单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 580 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-07 |
Circulating Adenoid Cystic Carcinoma associated MYB transcripts enable rapid and sensitive detection of metastatic disease in blood liquid biopsies
2024-Oct-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.10.15.24315549
PMID:39484279
|
研究论文 | 开发了一种基于MYB转录本的qPCR检测方法，用于通过液体活检检测腺样囊性癌的转移性疾病 | 首次利用循环肿瘤细胞中MYB转录本表达作为生物标志物，开发了敏感且经济有效的转移性ACC检测方法 | 样本量较小（总样本49例），需要更大规模的验证研究 | 开发通过血液液体活检检测转移性腺样囊性癌的敏感诊断方法 | 腺样囊性癌患者血液样本中的MYB转录本和循环肿瘤细胞 | 分子诊断 | 腺样囊性癌 | 定量PCR，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 49例患者样本（23例无ACC，15例无疾病证据，6例局部ACC，5例转移性ACC） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-01-15 |
Mechanisms of HIF1A-mediated immune evasion in gastric cancer and the impact on therapy resistance
2024-10-10, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09917-x
PMID:39384651
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌中静止癌细胞（QCCs）通过HIF1A介导的免疫逃逸机制及其对治疗抵抗的影响 | 揭示了QCCs通过HIF1A介导的糖酵解相关基因上调来抵抗T细胞介导的免疫反应的分子机制，并展示了HIF1A沉默在增强免疫治疗效果方面的潜力 | 研究主要依赖于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人类临床试验中验证这些发现 | 探索胃癌中QCCs的免疫抑制机制及其对免疫治疗抵抗的影响，以改进治疗策略 | 胃癌中的静止癌细胞（QCCs）及其与免疫细胞的相互作用 | 癌症研究 | 胃癌 | 基因编辑技术、转录组测序、单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、细胞实验数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了小鼠模型和体外细胞实验 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2025-10-07 |
Spatial multiomics atlas reveals smooth muscle phenotypic transformation and metabolic reprogramming in diabetic macroangiopathy
2024-10-12, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02458-x
PMID:39395983
|
研究论文 | 本研究首次构建了糖尿病大血管病变的空间多组学图谱，揭示了平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的特征 | 首次构建了胫前动脉的空间基因-代谢图谱，揭示了平滑肌细胞表型转化的转录驱动网络和代谢重编程关键基因 | 样本仅来自11例截肢糖尿病患者，样本量有限 | 探索糖尿病大血管病变中平滑肌细胞表型转化和代谢重编程的分子机制 | 糖尿病患者的胫前动脉组织 | 空间多组学 | 糖尿病大血管病变 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,空间代谢组测序 | 多组学整合分析,细胞通讯分析,时间序列分析,网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,空间代谢组数据 | 11例糖尿病截肢患者的胫前动脉 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间代谢组学 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics in thyroid eye disease
2024 Oct-Dec, Taiwan journal of ophthalmology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/tjo.TJO-D-23-00096
PMID:39803402
|
综述 | 总结单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的最新突破和应用前景 | 首次系统综述单细胞RNA测序技术在甲状腺眼病研究中的应用，揭示疾病发病机制的新见解 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要依赖已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞转录组学在甲状腺眼病研究中的应用价值和未来方向 | 甲状腺眼病患者眼眶后组织 | 数字病理学 | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclei RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional atlas of human breast cancers and model systems
2024-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70044
PMID:39417215
|
研究论文 | 构建了人类乳腺癌的单细胞转录图谱，包含患者样本和多种模型系统 | 整合了多种乳腺癌模型系统的单细胞RNA测序数据，开发了动态细胞样本注释方法 | 样本数量有限，模型系统与真实患者样本仍存在差异 | 深入理解乳腺癌细胞多样性，识别有效治疗方法 | 乳腺癌患者肿瘤组织、淋巴结转移灶、减乳成形术样本、PDX模型、PDXO类器官和细胞系 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | SCSubtype, TNBCtype细胞分型预测器 | 单细胞转录组数据 | 117个样本，共506,719个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2025-01-03 |
Tcf21 as a Founder Transcription Factor in Specifying Foxd1 Cells to the Juxtaglomerular Cell Lineage
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.25.586641
PMID:38585851
|
研究论文 | 本文探讨了Tcf21在Foxd1+基质祖细胞向肾小球旁细胞（JG细胞）分化中的关键作用 | 首次揭示了Tcf21在早期肾脏发育中对Foxd1+细胞向JG细胞分化的关键作用，并通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序分析了Tcf21的表达动态 | Tcf21在已确立的肾素表达细胞中的作用未被充分探讨 | 研究Tcf21在Foxd1+祖细胞向JG细胞分化中的作用 | Foxd1+基质祖细胞和肾小球旁细胞（JG细胞） | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞基因表达数据，染色质可及性数据 | 2,054个GFP+细胞（基质谱系） | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-12-30 |
The prognostic value and immunological role of calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) in pan-cancer study
2024-Oct-11, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040072
PMID:39465821
|
研究论文 | 本文通过整合多组学和临床数据，全面评估了钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2（CAMKK2）在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用 | 首次在泛癌研究中全面评估CAMKK2的分子景观，并发现其在不同癌症类型中的异常表达与生存结果相关 | 研究结果基于特定癌症队列，可能无法推广到所有癌症类型 | 评估CAMKK2在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用 | 多种癌症类型中的CAMKK2基因 | 癌症研究 | 泛癌 | 多组学分析、单细胞转录组分析 | NA | 多组学数据、临床数据 | 多个癌症队列（如IMvigor210、GSE176307、GSE78220等） | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-12-28 |
CD74+ fibroblasts proliferate upon mechanical stretching to promote angiogenesis in keloids
2024-Oct-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401302R
PMID:39400419
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了CD74+成纤维细胞在机械拉伸诱导的瘢痕疙瘩进展中的关键作用 | 首次识别出CD74+成纤维细胞作为机械拉伸诱导瘢痕疙瘩进展的关键细胞群，并阐明了其通过PIEZO1介导的钙内流及下游ERK和AKT信号通路促进血管生成和增殖的机制 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏在体实验验证 | 探究机械拉伸诱导瘢痕疙瘩进展的细胞机制 | 瘢痕疙瘩组织中的CD74+成纤维细胞 | 细胞生物学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-12-28 |
Identification of a seven-gene prognostic model for renal cell carcinoma associated with CD8+T lymphocyte cell
2024-Oct-04, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039938
PMID:39465721
|
研究论文 | 本研究通过分析肾细胞癌（RCC）中CD8+ T淋巴细胞相关的基因特征，构建了一个七基因预后模型 | 首次构建了一个与CD8+ T淋巴细胞相关的七基因预后模型，用于肾细胞癌患者的风险分层 | 研究数据主要来源于The Cancer Genome Atlas，可能缺乏多样性和广泛性 | 构建一个与CD8+ T淋巴细胞相关的肾细胞癌预后模型 | 肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 加权基因共表达网络分析、基因本体富集分析、京都基因与基因组百科全书信号通路分析、单细胞测序 | LASSO回归、单变量和多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 来自The Cancer Genome Atlas的肾细胞癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-12-25 |
Single-cell RNA Sequencing Identifies a Novel Subtype of Microglia with High Cd74 Expression that Facilitates White Matter Inflammation During Chronic Cerebral Hypoperfusion
2024-Oct, Neurochemical research
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11064-024-04206-9
PMID:39012534
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别出一种新型的小胶质细胞亚型，该亚型具有高Cd74表达，并促进慢性脑低灌注期间的脑白质炎症 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术发现了一种新型的小胶质细胞亚型（CIAM），并揭示了Cd74在其中的核心作用 | 本研究的局限性在于仅使用了大鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 研究微胶质细胞在血管性痴呆中的新型亚型及其在神经炎症中的作用 | 微胶质细胞及其在慢性脑低灌注模型中的变化 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了慢性脑低灌注大鼠模型，并通过磁激活细胞分选技术分离微胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-12-21 |
Does the brain make prolactin?
2024-10, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13432
PMID:39041379
|
综述 | 本文综述了关于脑内是否产生催乳素的研究证据 | 本文通过分析不同抗体和高度敏感的扩增技术检测到的催乳素免疫反应性，提出了对脑内催乳素产生可能性的质疑 | 证据不一致且变异性大，高度敏感的检测技术可能导致假阳性结果，且现代原位杂交和单细胞RNA测序未能提供支持证据 | 评估脑内催乳素产生的证据 | 催乳素及其受体在脑内的表达和功能 | NA | NA | 原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-12-20 |
Mechanisms of Berberine in anti-pancreatic ductal adenocarcinoma revealed by integrated multi-omics profiling
2024-10-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74943-y
PMID:39358545
|
研究论文 | 本研究通过整合药理学数据库与bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，揭示了小檗碱在抗胰腺导管腺癌中的潜在机制 | 首次通过多组学分析揭示了小檗碱在胰腺导管腺癌中的潜在抗肿瘤机制，并识别了关键的药物靶点和免疫调节作用 | 研究主要基于体外数据和计算分析，缺乏体内实验验证 | 揭示小檗碱在抗胰腺导管腺癌中的潜在机制 | 小檗碱在胰腺导管腺癌中的作用机制及潜在靶点 | NA | 胰腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | PPI网络 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-12-19 |
Catalytic activity of Setd2 is essential for embryonic development in mice: establishment of a mouse model harboring patient-derived Setd2 mutation
2024-Oct, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1095-1
PMID:39115793
|
研究论文 | 本文研究了Setd2的催化活性对小鼠胚胎发育的重要性，并建立了一个携带患者来源Setd2突变的小鼠模型 | 首次建立了携带患者来源催化失活Setd2突变的小鼠模型，揭示了Setd2催化活性对小鼠胚胎发育的必要性 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类疾病的具体机制 | 探讨Setd2催化活性在小鼠胚胎发育中的作用 | Setd2基因及其催化活性在小鼠胚胎发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Setd2和Setd2-CD小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-12-18 |
iMIRACLE: an Iterative Multi-View Graph Neural Network to Model Intercellular Gene Regulation from Spatial Transcriptomic Data
2024-Oct, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management
DOI:10.1145/3627673.3679574
PMID:39679382
|
研究论文 | 本文提出了一种名为iMiracle的迭代多视图图神经网络，用于从空间转录组数据中建模细胞间的基因调控 | iMiracle整合了细胞间和细胞内网络，采用迭代学习克服空间转录组数据的稀疏性，并推断细胞特异性的配体-基因调控评分 | NA | 填补从空间转录组数据中连接细胞间通信与基因调控的空白，提供细胞间调控的生物学见解 | 细胞间的基因调控 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | 空间转录组数据 | 九个模拟数据集和八个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-12-17 |
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics for Central Nervous System Disease
2024-Oct-10, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01499-w
PMID:39387975
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）在中枢神经系统（CNS）疾病研究中的应用 | 通过scRNA-seq和ST技术，揭示了CNS疾病的细胞异质性和功能特异性，发现了新的细胞类型或亚型，提出了新的病理生理机制，并发现了潜在的治疗靶点和生物标志物 | NA | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学在中枢神经系统疾病研究中的应用 | 中枢神经系统疾病，包括慢性神经退行性疾病和急性中枢神经系统损伤等 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-12-16 |
Single-cell RNA-seq Reveals the Inhibitory Effect of Methamphetamine on Liver Immunity with the Involvement of Dopamine Receptor D1
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae060
PMID:39196711
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的抑制作用，并发现多巴胺受体D1在其中的调节作用 | 研究仅限于慢性甲基苯丙胺暴露模型，未探讨急性暴露的影响 | 探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 | 肝脏免疫细胞及多巴胺受体D1 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肝脏免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-12-11 |
IgG autoantibodies in bullous pemphigoid directly induce a pathogenic MyD88-dependent pro-inflammatory response in keratinocytes
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.616103
PMID:39569141
|
研究论文 | 研究探讨了天疱疮（BP）中的IgG自身抗体如何直接诱导角质形成细胞中的病理性MyD88依赖性促炎反应 | 首次揭示了BP-IgG自身抗体依赖的角质形成细胞反应在天疱疮病理中的作用，并证明了MyD88在BP-IgG诱导的炎症反应中的关键作用 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，尚未完全阐明这些发现在人类中的直接应用 | 探讨天疱疮中IgG自身抗体对角质形成细胞的直接影响及其在疾病病理中的作用 | 天疱疮患者的IgG自身抗体、角质形成细胞、MyD88信号通路 | NA | 天疱疮 | 多重免疫分析、bulk RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括天疱疮患者和对照组的IgG处理过的原代角质形成细胞，以及患病和对照皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-12-08 |
Pharmacological and toxicological characteristics of baicalin in preventing spontaneous abortion and recurrent pregnancy loss: A multi-level critical review
2024-Oct-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38633
PMID:39640688
|
综述 | 本文综述了黄芩苷在预防自然流产和反复妊娠丢失中的药理学和毒理学特性 | 提出了基于病理动力学的多模态立体测序研究，结合单细胞RNA测序、空间转录组学和单细胞多模态组学，深入探讨黄芩苷的保胎机制 | 从临床角度阐述了使用黄芩苷的局限性 | 探讨黄芩苷在母胎界面上的代谢、毒理学和药理学效应，以及其在预防自然流产和反复妊娠丢失中的作用机制 | 黄芩苷及其代谢产物黄芩素在母胎界面上的生物效应 | NA | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多模态组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-12-08 |
scACT: Accurate Cross-modality Translation via Cycle-consistent Training from Unpaired Single-cell Data
2024-Oct, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management
DOI:10.1145/3627673.3679576
PMID:39628660
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scACT的深度生成模型，用于从未配对的单细胞数据中提取跨模态生物学见解 | scACT通过对抗训练对齐未配对的多模态数据，利用循环一致训练实现无先验知识的跨模态翻译，并通过模拟扰动探索可解释的调控相互联系 | NA | 解决现有跨模态翻译方法依赖于稀缺的高质量共测数据的问题 | 单细胞数据中的跨模态翻译 | 机器学习 | NA | 深度生成模型 | 对抗训练和循环一致训练 | 单细胞数据 | 多种单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-12-07 |
Hexokinase 2 expression in apical enterocytes correlates with inflammation severity in patients with inflammatory bowel disease
2024-10-23, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03710-7
PMID:39444028
|
研究论文 | 研究了炎症性肠病患者中顶端肠上皮细胞的己糖激酶2表达与炎症严重程度的关系 | 首次系统研究了己糖激酶2表达与炎症性肠病活动性的关系，并提出了靶向己糖激酶2抑制作为潜在治疗途径 | 研究基于两个独立队列的数据，但样本量和队列数量有限 | 探讨己糖激酶2表达与炎症性肠病炎症严重程度的关系 | 炎症性肠病患者的顶端肠上皮细胞 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 两个独立队列的炎症性肠病患者，包括克罗恩病和溃疡性结肠炎患者 | NA | NA | NA | NA |