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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-10-11 |
Combined inhibition of CTPS1 and ATR is a metabolic vulnerability in p53-deficient myeloma cells
2024-Oct, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70016
PMID:39380841
|
研究论文 | 研究评估了在p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞中,CTPS1和ATR的联合抑制是否会导致代谢上的可操作弱点 | 首次展示了CTPS1和ATR的联合抑制在p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞中诱导细胞死亡的协同效应 | NA | 探索p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞的代谢弱点,并评估CTPS1和ATR联合抑制的治疗潜力 | p53缺陷的多发性骨髓瘤细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | 24个患者样本,10个STP-B处理的多发性骨髓瘤细胞系,以及NCI-H929异种移植的NOD-scid IL2Rgamma小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 502 | 2024-10-10 |
Label-free high-throughput impedance-activated cell sorting
2024-Oct-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00487f
PMID:39315634
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研究论文 | 提出了一种基于阻抗检测和双膜泵的无标记、高通量、高精度的细胞分选系统 | 利用FPGA的低延迟特性,实现了实时双频单细胞阻抗检测,并实现了高吞吐量和高精度的单颗粒分选 | NA | 开发一种无标记、高通量、高精度的细胞分选系统,以应用于早期癌症诊断、细胞分化研究、药物筛选和单细胞测序等领域 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞 | NA | NA | 阻抗检测 | NA | 细胞 | HeLa细胞、MDA-MB-231细胞和Jurkat细胞,每秒处理5 × 10个细胞,实验中Jurkat和MDA-MB-231细胞的吞吐量达到每秒1000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 503 | 2024-10-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies a subtype of FN1 + tumor-associated macrophages associated with glioma recurrence and as a biomarker for immunotherapy
2024-Oct-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00662-1
PMID:39375795
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研究论文 | 研究利用单细胞测序、空间转录组学和RNA测序数据,识别出与胶质瘤复发相关的FN1+肿瘤相关巨噬细胞亚型,并探讨其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次发现FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发相关,并提出其作为免疫治疗反应的预测标志物 | NA | 探讨胶质瘤复发的分子机制,并寻找新的治疗靶点 | FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序、空间转录组学、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 504 | 2024-10-10 |
A New Tissue Engineering Strategy to Promote Tendon-bone Healing: Regulation of Osteogenic and Chondrogenic Differentiation of Tendon-derived Stem Cells
2024-Oct, Orthopaedic surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.1111/os.14152
PMID:39043618
|
综述 | 本文综述了当前促进肌腱-骨愈合的策略,并分析了相关的临床前和临床研究,重点探讨了肌腱来源干细胞(TDSCs)在肌腱-骨愈合中的潜力 | 本文提出了一种基于TDSCs驱动成骨和软骨分化的肌腱-骨愈合新策略 | NA | 旨在全面审查当前促进肌腱-骨愈合的策略,并分析相关研究,以优化肌腱-骨愈合结果 | 前交叉韧带(ACL)和肩袖(RC)损伤修复手术中的肌腱-骨愈合 | 再生医学 | 运动损伤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 505 | 2024-10-10 |
Enhanced interactions within microenvironment accelerates dismal prognosis in HBV-related HCC after TACE
2024-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000548
PMID:39365124
|
研究论文 | 本文研究了TACE治疗后HBV相关HCC患者的微环境变化及其对预后的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了TACE治疗后HCC的全球细胞图谱,揭示了TACE诱导的肿瘤异质性和促炎微环境的增强 | 研究样本主要集中在HBV相关HCC患者,结果可能不适用于其他类型的HCC | 探讨TACE治疗后HBV相关HCC患者的微环境变化及其对预后的影响 | HBV相关HCC患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6个新鲜HBV相关HCC样本和757个大规模多中心队列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 506 | 2024-10-10 |
Next-generation spatial transcriptomics: unleashing the power to gear up translational oncology
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.765
PMID:39376738
|
综述 | 本文系统回顾了空间转录组学(ST)技术在转化肿瘤学领域的最新进展和应用 | 本文更新了ST技术的范围,并提出了一个用于ST数据探索的工具箱,特别关注肿瘤微环境中的应用 | 需要实际经验来整合和利用ST工具以实现特定的研究目标 | 探讨空间转录组学在转化肿瘤学中的应用和进展 | 空间转录组学技术及其在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学(ST) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 507 | 2024-10-10 |
Correction to "Single-cell RNA sequencing of pediatric Hodgkin lymphoma to study the inhibition of T cell subtypes"
2024-Oct, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70023
PMID:39380840
|
correction | 对文章“单细胞RNA测序研究儿童霍奇金淋巴瘤中T细胞亚型抑制”的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 508 | 2024-10-09 |
RNA-seq and bulk RNA-seq data analysis of cancer-related fibroblasts (CAF) in LUAD to construct a CAF-based risk signature
2024-10-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74336-1
PMID:39369095
|
研究论文 | 研究通过分析LUAD中的CAF相关RNA-seq数据,构建了一个基于CAF的风险特征,用于预测LUAD患者的预后 | 构建了一个新的基于CAF的风险特征,并验证了其在预测LUAD预后和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 开发一种基于CAF的风险特征,用于预测LUAD患者的预后和免疫治疗反应 | LUAD中的CAF及其相关基因表达数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Lasso回归 | RNA-seq数据 | 2811个差异表达基因,其中1002个与CAF簇显著相关 | NA | NA | NA | NA |
| 509 | 2024-10-09 |
Lumican promotes calcific aortic valve disease through H3 histone lactylation
2024-Oct-05, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae407
PMID:38976370
|
研究论文 | 研究揭示了lumican在钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)中的关键调节作用,特别是通过H3组蛋白乳酸化促进钙化过程 | 首次发现lumican通过介导H3组蛋白乳酸化促进主动脉瓣钙化 | NA | 探讨lumican在钙化性主动脉瓣疾病中的作用机制 | 主动脉瓣间质细胞(VICs)及其在钙化过程中的转变 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 9个人类主动脉瓣 | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2024-10-09 |
C-ziptf: stable tensor factorization for zero-inflated multi-dimensional genomics data
2024-Oct-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05886-4
PMID:39369208
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的零膨胀多维基因组数据分解方法,名为零膨胀泊松张量分解(ZIPTF),并提出了共识ZIPTF(C-ZIPTF)以解决随机性问题 | 提出了ZIPTF和C-ZIPTF方法,能够有效处理零膨胀的多维基因组数据,并在重建精度和一致性方面优于传统方法 | NA | 开发一种能够有效处理零膨胀多维基因组数据的稳定张量分解方法 | 零膨胀的多维基因组数据,特别是单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 张量分解(TF) | 基因组数据 | 涉及合成数据、模拟scRNA-seq数据和真实的多样本多条件scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 511 | 2024-10-09 |
Antagonistic effects of the cytotoxic molecules granzyme B and TRAIL in the immunopathogenesis of sclerosing cholangitis
2024-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000830
PMID:38441998
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研究论文 | 研究了细胞毒性分子GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎免疫发病机制中的拮抗作用 | 首次揭示了GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的不同作用机制,GzmB促进细胞凋亡和纤维化,而TRAIL则调节炎症和细胞毒性免疫反应,减少肝损伤和纤维化 | 研究主要基于Mdr2-/-小鼠模型和患者样本,可能不完全适用于所有硬化性胆管炎病例 | 探讨GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的作用及其对疾病进展的影响 | 硬化性胆管炎患者样本和Mdr2-/-小鼠 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 患者样本和Mdr2-/-小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2024-10-08 |
Identification of KLHL17 as a prognostic marker for prostate cancer based on single-cell sequencing and in vitro/in vivo experiments
2024-Oct-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01406-1
PMID:39365488
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据识别前列腺癌中的恶性上皮细胞亚群及其分子特征,并构建了预测患者预后的风险评分模型 | 首次通过单细胞RNA测序和体内外实验验证KLHL17作为前列腺癌的预后标志物 | NA | 深入理解前列腺癌的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 前列腺癌中的恶性上皮细胞及其分子特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 513 | 2024-10-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral immunological features in Parkinson's Disease
2024-Oct-04, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-024-00790-3
PMID:39366969
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞中的免疫特征 | 首次揭示了NK细胞在帕金森病进展中的关键作用及其与疾病严重程度的正相关性 | 研究样本量有限,需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 探讨帕金森病患者外周免疫反应与疾病严重程度之间的关系 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括早期和晚期帕金森病患者及健康对照者的外周血单个核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 514 | 2024-10-08 |
Exploring the prognostic and diagnostic value of lactylation-related genes in sepsis
2024-10-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74040-0
PMID:39367086
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸化相关基因在脓毒症中的预后和诊断价值 | 首次识别出与脓毒症相关的55个乳酸化基因,并通过多种分析方法验证了这些基因的预后和诊断价值 | 样本量较小,且仅限于中国西南医科大学附属医院的患者 | 研究乳酸化相关基因在脓毒症中的预后和诊断作用 | 脓毒症患者和健康个体的血液样本 | NA | 脓毒症 | RNA测序、单细胞RNA测序、基因本体论分析、京都基因与基因组百科全书分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | RNA序列数据 | 20名脓毒症患者和10名健康个体的血液样本,以及5个外周血样本用于单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 515 | 2024-10-08 |
Leveraging explainable deep learning methodologies to elucidate the biological underpinnings of Huntington's disease using single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10855-5
PMID:39367331
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研究论文 | 利用可解释深度学习方法阐明亨廷顿病生物学基础的研究 | 使用单细胞RNA测序数据和残差神经网络(ResNet)模型,结合SHapley Additive exPlanations(SHAP)算法,揭示了影响亨廷顿病预测的基因及其在病理生物学中的作用 | 尽管模型在测试集上的F1分数达到96.53%,但仍存在一定的局限性 | 阐明亨廷顿病病理学的潜在机制 | 亨廷顿病细胞与健康细胞的差异基因表达模式 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 残差神经网络(ResNet) | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 516 | 2024-10-08 |
Deep learning to estimate response of concurrent chemoradiotherapy in non-small-cell lung carcinoma
2024-Oct-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05708-4
PMID:39367461
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研究论文 | 本文构建了一个深度学习模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应,并探索了相关的生物信号通路 | 首次使用深度学习模型预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 | NA | 开发和验证一个深度学习模型,用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 | 非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应 | 机器学习 | 肺癌 | 深度学习 | ResNet50 | 图像 | 229名非小细胞肺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 517 | 2024-10-08 |
Uncovering the role of traditional Chinese medicine in immune-metabolic balance of gastritis from the perspective of Cold and Hot: Jin Hong Tablets as a case study
2024-Oct-04, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-00998-8
PMID:39367502
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研究论文 | 本研究探讨了传统中药在慢性胃炎免疫代谢平衡中的作用,特别是从寒热角度出发,以金红片为例进行分析 | 首次结合转录组数据和机器学习算法,揭示了寒热证型慢性胃炎的分子特征及其对应中药的作用机制 | 样本量较小,且仅基于转录组数据进行分析,缺乏更全面的生物学验证 | 探讨传统中药在慢性胃炎免疫代谢平衡中的作用机制 | 慢性胃炎患者及其寒热证型,以及金红片等中药配方 | 机器学习 | 胃炎 | 转录组测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 35名寒热证型慢性胃炎患者和3例单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 518 | 2024-10-08 |
ERP29 regulates the proliferation of endometrial carcinoma via M6A modification
2024-Oct-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122976
PMID:39142507
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研究论文 | 研究ERP29通过M6A修饰调控子宫内膜癌增殖的作用 | 首次揭示了ERP29在子宫内膜癌中的高表达及其通过M6A修饰调控癌细胞增殖的机制 | 研究主要基于GEO和TCGA数据库,缺乏体内实验验证 | 探讨ERP29和M6A在子宫内膜癌进展中的作用 | ERP29基因、M6A修饰及其对子宫内膜癌细胞增殖的影响 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | WGCNA、机器学习算法、scRNA-seq、qPCR、Western blot、免疫组化、m6A Dot blot、MeRIP-qPCR | NA | 基因表达数据 | 基于GEO和TCGA数据库的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2024-10-08 |
Proteomic Analysis Reveals Oxidative Phosphorylation and JAK-STAT Pathways Mediated Pathogenesis of Pemphigus Vulgaris
2024-Oct, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15184
PMID:39373252
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析揭示了寻常型天疱疮发病机制中氧化磷酸化和JAK-STAT通路的潜在作用 | 首次通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示了寻常型天疱疮中氧化磷酸化和JAK-STAT通路的激活 | 研究仅限于体外细胞模型,尚未在临床试验中验证 | 阐明寻常型天疱疮的信号机制 | 寻常型天疱疮患者和健康志愿者的皮肤样本 | 蛋白质组学 | 自身免疫性疾病 | LC-MS/MS, scRNA-seq | NA | 蛋白质, 单细胞RNA | 880, 605, 586个差异表达蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 520 | 2024-10-07 |
Serial single-cell RNA sequencing unveils drug resistance and metastatic traits in stage IV breast cancer
2024-Oct-03, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00723-6
PMID:39363009
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了IV期乳腺癌患者的肿瘤细胞在化疗抵抗和转移过程中的转录组、基因组和表观基因组变化 | 首次在单个患者样本中系统分析了化疗抵抗和转移前细胞的特征,揭示了化疗抵抗细胞的克隆扩增和转移前细胞的表达谱变化 | 研究仅基于单个患者样本,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨IV期乳腺癌患者肿瘤细胞在化疗抵抗和转移过程中的分子机制 | IV期乳腺癌患者的原发肿瘤和远处转移瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个IV期乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |