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当前共找到 581 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-08-20 |
Recovering single-cell expression profiles from spatial transcriptomics with scResolve
2024-10-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100864
PMID:39326411
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研究论文 | 开发了scResolve方法，用于从多细胞分辨率的空间转录组数据中恢复单细胞表达谱 | 提出了一种新方法scResolve，能够从多细胞分辨率的空间转录组数据中准确恢复单个细胞在原始位置的表达谱，这一能力是传统细胞类型解卷积方法无法实现的，并支持细胞类型特异性的差异表达分析和罕见细胞群识别 | 摘要中未提及局限性 | 开发一种从空间转录组数据中恢复单细胞表达谱的方法，以提升空间分析的精度和灵活性 | 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 肺部疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2026-08-20 |
Generation, expansion, gene delivery, and single-cell profiling in rhesus macaque plasma B cells
2024-10-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100878
PMID:39406231
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研究论文 | 本研究开发了在恒河猴血浆B细胞中进行纯化、扩增、基因递送和单细胞分析的方法，为工程化B细胞治疗提供大型动物模型验证。 | 首次在非人灵长类恒河猴血浆B细胞中建立了完整的扩增、分化、AAV基因递送和单细胞分析流程，并发现了与人类不同的调控分子表达模式。 | 未提供具体局限性信息。 | 开发用于评估工程化B细胞在免疫健全大型动物模型中的方法。 | 恒河猴（非人灵长类）血浆B细胞。 | 单细胞测序、分子生物学 | NA | 单细胞测序、流式细胞术、AAV转导 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 恒河猴B细胞；培养7天后扩增10倍（具体样本量未给出） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-08-20 |
Dissecting the dynamic cellular transcriptional atlas of adult teleost testis development throughout the annual reproductive cycle
2024-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202296
PMID:38477640
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序，构建了成年黑石斑鱼在年度生殖周期中睾丸发育的动态细胞图谱，揭示了生殖细胞和体细胞的发育轨迹及相互作用网络 | 首次在成年硬骨鱼年度生殖周期中，利用单细胞转录组测序精细解析睾丸细胞异质性，并展示了精原细胞从糖酵解到线粒体呼吸的生物能量转换 | 未提及具体局限性 | 解析硬骨鱼睾丸在年度生殖周期中的动态细胞图谱，为精子发生调控和濒危物种种质保存奠定基础 | 成年黑石斑鱼的睾丸细胞，涵盖退化期、再生期和分化期 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞转录组测序 | 不适用 | 单细胞基因表达数据 | 来自成年黑石斑鱼在退化期、再生期和分化期的睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2026-08-16 |
Retinoic acid, an essential component of the roof plate organizer, promotes the spatiotemporal segregation of dorsal neural fates
2024-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202973
PMID:39250350
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了视黄酸在背侧神经管中促进神经嵴与顶板及中间神经元谱系分离的关键作用，并阐明了其通过Notch信号调控顶板-dI1边界建立的机制。 | 首次利用单细胞RNA测序结合在体局部抑制技术，全面解析了视黄酸在背侧神经命运分离过程中的下游分子机制，并发现视黄酸缺失导致感觉祖细胞与黑色素细胞未分离，形成异常的胶质-黑色素细胞。 | 未提及具体局限性，但可能受限于鸡胚模型与人类等哺乳动物的物种差异，且单细胞测序分析仅限于特定发育阶段。 | 探究背侧神经管来源的视黄酸如何影响中枢和外周谱系的时空分离，以及其在神经嵴生产终止和顶板形成中的作用。 | 鸡胚背侧神经管中的神经嵴细胞、顶板细胞和dI1中间神经元祖细胞。 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据（基因表达矩阵） | 具体数量未提及，涉及鸡胚样本。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 25 | 2026-08-13 |
Inflammation-induced epigenetic imprinting regulates intestinal stem cells
2024-10-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.006
PMID:39232559
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研究论文 | 本研究探讨了炎症如何通过表观遗传印记影响肠道干细胞的功能，并发现这些变化会持续存在并影响后续再生能力。 | 首次揭示了炎症诱导的代谢改变（特别是琥珀酸积累）导致肠道干细胞表观基因组重编程，从而持久影响其分化与再生能力。 | 未具体提及局限性。 | 探究肠道干细胞对炎症暴露的适应机制及其是否留下影响后续再生的表观遗传印记。 | Lgr5肠道干细胞，来自急性胃肠道移植物抗宿主病模型。 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞转录组学、类器官培养、代谢组学、表观基因组学、体内模型 | NA | 单细胞转录组数据、代谢数据、表观基因组数据 | 临床相关急性胃肠道移植物抗宿主病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-08-13 |
CCKBR+ cancer cells contribute to the intratumor heterogeneity of gastric cancer and confer sensitivity to FOXO inhibition
2024-10, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01360-z
PMID:39164456
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研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示胃癌中CCKBR+癌细胞异质性，并发现FOXO抑制对其具有治疗敏感性 | 首次识别CCKBR+干细胞样癌细胞与胃癌不良分化及预后相关，并揭示FOXO-唾液酸转移酶轴在维持肿瘤细胞稳态和生长中的新机制 | 研究主要基于有限样本（5例胃癌患者及40个样本的靶向分析），可能限制结果的普遍性 | 探索胃癌内肿瘤异质性的分子机制，并评估FOXO抑制作为靶向治疗策略的潜力 | 胃腺癌患者的恶性上皮细胞及CCKBR+肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag测序、凝集素沉降 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据 | 5例胃腺癌患者及40个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 27 | 2026-08-11 |
Deciphering the Sertoli Cell Signaling Pathway with Protein-Protein Interaction, Single-Cell Sequencing, and Gene Ontology
2024-10, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1089/cell.2024.0059
PMID:39475771
|
研究论文 | 该论文通过蛋白质相互作用、单细胞测序和基因本体分析，阐明支持细胞的信号通路在精子发生中的作用。 | 综合运用蛋白质-蛋白质相互作用、单细胞测序和基因本体分析，揭示支持细胞信号通路对精子发生的调控机制。 | 仅基于现有文献和生物信息学分析，缺乏实验验证。 | 解析支持细胞信号通路在精子发生中的调控机制，并探讨其失调与男性不育的关系。 | 支持细胞信号通路及其调控精子发生的分子机制。 | 生物信息学、单细胞测序 | 男性不育 | 单细胞测序、蛋白质相互作用分析、基因本体分析 | NA | 单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-08-09 |
Characterization of Cancer Stem Cells in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma by Single-cell RNA Sequencing
2024-10-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae056
PMID:39107908
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对喉鳞状细胞癌患者样本进行了癌症干细胞特征的综合分析，揭示了其分子机制和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上全面表征了喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞特性，鉴定了两个不同的干细胞亚群并发现其与肿瘤微环境的复杂相互作用 | 样本量较小（仅来自三名患者），且研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 揭示喉鳞状细胞癌中癌症干细胞的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 喉鳞状细胞癌患者的原发肿瘤组织、癌旁组织和局部淋巴结中的细胞 | 单细胞测序 | 喉鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名喉鳞状细胞癌患者的匹配肿瘤组织、癌旁组织和淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-08-09 |
Single-cell RNA-seq Reveals the Inhibitory Effect of Methamphetamine on Liver Immunity with the Involvement of Dopamine Receptor D1
2024-10-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae060
PMID:39196711
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示甲基苯丙胺对肝脏免疫的抑制作用及其与多巴胺受体D1的关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细描绘了慢性甲基苯丙胺暴露对肝脏免疫细胞亚群的影响，并揭示了多巴胺受体D1在调节免疫细胞身份转变和功能通路中的新作用 | 未提及具体的局限性信息 | 探究慢性甲基苯丙胺暴露对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与机制 | 肝脏免疫细胞，包括巨噬细胞、T细胞、自然杀伤T细胞和2型固有淋巴样细胞 | 单细胞转录组学 | 甲基苯丙胺诱导的免疫损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-08-09 |
Recessive variants in MYO1C as a potential novel cause of proteinuric kidney disease
2024-10, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-024-06426-1
PMID:38904753
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研究论文 | 通过外显子测序和纯合性定位，在1649名肾病综合征患儿中鉴定出MYO1C基因隐性变异作为潜在的新致病原因 | 首次将MYO1C基因隐性变异与儿童肾病综合征联系起来，并利用结构建模和单细胞RNA测序数据揭示其致病机制 | 仅在两例患者中发现变异，样本量小，缺乏功能实验验证，结构建模基于部分结构进行推断 | 阐明肾病综合征的新单基因病因 | 1649名患有肾病综合征的儿科患者，以及两例MYO1C变异携带者 | 基因组学 | 肾病综合征 | 外显子测序 | NA | 基因组测序数据及单细胞RNA测序数据 | 1649名儿童患者，其中两例携带MYO1C变异 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2026-08-09 |
Yeast9: a consensus genome-scale metabolic model for S. cerevisiae curated by the community
2024-Oct, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00060-7
PMID:39134886
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研究论文 | 介绍了由社区维护的酿酒酵母共识基因组规模代谢模型Yeast9，并通过多组学数据验证其预测性能 | 构建了更新的共识基因组规模代谢模型Yeast9，并结合单细胞转录组、蛋白质组和机器学习方法进行广泛验证 | 摘要未提及具体限制 | 评估Yeast9模型的预测性能，并展示其在多组学整合分析中的应用 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其突变菌株 | 系统生物学 | NA | 基因组规模代谢建模、单细胞转录组学、蛋白质组学、通量分析 | 基因组规模代谢模型（GEM）、机器学习模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 163个条件特异性GEMs（来自渗透压或参考条件下的单细胞转录组），1229个突变菌株的转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-08-07 |
Arabidopsis uses a molecular grounding mechanism and a biophysical circuit breaker to limit floral abscission signaling
2024-10-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405806121
PMID:39453742
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，解析了拟南芥花器官脱落过程中HAE/HSL2信号通路的分子调控机制，并揭示了MKP1基因和IDL家族基因在其中的作用。 | 首次通过单细胞测序技术全面表征植物脱落信号通路的核心基因表达程序，并发现MKP1作为负调控因子在信号激活前建立阈值，以及IDL家族基因在远端脱落区细胞的表达形成的生物物理断路器机制。 | 本研究的发现可能仅限于拟南芥模型，其在不同植物物种中的普适性尚未验证。 | 旨在阐明拟南芥花器官脱落信号通路的调控机制，特别是识别新的调控因子并理解其作用机制。 | 拟南芥花器官脱落区细胞，包括近端和远端脱落区细胞亚群。 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含脱落区细胞的拟南芥花组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 33 | 2026-08-07 |
Deciphering STAT3's negative regulation of LHPP in ESCC progression through single-cell transcriptomics analysis
2024-10-28, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00962-0
PMID:39468431
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示STAT3负调控LHPP在食管鳞状细胞癌进展中的作用机制 | 首次通过单细胞转录组分析揭示STAT3直接抑制LHPP启动子，形成调控轴影响食管鳞状细胞癌进展 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；未深入探讨STAT3-LHPP轴在其他癌症中的普适性 | 阐明食管鳞状细胞癌中细胞动态及分子机制，聚焦STAT3对LHPP的转录影响，寻找潜在治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤及癌旁组织细胞、ESCC细胞系 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、qPCR、实验测定 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本基因表达数据 | 44,206个细胞来自ESCC患者肿瘤及癌旁组织，21例ESCC患者用于qPCR验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-08-07 |
Rewriting cellular fate: epigenetic interventions in obesity and cellular programming
2024-10-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00944-2
PMID:39390356
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综述 | 本文探讨表观遗传干预在肥胖和细胞编程中的作用机制，涵盖DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA，并总结相关研究方法。 | 从表观遗传干预角度系统分析肥胖机制，整合多组学技术如单细胞测序和染色质免疫沉淀，提出针对表观遗传靶点的治疗干预策略。 | 未提供具体实验数据或临床验证，主要基于现有文献综述，缺乏实证支持。 | 阐明表观遗传修饰在肥胖发展中的关键作用，并探索表观遗传干预作为治疗靶点的潜力。 | 肥胖相关的表观遗传修饰、细胞编程和重编程过程，以及脂肪生成和代谢途径。 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化分析、组蛋白修饰分析、非编码RNA分析、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、体细胞核移植、细胞融合。 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、表观遗传修饰数据。 | NA | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀 | NA | NA |
| 35 | 2026-08-07 |
Functional plasticity shapes neutrophil response to Leishmania major infection in susceptible and resistant strains of mice
2024-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012592
PMID:39378227
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞在利什曼原虫感染中的功能可塑性，易感小鼠产生更多NETs，而抗性小鼠更倾向于吞噬作用 | 首次通过单细胞RNA测序和体内成像，发现NET形成与吞噬作用之间的平衡决定了宿主对利什曼原虫感染的易感性 | 未详细说明NET消化对寄生虫传播的长期影响及其在人类感染中的相关性 | 探究中性粒细胞效应功能（NET形成与吞噬作用）在利什曼原虫感染易感性和抗性小鼠中的差异及其机制 | BALB/c（易感）和C57BL/6（抗性）小鼠的中性粒细胞，以及利什曼原虫感染模型 | 免疫学、单细胞转录组学 | 利什曼病 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、体内成像 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、体内成像数据 | 两种小鼠品系（BALB/c和C57BL/6）的中性粒细胞，具体数量未在标题和摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'（推测，基于摘要中的scRNA-seq） |
| 36 | 2026-08-07 |
Gene signatures for cancer research: A 25-year retrospective and future avenues
2024-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012512
PMID:39413055
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观点文章 | 本文回顾了过去25年癌症研究中基因标签的发展，并探讨了提高其可靠性所面临的挑战和未来方向。 | 提出了通过多组学整合、机器学习和单细胞RNA-seq等技术提高基因标签可重复性的新见解。 | 作为观点文章，缺乏实证数据支持，主要基于作者的主观分析和文献回顾。 | 探讨基因标签在癌症研究中的挑战和改进策略，以提高其在精准医学中的应用可靠性。 | 癌症转录组研究中的基因标签及其跨队列一致性。 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 37 | 2026-08-07 |
Non-genetic differences underlie variability in proliferation among esophageal epithelial clones
2024-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012360
PMID:39466790
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研究论文 | 本研究通过成像和细胞条形码技术追踪食管上皮细胞的克隆生长，发现约10%的克隆呈指数增长，其余呈逻辑增长，并揭示非遗传因素导致的增殖差异与细胞状态相关 | 首次结合克隆追踪、数学建模和单细胞RNA测序，揭示食管上皮细胞克隆增殖差异的非遗传机制，并鉴定出与高增殖相关的WNT和PI3K通路基因 | 研究基于体外模型，可能无法完全反映体内复杂环境；克隆追踪仅覆盖四个倍增周期，长期行为未知 | 探究食管上皮细胞克隆增殖差异的动态和细胞状态基础 | 食管上皮细胞（EPC2-hTERT）克隆 | 数字病理学, 单细胞组学 | 食管疾病 | 细胞条形码, 单细胞RNA测序 | 数学模型（指数和逻辑增长模型） | 图像, 测序数据 | 未明确，涉及体外培养的食管上皮细胞克隆和健康人食管上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-08-07 |
Mcadet: A feature selection method for fine-resolution single-cell RNA-seq data based on multiple correspondence analysis and community detection
2024-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012560
PMID:39466833
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研究论文 | 提出Mcadet，一种基于多重对应分析和社区检测的特征选择方法，用于细分辨率单细胞RNA-seq数据。 | 创新地整合了多重对应分析、基于图的社区检测和一种新颖的统计检验方法，以解决现有高变基因选择方法在细分辨率数据集和少数细胞类型上准确性和可靠性不足的问题。 | 高变基因选择对不同下游分析的影响各异，需进一步研究。 | 开发一种特征选择框架，以提高细分辨率单细胞RNA-seq数据和少数细胞类型中高变基因选择的准确性和可靠性。 | 细分辨率单细胞RNA-seq数据集和包含少数细胞群的数据集。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多重对应分析、图社区检测、统计检验 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-08-07 |
scCaT: An explainable capsulating architecture for sepsis diagnosis transferring from single-cell RNA sequencing
2024-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012083
PMID:39432561
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研究论文 | 提出一种名为scCaT的可解释深度学习框架，结合胶囊架构与Transformer，利用单细胞RNA测序数据构建败血症诊断模型，并迁移至批量RNA数据。 | 将胶囊架构与Transformer融合，利用胶囊按生物学功能分组基因，提供基因表达编码的可解释性，并实现从单细胞到批量RNA数据的模型迁移。 | 未提及，但可能受限于单细胞数据质量及模型对批量数据的泛化性。 | 开发败血症诊断模型，提高诊断准确率并增强可解释性。 | 败血症患者和健康对照样本的基因表达数据（包括单细胞和批量RNA）。 | 机器学习 | 败血症 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 胶囊网络、Transformer | 基因表达数据 | 单细胞测试集和七个批量RNA队列，具体样本数未提供 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-08-06 |
Intraocular Immune Response in Human Uveitis: Time to Look Beyond Animal Models
2024-10, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.04.026
PMID:38703799
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综述 | 本文回顾了研究人类葡萄膜炎眼内免疫反应的当前和未来方法，并比较了人类研究与动物模型的优缺点。 | 强调单细胞RNA测序在分析眼内液体低细胞产量样本中的优势，并提倡结合历史病理数据和人类免疫表型与动物研究进行转化医学研究。 | 当前单细胞RNA测序技术成本高且劳动密集，且人类研究多局限于组织学或液体取样，可能无法完全反映眼内免疫反应的复杂性。 | 探索人类葡萄膜炎眼内免疫反应的研究方法，并推动超越动物模型的转化研究。 | 人类葡萄膜炎患者的眼内组织和液体样本，包括眼内液体、外周血及病理标本。 | 数字病理学 | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织病理学 | NA | 图像，文本 | 不适用（综述性文章，未报告具体样本量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |