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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-07 |
Influence of Vitamin D Receptor Signalling and Vitamin D on Colonic Epithelial Cell Fate Decisions in Ulcerative Colitis
2024-Oct-15, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjae074
PMID:38747639
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研究论文 | 本研究探讨维生素D受体信号传导和维生素D对溃疡性结肠炎患者结肠上皮细胞命运决定的影响 | 首次在人类结肠类器官模型中系统研究维生素D-VDR轴对上皮细胞分化的调控机制,并利用CRISPR/Cas9技术验证VDR依赖性 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体实验验证 | 阐明维生素D-VDR信号轴在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康个体的结肠活检样本及患者来源的结肠类器官 | 分子生物学 | 溃疡性结肠炎 | 免疫组织化学, RNA表达阵列, 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因敲除 | NA | 图像, 文本(基因表达数据) | 来自UC患者和健康个体的结肠活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
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研究论文 | 本研究通过整合分析构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的风险特征,用于三阴性乳腺癌的预后预测和免疫特征分析 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别TAM簇并构建8基因风险特征,开发了整合分期和TAM风险特征的新型列线图 | NA | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特征,构建预后风险特征并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,逆转录聚合酶链反应,Western blot,免疫组织化学 | LASSO回归,单变量Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-07 |
Cell and transcriptomic diversity of infrapatellar fat pad during knee osteoarthritis
2024-Oct-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225928
PMID:39375009
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了膝关节骨关节炎中髌下脂肪垫的细胞和转录组多样性 | 首次提供了人类髌下脂肪垫的全面细胞和转录组图谱,确定了与膝关节骨关节炎、性别和肥胖状态相关的成纤维细胞关键作用 | 样本量相对有限(21个样本),需要进一步验证 | 确定髌下脂肪垫在膝关节骨关节炎中的作用及其与性别和肥胖状态的关系 | 人类髌下脂肪垫组织 | 单细胞生物学 | 膝关节骨关节炎 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 21个髌下脂肪垫样本(6个健康对照,15个膝关节骨关节炎供体),共82,924个细胞核 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-07 |
NME4 suppresses NFκB2-CCL5 axis, restricting CD8+ T cell tumour infiltration in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-10, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13838
PMID:39016535
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研究论文 | 本研究揭示了NME4通过调控NFκB2-CCL5轴抑制CD8+ T细胞在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中浸润的机制 | 首次发现NME4在肿瘤微环境中的免疫调节功能,并阐明其通过NFκB2-CCL5轴调控CD8+ T细胞浸润的新机制 | 临床样本中NME4表达与临床病理和预后的相关性有限,主要机制研究基于小鼠模型 | 探究NME4在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫学作用及其分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本、C57BL/6小鼠同源肿瘤模型、AKR小鼠ESCC细胞系 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、蛋白质微阵列筛选 | 同源肿瘤小鼠模型 | 组织切片图像、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 | 食管鳞状细胞癌患者样本和小鼠模型样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-07 |
FANCD2 as a ferroptosis-related target for recurrent implantation failure by integrated bioinformatics and Mendelian randomization analysis
2024-Oct, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70119
PMID:39400935
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研究论文 | 通过整合生物信息学和孟德尔随机化分析,研究铁死亡相关基因在复发性种植失败中的作用 | 首次结合生物信息学分析和孟德尔随机化方法系统研究DEFRGs在RIF中的表达和意义,发现FANCD2通过非经典铁死亡依赖途径参与RIF发病机制 | 研究样本量有限,需要进一步实验验证基因功能机制 | 探究铁死亡相关基因在复发性种植失败发病机制中的作用 | 复发性种植失败患者和健康个体的子宫内膜组织 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | 生物信息学分析,孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-02-07 |
Single-cell omics and machine learning integration to develop a polyamine metabolism-based risk score model in breast cancer patients
2024-Oct-23, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06001-z
PMID:39441216
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研究论文 | 本研究结合单细胞组学和机器学习,开发了一种基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型 | 首次将单细胞组学与机器学习结合,开发基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型,揭示了肿瘤微环境的异质性 | 未提及样本的具体数量,可能影响模型的泛化能力 | 开发一种基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型,以个性化预后评估 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | SuperPC模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2025-02-07 |
A prospective diagnostic model for breast cancer utilizing machine learning to examine the molecular immune infiltrate in HSPB6
2024-Oct-23, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05995-w
PMID:39441229
|
研究论文 | 本研究利用机器学习技术分析乳腺癌中的分子免疫浸润,特别是HSPB6基因,以开发一种前瞻性诊断模型 | 通过机器学习模型识别乳腺癌诊断的关键基因,并揭示HSPB6在细胞迁移、增殖和凋亡中的作用 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步在体内模型中验证 | 深入了解乳腺癌的分子机制,并识别与疾病相关的关键基因 | 乳腺癌相关数据集和MCF7细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 差异基因表达分析、基因集富集分析(GSEA)、加权共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 乳腺癌相关数据集和MCF7细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2025-10-07 |
Novel insights into the heterogeneity of FOXP3 + Treg cells in drug-induced allergic reactions through single-cell transcriptomics
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09509-1
PMID:39073709
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示FOXP3+调节性T细胞在药物诱导过敏反应中的异质性及其免疫调节作用 | 首次在药物诱导过敏反应背景下发现FOXP3+Treg细胞的显著转录组异质性,并证实FOXP3过表达可减轻过敏反应 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探究FOXP3+Treg细胞在药物诱导过敏反应中的异质性和免疫调节功能 | 小鼠模型中的FOXP3+调节性T细胞 | 单细胞转录组学 | 药物过敏反应 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,CRISPR/Cas9基因编辑,ELISA,细胞增殖检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing revealed immune heterogeneity and its association with disease activity in rheumatoid arthritis patients
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09513-5
PMID:39009881
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序技术,揭示类风湿关节炎患者免疫异质性及其与疾病活动的关联 | 首次整合单细胞转录组/T细胞受体测序与两个大型队列的bulk RNA测序数据,系统揭示类风湿关节炎中免疫细胞异质性及其临床关联 | 样本来源仅限于外周血单个核细胞和滑膜液,未包含其他组织类型 | 探究类风湿关节炎患者免疫环境特征及其与临床特征的关联 | 类风湿关节炎患者的外周血单个核细胞和滑膜液样本 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液样本,整合两个大型队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-07 |
T cell receptor clonotype in tumor microenvironment contributes to intratumoral signaling network in patients with colorectal cancer
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09478-5
PMID:39112913
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中T细胞受体克隆型与信号网络的关系 | 首次在结直肠癌中整合单细胞转录组和T细胞受体测序,揭示TCR克隆扩增与肿瘤免疫信号网络的关联 | 样本量相对有限(30对样本),且仅针对结直肠癌 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中基因表达和免疫特征 | 结直肠癌患者肿瘤组织和配对正常组织 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 数字图像分析 | NA | 单细胞基因表达数据, TCR序列数据, 图像数据 | 30对结直肠癌和配对正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-07 |
Long non-coding RNA H19X as a regulator of mononuclear cell adhesion to the endothelium in systemic sclerosis
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae034
PMID:38305495
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研究论文 | 本研究探讨长链非编码RNA H19X在系统性硬化症血管病变中作为内皮细胞活化调节因子的功能 | 首次揭示H19X通过调控内皮细胞粘附分子表达参与系统性硬化症血管病变的机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 阐明H19X lncRNA在内皮细胞活化过程中的功能作用 | 系统性硬化症患者皮肤活检组织、人真皮微血管内皮细胞、外周血单核细胞 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 荧光染色, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells
2024-10, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904
PMID:39117004
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综述 | 本文通过单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞在正常和肿瘤状态下的更复杂分类 | 利用单细胞测序技术重新定义了胸腺上皮细胞的分类体系,揭示了从pre-AIRE状态到成熟medullary细胞再到post-AIRE细胞的分化轨迹 | NA | 探讨单细胞测序对胸腺上皮细胞分类的新见解 | 正常和肿瘤状态下的胸腺上皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
Spatial resolution of the head and neck cancer tumor microenvironment to identify tumor and stromal features associated with therapy response
2024-10, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12811
PMID:39048134
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术解析头颈癌肿瘤微环境特征与免疫治疗反应的关系 | 首次结合NanoString GeoMx空间转录组和Akoya Phenocycler-Fusion空间蛋白质组技术,在头颈癌中识别与免疫治疗反应相关的肿瘤和基质特征 | 样本量较小(仅12名患者),且为回顾性研究 | 识别头颈癌肿瘤微环境中与免疫治疗反应相关的生物学特征 | 头颈癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理 | 头颈癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 12名患者的25个组织核心(包括4名无应答者8个核心,2名应答者5个核心,6名未治疗者12个核心) | NanoString, Akoya | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler, PhenoCycler-Fusion | NanoString GeoMx全转录组空间分析, Akoya PhenoCycler-Fusion空间蛋白质组分析 |
| 254 | 2025-10-07 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
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研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组和染色质可及性分析揭示卵巢体细胞的进化特征 | 首次在人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子五个物种中整合分析单细胞转录组和染色质可及性数据,揭示卵巢细胞进化规律 | 研究仅针对成年卵巢,未涵盖发育过程;物种数量有限 | 探究不同物种间卵巢体细胞分子机制的保守性与差异性 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢体细胞 | 单细胞多组学 | 卵巢生理与疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 五个物种的卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice
2024-Oct, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006
PMID:39153545
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人巨细胞病毒感染人源化小鼠后外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次在人源化小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术研究HCMV感染后的免疫细胞反应 | 研究基于人源化小鼠模型,与真实人体感染环境存在差异 | 揭示HCMV感染过程中病毒与宿主的相互作用机制 | 人源化小鼠模型中的外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞测序分析 | 人巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
Metabolic Reprogramming Induced by Aging Modifies the Tumor Microenvironment
2024-10-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201721
PMID:39451239
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研究论文 | 本研究通过计算模型分析衰老如何通过代谢重编程改变肿瘤微环境 | 首次系统揭示衰老通过代谢可塑性影响肿瘤微环境的机制,特别是能量代谢通路在免疫细胞中的差异性变化 | 基于计算模型的分析需要实验验证,样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索衰老与代谢重编程的相互作用如何影响肿瘤微环境并促进肿瘤发生 | 17种与衰老相关的癌症类型,包括T细胞、巨噬细胞等免疫细胞 | 计算生物学 | 多种癌症 | MMPC计算模型,RNA-seq分析 | MMPC(代谢可塑性通路配对比较模型) | RNA-seq数据 | 涵盖17种癌症类型的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
Podoplanin Expression in Early-Stage Colorectal Cancer-Associated Fibroblasts and Its Utility as a Diagnostic Marker for Colorectal Lesions
2024-10-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201682
PMID:39451200
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研究论文 | 本研究探讨了podoplanin在早期结直肠癌相关成纤维细胞中的表达及其作为结直肠病变诊断标志物的应用价值 | 首次发现早期结直肠癌中隐窝周围成纤维细胞和网状细胞是CAFs的细胞来源,并证实PDPN表达可作为区分结直肠非肿瘤性与肿瘤性病变的诊断特征 | 早期结直肠癌中PDPN阳性CAFs的研究尚不充分,样本量未明确说明 | 研究早期结直肠癌相关成纤维细胞中podoplanin的表达特征及其诊断价值 | 腺瘤、早期结直肠癌、神经内分泌肿瘤、正常邻近组织和非肿瘤性结直肠病变 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
NBAtlas: A harmonized single-cell transcriptomic reference atlas of human neuroblastoma tumors
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114804
PMID:39368085
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研究论文 | 本研究整合了七个单细胞或单核转录组数据集,构建了一个包含362,991个细胞的人类神经母细胞瘤协调参考图谱 | 创建了首个涵盖61名患者的大规模神经母细胞瘤单细胞转录组协调参考图谱,揭示了肿瘤区室转录组特征与临床结局的关联 | 整合的研究数据量仍有限,可能无法完全代表神经母细胞瘤的全部异质性 | 构建人类神经母细胞瘤的单细胞转录组参考图谱并解析其肿瘤异质性 | 神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61名患者的362,991个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2025-10-07 |
PD-L1 restrains PD-1+Nrp1lo Treg cells to suppress inflammation-driven colorectal tumorigenesis
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114819
PMID:39368087
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研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过抑制PD-1+Nrp1lo Treg细胞调控IL6中性粒细胞募集,从而控制炎症驱动性结直肠肿瘤发生 | 首次发现PD-L1通过调控PD-1+Nrp1lo Treg细胞亚群和IL6中性粒细胞来抑制结直肠肿瘤发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究PD-L1在结直肠癌中调控T细胞功能的具体机制 | 小鼠结直肠肿瘤模型中的T细胞亚群和中性粒细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
Persistent bone marrow hemozoin accumulation confers a survival advantage against bacterial infection via cell-intrinsic Myd88 signaling
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114850
PMID:39392758
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研究论文 | 本研究揭示了疟疾中血晶素在骨髓持续沉积通过细胞内在Myd88信号通路增强先天免疫记忆的机制 | 首次发现血晶素通过细胞内在Myd88依赖途径诱导骨髓生成偏向,并证实其能增强单核细胞杀菌能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究血晶素沉积对造血和免疫反应的调控机制 | 骨髓造血祖细胞和单核细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 骨髓嵌合体, 骨内注射 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |