单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2024-10-26	Novel Arf1 Inhibitors Drive Cancer Stem Cell Aging and Potentiate Anti-Tumor Immunity 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202404442 PMID:39225354	研究论文	研究介绍了两种新型Arf1抑制剂DU101和DU102，通过触发癌症干细胞衰老和增强抗肿瘤免疫，展示了其在癌症治疗中的潜力	首次引入DU101和DU102作为新型Arf1抑制剂，通过单细胞测序分析其对肿瘤免疫微环境的重塑作用，并发现其能增加肿瘤相关CD8+ CD4+双阳性T细胞，从而提高癌症患者的无病生存率	NA	探索新型Arf1抑制剂在癌症治疗中的应用，特别是其对癌症干细胞衰老和抗肿瘤免疫的影响	Arf1抑制剂DU101和DU102对癌症干细胞和肿瘤免疫微环境的影响	癌症研究	癌症	单细胞测序	NA	细胞	小鼠癌症和PDX模型，以及癌症患者样本
262	2024-10-26	Astrocyte-induced Cdk5 expedites breast cancer brain metastasis by suppressing MHC-I expression to evade immune recognition 2024-Oct, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-024-01509-5 PMID:39304713	研究论文	研究揭示了星形胶质细胞诱导的Cdk5通过抑制MHC-I表达促进乳腺癌脑转移的免疫逃逸机制	首次揭示了星形胶质细胞诱导的Cdk5在乳腺癌脑转移中的作用，并阐明了其通过抑制MHC-I表达实现免疫逃逸的分子机制	研究主要在小鼠模型中进行，需要进一步在临床样本中验证	探讨乳腺癌脑转移的免疫逃逸机制及其潜在治疗策略	乳腺癌脑转移、星形胶质细胞、Cdk5、MHC-I	癌症研究	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型
263	2024-10-26	Proteomic Heterogeneity of the Extracellular Matrix Identifies Histologic Subtype-Specific Fibroblast in Gastric Cancer 2024-Oct, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.mcpro.2024.100843 PMID:39305996	研究论文	研究探讨了胃癌中细胞外基质（ECM）的蛋白质组异质性，并分析了其与组织学亚型和患者预后的关系	首次通过定量蛋白质组学分析胃癌去细胞化组织中的肿瘤ECM，识别出与特定组织学亚型相关的关键分子标记	研究主要集中在ECM的蛋白质组分析，未涉及其他分子层面的深入探讨	研究胃癌中细胞外基质的蛋白质组异质性及其与组织学亚型和患者预后的关系	胃癌患者的去细胞化组织样本	数字病理学	胃癌	定量蛋白质组学分析	NA	蛋白质组数据	多个胃癌患者的去细胞化组织样本
264	2024-10-25	Single-cell transcriptome profiling identifies the activation of type I interferon signaling in ossified posterior longitudinal ligament 2024-Oct-23, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-024-1075-5 PMID:39441507	研究论文	研究通过单细胞转录组测序揭示了后纵韧带骨化症中I型干扰素信号通路的激活	首次通过单细胞RNA测序揭示了后纵韧带骨化症中I型干扰素信号通路的激活，并验证了其促进骨化的作用	研究主要集中在体外实验和单细胞RNA测序，缺乏体内实验验证	探讨后纵韧带骨化症的分子机制及潜在的预防干预措施	后纵韧带骨化症患者的骨化韧带	数字病理学	骨骼疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	多个后纵韧带骨化症患者的骨化韧带样本
265	2024-10-25	Amino Acid Metabolism Subtypes in Neuroblastoma Identifying Distinct Prognosis and Therapeutic Vulnerabilities 2024-Oct-23, Journal of proteome research IF:3.8Q1 DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00554 PMID:39442086	研究论文	研究探讨了神经母细胞瘤中氨基酸代谢亚型与预后及治疗敏感性的关系	首次基于氨基酸代谢相关基因建立了三种神经母细胞瘤亚型，并揭示了它们与不同预后和治疗敏感性的关联	研究主要基于基因表达数据，未涉及临床试验验证	探讨氨基酸代谢在神经母细胞瘤中的作用及其与预后和治疗敏感性的关系	神经母细胞瘤及其氨基酸代谢亚型	数字病理学	神经母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确提及具体样本数量
266	2024-10-25	Immunoglobin attenuates fulminant myocarditis by inhibiting overactivated innate immune response 2024-Oct-23, British journal of pharmacology IF:6.8Q1 DOI:10.1111/bph.17372 PMID:39442535	研究论文	研究免疫球蛋白通过抑制过度激活的先天免疫反应来减轻暴发性心肌炎的治疗效果	首次揭示了免疫球蛋白通过调节心脏免疫稳态，特别是抑制过度激活的先天免疫反应，显著改善暴发性心肌炎小鼠的心脏功能	研究仅在A/JGpt小鼠模型中进行，结果的普适性有待进一步验证	探讨免疫调节药物对暴发性心肌炎的治疗效果	暴发性心肌炎小鼠模型	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	A/JGpt小鼠
267	2024-10-25	Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells 2024-Oct-21, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015 PMID:39025061	研究论文	本文通过空间和单细胞转录组学技术，详细研究了人类血管外膜中的间充质前体细胞的表型、潜能和微观解剖分布	首次详细描述了人类血管外膜中间充质前体细胞的微观解剖分布和异质性，并识别出一种具有高表面CD201表达的更原始细胞类型	研究主要集中在人类和小鼠的血管外膜细胞，未涉及其他物种或组织类型	揭示人类血管外膜中间充质前体细胞的微观解剖分布和异质性	人类和小鼠的血管外膜中间充质前体细胞	数字病理学	NA	空间转录组学和单细胞转录组学	NA	转录组数据	人类和小鼠的血管外膜样本
268	2024-10-25	A spatiotemporal molecular atlas of mouse spinal cord injury identifies a distinct astrocyte subpopulation and therapeutic potential of IGFBP2 2024-Oct-21, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.016 PMID:39029468	研究论文	本研究通过解析小鼠脊髓损伤后的时空分子组织结构，识别了一种特定的星形胶质细胞亚群，并探讨了IGFBP2的潜在治疗作用	本研究首次揭示了脊髓损伤后Igfbp2表达的星形胶质细胞亚群Astro-GMii的迁移和反应特性，并证明了IGFBP2在促进神经突生长和改善功能恢复中的作用	本研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性尚需进一步验证	解析脊髓损伤后的分子和细胞变化，并探索潜在的治疗靶点	小鼠脊髓损伤模型中的星形胶质细胞亚群和IGFBP2的表达	数字病理学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	空间数据	小鼠脊髓损伤模型
269	2024-10-25	Decoding the multiple functions of ZBP1 in the mechanism of sepsis-induced acute lung injury 2024-Oct-21, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07072-x PMID:39433574	研究论文	研究探讨了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的多重功能	首次定义了ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用，并揭示了其在调节巨噬细胞和肺内皮细胞功能中的重要性	研究仅基于ZBP1敲除小鼠模型，未涉及人类样本	探讨ZBP1在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用及其潜在治疗价值	ZBP1在巨噬细胞和肺内皮细胞中的功能	数字病理学	急性肺损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA	ZBP1敲除小鼠
270	2024-10-25	Enhancing spatial domain detection in spatial transcriptomics with EnSDD 2024-Oct-21, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07001-y PMID:39433947	研究论文	本文提出了一种名为EnSDD的方法，通过集成学习整合多种空间域检测方法，以提高空间转录组学中空间域的识别准确性	EnSDD的创新点在于其动态加权机制，优化了每个基础模型的贡献，并提供了一种无需真实标签数据的性能评估指标	NA	提高空间转录组学中空间域的识别准确性，揭示组织异质性和区域化特征	空间转录组学数据中的空间域、特定空间变异基因和细胞类型的空间分布	空间转录组学	NA	集成学习	集成学习模型	空间转录组数据	多种组织结构的空间转录组数据集
271	2024-10-25	Spatial-transcriptomic profiling: a new lens for understanding myelofibrosis pathophysiology 2024-Oct-21, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-024-01877-3 PMID:39434124	研究论文	本文探讨了空间转录组学在理解骨髓纤维化病理生理学中的应用	引入空间转录组学技术，提供了对骨髓和脾脏中基因表达的高分辨率映射，揭示了驱动疾病进展的分子特征和病理微环境	NA	通过空间转录组学技术深入理解骨髓纤维化的病理生理学，识别新的治疗靶点和生物标志物	骨髓纤维化的病理生理学、临床表型和治疗干预	数字病理学	血液病	空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
272	2024-10-25	Comprehensive multi-omics integration uncovers mitochondrial gene signatures for prognosis and personalized therapy in lung adenocarcinoma 2024-Oct-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05754-y PMID:39434164	研究论文	本研究通过多组学整合方法，揭示了线粒体相关基因在肺腺癌中的预后意义，并开发了个性化治疗策略	本研究首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，开发了一种基于线粒体相关基因的人工智能衍生预后签名模型，用于肺腺癌的预后评估和个性化治疗	本研究主要基于公开数据库的数据，未来需要在更大规模的临床样本中验证模型的有效性	本研究的目的是通过多组学整合方法，揭示线粒体相关基因在肺腺癌中的预后意义，并开发个性化治疗策略	本研究主要关注肺腺癌中的线粒体相关基因及其在预后和治疗中的作用	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	人工智能衍生预后签名模型	转录组数据	本研究使用了来自公开数据库的肺腺癌样本数据，具体样本数量未在摘要中明确提及
273	2024-10-25	Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea 2024-Oct-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52946-7 PMID:39384741	研究论文	研究通过单细胞转录组学揭示了玫瑰痤疮患者面部皮肤中异常的驻留细胞群体，并确定成纤维细胞在疾病发展中的关键作用	首次生成玫瑰痤疮患者和健康个体的面部皮肤单细胞图谱，发现并验证了成纤维细胞在玫瑰痤疮发展中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证	揭示玫瑰痤疮的细胞和分子机制，并确定关键的致病细胞类型	玫瑰痤疮患者和健康个体的面部皮肤细胞	数字病理学	皮肤疾病	单细胞转录组学	NA	转录组数据	女性玫瑰痤疮患者和健康个体的面部皮肤样本
274	2024-10-24	Association between biological ageing and periodontitis: Evidence from a cross-sectional survey and multi-omics Mendelian randomization analysis 2024-Oct, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.14040 PMID:38956929	研究论文	研究生物衰老与牙周炎之间的关系及潜在因果关系	采用多组学孟德尔随机化分析探索生物衰老与牙周炎之间的因果关联及潜在分子机制	研究基于横断面调查数据，因果关系的推断可能受限于数据类型	探讨生物衰老与牙周炎之间的关系及潜在因果关系	生物衰老与牙周炎	NA	牙周炎	多组学整合分析	NA	基因组数据	3189名参与者
275	2024-10-25	Exploring the impact of ITGB2 on glioma progression and treatment: Insights from non-apoptotic cell death and immunotherapy 2024-Oct, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24231 PMID:38488682	研究论文	研究探讨了整合素β2（ITGB2）在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用	首次揭示了ITGB2在非凋亡细胞死亡和免疫治疗反应中的关键作用，并展示了其在预测免疫活动、突变特征和药物反应中的潜力	研究主要基于体外模型和数据分析，未来需要进一步的临床验证	探讨ITGB2在胶质瘤进展和治疗中的作用，特别是其在非凋亡细胞死亡和免疫治疗效果中的关键作用	胶质瘤细胞和巨噬细胞	数字病理学	脑肿瘤	单细胞测序分析（iTalk和ICELLNET）	NA	数据集	10个不同的胶质瘤数据集
276	2024-10-25	Elucidating the role of FOS in modulating the immune microenvironment through fibroblast and myeloid cell regulation in locoregional recurrent HNSCC 2024-Oct, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24262 PMID:38567514	研究论文	本研究探讨了FOS在调节头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）局部复发中的免疫微环境中的作用，特别是其对成纤维细胞和髓系细胞的影响	本研究揭示了FOS在HNSCC肿瘤微环境中不同细胞群体中的表达差异，并探讨了其与免疫和缺氧相关通路的关联，为HNSCC的治疗提供了新的潜在靶点	NA	研究FOS在HNSCC局部复发中的免疫微环境调节作用	FOS在HNSCC肿瘤微环境中对成纤维细胞和髓系细胞的调节作用	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	RNA测序	NA	RNA	HNSCC患者组织样本及相邻非癌组织样本
277	2024-10-25	Single-cell and bulk RNA-sequencing reveal SPP1 and CXCL12 as cell-to-cell communication markers to predict prognosis in lung adenocarcinoma 2024-Oct, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24297 PMID:38622884	研究论文	本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，揭示了SPP1和CXCL12作为细胞间通讯标志物，用于预测肺腺癌预后的潜力	首次揭示了SPP1和CXCL12在肺腺癌微环境中的细胞间通讯作用，并探讨了它们与免疫细胞的关系	研究依赖于公共数据集，可能存在数据质量和样本偏差的问题	探讨肺腺癌微环境中的细胞间通讯特征及其与预后的关系	肺腺癌肿瘤组织及其邻近的非肿瘤组织	数字病理学	肺癌	RNA测序	NA	RNA	使用了来自公共数据集的肺腺癌批量RNA测序数据和单细胞RNA测序数据
278	2024-10-25	PTPN7 mediates macrophage-polarization and determines immunotherapy in gliomas: A single-cell sequencing analysis 2024-Oct, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24259 PMID:38581214	研究论文	研究探讨了PTPN7在胶质瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响	首次系统分析了PTPN7在胶质瘤微环境中的特征及其对免疫治疗的影响	研究主要基于单细胞测序和细胞培养实验，缺乏临床验证	探讨PTPN7在胶质瘤中的作用及其对免疫治疗的影响	PTPN7在胶质瘤中的表达、预后价值、基因组特征、免疫特性及对化疗和免疫治疗的预测作用	数字病理学	脑肿瘤	单细胞测序	NA	基因组数据	涉及HMC3和M0细胞与U251和T98G细胞的共培养实验
279	2024-10-25	RNA modification-related EIF4G2 is an immunotherapy determinant in osteosarcoma: A single-cell sequencing analysis 2024-Oct, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24261 PMID:38578024	研究论文	本研究探讨了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的关系，并识别出EIF4G2作为关键的免疫治疗决定因素	首次建立了RNA修饰与骨肉瘤免疫治疗之间的联系，并识别出EIF4G2作为潜在的治疗靶点	NA	探索骨肉瘤中RNA修饰与免疫治疗之间的关系，以识别新的治疗靶点	骨肉瘤中的RNA修饰和免疫治疗	数字病理学	骨肉瘤	单细胞测序	随机森林	RNA修饰相关特征	NA
280	2024-10-25	Using single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing data to reveal a correlation between smoking and neutrophil activation in esophageal carcinoma patients 2024-Oct, Environmental toxicology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/tox.24312 PMID:38700434	研究论文	研究使用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据揭示吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联	首次揭示了吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关联，并探讨了中性粒细胞在肿瘤微环境中的促癌作用	研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制	探讨吸烟与食管癌患者中性粒细胞激活之间的关系	食管癌患者的中性粒细胞	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序	NA	RNA测序数据	公共数据库中的数据，具体样本数量未提及