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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-07 |
Enhancing Endogenous Hyaluronic Acid in Osteoarthritic Joints with an Anti-Inflammatory Supramolecular Nanofiber Hydrogel Delivering HAS2 Lentivirus
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400542
PMID:38593309
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研究论文 | 开发了一种超分子纳米纤维水凝胶用于递送HAS2慢病毒,以增强骨关节炎关节内源性透明质酸产生 | 首次使用地塞米松磷酸钠作为载体构建超分子纳米纤维水凝胶递送HAS2慢病毒,实现内源性HA增强和滑膜炎症抑制的双重功能 | 研究仅在前交叉韧带横断诱导的OA小鼠模型中进行,尚未在更大型动物或临床环境中验证 | 开发新型骨关节炎治疗策略,通过增强内源性透明质酸产生和抑制炎症来延缓疾病进展 | 骨关节炎小鼠模型和滑膜组织细胞 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,慢病毒递送技术 | NA | 基因表达数据,组织学数据 | 前交叉韧带横断诱导的OA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-07 |
Employing single-cell RNA sequencing coupled with an array of bioinformatics approaches to ascertain the shared genetic characteristics between osteoporosis and obesity
2024-Oct-16, Bone & joint research
IF:4.7Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和生物信息学方法研究骨质疏松与肥胖的共享遗传特征 | 首次结合单细胞RNA测序与多种生物信息学方法系统揭示TLR2在骨质疏松和肥胖中的关键桥梁作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 识别骨质疏松和肥胖的共享遗传标记和分子机制,为同时治疗两种疾病提供靶点 | 骨质疏松和肥胖相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 骨质疏松, 肥胖 | 单细胞RNA测序, WGCNA, KEGG通路富集, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 机器学习, ELISA, 蛋白印迹, 细胞染色 | 机器学习 | 基因表达数据 | GEO数据库中的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in health and disease
2024-Oct, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-024-00841-1
PMID:38719971
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综述 | 本文综述了空间转录组技术在健康和疾病研究中的方法、应用及挑战 | 整合空间转录组与其他组学方法,推动全面分子图谱的构建 | 未具体说明技术应用的局限性 | 探讨空间转录组技术在生物医学研究中的应用前景 | 临床前模型和人类样本 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞测序, 蛋白质组学, 空间表观遗传学 | NA | NA |
| 224 | 2025-10-07 |
Recessive variants in MYO1C as a potential novel cause of proteinuric kidney disease
2024-Oct, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-024-06426-1
PMID:38904753
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研究论文 | 本研究通过外显子测序发现MYO1C基因隐性变异是儿童肾病综合征的潜在新病因 | 首次发现MYO1C基因隐性变异与肾病综合征的关联,并通过结构建模揭示了变异对蛋白质功能的破坏机制 | 仅在两名无关儿童中观察到该变异,样本量较小,需要进一步验证 | 探索肾病综合征的新单基因病因 | 1649名全球儿科肾病综合征患者队列 | 遗传学 | 肾病综合征 | 外显子测序, 纯合子定位, 单细胞RNA测序, 结构建模 | PyMol结构建模 | 基因组数据, 转录组数据, 结构数据 | 1649名儿科患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 外显子测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-07 |
Defining heritability, plasticity, and transition dynamics of cellular phenotypes in somatic evolution
2024-Oct, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01920-6
PMID:39317739
|
研究论文 | 提出PATH框架用于量化细胞状态的可遗传性与可塑性,并推断细胞状态转换和增殖动态 | 开发了PATH框架,首次能够从单细胞谱系追踪数据中量化细胞状态的可遗传性与可塑性,取代了传统的定性概念 | 方法依赖于单细胞谱系追踪数据的可用性,在不同组织类型中的普适性需要进一步验证 | 研究体细胞进化中细胞表型的可遗传性、可塑性和转换动态 | 胰腺癌小鼠模型、原发性胶质母细胞瘤、B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞生物学 | 胰腺癌, 胶质母细胞瘤, 白血病 | 单细胞谱系追踪, 单细胞全基因组测序 | 系统发育分析框架 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞谱系追踪, 单细胞全基因组测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptomics reveals dysregulated immnue homeostasis in different stages in HPV-induced cutaneous squamous cell carcinoma
2024-Oct, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15178
PMID:39385326
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示HPV诱导的皮肤鳞状细胞癌不同阶段免疫稳态失调的动态变化 | 首次在HPV诱导的cSCC中应用单细胞RNA测序技术,首次从不同感染阶段研究肿瘤发展过程 | 仅基于单一罕见病例研究,样本量有限 | 探索免疫稳态失调对HPV诱导的皮肤鳞状细胞癌发生发展的影响 | HPV诱导的皮肤鳞状细胞癌患者皮肤组织 | 单细胞转录组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光实验 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 1例罕见HPV诱导cSCC患者的4种不同皮肤状态组织,共11379个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2025-10-07 |
B-cell depletion limits HTLV-1-infected T-cell expansion and ameliorate HTLV-1-associated myelopathy
2024-Oct, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52190
PMID:39186315
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和临床试验证明B细胞耗竭可限制HTLV-1感染T细胞的扩增并改善HTLV-1相关脊髓病 | 首次提出通过靶向B细胞治疗HAM的创新策略,揭示了HTLV-1感染B细胞并促进T细胞增殖的新机制 | 样本量有限(14例临床试验患者),需要更大规模研究验证疗效 | 探索HAM的发病机制并评估利妥昔单抗治疗HAM患者的疗效 | HTLV-1相关脊髓病患者的外周血单个核细胞和临床病例 | 单细胞测序分析 | HTLV-1相关脊髓病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 14例HAM患者参与临床试验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2025-10-07 |
Single-Cell Proteomic and Transcriptomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619905
PMID:39553982
|
研究论文 | 通过单细胞蛋白质组学和转录组学技术表征耐药前列腺癌细胞的分子特征及其与形态变化的关联 | 开发了优化的高通量DIA方法实现单细胞水平蛋白质定量,并首次整合单细胞蛋白质组和转录组数据揭示耐药细胞的分子异质性 | 研究主要基于PC3细胞系,未在更多细胞系或临床样本中验证 | 揭示前列腺癌耐药细胞的蛋白质组学特征和分子机制 | 前列腺癌PC3细胞系及其衍生的耐药细胞 | 单细胞多组学 | 前列腺癌 | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 数据非依赖性采集 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 优化高通量DIA方法(通量60样本/天) |
| 229 | 2025-10-07 |
The SWI/SNF chromatin remodelling complex regulates pancreatic endocrine cell expansion and differentiation in mice in vivo
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06211-7
PMID:38958700
|
研究论文 | 本研究探讨SWI/SNF染色质重塑复合物在小鼠胰腺内分泌细胞发育和分化中的调控作用 | 首次在体内模型中系统研究BRG1和BRM ATPase亚基对内分泌细胞发育的协同调控机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明SWI/SNF染色质重塑复合物在内分泌细胞发育中的分子机制 | 小鼠胰腺内分泌祖细胞和分化细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 定量PCR, 组织学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 代谢表型数据, 组织学图像 | 胚胎期15.5天和出生后不同发育阶段的小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2025-10-07 |
Association between biological ageing and periodontitis: Evidence from a cross-sectional survey and multi-omics Mendelian randomization analysis
2024-10, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14040
PMID:38956929
|
研究论文 | 通过横断面调查和多组学孟德尔随机化分析探讨生物衰老与牙周炎之间的关联及潜在因果关系 | 首次结合横断面调查、孟德尔随机化分析和多组学整合方法系统研究生物衰老与牙周炎的因果关系及分子机制 | 基于观察性数据和遗传数据,无法完全排除残余混杂因素的影响 | 探究生物衰老与牙周炎之间的关系及潜在因果机制 | 3189名NHANES参与者和GWAS汇总统计数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序, GWAS, 孟德尔随机化分析, 多组学整合分析 | 多元回归分析, 两步MR中介分析 | 基因组数据, 调查数据, 单细胞测序数据 | 3189名NHANES参与者 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-07 |
SDePER: a hybrid machine learning and regression method for cell-type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2024-Oct-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03416-2
PMID:39402626
|
研究论文 | 开发了一种结合机器学习和回归的混合方法SDePER,用于空间条形码转录组数据的细胞类型解卷积 | 提出混合机器学习和回归方法,解决ST与scRNA-seq数据间的平台效应,同时处理稀疏性和空间相关性 | NA | 开发空间转录组数据细胞类型解卷积方法 | 空间条形码转录组数据和参考单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 混合机器学习与回归模型 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 模拟数据和四个真实数据集 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-07 |
Comprehensive multi-omics integration uncovers mitochondrial gene signatures for prognosis and personalized therapy in lung adenocarcinoma
2024-Oct-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05754-y
PMID:39434164
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研究论文 | 通过整合多组学数据开发基于线粒体相关基因的预后模型,用于肺腺癌的预后评估和个性化治疗 | 首次将单细胞RNA测序与转录组数据结合,聚焦线粒体相关基因,开发AI驱动的预后特征模型 | 基于公开数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 阐明线粒体相关基因在肺腺癌中的预后价值并开发个性化治疗策略 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | 集成机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | TCGA-LUAD数据集及多个独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-07 |
Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer
2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06010-y
PMID:39460820
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研究论文 | 通过遗传推断和单细胞表达分析探索心力衰竭与乳腺癌的潜在遗传靶点 | 整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,首次系统揭示ITM2B基因在乳腺癌中的功能作用 | 研究样本量未明确说明,体外实验仅针对MCF7细胞系,缺乏体内验证 | 探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点并验证其因果关系 | 心力衰竭和乳腺癌相关的遗传变异及ITM2B基因 | 生物信息学 | 乳腺癌,心血管疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2025-02-21 |
Microfluidic Chip-Based Automatic System for Sequencing Patient-Derived Organoids at the Single-Cell Level
2024-10-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05111
PMID:39399894
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于微流控芯片的自动系统MASSO,用于在单细胞水平上对患者来源的类器官进行测序 | MASSO系统通过在单一微流控芯片上执行所有必要步骤,避免了珍贵PDO的损失,并确保了单PDO细胞的全基因组扩增的高质量,自动化操作过程消除了人为错误,提高了数据重复性 | NA | 解决现有单细胞测序技术在处理临床组织样本来源的PDO时效率低下的问题 | 患者来源的类器官(PDOs) | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2025-02-21 |
DEPICT-seq: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Rare Cell Subsets Isolated via Nucleic Acid Cytometry
2024-10-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03075
PMID:39287475
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DEPICT-seq的高通量液滴核酸细胞计数方法,用于分离和分析基于核酸标记的稀有细胞亚群 | DEPICT-seq方法结合了批量细胞固定、双乳液数字PCR细胞分选和单细胞分辨率下的全长转录组分析,能够针对感兴趣的核酸标记进行细胞分选和转录组分析 | NA | 开发一种能够深入分析稀有细胞亚群的方法,以理解组织生理学和病理学 | 稀有细胞亚群,特别是T细胞受体(TCR)工程化的T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 双乳液数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2025-10-07 |
CBX1 is involved in hepatocellular carcinoma progression and resistance to sorafenib and lenvatinib via IGF-1R/AKT/SNAIL signaling pathway
2024-Oct, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-024-10696-0
PMID:38769286
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研究论文 | 本研究探讨CBX1在肝细胞癌进展及对索拉非尼和乐伐替尼耐药性中的作用机制 | 首次揭示CBX1通过IGF-1R/AKT/SNAIL信号通路促进肝细胞癌进展和酪氨酸激酶抑制剂耐药性的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,需要进一步临床验证 | 探究CBX1在泛癌及肝细胞癌中的表达特征、功能作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织、癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western Blotting、免疫组化、组织芯片、CCK-8、集落形成、Transwell侵袭、划痕实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 肝细胞癌组织及癌旁组织、多种癌细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-07 |
Association between premature vascular smooth muscle cells senescence and vascular inflammation in Takayasu's arteritis
2024-Oct-21, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225630
PMID:38816066
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研究论文 | 本研究探讨高安氏动脉炎中血管平滑肌细胞早衰与血管炎症之间的关联 | 首次揭示IL-6-线粒体STAT3-MFN2信号通路驱动血管平滑肌细胞衰老的分子机制 | 样本来源于手术患者,可能存在选择偏倚;体外实验结果需在更大样本中验证 | 探究高安氏动脉炎中血管平滑肌细胞衰老是否参与血管炎症过程 | 高安氏动脉炎患者的血管手术样本和原代血管平滑肌细胞 | 分子病理学 | 高安氏动脉炎 | 组织学检测、bulk RNA-Seq、单细胞RNA-seq、体外实验、离体实验 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 高安氏动脉炎患者血管手术样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveal potent extrafollicular B cell response linked with granzyme K+ CD8 T cell activation in lupus kidney
2024-Oct-17, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2024-225876
PMID:39419536
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了狼疮性肾炎肾脏中滤泡外B细胞反应与GZMK+ CD8 T细胞活化的关联机制 | 首次在单细胞水平系统描绘狼疮性肾炎肾脏适应性免疫景观,发现肾脏特异性IGHG4-59克隆扩增和GZMK+ CD8 T细胞与ABCs通过II型干扰素通路的相互作用 | 样本量有限,主要基于相关性分析,功能验证需要进一步深入 | 探索活动性狼疮性肾炎患者肾脏特异性适应性免疫景观 | 狼疮性肾炎患者的肾脏和配对外周血B、T细胞,以及匹配对照的外周血细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA/BCR/TCR测序,流式细胞术,ATAC-seq,多重免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据,BCR/TCR序列数据,表观遗传数据,蛋白质表达数据 | 活动性狼疮性肾炎患者肾脏和外周血样本,匹配对照外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞BCR/TCR测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 239 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic revealed intratumor heterogeneity and cancer stem cell enrichment in colorectal cancer metastasis
2024-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217181
PMID:39159882
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示结直肠癌原发灶和肝转移灶的瘤内异质性及癌症干细胞富集机制 | 首次利用空间转录组技术系统揭示结直肠癌转移过程中的瘤内异质性特征,发现FOXD1作为新型转移性癌症干细胞标志物 | 仅分析两对原发灶与匹配转移灶样本,样本量有限 | 探索结直肠癌转移的细胞机制和癌症干细胞作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤组织及匹配的肝转移组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 轨迹分析、伪时间分析、CellphoneDB互作分析 | 空间RNA转录组数据 | 2例原发结直肠癌组织及其匹配的肝转移组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 240 | 2025-10-07 |
Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02380-w
PMID:39187683
|
研究论文 | 提出FlowSig方法,从单细胞和空间转录组数据推断细胞间通讯驱动的信息流 | 首次结合图形因果建模和条件独立性分析,揭示细胞间通讯与细胞内基因模块之间的耦合关系 | 方法依赖于因果推断假设,需要实验验证其生物学意义 | 开发从单细胞和空间转录组数据推断细胞间信息流的方法 | 皮质类器官、胰腺胰岛、COVID-19患者样本、小鼠胚胎 | 生物信息学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图形因果模型 | 基因表达数据 | 多种实验数据集和合成数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |