单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-10-13 |
Landscape of epithelial cell subpopulations in the human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38091
PMID:39391485
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研究论文 | 研究揭示了人食管鳞状细胞癌微环境中上皮细胞亚群的景观及其在食管鳞状细胞癌发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率下获得了食管鳞状细胞癌的上皮细胞图谱，并揭示了上皮细胞在癌症进展中的作用及其对NK/T细胞的免疫抑制信号 | NA | 探索上皮细胞亚群在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞亚群及其在癌症发展中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及食管鳞状细胞癌及其邻近组织的11个主要细胞亚群和4个上皮细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse cardiac cells in response to retinoic acid
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38301
PMID:39391486
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研究论文 | 研究了视黄酸对小鼠心脏细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析视黄酸对小鼠心脏发育过程中细胞和分子机制的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类心脏疾病的研究 | 揭示视黄酸对心脏畸形的影响机制 | 小鼠心脏细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69,447个细胞，来自从E8.5到E17.5的七个发育阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-10-13 |
Cross-species comparison of airway epithelium transcriptomics
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38259
PMID:39391497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类、猴子、小鼠和大鼠在健康和哮喘条件下的肺细胞转录组相似性和差异 | 首次进行了跨物种的肺细胞转录组全面比较，揭示了跨物种细胞特异性标记基因、转录因子和生物通路的保守性 | 研究仅限于四种物种，且未涵盖所有可能的肺部疾病状态 | 探讨不同物种间肺细胞转录组的相似性和差异，以及这些差异在哮喘中的作用 | 人类、猴子、小鼠和大鼠的肺细胞在健康和哮喘条件下的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及四种物种的肺细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-10-13 |
Germinal center B-cell subgroups in the tumor microenvironment cannot be overlooked: Their involvement in prognosis, immunotherapy response, and treatment resistance in head and neck squamous carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37726
PMID:39391510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群，并构建了相关的风险预测模型 | 首次将生发中心B细胞（GCB）识别为B细胞特异性预后生物标志物，填补了头颈部鳞状细胞癌遗传预后预测模型的研究空白 | NA | 寻找新的生物标志物以实现头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和预测早期复发和转移 | 头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群及其在预后、免疫治疗反应和治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 头颈部鳞状细胞癌组织和外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-10-13 |
Intestinal newborn regulatory B cell antibodies modulate microbiota communities
2024-Oct-09, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.08.010
PMID:39243760
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研究论文 | 研究新生儿调节性B细胞产生的抗体如何调节微生物群落 | 首次发现新生儿调节性B细胞通过IL-10负调节IgM的产生，影响早期微生物群落的多样性和合作 | NA | 探讨新生儿调节性B细胞在早期生命中对微生物群落的影响 | 新生儿调节性B细胞及其产生的抗体 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 205个单克隆抗体 | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-10-13 |
Single-cell analysis reveals alternations between the aged and young mice prostates
2024-Oct-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00666-x
PMID:39385256
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了老年和年轻小鼠前列腺的细胞类型和基因表达变化 | 首次揭示了老年小鼠前列腺中细胞类型和基因表达的显著变化，包括间充质细胞和免疫细胞比例的增加，以及与细胞衰老、氧化应激和再生相关的基因和通路的改变 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨老年和年轻小鼠前列腺的细胞和分子变化 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP算法 | 基因表达数据 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 487 | 2024-10-13 |
Exosomal miR-106a-5p from highly metastatic colorectal cancer cells drives liver metastasis by inducing macrophage M2 polarization in the tumor microenvironment
2024-Oct-09, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03204-7
PMID:39385295
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研究论文 | 研究了高度转移性结直肠癌细胞分泌的外泌体miR-106a-5p如何通过诱导肿瘤微环境中巨噬细胞M2极化来驱动肝转移 | 揭示了外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的新机制，并发现其作为潜在生物标志物的可能性 | NA | 探讨外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的作用及其机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、外泌体miR-106a-5p | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、外泌体分离、免疫荧光、qRT-PCR、ELISA、流式细胞术 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-10-13 |
High mortality of Acinetobacter baumannii infection is attributed to macrophage-mediated induction of cytokine storm but preventable by naproxen
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105340
PMID:39303669
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研究论文 | 研究探讨了多药耐药鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制，并发现萘普生可预防由巨噬细胞介导的细胞因子风暴 | 揭示了鲍曼不动杆菌感染中巨噬细胞介导的细胞因子风暴机制，并发现萘普生可有效抑制炎症反应和M1极化，从而保护宿主免受致命感染 | NA | 解析鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制，并探索控制耐药感染的新策略 | 鲍曼不动杆菌感染的免疫反应和细胞因子风暴机制 | 免疫学 | 感染性疾病 | 流式细胞术、RNA测序、qRT-PCR、ELISA和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2024-10-13 |
Neural network-assisted humanisation of COVID-19 hamster transcriptomic data reveals matching severity states in human disease
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105312
PMID:39317638
|
研究论文 | 本文利用神经网络辅助的方法，分析了COVID-19仓鼠和人类单细胞转录组数据，揭示了不同疾病严重程度下的跨物种相似性 | 首次使用变分自编码器神经网络量化跨物种和疾病严重程度的转录组相似性，并识别出与疾病相关的关键基因和信号通路 | 仅限于分析仓鼠和人类的数据，未涉及其他动物模型 | 研究COVID-19在仓鼠和人类中的疾病机制，并开发跨物种的精确治疗策略 | COVID-19仓鼠和人类的单细胞转录组数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞转录组测序（scRNAseq） | 变分自编码器（VAE） | 转录组数据 | 来自人类和仓鼠的血液白细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 490 | 2024-10-12 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of bladder Ewing sarcoma
2024-Oct-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110921
PMID:39386756
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，深入研究了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制 | 首次揭示了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中特化的上皮细胞和肥大细胞的存在，并发现了TNFRSF12A的显著上调 | NA | 探讨膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制 | 膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中的特化细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA | 涉及膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-10-12 |
CD8+ T cell associated scoring model helps prognostic diagnosis and immunotherapy selection in patients with colon adenocarcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37998
PMID:39386801
|
研究论文 | 研究构建了一个基于CD8+ T细胞标记基因的评分模型，用于结肠腺癌患者的预后诊断和免疫治疗选择 | 首次基于CD8+ T细胞标记基因构建了一个新的预后评分模型，并验证了其在区分患者免疫治疗反应中的有效性 | 研究仅使用了5个数据集，样本量相对较小，可能影响模型的普适性 | 开发一种新的预后评分模型，用于结肠腺癌患者的预后预测和免疫治疗选择 | 结肠腺癌患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞转录组测序和Bulk转录组测序 | Lasso回归模型 | 转录组数据 | 5个数据集，包括单细胞和Bulk转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2024-10-12 |
Single-cell sequencing analysis revealed that NEAT1 was a potential biomarker and therapeutic target of prostate cancer
2024-Oct-08, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12926-y
PMID:39379919
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了NEAT1作为前列腺癌潜在生物标志物和治疗靶点的可能性 | 首次通过单细胞RNA测序数据探讨NEAT1在前列腺癌中的作用，并验证了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和细胞衍生异种移植模型，缺乏临床试验验证 | 探索前列腺癌发生相关的生物标志物，并验证NEAT1作为潜在治疗靶点的可能性 | 前列腺癌样本及其相关细胞亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 包括正常、良性前列腺增生和前列腺癌样本，具体数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-10-12 |
Single-cell sequencing unveils the impact of aging on the progenitor cell diversity in the telencephalon of the female killifish N. furzeri
2024-Oct, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14251
PMID:38949249
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研究论文 | 研究揭示了非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中衰老对前体细胞多样性的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了年轻成年雌性杀鱼端脑中前体细胞的多样性及其在衰老过程中的变化 | 研究仅限于特定品系的雌性杀鱼，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨衰老对端脑中前体细胞多样性的影响及其分子机制 | 非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中的前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻成年雌性杀鱼（GRZ-AD品系）的端脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-10-12 |
SCARF2 is a target for chronic obstructive pulmonary disease: Evidence from multi-omics research and cohort validation
2024-Oct, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14266
PMID:38958042
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研究论文 | 本文通过多组学研究和队列验证，发现SCARF2蛋白是慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新靶点 | 首次通过多组学分析和遗传共定位验证了SCARF2蛋白在COPD中的保护作用 | 单细胞RNA分析结果与全转录组MR结果存在差异，需要进一步研究解释 | 确定慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新治疗靶点 | SCARF2蛋白及其在COPD中的作用机制 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 全基因组元分析、转录组和蛋白质组孟德尔随机化、遗传共定位、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 2883例IPF病例和741,929例对照，17,547例COPD病例和617,598例对照，以及UK Biobank的个体数据 | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-10-12 |
Retinoic acid, an essential component of the roof plate organizer, promotes the spatiotemporal segregation of dorsal neural fates
2024-Oct-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202973
PMID:39250350
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研究论文 | 研究视黄酸在胚胎发育中对背侧神经命运分离的影响 | 通过单细胞转录组学揭示了视黄酸在背侧神经命运分离中的分子机制 | 研究仅限于鹌鹑胚胎，可能不适用于其他物种 | 探讨视黄酸在背侧神经命运分离中的作用及其分子机制 | 鹌鹑胚胎中的背侧神经管及其相关细胞命运 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 鹌鹑胚胎中的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-10-11 |
Machine learning based on biological context facilitates the identification of microvascular invasion in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Oct-10, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgae052
PMID:39086220
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研究论文 | 本研究利用随机森林模型构建了一个预测微血管侵犯（MVI）的模型，并揭示了其生物学基础 | 本研究首次结合单细胞转录组测序、全外显子测序和蛋白质组测序，构建了一个高准确性的MVI预测模型，并揭示了MVI相关的生物学机制 | 本研究仅限于肝内胆管癌，未涵盖其他类型的癌症 | 开发一个高准确性的微血管侵犯预测模型，并揭示其生物学机制 | 肝内胆管癌中的微血管侵犯 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组测序、全外显子测序、蛋白质组测序 | 随机森林模型 | 基因组数据、蛋白质组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-10-11 |
The axis of tumor-associated macrophages, extracellular matrix proteins, and cancer-associated fibroblasts in oncogenesis
2024-Oct-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03518-8
PMID:39375726
|
综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞在肿瘤发生中的相互关系 | 利用单细胞测序技术揭示了肿瘤微环境中细胞外基质蛋白的多样性及其在细胞间信号传导中的作用 | 需要整合单细胞数据并建立一个连贯的框架 | 探讨肿瘤微环境中细胞外基质蛋白、肿瘤相关巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用 | 肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-10-11 |
Phenotype remodelling of HNSCC cells in the muscle invasion environment
2024-Oct-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05607-8
PMID:39375763
|
研究论文 | 研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞在肌肉侵袭环境中的表型重塑及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次揭示了肌肉侵袭性HNSCC细胞的表型功能及其与肿瘤微环境的相互作用，并发现了G0S2作为肌肉侵袭性癌细胞的新标记物 | NA | 研究肌肉侵袭性HNSCC细胞的表型功能及其与肿瘤微环境的相互作用 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞及其在肌肉侵袭环境中的表型变化 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间RNA测序（ST） | NA | RNA测序数据 | 共使用了来自多个数据集的168个样本，包括scRNA-seq数据（N=55）、空间RNA-seq数据（N=4）和转录组数据（N=109） | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-10-11 |
Absent, but not glucocorticoid-modulated, corticotropin-releasing hormone (Crh) regulates anxiety-like behaviors in mice
2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614550
PMID:39386648
|
研究论文 | 研究探讨了皮质酮释放激素（Crh）在调节小鼠焦虑样行为中的作用，特别是在下丘脑-垂体-肾上腺（HPA）轴中的作用 | 发现下丘脑Crh的表达在原发性肾上腺功能不全或地塞米松（DEX）治疗下并不改变小鼠的焦虑行为 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨Crh在下丘脑-垂体-肾上腺轴中的作用及其对焦虑样行为的影响 | 小鼠的焦虑样行为和下丘脑Crh的表达 | NA | NA | 空间转录组学和ELISA | NA | 行为数据和生物标志物 | 野生型（WT）小鼠、原发性肾上腺功能不全（KO）小鼠和Crh全局缺失（KO）小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-10-11 |
Tobacco smoking is associated with sex- and plaque-type specific upregulation of CRLF1 in atherosclerotic lesions
2024-10, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 研究探讨了烟草吸烟对动脉粥样硬化斑块中CRLF1基因表达的影响，并分析了性别和斑块类型的特异性上调 | 首次揭示了烟草吸烟导致的动脉粥样硬化斑块中CRLF1基因的性别和斑块类型特异性上调 | 研究样本量相对较小，且仅限于颈动脉斑块 | 探讨烟草吸烟对动脉粥样硬化斑块基因表达的影响及其性别特异性 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 625个颈动脉斑块（151个女性和474个男性） | NA | NA | NA | NA |