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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 521 | 2024-10-07 |
Multi-scale transcriptomics reveals that specific tumor cells promote lung adenocarcinoma metastasis through crosstalk with the microenvironment
2024-Oct-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01306-4
PMID:39363121
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序、空间RNA测序和批量RNA测序，揭示了特定肿瘤细胞通过与微环境的相互作用促进肺腺癌转移的机制 | 建立了肺腺癌转移风险评分模型（LMRS），并识别出42个转移驱动基因和两种肿瘤上皮细胞亚型 | NA | 揭示肺腺癌转移的机制 | 肺腺癌的转移驱动基因、细胞间相互作用和细胞与配体-受体对的共定位关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间RNA测序（stRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 522 | 2024-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals immune microenvironment changes and insights into the transition from DCIS to IDC with associated prognostic genes
2024-Oct-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05706-6
PMID:39363164
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了从导管原位癌（DCIS）到浸润性导管癌（IDC）的免疫微环境变化，并发现了与预后相关的关键基因 | 本文首次通过单细胞转录组分析揭示了DCIS到IDC转变过程中免疫细胞的动态变化，并识别出五个可能作为乳腺癌预后标志物的关键基因 | 本文主要基于单细胞转录组数据进行分析，未涉及其他类型的数据或实验验证 | 研究DCIS向IDC转变的生物学机制，并寻找潜在的预后标志物 | 乳腺癌中的导管原位癌（DCIS）和浸润性导管癌（IDC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及DCIS和IDC的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 523 | 2024-10-07 |
Identification and evaluation of candidate COVID-19 critical genes and medicinal drugs related to plasma cells
2024-Oct-03, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-024-10000-3
PMID:39363208
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研究论文 | 本研究利用DESeq2和xCell算法分析COVID-19患者与对照组的差异表达基因和免疫浸润情况，识别与COVID-19相关的浆细胞模块基因，并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，识别关键基因和潜在药物 | 首次系统探索了浆细胞在COVID-19中的作用，识别了关键基因和潜在治疗药物 | NA | 探索COVID-19中浆细胞的作用，识别关键基因和潜在治疗药物 | COVID-19患者和对照组的差异表达基因、免疫浸润情况、关键基因和潜在药物 | 生物信息学 | COVID-19 | DESeq2, xCell, WGCNA, 单细胞RNA测序, Cytoscape, cMAP, AutoDock | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 使用GSE157103、GSE152641、GSE171524、GSE152418和GSE179627数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 524 | 2024-10-07 |
Tracking changes in functionality and morphology of repopulated microglia in young and old mice
2024-Oct-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03242-0
PMID:39363245
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研究论文 | 研究了年轻和老年小鼠中再生的微胶质细胞的功能和形态变化 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光和共聚焦成像技术，研究了再生的微胶质细胞的功能和形态变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨再生的微胶质细胞在年轻和老年小鼠中的功能和形态变化 | 年轻和老年小鼠的微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫荧光、共聚焦成像 | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的微胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-10-07 |
A combined analysis of bulk RNA-seq and scRNA-seq was performed to investigate the molecular mechanisms associated with the occurrence of myocardial infarction
2024-Oct-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10813-1
PMID:39363266
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，探讨了心肌梗死（MI）相关的分子机制 | 本研究首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，揭示了心肌梗死中细胞类型的转录变化，特别是内皮细胞的减少和巨噬细胞的增加 | 本研究仅使用了公开的RNA-seq数据，未进行实验验证，可能影响结果的可靠性 | 探讨心肌梗死相关的分子机制 | 心肌梗死模型中的心脏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用了来自小鼠心肌梗死模型的公开scRNA-seq（GSE136088）和bulk RNA-seq（GSE153485）数据 | NA | NA | NA | NA |
| 526 | 2024-10-07 |
Yeast9: a consensus genome-scale metabolic model for S. cerevisiae curated by the community
2024-Oct, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00060-7
PMID:39134886
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研究论文 | 本文介绍了由社区维护的S. cerevisiae的共识基因组规模代谢模型Yeast9，并评估了其在不同条件下的预测性能 | Yeast9是基于社区持续更新和改进的代谢模型，结合了单细胞转录组学和蛋白质组学数据，能够更好地预测酵母在不同条件下的代谢重构 | NA | 评估和展示Yeast9在不同条件下的预测性能，并探讨其在系统生物学研究中的应用潜力 | S. cerevisiae的基因组规模代谢模型Yeast9及其在不同条件下的代谢行为 | 代谢组学 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 代谢模型 | 163个条件特定的GEMs，1229个突变株的ssGEMs | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2024-10-06 |
CALB2 drives pancreatic cancer metastasis through inflammatory reprogramming of the tumor microenvironment
2024-Oct-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03201-w
PMID:39358777
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研究论文 | 研究探讨了CALB2在胰腺癌转移中的作用及其通过炎症重编程肿瘤微环境的机制 | 首次揭示了CALB2作为炎症重编程的关键调节因子，促进胰腺癌转移的机制，并提出了αCXCL14单克隆抗体与吉西他滨联合治疗的新策略 | NA | 探讨CALB2在胰腺癌转移中的作用及其通过炎症重编程肿瘤微环境的机制，并开发针对性的治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其相关成纤维细胞（CAFs）和患者来源的类器官（PDOs） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多色免疫荧光、CUT&RUN测定、荧光素酶报告基因测定、RNA测序、功能获得或丧失测定 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类PDAC样本、CAFs和PDOs的体外和体内共培养系统，以及免疫活性KPC类器官异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 528 | 2024-10-06 |
Exploring the prognostic value of BRMS1 + microglia based on single-cell anoikis regulator patterns in the immunologic microenvironment of GBM
2024-Oct, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04781-5
PMID:39143438
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和非负矩阵分解技术，探讨了胶质母细胞瘤（GBM）中BRMS1+小胶质细胞在免疫微环境中的预后价值 | 首次揭示了BRMS1+小胶质细胞在GBM免疫微环境中的重要作用，并提出其可能成为未来治疗的潜在靶点 | NA | 探讨BRMS1+小胶质细胞在GBM免疫微环境中的预后价值及其对免疫治疗的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）中的BRMS1+小胶质细胞及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组RNA测序（stRNA-seq）、非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA和CGGA数据集，具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 529 | 2024-10-06 |
Iron-laden macrophage-mediated paracrine profibrotic signaling induces lung fibroblast activation
2024-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00675.2023
PMID:39183565
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研究论文 | 研究探讨了铁在肺纤维化中的作用，特别是巨噬细胞介导的机制 | 揭示了铁在巨噬细胞中积累引发脂质过氧化，从而放大TGF-β1产生，并通过旁分泌信号激活成纤维细胞的新机制 | NA | 研究铁代谢在肺纤维化中的作用及其机制 | 肺纤维化中的巨噬细胞和成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠模型，包括博来霉素和胺碘酮诱导的肺纤维化模型 | NA | NA | NA | NA |
| 530 | 2024-10-05 |
Advanced machine learning unveils CD8 + T cell genetic markers enhancing prognosis and immunotherapy efficacy in breast cancer
2024-Oct-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12952-w
PMID:39354417
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法，识别出与乳腺癌预后和免疫治疗效果相关的CD8+ T细胞基因标记 | 开发了一种新的CD8+ T细胞相关基因预后签名（CTRGPS），并验证了其在多个独立数据集中的预后价值 | NA | 探索CD8+ T细胞在乳腺癌中的作用，识别新的生物标志物以改善预后和治疗策略 | CD8+ T细胞基因标记及其在乳腺癌中的预后和治疗效果 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因数据 | 涉及七个独立公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2024-10-05 |
Exploring the potential mechanism of Radix Bupleuri in the treatment of sepsis: a study based on network pharmacology and molecular docking
2024-Oct-01, BMC complementary medicine and therapies
IF:3.3Q1
DOI:10.1186/s12906-024-04637-5
PMID:39354431
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研究论文 | 本研究利用网络药理学和分子对接技术探讨柴胡治疗脓毒症的潜在机制 | 首次结合网络药理学和RNA-seq技术，系统分析了柴胡在脓毒症治疗中的活性成分和潜在靶点，并通过分子对接和分子动力学模拟验证了关键靶点的结合能力 | 样本量较小，且仅基于公共数据库的数据进行分析，缺乏临床试验验证 | 探讨柴胡治疗脓毒症的潜在机制 | 柴胡的活性成分及其在脓毒症治疗中的潜在靶点 | 网络药理学 | 脓毒症 | RNA-seq | 分子对接 | 基因表达数据 | 23名脓毒症患者和10名健康参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2024-10-05 |
Superior antitumor immune response achieved with proton over photon immunoradiotherapy is amplified by the nanoradioenhancer NBTXR3
2024-Oct-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02855-0
PMID:39354474
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研究论文 | 比较了光子放疗（XRT）和质子放疗（PRT）结合免疫检查点阻断（αPD1）在免疫放疗（IRT）中的疗效，并评估了纳米颗粒放射增敏剂NBTXR3的影响 | 发现质子放疗结合NBTXR3在治疗αPD1耐药肺癌中表现出优于光子放疗的效果，并能增强记忆性抗肿瘤免疫反应 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在临床试验中验证 | 探讨质子放疗与光子放疗在免疫放疗中的相对疗效，并评估NBTXR3的增效作用 | αPD1耐药的肺癌（344SQR）小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 涉及多个小鼠模型和三种不同的肺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 533 | 2024-10-05 |
Expression, DNA methylation pattern and transcription factor EPB41L3 in gastric cancer: a study of 262 cases
2024-Oct-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01849-7
PMID:39354571
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研究论文 | 研究胃癌中EPB41L3基因的表达、DNA甲基化模式及转录因子调控 | 揭示了EPB41L3基因非CpG甲基化与胃癌进展的关联，并识别了关键的转录因子和下游分子 | NA | 阐明EPB41L3在胃癌中的表达和甲基化，识别调控转录因子及受影响的下游通路 | 胃癌组织中的EPB41L3基因及其甲基化模式 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组化、高吞吐量亚硫酸氢盐测序、染色质免疫沉淀-定量PCR、荧光素酶报告基因检测、RNA测序 | NA | 组织样本 | 262例胃癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-10-05 |
Application of a single-cell-RNA-based biological-inspired graph neural network in diagnosis of primary liver tumors
2024-Oct-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05670-1
PMID:39354613
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的生物启发图神经网络框架，用于原发性肝肿瘤的分子诊断 | 该框架利用细胞间通信网络的生物合理性，通过整合细胞簇内的通路激活特征和建模单向细胞间通信，实现了对恶性肿瘤和良性肿瘤的稳健区分 | NA | 开发一种新的诊断方法，利用单细胞RNA测序数据进行原发性肝肿瘤的分子诊断 | 原发性肝肿瘤，包括肝细胞癌（HCC）、肝内胆管癌（iCCA）和局灶性结节性增生（FNH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 535 | 2024-10-05 |
Novel FABP4+C1q+ macrophages enhance antitumor immunity and associated with response to neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in NSCLC via AMPK/JAK/STAT axis
2024-Oct-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07074-x
PMID:39353883
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研究论文 | 研究了新型FABP4+C1q+巨噬细胞在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中增强抗肿瘤免疫的作用及其与新辅助派姆单抗和化疗（NAPC）疗效的关系 | 发现了与新辅助化疗免疫疗法疗效相关的新型FABP4C1q巨噬细胞亚型，并揭示了其通过AMPK/JAK/STAT轴增强抗炎和吞噬能力的机制 | NA | 探讨新辅助派姆单抗和化疗在非小细胞肺癌中的疗效机制及预测标志物 | 非小细胞肺癌患者及其肿瘤组织和淋巴结中的巨噬细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 536 | 2024-10-05 |
SAE-Impute: imputation for single-cell data via subspace regression and auto-encoders
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05944-x
PMID:39354334
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SAE-Impute的新计算方法，通过结合子空间回归和自动编码器来提高单细胞数据插补的准确性和可靠性 | SAE-Impute通过子空间回归评估样本相关性，并在自动编码器框架内利用这些预测进行插值，从而解决了现有方法忽略样本间相关性的问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高数据分析的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2024-10-05 |
ScRNAbox: empowering single-cell RNA sequencing on high performance computing systems
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05935-y
PMID:39354372
|
研究论文 | 介绍了一种名为scRNAbox的创新性单细胞RNA测序分析管道，专为高性能计算系统设计 | scRNAbox是一个端到端的解决方案，通过SLURM工作负载管理器高效处理标准和Hashtag样本的原始数据，并集成了质量控制过滤、样本整合、聚类、聚类注释工具以及细胞类型特异性差异基因表达分析 | NA | 开发一个用户友好且适用于高性能计算系统的单细胞RNA测序数据处理和分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2024-10-05 |
Comprehensive analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics revealed IER3 for predicting malignant progression and immunotherapy efficacy in glioma
2024-Oct-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03511-1
PMID:39354533
|
研究论文 | 本研究通过综合分析批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了IER3在预测胶质瘤恶性进展和免疫治疗效果中的作用 | 首次全面分析了IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | NA | 探讨IER3在胶质瘤病理中的作用及其作为生物标志物的潜力 | IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 免疫组化、免疫荧光、Cox回归分析、Kaplan-Meier曲线 | NA | RNA测序数据 | 公开的胶质瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2024-10-04 |
Novel Long Noncoding RNA HEAT4 Affects Monocyte Subtypes, Reducing Inflammation and Promoting Vascular Healing
2024-Oct, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究了新型长非编码RNA HEAT4在单核细胞亚型中的作用，减少炎症并促进血管愈合 | 发现了人类特异性的长非编码RNA HEAT4，其在心血管免疫学中的作用机制，包括在单核细胞亚型转换中的作用 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步在人体中验证其效果 | 探讨长非编码RNA在心血管疾病中的免疫调节作用 | 长非编码RNA HEAT4及其在单核细胞亚型转换中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | RNA | 包括心力衰竭、急性心肌梗死和心源性休克患者的血液样本，以及NOD.CB17-Prkdc scid/Rj小鼠的血管损伤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-10-04 |
Effector MoSDT1 enhances Magnaporthe oryzae virulence and plays a dual role in regulating rice defense
2024-Oct-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae364
PMID:39046202
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研究论文 | 研究了C2H2锌效应子MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重作用 | 首次揭示了MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的双重调节作用，并通过RNA-seq、scRNA-seq和ChIP-seq技术深入分析了其调控机制 | 研究主要集中在MoSDT1的过表达和敲除菌株上，未涉及其在自然环境中的表现 | 探讨MoSDT1在稻瘟病菌致病性和水稻防御中的作用机制 | 稻瘟病菌MoSDT1效应子和水稻防御反应 | NA | NA | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 包括MoSDT1过表达菌株和两个敲除菌株 | NA | NA | NA | NA |