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当前共找到 581 篇文献,本页显示第 321 - 340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2024-11-29
Single-Cell Analysis Reveals the Cellular and Molecular Changes of Liver Injury and Fibrosis in Mice During the Progression of Schistosoma japonicum Infection
2024-Oct-23, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3
研究论文 研究使用单细胞RNA测序技术分析了血吸虫感染小鼠肝脏在感染进展过程中的细胞和分子变化 首次提供了血吸虫感染小鼠肝脏在感染进展过程中的全面单细胞转录组图谱,并揭示了关键的细胞和分子事件 NA 阐明血吸虫感染进展过程中的致病机制 血吸虫感染小鼠的肝脏细胞 数字病理学 寄生虫病 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 转录组数据 31,847个肝脏细胞 NA NA NA NA
322 2024-11-26
Mapping intratumoral myeloid-T cell interactomes at single-cell resolution reveals targets for overcoming checkpoint inhibitor resistance
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种计算方法,用于分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)衍生的单细胞分辨率细胞间相互作用图谱,并应用于研究CD40激动剂(CD40ag)如何改变免疫细胞间的对话,特别是在肿瘤模型中与免疫检查点阻断(ICB)联合使用时 本文创新性地开发了一种计算方法,能够有效分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用,并揭示了CD40ag在改善ICB反应中的作用 本文未详细讨论该计算方法在其他类型肿瘤或不同数据集上的适用性和泛化能力 研究如何通过分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用,揭示CD40ag在克服免疫检查点抑制剂耐药性中的作用 研究对象包括肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞,以及它们在CD40ag和ICB治疗下的相互作用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 具体样本数量未在摘要中提及 NA NA NA NA
323 2024-11-26
Cell2Sentence: Teaching Large Language Models the Language of Biology
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍了一种名为Cell2Sentence的新方法,将大型语言模型直接适应于生物学背景,特别是单细胞转录组学 通过将基因表达数据转化为“细胞句子”,Cell2Sentence方法填补了自然语言处理与生物学之间的空白 NA 探索如何将大型语言模型应用于生物学领域,特别是单细胞转录组学 单细胞转录组学数据和大型语言模型 自然语言处理 NA NA GPT-2 基因表达数据 NA NA NA NA NA
324 2024-11-23
Transcriptomic mapping of the 5-HT receptor landscape
2024-Oct-11, Patterns (New York, N.Y.)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和多重荧光原位杂交技术,对成年小鼠大脑中的5-HT受体进行了全面的转录组分析 首次在单细胞水平上揭示了5-HT受体的多样性分布和共转录现象 NA 研究5-HT受体在小鼠大脑中的转录模式和空间分布 5-HT受体及其在小鼠大脑中的表达 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重荧光原位杂交(MERFISH) NA 转录组数据 约400万细胞(scRNA-seq)和约1000万细胞(MERFISH) NA NA NA NA
325 2024-11-22
Characterization of the single cell landscape in normal and osteoarthritic equine joints
2024-Oct-20, Annals of translational medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了正常和骨关节炎马关节滑液中的细胞组成,揭示了骨关节炎免疫病理发生中的关键细胞类型和相互作用 首次在马关节滑液和滑膜中进行了单细胞RNA测序,识别了多种免疫细胞亚群及其在骨关节炎中的变化,为未来研究提供了马特异性细胞类型基因签名 样本量较小,仅包括三只正常马和三只骨关节炎马的关节滑液,以及一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 通过分析骨关节炎关节中的转录组反应,加深对骨关节炎免疫病理发生的理解,促进靶向疗法的开发 正常和骨关节炎马的关节滑液和滑膜中的免疫细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 28,639个细胞来自正常和骨关节炎马的关节滑液,17,690个细胞来自一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 NA NA NA NA
326 2024-11-21
Sex-Based Differences in Thyroid Plasma B Cell Infiltration: Implications for Autoimmune Disease Susceptibility
2024-Oct-30, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 研究探讨了甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 首次研究了女性甲状腺中浆细胞的浸润情况,并揭示了CXCL13-CXCR5信号轴在浆细胞招募和组织中的关键作用 研究仅限于女性甲状腺,未涉及男性甲状腺的对比分析 探讨甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 女性甲状腺中的浆细胞浸润情况 免疫学 自身免疫疾病 RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及具体样本数量 NA NA NA NA
327 2024-11-21
New insight into the development of synpolydactyly caused by expansion of HOXD13 polyalanine based on weighted gene co-expression network analysis
2024-10-29, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨了HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形(SPD)的分子机制 首次通过WGCNA分析揭示了HOXD13多聚丙氨酸扩展对免疫反应、破骨细胞分化和DNA复制的调控作用 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 探讨HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形的分子机制 HOXD13多聚丙氨酸扩展小鼠模型的肢芽细胞 NA 先天性畸形 加权基因共表达网络分析(WGCNA) NA 单细胞RNA测序数据 HOXD13+7A杂合子并指多指畸形小鼠模型的肢芽细胞 NA NA NA NA
328 2024-11-20
Identifying a CD8T cell signature in the tumor microenvironment to forecast gastric cancer outcomes from sequencing data
2024-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology IF:2.0Q3
研究论文 研究通过分析肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因,预测胃癌患者的预后 首次利用CD8T细胞相关基因构建胃癌预后预测模型 研究仅基于TCGA数据库的数据,样本量有限 探索肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因在胃癌预后预测中的作用 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8T细胞相关基因 数字病理学 胃癌 单细胞mRNA测序 Cox回归模型 基因数据 TCGA数据库中的胃癌患者数据 NA NA NA NA
329 2024-11-20
Landscape of immune cells in systematic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection: assessed by single-cell sequencing
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 研究分析了系统性红斑狼疮患者在有无EB病毒感染情况下的免疫细胞和B细胞受体(BCR)谱,并通过单细胞RNA测序识别两者之间的差异 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱,揭示了CD8+增殖T细胞比例和IFN-α/β通路在感染组中的变化 样本量较小,仅包括两名健康对照,可能影响结果的普遍性 分析系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱,以更好地理解免疫反应机制 系统性红斑狼疮患者及其在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱 数字病理学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 共8名参与者,包括2名SLE-EBV+患者,4名SLE-EBV-患者和2名健康对照,共获得83,478个细胞 NA NA NA NA
330 2024-11-20
Biallelic RXFP2 variants lead to congenital bilateral cryptorchidism and male infertility, supporting a role of RXFP2 in spermatogenesis
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 研究探讨了RXFP2基因的双等位变异如何导致先天性双侧隐睾和男性不育,并支持RXFP2在精子发生中的作用 首次在人类病例中证实RXFP2在精子发生成熟中的作用,并发现双等位变异导致男性不育 目前仅基于一个家庭的研究,需要更多病例验证 探讨RXFP2基因变异对男性生育能力的影响 RXFP2基因及其在精子发生中的作用 NA 男性不育 长读长测序、单细胞RNA测序、环AMP报告基因检测 NA 基因组数据、单细胞RNA测序数据 一个家庭中的两名男性成员 NA NA NA NA
331 2024-11-20
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for human testicular ageing
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类睾丸衰老的转录组图谱和潜在靶点 首次提供了年轻和老年人类睾丸的全面单细胞转录组图谱,并揭示了与睾丸衰老相关的分子机制和潜在治疗靶点 由于收集人类睾丸组织的困难,样本量有限,未来需要进一步的功能和机制研究 探讨人类睾丸衰老的分子基础和潜在治疗靶点 年轻和老年人类睾丸组织中的单细胞转录组 基因组学 男性生殖系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 6个年轻个体和6个老年个体的睾丸组织样本,以及10个年轻捐赠者和10个老年捐赠者的更大样本集 NA NA NA NA
332 2024-11-20
The Inflammatory Characteristics of Symptomatic Glioma Associated With Poor Prognosis and Chemoresistance via Tumor Necrosis Factor Signaling Pathway
2024-Oct, Brain tumor research and treatment
研究论文 研究分析了有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异,发现有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应,导致预后不良和化疗耐药 首次揭示了有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应,导致预后不良和化疗耐药 研究为回顾性分析,样本量有限,需要进一步的前瞻性研究验证 探讨有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异及其对预后和化疗耐药的影响 有症状和无症状胶质瘤样本 数字病理学 脑肿瘤 RNA测序 (RNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA RNA数据 TCGA和CGGA数据集中的胶质瘤样本 NA NA NA NA
333 2024-11-19
VAPOR: Variational autoencoder with transport operators decouples co-occurring biological processes in development
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为VAPOR的方法,通过变分自编码器与传输算子来解耦发育过程中同时发生的生物学过程 VAPOR方法能够将基因表达动态分解为多个子空间,每个子空间的动态由常微分方程模型控制,从而揭示不同生物学过程的多方面时间尺度 NA 开发一种新的计算方法来解耦发育过程中同时发生的生物学过程的基因表达动态 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 变分自编码器 基因表达数据 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 NA NA NA NA
334 2024-11-19
Integrative analyses of bulk and single-cell RNA-seq reveals the correlation between SPP1+ macrophages and resistance to neoadjuvant chemoimmunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Oct-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,揭示了SPP1+巨噬细胞与食管鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗抵抗之间的关联 首次通过单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性,并发现了SPP1+巨噬细胞在治疗抵抗中的关键作用 研究样本量较小,且仅基于公开数据集,未来需要更大规模的临床验证 探讨新辅助化疗免疫治疗在食管鳞状细胞癌中的疗效差异及其潜在机制 食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性及巨噬细胞的作用 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 32例接受手术的食管鳞状细胞癌患者 NA NA NA NA
335 2024-11-19
NitraTh epitope-based neoantigen vaccines for effective tumor immunotherapy
2024-Oct-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 介绍了一种基于NitraTh表位的肿瘤新抗原疫苗设计方法,该方法不依赖于计算预测CD4 T细胞表位,并在肝癌小鼠模型中显著抑制了肿瘤进展 提出了一种新的NitraTh表位,不依赖于计算预测CD4 T细胞表位,成功设计出能引发强烈新抗原特异性免疫反应的肿瘤新抗原疫苗 NA 开发一种有效的新抗原疫苗设计方法,用于肿瘤免疫治疗 肿瘤新抗原疫苗及其在肝癌小鼠模型中的效果 肿瘤免疫治疗 肝癌 单细胞测序 NA NA H22细胞异种移植和患者来源的异种移植(PDX)肝癌小鼠模型 NA NA NA NA
336 2024-11-19
A random survival forest-based pathomics signature classifies immunotherapy prognosis and profiles TIME and genomics in ES-SCLC patients
2024-Oct-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本文构建了一个基于随机生存森林的病理组学特征模型,用于分类广泛期小细胞肺癌患者的免疫治疗预后,并探索其与基因组学和肿瘤免疫微环境的关系 首次利用随机生存森林模型结合病理组学特征来预测广泛期小细胞肺癌患者的免疫治疗预后,并揭示了其与基因组学和肿瘤免疫微环境的潜在关联 研究样本量有限,且仅限于南京金陵医院的患者,研究结果的普适性有待进一步验证 探索广泛期小细胞肺癌患者免疫治疗预后的可靠生物标志物 广泛期小细胞肺癌患者 数字病理学 肺癌 下一代测序 随机生存森林 图像 118名接受一线免疫治疗的广泛期小细胞肺癌患者 NA NA NA NA
337 2024-11-17
Integrating Microarray Data and Single-Cell RNA-Seq Reveals Key Gene Involved in Spermatogonia Stem Cell Aging
2024-Oct-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文通过整合微阵列数据和单细胞RNA测序,揭示了精原干细胞衰老过程中的关键基因 本文创新性地整合了微阵列数据和单细胞RNA测序,识别出精原干细胞特异性转录因子和枢纽基因,并提出了复杂的网络调控机制 由于样本量有限且缺乏精确的衰老指标,研究结果的普适性和准确性可能受到限制 揭示精原干细胞衰老过程中的关键基因及其调控机制,为解决男性不育问题提供新思路 精原干细胞及其衰老过程中的基因表达变化 基因组学 男性不育 微阵列分析、单细胞RNA测序、ATAC-seq、DNase-seq NA 基因表达数据 三个不同精原干细胞的人类样本 NA NA NA NA
338 2024-11-17
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Monocyte-Derived Interstitial Macrophages with a Pro-Fibrotic Phenotype in Bleomycin-Induced Pulmonary Fibrosis
2024-Oct-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序研究了博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型中由单核细胞衍生的间质巨噬细胞的细胞异质性和发育轨迹 首次揭示了由单核细胞衍生的间质巨噬细胞在博来霉素诱导的肺纤维化中的促纤维化表型及其与成纤维细胞的相互作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探讨间质巨噬细胞在特发性肺纤维化发病机制中的作用 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型中的间质巨噬细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 博来霉素处理的小鼠肺组织 NA NA NA NA
339 2024-11-15
Single Cell Isolation from Human Diabetic Fibrovascular Membranes for Single-Cell RNA Sequencing
2024-Oct-20, Bio-protocol IF:1.0Q3
研究论文 本文介绍了一种从增生性糖尿病视网膜病变患者手术切除的纤维血管膜中制备单细胞悬液的胶原酶I消化协议,并进行了单细胞RNA测序分析 本文提供了一种新的胶原酶I消化协议,用于从纤维血管膜中制备单细胞悬液,并进行了详细的单细胞RNA测序分析 该协议可能对某些细胞类型造成损伤,尤其是在消化纤维化组织时 研究在生理和病理条件下单细胞水平的基因表达变化 增生性糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 从增生性糖尿病视网膜病变患者中提取的纤维血管膜样本 NA NA NA NA
340 2024-11-15
The Expression of MAFB Gene in Circulating Monocytes Is Related to Chronic Inflammatory Status in T2DM Patients
2024-Oct, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 研究探讨了MAFB基因在T2DM患者循环单核细胞中的表达与慢性炎症状态的关系 首次发现MAFB基因在T2DM患者循环单核细胞中的表达与慢性炎症状态相关,并具有一定的预测价值 研究仅基于bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,未涉及其他类型的实验验证 探讨T2DM患者循环免疫细胞中的炎症标志物,预测胰岛素抵抗和T2DM的发生 T2DM患者的循环单核细胞和外周血单核细胞 NA 糖尿病 bulk RNA-seq, scRNA-seq NA 基因表达数据 T2DM患者的外周血单核细胞样本 NA NA NA NA
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