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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-11-12 |
Gene expression landscape of cutaneous squamous cell carcinoma progression
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae249
PMID:38867481
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研究论文 | 本文通过元分析公开的RNA-Seq样本,定义了从正常皮肤到皮肤鳞状细胞癌(cSCC)不同阶段的转录组景观 | 本文通过整合多个研究的数据,定义了cSCC进展过程中不同阶段的差异表达基因(DEGs),并使用单细胞RNA-Seq数据验证了这些基因的表达情况 | 由于样本量较小和分析协议的多样性,研究结果的可转移性可能有限 | 定义皮肤鳞状细胞癌进展过程中不同阶段的转录组景观 | 正常皮肤、光化性角化病、原位鳞状细胞癌、角化棘皮瘤和皮肤鳞状细胞癌的RNA-Seq样本 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 共分析了73个正常皮肤样本、46个光化性角化病样本、16个原位鳞状细胞癌样本、13个角化棘皮瘤样本和147个皮肤鳞状细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-11-12 |
COL10A1 expression distinguishes a subset of cancer-associated fibroblasts present in the stroma of high-risk basal cell carcinoma
2024-Oct-17, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae258
PMID:38916477
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研究论文 | 研究探讨了基底细胞癌(BCC)不同亚型间基质中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的特征,特别是COL10A1的表达 | 首次发现COL10A1作为高风险BCC的标志物,特别是在硬化/浸润性和基底鳞状亚型中 | 研究样本量有限,且仅限于特定亚型的BCC | 研究BCC不同亚型基质中CAFs的特征,以寻找新的治疗靶点和预后生物标志物 | 基底细胞癌的不同亚型及其基质中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA测序(RNA-Seq)、激光捕获显微切割(LCM)、免疫组织化学(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 15个BCC样本(来自5种不同纯亚型,每种3个样本),6个健康皮肤样本,93个不同BCC样本和13个健康皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-11-11 |
Inhibition of PNCK inflames tumor microenvironment and sensitizes head and neck squamous cell carcinoma to immune checkpoint inhibitors
2024-Oct-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009893
PMID:39395840
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研究论文 | 研究探讨了PNCK在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用及其与免疫检查点抑制剂的关系 | 首次揭示了PNCK在调节肿瘤微环境(TME)和增强免疫检查点抑制剂敏感性中的关键作用 | 研究主要基于体外和体内实验,需要进一步的临床验证 | 探讨PNCK在HNSCC中的作用及其对免疫治疗的影响 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)及其肿瘤微环境 | 癌症研究 | 头颈部鳞状细胞癌 | 测序技术、单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 包括体外细胞实验、体内动物模型和公共数据库数据 | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-11-10 |
Copper drives remodeling of metabolic state and progression of clear cell renal cell carcinoma
2024-Oct-31, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0187
PMID:39476412
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研究论文 | 研究揭示了铜在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的积累及其对代谢状态和肿瘤进展的影响 | 首次系统性地探讨了铜在ccRCC中的作用,揭示了铜通过促进CuCOX生物合成来增强肿瘤生长,并提出了新的治疗靶点 | NA | 探讨铜在透明细胞肾细胞癌中的作用及其对肿瘤代谢和进展的影响 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) | NA | 肾癌 | 代谢组学、脂质组学、同位素标记葡萄糖和谷氨酰胺通量分析、转录组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 | NA | 转录组数据、代谢数据 | 肿瘤样本、细胞系、异种移植模型、PDX模型 | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-11-09 |
Multi-omics revealed that ELAVL3 regulates MYCN in neuroblastoma via immunogenic cell death: Risk stratification and experimental research
2024-Oct-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.137045
PMID:39486730
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了ELAVL3通过免疫原性细胞死亡调节神经母细胞瘤中的MYCN,并进行了风险分层和实验研究 | 首次报道了免疫原性细胞死亡相关指数(ICDR-Index),并发现ELAVL3在神经母细胞瘤中的关键作用 | 研究主要基于批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,未涉及临床试验 | 研究神经母细胞瘤的风险分层和免疫原性细胞死亡机制 | 神经母细胞瘤患者及其免疫治疗反应 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 1244个神经母细胞瘤样本和16个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-11-09 |
Heterotypic macrophages/microglia differentially contribute to retinal ischaemia and neovascularisation
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06215-3
PMID:38977459
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研究论文 | 研究了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用 | 揭示了异型巨噬细胞/小胶质细胞在视网膜缺血和新生血管形成中的不同作用,为针对特定细胞的治疗方法提供了新的基础 | NA | 阐明巨噬细胞/小胶质细胞在增生性缺血性视网膜病变发病机制中的不同作用 | 巨噬细胞和小胶质细胞在糖尿病视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 免疫染色、定量实时RT-PCR、流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-11-08 |
Case report: Single-cell RNA sequencing of PBMCs highlights monocyte gene expression alterations in a type A HBV-ACLF patient
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38344
PMID:39502220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化及其M1/M2极化状态的动态变化 | 单细胞RNA测序技术耗时且难以在日常临床实践中应用 | 探究HBV-ACLF患者外周血单核细胞的基因表达变化及其在疾病发展中的作用 | HBV-ACLF患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 64名患者(包括15名正常对照、10名肝硬化患者、10名慢性乙型肝炎感染者、10名慢性肝功能障碍患者和20名HBV-ACLF患者) | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-11-08 |
Single-cell spatiotemporal analysis reveals alveolar dendritic cell-T cell immunity hubs defending against pulmonary infection
2024-Oct-16, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00733-5
PMID:39414763
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研究论文 | 本文通过高分辨率技术免疫制图,结合空间和单细胞RNA测序,研究了SARS-CoV-2感染的叙利亚仓鼠模型中肺部感染过程中免疫细胞的时空协调机制 | 首次揭示了肺泡树突状细胞-T细胞免疫枢纽在SARS-CoV-2感染中的快速扩展和病毒清除机制 | 研究主要基于叙利亚仓鼠模型和hACE2小鼠模型,尚未在人类中直接验证 | 揭示肺部感染过程中免疫细胞的时空协调机制 | 肺泡树突状细胞、T细胞、巨噬细胞等免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 142,965个细胞,45个肺叶,25只仓鼠,5个时间点 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-11-08 |
Single-cell spatiotemporal analysis of the lungs reveals Slamf9+ macrophages involved in viral clearance and inflammation resolution
2024-Oct-16, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00734-4
PMID:39414783
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2感染后肺部免疫稳态的恢复过程,发现Slamf9+巨噬细胞在病毒清除和炎症消退中的作用 | 首次揭示了Slamf9+巨噬细胞在SARS-CoV-2感染后肺部组织修复和炎症消退中的关键作用 | 研究主要基于叙利亚仓鼠模型和hACE2小鼠模型,尚未在人类中进行直接验证 | 探究肺部在SARS-CoV-2感染后免疫稳态的恢复机制 | SARS-CoV-2感染后的肺部免疫反应和组织修复过程 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 叙利亚仓鼠模型和hACE2小鼠模型,以及公开的人类尸检单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-11-07 |
Epigenetic agents plus anti-PD-1 reprogram the tumor microenvironment and restore antitumor efficacy in Hodgkin lymphoma
2024-10-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024487
PMID:39093981
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研究论文 | 研究评估了三联疗法(组蛋白去乙酰化酶抑制剂、DNA甲基转移酶抑制剂和抗PD-1抗体)在复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤中的疗效和安全性 | 首次评估了三联疗法在先前接受过DP疗法的患者中的疗效,并揭示了该疗法通过调节肿瘤微环境克服免疫疗法抵抗的机制 | 研究样本量较小,且仅限于先前接受过DP疗法的患者 | 评估三联疗法在复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤中的疗效和安全性,并探讨其克服免疫疗法抵抗的机制 | 复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 52名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-11-07 |
GraphCVAE: Uncovering cell heterogeneity and therapeutic target discovery through residual and contrastive learning
2024-Oct-31, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123208
PMID:39488267
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GraphCVAE的模型,通过结合空间和形态信息、纠正批次效应和管理异质数据,增强空间域识别能力 | GraphCVAE结合了多层图卷积网络和变分自编码器,通过对比学习捕捉细胞类型和状态的细微差异,显著提高了空间信息表示和整合的准确性 | NA | 提高空间转录组学中空间域识别的准确性,揭示细胞异质性和治疗靶点 | 空间转录组学数据,特别是前额叶皮质和胶质母细胞瘤等疾病数据 | 机器学习 | NA | 图卷积网络(GCN),变分自编码器(VAE),对比学习 | 图卷积网络(GCN),变分自编码器(VAE) | 空间转录组学数据 | 涉及多种空间转录组学数据集,包括前额叶皮质和胶质母细胞瘤等 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-11-07 |
Exogenous IL-33 promotes tumor immunity via macroscopic regulation of ILC2s
2024-10-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77751-6
PMID:39478174
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研究论文 | 研究探讨了外源性IL-33通过宏观调控ILC2s促进肿瘤免疫的作用 | 首次揭示了外源性IL-33通过减少中性粒细胞积累和增加ILC2s比例来改善肿瘤免疫微环境,并促进抗肿瘤免疫反应 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证其效果 | 探讨外源性IL-33对肿瘤免疫微环境的影响及其机制 | 外源性IL-33、ILC2s、中性粒细胞、肿瘤免疫微环境 | NA | 黑色素瘤 | scRNA-seq、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞比例数据 | Il7rArg1小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-11-07 |
The critical involvement of monocytes/macrophages in the pathogenesis of primary Sjögren's syndrome: New evidence from Mendelian randomization and single-cell sequencing
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39130
PMID:39497977
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研究论文 | 本文探讨了单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征(pSS)发病机制中的关键作用 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,全面揭示了单核细胞/巨噬细胞在pSS复杂发病机制中的贡献 | NA | 揭示单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征发病机制中的作用 | 单核细胞/巨噬细胞在原发性干燥综合征中的基因表达和信号通路变化 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 1434个差异表达基因,其中60个与pSS发生密切相关 | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-11-07 |
Novel mechanisms of intestinal flora regulation in high-altitude hypoxia
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38220
PMID:39498080
|
研究论文 | 研究探讨了在高海拔低氧环境下,厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程的分子机制 | 揭示了厚壁菌门通过抑制HIF-1α/糖酵解途径来缓解高海拔低氧引起的肠道黏膜屏障损伤 | NA | 探究高海拔低氧环境下肠道菌群调节的分子机制 | 厚壁菌门介导的巨噬细胞极化和糖酵解代谢重编程 | NA | NA | 单细胞转录组测序、蛋白质组分析、代谢组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-11-07 |
Deciphering STAT3's negative regulation of LHPP in ESCC progression through single-cell transcriptomics analysis
2024-Oct-28, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00962-0
PMID:39468431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了STAT3对LHPP在食管鳞状细胞癌进展中的负调控作用 | 发现了STAT3对LHPP表达的显著调控作用,揭示了食管鳞状细胞癌发病机制的新方面 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌中的细胞动力学和分子机制,特别是STAT3与LHPP的转录相互作用 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤和邻近正常组织细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 44,206个细胞样本,包括21名食管鳞状细胞癌患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-11-07 |
Characterization of EpCAM-Positive and EpCAM-Negative Tumor Cells in Early-Stage Breast Cancer
2024-Oct-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252011109
PMID:39456890
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研究论文 | 研究早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征 | 强调了EpCAM阴性CTC的存在,并评估了不同亚群中的干细胞标志物和EMT标志物 | 需要进一步研究以阐明EpCAM阴性和阳性CTC的预后意义 | 探讨早期乳腺癌中EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞的特征及其预后意义 | 早期乳腺癌中的EpCAM阳性及阴性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 涉及早期乳腺癌患者的CTC和原发肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-11-07 |
Microglia Signatures: A Cause or Consequence of Microglia-Related Brain Disorders?
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010951
PMID:39456734
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研究论文 | 本文探讨了小胶质细胞特征与相关脑部疾病之间的关系 | 利用单细胞RNA测序技术,详细研究了小胶质细胞在不同功能状态下的独特基因表达模式 | NA | 探讨小胶质细胞特征与神经退行性疾病和其他脑部疾病之间的关联 | 小胶质细胞的基因表达特征及其在不同病理条件下的变化 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-11-07 |
Deubiquitinase USP18 inhibits hepatic stellate cells activation and alleviates liver fibrosis via regulation of TAK1 activity
2024-Oct-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2024.114235
PMID:39236989
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研究论文 | 研究揭示了去泛素化酶USP18通过调节TAK1活性抑制肝星状细胞活化和减轻肝纤维化的机制 | 首次揭示了USP18在肝星状细胞活化中的作用及其通过调节TAK1活性减轻肝纤维化的机制 | NA | 揭示肝星状细胞活化的分子机制,寻找抑制肝纤维化的有效靶点 | 肝星状细胞(HSCs)和去泛素化酶USP18 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠原代肝星状细胞和CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-11-06 |
Identification of immune feature genes and intercellular profiles in diabetic cardiomyopathy
2024-Oct-15, World journal of diabetes
IF:4.2Q1
DOI:10.4239/wjd.v15.i10.2093
PMID:39493556
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研究论文 | 研究探讨了糖尿病心肌病(DCM)中的免疫分子机制,并基于免疫特征基因构建了诊断和预后模型 | 首次识别出Proenkephalin(Penk)和retinol binding protein 7(Rbp7)作为潜在的DCM生物标志物,并揭示了间质细胞与免疫细胞之间的异常表型转换和信号交流 | NA | 探讨糖尿病心肌病中的免疫分子机制并构建诊断和预后模型 | 糖尿病心肌病患者的免疫特征基因和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序(RNA-seq)、单样本基因集富集分析(ssGSEA)、实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹技术 | 机器学习 | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 验证队列中的样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-11-06 |
Loss of Smek1 Induces Tauopathy and Triggers Neurodegeneration by Regulating Microtubule Stability
2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400584
PMID:39206808
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研究论文 | 研究探讨了Smek1在tauopathy中防止神经退行性变的作用 | 首次证明Smek1缺乏通过加剧tau病理和线粒体功能障碍以年龄依赖性方式逐渐诱导神经退行性变 | NA | 研究Smek1在tauopathy和神经退行性变中的生理和病理作用 | Smek1在tauopathy中的作用及其对神经退行性变的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质相互作用分析 | Smek1敲除小鼠和shSmek1细胞 | NA | NA | NA | NA |