单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 595 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-10-19 |
Neutrophils Recruited by NKX2-1 Suppression via Activation of CXCLs/CXCR2 Axis Promote Lung Adenocarcinoma Progression
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400370
PMID:39113226
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研究论文 | 研究探讨了NKX2-1通过激活CXCLs/CXCR2轴招募中性粒细胞促进肺腺癌进展的机制 | 揭示了NKX2-1在调控肿瘤免疫微环境中通过抑制CXCLs/CXCR2依赖机制影响中性粒细胞浸润的新机制 | NA | 研究NKX2-1在肺腺癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 肺腺癌细胞、中性粒细胞及CXCLs/CXCR2信号通路 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、Visium原位捕获分析、qRT-PCR、ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 402 | 2024-10-19 |
Endothelial Cell-Derived Extracellular Vesicles Promote Aberrant Neutrophil Trafficking and Subsequent Remote Lung Injury
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400647
PMID:39119837
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研究论文 | 研究揭示了内皮细胞衍生的外泌体在促进中性粒细胞异常迁移和随后的远端肺损伤中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析揭示了内皮细胞释放的外泌体在促进中性粒细胞反向跨内皮迁移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本，缺乏人体内直接干预实验 | 探讨脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中中性粒细胞异常迁移的分子机制 | 中性粒细胞、内皮细胞及其衍生的外泌体 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 小鼠模型和脓毒症相关ARDS患者的血液样本 |
| 403 | 2024-10-19 |
Identification of a Novel ECM Remodeling Macrophage Subset in AKI to CKD Transition by Integrative Spatial and Single-Cell Analysis
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309752
PMID:39119903
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，研究了AKI到CKD过渡期间巨噬细胞的时空异质性 | 发现了与肾纤维化相关的新的巨噬细胞亚群，即细胞外基质重塑相关巨噬细胞（EAMs） | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床适用性需要进一步验证 | 探讨AKI到CKD过渡期间巨噬细胞的异质性和动态特征 | AKI到CKD过渡期间的小鼠巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠AKI-to-CKD模型中的多个时间点样本 |
| 404 | 2024-10-19 |
Characterization of Ucp1-iCre knockin mice reveals the recombination activity in male germ cells
2024-Oct-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00128.2024
PMID:39230395
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研究论文 | 本文研究了Ucp1-iCre敲入小鼠的Cre重组活性，特别是在雄性生殖细胞中的表现 | 通过靶向插入IRES-Cre盒，生成了Ucp1-iCre小鼠，减少了Cre在非脂肪组织中的异位活性 | Ucp1-iCre小鼠在某些组织中仍表现出有限的Cre活性，需要谨慎进行小鼠交配和基因分型 | 验证Ucp1-iCre敲入小鼠在脂肪组织中的特异性基因操作能力 | Ucp1-iCre敲入小鼠及其在脂肪组织和生殖细胞中的Cre重组活性 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及Ucp1-iCre小鼠和Rosa-tdTomato报告小鼠的杂交后代 |
| 405 | 2024-10-19 |
vSPACE: exploring virtual spatial representation of articular chondrocytes at the single-cell level
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae568
PMID:39363499
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研究论文 | vSPACE是一个基于网络的应用程序，通过模拟空间转录组技术，以虚拟方式展示人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据的空间表达模式 | vSPACE通过虚拟二维图展示人类关节软骨细胞的基因表达模式，揭示了科学家可以理解的沿区域轴的推断空间分布模式 | NA | 探索关节软骨细胞在单细胞水平上的虚拟空间表达模式 | 人类关节软骨细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 406 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，揭示了膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 首次探索了与细胞分化相关基因（CDR）相关的分子亚型及其预后影响，并开发了CDR评分系统 | NA | 揭示膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 膀胱癌患者及其分子亚型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | Lasso回归和Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO单细胞数据集 |
| 407 | 2024-10-18 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Oct-16, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 研究通过整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了自噬在衰老组织中的作用及其潜在机制 | 首次通过整合大量bulk RNA-seq和单细胞测序数据，揭示了血液组织中自噬与衰老的最高正相关性，并发现了经典单核细胞在衰老过程中的关键作用 | 研究主要集中在血液组织和急性髓系白血病，其他组织和疾病的相关性未被探讨 | 识别与自噬和衰老最相关的组织，并探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 正常组织样本、不同年龄的血液样本、急性髓系白血病的bulk RNA-seq和单细胞数据 | 生物信息学 | 血液疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过7000个正常组织样本、2000多个急性髓系白血病bulk RNA-seq样本和多组AML单细胞数据 |
| 408 | 2024-10-18 |
Cross-tissue human fibroblast atlas reveals myofibroblast subtypes with distinct roles in immune modulation
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.020
PMID:39303725
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自517个人类样本的纤维母细胞，揭示了不同亚型在免疫调节中的独特作用 | 识别了四种转录上不同的肌纤维母细胞亚群，并揭示了它们在肿瘤微环境中的不同功能 | NA | 深入理解纤维母细胞生物学，并探索针对特定纤维母细胞亚群的癌症治疗策略 | 人类纤维母细胞及其在不同组织和病理状态下的亚型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 517个人类样本，涵盖11种组织类型和多种病理状态 |
| 409 | 2024-10-18 |
Coagulation factor X promotes resistance to androgen-deprivation therapy in prostate cancer
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.018
PMID:39303726
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研究论文 | 研究探讨了凝血因子X在前列腺癌中促进对雄激素剥夺疗法抵抗的作用 | 首次揭示了免疫抑制性中性粒细胞（PMN-MDSCs）是凝血因子X的关键非肝源性来源，并阐明了其在肿瘤微环境中通过激活PAR2和ERK1/2促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类患者中验证 | 探讨凝血因子X在前列腺癌中的作用及其对雄激素剥夺疗法的影响 | 前列腺癌、免疫抑制性中性粒细胞（PMN-MDSCs）、凝血因子X | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的前列腺肿瘤微环境样本 |
| 410 | 2024-10-18 |
Cancer cell-specific PD-L1 expression is a predictor of poor outcome in patients with locally advanced oral cavity squamous cell carcinoma
2024-Oct-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009617
PMID:39357980
|
研究论文 | 研究探讨了程序性死亡配体1（PD-L1）在局部晚期口腔鳞状细胞癌（OCSCC）中的表达及其对患者预后的影响 | 首次揭示了PD-L1在癌症细胞中的表达对局部晚期OCSCC患者预后的负面影响，并发现PD-L1的表达与免疫细胞无关，而是由复杂的调控网络介导 | 样本量较小，特别是单细胞RNA测序部分仅涉及10个样本 | 研究PD-L1表达在局部晚期口腔鳞状细胞癌中的预后意义及其与免疫微环境的关系 | 局部晚期口腔鳞状细胞癌患者及其肿瘤中的PD-L1表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 多重免疫组化染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 132名局部晚期口腔鳞状细胞癌患者，其中10名患者进行单细胞RNA测序 |
| 411 | 2024-10-18 |
Role of TOMM34 on NF-κB activation-related hyperinflammation in severely ill patients with COVID-19 and influenza
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105343
PMID:39276680
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研究论文 | 研究探讨了TOMM34在COVID-19和流感重症患者中与NF-κB激活相关的过度炎症中的作用 | 首次揭示了TOMM34在病毒感染中通过招募TRAF6促进NEMO的K63连接的多聚泛素化，从而促进NF-κB激活的机制 | NA | 识别驱动NF-κB激活和炎症的未知宿主因子，以开发免疫干预策略 | COVID-19和流感重症患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 健康个体27人，COVID-19重症患者21人，健康个体22人，COVID-19重症患者45人，流感重症患者16人 |
| 412 | 2024-10-18 |
Damping excessive viral-induced IFN-γ rescues the impaired anti-Aspergillus host immune response in influenza-associated pulmonary aspergillosis
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105347
PMID:39353282
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研究论文 | 研究流感相关肺曲霉病（IAPA）中免疫病理机制，发现过度产生的IFN-γ是主要驱动因素，并探讨了其分子机制和潜在的免疫治疗靶点 | 揭示了流感诱导的IFN-γ过度产生是IAPA中免疫功能障碍的主要驱动因素，并提出了新的免疫治疗靶点 | NA | 揭示流感相关肺曲霉病的免疫病理机制，开发辅助免疫调节疗法 | 流感相关肺曲霉病（IAPA）的免疫病理机制 | NA | 肺曲霉病 | 微计算机断层扫描（μCT）、生物发光成像（BLI）、空间转录组学、免疫荧光染色、功能性吞噬和杀伤试验 | NA | NA | 使用免疫功能正常的鼠模型进行研究 |
| 413 | 2024-10-17 |
Peripheral mononuclear cells and systemic lupus erythematosus association: Integrated study of single-cell sequencing and mendelian randomization analysis
2024-Oct-15, Lupus
IF:1.9Q3
DOI:10.1177/09612033241292705
PMID:39404110
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研究论文 | 本研究整合单细胞测序和孟德尔随机化分析，探讨外周单核细胞与系统性红斑狼疮的关联 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了系统性红斑狼疮发病机制中的关键基因和细胞亚型 | 本研究依赖于公开数据集，样本量有限，且未进行体内验证 | 探讨外周单核细胞与系统性红斑狼疮的关联，并识别疾病进展中的关键基因 | 系统性红斑狼疮患者的外周单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GSE135779数据集的样本 |
| 414 | 2024-10-17 |
Root-specific theanine metabolism and regulation at the single-cell level in tea plants (Camellia sinensis)
2024-Oct-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95891
PMID:39401074
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了茶树根部特定细胞类型中L-茶氨酸的代谢途径及其调控机制 | 首次在单细胞水平上解析了茶树根部L-茶氨酸的生物合成、储存和运输过程，并提出了多细胞分隔的生物合成模型 | NA | 探讨茶树根部特定细胞类型中L-茶氨酸的代谢及其调控机制 | 茶树根部特定细胞类型中的L-茶氨酸代谢 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
| 415 | 2024-10-17 |
B cell heterogeneity in cancer comes of age
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.013
PMID:39406185
|
研究论文 | 本文探讨了B细胞在癌症中的作用，并通过单细胞RNA测序定义了肿瘤浸润B细胞亚群的泛癌图谱 | 通过单细胞RNA测序技术定义了肿瘤浸润B细胞亚群的泛癌图谱，为理解B细胞依赖的抗肿瘤免疫提供了新的视角 | B细胞在癌症中的作用仍不完全清楚，需要进一步研究 | 探讨B细胞在癌症中的作用及其对肿瘤免疫的影响 | B细胞及其在癌症中的亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 416 | 2024-10-17 |
A pan-cancer single-cell RNA-seq atlas of intratumoral B cells
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.011
PMID:39406187
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了一个泛癌肿瘤内B细胞的图谱 | 首次提供了泛癌肿瘤内B细胞和浆细胞的单细胞RNA测序图谱，揭示了这些细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | NA | 旨在填补肿瘤浸润B细胞缺乏全面分类系统的空白 | 肿瘤浸润B细胞和浆细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 大量样本 |
| 417 | 2024-10-17 |
Immunotherapy and pan-apoptotic characterization of the tumor microenvironment in gastric cancer (STAD): a single-cell multidimensional analysis
2024-Oct-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01429-8
PMID:39397186
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研究论文 | 本研究通过单细胞多维分析，探讨了胃癌肿瘤微环境中自噬相关基因聚集的关键作用及其在细胞功能中的主要作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和非负矩阵分解技术，揭示了自噬相关基因在胃癌肿瘤微环境中的动态表达及其在细胞间通信中的作用 | 本研究主要集中在胃癌肿瘤微环境中的细胞亚群和基因表达模式，未涉及其他癌症类型或更广泛的应用场景 | 阐明自噬相关基因在胃癌肿瘤微环境细胞中的关键作用及其在细胞功能中的主要作用 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞亚群及其自噬相关基因的表达模式 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 (NMF) | 基因表达数据 | 多个胃癌肿瘤微环境中的细胞亚群 |
| 418 | 2024-10-17 |
Heterogeneity in extracellular matrix and immune microenvironment of anterior vaginal wall revealed by single-cell sequencing in women with stress urinary incontinence
2024-Oct-10, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114280
PMID:39395557
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了压力性尿失禁患者前阴道壁中不同细胞类型的转录组特征，揭示了细胞外基质和免疫微环境的异质性 | 首次通过单细胞测序技术揭示了压力性尿失禁患者前阴道壁中细胞外基质和免疫微环境的异质性，并发现了与疾病发生相关的特定细胞类型和细胞间通信变化 | 研究样本仅限于压力性尿失禁患者，且样本量未明确提及，可能影响结果的普适性 | 探索压力性尿失禁病理生理学中的细胞外基质和免疫微环境的异质性 | 压力性尿失禁患者前阴道壁中的不同细胞类型 | NA | 泌尿系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 419 | 2024-10-17 |
Exposure to PFOA, PFOS, and PFHxS induces Alzheimer's disease-like neuropathology in cerebral organoids
2024-Oct-09, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125098
PMID:39389246
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研究论文 | 研究探讨了全氟烷基物质（PFASs）暴露对大脑类器官的神经毒性影响 | 首次使用单细胞RNA测序和大脑类器官模型，揭示了PFASs暴露与阿尔茨海默病样神经病理学之间的关联 | 研究仅限于体外模型，需要进一步的体内实验验证 | 探究PFASs暴露对人类长期神经健康的影响 | 大脑类器官和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大脑类器官暴露于不同浓度的PFAS混合物，持续35天，并在第70天进行后续分析 |
| 420 | 2024-10-17 |
Mechanism exploration and model construction for small cell transformation in EGFR-mutant lung adenocarcinomas
2024-Oct-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01981-3
PMID:39353908
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研究论文 | 研究探索了EGFR突变型肺腺癌中向小细胞肺癌转化的机制，并构建了一个预测模型 | 首次通过转录组分析和多重免疫荧光技术揭示了EGFR-TKI治疗后肺腺癌向小细胞肺癌转化的潜在分子机制，并构建了一个高灵敏度和特异性的预测模型 | 研究样本量较小，且仅限于EGFR突变型肺腺癌，可能限制了结果的普适性 | 探索EGFR突变型肺腺癌中向小细胞肺癌转化的分子机制，并开发预测模型 | EGFR-TKI治疗前后的肺腺癌和小细胞肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析、空间转录组学、多重免疫荧光 | 预测模型 | 转录组数据、免疫荧光图像 | 包括LUAD-NT、SCLC-P、LUAD-BT和SCLC-AT的多个样本 |