单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
241	2024-10-26	Dissecting the role of transcription factor AP2-M in Babesia asexual replication 2024-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202400127RRR PMID:39441647	研究论文	本文研究了转录因子AP2-M在巴贝西虫无性复制中的作用	首次鉴定了巴贝西虫中的转录因子AP2-M，并揭示了其在红细胞入侵和细胞周期进展中的调控作用	NA	探讨转录因子AP2-M在巴贝西虫无性复制中的功能	巴贝西虫中的转录因子AP2-M及其靶基因	NA	NA	Cut-Tag, RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序	NA	DNA, RNA, 蛋白质	包含AP2-M基因敲除的巴贝西虫株
242	2024-10-26	Single-cell RNA sequencing highlights the role of proinflammatory fibroblasts, vascular endothelial cells, and immune cells in the keloid immune microenvironment 2024-Oct-25, International journal of dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/ijd.17516 PMID:39450923	研究论文	研究通过单细胞RNA测序分析了瘢痕疙瘩中的免疫微环境，揭示了促炎性成纤维细胞和血管内皮细胞在其中的关键作用	首次揭示了促炎性成纤维细胞和血管内皮细胞在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用	研究样本量较小，仅包括三个瘢痕疙瘩病变和两个健康皮肤样本	探讨瘢痕疙瘩免疫微环境中细胞的功能状态	瘢痕疙瘩病变组织和健康皮肤组织中的细胞	数字病理学	皮肤疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	三个瘢痕疙瘩病变和两个健康皮肤样本
243	2024-10-26	Construction of mitochondrial quality regulation genes-related prognostic model based on bulk-RNA-seq analysis in multiple myeloma 2024-Oct-24, BioFactors (Oxford, England) DOI:10.1002/biof.2135 PMID:39446019	研究论文	本文构建了一个与线粒体质量调控基因相关的多发性骨髓瘤预后模型	开发了一个基于线粒体质量调控基因的预后模型，并验证了其在多发性骨髓瘤患者中的独立预后价值	研究仅基于bulk RNA-seq数据，未考虑其他类型的数据或临床信息	开发一个与线粒体质量调控基因相关的预后模型，用于多发性骨髓瘤患者的预后预测	多发性骨髓瘤患者的预后模型	数字病理	多发性骨髓瘤	RNA-seq	Cox比例风险模型	基因表达数据	多个样本
244	2024-10-26	I-mfa, Mesangial Cell TRPC1 Channel, and Regulation of Glomerular Filtration Rate 2024-Oct-24, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.0000000533 PMID:39446484	研究论文	研究探讨了I-mfa蛋白在肾小球滤过率（GFR）调节中的作用	首次揭示了I-mfa通过抑制TRPC1介导的钙信号传导来正向调节GFR	研究仅在动物模型和体外细胞实验中进行，尚未在人体中验证	探讨I-mfa在肾小球滤过率调节中的作用	I-mfa蛋白、肾小球滤过率（GFR）、TRPC1通道	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Western blot、钙成像	NA	蛋白质、RNA	野生型（WT）和I-mfa敲除（KO）小鼠、人及小鼠系膜细胞
245	2024-10-26	Senescence landscape in the liver following sepsis and senolytics as potential therapeutics 2024-Oct-23, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.14354 PMID:39444093	研究论文	研究了败血症后肝脏中的细胞衰老现象，并探讨了衰老细胞作为潜在治疗靶点的可能性	首次描述了败血症肝脏中的衰老景观，并证明了衰老细胞在败血症恶化结果中的作用	NA	探讨败血症后肝脏中的细胞衰老现象及其对治疗的影响	败血症后的小鼠肝脏细胞	NA	NA	单细胞测序	NA	细胞	败血症诱导后的小鼠肝脏细胞
246	2024-10-26	FABP5+ macrophages contribute to lipid metabolism dysregulation in type A aortic dissection 2024-Oct-23, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113438 PMID:39447410	研究论文	本文研究了FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层中对脂质代谢失调的贡献	首次系统评估了非免疫细胞和免疫细胞在主动脉夹层中的相互作用及其对代谢的影响	NA	阐明A型主动脉夹层中脂质代谢的全面图景	FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层中的作用	NA	心血管疾病	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂质代谢组学	NA	RNA, 脂质	A型主动脉夹层模型小鼠和患者
247	2024-10-26	Characterization of HPV6/11-reactive T-cell subsets in papillomas of patients with juvenile-onset recurrent respiratory papillomatosis and identification of HPV11 E7-specific candidate TCR clonotypes 2024-Oct-22, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.00677-24 PMID:39258910	研究论文	研究了青少年复发性呼吸道乳头状瘤病（JORRP）患者乳头状瘤中HPV6/11反应性T细胞亚群，并鉴定了HPV11 E7特异性候选TCR克隆型	首次通过单细胞RNA测序和RNA微阵列技术，揭示了CD8+组织驻留记忆T细胞在JORRP乳头状瘤中的扩增及其与疾病严重程度的关系，并鉴定了HPV11 E7特异性候选TCR克隆型	NA	研究JORRP患者乳头状瘤中HPV6/11反应性T细胞亚群及其在疾病进展中的作用	JORRP患者乳头状瘤中的HPV6/11反应性T细胞亚群	免疫学	青少年复发性呼吸道乳头状瘤病	单细胞RNA测序、RNA微阵列	NA	RNA	NA
248	2024-10-26	IL-1β-induced epithelial cell and fibroblast transdifferentiation promotes neutrophil recruitment in chronic rhinosinusitis with nasal polyps 2024-Oct-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53307-0 PMID:39438439	研究论文	研究探讨了IL-1β诱导的上皮细胞和成纤维细胞转分化在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中促进中性粒细胞招募的作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了IL-1信号诱导的LY6D杯状细胞和IDO1成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的作用	研究主要基于小鼠模型和人类样本，缺乏更大规模的临床验证	探讨IL-1β在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中促进中性粒细胞招募的机制	IL-1β诱导的上皮细胞和成纤维细胞转分化及其对中性粒细胞招募的影响	NA	慢性鼻窦炎伴鼻息肉	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的下鼻甲、中鼻甲和鼻息肉样本
249	2024-10-26	Single-cell sequencing reveals immune features of treatment response to neoadjuvant immunochemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma 2024-Oct-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52977-0 PMID:39438438	研究论文	研究使用单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了接受新辅助免疫化疗的食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境，揭示了治疗反应的免疫特征	首次揭示了CXCL13CD8 Tex细胞在治疗前后的变化及其作为治疗反应预测因子的潜力，并发现了与治疗抵抗相关的关键标记物	研究样本量较小，可能影响结果的普适性	探讨新辅助免疫化疗对食管鳞状细胞癌治疗反应的影响因素	食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	接受新辅助免疫化疗的食管鳞状细胞癌患者
250	2024-10-26	Oxysterols contribute to immune cell recruitment in SLE skin lesions 2024-Oct-22, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-024-03414-6 PMID:39438997	研究论文	研究探讨了氧化固醇在系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中对免疫细胞招募的贡献	首次揭示了纤维细胞通过表达CH25H和CYP7B1促进SLE皮肤病变中免疫细胞招募的机制	NA	探讨氧化固醇在SLE皮肤病变中的作用及其机制	SLE患者的皮肤病变和氧化固醇代谢	NA	系统性红斑狼疮	液相色谱-质谱联用（LC-MS）、免疫组化染色、单细胞测序	NA	代谢物数据、基因表达数据	NA
251	2024-10-26	Integrated immunogenomic analyses of single-cell and bulk profiling construct a T cell-related signature for predicting prognosis and treatment response in osteosarcoma 2024-Oct-22, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01461-8 PMID:39436466	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了一个与T细胞相关的特征，用于预测骨肉瘤患者的预后和治疗反应	本研究首次通过单细胞RNA测序数据识别了与T细胞相关的基因，并构建了一个预测骨肉瘤患者预后的特征	本研究主要基于公共数据库的数据，未涉及临床试验验证	研究T细胞相关基因在骨肉瘤发病机制中的作用，并构建预测模型	骨肉瘤患者的T细胞相关基因和免疫反应	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	3000个高度可变基因，多个骨肉瘤细胞系
252	2024-10-26	Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment changes and prognostic gene signatures in hepatocellular carcinoma 2024-Oct-22, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113317 PMID:39447409	研究论文	本文利用单细胞RNA转录组数据研究了肝细胞癌（HCC）恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记	首次通过单细胞RNA转录组数据揭示了HCC进展过程中肿瘤微环境的主要成分变化，并识别了与预后相关的基因标记	研究基于公开的单细胞RNA转录组数据，样本量有限，可能影响结果的普适性	探究肝细胞癌恶性进展过程中肿瘤微环境的变化及其与患者预后相关的基因标记	肝细胞癌患者的单细胞RNA转录组数据	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	来自不同阶段的HCC患者样本，代表I-IV期
253	2024-10-26	Isotope Encoded chemical Imaging Identifies Amyloid Plaque Age Dependent Structural Maturation, Synaptic Loss, and Increased Toxicity 2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.08.617019 PMID:39416086	研究论文	研究使用同位素编码的化学成像技术，追踪阿尔茨海默病中β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，并分析其对神经元功能和毒性的影响	首次将动态MSI、结构斑块成像和全基因组空间转录组学在单个斑块水平上进行功能整合，提供了前所未有的时间和空间分辨率	NA	阐明早期β-淀粉样蛋白斑块形成过程中的生化过程，并研究斑块成熟对神经元功能和毒性的影响	β-淀粉样蛋白斑块的形成和成熟过程，以及其对神经元功能和毒性的影响	数字病理学	阿尔茨海默病	质谱成像(MSI)、代谢同位素标记、超光谱共聚焦显微镜	NA	图像、基因表达数据	使用敲入Aβ小鼠模型，样本包括10个月和18个月大的动物
254	2024-10-26	Sex-dependent APOE4 neutrophil-microglia interactions drive cognitive impairment in Alzheimer's disease 2024-Oct, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03122-3 PMID:38961225	研究论文	研究探讨了APOE4在阿尔茨海默病中通过中性粒细胞与小胶质细胞相互作用驱动认知障碍的性别依赖性	发现了APOE4女性携带者中与认知障碍相关的新型中性粒细胞亚群，并揭示了IL-17F在其中的作用机制	研究主要基于小鼠模型和独立人群，需要进一步在人类中验证	探讨APOE4在阿尔茨海默病中驱动认知障碍的机制，并寻找潜在的治疗靶点	APOE4女性携带者中的中性粒细胞与小胶质细胞相互作用	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞转录组学、多重流式细胞术	NA	基因表达数据	两个独立人群的APOE4女性携带者
255	2024-10-26	Integrated immuno-transcriptomic analysis of ovarian cancer identifies a four-chemokine-dominated subtype with antitumor immune-active phenotype and favorable prognosis 2024-Oct, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-024-02803-7 PMID:39095528	研究论文	本研究通过整合免疫转录组分析卵巢癌样本，识别出一种以四种趋化因子为主的亚型，该亚型具有抗肿瘤免疫活性和良好的预后	本研究首次在卵巢癌中引入了一种基于四种趋化因子的免疫分类方法，并验证了其在多中心队列中的有效性	本研究的样本量虽然较大，但仍需在更多不同来源的样本中进一步验证	探讨卵巢癌中免疫活性肿瘤表型与临床结局之间的关系	卵巢癌样本及其免疫微环境	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	2850个卵巢癌样本和39个单细胞RNA测序样本
256	2024-10-26	Berberine Protects against Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Intrahepatic T Cell Heterogeneity 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405182 PMID:39135526	研究论文	研究探讨了小檗碱通过调节肝内T细胞异质性来抑制肝细胞癌进展的机制	首次详细阐述了小檗碱通过调节肝内T细胞异质性来抑制肝细胞癌进展的机制	研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证	探讨小檗碱在肝细胞癌中的抗肿瘤作用及其机制	小檗碱对肝细胞癌免疫微环境的影响	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	使用小鼠模型进行研究
257	2024-10-26	A LDH-Derived Metal Sulfide Nanosheet-Functionalized Bioactive Glass Scaffold for Vascularized Osteogenesis and Periprosthetic Infection Prevention/Treatment 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202403009 PMID:39159063	研究论文	开发了一种基于LDH衍生的硫化物纳米片功能化的生物活性玻璃支架，用于血管化骨再生和预防/治疗假体周围感染	该支架具有优异的近红外二区光热性能，能有效消除假体周围感染，并在骨质量和血管新生方面表现出显著增强效果	NA	解决骨科植入手术后常见的假体周围感染和假体松动问题	生物活性玻璃支架及其在血管化骨再生和感染预防/治疗中的应用	NA	NA	转录组测序，单细胞测序	NA	NA	NA
258	2024-10-26	From Cell to Gene: Deciphering the Mechanism of Heart Failure With Single-Cell Sequencing 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202308900 PMID:39159065	综述	本文综述了单细胞测序技术在解析心力衰竭机制中的应用	单细胞测序技术能够精确分析单个细胞的基因结构和表达，揭示心力衰竭过程中细胞成分和基因表达的变化	当前心血管研究中面临的挑战	深入探讨心力衰竭的潜在机制	心力衰竭的细胞异质性和细胞间通讯网络	数字病理学	心血管疾病	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA
259	2024-10-26	GJB2 Promotes HCC Progression by Activating Glycolysis Through Cytoplasmic Translocation and Generating a Suppressive Tumor Microenvironment Based on Single Cell RNA Sequencing 2024-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202402115 PMID:39162005	研究论文	研究GJB2通过细胞质转位激活糖酵解并生成抑制性肿瘤微环境促进肝细胞癌进展的机制	发现GJB2在肝细胞癌中的高表达与不良预后相关，并通过细胞质转位激活糖酵解和生成抑制性肿瘤微环境	NA	寻找肝细胞癌的有效治疗靶点	GJB2在肝细胞癌中的表达及功能	NA	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
260	2024-10-26	Retinoic acid induces human gastruloids with posterior embryo-like structures 2024-Oct, Nature cell biology IF:17.3Q1 DOI:10.1038/s41556-024-01487-8 PMID:39164488	研究论文	研究展示了视黄酸（RA）和Matrigel的早期脉冲可以诱导人类胚胎样后部结构的形成	首次展示了视黄酸和Matrigel的组合可以诱导人类胚胎样后部结构的形成，包括神经管、分段体节和多种细胞类型	研究主要集中在体外模型，尚未在体内验证这些结构的功能和发育潜力	探索视黄酸在早期人类胚胎发育中的作用，并开发新的体外模型	人类胚胎样结构，包括神经管、体节和多种细胞类型	发育生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确提及具体样本数量