单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
481	2024-10-12	Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 2024-Oct-08, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.016 PMID:39317200	研究论文	研究揭示了Notch信号通路在代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD/MASH）中调节巨噬细胞介导的炎症的作用	首次揭示了Notch-RBPJ信号通路在控制单核细胞向巨噬细胞转变中的关键作用，并发现Rbpj缺陷会抑制炎症性巨噬细胞和单核细胞来源的Kupffer细胞的分化，同时促进保护性Ly6C单核细胞的出现	NA	探讨Notch信号通路在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中巨噬细胞分化和功能的作用机制	巨噬细胞在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的分化和功能	NA	代谢功能障碍相关脂肪性肝病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	涉及肝脏巨噬细胞亚群的时空动态分析
482	2024-10-12	Single-cell sequencing analysis revealed that NEAT1 was a potential biomarker and therapeutic target of prostate cancer 2024-Oct-08, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-024-12926-y PMID:39379919	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了NEAT1作为前列腺癌潜在生物标志物和治疗靶点的可能性	首次通过单细胞RNA测序数据探讨NEAT1在前列腺癌中的作用，并验证了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于体外实验和细胞衍生异种移植模型，缺乏临床试验验证	探索前列腺癌发生相关的生物标志物，并验证NEAT1作为潜在治疗靶点的可能性	前列腺癌样本及其相关细胞亚群	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA	包括正常、良性前列腺增生和前列腺癌样本，具体数量未明确提及
483	2024-10-12	The small inhibitor WM-1119 effectively targets KAT6A-rearranged AML, but not KMT2A-rearranged AML, despite shared KAT6 genetic dependency 2024-Oct-08, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1 DOI:10.1186/s13045-024-01610-0 PMID:39380002	研究论文	研究评估了小分子抑制剂WM-1119对KAT6A重排的AML的疗效，并探讨了其在KMT2A重排的AML中的作用	首次评估了KAT6A抑制剂WM-1119在KAT6A和KMT2A重排的AML中的作用，发现其对KAT6A重排的AML有显著疗效，但对KMT2A重排的AML影响有限	研究主要集中在细胞和分子水平，缺乏临床试验数据支持	评估KAT6A抑制剂WM-1119在不同类型AML中的疗效	KAT6A和KMT2A重排的AML细胞	数字病理学	血液肿瘤	流式细胞术、克隆形成实验、细胞生长实验、shRNA敲减、CRISPR敲除、bulk和单细胞RNA-seq、ChIP-seq	NA	RNA	包括KAT6A和KMT2A重排的AML细胞系及患者原代AML细胞
484	2024-10-12	Single-cell dissection reveals promotive role of ENO1 in leukemia stem cell self-renewal and chemoresistance in acute myeloid leukemia 2024-Oct-08, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03969-w PMID:39380054	研究论文	研究探讨了ENO1在急性髓系白血病（AML）中对白血病干细胞（LSCs）自我更新和化疗耐药性的促进作用	首次揭示了ENO1在AML中对LSCs自我更新和化疗耐药性的关键作用，并提出了ENO1作为AML靶向治疗和预后标志物的潜力	研究样本量较小，且仅限于AML患者和健康对照组，未来需要更大规模的研究来验证结果	探讨ENO1在AML中对LSCs自我更新和化疗耐药性的影响及其机制	AML患者的骨髓样本和AML细胞系	数字病理学	血液肿瘤	单细胞RNA测序	机器学习	RNA	8名复发/难治性AML患者和4名健康对照者的骨髓样本，以及37名对照者的样本
485	2024-10-12	Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis 2024-Oct-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53104-9 PMID:39375367	研究论文	利用单细胞RNA测序技术揭示原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用及其分子机制	研究主要基于小鼠模型和PBC患者样本，可能存在种属差异	揭示原发性胆汁性胆管炎的病理机制并寻找潜在治疗靶点	原发性胆汁性胆管炎患者的肝脏免疫细胞	数字病理学	肝脏疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏样本
486	2024-10-12	Screening and validating genes associated with cuproptosis in systemic lupus erythematosus by expression profiling combined with machine learning 2024-Oct-02, Biomolecules & biomedicine DOI:10.17305/bb.2024.10996 PMID:39388708	研究论文	本文通过结合单细胞测序和机器学习技术，筛选并验证了与系统性红斑狼疮中铜死亡相关的基因	首次利用机器学习结合单细胞测序技术，识别系统性红斑狼疮中与铜死亡相关的基因	实验验证的样本量较小，可能影响结果的普适性	识别与系统性红斑狼疮中铜死亡相关的基因	系统性红斑狼疮患者的外周血样本	机器学习	系统性红斑狼疮	单细胞测序（scRNA-seq）	支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）	基因表达数据	两个微阵列基因表达数据集（GSE65391和GSE61635），以及单细胞RNA测序数据（GSE162577）
487	2024-10-12	Single-cell sequencing unveils the impact of aging on the progenitor cell diversity in the telencephalon of the female killifish N. furzeri 2024-Oct, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14251 PMID:38949249	研究论文	研究揭示了非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中衰老对前体细胞多样性的影响	首次通过单细胞RNA测序揭示了年轻成年雌性杀鱼端脑中前体细胞的多样性及其在衰老过程中的变化	研究仅限于特定品系的雌性杀鱼，结果的普适性有待进一步验证	探讨衰老对端脑中前体细胞多样性的影响及其分子机制	非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中的前体细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	年轻成年雌性杀鱼（GRZ-AD品系）的端脑样本
488	2024-10-12	Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals immune suppression subtypes and establishes a novel signature for determining the prognosis in lung adenocarcinoma 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00948-4 PMID:38616208	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型，并建立了一个新的预后标志物	本文首次通过多组学分析揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型，并发现了CDC25C基因作为潜在的预后标志物	本文的样本量较小，仅包括6对肺腺癌和邻近组织，可能影响结果的普适性	探索肺腺癌的生物学特性，识别新的生物标志物和治疗靶点	肺腺癌组织及其邻近组织	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	6对肺腺癌和邻近组织
489	2024-10-12	SCARF2 is a target for chronic obstructive pulmonary disease: Evidence from multi-omics research and cohort validation 2024-Oct, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14266 PMID:38958042	研究论文	本文通过多组学研究和队列验证，发现SCARF2蛋白是慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新靶点	首次通过多组学分析和遗传共定位验证了SCARF2蛋白在COPD中的保护作用	单细胞RNA分析结果与全转录组MR结果存在差异，需要进一步研究解释	确定慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新治疗靶点	SCARF2蛋白及其在COPD中的作用机制	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	全基因组元分析、转录组和蛋白质组孟德尔随机化、遗传共定位、单细胞转录组分析	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	2883例IPF病例和741,929例对照，17,547例COPD病例和617,598例对照，以及UK Biobank的个体数据
490	2024-10-12	Deciphering the molecular landscape: evolutionary progression from gynecomastia to aggressive male breast cancer 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00964-4 PMID:38888848	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了从男性乳腺发育异常（乳腺增生）到侵袭性男性乳腺癌的分子进化过程	首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了乳腺增生与男性乳腺癌之间的细胞景观，并揭示了CD13在驱动这一转变中的关键作用	研究主要集中在单细胞RNA测序和基因表达分析上，可能忽略了其他潜在的致癌机制	揭示从乳腺增生到男性乳腺癌的分子进化过程，并识别潜在的治疗靶点	乳腺增生和男性乳腺癌的细胞景观及其分子特征	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	涉及乳腺增生和男性乳腺癌的多个单细胞样本
491	2024-10-12	CBX1 is involved in hepatocellular carcinoma progression and resistance to sorafenib and lenvatinib via IGF-1R/AKT/SNAIL signaling pathway 2024-Oct, Hepatology international IF:5.9Q1 DOI:10.1007/s12072-024-10696-0 PMID:38769286	研究论文	研究CBX1在肝细胞癌进展和索拉非尼及乐伐替尼耐药中的作用及其通过IGF-1R/AKT/SNAIL信号通路的机制	首次探讨了CBX1在肝细胞癌中的作用及其通过IGF-1R/AKT/SNAIL信号通路促进癌症进展和耐药性的机制	研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的临床验证	探讨CBX1在肝细胞癌中的作用及其机制	CBX1在肝细胞癌中的表达及其对癌细胞增殖、侵袭、迁移和耐药性的影响	数字病理学	肝癌	实时聚合酶链反应 (RT-PCR), 蛋白质印迹 (WB), 免疫组化分析, 组织微阵列, CCK-8, 集落形成, Transwell侵袭, 划痕测试, 异种移植研究	NA	RNA序列, 组织	包括肝细胞癌和邻近非肿瘤组织样本, 以及裸鼠异种移植模型
492	2024-10-12	The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone 2024-Oct, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07822-1 PMID:39169177	研究论文	研究揭示了骨膜在癌症侵袭骨组织中的防御作用	首次展示了骨膜反应在抑制癌症侵袭骨组织中的生理作用，并揭示了TIMP1基因在其中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和人类头颈部鳞状细胞癌的病理分析，可能需要进一步的临床验证	探讨骨膜在癌症侵袭骨组织中的防御机制	骨膜、头颈部鳞状细胞癌、小鼠模型	NA	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	人类头颈部鳞状细胞癌病变样本和小鼠模型
493	2024-10-12	Retinoic acid, an essential component of the roof plate organizer, promotes the spatiotemporal segregation of dorsal neural fates 2024-Oct-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.202973 PMID:39250350	研究论文	研究视黄酸在胚胎发育中对背侧神经命运分离的影响	通过单细胞转录组学揭示了视黄酸在背侧神经命运分离中的分子机制	研究仅限于鹌鹑胚胎，可能不适用于其他物种	探讨视黄酸在背侧神经命运分离中的作用及其分子机制	鹌鹑胚胎中的背侧神经管及其相关细胞命运	发育生物学	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	鹌鹑胚胎中的单个细胞
494	2024-10-11	Investigating the mechanisms of inflammation and immune alterations in Parkinson's disease using spatial transcriptomics techniques 2024-Oct-15, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2024.111076 PMID:39306046	研究论文	研究通过空间转录组学技术探讨帕金森病中炎症和免疫变化的机制	首次通过空间转录组学技术揭示帕金森病发展过程中特定脑区的病理变化，并提出炎症和免疫变化通过诱导铁死亡加速疾病进展的假设	研究仅基于MPTP诱导的帕金森病小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证	探讨帕金森病中炎症和免疫变化的机制	帕金森病小鼠模型的中脑区域	数字病理学	神经退行性疾病	空间转录组学	NA	转录组数据	MPTP诱导的帕金森病小鼠模型
495	2024-10-11	Machine learning based on biological context facilitates the identification of microvascular invasion in intrahepatic cholangiocarcinoma 2024-Oct-10, Carcinogenesis IF:3.3Q2 DOI:10.1093/carcin/bgae052 PMID:39086220	研究论文	本研究利用随机森林模型构建了一个预测微血管侵犯（MVI）的模型，并揭示了其生物学基础	本研究首次结合单细胞转录组测序、全外显子测序和蛋白质组测序，构建了一个高准确性的MVI预测模型，并揭示了MVI相关的生物学机制	本研究仅限于肝内胆管癌，未涵盖其他类型的癌症	开发一个高准确性的微血管侵犯预测模型，并揭示其生物学机制	肝内胆管癌中的微血管侵犯	机器学习	肝内胆管癌	单细胞转录组测序、全外显子测序、蛋白质组测序	随机森林模型	基因组数据、蛋白质组数据	未明确提及具体样本数量
496	2024-10-11	Different inflammatory, fibrotic, and immunologic signatures between pre-fibrotic and overt primary myelofibrosis 2024-Oct-10, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.285598 PMID:39385733	研究论文	研究分析了不同阶段的原发性骨髓纤维化（PMF）中的炎症、纤维化和免疫特征	首次使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了从前期纤维化到明显纤维化的PMF进展中的细胞类型和子集特征	研究未能在PMF进展过程中识别出决定性的细胞子集	探讨原发性骨髓纤维化进展过程中不同细胞类型的炎症、纤维化和免疫功能变化	骨髓纤维化患者的前期和明显阶段的骨髓样本	NA	血液系统疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	包括前期纤维化PMF、明显纤维化PMF和其他骨髓增生性肿瘤（MPN）的骨髓样本
497	2024-10-11	Small Molecule Hydrogels Loading Small Molecule Drugs from Chinese Medicine for the Enhanced Treatment of Traumatic Brain Injury 2024-Oct-09, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c09097 PMID:39383335	研究论文	研究了一种源自中药的小分子药物负载的水凝胶，用于增强创伤性脑损伤的治疗	开发了一种无需额外药物加载或无活性成分的小分子水凝胶，具有易于制备、成本效益高和生物相容性好的优点	NA	探索一种新的创伤性脑损伤治疗方法	创伤性脑损伤及其治疗	NA	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
498	2024-10-11	Extraembryonic mesoderm cells derived from human embryonic stem cells rely on Wnt pathway activation 2024-Oct-09, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13761 PMID:39385268	研究论文	本文描述了一种三维分化方案，通过激活Wnt通路将人启动胚胎干细胞（hpESCs）诱导为外胚层间充质细胞（EXMCs），并进一步分化为间充质干细胞（MSCs）	首次展示了人启动胚胎干细胞可以通过激活Wnt通路分化为具有间充质干细胞特性的外胚层间充质细胞	研究仅限于体外实验，未涉及体内验证	开发一种新的方法，将人启动胚胎干细胞分化为外胚层间充质细胞及其后续的间充质干细胞	人启动胚胎干细胞（hpESCs）及其分化产物外胚层间充质细胞（EXMCs）和间充质干细胞（MSCs）	干细胞生物学	NA	单细胞转录组分析、免疫染色分析、细胞分选	NA	细胞	未明确提及具体样本数量
499	2024-10-11	Restoring social deficits in IRSp53-deleted mice: chemogenetic inhibition of ventral dentate gyrus Emx1-expressing cells 2024-Oct-07, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-024-03104-6 PMID:39375329	研究论文	研究通过化学遗传学抑制IRSp53缺失小鼠的腹侧齿状回Emx1表达细胞，恢复其社交缺陷	首次确定腹侧齿状回是IRSp53缺失导致社交缺陷的关键脑区，并通过化学遗传学抑制恢复社交缺陷	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨IRSp53缺失导致社交缺陷的脑区机制，并寻找潜在的治疗方法	IRSp53缺失小鼠的腹侧齿状回Emx1表达细胞	神经科学	精神疾病	化学遗传学抑制	NA	RNA测序	IRSp53缺失小鼠和对照小鼠
500	2024-10-11	The axis of tumor-associated macrophages, extracellular matrix proteins, and cancer-associated fibroblasts in oncogenesis 2024-Oct-07, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-024-03518-8 PMID:39375726	综述	本文综述了肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞在肿瘤发生中的相互关系	利用单细胞测序技术揭示了肿瘤微环境中细胞外基质蛋白的多样性及其在细胞间信号传导中的作用	需要整合单细胞数据并建立一个连贯的框架	探讨肿瘤微环境中细胞外基质蛋白、肿瘤相关巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用	肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞	NA	NA	单细胞测序	NA	NA	NA