单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 615 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-11-02 |
A tumorigenicity evaluation platform for cell therapies based on brain organoids
2024-Oct-29, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-024-00446-5
PMID:39472972
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研究论文 | 本文介绍了一种基于脑类器官的细胞治疗致瘤性评估平台 | 提出了使用脑类器官和胶质母细胞瘤样类器官模型来评估细胞治疗产品的致瘤性风险，相较于传统动物模型具有更高的检测敏感性 | NA | 评估脑类器官在细胞治疗致瘤性评估中的应用潜力 | 人多能干细胞（hPSCs）和从中衍生的中脑多巴胺（mDA）细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自人胚胎干细胞的中脑多巴胺细胞、hPSCs、混合细胞以及未成熟的中脑多巴胺细胞，并将其注射到脑类器官和NOD SCID小鼠中进行评估 |
| 222 | 2024-11-02 |
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618486
PMID:39464096
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研究论文 | 研究分析了人类抗糖抗体的B细胞受体库，揭示了抗糖反应的驱动机制 | 首次结合BCR受体克隆与表达以及单细胞转录组学分析，探讨了抗N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)抗体的B细胞库及其免疫进化 | NA | 探讨人类抗糖抗体反应的驱动机制及其在早期儿童时期的亲和力成熟过程 | 抗N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)抗体的B细胞库 | 免疫学 | NA | BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 人类队列中的B细胞 |
| 223 | 2024-11-02 |
Characterization of Cancer Stem Cells in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma by Single-cell RNA Sequencing
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae056
PMID:39107908
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，全面表征喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞 | 首次在单细胞水平上全面表征喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞特性 | 研究样本仅限于三名患者，可能影响结果的普适性 | 识别喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞及其分子机制 | 喉鳞状细胞癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名喉鳞状细胞癌患者的匹配原发肿瘤组织、癌旁组织和局部淋巴结 |
| 224 | 2024-11-02 |
ADAMTS7 Promotes Smooth Muscle Foam Cell Expansion in Atherosclerosis
2024-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582156
PMID:38463994
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研究论文 | 研究探讨了ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞扩张的机制 | 首次揭示了ADAMTS7在平滑肌细胞和内皮细胞中表达，并通过增加PU.1和CD36表达促进氧化低密度脂蛋白摄取，从而促进泡沫细胞形成和动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨ADAMTS7在动脉粥样硬化中的细胞特异性机制 | ADAMTS7在平滑肌细胞和内皮细胞中的表达及其对动脉粥样硬化的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 225 | 2024-11-02 |
Unraveling the role of low-density lipoprotein-related genes in lung adenocarcinoma: Insights into tumor microenvironment and clinical prognosis
2024-Oct, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24230
PMID:38488684
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研究论文 | 研究探讨了低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的作用及其对肿瘤微环境和临床预后的影响 | 首次系统地研究了低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的作用，并开发了一种新的低密度脂蛋白相关签名用于预后评估 | 研究主要基于单细胞转录组数据，可能无法全面反映所有相关基因的表达情况 | 揭示低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的功能及其对肿瘤微环境和临床预后的影响 | 低密度脂蛋白相关基因在肺腺癌中的表达模式及其与肿瘤微环境和临床预后的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 226 | 2024-10-30 |
ncPlantDB: a plant ncRNA database with potential ncPEP information and cell type-specific interaction
2024-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1017
PMID:39470718
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研究论文 | 介绍了一个名为ncPlantDB的综合数据库，整合了43种植物的ncRNA和ncPEP数据，并提供了细胞类型特异性交互信息 | ncPlantDB是首个全面整合植物ncRNA和ncPEP数据的数据库，提供了细胞特异性交互网络和可视化工具 | NA | 填补现有植物ncRNA数据库在ncPEP信息和细胞类型特异性交互方面的不足 | 植物ncRNA及其编码的ncPEP | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序和Ribo-seq分析 | NA | ncRNA和ncPEP数据 | 43种植物，包含353140个ncRNA和3799个ncPEP |
| 227 | 2024-10-30 |
scLTdb: a comprehensive single-cell lineage tracing database
2024-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae913
PMID:39470724
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scLTdb的综合单细胞谱系追踪数据库 | 首次提供了一个全面的单细胞谱系追踪数据库，包含109个经过手动筛选和标准流程分析的数据集 | NA | 开发一个综合的单细胞谱系追踪数据库，以促进对细胞命运决定和谱系承诺的理解 | 单细胞谱系追踪数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | 109个数据集 |
| 228 | 2024-10-30 |
LnCeCell 2.0: an updated resource for lncRNA-associated ceRNA networks and web tools based on single-cell and spatial transcriptomics sequencing data
2024-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae947
PMID:39470723
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研究论文 | 本文介绍了LnCeCell 2.0，一个基于单细胞和空间转录组测序数据的lncRNA相关ceRNA网络和网络工具的更新资源 | LnCeCell 2.0数据库在数据量和功能上进行了显著扩展和改进，包括增加了257个单细胞RNA测序和stRNA-seq数据集，836,581个细胞特异性和空间点特异的ceRNA相互作用和功能网络，以及15,489个实验支持的lncRNA生物标志物 | NA | 开发和更新一个资源，用于研究基于单细胞和空间转录组测序数据的lncRNA相关ceRNA网络 | lncRNA相关ceRNA网络及其在疾病病理、诊断和治疗中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组测序(stRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 257个单细胞RNA测序和stRNA-seq数据集，涉及86种疾病/表型和80种人类正常组织，以及20,326名癌症患者的临床信息 |
| 229 | 2024-10-30 |
IRescue: uncertainty-aware quantification of transposable elements expression at single cell level
2024-Oct-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae793
PMID:39271103
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IRescue的软件，用于在单细胞水平上量化转座元件的表达 | IRescue软件结合了独特的UMI去重算法和期望最大化过程，有效纠正测序错误并重新分配多重映射读数的计数 | NA | 研究转座元件在不同组织中的细胞多样性及其在疾病进展中的潜在作用 | 转座元件在单细胞水平上的表达 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 包括来自人类结直肠癌、脑部、皮肤老化和SARS-CoV-2感染及恢复期间的PBMCs的单细胞和细胞核RNA-seq数据 |
| 230 | 2024-10-30 |
Non-glycanated ΔDCN isoform in muscle invasive bladder cancer mediates cancer stemness and gemcitabine resistance
2024-Oct-28, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00998-8
PMID:39466536
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研究论文 | 研究了非糖基化ΔDCN异构体在肌肉浸润性膀胱癌中的作用及其对癌症干细胞和吉西他滨耐药性的影响 | 首次揭示了非糖基化ΔDCN异构体在膀胱癌干细胞中的存在及其对癌症干细胞特性和吉西他滨化疗耐药性的影响 | 研究主要基于体外和体内实验，缺乏临床试验数据支持 | 探讨DCN在肌肉浸润性膀胱癌中的调控作用及其对膀胱癌干细胞的影响机制 | 膀胱癌干细胞和肌肉浸润性膀胱癌 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq、流式细胞术、CCK8和Sphere形成实验 | NA | 基因表达数据、临床病理特征和生存数据 | 来自TCGA和GEO的数据，包括临床组织样本和膀胱癌细胞系 |
| 231 | 2024-10-30 |
Caerin 1.1 and 1.9 peptides halt B16 melanoma metastatic tumours via expanding cDC1 and reprogramming tumour macrophages
2024-Oct-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05763-x
PMID:39468595
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研究论文 | 研究了caerin 1.1和1.9肽在B16黑色素瘤模型中通过扩增cDC1和重编程肿瘤相关巨噬细胞来抑制转移性肿瘤的潜力 | 结合免疫疗法，caerin 1.1和1.9肽能够有效调节原发和继发性肿瘤的微环境，减少肿瘤生长并增强系统性免疫 | NA | 探讨caerin 1.1和1.9肽在B16黑色素瘤模型中与免疫疗法结合的治疗潜力 | B16黑色素瘤模型中的肿瘤生长和转移 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 232 | 2024-10-30 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals the impact of nicotinamide and tryptophan metabolism on glioma prognosis and immunotherapy sensitivity
2024-Oct-28, BMC neurology
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12883-024-03924-5
PMID:39468708
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，探讨了烟酰胺和色氨酸代谢对胶质瘤预后和免疫治疗敏感性的影响 | 首次全面评估了烟酰胺和色氨酸代谢对胶质瘤预后和肿瘤免疫微环境的影响，并开发了相关模型用于预测胶质瘤的预后和免疫治疗敏感性 | 研究主要基于TCGA、CGGA和GSE159416的数据，体外实验验证范围有限 | 探讨烟酰胺和色氨酸代谢与胶质瘤预后及免疫状态的关系，并开发预测模型 | 胶质瘤患者的批量和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | LASSO回归 | 转录组数据 | TCGA、CGGA和GSE159416的数据 |
| 233 | 2024-10-30 |
Comprehensive analysis of clinical features, mRNA splicing, and immunological role of REEP5 in esophageal squamous cell carcinoma
2024-10-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77631-z
PMID:39463444
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研究论文 | 本文综合分析了REEEP5在食管鳞状细胞癌中的临床特征、mRNA剪接和免疫学作用 | 首次全面探讨了REEEP5在食管鳞状细胞癌中的生物学功能及其在肿瘤微环境中的作用，并验证了其在肿瘤和非肿瘤组织中的表达差异 | 研究样本量相对较小，且仅限于食管鳞状细胞癌，可能限制了结果的普适性 | 探讨REEEP5在食管鳞状细胞癌中的生物学功能及其在肿瘤微环境中的作用 | REEEP5在食管鳞状细胞癌中的表达及其与临床特征、mRNA剪接和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 272名食管鳞状细胞癌患者 |
| 234 | 2024-10-30 |
Multiple cell types including melanocytes contribute to elastogenesis in the developing murine aortic valve
2024-10-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-73673-5
PMID:39461968
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研究论文 | 研究探讨了小鼠主动脉瓣发育过程中弹性纤维的生成机制，发现多种细胞类型包括黑色素细胞参与其中 | 首次揭示了黑色素细胞在小鼠主动脉瓣弹性纤维生成中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需进一步验证在人类中的适用性 | 探讨主动脉瓣发育过程中弹性纤维的生成机制 | 小鼠主动脉瓣中的弹性纤维生成 | NA | NA | 空间转录组学和RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 235 | 2024-10-30 |
Profiling the transcriptomic age of single-cells in humans
2024-Oct-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07094-5
PMID:39462118
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研究论文 | 本文利用scRNA-seq数据开发单细胞转录组时钟，预测人类血液细胞的年龄 | 首次在人类中开发单细胞转录组时钟，填补了单细胞水平上人类细胞年龄预测的空白 | 研究仅限于血液细胞，且样本量相对较小 | 开发单细胞转录组时钟，预测人类细胞的年龄 | 人类血液细胞 | 基因组学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 1,058,909个血液细胞，来自508名健康捐赠者（年龄范围19至75岁） |
| 236 | 2024-10-30 |
Shrinkage estimation of gene interaction networks in single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-26, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05946-9
PMID:39462345
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研究论文 | 本文开发了一种用于单细胞RNA测序数据的稀疏逆协方差矩阵估计框架，以捕捉基因之间的直接功能相互作用 | 提出了基于负二项分布的零膨胀模型，增强了稀疏方法在零膨胀数据中的性能，同时不影响非零膨胀计数数据 | NA | 分析单细胞RNA测序数据中的基因相互作用网络 | 单细胞RNA测序数据中的基因相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏逆协方差矩阵估计 | 基因表达数据 | NA |
| 237 | 2024-10-30 |
The development of the occurrence and metastasis of breast cancer by single-cell sequencing
2024-Oct-26, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03531-x
PMID:39462368
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在乳腺癌发生和转移中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在发现乳腺癌分子亚群、疾病发展和多种机制中的应用 | 未提及具体的研究局限性 | 探讨单细胞测序技术在乳腺癌综合治疗中的新思路 | 乳腺癌的发生和转移机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因结构和表达水平数据 | 未提及具体样本数量 |
| 238 | 2024-10-30 |
Endothelial KLF11 is a novel protector against diabetic atherosclerosis
2024-Oct-26, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02473-y
PMID:39462409
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研究论文 | 研究探讨了内皮细胞中的KLF11因子在糖尿病性动脉粥样硬化中的保护作用 | 首次揭示了KLF11在糖尿病性动脉粥样硬化中的保护作用 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨KLF11在糖尿病性动脉粥样硬化中的作用及其潜在的治疗应用 | 内皮细胞中的KLF11因子及其在糖尿病性动脉粥样硬化中的作用 | 心血管疾病 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 内皮特异性KLF11转基因和敲除小鼠 |
| 239 | 2024-10-30 |
Identification of molecular subtypes based on bile acid metabolism in cholangiocarcinoma
2024-Oct-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-13081-0
PMID:39455933
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研究论文 | 本研究基于胆汁酸代谢特征对胆管癌进行分子亚型分类 | 建立了基于胆汁酸代谢的胆管癌新分类方法，并验证了其在预测肿瘤微环境和预后中的重要性 | NA | 研究胆汁酸代谢在胆管癌发展中的作用，并基于此识别特定亚型以优化患者个体化治疗和预后评估 | 胆管癌患者的胆汁酸代谢特征及分子亚型 | NA | 胆管癌 | 超高效液相色谱串联质谱法、单细胞RNA测序 | NA | 胆汁酸代谢数据、单细胞RNA测序数据 | 30种胆汁酸 |
| 240 | 2024-10-30 |
High expression of PLA2G2A in fibroblasts plays a crucial role in the early progression of carotid atherosclerosis
2024-Oct-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05679-6
PMID:39449149
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研究论文 | 研究PLA2G2A基因在动脉粥样硬化早期进展中的作用及其机制 | 发现PLA2G2A在血管成纤维细胞中高表达，并通过激活巨噬细胞补体和凝血级联途径促进斑块进展 | 研究主要基于小鼠模型和临床患者信息，未涉及人类大规模临床试验 | 探讨PLA2G2A在动脉粥样硬化早期进展中的作用及其机制 | PLA2G2A基因在动脉粥样硬化斑块中的表达特征及其对斑块进展的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两组颈动脉斑块的单细胞转录组数据及临床患者信息 |