单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
461	2024-10-12	Single-cell dissection reveals promotive role of ENO1 in leukemia stem cell self-renewal and chemoresistance in acute myeloid leukemia 2024-Oct-08, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03969-w PMID:39380054	研究论文	研究探讨了ENO1在急性髓系白血病（AML）中对白血病干细胞（LSCs）自我更新和化疗耐药性的促进作用	首次揭示了ENO1在AML中对LSCs自我更新和化疗耐药性的关键作用，并提出了ENO1作为AML靶向治疗和预后标志物的潜力	研究样本量较小，且仅限于AML患者和健康对照组，未来需要更大规模的研究来验证结果	探讨ENO1在AML中对LSCs自我更新和化疗耐药性的影响及其机制	AML患者的骨髓样本和AML细胞系	数字病理学	血液肿瘤	单细胞RNA测序	机器学习	RNA	8名复发/难治性AML患者和4名健康对照者的骨髓样本，以及37名对照者的样本
462	2024-10-12	Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis 2024-Oct-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53104-9 PMID:39375367	研究论文	利用单细胞RNA测序技术揭示原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用及其分子机制	研究主要基于小鼠模型和PBC患者样本，可能存在种属差异	揭示原发性胆汁性胆管炎的病理机制并寻找潜在治疗靶点	原发性胆汁性胆管炎患者的肝脏免疫细胞	数字病理学	肝脏疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏样本
463	2024-10-12	Single-cell sequencing unveils the impact of aging on the progenitor cell diversity in the telencephalon of the female killifish N. furzeri 2024-Oct, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14251 PMID:38949249	研究论文	研究揭示了非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中衰老对前体细胞多样性的影响	首次通过单细胞RNA测序揭示了年轻成年雌性杀鱼端脑中前体细胞的多样性及其在衰老过程中的变化	研究仅限于特定品系的雌性杀鱼，结果的普适性有待进一步验证	探讨衰老对端脑中前体细胞多样性的影响及其分子机制	非洲蓝绿杀鱼（N. furzeri）端脑中的前体细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	年轻成年雌性杀鱼（GRZ-AD品系）的端脑样本
464	2024-10-12	Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals immune suppression subtypes and establishes a novel signature for determining the prognosis in lung adenocarcinoma 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00948-4 PMID:38616208	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型，并建立了一个新的预后标志物	本文首次通过多组学分析揭示了肺腺癌中的免疫抑制亚型，并发现了CDC25C基因作为潜在的预后标志物	本文的样本量较小，仅包括6对肺腺癌和邻近组织，可能影响结果的普适性	探索肺腺癌的生物学特性，识别新的生物标志物和治疗靶点	肺腺癌组织及其邻近组织	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	6对肺腺癌和邻近组织
465	2024-10-12	SCARF2 is a target for chronic obstructive pulmonary disease: Evidence from multi-omics research and cohort validation 2024-Oct, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14266 PMID:38958042	研究论文	本文通过多组学研究和队列验证，发现SCARF2蛋白是慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新靶点	首次通过多组学分析和遗传共定位验证了SCARF2蛋白在COPD中的保护作用	单细胞RNA分析结果与全转录组MR结果存在差异，需要进一步研究解释	确定慢性阻塞性肺疾病（COPD）的新治疗靶点	SCARF2蛋白及其在COPD中的作用机制	数字病理学	慢性阻塞性肺疾病	全基因组元分析、转录组和蛋白质组孟德尔随机化、遗传共定位、单细胞转录组分析	NA	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	2883例IPF病例和741,929例对照，17,547例COPD病例和617,598例对照，以及UK Biobank的个体数据
466	2024-10-12	Deciphering the molecular landscape: evolutionary progression from gynecomastia to aggressive male breast cancer 2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands) DOI:10.1007/s13402-024-00964-4 PMID:38888848	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了从男性乳腺发育异常（乳腺增生）到侵袭性男性乳腺癌的分子进化过程	首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了乳腺增生与男性乳腺癌之间的细胞景观，并揭示了CD13在驱动这一转变中的关键作用	研究主要集中在单细胞RNA测序和基因表达分析上，可能忽略了其他潜在的致癌机制	揭示从乳腺增生到男性乳腺癌的分子进化过程，并识别潜在的治疗靶点	乳腺增生和男性乳腺癌的细胞景观及其分子特征	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	涉及乳腺增生和男性乳腺癌的多个单细胞样本
467	2024-10-12	The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone 2024-Oct, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07822-1 PMID:39169177	研究论文	研究揭示了骨膜在癌症侵袭骨组织中的防御作用	首次展示了骨膜反应在抑制癌症侵袭骨组织中的生理作用，并揭示了TIMP1基因在其中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和人类头颈部鳞状细胞癌的病理分析，可能需要进一步的临床验证	探讨骨膜在癌症侵袭骨组织中的防御机制	骨膜、头颈部鳞状细胞癌、小鼠模型	NA	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	人类头颈部鳞状细胞癌病变样本和小鼠模型
468	2024-10-12	Retinoic acid, an essential component of the roof plate organizer, promotes the spatiotemporal segregation of dorsal neural fates 2024-Oct-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.202973 PMID:39250350	研究论文	研究视黄酸在胚胎发育中对背侧神经命运分离的影响	通过单细胞转录组学揭示了视黄酸在背侧神经命运分离中的分子机制	研究仅限于鹌鹑胚胎，可能不适用于其他物种	探讨视黄酸在背侧神经命运分离中的作用及其分子机制	鹌鹑胚胎中的背侧神经管及其相关细胞命运	发育生物学	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	鹌鹑胚胎中的单个细胞
469	2024-10-11	Machine learning based on biological context facilitates the identification of microvascular invasion in intrahepatic cholangiocarcinoma 2024-Oct-10, Carcinogenesis IF:3.3Q2 DOI:10.1093/carcin/bgae052 PMID:39086220	研究论文	本研究利用随机森林模型构建了一个预测微血管侵犯（MVI）的模型，并揭示了其生物学基础	本研究首次结合单细胞转录组测序、全外显子测序和蛋白质组测序，构建了一个高准确性的MVI预测模型，并揭示了MVI相关的生物学机制	本研究仅限于肝内胆管癌，未涵盖其他类型的癌症	开发一个高准确性的微血管侵犯预测模型，并揭示其生物学机制	肝内胆管癌中的微血管侵犯	机器学习	肝内胆管癌	单细胞转录组测序、全外显子测序、蛋白质组测序	随机森林模型	基因组数据、蛋白质组数据	未明确提及具体样本数量
470	2024-10-11	Small Molecule Hydrogels Loading Small Molecule Drugs from Chinese Medicine for the Enhanced Treatment of Traumatic Brain Injury 2024-Oct-09, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c09097 PMID:39383335	研究论文	研究了一种源自中药的小分子药物负载的水凝胶，用于增强创伤性脑损伤的治疗	开发了一种无需额外药物加载或无活性成分的小分子水凝胶，具有易于制备、成本效益高和生物相容性好的优点	NA	探索一种新的创伤性脑损伤治疗方法	创伤性脑损伤及其治疗	NA	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
471	2024-10-11	Restoring social deficits in IRSp53-deleted mice: chemogenetic inhibition of ventral dentate gyrus Emx1-expressing cells 2024-Oct-07, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-024-03104-6 PMID:39375329	研究论文	研究通过化学遗传学抑制IRSp53缺失小鼠的腹侧齿状回Emx1表达细胞，恢复其社交缺陷	首次确定腹侧齿状回是IRSp53缺失导致社交缺陷的关键脑区，并通过化学遗传学抑制恢复社交缺陷	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨IRSp53缺失导致社交缺陷的脑区机制，并寻找潜在的治疗方法	IRSp53缺失小鼠的腹侧齿状回Emx1表达细胞	神经科学	精神疾病	化学遗传学抑制	NA	RNA测序	IRSp53缺失小鼠和对照小鼠
472	2024-10-11	The axis of tumor-associated macrophages, extracellular matrix proteins, and cancer-associated fibroblasts in oncogenesis 2024-Oct-07, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-024-03518-8 PMID:39375726	综述	本文综述了肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞在肿瘤发生中的相互关系	利用单细胞测序技术揭示了肿瘤微环境中细胞外基质蛋白的多样性及其在细胞间信号传导中的作用	需要整合单细胞数据并建立一个连贯的框架	探讨肿瘤微环境中细胞外基质蛋白、肿瘤相关巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用	肿瘤相关巨噬细胞、细胞外基质蛋白和癌症相关成纤维细胞	NA	NA	单细胞测序	NA	NA	NA
473	2024-10-11	Phenotype remodelling of HNSCC cells in the muscle invasion environment 2024-Oct-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05607-8 PMID:39375763	研究论文	研究探讨了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞在肌肉侵袭环境中的表型重塑及其与肿瘤微环境的相互作用	首次揭示了肌肉侵袭性HNSCC细胞的表型功能及其与肿瘤微环境的相互作用，并发现了G0S2作为肌肉侵袭性癌细胞的新标记物	NA	研究肌肉侵袭性HNSCC细胞的表型功能及其与肿瘤微环境的相互作用	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞及其在肌肉侵袭环境中的表型变化	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间RNA测序（ST）	NA	RNA测序数据	共使用了来自多个数据集的168个样本，包括scRNA-seq数据（N=55）、空间RNA-seq数据（N=4）和转录组数据（N=109）
474	2024-10-11	The generation of stable microvessels in ischemia is mediated by endothelial cell derived TRAIL 2024-Oct-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adn8760 PMID:39365855	研究论文	本文探讨了肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体（TRAIL）在缺血条件下促进新血管生成和血管稳定中的作用	发现TRAIL在健康循环中的内皮细胞中起重要作用，并在外周动脉疾病（PAD）中受损	NA	研究TRAIL在缺血条件下促进新血管生成和血管稳定的作用机制	内皮细胞（EC）和周细胞在缺血条件下的相互作用	NA	外周动脉疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
475	2024-10-11	MerTK+ macrophages promote melanoma progression and immunotherapy resistance through AhR-ALKAL1 activation 2024-Oct-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.ado8366 PMID:39365866	研究论文	研究了MerTK+巨噬细胞通过AhR-ALKAL1激活促进黑色素瘤进展和免疫治疗抵抗的机制	首次揭示了ALKAL1作为AhR的靶基因促进MerTK磷酸化，增强MerTK巨噬细胞的吞噬活性和免疫抑制表型的机制	仅在实验小鼠模型中验证了机制，尚未在人体中进行验证	揭示MerTK+巨噬细胞在黑色素瘤进展和免疫治疗抵抗中的作用机制	MerTK+巨噬细胞及其在黑色素瘤中的功能	免疫学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	实验小鼠模型
476	2024-10-11	Proximity-dependent labeling identifies dendritic cells that drive the tumor-specific CD4+ T cell response 2024-Oct-04, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adq8843 PMID:39365874	研究论文	研究使用基于LIPSTIC的单细胞转录组学方法，识别出能够向CD4 T细胞呈递抗原的树突状细胞（DCs），并探讨了这些DCs在肿瘤引流淋巴结（tdLN）和肿瘤微环境（TME）中的作用	首次使用LIPSTIC技术识别出在tdLN和TME中与CD4 T细胞相互作用的DCs，并发现这些DCs具有相似的超激活转录表型	NA	探讨树突状细胞在肿瘤特异性CD4+ T细胞反应中的作用及其与免疫检查点阻断疗法的关系	树突状细胞（DCs）、肿瘤引流淋巴结（tdLN）、肿瘤微环境（TME）、CD4 T细胞	免疫学	NA	LIPSTIC（Labeling Immune Partnerships by SorTagging Intercellular Contacts）	NA	单细胞转录组	NA
477	2024-10-11	Absent, but not glucocorticoid-modulated, corticotropin-releasing hormone (Crh) regulates anxiety-like behaviors in mice 2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.23.614550 PMID:39386648	研究论文	研究探讨了皮质酮释放激素（Crh）在调节小鼠焦虑样行为中的作用，特别是在下丘脑-垂体-肾上腺（HPA）轴中的作用	发现下丘脑Crh的表达在原发性肾上腺功能不全或地塞米松（DEX）治疗下并不改变小鼠的焦虑行为	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	探讨Crh在下丘脑-垂体-肾上腺轴中的作用及其对焦虑样行为的影响	小鼠的焦虑样行为和下丘脑Crh的表达	NA	NA	空间转录组学和ELISA	NA	行为数据和生物标志物	野生型（WT）小鼠、原发性肾上腺功能不全（KO）小鼠和Crh全局缺失（KO）小鼠
478	2024-10-11	Synergy Between NK Cells and Monocytes in Potentiating Cardiovascular Disease Risk in Severe COVID-19 2024-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321085 PMID:38989579	研究论文	研究探讨了自然杀伤细胞（NK细胞）和单核细胞在严重COVID-19患者中增加心血管疾病风险的协同作用	首次揭示了NK细胞和单核细胞在严重COVID-19患者中心血管疾病风险增加中的具体机制	研究样本量较小，且仅限于严重COVID-19患者，可能限制了结果的普适性	探讨严重COVID-19患者中心血管疾病风险增加的免疫机制	严重COVID-19患者、康复患者和未感染SARS-CoV-2的对照组	心血管疾病	心血管疾病	光谱流式细胞术、单细胞转录组分析	NA	血液样本	共77名参与者，包括31名严重COVID-19患者、29名康复患者和17名未感染对照组
479	2024-10-11	Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing 2024-Oct, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.13663 PMID:38770541	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，分析了一名慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者在疾病进展和治疗反应中的动态变化	首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了耐药CLL细胞的克隆进化过程，并追踪了高基因组复杂性细胞的早期形成	研究仅基于单一患者的数据，结果的普适性有待进一步验证	揭示耐药CLL细胞的动态变化和分子特征，为早期识别耐药细胞提供新视角	慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者的耐药细胞	数字病理学	血液系统疾病	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	单一患者
480	2024-10-11	Tobacco smoking is associated with sex- and plaque-type specific upregulation of CRLF1 in atherosclerotic lesions 2024-10, Atherosclerosis IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.atherosclerosis.2024.118554 PMID:39137621	研究论文	研究探讨了烟草吸烟对动脉粥样硬化斑块中CRLF1基因表达的影响，并分析了性别和斑块类型的特异性上调	首次揭示了烟草吸烟导致的动脉粥样硬化斑块中CRLF1基因的性别和斑块类型特异性上调	研究样本量相对较小，且仅限于颈动脉斑块	探讨烟草吸烟对动脉粥样硬化斑块基因表达的影响及其性别特异性	动脉粥样硬化斑块中的基因表达	心血管疾病	心血管疾病	RNA-seq	NA	基因表达数据	625个颈动脉斑块（151个女性和474个男性）