探讨肥胖与胰腺导管腺癌之间的分子机制 | 胰腺导管上皮细胞、肥胖患者血清、小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及不同代谢状态的人类血清样本和肥胖小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |