单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-10-26 |
Oxysterols contribute to immune cell recruitment in SLE skin lesions
2024-Oct-22, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03414-6
PMID:39438997
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研究论文 | 研究探讨了氧化固醇在系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中对免疫细胞招募的贡献 | 首次揭示了纤维细胞通过表达CH25H和CYP7B1促进SLE皮肤病变中免疫细胞招募的机制 | NA | 探讨氧化固醇在SLE皮肤病变中的作用及其机制 | SLE患者的皮肤病变和氧化固醇代谢 | NA | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）、免疫组化染色、单细胞测序 | NA | 代谢物数据、基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-10-26 |
Integrated immunogenomic analyses of single-cell and bulk profiling construct a T cell-related signature for predicting prognosis and treatment response in osteosarcoma
2024-Oct-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01461-8
PMID:39436466
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了一个与T细胞相关的特征，用于预测骨肉瘤患者的预后和治疗反应 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别了与T细胞相关的基因，并构建了一个预测骨肉瘤患者预后的特征 | 本研究主要基于公共数据库的数据，未涉及临床试验验证 | 研究T细胞相关基因在骨肉瘤发病机制中的作用，并构建预测模型 | 骨肉瘤患者的T细胞相关基因和免疫反应 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3000个高度可变基因，多个骨肉瘤细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-10-26 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment changes and prognostic gene signatures in hepatocellular carcinoma
2024-Oct-22, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113317
PMID:39447409
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA转录组数据研究了肝细胞癌（HCC）恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记 | 首次通过单细胞RNA转录组数据揭示了HCC进展过程中肿瘤微环境的主要成分变化，并识别了与预后相关的基因标记 | 研究基于公开的单细胞RNA转录组数据，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探究肝细胞癌恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记 | 肝细胞癌患者的单细胞RNA转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自不同阶段的HCC患者样本，代表I-IV期 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-10-26 |
Isotope Encoded chemical Imaging Identifies Amyloid Plaque Age Dependent Structural Maturation, Synaptic Loss, and Increased Toxicity
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617019
PMID:39416086
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研究论文 | 研究使用同位素编码的化学成像技术，追踪阿尔茨海默病中β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，并分析其对神经元功能和毒性的影响 | 首次将动态MSI、结构斑块成像和全基因组空间转录组学在单个斑块水平上进行功能整合，提供了前所未有的时间和空间分辨率 | NA | 阐明早期β-淀粉样蛋白斑块形成过程中的生化过程，并研究斑块成熟对神经元功能和毒性的影响 | β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，以及其对神经元功能和毒性的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 质谱成像(MSI)、代谢同位素标记、超光谱共聚焦显微镜 | NA | 图像、基因表达数据 | 使用敲入Aβ小鼠模型，样本包括10个月和18个月大的动物 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-10-26 |
Berberine Protects against Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Intrahepatic T Cell Heterogeneity
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405182
PMID:39135526
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研究论文 | 研究探讨了小檗碱通过调节肝内T细胞异质性来抑制肝细胞癌进展的机制 | 首次详细阐述了小檗碱通过调节肝内T细胞异质性来抑制肝细胞癌进展的机制 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨小檗碱在肝细胞癌中的抗肿瘤作用及其机制 | 小檗碱对肝细胞癌免疫微环境的影响 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-10-26 |
Novel Arf1 Inhibitors Drive Cancer Stem Cell Aging and Potentiate Anti-Tumor Immunity
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202404442
PMID:39225354
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研究论文 | 研究介绍了两种新型Arf1抑制剂DU101和DU102，通过触发癌症干细胞衰老和增强抗肿瘤免疫，展示了其在癌症治疗中的潜力 | 首次引入DU101和DU102作为新型Arf1抑制剂，通过单细胞测序分析其对肿瘤免疫微环境的重塑作用，并发现其能增加肿瘤相关CD8+ CD4+双阳性T细胞，从而提高癌症患者的无病生存率 | NA | 探索新型Arf1抑制剂在癌症治疗中的应用，特别是其对癌症干细胞衰老和抗肿瘤免疫的影响 | Arf1抑制剂DU101和DU102对癌症干细胞和肿瘤免疫微环境的影响 | 癌症研究 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 小鼠癌症和PDX模型，以及癌症患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-10-26 |
Proteomic Heterogeneity of the Extracellular Matrix Identifies Histologic Subtype-Specific Fibroblast in Gastric Cancer
2024-Oct, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2024.100843
PMID:39305996
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研究论文 | 研究探讨了胃癌中细胞外基质（ECM）的蛋白质组异质性，并分析了其与组织学亚型和患者预后的关系 | 首次通过定量蛋白质组学分析胃癌去细胞化组织中的肿瘤ECM，识别出与特定组织学亚型相关的关键分子标记 | 研究主要集中在ECM的蛋白质组分析，未涉及其他分子层面的深入探讨 | 研究胃癌中细胞外基质的蛋白质组异质性及其与组织学亚型和患者预后的关系 | 胃癌患者的去细胞化组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | 多个胃癌患者的去细胞化组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-10-25 |
Decoding the multiple functions of ZBP1 in the mechanism of sepsis-induced acute lung injury
2024-Oct-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07072-x
PMID:39433574
|
研究论文 | 研究探讨了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的多重功能 | 首次定义了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用，并揭示了其在调节巨噬细胞和肺内皮细胞功能中的重要性 | 研究仅基于ZBP1敲除小鼠模型，未涉及人类样本 | 探讨ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用及其潜在治疗价值 | ZBP1在巨噬细胞和肺内皮细胞中的功能 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | ZBP1敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-10-25 |
Enhancing spatial domain detection in spatial transcriptomics with EnSDD
2024-Oct-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07001-y
PMID:39433947
|
研究论文 | 本文提出了一种名为EnSDD的方法，通过集成学习整合多种空间域检测方法，以提高空间转录组学中空间域的识别准确性 | EnSDD的创新点在于其动态加权机制，优化了每个基础模型的贡献，并提供了一种无需真实标签数据的性能评估指标 | NA | 提高空间转录组学中空间域的识别准确性，揭示组织异质性和区域化特征 | 空间转录组学数据中的空间域、特定空间变异基因和细胞类型的空间分布 | 空间转录组学 | NA | 集成学习 | 集成学习模型 | 空间转录组数据 | 多种组织结构的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-10-25 |
Spatial-transcriptomic profiling: a new lens for understanding myelofibrosis pathophysiology
2024-Oct-21, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01877-3
PMID:39434124
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学在理解骨髓纤维化病理生理学中的应用 | 引入空间转录组学技术，提供了对骨髓和脾脏中基因表达的高分辨率映射，揭示了驱动疾病进展的分子特征和病理微环境 | NA | 通过空间转录组学技术深入理解骨髓纤维化的病理生理学，识别新的治疗靶点和生物标志物 | 骨髓纤维化的病理生理学、临床表型和治疗干预 | 数字病理学 | 血液病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-10-25 |
Exploring the impact of ITGB2 on glioma progression and treatment: Insights from non-apoptotic cell death and immunotherapy
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24231
PMID:38488682
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研究论文 | 研究探讨了整合素β2（ITGB2）在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用 | 首次揭示了ITGB2在非凋亡细胞死亡和免疫治疗反应中的关键作用，并展示了其在预测免疫活动、突变特征和药物反应中的潜力 | 研究主要基于体外模型和数据分析，未来需要进一步的临床验证 | 探讨ITGB2在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用 | 胶质瘤细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序分析（iTalk和ICELLNET） | NA | 数据集 | 10个不同的胶质瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-10-25 |
Elucidating the role of FOS in modulating the immune microenvironment through fibroblast and myeloid cell regulation in locoregional recurrent HNSCC
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24262
PMID:38567514
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研究论文 | 本研究探讨了FOS在调节头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）局部复发中的免疫微环境中的作用，特别是其对成纤维细胞和髓系细胞的影响 | 本研究揭示了FOS在HNSCC肿瘤微环境中不同细胞群体中的表达差异，并探讨了其与免疫和缺氧相关通路的关联，为HNSCC的治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 研究FOS在HNSCC局部复发中的免疫微环境调节作用 | FOS在HNSCC肿瘤微环境中对成纤维细胞和髓系细胞的调节作用 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA | HNSCC患者组织样本及相邻非癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-10-25 |
Single-cell and bulk RNA-sequencing reveal SPP1 and CXCL12 as cell-to-cell communication markers to predict prognosis in lung adenocarcinoma
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24297
PMID:38622884
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，揭示了SPP1和CXCL12作为细胞间通讯标志物，用于预测肺腺癌预后的潜力 | 首次揭示了SPP1和CXCL12在肺腺癌微环境中的细胞间通讯作用，并探讨了它们与免疫细胞的关系 | 研究依赖于公共数据集，可能存在数据质量和样本偏差的问题 | 探讨肺腺癌微环境中的细胞间通讯特征及其与预后的关系 | 肺腺癌肿瘤组织及其邻近的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自公共数据集的肺腺癌批量RNA测序数据和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-10-25 |
PTPN7 mediates macrophage-polarization and determines immunotherapy in gliomas: A single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24259
PMID:38581214
|
研究论文 | 研究探讨了PTPN7在胶质瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 首次系统分析了PTPN7在胶质瘤微环境中的特征及其对免疫治疗的影响 | 研究主要基于单细胞测序和细胞培养实验，缺乏临床验证 | 探讨PTPN7在胶质瘤中的作用及其对免疫治疗的影响 | PTPN7在胶质瘤中的表达、预后价值、基因组特征、免疫特性及对化疗和免疫治疗的预测作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 涉及HMC3和M0细胞与U251和T98G细胞的共培养实验 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-10-25 |
RNA modification-related EIF4G2 is an immunotherapy determinant in osteosarcoma: A single-cell sequencing analysis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24261
PMID:38578024
|
研究论文 | 本研究探讨了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的关系，并识别出EIF4G2作为关键的免疫治疗决定因素 | 首次建立了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的联系，并识别出EIF4G2作为潜在的治疗靶点 | NA | 探索骨肉瘤中RNA修饰与免疫治疗之间的关系，以识别新的治疗靶点 | 骨肉瘤中的RNA修饰和免疫治疗 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | 随机森林 | RNA修饰相关特征 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-10-25 |
Using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing data to reveal a correlation between smoking and neutrophil activation in esophageal carcinoma patients
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24312
PMID:38700434
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据揭示吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联 | 首次揭示了吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联，并探讨了中性粒细胞在肿瘤微环境中的促癌作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 探讨吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关系 | 食管癌患者的中性粒细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 公共数据库中的数据，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-10-25 |
LineageVAE: reconstructing historical cell states and transcriptomes toward unobserved progenitors
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae520
PMID:39172488
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LineageVAE的新型计算方法，利用深度学习技术重建不可观测的细胞状态和转录组 | 开发了LineageVAE，一种基于深度生成模型的计算方法，能够将具有相同谱系条码的scRNA-seq观测数据转换为潜在细胞状态空间中的序列轨迹，从而重建不可观测的细胞状态转变、历史转录组和调控动力学 | 由于实验性质，观测数据稀疏，早期状态的细胞并非后期观测细胞的直接祖先 | 克服单细胞RNA测序在动态过程中测量基因表达变化的限制，重建不可观测的细胞状态和转录组 | 细胞状态转变、历史转录组和调控动力学 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE | 基因表达数据 | 涉及造血和重编程成纤维细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-10-25 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal apelin/APJ pathway's role in microvessel formation and tumour progression in hepatocellular carcinoma
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70152
PMID:39434201
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研究论文 | 本研究探讨了apelin/APJ通路在肝细胞癌（HCC）中的作用及其对微血管形成和肿瘤进展的影响 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术揭示了apelin/APJ通路在HCC中的功能，并验证了其作为潜在治疗靶点的可能性 | 实验验证主要集中在基因沉默对血管生成的影响，未涉及其他治疗策略的探索 | 阐明apelin/APJ通路在HCC中的功能，并识别潜在的治疗生物标志物 | 肝细胞癌（HCC）中的apelin/APJ通路及其对微血管形成和肿瘤进展的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-10-25 |
Research progress on single-cell expression quantitative trait loci
2024-Oct, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-162
PMID:39443309
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综述 | 本文综述了单细胞表达定量性状位点（sc-eQTL）研究的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）揭示依赖于细胞类型、状态和动态的eQTL，增强了对基因表达相关遗传变异的分析能力 | 当前研究面临实验设计和建模方法的挑战 | 提供新的视角来识别与疾病相关的位点并阐明基因调控机制 | 单细胞表达定量性状位点（sc-eQTL） | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-10-24 |
-RAMP3 promotes hepatocellular carcinoma tumor cell-mediated CCL2 degradation by supporting membrane distribution of ACKR2
2024-Oct-21, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113419
PMID:39437486
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研究论文 | 研究探讨了RAMP3与ACKR2的结合及其在肝细胞癌肿瘤微环境中对CCL2降解的协同调控作用 | 首次揭示了RAMP3通过支持ACKR2的膜分布促进CCL2在肝细胞癌中的降解 | 研究主要基于细胞系和生物信息学分析，缺乏临床样本的验证 | 探索RAMP3与ACKR2在肝细胞癌中的相互作用及其对CCL2降解的影响 | RAMP3、ACKR2、CCL2以及肝细胞癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | RNA序列、蛋白质相互作用数据 | 使用了人肝细胞癌细胞系Huh7和HepG2以及小鼠肝细胞癌细胞系Hepa1-6 | NA | NA | NA | NA |