单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 580 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-10-15 |
Investigating PPT2's role in ovarian cancer prognosis and immunotherapy outcomes
2024-Oct-11, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01527-9
PMID:39394143
|
研究论文 | 研究探讨了PPT2基因在卵巢癌预后和免疫治疗结果中的作用 | 首次系统研究了PPT2基因在卵巢癌中的表达与预后、免疫浸润及分子机制的关系 | 需要进一步研究PPT2与免疫治疗效果在卵巢癌患者中的关系 | 确定PPT2表达与卵巢癌预后、免疫浸润及潜在分子机制的关联 | PPT2基因在卵巢癌中的表达及其对预后和免疫治疗结果的影响 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、GTEx和GEO数据库的RNA-seq和临床数据，以及内部数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-10-15 |
Immunometabolic changes and potential biomarkers in CFS peripheral immune cells revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Oct-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05710-w
PMID:39394558
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并发现了潜在的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并识别出ESRRA-APP-CD74信号通路作为潜在的生物标志物 | 样本量较小且仅评估了外周血 | 探讨慢性疲劳综合征的病理机制及其潜在的生物标志物 | 慢性疲劳综合征患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名慢性疲劳综合征患者和4名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-10-14 |
Prognostic risk model of LIHC T-cells based on scRNA-seq and RNA-seq and the regulation of the tumor immune microenvironment
2024-Oct-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01424-z
PMID:39388011
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和RNA测序数据，构建了LIHC患者的T细胞标记基因的预后风险模型，并探讨了该模型对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次基于T细胞标记基因构建了LIHC患者的预后风险模型，并验证了其在独立数据集中的有效性 | 研究仅限于TCGA和GEO数据库的数据，未涵盖所有可能的临床样本 | 开发一种基于T细胞标记基因的预后风险模型，用于预测LIHC患者的生存结果和免疫治疗效果 | LIHC患者的T细胞标记基因及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 风险模型 | 基因数据 | 860个T细胞标记基因，TCGA-LIHC数据集和独立GEO数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-10-14 |
Discovery of prognostic lncRNAs in colorectal cancer using spatial transcriptomics
2024-Oct-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00728-1
PMID:39390212
|
研究论文 | 研究利用空间转录组学技术在结直肠癌中发现与预后相关的长链非编码RNA（lncRNA） | 首次利用空间转录组学技术研究结直肠癌中的lncRNA，提供更精确的细胞类型特异性表达数据 | 研究仅限于结直肠癌，且样本量较小，需要进一步验证和扩大样本量 | 发现结直肠癌中与转移相关的lncRNA，作为早期风险评估的潜在生物标志物 | 结直肠癌中的lncRNA及其在肿瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | RNA | 301个与恶性结直肠癌区域相关的lncRNA | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-10-14 |
Rewriting cellular fate: epigenetic interventions in obesity and cellular programming
2024-Oct-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00944-2
PMID:39390356
|
研究论文 | 本文讨论了表观遗传干预在肥胖和细胞编程中的机制 | 本文详细分析了表观遗传调控在肥胖中的作用，并介绍了多种用于揭示这些调控的方法 | NA | 探讨表观遗传干预如何影响肥胖，并分析相关的方法 | 肥胖和细胞编程 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体细胞核移植、细胞融合 | NA | 基因表达数据、表观遗传标记数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-10-14 |
Key platelet genes play important roles in predicting the prognosis of sepsis
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74052-w
PMID:39384856
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，结合多种算法分析，构建了一个稳定的脓毒症预后模型 | 首次通过scRNA-seq技术识别脓毒症患者中的关键细胞，并结合批量RNA-seq数据和多种算法构建预后模型 | 研究样本量较小，且仅基于GEO数据库的数据，可能影响模型的普适性 | 通过scRNA-seq和批量RNA-seq数据，结合多种算法分析，构建一个稳定的脓毒症预后模型 | 脓毒症患者的预后预测 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），定量实时PCR（qRT-PCR） | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 9个样本的scRNA-seq数据，批量RNA-seq数据来自GEO数据库，qRT-PCR在CLP诱导的脓毒症小鼠模型中进行 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-10-14 |
Single-cell sequencing analysis reveals the dynamic tumour ecosystems of primary and metastatic lymph nodes in nasopharyngeal carcinoma
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70137
PMID:39392128
|
研究论文 | 研究分析了鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组，揭示了肿瘤生态系统的动态变化 | 首次系统地描述了鼻咽癌原发和转移淋巴结肿瘤的生态系统，揭示了免疫微环境和细胞间通讯的复杂性 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 揭示鼻咽癌淋巴结转移的肿瘤生态系统，为治疗策略提供依据 | 鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 47,618个单细胞，来自8个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptome and chromatin accessibility mapping of upper lip and primary palate fusion
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70128
PMID:39392189
|
研究论文 | 研究使用单细胞转录组和染色质可及性测序技术，分析了小鼠胚胎在关键发育阶段的唇腭融合过程 | 首次结合单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术，揭示了唇腭融合过程中不同细胞亚群的转录特征和染色质可及性变化 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 揭示唇腭融合的分子机制 | 小鼠胚胎的唇腭融合过程 | 数字病理学 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | C57BL/6J小鼠胚胎在10.5、11.5和12.5胚胎日的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-10-13 |
Landscape of epithelial cell subpopulations in the human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38091
PMID:39391485
|
研究论文 | 研究揭示了人食管鳞状细胞癌微环境中上皮细胞亚群的景观及其在食管鳞状细胞癌发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率下获得了食管鳞状细胞癌的上皮细胞图谱，并揭示了上皮细胞在癌症进展中的作用及其对NK/T细胞的免疫抑制信号 | NA | 探索上皮细胞亚群在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞亚群及其在癌症发展中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及食管鳞状细胞癌及其邻近组织的11个主要细胞亚群和4个上皮细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse cardiac cells in response to retinoic acid
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38301
PMID:39391486
|
研究论文 | 研究了视黄酸对小鼠心脏细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析视黄酸对小鼠心脏发育过程中细胞和分子机制的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类心脏疾病的研究 | 揭示视黄酸对心脏畸形的影响机制 | 小鼠心脏细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69,447个细胞，来自从E8.5到E17.5的七个发育阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-10-13 |
Cross-species comparison of airway epithelium transcriptomics
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38259
PMID:39391497
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类、猴子、小鼠和大鼠在健康和哮喘条件下的肺细胞转录组相似性和差异 | 首次进行了跨物种的肺细胞转录组全面比较，揭示了跨物种细胞特异性标记基因、转录因子和生物通路的保守性 | 研究仅限于四种物种，且未涵盖所有可能的肺部疾病状态 | 探讨不同物种间肺细胞转录组的相似性和差异，以及这些差异在哮喘中的作用 | 人类、猴子、小鼠和大鼠的肺细胞在健康和哮喘条件下的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及四种物种的肺细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-10-13 |
Germinal center B-cell subgroups in the tumor microenvironment cannot be overlooked: Their involvement in prognosis, immunotherapy response, and treatment resistance in head and neck squamous carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37726
PMID:39391510
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群，并构建了相关的风险预测模型 | 首次将生发中心B细胞（GCB）识别为B细胞特异性预后生物标志物，填补了头颈部鳞状细胞癌遗传预后预测模型的研究空白 | NA | 寻找新的生物标志物以实现头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和预测早期复发和转移 | 头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群及其在预后、免疫治疗反应和治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 头颈部鳞状细胞癌组织和外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-10-13 |
Intestinal newborn regulatory B cell antibodies modulate microbiota communities
2024-Oct-09, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.08.010
PMID:39243760
|
研究论文 | 研究新生儿调节性B细胞产生的抗体如何调节微生物群落 | 首次发现新生儿调节性B细胞通过IL-10负调节IgM的产生，影响早期微生物群落的多样性和合作 | NA | 探讨新生儿调节性B细胞在早期生命中对微生物群落的影响 | 新生儿调节性B细胞及其产生的抗体 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 205个单克隆抗体 | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-10-13 |
Single-cell analysis reveals alternations between the aged and young mice prostates
2024-Oct-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00666-x
PMID:39385256
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了老年和年轻小鼠前列腺的细胞类型和基因表达变化 | 首次揭示了老年小鼠前列腺中细胞类型和基因表达的显著变化，包括间充质细胞和免疫细胞比例的增加，以及与细胞衰老、氧化应激和再生相关的基因和通路的改变 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨老年和年轻小鼠前列腺的细胞和分子变化 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | UMAP算法 | 基因表达数据 | 2个月和24个月的小鼠前列腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-10-13 |
Exosomal miR-106a-5p from highly metastatic colorectal cancer cells drives liver metastasis by inducing macrophage M2 polarization in the tumor microenvironment
2024-Oct-09, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03204-7
PMID:39385295
|
研究论文 | 研究了高度转移性结直肠癌细胞分泌的外泌体miR-106a-5p如何通过诱导肿瘤微环境中巨噬细胞M2极化来驱动肝转移 | 揭示了外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的新机制，并发现其作为潜在生物标志物的可能性 | NA | 探讨外泌体miR-106a-5p在结直肠癌肝转移中的作用及其机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、外泌体miR-106a-5p | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、外泌体分离、免疫荧光、qRT-PCR、ELISA、流式细胞术 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-10-13 |
High mortality of Acinetobacter baumannii infection is attributed to macrophage-mediated induction of cytokine storm but preventable by naproxen
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105340
PMID:39303669
|
研究论文 | 研究探讨了多药耐药鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制，并发现萘普生可预防由巨噬细胞介导的细胞因子风暴 | 揭示了鲍曼不动杆菌感染中巨噬细胞介导的细胞因子风暴机制，并发现萘普生可有效抑制炎症反应和M1极化，从而保护宿主免受致命感染 | NA | 解析鲍曼不动杆菌感染的高死亡率机制，并探索控制耐药感染的新策略 | 鲍曼不动杆菌感染的免疫反应和细胞因子风暴机制 | 免疫学 | 感染性疾病 | 流式细胞术、RNA测序、qRT-PCR、ELISA和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-10-13 |
Neural network-assisted humanisation of COVID-19 hamster transcriptomic data reveals matching severity states in human disease
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105312
PMID:39317638
|
研究论文 | 本文利用神经网络辅助的方法，分析了COVID-19仓鼠和人类单细胞转录组数据，揭示了不同疾病严重程度下的跨物种相似性 | 首次使用变分自编码器神经网络量化跨物种和疾病严重程度的转录组相似性，并识别出与疾病相关的关键基因和信号通路 | 仅限于分析仓鼠和人类的数据，未涉及其他动物模型 | 研究COVID-19在仓鼠和人类中的疾病机制，并开发跨物种的精确治疗策略 | COVID-19仓鼠和人类的单细胞转录组数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞转录组测序（scRNAseq） | 变分自编码器（VAE） | 转录组数据 | 来自人类和仓鼠的血液白细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-10-12 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of bladder Ewing sarcoma
2024-Oct-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110921
PMID:39386756
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，深入研究了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制 | 首次揭示了膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中特化的上皮细胞和肥大细胞的存在，并发现了TNFRSF12A的显著上调 | NA | 探讨膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的发病机制 | 膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤中的特化细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA | 涉及膀胱Ewing肉瘤/原始神经外胚层肿瘤的多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-10-12 |
CD8+ T cell associated scoring model helps prognostic diagnosis and immunotherapy selection in patients with colon adenocarcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37998
PMID:39386801
|
研究论文 | 研究构建了一个基于CD8+ T细胞标记基因的评分模型，用于结肠腺癌患者的预后诊断和免疫治疗选择 | 首次基于CD8+ T细胞标记基因构建了一个新的预后评分模型，并验证了其在区分患者免疫治疗反应中的有效性 | 研究仅使用了5个数据集，样本量相对较小，可能影响模型的普适性 | 开发一种新的预后评分模型，用于结肠腺癌患者的预后预测和免疫治疗选择 | 结肠腺癌患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞转录组测序和Bulk转录组测序 | Lasso回归模型 | 转录组数据 | 5个数据集，包括单细胞和Bulk转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-10-12 |
Single-cell sequencing analysis revealed that NEAT1 was a potential biomarker and therapeutic target of prostate cancer
2024-Oct-08, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12926-y
PMID:39379919
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了NEAT1作为前列腺癌潜在生物标志物和治疗靶点的可能性 | 首次通过单细胞RNA测序数据探讨NEAT1在前列腺癌中的作用，并验证了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和细胞衍生异种移植模型，缺乏临床试验验证 | 探索前列腺癌发生相关的生物标志物，并验证NEAT1作为潜在治疗靶点的可能性 | 前列腺癌样本及其相关细胞亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 包括正常、良性前列腺增生和前列腺癌样本，具体数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |