单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 580 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-03-04
Sex-dependent APOE4 neutrophil-microglia interactions drive cognitive impairment in Alzheimer's disease
2024-Oct, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学等技术,揭示了APOE4女性携带者中一种新型中性粒细胞亚群与认知障碍的关联,并提出了靶向IL-17F的治疗策略 首次在APOE4女性阿尔茨海默病患者中发现与认知障碍相关的特定中性粒细胞亚群,并阐明其通过IL-17F/IL-17RA轴抑制小胶质细胞功能的机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类队列,需要在更大规模人群中验证;治疗策略的临床转化效果尚待评估 探究APOE4基因型在阿尔茨海默病中的性别特异性免疫机制 APOE4携带者的中性粒细胞与小胶质细胞 单细胞组学与神经免疫学 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序,多重流式细胞术 NA 转录组数据,流式细胞数据 两个独立的APOE4女性AD患者队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-03-03
Recovering single-cell expression profiles from spatial transcriptomics with scResolve
2024-Oct-21, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文开发了一种名为scResolve的方法,用于从多细胞分辨率空间转录组学数据中恢复单细胞表达谱 scResolve能够准确恢复单个细胞在其位置上的表达谱,这是细胞类型去卷积方法无法实现的,并支持细胞类型特异性差异基因表达分析和稀有细胞群体的准确识别 NA 开发一种从空间转录组学测量中恢复单细胞表达谱的方法,以克服现有技术缺乏单细胞分辨率的问题 人类乳腺癌数据和人类肺部疾病数据 数字病理学 肺癌 空间转录组学 NA 空间转录组学测量数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
23 2026-03-03
A single-cell RNA-seq dataset describing macrophages in NSCLC tumor and peritumor tissues
2024-10-01, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序生成了非小细胞肺癌肿瘤及瘤周组织中巨噬细胞的转录组数据集,以探究其在肿瘤微环境中的特征差异和相关性 首次基于单细胞RNA测序技术,全面描述了NSCLC肿瘤与瘤周组织中巨噬细胞的转录组特征,填补了该领域在组织特异性差异方面的知识空白 研究仅提供了数据集,未进行深入的机制或功能验证分析,且样本来源和数量未在摘要中明确说明 探究非小细胞肺癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞的特性,以理解NSCLC的进展并识别临床治疗靶点 非小细胞肺癌肿瘤及瘤周组织中的巨噬细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2026-03-02
Colorectal cancer-associated bacteria are broadly distributed in global microbiomes and drivers of precancerous change
2024-10-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过宏基因组分析揭示了与结直肠癌相关的肠道细菌在全球微生物组中的广泛分布,并证明这些微生物可驱动癌前病变 首次在全球范围内系统鉴定结直肠癌相关肠道细菌,采用参考基因组无关的基因聚类方法,发现大量先前未知的CRC相关微生物,并在临床前模型中验证其诱导癌前病变的能力 研究主要基于已有宏基因组数据,需要进一步实验验证具体机制;临床前模型结果需在人体中确认 系统定义全球人群中与结直肠癌及健康相关的肠道细菌组成及其功能 全球人群的肠道微生物组、结直肠癌患者与健康个体的微生物组差异 微生物组学 结直肠癌 超深度鸟枪法宏基因组测序、单细胞RNA测序、类器官共培养 NA 宏基因组测序数据、单细胞RNA测序数据 全球微生物组调查的已发表数据(具体样本数量未明确说明) NA 宏基因组测序、单细胞RNA测序 NA NA
25 2026-02-28
Dual targeting macrophages and microglia is a therapeutic vulnerability in models of PTEN-deficient glioblastoma
2024-Oct-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中巨噬细胞与小胶质细胞的负相关性,并提出了靶向LOX和CLOCK-OLFML3轴的双重抑制联合抗PD1疗法的治疗策略 首次发现PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中巨噬细胞与小胶质细胞在肿瘤微环境中呈负相关,并揭示了LOX抑制通过NF-κB-PATZ1信号通路上调OLFML3表达的补偿机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 探索PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞和小胶质细胞的相互作用机制及联合靶向治疗策略 PTEN缺陷型胶质母细胞瘤小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞、小胶质细胞及肿瘤细胞 肿瘤免疫学 胶质母细胞瘤 单细胞转录组学、多重顺序免疫荧光、功能研究 NA 转录组数据、免疫荧光图像 未明确说明具体样本数量,使用PTEN缺陷型胶质母细胞瘤小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
26 2026-02-27
MerTK+ macrophages promote melanoma progression and immunotherapy resistance through AhR-ALKAL1 activation
2024-10-04, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序识别了表达高水平MerTK的巨噬细胞亚群,揭示了其在黑色素瘤进展和免疫治疗耐药中的作用机制 首次发现AhR-ALKAL1通路激活驱动MerTK+巨噬细胞的免疫抑制表型极化,并开发了靶向递送AhR拮抗剂的治疗策略 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;靶向递送系统的临床转化潜力需进一步评估 探究巨噬细胞异质性在黑色素瘤微环境中的调控机制及免疫治疗耐药成因 黑色素瘤微环境中的MerTK+巨噬细胞亚群 单细胞组学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量(基于小鼠模型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2026-02-26
Interfacial delivery of carbon monoxide via smart titanium implant coating for enhanced soft tissue integration with switchable antibacterial and immunomodulatory properties
2024-Oct, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本研究开发了一种智能钛植入物涂层,通过近红外光控释放一氧化碳,以增强软组织整合,并具有可切换的抗菌和免疫调节功能 创新点在于构建了一种可控释放一氧化碳的双功能涂层,能在近红外照射下主动加速一氧化碳生成以抗菌,无照射时则缓慢释放一氧化碳诱导巨噬细胞极化,从而调节免疫微环境 研究仅在大鼠植入模型中进行验证,未涉及更大型动物或人体试验,且涂层长期稳定性和安全性需进一步评估 研究目标是增强钛植入物周围的软组织整合,以提高植入物的长期成功率 研究对象为钛植入物表面涂层及其在大鼠模型中的软组织整合效果 生物医学工程 植入物相关感染和炎症 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 大鼠植入模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2026-02-18
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了囊性纤维化相关糖尿病(CFRD)中胰岛GLP-1受体表达降低及细胞特异性转录程序紊乱的机制 首次结合空间转录组学和免疫组化揭示CFRD中胰岛α/β细胞基因表达失调及GLP-1R蛋白表达特异性降低 样本量有限,未验证GLP-1R恢复是否能直接改善β细胞功能 阐明CFRD中胰岛素分泌受损的分子机制 人类胰腺组织(CFRD患者与非CF/非糖尿病对照) 空间转录组学 囊性纤维化相关糖尿病 免疫组化、空间转录组学、基因集富集分析 NA 组织切片图像、空间基因表达数据 人类CFRD与非CF/非糖尿病对照胰腺样本(未明确数量) NA 空间转录组学 NA NA
29 2026-02-17
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1
综述 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合征之间的共同联系,并提出了利用组学平台进行未来研究的建议 首次提出将组学技术(如空间转录组学、蛋白质组学)应用于研究mTOR通路在唐氏综合征相关阿尔茨海默病中的作用,采用无偏倚方法揭示病理机制 目前尚未实际应用组学技术分析mTOR通路与DS-AD的关联,机制研究尚不充分 探讨mTOR通路在阿尔茨海默病与唐氏综合征共同病理机制中的作用,并推动未来跨组学研究 阿尔茨海默病和唐氏综合征的分子病理机制,特别是mTOR通路及其上游调控因子 生物信息学 阿尔茨海默病 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 NA 多组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
30 2026-02-17
Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-10-17, Viruses
研究论文 开发了一种基于激活诱导标记(AIM)的检测方法,用于识别、分选并分析丙型肝炎病毒(HCV)特异性T细胞,以进行单细胞RNA测序研究 该方法不依赖于MHC多聚体,能够高灵敏度检测稀有的抗原特异性T细胞,并适用于不同MHC匹配的研究对象 研究仅基于一名受试者进行验证,样本量较小,且未在更大队列中评估方法的普适性 开发一种用于识别和分离HCV特异性T细胞的方法,以进行单细胞转录组分析 HCV特异性T细胞(包括CD4和CD8 T细胞) 免疫学 丙型肝炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、激活诱导标记(AIM)检测、T细胞受体(TCR)分析 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据 一名受试者(具体数量未明确说明,但基于单例分析) NA 单细胞RNA-seq NA NA
31 2026-02-10
Identification of kidney cell types in scRNA-seq and snRNA-seq data using machine learning algorithms
2024-Oct-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本文评估了五种监督机器学习算法在自动注释肾脏单细胞和单核RNA测序数据中细胞类型的性能 首次系统比较了五种监督分类方法在肾脏scRNA-seq和snRNA-seq数据中的细胞类型注释性能,并展示了跨数据集和测序技术的高准确性 研究样本数量有限,且当模型主要在scRNA-seq数据上训练并测试于snRNA-seq数据时,性能有所下降 开发自动细胞类型注释方法以替代耗时的手动注释,促进肾脏疾病细胞机制研究 肾脏细胞 机器学习 肾脏疾病 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 支持向量机, 随机森林, 多层感知器, k近邻, 极端梯度提升 RNA测序数据 79个肾脏活检样本中的62,120个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
32 2026-02-06
Single-cell dissection reveals promotive role of ENO1 in leukemia stem cell self-renewal and chemoresistance in acute myeloid leukemia
2024-10-08, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了α-烯醇化酶(ENO1)在急性髓系白血病干细胞自我更新和化疗耐药中的促进作用 首次在单细胞水平上结合生物信息学和机器学习算法,系统分析了ENO1在白血病干细胞中的功能,并验证其作为治疗靶点和预后生物标志物的潜力 样本量相对较小(8名患者和4名健康对照),且功能研究主要在细胞系中进行,缺乏体内实验验证 探究ENO1是否以及如何影响急性髓系白血病中白血病干细胞的自我更新和化疗耐药性 急性髓系白血病患者的骨髓样本、健康对照者的骨髓样本以及AML细胞系 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序、生物信息学分析、机器学习算法 机器学习模型 单细胞RNA测序数据 8名复发/难治性AML患者和4名健康对照的骨髓样本,以及37名对照受试者的表达数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
33 2026-01-28
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
研究论文 本研究探讨在空间转录组学数据中,将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 首次系统评估高变异基因与空间变异基因联合使用对细胞类型聚类的影响,覆盖多个平台和超过50个真实数据集 未详细探讨基因选择方法对聚类结果的具体影响机制,可能受数据集异质性限制 提高空间转录组学数据中细胞类型聚类的准确性和效率 空间转录组学数据中的基因表达模式 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 NA 转录组数据 超过50个真实空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
34 2026-01-24
Restoring social deficits in IRSp53-deleted mice: chemogenetic inhibition of ventral dentate gyrus Emx1-expressing cells
2024-10-07, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过化学遗传学抑制小鼠腹侧齿状回Emx1表达细胞,恢复了IRSp53缺失导致的社会行为缺陷 首次确定腹侧齿状回是IRSp53缺失引起社会行为缺陷的关键脑区,并通过化学遗传学方法实现行为恢复 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床验证;机制研究仍待深入 探究IRSp53缺失导致社会行为缺陷的神经机制并寻找潜在治疗靶点 Emx1-Cre;IRSp53 flox/flox基因工程小鼠 神经科学 精神疾病 化学遗传学、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 行为学数据、基因表达数据 未明确说明,但涉及实验组和对照组小鼠 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
35 2026-01-21
Single cell RNA-sequencing identifies the effect of Normothermic ex vivo liver perfusion on liver-resident T cells
2024-10, Transplant immunology IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了常温体外肝脏灌注对肝脏驻留记忆T细胞的影响,并评估了抗炎细胞因子在减少T细胞激活中的作用 首次在大鼠肝脏中创建了肝脏驻留记忆T细胞的图谱,并在单细胞基因表达水平上展示了常温体外肝脏灌注对T细胞的影响 研究仅基于大鼠模型,未涉及人类样本,且样本规模有限,可能影响结果的普适性 研究常温体外肝脏灌注对肝脏驻留记忆T细胞表型的影响,并评估抗炎细胞因子在灌注过程中的保护作用 大鼠肝脏及其中的组织驻留记忆T细胞 单细胞测序 肝脏移植相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 大鼠肝脏样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
36 2026-01-16
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-10, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1
综述 本文探讨了细胞间相互作用在复杂生物功能中的作用,并综述了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术如何革新我们对细胞间通讯的理解 整合了单细胞测序、空间转录组学与生物工程工具,提供了分析细胞接触介导基因表达变化的新视角 作为综述文章,未涉及具体实验数据或方法验证 解析细胞间接触如何调控细胞反应网络 多细胞生物中的细胞间相互作用 计算生物学 NA 单细胞测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
37 2026-01-09
Characterization of cell states in biliary tract cancers identifies mechanisms of therapeutic resistance in a phase II trial of DKN-01/nivolumab
2024-Oct-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析胆道癌患者活检样本,鉴定了五种恶性细胞状态,并揭示了DKN-01/nivolumab联合治疗中免疫抑制机制与治疗抵抗的新见解 首次系统分类胆道癌中功能注释的细胞状态,并描述了神经样和内皮样状态在胆道癌中的新发现,这些状态在其他癌症中与治疗抵抗相关 研究为单臂二期临床试验,样本量有限,未观察到客观治疗反应,且机制分析基于配对活检,可能受样本异质性影响 探索胆道癌治疗抵抗机制,特别是针对DKN-01/nivolumab联合免疫疗法的失败原因 晚期胆道癌患者的配对治疗前和治疗中活检样本 数字病理学 胆道癌 scRNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 二期临床试验中的患者配对活检样本(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2026-01-07
Altered AP-1, RUNX and EGR chromatin dynamics drive fibrotic lung disease
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学单核ATAC/RNA测序分析,揭示了AP-1、RUNX和EGR转录因子在纤维化肺病中的染色质动态变化及其对促纤维化基因程序的调控机制 首次使用神经网络工具ChromBPNet在单碱基对分辨率下推断转录因子结合,并开发新算法HALO确认AP-1、RUNX和EGR的活性,构建了TF-调控元件-基因网络 研究基于移植肺样本,可能无法完全反映疾病早期或动态变化,且样本量有限 探究纤维化肺病中成纤维细胞和巨噬细胞的转录调控机制 系统性硬化相关间质性肺病(SSc-ILD)患者和供体对照的肺组织 数字病理学 肺纤维化 单核ATAC-seq, 单核RNA-seq, 多组学分析 神经网络(ChromBPNet) 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
39 2025-12-31
Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia
2024-Oct-16, Research square
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了阿尔茨海默病大脑中微胶质细胞的异质性及其与淀粉样斑块的空间分布关系 首次整合多队列、多脑区的单细胞与空间转录组学数据,系统绘制了微胶质细胞在阿尔茨海默病中的多样性图谱,并揭示了其状态与淀粉样斑块空间定位的特异性关联 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本来源和脑区覆盖可能仍存在一定局限性 阐明阿尔茨海默病中微胶质细胞的转录状态异质性及其空间分布特征 实验模型和人类大脑中的微胶质细胞,包括阿尔茨海默病患者与对照样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 空间定位数据, 免疫染色图像 多队列、多脑区样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
40 2025-12-28
Engineered extracellular vesicles enable high-efficient delivery of intracellular therapeutic proteins
2024-Oct-01, Protein & cell IF:13.6Q1
研究论文 本文报告了一种基于细胞外囊泡的细胞内递送方法(IDEA),用于高效递送细胞内治疗蛋白,无需使用支架 提出IDEA方法,无需支架即可高效包装和递送原生蛋白质,避免了传统策略对货物稳定性和功能性的影响 NA 开发一种高效的细胞内递送系统,以扩展作用于细胞质或核靶点的蛋白质治疗 细胞外囊泡(EVs)作为递送载体,以及cGAS蛋白作为概念验证货物 生物医学工程 肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 多个同基因肿瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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