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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-10-24 |
Effector Function Characteristics of Exhausted CD8+ T-Cell in Microsatellite Stable and Unstable Gastric Cancer
2024-Oct, Cancer research and treatment
IF:4.1Q2
DOI:10.4143/crt.2024.317
PMID:38637967
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研究论文 | 研究了微卫星稳定和不稳定胃癌中耗竭CD8+ T细胞的效应功能特征 | 发现微卫星不稳定胃癌中的耗竭T细胞保留了IFN-γ信号通路,为胃癌免疫治疗提供了新的视角 | 样本量较小,仅包括三例微卫星不稳定和三例微卫星稳定胃癌样本 | 探讨微卫星不稳定胃癌的肿瘤免疫微环境特征 | 微卫星稳定和不稳定胃癌中的CD8+ T细胞亚型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 三例微卫星不稳定和三例微卫星稳定胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-10-24 |
The crucial prognostic signaling pathways of pancreatic ductal adenocarcinoma were identified by single-cell and bulk RNA sequencing data
2024-Oct, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-024-02663-4
PMID:38526745
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序数据识别胰腺导管腺癌的关键预后信号通路 | 利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出12个独立的胰腺导管腺癌预后因子,并构建了具有良好区分度和校准度的预后模型 | 研究仅基于特定的数据集,结果的普适性有待进一步验证 | 探索胰腺导管腺癌的潜在预后信号通路,提高预后预测的准确性 | 胰腺导管腺癌的预后因子及其相关信号通路 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序 | Cox回归模型,Lasso回归模型 | RNA测序数据 | 一个单细胞RNA测序队列和四个GEO队列的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 423 | 2024-10-24 |
LTBR acts as a novel immune checkpoint of tumor-associated macrophages for cancer immunotherapy
2024-Oct, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.233
PMID:39429877
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研究论文 | 研究揭示了淋巴毒素β受体(LTBR)作为肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的新型免疫检查点,并提出了一种新的癌症免疫治疗策略 | 首次发现LTBR作为TAMs的新型免疫检查点,并提出了一种新的免疫治疗策略,通过靶向LTBR TAMs来克服免疫检查点抑制剂的耐药性 | 研究主要基于肺腺癌(LUAD)的数据,结果的普适性需要进一步验证 | 揭示肿瘤相关巨噬细胞在癌症免疫治疗中的作用机制,并寻找新的免疫检查点 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)及其在肺腺癌(LUAD)中的作用 | 免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq) | NA | 基因组数据 | 涉及肺腺癌(LUAD)的免疫多组学数据和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2024-10-24 |
Integrative Analysis by Mendelian Randomization and Large-Scale Single-Cell Transcriptomics Reveals Causal Links between B Cell Subtypes and Diabetic Kidney Disease
2024-Oct, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000539689
PMID:39430286
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和大规模单细胞转录组学分析,揭示了B细胞亚型与糖尿病肾病之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化和单细胞疾病相关评分(scDRS)分析,揭示了B细胞亚型在糖尿病肾病发病中的潜在作用 | 研究主要集中在B细胞亚型,未全面探讨其他免疫细胞类型对糖尿病肾病的影响 | 深入理解糖尿病肾病的病理机制,特别是循环免疫细胞的作用 | 糖尿病肾病患者和B细胞亚型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化分析、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 425 | 2024-10-22 |
Multi-scalar data integration decoding risk genes for chronic kidney disease
2024-Oct-18, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03798-2
PMID:39425076
|
研究论文 | 本研究通过整合全基因组关联研究、RNA测序和单细胞RNA测序数据,探索与慢性肾脏疾病相关的基因和细胞类型 | 本研究首次整合了多种尺度的数据,包括全基因组关联研究、RNA测序和单细胞RNA测序,以揭示慢性肾脏疾病的基因和细胞类型 | 本研究主要基于现有数据库中的数据,未进行新的实验验证 | 探索与慢性肾脏疾病相关的基因、通路和细胞类型,为进一步的机制研究奠定基础 | 慢性肾脏疾病的基因和细胞类型 | 基因组学 | 肾脏疾病 | 全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 779个SNPs,涉及681个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2024-10-22 |
Scalable identification of lineage-specific gene regulatory networks from metacells with NetID
2024-Oct-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03418-0
PMID:39425176
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为NetID的方法,用于从单细胞RNA测序数据中识别基因调控网络,特别是针对细胞谱系特异性网络 | NetID通过利用同质性metacells并避免虚假的基因-基因相关性,克服了数据稀疏性和高维度的挑战,相比基于插补的方法表现出更优越的性能 | NA | 旨在开发一种可扩展的方法来识别细胞谱系特异性的基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-10-21 |
Novel combination therapy using recombinant oncolytic adenovirus silk hydrogel and PD-L1 inhibitor for bladder cancer treatment
2024-Oct-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02903-9
PMID:39420389
|
研究论文 | 研究了一种新的联合治疗策略,通过联合使用重组溶瘤腺病毒丝素水凝胶和PD-L1抑制剂来治疗膀胱癌 | 开发了一种新的纳米复合水凝胶,能够有效加载和释放重组溶瘤腺病毒,并联合PD-L1抑制剂显著增强T细胞浸润和肿瘤杀伤效果 | NA | 探索一种新的联合治疗策略,以提高膀胱癌的治疗效果 | 膀胱癌组织和小鼠模型 | NA | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠膀胱癌组织 | NA | NA | NA | NA |
| 428 | 2024-10-21 |
Enhancing GFPT1 expression with glutamine protects chondrocytes in osteoarthritis
2024-Oct-18, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113427
PMID:39426230
|
研究论文 | 研究通过孟德尔随机化分析和共定位分析,发现GFPT1在骨关节炎中的表达下调,并通过体外实验验证了补充谷氨酰胺可以上调GFPT1表达,从而改善骨关节炎中软骨细胞的代谢 | 首次通过孟德尔随机化分析和共定位分析确定GFPT1为骨关节炎的治疗靶点,并验证了谷氨酰胺在恢复GFPT1表达和软骨代谢中的作用 | 研究主要基于体外实验,尚未在临床上验证其疗效 | 识别并验证能够减缓骨关节炎进展的潜在药物靶点 | 骨关节炎中的软骨细胞和GFPT1基因 | 生物医学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化分析、共定位分析、RNA测序 | NA | RNA | 2645个靶点,人类和小鼠的软骨样本 | NA | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-10-21 |
Osteopetrosis-like disorders induced by osteoblast-specific retinoic acid signaling inhibition in mice
2024-Oct-17, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00353-5
PMID:39419968
|
研究论文 | 研究构建了骨细胞特异性抑制视黄酸信号的小鼠模型,发现其表现出类似人类骨硬化症的症状,并揭示了视黄酸信号在骨细胞中的抑制作用导致骨骼、造血和免疫系统功能障碍的机制 | 首次揭示了骨细胞中视黄酸信号的抑制作用导致类似骨硬化症的病理机制,为骨硬化症的治疗提供了新的见解 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨骨细胞中视黄酸信号的抑制作用对骨骼、造血和免疫系统的影响 | 骨细胞特异性抑制视黄酸信号的小鼠模型 | NA | 骨硬化症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq),RNA测序 (RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-10-21 |
Computational identification of surface markers for isolating distinct subpopulations from heterogeneous cancer cell populations
2024-Oct-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00441-6
PMID:39420005
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为clusterCleaver的计算工具,用于识别和分离异质性癌细胞群体中的不同亚群 | 开发了一种新的计算工具clusterCleaver,用于识别单细胞RNA测序数据中的表面标记物,以分离癌细胞亚群 | NA | 开发一种计算工具,用于识别和分离癌细胞群体中的不同亚群,以提高治疗效果和理解肿瘤进展 | 癌细胞亚群的表面标记物 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | MDA-MB-231和MDA-MB-436细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-10-21 |
Tregs ST2 deficiency enhances the abscopal anti-tumor response induced by microwave ablation
2024-Oct-17, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113330
PMID:39423663
|
研究论文 | 研究探讨了微波消融(MWA)对肿瘤微环境中Treg细胞ST2表达的影响及其在抗肿瘤反应中的作用 | 首次研究了Treg细胞中ST2缺乏对微波消融诱导的远端抗肿瘤反应的增强作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在临床试验中验证 | 探索微波消融对肿瘤微环境中Treg细胞ST2表达的影响及其在抗肿瘤反应中的机制 | Treg细胞、肿瘤微环境、微波消融 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术、单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | Foxp3Cre和Foxp3CreIl1rl1fl/fl小鼠的双侧背部肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-10-21 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals that Wolbachia induces gene expression changes in Drosophila ovary cells to favor its own maternal transmission
2024-Oct-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01473-24
PMID:39194189
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了Wolbachia在果蝇卵巢细胞中的基因表达变化,揭示了Wolbachia如何通过改变宿主基因表达来促进其母系传播 | 首次系统地分析了Wolbachia感染对果蝇卵巢细胞基因表达的影响,揭示了Wolbachia通过调节宿主基因表达来促进其在宿主卵巢细胞中的传播 | 研究仅限于特定Wolbachia菌株(Mel)和果蝇卵巢细胞,未来需要进一步研究其他菌株和宿主物种 | 探讨Wolbachia在果蝇卵巢细胞中的基因表达变化及其对母系传播的影响 | Wolbachia感染的果蝇卵巢细胞和未感染的卵巢细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 感染和未感染Wolbachia的果蝇卵巢细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-10-21 |
DGSIST: Clustering spatial transcriptome data based on deep graph structure Infomax
2024-Oct-15, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.10.002
PMID:39413889
|
研究论文 | 提出了一种基于深度图结构互信息最大化(DGSI)模型的空间转录组数据聚类方法DGSIST | DGSIST模型结合了图卷积神经网络和无监督学习方法,能够有效捕捉节点及其邻居的局部信息,并将其整合到整体图结构中 | NA | 旨在充分利用空间转录组数据,提高细胞类型识别的准确性 | 空间转录组数据中的细胞类型 | 生物信息学 | 癌症 | 图卷积神经网络 | DGSI | 空间转录组数据 | 多种组织类型和技术平台的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-10-21 |
Comprehensive transcriptome and scRNA-seq analyses uncover the expression and underlying mechanism of SYNJ2 in papillary thyroid carcinoma
2024-Oct, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12099
PMID:39370684
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研究论文 | 研究探讨了SYNJ2在甲状腺乳头状癌中的表达及其潜在机制 | 首次揭示了SYNJ2在甲状腺乳头状癌中的高表达及其与临床特征的关联,并探讨了其在肿瘤进展中的作用 | 研究主要基于现有数据和分析,缺乏体内实验验证 | 探讨SYNJ2在甲状腺乳头状癌中的表达及其潜在机制 | SYNJ2在甲状腺乳头状癌中的表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 免疫组化、mRNA芯片、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个甲状腺乳头状癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-10-20 |
Characterization of mitochondrial metabolism related molecular subtypes and immune infiltration in colorectal adenocarcinoma
2024-10-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75482-2
PMID:39414905
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研究论文 | 研究了结直肠腺癌中与线粒体代谢相关的分子亚型及其免疫浸润特征 | 通过无监督共识聚类分析筛选出与结直肠腺癌预后相关的线粒体代谢相关基因,并构建了预测模型,同时发现了新的潜在治疗靶点SEC11A | NA | 探索结直肠腺癌的预后因素及其可能的机制 | 结直肠腺癌中的线粒体代谢相关基因及其分子亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析 | LASSO-单变量Cox分析 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2024-10-20 |
Key genes and immune pathways in T-cell mediated rejection post-liver transplantation identified via integrated RNA-seq and machine learning
2024-10-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74874-8
PMID:39414868
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和机器学习方法,识别了肝移植后T细胞介导的排斥反应中的关键基因及其潜在的生物学过程和机制 | 本研究首次通过综合分析RNA测序数据和机器学习算法,识别了与T细胞介导的排斥反应相关的关键基因,并揭示了其生物学意义和潜在的治疗靶点 | 本研究主要基于GSE145780数据集和单细胞RNA测序数据,样本量有限,可能影响结果的普适性 | 识别肝移植后T细胞介导的排斥反应中的关键基因及其生物学过程和机制 | 肝移植后T细胞介导的排斥反应中的关键基因及其生物学过程和机制 | 机器学习 | NA | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | GSE145780数据集和来自患者的单细胞RNA测序数据及肝活检组织 | NA | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-10-20 |
The molecular anatomy of cashmere goat hair follicle during cytodifferentiation stage
2024-Oct-15, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10820-2
PMID:39407092
|
研究论文 | 研究了绒山羊毛囊在细胞分化阶段的分子结构及其对纤维质量的影响 | 揭示了绒山羊毛囊内层细胞分化过程中的复杂过程和转录动态,识别了九种细胞群体和关键结构,并发现了三种主要内层谱系及其在特化和信号传导中的作用 | NA | 深入理解绒山羊次级毛囊发育及其对纤维质量的影响,为育种策略提供信息 | 绒山羊的次级毛囊及其在细胞分化阶段的分子结构 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2024-10-17 |
Multimodal Identification of Molecular Factors Linked to Severe Diabetic Foot Ulcers Using Artificial Intelligence
2024-Oct-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910686
PMID:39409014
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研究论文 | 利用多模态方法和人工智能技术识别与严重糖尿病足溃疡相关的分子因素 | 本研究通过整合电子健康记录和单细胞转录组学数据,识别出与糖尿病足溃疡严重程度相关的细胞类型特异性和分子因素,并考虑了关键的人口统计学差异 | NA | 识别与严重糖尿病足溃疡相关的分子因素 | 糖尿病足溃疡的分子因素 | 机器学习 | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 文本 | 数千名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-09-15 |
Analyzing submicron spatial transcriptomics data at their original resolution
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02416-1
PMID:39271936
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2024-10-20 |
Unveiling the Enigmatic Role of SLC35F3 in Lung Adenocarcinoma
2024-Oct, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70023
PMID:39414367
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研究论文 | 研究探讨了SLC35F3在肺腺癌中的作用及其临床相关性 | 首次系统分析了SLC35F3在肺腺癌中的表达模式及其与免疫浸润、肿瘤突变负荷和药物敏感性的关系 | 研究主要基于TCGA数据库和细胞系实验,缺乏临床样本的直接验证 | 揭示SLC35F3在肺腺癌中的作用及其潜在的临床应用 | SLC35F3在不同癌症类型中的表达及其在肺腺癌中的临床相关性 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 包括来自TCGA数据库的肺腺癌患者数据和细胞系样本 | NA | NA | NA | NA |