单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 668 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-10-19 |
Pan-cancer analysis of Sp1 with a focus on immunomodulatory roles in gastric cancer
2024-Oct-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03521-z
PMID:39402565
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研究论文 | 本文通过生物信息学工具和公共数据集，全面分析了Sp1在不同癌症中的表达及其在胃癌中的免疫调节作用 | 首次进行了全面的泛癌分析，探讨了Sp1在肿瘤发生中的多方面作用，并验证了其在胃癌患者免疫治疗中的预后和预测价值 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨Sp1在不同癌症中的表达及其在胃癌中的免疫调节作用，评估其在胃癌患者免疫治疗中的预后和预测价值 | Sp1在正常组织、肿瘤和免疫细胞中的表达及其与免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷和免疫检查点信号的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学分析、免疫组化、多重免疫荧光 | Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 免疫治疗患者队列 |
| 362 | 2024-10-19 |
Identification of the metabolic protein ATP5MF as a potential therapeutic target of TNBC
2024-Oct-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05692-9
PMID:39402579
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研究论文 | 本文研究了三阴性乳腺癌（TNBC）中代谢蛋白ATP5MF作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次将ATP5MF确定为非BRCA1/2突变型TNBC的潜在治疗靶点 | 研究仅限于体外和动物模型实验，尚未进行临床试验 | 开发针对非BRCA1/2突变型TNBC的新治疗策略 | 三阴性乳腺癌细胞和相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据 | 包括两个TNBC细胞系（MDA-MB-231和BT-549）和裸鼠肿瘤异种移植模型 |
| 363 | 2024-10-19 |
BNIP3+ fibroblasts associated with hypoxia and inflammation predict prognosis and immunotherapy response in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Oct-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05674-x
PMID:39402590
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研究论文 | 研究探讨了BNIP3+纤维母细胞亚型在胰腺导管腺癌中的作用及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 首次揭示了BNIP3+纤维母细胞亚型与低氧和炎症反应的关联，并发现其与胰腺导管腺癌患者的预后和免疫治疗反应密切相关 | 研究样本量较小，且仅基于单细胞测序数据，可能影响结果的普适性 | 探索胰腺导管腺癌中癌症相关纤维母细胞的新靶点，以改善治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者的癌症相关纤维母细胞及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 35例胰腺导管腺癌患者的单细胞测序数据 |
| 364 | 2024-10-19 |
scCTS: identifying the cell type-specific marker genes from population-level single-cell RNA-seq
2024-Oct-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03410-8
PMID:39402623
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scCTS的统计模型，用于从群体水平的单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性标记基因 | 开发了一种新的统计模型scCTS，能够更有效地从群体水平的单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性基因 | 未提及 | 旨在改进从群体水平单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性标记基因的方法 | 群体水平的单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性标记基因 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 多个供体的单细胞RNA测序数据 |
| 365 | 2024-10-17 |
Transcriptional landscape of sweetpotato root tip development at the single-cell level
2024-Oct-12, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-05574-8
PMID:39394068
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了甘薯根尖分生组织的细胞异质性 | 首次利用单细胞转录组测序技术分析甘薯根尖组织的细胞类型和发育轨迹 | NA | 研究甘薯根尖分生组织的细胞类型和发育调控机制 | 甘薯根尖分生组织的单细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 12,172个单细胞和27,355个基因 |
| 366 | 2024-10-19 |
Integrating spatial transcriptomics and single-nucleus RNA-seq revealed the specific inhibitory effects of TGF-β on intramuscular fat deposition
2024-Oct-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2696-5
PMID:39422812
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研究论文 | 研究结合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了TGF-β对肌内脂肪沉积的特异性抑制作用 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了TGF-β信号通路在肌内脂肪沉积中的特异性作用 | 研究主要基于猪和肥胖小鼠模型，结果的普适性需进一步验证 | 探究影响肌内脂肪形成的关键因素及其调控机制 | 猪的背最长肌和肥胖小鼠的肌内脂肪 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | RNA | 不同肌内脂肪含量的猪背最长肌样本，肥胖小鼠模型 |
| 367 | 2024-10-19 |
Deletion of platelet-derived growth factor receptor β suppresses tumorigenesis in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) mice with diabetes
2024-10-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75713-6
PMID:39394459
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研究论文 | 研究了血小板衍生生长因子受体β（PDGFRβ）在糖尿病相关代谢功能障碍性脂肪性肝炎（MASH）小鼠模型中的表达及其对肿瘤发生的影响 | 首次探讨了PDGFRβ在糖尿病MASH小鼠模型中的作用，并发现其缺失可抑制肿瘤发生 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证结果 | 探讨PDGFRβ在糖尿病MASH中的作用及其对肿瘤发生的影响 | 糖尿病MASH小鼠模型中的PDGFRβ表达及其对肿瘤发生的影响 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型（KO和FL） |
| 368 | 2024-10-19 |
Dual spatial host-bacterial gene expression in Mycobacterium abscessus respiratory infections
2024-Oct-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06929-5
PMID:39384974
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研究论文 | 本文展示了定制细菌探针在甲醛固定石蜡包埋（FFPE）组织中识别宿主-病原体相互作用的能力 | 本文首次通过探针空间转录组技术，在FFPE组织中同时检测宿主和细菌的基因表达 | 研究仅在慢性感染的鼠肺组织中进行，结果的普适性有待验证 | 探索宿主和病原体在空间转录组信息上的共定位，以深化对微生物致病机制的理解 | 慢性感染了脓肿分枝杆菌的鼠肺组织 | NA | NA | 探针空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 鼠肺组织样本 |
| 369 | 2024-10-19 |
Hyperbaric oxygen therapy enhances osteointegration of reimplanted cranial flap by regulating osteogenesis-angiogenesis coupling
2024-Oct, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.25875
PMID:38751166
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研究论文 | 研究高压氧治疗对颅骨瓣再植后骨整合的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示高压氧治疗对颅骨瓣再植后骨形成和血管形成的具体细胞类型和信号通路的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在临床上验证 | 探讨高压氧治疗在颅骨瓣再植后骨整合中的作用 | 颅骨瓣再植后的骨形成和血管形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 370 | 2024-10-19 |
Neutrophils Recruited by NKX2-1 Suppression via Activation of CXCLs/CXCR2 Axis Promote Lung Adenocarcinoma Progression
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400370
PMID:39113226
|
研究论文 | 研究探讨了NKX2-1通过激活CXCLs/CXCR2轴招募中性粒细胞促进肺腺癌进展的机制 | 揭示了NKX2-1在调控肿瘤免疫微环境中通过抑制CXCLs/CXCR2依赖机制影响中性粒细胞浸润的新机制 | NA | 研究NKX2-1在肺腺癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 肺腺癌细胞、中性粒细胞及CXCLs/CXCR2信号通路 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、Visium原位捕获分析、qRT-PCR、ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 371 | 2024-10-19 |
VCAM-1 mediates proximal tubule-immune cell cross talk in failed tubule recovery during AKI-to-CKD transition
2024-Oct-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00076.2024
PMID:39116349
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研究论文 | 研究探讨了VCAM-1在AKI向CKD转变过程中对近端小管修复失败的作用 | 首次揭示了VCAM-1在近端小管细胞中表达增加，并通过NF-κB信号通路促进免疫细胞粘附，从而加剧小管损伤和AKI向CKD的进展 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步的人体研究验证 | 探讨AKI向CKD转变过程中炎症反应与肾小管修复失败的关系 | AKI和CKD患者以及CKD小鼠模型的近端小管细胞 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞转录组分析、RNA测序、蛋白质分析 | NA | RNA、蛋白质 | 包括AKI和CKD患者以及CKD小鼠模型的样本 |
| 372 | 2024-10-19 |
Endothelial Cell-Derived Extracellular Vesicles Promote Aberrant Neutrophil Trafficking and Subsequent Remote Lung Injury
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400647
PMID:39119837
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研究论文 | 研究揭示了内皮细胞衍生的外泌体在促进中性粒细胞异常迁移和随后的远端肺损伤中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析揭示了内皮细胞释放的外泌体在促进中性粒细胞反向跨内皮迁移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本，缺乏人体内直接干预实验 | 探讨脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中中性粒细胞异常迁移的分子机制 | 中性粒细胞、内皮细胞及其衍生的外泌体 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 小鼠模型和脓毒症相关ARDS患者的血液样本 |
| 373 | 2024-10-19 |
Identification of a Novel ECM Remodeling Macrophage Subset in AKI to CKD Transition by Integrative Spatial and Single-Cell Analysis
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309752
PMID:39119903
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，研究了AKI到CKD过渡期间巨噬细胞的时空异质性 | 发现了与肾纤维化相关的新的巨噬细胞亚群，即细胞外基质重塑相关巨噬细胞（EAMs） | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床适用性需要进一步验证 | 探讨AKI到CKD过渡期间巨噬细胞的异质性和动态特征 | AKI到CKD过渡期间的小鼠巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠AKI-to-CKD模型中的多个时间点样本 |
| 374 | 2024-10-19 |
Characterization of Ucp1-iCre knockin mice reveals the recombination activity in male germ cells
2024-Oct-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00128.2024
PMID:39230395
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研究论文 | 本文研究了Ucp1-iCre敲入小鼠的Cre重组活性，特别是在雄性生殖细胞中的表现 | 通过靶向插入IRES-Cre盒，生成了Ucp1-iCre小鼠，减少了Cre在非脂肪组织中的异位活性 | Ucp1-iCre小鼠在某些组织中仍表现出有限的Cre活性，需要谨慎进行小鼠交配和基因分型 | 验证Ucp1-iCre敲入小鼠在脂肪组织中的特异性基因操作能力 | Ucp1-iCre敲入小鼠及其在脂肪组织和生殖细胞中的Cre重组活性 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及Ucp1-iCre小鼠和Rosa-tdTomato报告小鼠的杂交后代 |
| 375 | 2024-10-19 |
vSPACE: exploring virtual spatial representation of articular chondrocytes at the single-cell level
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae568
PMID:39363499
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研究论文 | vSPACE是一个基于网络的应用程序，通过模拟空间转录组技术，以虚拟方式展示人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据的空间表达模式 | vSPACE通过虚拟二维图展示人类关节软骨细胞的基因表达模式，揭示了科学家可以理解的沿区域轴的推断空间分布模式 | NA | 探索关节软骨细胞在单细胞水平上的虚拟空间表达模式 | 人类关节软骨细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 376 | 2024-10-19 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，揭示了膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 首次探索了与细胞分化相关基因（CDR）相关的分子亚型及其预后影响，并开发了CDR评分系统 | NA | 揭示膀胱癌中与细胞分化相关的分子亚型及其预后意义 | 膀胱癌患者及其分子亚型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | Lasso回归和Cox回归 | 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO单细胞数据集 |
| 377 | 2024-10-18 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2024-Oct-17, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
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研究论文 | 研究揭示了6p22.2区域中的调控变异rs9379874通过影响BTN3A1表达来调节T细胞功能，从而与1型糖尿病（T1D）风险相关 | 发现了rs9379874变异通过FOXA1结合增加BTN3A1表达，扩展了T1D风险的基因组图谱，并提供了潜在的治疗靶点 | 研究未发现该变异与胰岛功能或自身免疫的显著关联 | 揭示6p22.2区域与T1D亚型及相关临床特征的关联，并识别该区域的因果变异和目标基因 | 6p22.2区域中的基因变异与T1D风险的关系 | NA | 糖尿病 | 全基因组关联研究（GWAS）、双荧光素酶报告基因检测、表达数量性状位点（eQTL）分析 | NA | 基因型数据、单细胞RNA测序数据 | 2608例T1D患者和4814例健康对照 |
| 378 | 2024-10-18 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Oct-16, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 研究通过整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了自噬在衰老组织中的作用及其潜在机制 | 首次通过整合大量bulk RNA-seq和单细胞测序数据，揭示了血液组织中自噬与衰老的最高正相关性，并发现了经典单核细胞在衰老过程中的关键作用 | 研究主要集中在血液组织和急性髓系白血病，其他组织和疾病的相关性未被探讨 | 识别与自噬和衰老最相关的组织，并探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 正常组织样本、不同年龄的血液样本、急性髓系白血病的bulk RNA-seq和单细胞数据 | 生物信息学 | 血液疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过7000个正常组织样本、2000多个急性髓系白血病bulk RNA-seq样本和多组AML单细胞数据 |
| 379 | 2024-10-18 |
Distinct tumor architectures and microenvironments for the initiation of breast cancer metastasis in the brain
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.015
PMID:39270646
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研究论文 | 研究了三阴性乳腺癌和HER2阳性乳腺癌在脑部转移的早期阶段，发现两种肿瘤类型在脑部形成不同的肿瘤结构和微环境 | 发现了三阴性乳腺癌和HER2阳性乳腺癌在脑部转移时形成的不同肿瘤结构和微环境，并揭示了这些结构如何影响阿尔茨海默病相关微胶质细胞的反应 | NA | 理解乳腺癌脑部转移的早期阶段 | 三阴性乳腺癌和HER2阳性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本 | 使用小鼠模型和人类组织样本 |
| 380 | 2024-10-18 |
Cross-tissue human fibroblast atlas reveals myofibroblast subtypes with distinct roles in immune modulation
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.020
PMID:39303725
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自517个人类样本的纤维母细胞，揭示了不同亚型在免疫调节中的独特作用 | 识别了四种转录上不同的肌纤维母细胞亚群，并揭示了它们在肿瘤微环境中的不同功能 | NA | 深入理解纤维母细胞生物学，并探索针对特定纤维母细胞亚群的癌症治疗策略 | 人类纤维母细胞及其在不同组织和病理状态下的亚型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 517个人类样本，涵盖11种组织类型和多种病理状态 |