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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-10-16 |
Breast Cancer Disseminated Tumor Cells: Do They Stay and Fight or Run and Hide?
2024-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2408
PMID:39402990
|
研究论文 | 研究乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用 | 探讨了NK细胞在乳腺癌早期扩散和休眠中的作用,并提出了STING通路和转录因子Sox2、Bach1的机制 | 需要进一步研究不同免疫类型在休眠和复发中的具体机制和重要性 | 探讨乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用及其机制 | 乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞和NK细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞基因组学和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-10-16 |
Differential transcriptomic host responses in the early phase of viral and bacterial infections in human lung tissue explants ex vivo
2024-Oct-12, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02988-8
PMID:39395995
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研究论文 | 研究了人类肺组织体外培养物在病毒和细菌感染早期阶段的转录组差异反应 | 首次使用RNA测序技术研究了人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 研究仅限于体外培养的肺组织,无法完全模拟自然感染环境 | 探讨人类肺组织在病毒和细菌感染早期阶段的转录组反应差异 | 人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 来自肺气肿患者的肺组织体外培养物 | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-10-16 |
Resting natural killer cells promote the progress of colon cancer liver metastasis by elevating tumor-derived stem cell factor
2024-Oct-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97201
PMID:39387546
|
研究论文 | 研究了自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 首次揭示了GZMK+静息状态的自然杀伤细胞在肿瘤组织中的显著增加,并发现其在肿瘤区域中的富集与较差的预后相关 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内实验验证 | 探讨自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的临床相关性和细胞作用 | 自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的生物学特性和功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及结直肠癌和肝转移癌的肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-10-16 |
Visualizing scRNA-Seq data at population scale with GloScope
2024-Oct-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03398-1
PMID:39380041
|
研究论文 | 本文提出了一种名为GloScope的框架,用于在群体规模上可视化和分析scRNA-Seq数据 | GloScope框架能够有效地处理样本间的变异,支持样本级别的可视化和质量控制评估 | NA | 开发一种新的生物信息学方法,用于在群体规模上分析scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据及其在不同样本中的变异 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12到300个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-10-16 |
CRIP1 regulates osteogenic differentiation of bone marrow stromal cells and pre-osteoblasts via the Wnt signaling pathway
2024-10-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150277
PMID:38936225
|
研究论文 | 研究CRIP1通过Wnt信号通路调控骨髓间充质干细胞和前成骨细胞的成骨分化 | 揭示了CRIP1在调控骨髓间充质干细胞成骨分化中的新作用,并通过Wnt信号通路增强成骨分化 | NA | 探索骨髓间充质干细胞分化调控机制,为骨质疏松症的治疗提供新思路 | 骨髓间充质干细胞和前成骨细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受全髋关节置换术的患者中收集的股骨头骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-10-16 |
Single-cell transcriptome atlas revealed bronchoalveolar immune features related to disease severity in pediatric Mycoplasma pneumoniae pneumonia
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.748
PMID:39399649
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了支气管肺泡灌洗液样本中的免疫特征,揭示了轻度和重度肺炎患者之间的免疫差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了轻度和重度肺炎患者的支气管肺泡灌洗液免疫景观,揭示了不同疾病严重程度下的免疫特征 | 研究样本量有限,且仅限于儿童肺炎患者,可能影响结果的普适性 | 探讨轻度肺炎的保护性免疫机制和重度肺炎的病理机制 | 支气管肺泡灌洗液样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名健康捐赠者和24名住院的儿童肺炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-10-15 |
Network Medicine Approach Unravels Endophenotype Signature in Alzheimer's Disease through Large-Scale Comparative Proteomics Analysis: Vascular Dysfunction as a Prime Example
2024-Oct-14, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c01344
PMID:39322987
|
研究论文 | 研究通过大规模比较蛋白质组学分析,揭示了阿尔茨海默病中的内表型特征,特别是血管功能障碍 | 提出了基于网络的框架来识别阿尔茨海默病病理内表型的蛋白质特征,并发现了新的生物标志物候选者 | NA | 揭示阿尔茨海默病中的内表型特征 | 阿尔茨海默病患者的蛋白质特征 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质数据 | 23个蛋白质数据集,包括阿尔茨海默病患者和转基因小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-10-15 |
Investigating PPT2's role in ovarian cancer prognosis and immunotherapy outcomes
2024-Oct-11, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01527-9
PMID:39394143
|
研究论文 | 研究探讨了PPT2基因在卵巢癌预后和免疫治疗结果中的作用 | 首次系统研究了PPT2基因在卵巢癌中的表达与预后、免疫浸润及分子机制的关系 | 需要进一步研究PPT2与免疫治疗效果在卵巢癌患者中的关系 | 确定PPT2表达与卵巢癌预后、免疫浸润及潜在分子机制的关联 | PPT2基因在卵巢癌中的表达及其对预后和免疫治疗结果的影响 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、GTEx和GEO数据库的RNA-seq和临床数据,以及内部数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-10-15 |
Immunometabolic changes and potential biomarkers in CFS peripheral immune cells revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Oct-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05710-w
PMID:39394558
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化,并发现了潜在的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化,并识别出ESRRA-APP-CD74信号通路作为潜在的生物标志物 | 样本量较小且仅评估了外周血 | 探讨慢性疲劳综合征的病理机制及其潜在的生物标志物 | 慢性疲劳综合征患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名慢性疲劳综合征患者和4名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-10-15 |
Single-cell RNA transcriptomic analyses of tumor microenvironment of ovarian metastasis in gastric cancer
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00974-2
PMID:39162990
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 首次综合分析了胃癌卵巢转移的免疫微环境,并识别了与转移相关的特定细胞类型和基因特征 | 样本量较小,仅分析了两对临床样本 | 揭示胃癌卵巢转移的免疫微环境,促进新治疗策略的发现 | 胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两对临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-10-14 |
Prognostic risk model of LIHC T-cells based on scRNA-seq and RNA-seq and the regulation of the tumor immune microenvironment
2024-Oct-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01424-z
PMID:39388011
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和RNA测序数据,构建了LIHC患者的T细胞标记基因的预后风险模型,并探讨了该模型对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次基于T细胞标记基因构建了LIHC患者的预后风险模型,并验证了其在独立数据集中的有效性 | 研究仅限于TCGA和GEO数据库的数据,未涵盖所有可能的临床样本 | 开发一种基于T细胞标记基因的预后风险模型,用于预测LIHC患者的生存结果和免疫治疗效果 | LIHC患者的T细胞标记基因及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 风险模型 | 基因数据 | 860个T细胞标记基因,TCGA-LIHC数据集和独立GEO数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-10-14 |
Discovery of prognostic lncRNAs in colorectal cancer using spatial transcriptomics
2024-Oct-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00728-1
PMID:39390212
|
研究论文 | 研究利用空间转录组学技术在结直肠癌中发现与预后相关的长链非编码RNA(lncRNA) | 首次利用空间转录组学技术研究结直肠癌中的lncRNA,提供更精确的细胞类型特异性表达数据 | 研究仅限于结直肠癌,且样本量较小,需要进一步验证和扩大样本量 | 发现结直肠癌中与转移相关的lncRNA,作为早期风险评估的潜在生物标志物 | 结直肠癌中的lncRNA及其在肿瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | RNA | 301个与恶性结直肠癌区域相关的lncRNA | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-10-14 |
Rewriting cellular fate: epigenetic interventions in obesity and cellular programming
2024-Oct-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00944-2
PMID:39390356
|
研究论文 | 本文讨论了表观遗传干预在肥胖和细胞编程中的机制 | 本文详细分析了表观遗传调控在肥胖中的作用,并介绍了多种用于揭示这些调控的方法 | NA | 探讨表观遗传干预如何影响肥胖,并分析相关的方法 | 肥胖和细胞编程 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体细胞核移植、细胞融合 | NA | 基因表达数据、表观遗传标记数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-10-14 |
Key platelet genes play important roles in predicting the prognosis of sepsis
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74052-w
PMID:39384856
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(RNA-seq)数据,结合多种算法分析,构建了一个稳定的脓毒症预后模型 | 首次通过scRNA-seq技术识别脓毒症患者中的关键细胞,并结合批量RNA-seq数据和多种算法构建预后模型 | 研究样本量较小,且仅基于GEO数据库的数据,可能影响模型的普适性 | 通过scRNA-seq和批量RNA-seq数据,结合多种算法分析,构建一个稳定的脓毒症预后模型 | 脓毒症患者的预后预测 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq),定量实时PCR(qRT-PCR) | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 9个样本的scRNA-seq数据,批量RNA-seq数据来自GEO数据库,qRT-PCR在CLP诱导的脓毒症小鼠模型中进行 | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-10-14 |
Single-cell sequencing analysis reveals the dynamic tumour ecosystems of primary and metastatic lymph nodes in nasopharyngeal carcinoma
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70137
PMID:39392128
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研究论文 | 研究分析了鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组,揭示了肿瘤生态系统的动态变化 | 首次系统地描述了鼻咽癌原发和转移淋巴结肿瘤的生态系统,揭示了免疫微环境和细胞间通讯的复杂性 | 样本量相对较小,可能影响结果的普适性 | 揭示鼻咽癌淋巴结转移的肿瘤生态系统,为治疗策略提供依据 | 鼻咽癌原发和转移淋巴结的单细胞转录组 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 47,618个单细胞,来自8个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-10-14 |
Single-cell transcriptome and chromatin accessibility mapping of upper lip and primary palate fusion
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70128
PMID:39392189
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研究论文 | 研究使用单细胞转录组和染色质可及性测序技术,分析了小鼠胚胎在关键发育阶段的唇腭融合过程 | 首次结合单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术,揭示了唇腭融合过程中不同细胞亚群的转录特征和染色质可及性变化 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型,结果的普适性有待进一步验证 | 揭示唇腭融合的分子机制 | 小鼠胚胎的唇腭融合过程 | 数字病理学 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和染色质可及性测序(scATAC-seq) | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | C57BL/6J小鼠胚胎在10.5、11.5和12.5胚胎日的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-10-13 |
Landscape of epithelial cell subpopulations in the human esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38091
PMID:39391485
|
研究论文 | 研究揭示了人食管鳞状细胞癌微环境中上皮细胞亚群的景观及其在食管鳞状细胞癌发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率下获得了食管鳞状细胞癌的上皮细胞图谱,并揭示了上皮细胞在癌症进展中的作用及其对NK/T细胞的免疫抑制信号 | NA | 探索上皮细胞亚群在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的上皮细胞亚群及其在癌症发展中的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及食管鳞状细胞癌及其邻近组织的11个主要细胞亚群和4个上皮细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-10-13 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse cardiac cells in response to retinoic acid
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38301
PMID:39391486
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研究论文 | 研究了视黄酸对小鼠心脏细胞的单细胞RNA测序分析 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析视黄酸对小鼠心脏发育过程中细胞和分子机制的影响 | 仅限于小鼠模型,未涉及人类心脏疾病的研究 | 揭示视黄酸对心脏畸形的影响机制 | 小鼠心脏细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69,447个细胞,来自从E8.5到E17.5的七个发育阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-10-13 |
Cross-species comparison of airway epithelium transcriptomics
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38259
PMID:39391497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类、猴子、小鼠和大鼠在健康和哮喘条件下的肺细胞转录组相似性和差异 | 首次进行了跨物种的肺细胞转录组全面比较,揭示了跨物种细胞特异性标记基因、转录因子和生物通路的保守性 | 研究仅限于四种物种,且未涵盖所有可能的肺部疾病状态 | 探讨不同物种间肺细胞转录组的相似性和差异,以及这些差异在哮喘中的作用 | 人类、猴子、小鼠和大鼠的肺细胞在健康和哮喘条件下的转录组 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及四种物种的肺细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-10-13 |
Germinal center B-cell subgroups in the tumor microenvironment cannot be overlooked: Their involvement in prognosis, immunotherapy response, and treatment resistance in head and neck squamous carcinoma
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37726
PMID:39391510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群,并构建了相关的风险预测模型 | 首次将生发中心B细胞(GCB)识别为B细胞特异性预后生物标志物,填补了头颈部鳞状细胞癌遗传预后预测模型的研究空白 | NA | 寻找新的生物标志物以实现头颈部鳞状细胞癌的早期诊断和预测早期复发和转移 | 头颈部鳞状细胞癌中的B细胞亚群及其在预后、免疫治疗反应和治疗抵抗中的作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 头颈部鳞状细胞癌组织和外周血样本 | NA | NA | NA | NA |