单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-10-05 |
Application of a single-cell-RNA-based biological-inspired graph neural network in diagnosis of primary liver tumors
2024-Oct-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05670-1
PMID:39354613
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的生物启发图神经网络框架，用于原发性肝肿瘤的分子诊断 | 该框架利用细胞间通信网络的生物合理性，通过整合细胞簇内的通路激活特征和建模单向细胞间通信，实现了对恶性肿瘤和良性肿瘤的稳健区分 | NA | 开发一种新的诊断方法，利用单细胞RNA测序数据进行原发性肝肿瘤的分子诊断 | 原发性肝肿瘤，包括肝细胞癌（HCC）、肝内胆管癌（iCCA）和局灶性结节性增生（FNH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 522 | 2024-10-05 |
Novel FABP4+C1q+ macrophages enhance antitumor immunity and associated with response to neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in NSCLC via AMPK/JAK/STAT axis
2024-Oct-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07074-x
PMID:39353883
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研究论文 | 研究了新型FABP4+C1q+巨噬细胞在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中增强抗肿瘤免疫的作用及其与新辅助派姆单抗和化疗（NAPC）疗效的关系 | 发现了与新辅助化疗免疫疗法疗效相关的新型FABP4C1q巨噬细胞亚型，并揭示了其通过AMPK/JAK/STAT轴增强抗炎和吞噬能力的机制 | NA | 探讨新辅助派姆单抗和化疗在非小细胞肺癌中的疗效机制及预测标志物 | 非小细胞肺癌患者及其肿瘤组织和淋巴结中的巨噬细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 523 | 2024-10-05 |
SAE-Impute: imputation for single-cell data via subspace regression and auto-encoders
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05944-x
PMID:39354334
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAE-Impute的新计算方法，通过结合子空间回归和自动编码器来提高单细胞数据插补的准确性和可靠性 | SAE-Impute通过子空间回归评估样本相关性，并在自动编码器框架内利用这些预测进行插值，从而解决了现有方法忽略样本间相关性的问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高数据分析的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 524 | 2024-10-05 |
ScRNAbox: empowering single-cell RNA sequencing on high performance computing systems
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05935-y
PMID:39354372
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研究论文 | 介绍了一种名为scRNAbox的创新性单细胞RNA测序分析管道，专为高性能计算系统设计 | scRNAbox是一个端到端的解决方案，通过SLURM工作负载管理器高效处理标准和Hashtag样本的原始数据，并集成了质量控制过滤、样本整合、聚类、聚类注释工具以及细胞类型特异性差异基因表达分析 | NA | 开发一个用户友好且适用于高性能计算系统的单细胞RNA测序数据处理和分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-10-05 |
Comprehensive analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics revealed IER3 for predicting malignant progression and immunotherapy efficacy in glioma
2024-Oct-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03511-1
PMID:39354533
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了IER3在预测胶质瘤恶性进展和免疫治疗效果中的作用 | 首次全面分析了IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | NA | 探讨IER3在胶质瘤病理中的作用及其作为生物标志物的潜力 | IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 免疫组化、免疫荧光、Cox回归分析、Kaplan-Meier曲线 | NA | RNA测序数据 | 公开的胶质瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 526 | 2024-10-04 |
Novel Long Noncoding RNA HEAT4 Affects Monocyte Subtypes, Reducing Inflammation and Promoting Vascular Healing
2024-Oct, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 研究了新型长非编码RNA HEAT4在单核细胞亚型中的作用，减少炎症并促进血管愈合 | 发现了人类特异性的长非编码RNA HEAT4，其在心血管免疫学中的作用机制，包括在单核细胞亚型转换中的作用 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步在人体中验证其效果 | 探讨长非编码RNA在心血管疾病中的免疫调节作用 | 长非编码RNA HEAT4及其在单核细胞亚型转换中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | RNA | 包括心力衰竭、急性心肌梗死和心源性休克患者的血液样本，以及NOD.CB17-Prkdc scid/Rj小鼠的血管损伤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2024-10-04 |
Effector MoSDT1 enhances Magnaporthe oryzae virulence and plays a dual role in regulating rice defense
2024-Oct-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae364
PMID:39046202
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研究论文 | 研究了C2H2锌效应子MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重作用 | 首次揭示了MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重调节作用，并通过RNA-seq、scRNA-seq和ChIP-seq技术深入分析了其调控机制 | 研究主要集中在MoSDT1的过表达和敲除菌株上，未涉及其在自然环境中的表现 | 探讨MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的作用机制 | 稻瘟病菌MoSDT1效应子和水稻防御反应 | NA | NA | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 包括MoSDT1过表达菌株和两个敲除菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 528 | 2024-10-04 |
The temporal protein signature analyses of developing human deciduous molar tooth germ
2024-Oct, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202300396
PMID:38522031
|
研究论文 | 研究分析了人类乳牙牙胚在胚胎阶段的时间依赖性蛋白质组变化 | 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术，揭示了713种差异表达蛋白及其在牙发育中的五种时间表达模式，并筛选出24种潜在的牙发育驱动蛋白 | NA | 探讨人类乳牙牙胚发育过程中的蛋白质表达变化及其潜在机制 | 人类乳牙牙胚在胚胎阶段的蛋白质表达 | 发育生物学 | NA | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 胚胎阶段的人类乳牙牙胚样本 | NA | NA | NA | NA |
| 529 | 2024-10-04 |
Characterization of regeneration initiating cells during Xenopus laevis tail regeneration
2024-Oct-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03396-3
PMID:39350302
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研究论文 | 本文研究了非洲爪蟾尾巴再生过程中再生启动细胞的特征 | 发现了再生启动细胞（RICs），这是一种新发现的短暂细胞状态，参与再生过程的启动 | 主要基于受伤后1天的实验评估 | 揭示再生启动的关键步骤及其在受伤后数小时内发生的现象 | 非洲爪蟾尾巴再生过程中的再生启动细胞 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 530 | 2024-10-04 |
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-Oct-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3257
PMID:39350665
|
研究论文 | 本文研究了一种主要增强疫苗接种方法，通过肌肉注射DNA疫苗和鼻内接种减毒流感疫苗，诱导肺部记忆CD8+ T细胞，从而预防肿瘤肺转移 | 首次发现中心记忆T细胞是疫苗诱导的肺部记忆T细胞的前体，并揭示了鼻内接种减毒流感疫苗通过改变黏膜微环境促进中心记忆T细胞向肺部记忆T细胞分化的机制 | NA | 研究疫苗接种方法对肺部记忆T细胞的诱导及其在预防肿瘤肺转移中的作用 | 肺部记忆CD8+ T细胞及其前体中心记忆T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2024-10-02 |
Gene Regulatory Network Analysis of Decidual Stromal Cells and Natural Killer Cells
2024-Oct, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01653-1
PMID:39090334
|
研究论文 | 本文分析了蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞的基因调控网络，揭示了这些细胞在妊娠早期分化过程中的关键转录因子 | 首次对蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞亚群进行了基因调控网络分析，并发现了新的蜕膜化驱动转录因子 | 研究基于第一孕期终止妊娠的单细胞转录组数据，可能无法完全代表正常妊娠过程 | 探讨蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞在妊娠早期的分化机制及其与妊娠障碍的关系 | 蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞 | NA | 妊娠障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 第一孕期终止妊娠的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2024-10-02 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the regulatory functions of islet exocrine cells after short-time obesogenic diet
2024-Oct, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-024-03883-4
PMID:38806892
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了高脂饮食诱导的早期肥胖中胰岛外分泌细胞亚型的调控功能 | 首次揭示了高脂饮食诱导的早期肥胖中胰岛外分泌细胞亚型的功能变化及其对胰岛素抵抗的影响 | 研究仅基于已发表的单细胞RNA测序数据，缺乏实验验证 | 探讨高脂饮食诱导的早期肥胖中胰岛外分泌细胞亚型的功能及其调控机制 | 高脂饮食诱导的早期肥胖中的胰岛外分泌细胞亚型 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26个细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 533 | 2024-10-02 |
Potential different immune phenotypes of macrophages in oral lichen planus by integrating immunofluorescence double staining and single-cell RNA sequencing
2024-Oct, Journal of dental sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.jds.2024.03.002
PMID:39347036
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研究论文 | 本研究通过免疫荧光双染色和单细胞RNA测序技术，探讨了口腔扁平苔藓中巨噬细胞的不同免疫表型及其基因特征 | 结合免疫荧光双染色和单细胞RNA测序技术，首次全面揭示了口腔扁平苔藓中巨噬细胞的基因特征及其在炎症微环境中的作用 | 样本量较小，可能影响结果的普适性 | 研究口腔扁平苔藓中巨噬细胞的表型及其基因特征 | 口腔扁平苔藓中的巨噬细胞 | NA | 口腔扁平苔藓 | 免疫荧光双染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11例口腔扁平苔藓组织样本和5例健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-10-01 |
Ependymal cells undergo astrocyte-like reactivity in response to neuroinflammation
2024-Oct, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.16120
PMID:38702968
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，比较了在自身免疫介导的神经炎症模型中，反应性室管膜细胞和星形胶质细胞的转录组特征 | 揭示了在多种神经炎症背景下，室管膜细胞和星形胶质细胞反应性状态的保守基因特征 | 尚未探索驱动室管膜细胞反应性的机制及其下游功能后果 | 研究室管膜细胞在神经炎症中的反应性状态及其与星形胶质细胞反应性的相似性 | 室管膜细胞和星形胶质细胞在神经炎症中的反应性转录组特征 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 535 | 2024-09-30 |
KNSTRN Is a Prognostic Biomarker That Is Correlated with Immune Infiltration in Breast Cancer and Promotes Cell Cycle and Proliferation
2024-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10615-2
PMID:38198023
|
研究论文 | 本研究分析了KNSTRN在乳腺癌中的表达、预后、与免疫浸润的相关性及其调控细胞周期的作用 | 首次揭示了KNSTRN在乳腺癌中的生物学功能及其作为预后标志物的潜力 | 主要依赖于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨KNSTRN在乳腺癌中的表达及其生物学功能 | KNSTRN在乳腺癌中的表达、预后、免疫浸润相关性及细胞周期调控 | NA | 乳腺癌 | 基因集富集分析、单细胞转录组数据分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas、Gene Expression Omnibus、TIMER和The Human Protein Atlas数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 536 | 2024-09-30 |
Integrated multi-omics analyses reveal the pro-inflammatory and pro-fibrotic pulmonary macrophage subcluster in silicosis
2024-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116899
PMID:39181076
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了硅肺病中促进炎症和纤维化的肺巨噬细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了硅肺病中Mmp12hi巨噬细胞亚群的异质性和空间定位 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨硅肺病中肺巨噬细胞的表型和功能异质性 | 硅肺病小鼠模型中的肺巨噬细胞 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、定量聚合酶链反应 | NA | RNA | 硅肺病小鼠模型和患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2024-09-30 |
Single-cell RNA sequencing of estrual mice reveals PM2.5-induced uterine cell heterogeneity and reproductive toxicity
2024-Oct-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116968
PMID:39236655
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了PM2.5暴露对小鼠子宫细胞群和基因表达的影响 | 首次揭示了PM2.5暴露导致子宫细胞异质性和生殖毒性的细胞机制，特别是NK细胞中IL-17信号通路的抑制 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨PM2.5暴露对小鼠子宫细胞群和基因表达的影响及其生殖毒性的机制 | 小鼠子宫细胞群和基因表达 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2024-09-30 |
Natural hydrogen gas and engineered microalgae prevent acute lung injury in sepsis
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101247
PMID:39328786
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研究论文 | 研究探讨了天然氢气和工程微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 提出了DQB@C作为一种新型生物纳米系统，具有治疗脓毒症相关急性肺损伤的巨大潜力 | NA | 整合氢气和生物纳米微藻，扩展脓毒症的治疗选择 | 研究氢气和微藻在预防脓毒症引起的急性肺损伤中的作用 | 生物医学工程 | 脓毒症 | 磷酸蛋白质组学、代谢组学和蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组学数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2024-09-28 |
[Advances in the application of single-cell sequencing technology in the study of neonatal necrotizing enterocolitis]
2024-Oct-02, Zhonghua er ke za zhi = Chinese journal of pediatrics
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-09-28 |
Machine Learning Developed a MYC Expression Feature-Based Signature for Predicting Prognosis and Chemoresistance in Pancreatic Adenocarcinoma
2024-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10625-0
PMID:38245886
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研究论文 | 本研究开发了一种基于MYC表达特征的签名，用于预测胰腺腺癌的预后和化疗耐药性 | 首次在胰腺腺癌中建立了基于MYC表达特征的风险模型，并发现了与MYC表达和患者生存密切相关的七个基因 | 研究主要基于TCGA和其他数据库的数据，缺乏临床验证 | 开发一种新的生物标志物，用于预测胰腺腺癌患者的预后和化疗耐药性 | 胰腺腺癌患者的基因表达数据和临床信息 | 数字病理 | 胰腺癌 | LASSO回归分析 | 风险模型 | 基因表达数据 | 训练集包括TCGA数据库的胰腺腺癌患者数据，验证集包括GSE57495、GSE62452和ICGC-PACA数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |