单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-11-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for human testicular ageing
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deae199
PMID:39241251
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类睾丸衰老的转录组图谱和潜在靶点 | 首次提供了年轻和老年人类睾丸的全面单细胞转录组图谱，并揭示了与睾丸衰老相关的分子机制和潜在治疗靶点 | 由于收集人类睾丸组织的困难，样本量有限，未来需要进一步的功能和机制研究 | 探讨人类睾丸衰老的分子基础和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人类睾丸组织中的单细胞转录组 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6个年轻个体和6个老年个体的睾丸组织样本，以及10个年轻捐赠者和10个老年捐赠者的更大样本集 | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2024-11-20 |
The Inflammatory Characteristics of Symptomatic Glioma Associated With Poor Prognosis and Chemoresistance via Tumor Necrosis Factor Signaling Pathway
2024-Oct, Brain tumor research and treatment
DOI:10.14791/btrt.2024.0035
PMID:39542520
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研究论文 | 研究分析了有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异，发现有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 首次揭示了有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 研究为回顾性分析，样本量有限，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探讨有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异及其对预后和化疗耐药的影响 | 有症状和无症状胶质瘤样本 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 (RNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | TCGA和CGGA数据集中的胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2024-11-19 |
VAPOR: Variational autoencoder with transport operators decouples co-occurring biological processes in development
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620534
PMID:39554007
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAPOR的方法，通过变分自编码器与传输算子来解耦发育过程中同时发生的生物学过程 | VAPOR方法能够将基因表达动态分解为多个子空间，每个子空间的动态由常微分方程模型控制，从而揭示不同生物学过程的多方面时间尺度 | NA | 开发一种新的计算方法来解耦发育过程中同时发生的生物学过程的基因表达动态 | 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 284 | 2024-11-19 |
Integrative analyses of bulk and single-cell RNA-seq reveals the correlation between SPP1+ macrophages and resistance to neoadjuvant chemoimmunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Oct-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03848-6
PMID:39367943
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，揭示了SPP1+巨噬细胞与食管鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗抵抗之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性，并发现了SPP1+巨噬细胞在治疗抵抗中的关键作用 | 研究样本量较小，且仅基于公开数据集，未来需要更大规模的临床验证 | 探讨新辅助化疗免疫治疗在食管鳞状细胞癌中的疗效差异及其潜在机制 | 食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性及巨噬细胞的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 32例接受手术的食管鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 285 | 2024-11-19 |
NitraTh epitope-based neoantigen vaccines for effective tumor immunotherapy
2024-Oct-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03830-2
PMID:39358493
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研究论文 | 介绍了一种基于NitraTh表位的肿瘤新抗原疫苗设计方法，该方法不依赖于计算预测CD4 T细胞表位，并在肝癌小鼠模型中显著抑制了肿瘤进展 | 提出了一种新的NitraTh表位，不依赖于计算预测CD4 T细胞表位，成功设计出能引发强烈新抗原特异性免疫反应的肿瘤新抗原疫苗 | NA | 开发一种有效的新抗原疫苗设计方法，用于肿瘤免疫治疗 | 肿瘤新抗原疫苗及其在肝癌小鼠模型中的效果 | 肿瘤免疫治疗 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | NA | H22细胞异种移植和患者来源的异种移植（PDX）肝癌小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 286 | 2024-11-19 |
A random survival forest-based pathomics signature classifies immunotherapy prognosis and profiles TIME and genomics in ES-SCLC patients
2024-Oct-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03829-9
PMID:39358575
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研究论文 | 本文构建了一个基于随机生存森林的病理组学特征模型，用于分类广泛期小细胞肺癌患者的免疫治疗预后，并探索其与基因组学和肿瘤免疫微环境的关系 | 首次利用随机生存森林模型结合病理组学特征来预测广泛期小细胞肺癌患者的免疫治疗预后，并揭示了其与基因组学和肿瘤免疫微环境的潜在关联 | 研究样本量有限，且仅限于南京金陵医院的患者，研究结果的普适性有待进一步验证 | 探索广泛期小细胞肺癌患者免疫治疗预后的可靠生物标志物 | 广泛期小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序 | 随机生存森林 | 图像 | 118名接受一线免疫治疗的广泛期小细胞肺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 287 | 2024-11-17 |
Integrating Microarray Data and Single-Cell RNA-Seq Reveals Key Gene Involved in Spermatogonia Stem Cell Aging
2024-Oct-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252111653
PMID:39519201
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研究论文 | 本文通过整合微阵列数据和单细胞RNA测序，揭示了精原干细胞衰老过程中的关键基因 | 本文创新性地整合了微阵列数据和单细胞RNA测序，识别出精原干细胞特异性转录因子和枢纽基因，并提出了复杂的网络调控机制 | 由于样本量有限且缺乏精确的衰老指标，研究结果的普适性和准确性可能受到限制 | 揭示精原干细胞衰老过程中的关键基因及其调控机制，为解决男性不育问题提供新思路 | 精原干细胞及其衰老过程中的基因表达变化 | 基因组学 | 男性不育 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、ATAC-seq、DNase-seq | NA | 基因表达数据 | 三个不同精原干细胞的人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 288 | 2024-11-17 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Monocyte-Derived Interstitial Macrophages with a Pro-Fibrotic Phenotype in Bleomycin-Induced Pulmonary Fibrosis
2024-Oct-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252111669
PMID:39519222
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究了博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型中由单核细胞衍生的间质巨噬细胞的细胞异质性和发育轨迹 | 首次揭示了由单核细胞衍生的间质巨噬细胞在博来霉素诱导的肺纤维化中的促纤维化表型及其与成纤维细胞的相互作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨间质巨噬细胞在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型中的间质巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 博来霉素处理的小鼠肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-11-17 |
Endothelial YAP/TAZ activation promotes atherosclerosis in a mouse model of Hutchinson-Gilford progeria syndrome
2024-Oct-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173448
PMID:39352768
|
研究论文 | 研究了Hutchinson-Gilford早衰综合征（HGPS）小鼠模型中内皮细胞YAP/TAZ激活促进动脉粥样硬化的机制 | 首次揭示了内皮细胞YAP/TAZ信号通路在HGPS血管疾病中的关键作用，并提出了针对YAP/TAZ的治疗策略 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类HGPS患者中验证 | 探讨HGPS血管病理的机制 | HGPS小鼠模型的主动脉内皮细胞 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、原子力显微镜、超声波评估 | NA | 基因表达数据 | HGPS小鼠和野生型对照小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 290 | 2024-11-15 |
Single Cell Isolation from Human Diabetic Fibrovascular Membranes for Single-Cell RNA Sequencing
2024-Oct-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5096
PMID:39512888
|
研究论文 | 本文介绍了一种从增生性糖尿病视网膜病变患者手术切除的纤维血管膜中制备单细胞悬液的胶原酶I消化协议，并进行了单细胞RNA测序分析 | 本文提供了一种新的胶原酶I消化协议，用于从纤维血管膜中制备单细胞悬液，并进行了详细的单细胞RNA测序分析 | 该协议可能对某些细胞类型造成损伤，尤其是在消化纤维化组织时 | 研究在生理和病理条件下单细胞水平的基因表达变化 | 增生性糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从增生性糖尿病视网膜病变患者中提取的纤维血管膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2024-11-15 |
The Expression of MAFB Gene in Circulating Monocytes Is Related to Chronic Inflammatory Status in T2DM Patients
2024-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02012-7
PMID:38602607
|
研究论文 | 研究探讨了MAFB基因在T2DM患者循环单核细胞中的表达与慢性炎症状态的关系 | 首次发现MAFB基因在T2DM患者循环单核细胞中的表达与慢性炎症状态相关，并具有一定的预测价值 | 研究仅基于bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，未涉及其他类型的实验验证 | 探讨T2DM患者循环免疫细胞中的炎症标志物，预测胰岛素抵抗和T2DM的发生 | T2DM患者的循环单核细胞和外周血单核细胞 | NA | 糖尿病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | T2DM患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2024-11-15 |
Mcadet: A feature selection method for fine-resolution single-cell RNA-seq data based on multiple correspondence analysis and community detection
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012560
PMID:39466833
|
研究论文 | 提出了一种名为Mcadet的新特征选择方法，用于高分辨率单细胞RNA测序数据 | Mcadet结合了多重对应分析、基于图的社区检测和一种新的统计测试方法，显著提高了在高分辨率单细胞RNA测序数据和少数细胞类型数据中选择高变异基因的性能 | 高变异基因选择对不同下游分析的影响需要进一步研究 | 解决现有特征选择方法在高分辨率单细胞RNA测序数据中的局限性 | 高分辨率单细胞RNA测序数据和少数细胞类型数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 293 | 2024-11-13 |
The multifaceted role of mitochondria in cardiac function: insights and approaches
2024-Oct-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01899-x
PMID:39472951
|
综述 | 本文综述了线粒体在心脏功能中的多方面作用及其在心血管疾病中的重要性 | 讨论了线粒体异质性和亚群在维持心脏功能和疾病相关重塑中的作用，并强调了线粒体与核的逆向通讯 | 未提供具体的研究数据或实验结果 | 探讨线粒体在心脏功能中的作用及其在心血管疾病中的潜在治疗策略 | 线粒体及其在心脏功能和疾病中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究 (GWAS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 294 | 2024-11-12 |
Gene expression landscape of cutaneous squamous cell carcinoma progression
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae249
PMID:38867481
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研究论文 | 本文通过元分析公开的RNA-Seq样本，定义了从正常皮肤到皮肤鳞状细胞癌（cSCC）不同阶段的转录组景观 | 本文通过整合多个研究的数据，定义了cSCC进展过程中不同阶段的差异表达基因（DEGs），并使用单细胞RNA-Seq数据验证了这些基因的表达情况 | 由于样本量较小和分析协议的多样性，研究结果的可转移性可能有限 | 定义皮肤鳞状细胞癌进展过程中不同阶段的转录组景观 | 正常皮肤、光化性角化病、原位鳞状细胞癌、角化棘皮瘤和皮肤鳞状细胞癌的RNA-Seq样本 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 共分析了73个正常皮肤样本、46个光化性角化病样本、16个原位鳞状细胞癌样本、13个角化棘皮瘤样本和147个皮肤鳞状细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 295 | 2024-11-12 |
COL10A1 expression distinguishes a subset of cancer-associated fibroblasts present in the stroma of high-risk basal cell carcinoma
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae258
PMID:38916477
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研究论文 | 研究探讨了基底细胞癌（BCC）不同亚型间基质中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的特征，特别是COL10A1的表达 | 首次发现COL10A1作为高风险BCC的标志物，特别是在硬化/浸润性和基底鳞状亚型中 | 研究样本量有限，且仅限于特定亚型的BCC | 研究BCC不同亚型基质中CAFs的特征，以寻找新的治疗靶点和预后生物标志物 | 基底细胞癌的不同亚型及其基质中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA测序（RNA-Seq）、激光捕获显微切割（LCM）、免疫组织化学（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 15个BCC样本（来自5种不同纯亚型，每种3个样本），6个健康皮肤样本，93个不同BCC样本和13个健康皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 296 | 2024-11-11 |
Inhibition of PNCK inflames tumor microenvironment and sensitizes head and neck squamous cell carcinoma to immune checkpoint inhibitors
2024-Oct-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009893
PMID:39395840
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研究论文 | 研究探讨了PNCK在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用及其与免疫检查点抑制剂的关系 | 首次揭示了PNCK在调节肿瘤微环境（TME）和增强免疫检查点抑制剂敏感性中的关键作用 | 研究主要基于体外和体内实验，需要进一步的临床验证 | 探讨PNCK在HNSCC中的作用及其对免疫治疗的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）及其肿瘤微环境 | 癌症研究 | 头颈部鳞状细胞癌 | 测序技术、单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 包括体外细胞实验、体内动物模型和公共数据库数据 | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2024-11-10 |
Copper drives remodeling of metabolic state and progression of clear cell renal cell carcinoma
2024-Oct-31, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0187
PMID:39476412
|
研究论文 | 研究揭示了铜在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的积累及其对代谢状态和肿瘤进展的影响 | 首次系统性地探讨了铜在ccRCC中的作用，揭示了铜通过促进CuCOX生物合成来增强肿瘤生长，并提出了新的治疗靶点 | NA | 探讨铜在透明细胞肾细胞癌中的作用及其对肿瘤代谢和进展的影响 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | NA | 肾癌 | 代谢组学、脂质组学、同位素标记葡萄糖和谷氨酰胺通量分析、转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据、代谢数据 | 肿瘤样本、细胞系、异种移植模型、PDX模型 | NA | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-11-09 |
Multi-omics revealed that ELAVL3 regulates MYCN in neuroblastoma via immunogenic cell death: Risk stratification and experimental research
2024-Oct-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.137045
PMID:39486730
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了ELAVL3通过免疫原性细胞死亡调节神经母细胞瘤中的MYCN，并进行了风险分层和实验研究 | 首次报道了免疫原性细胞死亡相关指数（ICDR-Index），并发现ELAVL3在神经母细胞瘤中的关键作用 | 研究主要基于批量转录组数据和单细胞RNA测序数据，未涉及临床试验 | 研究神经母细胞瘤的风险分层和免疫原性细胞死亡机制 | 神经母细胞瘤患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 1244个神经母细胞瘤样本和16个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 299 | 2024-11-09 |
Heterotypic macrophages/microglia differentially contribute to retinal ischaemia and neovascularisation
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06215-3
PMID:38977459
|
研究论文 | 研究了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用 | 揭示了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用，为针对特定细胞的治疗方法提供了新的基础 | NA | 阐明巨噬细胞/小胶质细胞在增生性缺血性视网膜病变发病机制中的不同作用 | 巨噬细胞和小胶质细胞在糖尿病视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 免疫染色、定量实时RT-PCR、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2024-11-08 |
Case report: Single-cell RNA sequencing of PBMCs highlights monocyte gene expression alterations in a type A HBV-ACLF patient
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38344
PMID:39502220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化及其M1/M2极化状态的动态变化 | 单细胞RNA测序技术耗时且难以在日常临床实践中应用 | 探究HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化及其在疾病发展中的作用 | HBV-ACLF患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 64名患者（包括15名正常对照、10名肝硬化患者、10名慢性乙型肝炎感染者、10名慢性肝功能障碍患者和20名HBV-ACLF患者） | NA | NA | NA | NA |