单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 595 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-10-29 |
The First Comprehensive Description of the Platelet Single Cell Transcriptome
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618506
PMID:39464035
|
研究论文 | 首次全面描述了血小板单细胞转录组 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析血小板转录组，揭示了血小板基因表达的异质性 | 现有的细胞识别算法可能导致血小板被错误分类为其他血细胞类型 | 扩展对血小板功能的理解，超越其在凝血中的传统角色 | 血小板单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名健康供体的血小板样本 |
| 302 | 2024-10-29 |
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13206183
PMID:39458132
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研究论文 | 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症之间的共同联系 | 本文首次利用基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学等新技术，分析mTOR通路与唐氏综合症相关阿尔茨海默病的关系 | 本文尚未完全揭示唐氏综合症相关阿尔茨海默病病理进展的机制 | 研究mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症中的作用 | mTOR通路及其上游调控因子在唐氏综合症相关阿尔茨海默病中的作用 | NA | 阿尔茨海默病 | 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-10-29 |
Obesity-Associated Changes in Immune Cell Dynamics During Alphavirus Infection Revealed by Single Cell Transcriptomic Analysis
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.10.617696
PMID:39416014
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了肥胖与阿尔法病毒感染期间免疫细胞动态变化的关系 | 首次探讨了肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响，并发现了肥胖小鼠中缺失的一种独特巨噬细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响 | 肥胖和正常体重小鼠在阿尔法病毒感染期间的免疫细胞动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 肥胖和正常体重小鼠样本 |
| 304 | 2024-10-29 |
Integrative Omics Strategies for Understanding and Combating Brown Planthopper Virulence in Rice Production: A Review
2024-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010981
PMID:39456764
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综述 | 本文综述了利用整合组学策略理解并对抗褐飞虱对水稻生产的危害 | 整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据，深入理解褐飞虱的生物学特性，并探讨了通过操纵宿主-微生物相互作用来增强植物保护的新机会 | 尚未全面开展利用下一代组学技术对褐飞虱的遗传相互作用和种群动态进行全面研究 | 总结近期利用组学数据对抗褐飞虱的进展和新视角，以开发更可持续的害虫管理策略 | 褐飞虱及其与水稻的相互作用 | NA | NA | 基因组测序、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序、元基因组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA |
| 305 | 2024-10-29 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Cellular Heterogeneity and Drivers in Serrated Pathway-Driven Colorectal Cancer Progression
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010944
PMID:39456726
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 | 研究样本量有限，可能影响结果的普适性 | 阐明锯齿状病变在结直肠癌进展中的机制 | 正常结肠组织和锯齿状病变组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三份正常结肠组织和十五份锯齿状病变组织 |
| 306 | 2024-10-29 |
Statistical batch-aware embedded integration, dimension reduction, and alignment for spatial transcriptomics
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae611
PMID:39400541
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研究论文 | 本文提出了一种分层隐马尔可夫随机场模型STADIA，用于空间转录组学数据的批次效应校正、维度降低和空间域识别 | STADIA模型通过联合建模多个步骤，增强了技术伪影和生物信号之间复杂相互作用的理解，从而提高了结果的准确性和洞察力 | NA | 解决空间转录组学数据中批次效应和空间域识别的问题 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 隐马尔可夫随机场模型 | 基因表达数据 | 五个来自不同物种（人类和老鼠）、不同器官（大脑、皮肤和肝脏）以及不同平台（10x Visium、ST和Slice-seqV2）的数据集 |
| 307 | 2024-10-28 |
CancerSCEM 2.0: an updated data resource of single-cell expression map across various human cancers
2024-Oct-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae954
PMID:39460627
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研究论文 | CancerSCEM 2.0是一个更新后的单细胞表达图谱数据资源，涵盖多种人类癌症 | CancerSCEM 2.0增加了拷贝数变异评估、转录因子富集、伪时间轨迹构建和多种生物特征评分，并引入了新的单细胞水平癌症代谢图 | NA | 提供一个集成、分析和可视化单细胞RNA测序数据的公共资源，支持癌症相关研究 | 单细胞RNA测序数据，涵盖肿瘤、匹配正常和外周血样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1466个数据集，涵盖127个研究项目和74种癌症类型 |
| 308 | 2024-10-28 |
Potential mechanisms of metabolic reprogramming induced by ischemia-reperfusion injury in diabetic myocardium
2024-Oct, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.70018
PMID:39450829
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研究论文 | 研究探讨了糖尿病心肌在缺血-再灌注损伤后的代谢重编程及其潜在机制 | 首次通过代谢组学和单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病心肌在缺血-再灌注损伤后脂肪酸代谢的显著上升趋势，并发现PPARA信号通路的过度激活可能参与了代谢重编程的调控 | 研究仅限于db/db小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探索糖尿病心肌在缺血-再灌注损伤后的代谢重编程及其潜在机制 | 糖尿病心肌在缺血-再灌注损伤后的代谢变化 | NA | 心血管疾病 | 代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物, RNA | 四组小鼠心脏组织样本 |
| 309 | 2024-10-27 |
Visualizing Immune Checkpoint Inhibitors Derived Inflammation in Atherosclerosis
2024-Oct-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324260
PMID:39328090
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研究论文 | 研究使用放射性示踪剂和正电子发射断层扫描（PET）评估免疫检查点抑制剂治疗后小鼠动脉粥样硬化模型中加重的炎症反应 | 首次使用CCR2靶向放射性示踪剂和PET非侵入性地检测免疫检查点抑制剂治疗后动脉粥样硬化中的炎症反应 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探索免疫检查点抑制剂治疗后动脉粥样硬化中炎症反应的机制 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 正电子发射断层扫描（PET） | NA | 图像 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠 |
| 310 | 2024-10-27 |
AKAP12 positive fibroblast determines immunosuppressive contexture and immunotherapy response in patients with TNBC by promoting macrophage M2 polarization
2024-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009877
PMID:39448199
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研究论文 | 研究AKAP12阳性成纤维细胞在三阴性乳腺癌（TNBC）中的作用及其对免疫治疗反应的影响 | 首次发现AKAP12阳性成纤维细胞通过促进巨噬细胞M2极化来塑造TNBC的免疫抑制微环境，并影响免疫治疗效果 | 研究样本量较小，仅涉及80名TNBC患者 | 识别特定成纤维细胞亚群对TNBC发展和免疫治疗反应的贡献 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者中的成纤维细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析、免疫荧光双标记、飞行时间流式细胞术、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 80名TNBC患者 |
| 311 | 2024-10-27 |
Heterogeneity in Dental Tissue-Derived MSCs Revealed by Single-Cell RNA-seq
2024-Oct, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241271997
PMID:39327720
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示牙源性间充质干细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了来自牙周韧带和牙龈的间充质干细胞的异质性，并区分了供体间和组织间的差异 | 研究仅限于牙周韧带和牙龈的间充质干细胞，未涉及其他组织来源的干细胞 | 探讨牙源性间充质干细胞在转录组水平上的组织和供体特异性差异 | 来自牙周韧带和牙龈的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名牙周健康个体的牙周韧带和牙龈组织，共生成3,844个转录组 |
| 312 | 2024-10-27 |
Single-cell transcriptomic analysis of flowering regulation and vernalization in Chinese cabbage shoot apex
2024-Oct, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae214
PMID:39391013
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研究论文 | 研究分析了单细胞转录组在白菜花芽分化和春化过程中的作用 | 首次建立了白菜在非春化处理25天后的单细胞转录组图谱，并分析了不同细胞类型在花芽分化和春化过程中的基因表达变化 | NA | 深入理解白菜花芽分化和春化过程中不同细胞类型的作用 | 白菜花芽分化和春化过程中的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 19,602个单细胞 |
| 313 | 2024-10-27 |
PLXNB1/SEMA4D signals mediate interactions between malignant epithelial and immune cells to promote colorectal cancer liver metastasis
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70142
PMID:39443302
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研究论文 | 研究评估了结直肠癌（CRC）和肝转移（LM）的细胞异质性，通过整合单细胞测序数据构建了预后模型，并识别了CRC和LM中上皮细胞与免疫细胞之间的细胞间受体-配体相互作用 | 发现了Epi-11细胞在LM组织中的高表达，并揭示了PLXNB1/SEMA4D轴在CRC和LM中上皮细胞与免疫细胞相互作用中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验和免疫荧光染色，缺乏体内实验验证 | 探讨结直肠癌肝转移的机制及其与免疫细胞的相互作用 | 结直肠癌（CRC）和肝转移（LM）中的上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 约17种上皮细胞亚型，HCT116细胞用于体外实验 |
| 314 | 2024-10-27 |
Mouse Corneal Immune Cell Heterogeneity Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.12.29
PMID:39432400
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫荧光染色技术，揭示了小鼠角膜中免疫细胞的异质性、空间定位和功能角色 | 发现了三种新的角膜驻留巨噬细胞亚型，并揭示了从单核细胞到常规树突状细胞、驻留巨噬细胞和朗格汉斯细胞的分化途径 | NA | 定义小鼠角膜中免疫细胞的异质性、空间定位和功能角色 | 小鼠角膜中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57BL/6品系小鼠，年龄16-20周 |
| 315 | 2024-10-26 |
Dissecting the role of transcription factor AP2-M in Babesia asexual replication
2024-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400127RRR
PMID:39441647
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研究论文 | 本文研究了转录因子AP2-M在巴贝西虫无性复制中的作用 | 首次鉴定了巴贝西虫中的转录因子AP2-M，并揭示了其在红细胞入侵和细胞周期进展中的调控作用 | NA | 探讨转录因子AP2-M在巴贝西虫无性复制中的功能 | 巴贝西虫中的转录因子AP2-M及其靶基因 | NA | NA | Cut-Tag, RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | DNA, RNA, 蛋白质 | 包含AP2-M基因敲除的巴贝西虫株 |
| 316 | 2024-10-26 |
I-mfa, Mesangial Cell TRPC1 Channel, and Regulation of Glomerular Filtration Rate
2024-Oct-24, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000533
PMID:39446484
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研究论文 | 研究探讨了I-mfa蛋白在肾小球滤过率（GFR）调节中的作用 | 首次揭示了I-mfa通过抑制TRPC1介导的钙信号传导来正向调节GFR | 研究仅在动物模型和体外细胞实验中进行，尚未在人体中验证 | 探讨I-mfa在肾小球滤过率调节中的作用 | I-mfa蛋白、肾小球滤过率（GFR）、TRPC1通道 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blot、钙成像 | NA | 蛋白质、RNA | 野生型（WT）和I-mfa敲除（KO）小鼠、人及小鼠系膜细胞 |
| 317 | 2024-10-26 |
Senescence landscape in the liver following sepsis and senolytics as potential therapeutics
2024-Oct-23, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14354
PMID:39444093
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研究论文 | 研究了败血症后肝脏中的细胞衰老现象，并探讨了衰老细胞作为潜在治疗靶点的可能性 | 首次描述了败血症肝脏中的衰老景观，并证明了衰老细胞在败血症恶化结果中的作用 | NA | 探讨败血症后肝脏中的细胞衰老现象及其对治疗的影响 | 败血症后的小鼠肝脏细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 败血症诱导后的小鼠肝脏细胞 |
| 318 | 2024-10-26 |
Oxysterols contribute to immune cell recruitment in SLE skin lesions
2024-Oct-22, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03414-6
PMID:39438997
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研究论文 | 研究探讨了氧化固醇在系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中对免疫细胞招募的贡献 | 首次揭示了纤维细胞通过表达CH25H和CYP7B1促进SLE皮肤病变中免疫细胞招募的机制 | NA | 探讨氧化固醇在SLE皮肤病变中的作用及其机制 | SLE患者的皮肤病变和氧化固醇代谢 | NA | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）、免疫组化染色、单细胞测序 | NA | 代谢物数据、基因表达数据 | NA |
| 319 | 2024-10-26 |
Integrated immunogenomic analyses of single-cell and bulk profiling construct a T cell-related signature for predicting prognosis and treatment response in osteosarcoma
2024-Oct-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01461-8
PMID:39436466
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了一个与T细胞相关的特征，用于预测骨肉瘤患者的预后和治疗反应 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别了与T细胞相关的基因，并构建了一个预测骨肉瘤患者预后的特征 | 本研究主要基于公共数据库的数据，未涉及临床试验验证 | 研究T细胞相关基因在骨肉瘤发病机制中的作用，并构建预测模型 | 骨肉瘤患者的T细胞相关基因和免疫反应 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3000个高度可变基因，多个骨肉瘤细胞系 |
| 320 | 2024-10-26 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment changes and prognostic gene signatures in hepatocellular carcinoma
2024-Oct-22, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113317
PMID:39447409
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA转录组数据研究了肝细胞癌（HCC）恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记 | 首次通过单细胞RNA转录组数据揭示了HCC进展过程中肿瘤微环境的主要成分变化，并识别了与预后相关的基因标记 | 研究基于公开的单细胞RNA转录组数据，样本量有限，可能影响结果的普适性 | 探究肝细胞癌恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记 | 肝细胞癌患者的单细胞RNA转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自不同阶段的HCC患者样本，代表I-IV期 |