单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 600 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-10-10 |
KLHL21 suppresses gastric tumourigenesis via maintaining STAT3 signalling equilibrium in stomach homoeostasis
2024-Oct-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331111
PMID:38969490
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研究论文 | 研究探讨了KLHL21在胃癌发生中的作用及其通过维持STAT3信号平衡来抑制胃肿瘤发生的机制 | 首次揭示了KLHL21缺失通过STAT3信号通路促进胃癌发生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，缺乏更大规模的人类临床数据验证 | 探讨KLHL21在胃癌发生中的作用及其分子机制 | KLHL21基因、STAT3信号通路、胃癌患者样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色、质谱分析、核糖体测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 包括多个小鼠模型和胃癌患者样本 |
| 482 | 2024-10-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies a subtype of FN1 + tumor-associated macrophages associated with glioma recurrence and as a biomarker for immunotherapy
2024-Oct-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00662-1
PMID:39375795
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研究论文 | 研究利用单细胞测序、空间转录组学和RNA测序数据，识别出与胶质瘤复发相关的FN1+肿瘤相关巨噬细胞亚型，并探讨其在免疫治疗中的潜在作用 | 首次发现FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发相关，并提出其作为免疫治疗反应的预测标志物 | NA | 探讨胶质瘤复发的分子机制，并寻找新的治疗靶点 | FN1+肿瘤相关巨噬细胞与胶质瘤复发的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序、空间转录组学、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 483 | 2024-10-10 |
Endothelial pyroptosis-driven microglial activation in choroid plexus mediates neuronal apoptosis in hemorrhagic stroke rats
2024-Oct-05, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106695
PMID:39370051
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研究论文 | 研究揭示了在出血性中风大鼠模型中，脉络丛中的内皮细胞焦亡通过NF-κB途径驱动小胶质细胞活化，进而介导神经元凋亡 | 首次揭示了内皮细胞焦亡在出血性中风后通过NF-κB途径触发小胶质细胞活化，并介导神经元凋亡的机制 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨出血性中风后炎症反应的来源及其对神经元损伤的影响 | 出血性中风大鼠模型中的内皮细胞、小胶质细胞和神经元 | NA | 出血性中风 | Luminex®分析、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA | 出血性中风大鼠模型的出血半球 |
| 484 | 2024-10-10 |
A New Tissue Engineering Strategy to Promote Tendon-bone Healing: Regulation of Osteogenic and Chondrogenic Differentiation of Tendon-derived Stem Cells
2024-Oct, Orthopaedic surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.1111/os.14152
PMID:39043618
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综述 | 本文综述了当前促进肌腱-骨愈合的策略，并分析了相关的临床前和临床研究，重点探讨了肌腱来源干细胞（TDSCs）在肌腱-骨愈合中的潜力 | 本文提出了一种基于TDSCs驱动成骨和软骨分化的肌腱-骨愈合新策略 | NA | 旨在全面审查当前促进肌腱-骨愈合的策略，并分析相关研究，以优化肌腱-骨愈合结果 | 前交叉韧带（ACL）和肩袖（RC）损伤修复手术中的肌腱-骨愈合 | 再生医学 | 运动损伤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 485 | 2024-10-10 |
Enhanced interactions within microenvironment accelerates dismal prognosis in HBV-related HCC after TACE
2024-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000548
PMID:39365124
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研究论文 | 本文研究了TACE治疗后HBV相关HCC患者的微环境变化及其对预后的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了TACE治疗后HCC的全球细胞图谱，揭示了TACE诱导的肿瘤异质性和促炎微环境的增强 | 研究样本主要集中在HBV相关HCC患者，结果可能不适用于其他类型的HCC | 探讨TACE治疗后HBV相关HCC患者的微环境变化及其对预后的影响 | HBV相关HCC患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6个新鲜HBV相关HCC样本和757个大规模多中心队列样本 |
| 486 | 2024-10-10 |
Next-generation spatial transcriptomics: unleashing the power to gear up translational oncology
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.765
PMID:39376738
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综述 | 本文系统回顾了空间转录组学（ST）技术在转化肿瘤学领域的最新进展和应用 | 本文更新了ST技术的范围，并提出了一个用于ST数据探索的工具箱，特别关注肿瘤微环境中的应用 | 需要实际经验来整合和利用ST工具以实现特定的研究目标 | 探讨空间转录组学在转化肿瘤学中的应用和进展 | 空间转录组学技术及其在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 487 | 2024-10-10 |
Correction to "Single-cell RNA sequencing of pediatric Hodgkin lymphoma to study the inhibition of T cell subtypes"
2024-Oct, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70023
PMID:39380840
|
correction | 对文章“单细胞RNA测序研究儿童霍奇金淋巴瘤中T细胞亚型抑制”的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-10-09 |
RNA-seq and bulk RNA-seq data analysis of cancer-related fibroblasts (CAF) in LUAD to construct a CAF-based risk signature
2024-10-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74336-1
PMID:39369095
|
研究论文 | 研究通过分析LUAD中的CAF相关RNA-seq数据，构建了一个基于CAF的风险特征，用于预测LUAD患者的预后 | 构建了一个新的基于CAF的风险特征，并验证了其在预测LUAD预后和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 开发一种基于CAF的风险特征，用于预测LUAD患者的预后和免疫治疗反应 | LUAD中的CAF及其相关基因表达数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Lasso回归 | RNA-seq数据 | 2811个差异表达基因，其中1002个与CAF簇显著相关 |
| 489 | 2024-10-09 |
Lumican promotes calcific aortic valve disease through H3 histone lactylation
2024-Oct-05, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae407
PMID:38976370
|
研究论文 | 研究揭示了lumican在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键调节作用，特别是通过H3组蛋白乳酸化促进钙化过程 | 首次发现lumican通过介导H3组蛋白乳酸化促进主动脉瓣钙化 | NA | 探讨lumican在钙化性主动脉瓣疾病中的作用机制 | 主动脉瓣间质细胞（VICs）及其在钙化过程中的转变 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 9个人类主动脉瓣 |
| 490 | 2024-10-09 |
Imputing spatial transcriptomics through gene network constructed from protein language model
2024-Oct-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06964-2
PMID:39369061
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于蛋白质语言模型构建基因网络的空间转录组学插补方法stImpute | stImpute利用蛋白质语言模型ESM-2构建基因网络，通过图神经网络进行基因表达插补，显著提高了插补和聚类的准确性 | NA | 开发一种新的计算方法来克服空间转录组学中基因数量有限的挑战 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 基因表达数据 | 多个数据集 |
| 491 | 2024-10-09 |
Spatial multi-omics in whole skeletal muscle reveals complex tissue architecture
2024-Oct-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06949-1
PMID:39369093
|
研究论文 | 本文通过结合RNA断层扫描和质谱成像技术，揭示了小鼠胫骨前肌的完整组织结构 | 首次在全组织水平上展示了基因表达、代谢差异和肌纤维类型比例的区域化特征 | NA | 阐明骨骼肌的完整组织结构 | 小鼠胫骨前肌的基因表达、代谢和脂质组织 | 数字病理学 | NA | RNA断层扫描和质谱成像 | NA | 空间转录组学、空间代谢组学和空间脂质组学数据 | 小鼠胫骨前肌、趾长伸肌和比目鱼肌 |
| 492 | 2024-10-09 |
C-ziptf: stable tensor factorization for zero-inflated multi-dimensional genomics data
2024-Oct-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05886-4
PMID:39369208
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研究论文 | 本文介绍了一种新的零膨胀多维基因组数据分解方法，名为零膨胀泊松张量分解（ZIPTF），并提出了共识ZIPTF（C-ZIPTF）以解决随机性问题 | 提出了ZIPTF和C-ZIPTF方法，能够有效处理零膨胀的多维基因组数据，并在重建精度和一致性方面优于传统方法 | NA | 开发一种能够有效处理零膨胀多维基因组数据的稳定张量分解方法 | 零膨胀的多维基因组数据，特别是单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 张量分解（TF） | 基因组数据 | 涉及合成数据、模拟scRNA-seq数据和真实的多样本多条件scRNA-seq数据 |
| 493 | 2024-10-09 |
A versatile tissue-rolling technique for spatial-omics analyses of the entire murine gastrointestinal tract
2024-Oct, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01001-2
PMID:38906985
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研究论文 | 本文介绍了一种用于小鼠整个胃肠道空间组学分析的多功能组织滚动技术 | 开发了一种简单的固定技术，可以最大化分析的组织面积，涵盖小鼠整个胃肠道，并结合了先进的转录组学和蛋白质组学方法 | 整个过程需要2-3天，对于空间转录组学和蛋白质组学分析分别需要额外2天和3-4天 | 全面表征和理解组织内生物过程背后的细胞电路 | 小鼠整个胃肠道 | 数字病理学 | NA | 组织滚动技术、Visium空间转录组学、ChipCytometry和CODEX-PhenoCycler蛋白质组学 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | 小鼠整个胃肠道 |
| 494 | 2024-10-09 |
Antagonistic effects of the cytotoxic molecules granzyme B and TRAIL in the immunopathogenesis of sclerosing cholangitis
2024-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000830
PMID:38441998
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研究论文 | 研究了细胞毒性分子GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎免疫发病机制中的拮抗作用 | 首次揭示了GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的不同作用机制，GzmB促进细胞凋亡和纤维化，而TRAIL则调节炎症和细胞毒性免疫反应，减少肝损伤和纤维化 | 研究主要基于Mdr2-/-小鼠模型和患者样本，可能不完全适用于所有硬化性胆管炎病例 | 探讨GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的作用及其对疾病进展的影响 | 硬化性胆管炎患者样本和Mdr2-/-小鼠 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 患者样本和Mdr2-/-小鼠 |
| 495 | 2024-10-09 |
Single cell RNA sequencing of human eosinophils from nasal polyps reveals eosinophil heterogeneity in chronic rhinosinusitis tissue
2024-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.05.014
PMID:38797240
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的嗜酸性粒细胞，揭示其在慢性鼻窦炎中的异质性和作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鼻息肉组织中嗜酸性粒细胞的异质性及其在慢性鼻窦炎中的潜在病理作用 | 研究样本量较小，且仅限于鼻息肉和对照鼻窦组织，可能影响结果的普遍性 | 揭示嗜酸性粒细胞在鼻息肉组织中的作用及其异质性 | 鼻息肉组织中的嗜酸性粒细胞 | 数字病理学 | 鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5名对照患者和5名慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的鼻息肉组织和外周血样本 |
| 496 | 2024-10-09 |
Single-cell RNA-sequencing of human eosinophils in allergic inflammation in the esophagus
2024-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.05.029
PMID:38871184
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了过敏性炎症中食管嗜酸性粒细胞的转录组特征 | 首次全面描述了食管嗜酸性粒细胞在过敏性炎症中的转录组特征和生物学功能 | 样本量较小，仅包括6名患者和6名对照个体 | 全面表征过敏性炎症中食管嗜酸性粒细胞的转录组和生物学功能 | 过敏性炎症中食管嗜酸性粒细胞 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 586个嗜酸性粒细胞（血液中188个，食管中398个） |
| 497 | 2024-10-09 |
All-optical voltage imaging-guided postsynaptic single-cell transcriptome profiling with Voltage-Seq
2024-Oct, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01005-y
PMID:38834919
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Voltage-Seq的新技术，结合光学电压成像和单细胞转录组测序，用于研究神经元突触后反应类型 | 开发了Voltage-Seq技术，结合遗传编码电压指示剂Voltron和单细胞RNA测序，实现了基于特定突触后反应类型的高通量光学成像和单细胞转录组分析 | 技术需要基本实验室技能、显微操作技能以及分子生物学和生物信息学经验 | 克服传统低通量电生理方法的限制，实现基于特定突触后反应类型的高通量单细胞RNA测序 | 神经元突触后反应类型及其与基因表达的关系 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自小鼠急性脑切片的多个动物的连接组数据 |
| 498 | 2024-10-09 |
ProBac-seq, a bacterial single-cell RNA sequencing methodology using droplet microfluidics and large oligonucleotide probe sets
2024-Oct, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01002-1
PMID:38769144
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研究论文 | 介绍了一种名为ProBac-seq的细菌单细胞RNA测序方法，该方法利用液滴微流控技术和大型寡核苷酸探针集 | ProBac-seq克服了现有技术在细菌样本中的技术难题，提供了高质量的单细胞基因表达数据 | 从探针扩增到文库制备需要约7天时间 | 开发一种适用于细菌单细胞RNA测序的新方法 | 细菌单细胞的基因表达数据 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 数千个细菌细胞 |
| 499 | 2024-10-08 |
Identification of KLHL17 as a prognostic marker for prostate cancer based on single-cell sequencing and in vitro/in vivo experiments
2024-Oct-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01406-1
PMID:39365488
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据识别前列腺癌中的恶性上皮细胞亚群及其分子特征，并构建了预测患者预后的风险评分模型 | 首次通过单细胞RNA测序和体内外实验验证KLHL17作为前列腺癌的预后标志物 | NA | 深入理解前列腺癌的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 前列腺癌中的恶性上皮细胞及其分子特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | RNA测序数据 | NA |
| 500 | 2024-10-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral immunological features in Parkinson's Disease
2024-Oct-04, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-024-00790-3
PMID:39366969
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞中的免疫特征 | 首次揭示了NK细胞在帕金森病进展中的关键作用及其与疾病严重程度的正相关性 | 研究样本量有限，需要进一步验证和扩大样本以确认结果的普遍性 | 探讨帕金森病患者外周免疫反应与疾病严重程度之间的关系 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括早期和晚期帕金森病患者及健康对照者的外周血单个核细胞样本 |