单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 668 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-10-15 |
Identification of novel biomarkers for atherosclerosis using single-cell RNA sequencing and machine learning
2024-Oct-14, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-024-10077-w
PMID:39400603
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习技术识别动脉粥样硬化的潜在生物标志物 | 利用单细胞RNA测序和加权共表达网络分析结合机器学习技术，识别出与动脉粥样硬化相关的256个差异表达基因，并验证了C1QC和COL1A1作为潜在的诊断标志物 | NA | 识别动脉粥样硬化的潜在生物标志物 | 动脉粥样硬化相关的差异表达基因及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、加权共表达网络分析、LASSO、SVM-RFE、CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 动脉粥样硬化和正常样本，以及小鼠和人类样本 |
| 442 | 2024-10-15 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveals the Regional Division of the Spatial Structure of MASH Fibrosis
2024-Oct-14, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.16125
PMID:39400982
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研究论文 | 研究使用空间转录组学和单细胞RNA测序技术分析了MASH纤维化在肝脏中的区域分布，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次描述了MASH纤维化中基因表达的谱系特异性变化、亚群组成和伪时间分析，揭示了潜在的治疗靶点 | NA | 阐明代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）纤维化在肝脏中的区域分布，并识别潜在的治疗靶点 | 健康对照组、单纯脂肪变性患者和MASH患者的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照组、单纯脂肪变性患者和MASH患者的肝脏组织样本 |
| 443 | 2024-10-15 |
Investigating PPT2's role in ovarian cancer prognosis and immunotherapy outcomes
2024-Oct-11, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01527-9
PMID:39394143
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研究论文 | 研究探讨了PPT2基因在卵巢癌预后和免疫治疗结果中的作用 | 首次系统研究了PPT2基因在卵巢癌中的表达与预后、免疫浸润及分子机制的关系 | 需要进一步研究PPT2与免疫治疗效果在卵巢癌患者中的关系 | 确定PPT2表达与卵巢癌预后、免疫浸润及潜在分子机制的关联 | PPT2基因在卵巢癌中的表达及其对预后和免疫治疗结果的影响 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、GTEx和GEO数据库的RNA-seq和临床数据，以及内部数据集 |
| 444 | 2024-10-15 |
Immunometabolic changes and potential biomarkers in CFS peripheral immune cells revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Oct-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05710-w
PMID:39394558
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并发现了潜在的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并识别出ESRRA-APP-CD74信号通路作为潜在的生物标志物 | 样本量较小且仅评估了外周血 | 探讨慢性疲劳综合征的病理机制及其潜在的生物标志物 | 慢性疲劳综合征患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名慢性疲劳综合征患者和4名健康对照 |
| 445 | 2024-10-15 |
SpatialDeX is a Reference-Free Method for Cell Type Deconvolution of Spatial Transcriptomics Data in Solid Tumors
2024-Oct-10, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1472
PMID:39387817
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialDeX的无参考方法，用于固体肿瘤空间转录组数据中的细胞类型反卷积 | SpatialDeX在模拟和实验空间转录组数据中均表现出色，优于其他无参考方法，并且在泛癌聚类分析中揭示了不同癌症类型间的独特肿瘤进展机制 | NA | 开发一种无需参考的细胞类型反卷积方法，用于解析空间转录组数据中的细胞组织结构 | 固体肿瘤的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 回归模型 | 转录组数据 | NA |
| 446 | 2024-10-15 |
Single-cell RNA transcriptomic analyses of tumor microenvironment of ovarian metastasis in gastric cancer
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00974-2
PMID:39162990
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 首次综合分析了胃癌卵巢转移的免疫微环境，并识别了与转移相关的特定细胞类型和基因特征 | 样本量较小，仅分析了两对临床样本 | 揭示胃癌卵巢转移的免疫微环境，促进新治疗策略的发现 | 胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两对临床样本 |
| 447 | 2024-09-25 |
Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics
2024-Oct, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907
PMID:39206540
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-10-14 |
A tumor cornification and immune-infiltration-based scheme for anti-PD-1 plus chemotherapy response in advanced squamous cell lung carcinoma
2024-Oct-11, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.09.005
PMID:39395411
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研究论文 | 本文探讨了鳞状细胞肺癌中肿瘤角化和免疫浸润对PD-1抑制剂联合化疗疗效的影响 | 提出了基于肿瘤角化和免疫浸润特征的新分类方案LICC，用于预测PD-1抑制剂联合化疗的疗效 | NA | 探索鳞状细胞肺癌中预测PD-1抑制剂联合化疗疗效的生物标志物 | 鳞状细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | RNA数据、免疫细胞数据 | 349个鳞状细胞肺癌样本 |
| 449 | 2024-10-14 |
Prognostic risk model of LIHC T-cells based on scRNA-seq and RNA-seq and the regulation of the tumor immune microenvironment
2024-Oct-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01424-z
PMID:39388011
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和RNA测序数据，构建了LIHC患者的T细胞标记基因的预后风险模型，并探讨了该模型对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次基于T细胞标记基因构建了LIHC患者的预后风险模型，并验证了其在独立数据集中的有效性 | 研究仅限于TCGA和GEO数据库的数据，未涵盖所有可能的临床样本 | 开发一种基于T细胞标记基因的预后风险模型，用于预测LIHC患者的生存结果和免疫治疗效果 | LIHC患者的T细胞标记基因及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 风险模型 | 基因数据 | 860个T细胞标记基因，TCGA-LIHC数据集和独立GEO数据集 |
| 450 | 2024-10-14 |
Discovery of prognostic lncRNAs in colorectal cancer using spatial transcriptomics
2024-Oct-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00728-1
PMID:39390212
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研究论文 | 研究利用空间转录组学技术在结直肠癌中发现与预后相关的长链非编码RNA（lncRNA） | 首次利用空间转录组学技术研究结直肠癌中的lncRNA，提供更精确的细胞类型特异性表达数据 | 研究仅限于结直肠癌，且样本量较小，需要进一步验证和扩大样本量 | 发现结直肠癌中与转移相关的lncRNA，作为早期风险评估的潜在生物标志物 | 结直肠癌中的lncRNA及其在肿瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | RNA | 301个与恶性结直肠癌区域相关的lncRNA |
| 451 | 2024-10-14 |
Rewriting cellular fate: epigenetic interventions in obesity and cellular programming
2024-Oct-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00944-2
PMID:39390356
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研究论文 | 本文讨论了表观遗传干预在肥胖和细胞编程中的机制 | 本文详细分析了表观遗传调控在肥胖中的作用，并介绍了多种用于揭示这些调控的方法 | NA | 探讨表观遗传干预如何影响肥胖，并分析相关的方法 | 肥胖和细胞编程 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体细胞核移植、细胞融合 | NA | 基因表达数据、表观遗传标记数据 | NA |
| 452 | 2024-10-14 |
Key platelet genes play important roles in predicting the prognosis of sepsis
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74052-w
PMID:39384856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）数据，结合多种算法分析，构建了一个稳定的脓毒症预后模型 | 首次通过scRNA-seq技术识别脓毒症患者中的关键细胞，并结合批量RNA-seq数据和多种算法构建预后模型 | 研究样本量较小，且仅基于GEO数据库的数据，可能影响模型的普适性 | 通过scRNA-seq和批量RNA-seq数据，结合多种算法分析，构建一个稳定的脓毒症预后模型 | 脓毒症患者的预后预测 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq），定量实时PCR（qRT-PCR） | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 9个样本的scRNA-seq数据，批量RNA-seq数据来自GEO数据库，qRT-PCR在CLP诱导的脓毒症小鼠模型中进行 |
| 453 | 2024-10-14 |
Perivascular NOTCH3+ Stem Cells Drive Meningioma Tumorigenesis and Resistance to Radiotherapy
2024-Oct-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1459
PMID:38742767
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研究论文 | 研究报告NOTCH3驱动脑膜瘤的肿瘤发生和放疗抵抗，并发现周围血管NOTCH3+干细胞在人类、狗和鼠的脑膜瘤中保守存在 | 首次揭示NOTCH3在脑膜瘤肿瘤发生和放疗抵抗中的作用，并发现一种新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和异种移植，需要进一步临床验证 | 探讨脑膜瘤肿瘤发生和放疗抵抗的细胞类型和信号机制 | 脑膜瘤及其对放疗的抵抗性 | NA | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪和成像技术 | NA | 基因数据 | 人类、狗和鼠的脑膜瘤样本 |
| 454 | 2024-10-14 |
Single-cell sequencing analysis reveals the dynamic tumour ecosystems of primary and metastatic lymph nodes in nasopharyngeal carcinoma
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70137
PMID:39392128
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研究论文 | 研究分析了鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组，揭示了肿瘤生态系统的动态变化 | 首次系统地描述了鼻咽癌原发和转移淋巴结肿瘤的生态系统，揭示了免疫微环境和细胞间通讯的复杂性 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 揭示鼻咽癌淋巴结转移的肿瘤生态系统，为治疗策略提供依据 | 鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 47,618个单细胞，来自8个样本 |
| 455 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptome and chromatin accessibility mapping of upper lip and primary palate fusion
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70128
PMID:39392189
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组和染色质可及性测序技术，分析了小鼠胚胎在关键发育阶段的唇腭融合过程 | 首次结合单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术，揭示了唇腭融合过程中不同细胞亚群的转录特征和染色质可及性变化 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 揭示唇腭融合的分子机制 | 小鼠胚胎的唇腭融合过程 | 数字病理学 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | C57BL/6J小鼠胚胎在10.5、11.5和12.5胚胎日的样本 |
| 456 | 2024-10-13 |
Landscape of epithelial cell subpopulations in the human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38091
PMID:39391485
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研究论文 | 研究揭示了人食管鳞状细胞癌微环境中上皮细胞亚群的景观及其在食管鳞状细胞癌发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率下获得了食管鳞状细胞癌的上皮细胞图谱，并揭示了上皮细胞在癌症进展中的作用及其对NK/T细胞的免疫抑制信号 | NA | 探索上皮细胞亚群在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞亚群及其在癌症发展中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及食管鳞状细胞癌及其邻近组织的11个主要细胞亚群和4个上皮细胞亚群 |
| 457 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse cardiac cells in response to retinoic acid
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38301
PMID:39391486
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研究论文 | 研究了视黄酸对小鼠心脏细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析视黄酸对小鼠心脏发育过程中细胞和分子机制的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类心脏疾病的研究 | 揭示视黄酸对心脏畸形的影响机制 | 小鼠心脏细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69,447个细胞，来自从E8.5到E17.5的七个发育阶段 |
| 458 | 2024-10-13 |
Cross-species comparison of airway epithelium transcriptomics
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38259
PMID:39391497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类、猴子、小鼠和大鼠在健康和哮喘条件下的肺细胞转录组相似性和差异 | 首次进行了跨物种的肺细胞转录组全面比较，揭示了跨物种细胞特异性标记基因、转录因子和生物通路的保守性 | 研究仅限于四种物种，且未涵盖所有可能的肺部疾病状态 | 探讨不同物种间肺细胞转录组的相似性和差异，以及这些差异在哮喘中的作用 | 人类、猴子、小鼠和大鼠的肺细胞在健康和哮喘条件下的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及四种物种的肺细胞样本 |
| 459 | 2024-10-13 |
Germinal center B-cell subgroups in the tumor microenvironment cannot be overlooked: Their involvement in prognosis, immunotherapy response, and treatment resistance in head and neck squamous carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37726
PMID:39391510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群，并构建了相关的风险预测模型 | 首次将生发中心B细胞（GCB）识别为B细胞特异性预后生物标志物，填补了头颈部鳞状细胞癌遗传预后预测模型的研究空白 | NA | 寻找新的生物标志物以实现头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和预测早期复发和转移 | 头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群及其在预后、免疫治疗反应和治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 头颈部鳞状细胞癌组织和外周血样本 |
| 460 | 2024-10-13 |
Mechanisms of HIF1A-mediated immune evasion in gastric cancer and the impact on therapy resistance
2024-Oct-10, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09917-x
PMID:39384651
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研究论文 | 研究胃癌中HIF1A介导的免疫逃避机制及其对治疗抵抗的影响 | 揭示了静止癌细胞（QCCs）通过免疫抑制机制抵抗T细胞介导的免疫反应，并探讨了HIF1A在其中的作用 | 主要基于小鼠模型和体外细胞实验，需要进一步的临床验证 | 探索胃癌中静止癌细胞的免疫抑制机制及其对免疫治疗抵抗的影响 | 胃癌中的静止癌细胞（QCCs）及其与免疫细胞和HIF1A的相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 基因编辑技术、转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和体外细胞实验 |