单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-11-21 |
Non-genetic differences underlie variability in proliferation among esophageal epithelial clones
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012360
PMID:39466790
|
研究论文 | 研究了食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性，发现非遗传因素在不同克隆的增殖能力中起重要作用 | 通过成像和细胞条形码技术追踪克隆，结合单细胞RNA测序，揭示了与高增殖克隆相关的细胞状态和基因通路 | 研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响 | 探讨食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性和相关细胞状态 | 食管上皮细胞（EPC2-hTERT）的克隆增殖行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学模型 | 图像数据和基因表达数据 | 涉及约10%的指数增长克隆和其余的非增殖克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-11-20 |
Identifying a CD8T cell signature in the tumor microenvironment to forecast gastric cancer outcomes from sequencing data
2024-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-603
PMID:39554559
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研究论文 | 研究通过分析肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因，预测胃癌患者的预后 | 首次利用CD8T细胞相关基因构建胃癌预后预测模型 | 研究仅基于TCGA数据库的数据，样本量有限 | 探索肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因在胃癌预后预测中的作用 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8T细胞相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞mRNA测序 | Cox回归模型 | 基因数据 | TCGA数据库中的胃癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-11-20 |
Landscape of immune cells in systematic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection: assessed by single-cell sequencing
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/kead673
PMID:38078808
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研究论文 | 研究分析了系统性红斑狼疮患者在有无EB病毒感染情况下的免疫细胞和B细胞受体（BCR）谱，并通过单细胞RNA测序识别两者之间的差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱，揭示了CD8+增殖T细胞比例和IFN-α/β通路在感染组中的变化 | 样本量较小，仅包括两名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 分析系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱，以更好地理解免疫反应机制 | 系统性红斑狼疮患者及其在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共8名参与者，包括2名SLE-EBV+患者，4名SLE-EBV-患者和2名健康对照，共获得83,478个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-11-20 |
Biallelic RXFP2 variants lead to congenital bilateral cryptorchidism and male infertility, supporting a role of RXFP2 in spermatogenesis
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deae195
PMID:39222519
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研究论文 | 研究探讨了RXFP2基因的双等位变异如何导致先天性双侧隐睾和男性不育，并支持RXFP2在精子发生中的作用 | 首次在人类病例中证实RXFP2在精子发生成熟中的作用，并发现双等位变异导致男性不育 | 目前仅基于一个家庭的研究，需要更多病例验证 | 探讨RXFP2基因变异对男性生育能力的影响 | RXFP2基因及其在精子发生中的作用 | NA | 男性不育 | 长读长测序、单细胞RNA测序、环AMP报告基因检测 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 一个家庭中的两名男性成员 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-11-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for human testicular ageing
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deae199
PMID:39241251
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类睾丸衰老的转录组图谱和潜在靶点 | 首次提供了年轻和老年人类睾丸的全面单细胞转录组图谱，并揭示了与睾丸衰老相关的分子机制和潜在治疗靶点 | 由于收集人类睾丸组织的困难，样本量有限，未来需要进一步的功能和机制研究 | 探讨人类睾丸衰老的分子基础和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人类睾丸组织中的单细胞转录组 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6个年轻个体和6个老年个体的睾丸组织样本，以及10个年轻捐赠者和10个老年捐赠者的更大样本集 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-11-20 |
The Inflammatory Characteristics of Symptomatic Glioma Associated With Poor Prognosis and Chemoresistance via Tumor Necrosis Factor Signaling Pathway
2024-Oct, Brain tumor research and treatment
DOI:10.14791/btrt.2024.0035
PMID:39542520
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研究论文 | 研究分析了有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异，发现有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 首次揭示了有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 研究为回顾性分析，样本量有限，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探讨有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异及其对预后和化疗耐药的影响 | 有症状和无症状胶质瘤样本 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 (RNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | TCGA和CGGA数据集中的胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-11-19 |
VAPOR: Variational autoencoder with transport operators decouples co-occurring biological processes in development
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620534
PMID:39554007
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAPOR的方法，通过变分自编码器与传输算子来解耦发育过程中同时发生的生物学过程 | VAPOR方法能够将基因表达动态分解为多个子空间，每个子空间的动态由常微分方程模型控制，从而揭示不同生物学过程的多方面时间尺度 | NA | 开发一种新的计算方法来解耦发育过程中同时发生的生物学过程的基因表达动态 | 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-11-19 |
Integrative analyses of bulk and single-cell RNA-seq reveals the correlation between SPP1+ macrophages and resistance to neoadjuvant chemoimmunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Oct-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03848-6
PMID:39367943
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，揭示了SPP1+巨噬细胞与食管鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗抵抗之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性，并发现了SPP1+巨噬细胞在治疗抵抗中的关键作用 | 研究样本量较小，且仅基于公开数据集，未来需要更大规模的临床验证 | 探讨新辅助化疗免疫治疗在食管鳞状细胞癌中的疗效差异及其潜在机制 | 食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性及巨噬细胞的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 32例接受手术的食管鳞状细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-11-19 |
NitraTh epitope-based neoantigen vaccines for effective tumor immunotherapy
2024-Oct-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03830-2
PMID:39358493
|
研究论文 | 介绍了一种基于NitraTh表位的肿瘤新抗原疫苗设计方法，该方法不依赖于计算预测CD4 T细胞表位，并在肝癌小鼠模型中显著抑制了肿瘤进展 | 提出了一种新的NitraTh表位，不依赖于计算预测CD4 T细胞表位，成功设计出能引发强烈新抗原特异性免疫反应的肿瘤新抗原疫苗 | NA | 开发一种有效的新抗原疫苗设计方法，用于肿瘤免疫治疗 | 肿瘤新抗原疫苗及其在肝癌小鼠模型中的效果 | 肿瘤免疫治疗 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | NA | H22细胞异种移植和患者来源的异种移植（PDX）肝癌小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-11-19 |
A random survival forest-based pathomics signature classifies immunotherapy prognosis and profiles TIME and genomics in ES-SCLC patients
2024-Oct-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03829-9
PMID:39358575
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研究论文 | 本文构建了一个基于随机生存森林的病理组学特征模型，用于分类广泛期小细胞肺癌患者的免疫治疗预后，并探索其与基因组学和肿瘤免疫微环境的关系 | 首次利用随机生存森林模型结合病理组学特征来预测广泛期小细胞肺癌患者的免疫治疗预后，并揭示了其与基因组学和肿瘤免疫微环境的潜在关联 | 研究样本量有限，且仅限于南京金陵医院的患者，研究结果的普适性有待进一步验证 | 探索广泛期小细胞肺癌患者免疫治疗预后的可靠生物标志物 | 广泛期小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序 | 随机生存森林 | 图像 | 118名接受一线免疫治疗的广泛期小细胞肺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-11-17 |
Integrating Microarray Data and Single-Cell RNA-Seq Reveals Key Gene Involved in Spermatogonia Stem Cell Aging
2024-Oct-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252111653
PMID:39519201
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研究论文 | 本文通过整合微阵列数据和单细胞RNA测序，揭示了精原干细胞衰老过程中的关键基因 | 本文创新性地整合了微阵列数据和单细胞RNA测序，识别出精原干细胞特异性转录因子和枢纽基因，并提出了复杂的网络调控机制 | 由于样本量有限且缺乏精确的衰老指标，研究结果的普适性和准确性可能受到限制 | 揭示精原干细胞衰老过程中的关键基因及其调控机制，为解决男性不育问题提供新思路 | 精原干细胞及其衰老过程中的基因表达变化 | 基因组学 | 男性不育 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、ATAC-seq、DNase-seq | NA | 基因表达数据 | 三个不同精原干细胞的人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-11-17 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Monocyte-Derived Interstitial Macrophages with a Pro-Fibrotic Phenotype in Bleomycin-Induced Pulmonary Fibrosis
2024-Oct-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252111669
PMID:39519222
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究了博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型中由单核细胞衍生的间质巨噬细胞的细胞异质性和发育轨迹 | 首次揭示了由单核细胞衍生的间质巨噬细胞在博来霉素诱导的肺纤维化中的促纤维化表型及其与成纤维细胞的相互作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨间质巨噬细胞在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型中的间质巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 博来霉素处理的小鼠肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-11-17 |
Dual targeting macrophages and microglia is a therapeutic vulnerability in models of PTEN-deficient glioblastoma
2024-Oct-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178628
PMID:39352749
|
研究论文 | 研究探讨了在PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中，通过双重靶向巨噬细胞和微胶质细胞来实现治疗效果的可能性 | 首次提出通过抑制LOX和CLOCK-OLFML3轴来双重靶向巨噬细胞和微胶质细胞，结合抗PD1疗法，实现超过60%的动物模型中肿瘤完全消退 | NA | 探索在PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中，通过靶向巨噬细胞和微胶质细胞来增强治疗效果的策略 | PTEN缺陷型胶质母细胞瘤中的巨噬细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学、多重顺序免疫荧光 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-11-17 |
Endothelial YAP/TAZ activation promotes atherosclerosis in a mouse model of Hutchinson-Gilford progeria syndrome
2024-Oct-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173448
PMID:39352768
|
研究论文 | 研究了Hutchinson-Gilford早衰综合征（HGPS）小鼠模型中内皮细胞YAP/TAZ激活促进动脉粥样硬化的机制 | 首次揭示了内皮细胞YAP/TAZ信号通路在HGPS血管疾病中的关键作用，并提出了针对YAP/TAZ的治疗策略 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类HGPS患者中验证 | 探讨HGPS血管病理的机制 | HGPS小鼠模型的主动脉内皮细胞 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、原子力显微镜、超声波评估 | NA | 基因表达数据 | HGPS小鼠和野生型对照小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-11-15 |
Single Cell Isolation from Human Diabetic Fibrovascular Membranes for Single-Cell RNA Sequencing
2024-Oct-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5096
PMID:39512888
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研究论文 | 本文介绍了一种从增生性糖尿病视网膜病变患者手术切除的纤维血管膜中制备单细胞悬液的胶原酶I消化协议，并进行了单细胞RNA测序分析 | 本文提供了一种新的胶原酶I消化协议，用于从纤维血管膜中制备单细胞悬液，并进行了详细的单细胞RNA测序分析 | 该协议可能对某些细胞类型造成损伤，尤其是在消化纤维化组织时 | 研究在生理和病理条件下单细胞水平的基因表达变化 | 增生性糖尿病视网膜病变患者的纤维血管膜 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从增生性糖尿病视网膜病变患者中提取的纤维血管膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-11-15 |
The Expression of MAFB Gene in Circulating Monocytes Is Related to Chronic Inflammatory Status in T2DM Patients
2024-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02012-7
PMID:38602607
|
研究论文 | 研究探讨了MAFB基因在T2DM患者循环单核细胞中的表达与慢性炎症状态的关系 | 首次发现MAFB基因在T2DM患者循环单核细胞中的表达与慢性炎症状态相关，并具有一定的预测价值 | 研究仅基于bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，未涉及其他类型的实验验证 | 探讨T2DM患者循环免疫细胞中的炎症标志物，预测胰岛素抵抗和T2DM的发生 | T2DM患者的循环单核细胞和外周血单核细胞 | NA | 糖尿病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | T2DM患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-11-15 |
Mcadet: A feature selection method for fine-resolution single-cell RNA-seq data based on multiple correspondence analysis and community detection
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012560
PMID:39466833
|
研究论文 | 提出了一种名为Mcadet的新特征选择方法，用于高分辨率单细胞RNA测序数据 | Mcadet结合了多重对应分析、基于图的社区检测和一种新的统计测试方法，显著提高了在高分辨率单细胞RNA测序数据和少数细胞类型数据中选择高变异基因的性能 | 高变异基因选择对不同下游分析的影响需要进一步研究 | 解决现有特征选择方法在高分辨率单细胞RNA测序数据中的局限性 | 高分辨率单细胞RNA测序数据和少数细胞类型数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-11-14 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 研究探讨了在空间转录组数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提高细胞类型聚类性能 | 首次研究了将高变异基因与空间变异基因结合对细胞类型聚类性能的影响 | 仅在50个真实空间转录组数据集上进行了测试，可能需要更多数据集验证 | 探讨在空间转录组数据中，结合高变异基因与空间变异基因对细胞类型聚类性能的影响 | 空间转录组数据中的高变异基因和空间变异基因 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 50个真实空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-11-14 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-Oct-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
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研究论文 | 研究使用单细胞测序技术分析急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探讨急性T淋巴母细胞白血病中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病过程中的作用 | 急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 来自公共数据库的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-11-13 |
The multifaceted role of mitochondria in cardiac function: insights and approaches
2024-Oct-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01899-x
PMID:39472951
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综述 | 本文综述了线粒体在心脏功能中的多方面作用及其在心血管疾病中的重要性 | 讨论了线粒体异质性和亚群在维持心脏功能和疾病相关重塑中的作用，并强调了线粒体与核的逆向通讯 | 未提供具体的研究数据或实验结果 | 探讨线粒体在心脏功能中的作用及其在心血管疾病中的潜在治疗策略 | 线粒体及其在心脏功能和疾病中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究 (GWAS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |