单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 668 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals vascularization-associated cell subpopulations in dental pulp: PDGFRβ+ DPSCs with activated PI3K/AKT pathway
2024-Oct-09, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae051
PMID:39167061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牙髓中与血管化相关的细胞亚群，特别是PDGFRβ+ DPSCs，并探讨了其通过激活PI3K/AKT通路在牙髓再生中的作用 | 本研究首次定义了PDGFRβ+ DPSCs亚群，并揭示了其在牙髓再生中的重要作用和临床转化潜力 | 本研究主要集中在体外和基因编辑小鼠模型中，尚未进行临床试验验证 | 解决牙髓再生治疗中的挑战，特别是不同年龄和条件供体来源的DPSCs异质性问题 | 牙髓中的DPSCs及其亚群PDGFRβ+ DPSCs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基因编辑小鼠模型和体外培养的DPSCs |
| 462 | 2024-10-13 |
Intestinal newborn regulatory B cell antibodies modulate microbiota communities
2024-Oct-09, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.08.010
PMID:39243760
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研究论文 | 研究新生儿调节性B细胞产生的抗体如何调节微生物群落 | 首次发现新生儿调节性B细胞通过IL-10负调节IgM的产生，影响早期微生物群落的多样性和合作 | NA | 探讨新生儿调节性B细胞在早期生命中对微生物群落的影响 | 新生儿调节性B细胞及其产生的抗体 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 205个单克隆抗体 |
| 463 | 2024-10-13 |
Colorectal cancer-associated bacteria are broadly distributed in global microbiomes and drivers of precancerous change
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70702-1
PMID:39384807
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研究论文 | 研究分析了全球微生物组中与结直肠癌相关的细菌，并探讨了这些细菌在癌前病变中的作用 | 首次通过基因水平聚类方法识别出与结直肠癌或健康相关的细菌基因簇，并验证了这些细菌在癌前病变中的作用 | 研究主要基于已发表的宏基因组数据，缺乏对新样本的验证 | 确定全球人群中与结直肠癌和健康相关的肠道细菌的规模和成员 | 全球微生物组中的肠道细菌及其与结直肠癌的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 宏基因组测序 | NA | 基因数据 | 使用已发表的全球微生物组调查中的超深度宏基因组测序数据 |
| 464 | 2024-10-13 |
Single-cell analysis reveals alternations between the aged and young mice prostates
2024-Oct-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00666-x
PMID:39385256
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了老年和年轻小鼠前列腺的细胞类型和基因表达变化 | 首次揭示了老年小鼠前列腺中细胞类型和基因表达的显著变化，包括间充质细胞和免疫细胞比例的增加，以及与细胞衰老、氧化应激和再生相关的基因和通路的改变 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨老年和年轻小鼠前列腺的细胞和分子变化 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP算法 | 基因表达数据 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织样本 |
| 465 | 2024-10-13 |
Exosomal miR-106a-5p from highly metastatic colorectal cancer cells drives liver metastasis by inducing macrophage M2 polarization in the tumor microenvironment
2024-Oct-09, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03204-7
PMID:39385295
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研究论文 | 研究了高度转移性结直肠癌细胞分泌的外泌体miR-106a-5p如何通过诱导肿瘤微环境中巨噬细胞M2极化来驱动肝转移 | 揭示了外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的新机制，并发现其作为潜在生物标志物的可能性 | NA | 探讨外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的作用及其机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、外泌体miR-106a-5p | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、外泌体分离、免疫荧光、qRT-PCR、ELISA、流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 466 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-Oct-04, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）在揭示非模式生物在污染环境中的生理、适应和生化深度方面的关键作用 | scRNA-Seq不仅在疾病研究中得到广泛应用，还为非模式生物对环境污染物的反应提供了新的见解 | NA | 探讨scRNA-Seq在生物系统中揭示基因型-表型关系的作用，并展示其在非模式生物环境响应研究中的应用 | 非模式生物在污染环境中的细胞反应 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 467 | 2024-10-13 |
NME4 suppresses NFκB2-CCL5 axis, restricting CD8+ T cell tumour infiltration in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-Oct, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13838
PMID:39016535
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研究论文 | 研究NME4在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的免疫学意义及其对CD8+ T细胞浸润的抑制作用 | 首次探讨了NME4在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞浸润的抑制作用，并揭示了其通过调控NFκB2-CCL5轴的分子机制 | NME4表达在ESCC患者中的临床病理和预后重要性有限 | 探讨NME4在食管鳞状细胞癌中的免疫学意义及其对CD8+ T细胞浸润的影响 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）及其肿瘤微环境中的NME4表达 | 数字病理学 | 食管癌 | 多重免疫组化、单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、蛋白质微阵列筛选 | NA | 图像、基因表达数据 | 使用C57BL/6小鼠建立同基因肿瘤模型，并分析了NME4在AKR细胞系中的表达 |
| 468 | 2024-10-13 |
Inducible pluripotent stem cells to study human mast cell trajectories
2024-Oct, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.07.003
PMID:39038754
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研究论文 | 本文开发了一种基于诱导多能干细胞（iPSC）的人类肥大细胞分化体外模型，用于研究人类肥大细胞的分化轨迹 | 首次利用iPSC技术生成人类肥大细胞前体和功能成熟的肥大细胞群体 | NA | 研究人类肥大细胞的分化轨迹和亚型 | 人类肥大细胞 | 干细胞生物学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 547个细胞用于单细胞RNA测序分析 |
| 469 | 2024-10-13 |
Sympathetic neuropeptide Y protects from obesity by sustaining thermogenic fat
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07863-6
PMID:39198648
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研究论文 | 本文揭示了交感神经中的神经肽Y（NPY）通过维持产热脂肪来防止肥胖的机制 | 首次阐明了NPY在交感神经中的作用，及其通过维持壁细胞增殖来防止肥胖的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨NPY在交感神经中的作用及其对肥胖的影响 | 神经肽Y（NPY）、交感神经、壁细胞、产热脂肪 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 470 | 2024-09-07 |
Bridging gaps: a neural network approach for cross-species scRNA-seq analysis in COVID-19
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105324
PMID:39236555
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-10-13 |
Therapeutic single-cell landscape: methotrexate exacerbates interstitial lung disease by compromising the stemness of alveolar epithelial cells under systemic inflammation
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105339
PMID:39303666
|
研究论文 | 研究探讨了甲氨蝶呤和TNF抑制剂对类风湿性关节炎相关间质性肺病的影响 | 揭示了甲氨蝶呤通过损害肺泡上皮细胞的干性来加剧间质性肺病，而TNF抑制剂则能改善这些特征并抑制疾病进展 | 研究主要基于SKG小鼠模型和单细胞转录组学数据，可能无法完全反映人类情况 | 探讨甲氨蝶呤和TNF抑制剂对类风湿性关节炎相关间质性肺病的影响 | 类风湿性关节炎相关间质性肺病患者及SKG小鼠模型 | NA | 间质性肺病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | SKG小鼠模型及人类RA-ILD患者队列 |
| 472 | 2024-10-13 |
High mortality of Acinetobacter baumannii infection is attributed to macrophage-mediated induction of cytokine storm but preventable by naproxen
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105340
PMID:39303669
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研究论文 | 研究探讨了多药耐药鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制，并发现萘普生可预防由巨噬细胞介导的细胞因子风暴 | 揭示了鲍曼不动杆菌感染中巨噬细胞介导的细胞因子风暴机制，并发现萘普生可有效抑制炎症反应和M1极化，从而保护宿主免受致命感染 | NA | 解析鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制，并探索控制耐药感染的新策略 | 鲍曼不动杆菌感染的免疫反应和细胞因子风暴机制 | 免疫学 | 感染性疾病 | 流式细胞术、RNA测序、qRT-PCR、ELISA和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 473 | 2024-10-13 |
Neural network-assisted humanisation of COVID-19 hamster transcriptomic data reveals matching severity states in human disease
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105312
PMID:39317638
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研究论文 | 本文利用神经网络辅助的方法，分析了COVID-19仓鼠和人类单细胞转录组数据，揭示了不同疾病严重程度下的跨物种相似性 | 首次使用变分自编码器神经网络量化跨物种和疾病严重程度的转录组相似性，并识别出与疾病相关的关键基因和信号通路 | 仅限于分析仓鼠和人类的数据，未涉及其他动物模型 | 研究COVID-19在仓鼠和人类中的疾病机制，并开发跨物种的精确治疗策略 | COVID-19仓鼠和人类的单细胞转录组数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞转录组测序（scRNAseq） | 变分自编码器（VAE） | 转录组数据 | 来自人类和仓鼠的血液白细胞样本 |
| 474 | 2024-10-13 |
Single-cell multi-omics map of human fetal blood in Down syndrome
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07946-4
PMID:39322663
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研究论文 | 研究整合了单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据，分析了唐氏综合征胎儿血液中的造血异常 | 首次建立了唐氏综合征胎儿血液的单细胞多组学图谱，揭示了基因表达差异依赖于细胞类型和环境，并发现了造血干细胞在唐氏综合征中的分化倾向 | 研究样本量较小，仅包括3个二体和15个三体胎儿，可能影响结果的普适性 | 理解唐氏综合征中造血异常的分子机制 | 唐氏综合征胎儿的肝脏和骨髓样本 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 3个二体和15个三体胎儿的肝脏和骨髓样本，共110万个细胞 |
| 475 | 2024-10-12 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of bladder Ewing sarcoma
2024-Oct-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110921
PMID:39386756
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，深入研究了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制 | 首次揭示了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中特化的上皮细胞和肥大细胞的存在，并发现了TNFRSF12A的显著上调 | NA | 探讨膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制 | 膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中的特化细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA | 涉及膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的多个细胞类型 |
| 476 | 2024-10-12 |
CD8+ T cell associated scoring model helps prognostic diagnosis and immunotherapy selection in patients with colon adenocarcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37998
PMID:39386801
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研究论文 | 研究构建了一个基于CD8+ T细胞标记基因的评分模型，用于结肠腺癌患者的预后诊断和免疫治疗选择 | 首次基于CD8+ T细胞标记基因构建了一个新的预后评分模型，并验证了其在区分患者免疫治疗反应中的有效性 | 研究仅使用了5个数据集，样本量相对较小，可能影响模型的普适性 | 开发一种新的预后评分模型，用于结肠腺癌患者的预后预测和免疫治疗选择 | 结肠腺癌患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞转录组测序和Bulk转录组测序 | Lasso回归模型 | 转录组数据 | 5个数据集，包括单细胞和Bulk转录组数据 |
| 477 | 2024-10-12 |
The role of fibroblast in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: a key player in the inflammatory process
2024-Oct-11, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2414774
PMID:39378160
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综述 | 本文综述了纤维母细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中的关键作用，特别是鼻息肉来源的纤维母细胞（NPDFs）在炎症反应中的作用 | 本文通过单细胞RNA测序数据深入探讨了CRSwNP中纤维母细胞的异质性和功能机制，指出了纤维母细胞作为治疗CRSwNP的有前景的治疗靶点 | 尽管有这些进展，纤维母细胞靶向疗法在CRSwNP的临床开发中仍然面临挑战 | 深入理解纤维母细胞在CRSwNP发病机制中的具体作用，以开发针对性的治疗方法 | 纤维母细胞在CRSwNP中的作用及其在炎症反应和组织重塑中的关键角色 | NA | 鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 478 | 2024-10-12 |
YAP Overcomes Mechanical Barriers to Induce Mitotic Rounding and Adult Cardiomyocyte Division
2024-Oct-11, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究探讨了YAP5SA如何克服机械屏障，诱导成年心肌细胞的细胞周期重新进入和分裂 | 揭示了YAP5SA通过克服心肌微环境的机械约束，诱导心肌细胞进行有丝分裂圆化和分裂的新机制 | 主要基于细胞培养模型，对哺乳动物细胞周期停滞的理解有限 | 探讨成年哺乳动物心肌细胞如何通过YAP5SA重新进入细胞周期并分裂 | 成年心肌细胞及其细胞周期 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | YAP5SA心肌细胞克隆，其中>20%包含≥2个心肌细胞 |
| 479 | 2024-10-12 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing comparison of CD4+, CD8+ and T-cell receptor γδ+ cutaneous T-cell lymphomas reveals subset-specific molecular phenotypes
2024-Oct-11, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae374
PMID:39392468
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-10-12 |
Integrating Metabolic RNA Labeling-Based Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics for Spatiotemporal Transcriptomic Analysis
2024-Oct-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401297
PMID:39390840
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研究论文 | 本文展示了将基于代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序与空间转录组学结合，用于时空转录组分析的新方法 | 首次将时间分辨单细胞RNA测序与空间转录组学结合，揭示了胶质母细胞瘤细胞中的EZH2介导的间充质转化途径及其在肿瘤微环境中的相互作用 | NA | 揭示基因表达的时空动态及其在疾病中的调控机制 | 胶质母细胞瘤细胞及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 单细胞测序 | 脑癌 | 基于代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序（scRNA-seq）与空间转录组学 | NA | RNA | NA |