单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 615 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-10-16 |
Establish a novel immune-related gene prognostic risk index (IRGPRI) associated with CD8+ cytotoxic T lymphocytes in non-small-cell lung cancer (NSCLC)
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38324
PMID:39397989
|
研究论文 | 本研究旨在建立一个与非小细胞肺癌（NSCLC）中CD8+细胞毒性T淋巴细胞相关的免疫相关基因预后风险指数（IRGPRI），用于预测患者的预后和评估免疫检查点抑制剂（ICIs）治疗的疗效 | 本研究创新性地利用单细胞RNA测序技术识别CD8+细胞毒性T淋巴细胞与其他细胞类型的差异表达基因，并通过LASSO Cox回归分析构建IRGPRI | NA | 建立一个能够预测非小细胞肺癌患者预后和评估免疫检查点抑制剂治疗疗效的免疫相关基因预后风险指数 | 非小细胞肺癌患者及其CD8+细胞毒性T淋巴细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归分析 | 基因表达数据 | 109个基因，7个预后相关基因，GSE131907数据集 |
| 422 | 2024-10-16 |
Breast Cancer Disseminated Tumor Cells: Do They Stay and Fight or Run and Hide?
2024-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2408
PMID:39402990
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研究论文 | 研究乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用 | 探讨了NK细胞在乳腺癌早期扩散和休眠中的作用，并提出了STING通路和转录因子Sox2、Bach1的机制 | 需要进一步研究不同免疫类型在休眠和复发中的具体机制和重要性 | 探讨乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞在免疫系统中的作用及其机制 | 乳腺癌早期扩散的肿瘤细胞和NK细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞基因组学和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 423 | 2024-10-16 |
SCG2 Mediates HNSCC Progression With CCL2/TGFβ1high M2 Macrophage Infiltration
2024-Oct-15, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15154
PMID:39404611
|
研究论文 | 研究探讨了M2巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的极化机制，并识别了潜在的治疗靶点 | 发现了SCG2在HNSCC中调节M2巨噬细胞极化的关键作用，并揭示了其通过影响CCL2和TGFβ1的分泌来影响肿瘤进展 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 揭示M2巨噬细胞在HNSCC中的极化机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的M2巨噬细胞极化 | NA | 头颈部鳞状细胞癌 | 生物信息学分析 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的HNSCC大量转录组数据，以及单细胞转录组数据和体外实验样本 |
| 424 | 2024-10-16 |
Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of Cervical Cancer
2024-Oct-14, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae046
PMID:39402008
|
综述 | 本文综述了HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用 | 整合HPV检测与现有筛查方法，如宫颈细胞学和视觉检查，提高了宫颈癌筛查的敏感性和特异性 | NA | 探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的最新进展 | HPV感染及其相关生物标志物在宫颈癌中的作用 | NA | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 425 | 2024-10-16 |
Differential transcriptomic host responses in the early phase of viral and bacterial infections in human lung tissue explants ex vivo
2024-Oct-12, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02988-8
PMID:39395995
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研究论文 | 研究了人类肺组织体外培养物在病毒和细菌感染早期阶段的转录组差异反应 | 首次使用RNA测序技术研究了人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 研究仅限于体外培养的肺组织，无法完全模拟自然感染环境 | 探讨人类肺组织在病毒和细菌感染早期阶段的转录组反应差异 | 人类肺组织体外培养物在流感病毒A、BCG和铜绿假单胞菌感染早期阶段的转录组变化 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 来自肺气肿患者的肺组织体外培养物 |
| 426 | 2024-10-16 |
Best practices for differential accessibility analysis in single-cell epigenomics
2024-Oct-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53089-5
PMID:39394227
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研究论文 | 本文系统评估了用于识别单细胞ATAC-seq数据中差异可及性区域的统计方法 | 本文通过系统评估多种统计方法，提出了单细胞ATAC-seq数据分析的最佳实践，并开发了相应的R包 | 本文主要关注单细胞ATAC-seq数据的差异可及性分析，未涵盖其他类型的单细胞数据 | 评估和确定单细胞ATAC-seq数据差异可及性分析的最佳统计方法 | 单细胞ATAC-seq数据及其匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 多个scATAC-seq实验及其匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据 |
| 427 | 2024-10-16 |
Resting natural killer cells promote the progress of colon cancer liver metastasis by elevating tumor-derived stem cell factor
2024-Oct-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97201
PMID:39387546
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研究论文 | 研究了自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 首次揭示了GZMK+静息状态的自然杀伤细胞在肿瘤组织中的显著增加，并发现其在肿瘤区域中的富集与较差的预后相关 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的临床相关性和细胞作用 | 自然杀伤细胞在结直肠癌肝转移中的生物学特性和功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及结直肠癌和肝转移癌的肿瘤组织样本 |
| 428 | 2024-10-16 |
Detecting Rhythmic Gene Expression in Single-cell Transcriptomics
2024-Oct-08, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304241273182
PMID:39377613
|
研究论文 | 本文研究了在单细胞转录组数据中检测节律基因表达的方法 | 提出了结合子采样和谐波回归的高效策略来检测单细胞数据中的昼夜节律基因 | 尚未完全解决如何将现有的节律检测算法适应于单细胞RNA测序数据的问题 | 探讨如何将现有的节律检测方法适应于单细胞RNA测序数据，并提出新的检测策略 | 单细胞转录组数据中的昼夜节律基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谐波回归 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 429 | 2024-10-16 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2024-Oct-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52990-3
PMID:39379371
|
研究论文 | 本文通过多组学单细胞测序技术，研究了Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）患者的皮肤组织特异性反应 | 首次在单细胞水平上综合分析了SJS/TEN患者的转录组、表面蛋白质组和T细胞受体，揭示了细胞免疫发病机制中的关键细胞和分子 | 研究样本量较小，仅涉及15名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨SJS/TEN的细胞免疫发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水肿液中的细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞数据 | 15名SJS/TEN患者，共109,888个细胞 |
| 430 | 2024-10-16 |
Visualizing scRNA-Seq data at population scale with GloScope
2024-Oct-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03398-1
PMID:39380041
|
研究论文 | 本文提出了一种名为GloScope的框架，用于在群体规模上可视化和分析scRNA-Seq数据 | GloScope框架能够有效地处理样本间的变异，支持样本级别的可视化和质量控制评估 | NA | 开发一种新的生物信息学方法，用于在群体规模上分析scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据及其在不同样本中的变异 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12到300个样本 |
| 431 | 2024-10-16 |
CRIP1 regulates osteogenic differentiation of bone marrow stromal cells and pre-osteoblasts via the Wnt signaling pathway
2024-10-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150277
PMID:38936225
|
研究论文 | 研究CRIP1通过Wnt信号通路调控骨髓间充质干细胞和前成骨细胞的成骨分化 | 揭示了CRIP1在调控骨髓间充质干细胞成骨分化中的新作用，并通过Wnt信号通路增强成骨分化 | NA | 探索骨髓间充质干细胞分化调控机制，为骨质疏松症的治疗提供新思路 | 骨髓间充质干细胞和前成骨细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从接受全髋关节置换术的患者中收集的股骨头骨髓细胞 |
| 432 | 2024-10-16 |
Single-cell transcriptome atlas revealed bronchoalveolar immune features related to disease severity in pediatric Mycoplasma pneumoniae pneumonia
2024-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.748
PMID:39399649
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了支气管肺泡灌洗液样本中的免疫特征，揭示了轻度和重度肺炎患者之间的免疫差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了轻度和重度肺炎患者的支气管肺泡灌洗液免疫景观，揭示了不同疾病严重程度下的免疫特征 | 研究样本量有限，且仅限于儿童肺炎患者，可能影响结果的普适性 | 探讨轻度肺炎的保护性免疫机制和重度肺炎的病理机制 | 支气管肺泡灌洗液样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名健康捐赠者和24名住院的儿童肺炎患者 |
| 433 | 2024-10-15 |
Network Medicine Approach Unravels Endophenotype Signature in Alzheimer's Disease through Large-Scale Comparative Proteomics Analysis: Vascular Dysfunction as a Prime Example
2024-Oct-14, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c01344
PMID:39322987
|
研究论文 | 研究通过大规模比较蛋白质组学分析，揭示了阿尔茨海默病中的内表型特征，特别是血管功能障碍 | 提出了基于网络的框架来识别阿尔茨海默病病理内表型的蛋白质特征，并发现了新的生物标志物候选者 | NA | 揭示阿尔茨海默病中的内表型特征 | 阿尔茨海默病患者的蛋白质特征 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质数据 | 23个蛋白质数据集，包括阿尔茨海默病患者和转基因小鼠模型 |
| 434 | 2024-10-15 |
Investigating PPT2's role in ovarian cancer prognosis and immunotherapy outcomes
2024-Oct-11, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01527-9
PMID:39394143
|
研究论文 | 研究探讨了PPT2基因在卵巢癌预后和免疫治疗结果中的作用 | 首次系统研究了PPT2基因在卵巢癌中的表达与预后、免疫浸润及分子机制的关系 | 需要进一步研究PPT2与免疫治疗效果在卵巢癌患者中的关系 | 确定PPT2表达与卵巢癌预后、免疫浸润及潜在分子机制的关联 | PPT2基因在卵巢癌中的表达及其对预后和免疫治疗结果的影响 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA、GTEx和GEO数据库的RNA-seq和临床数据，以及内部数据集 |
| 435 | 2024-10-15 |
Immunometabolic changes and potential biomarkers in CFS peripheral immune cells revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Oct-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05710-w
PMID:39394558
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并发现了潜在的生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性疲劳综合征患者外周血单核细胞的免疫代谢变化，并识别出ESRRA-APP-CD74信号通路作为潜在的生物标志物 | 样本量较小且仅评估了外周血 | 探讨慢性疲劳综合征的病理机制及其潜在的生物标志物 | 慢性疲劳综合征患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4名慢性疲劳综合征患者和4名健康对照 |
| 436 | 2024-10-15 |
Single-cell RNA transcriptomic analyses of tumor microenvironment of ovarian metastasis in gastric cancer
2024-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00974-2
PMID:39162990
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 首次综合分析了胃癌卵巢转移的免疫微环境，并识别了与转移相关的特定细胞类型和基因特征 | 样本量较小，仅分析了两对临床样本 | 揭示胃癌卵巢转移的免疫微环境，促进新治疗策略的发现 | 胃癌卵巢转移的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两对临床样本 |
| 437 | 2024-09-25 |
Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics
2024-Oct, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907
PMID:39206540
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2024-10-14 |
Prognostic risk model of LIHC T-cells based on scRNA-seq and RNA-seq and the regulation of the tumor immune microenvironment
2024-Oct-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01424-z
PMID:39388011
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和RNA测序数据，构建了LIHC患者的T细胞标记基因的预后风险模型，并探讨了该模型对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次基于T细胞标记基因构建了LIHC患者的预后风险模型，并验证了其在独立数据集中的有效性 | 研究仅限于TCGA和GEO数据库的数据，未涵盖所有可能的临床样本 | 开发一种基于T细胞标记基因的预后风险模型，用于预测LIHC患者的生存结果和免疫治疗效果 | LIHC患者的T细胞标记基因及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 风险模型 | 基因数据 | 860个T细胞标记基因，TCGA-LIHC数据集和独立GEO数据集 |
| 439 | 2024-10-14 |
Discovery of prognostic lncRNAs in colorectal cancer using spatial transcriptomics
2024-Oct-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00728-1
PMID:39390212
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研究论文 | 研究利用空间转录组学技术在结直肠癌中发现与预后相关的长链非编码RNA（lncRNA） | 首次利用空间转录组学技术研究结直肠癌中的lncRNA，提供更精确的细胞类型特异性表达数据 | 研究仅限于结直肠癌，且样本量较小，需要进一步验证和扩大样本量 | 发现结直肠癌中与转移相关的lncRNA，作为早期风险评估的潜在生物标志物 | 结直肠癌中的lncRNA及其在肿瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | RNA | 301个与恶性结直肠癌区域相关的lncRNA |
| 440 | 2024-10-14 |
Rewriting cellular fate: epigenetic interventions in obesity and cellular programming
2024-Oct-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00944-2
PMID:39390356
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研究论文 | 本文讨论了表观遗传干预在肥胖和细胞编程中的机制 | 本文详细分析了表观遗传调控在肥胖中的作用，并介绍了多种用于揭示这些调控的方法 | NA | 探讨表观遗传干预如何影响肥胖，并分析相关的方法 | 肥胖和细胞编程 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体细胞核移植、细胞融合 | NA | 基因表达数据、表观遗传标记数据 | NA |