单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 595 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-11-27 |
Regulation of Diseases-Associated Microglia in the Optic Nerve by Lipoxin B4 and Ocular Hypertension
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585452
PMID:38562864
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研究论文 | 研究了脂氧素B4和眼压升高对视神经中疾病相关小胶质细胞的调控作用 | 首次揭示了脂氧素B4在视网膜和视神经中对小胶质细胞的调控作用，并发现其在眼压升高诱导的神经退行性变中的神经保护机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探讨脂氧素B4在眼压升高诱导的视神经退行性变中的作用及其对小胶质细胞的调控机制 | 视网膜和视神经中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、qPCR、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 小鼠眼内注射硅油诱导持续稳定的眼压升高 |
| 202 | 2024-11-26 |
Mapping intratumoral myeloid-T cell interactomes at single-cell resolution reveals targets for overcoming checkpoint inhibitor resistance
2024-Oct-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620093
PMID:39554094
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）衍生的单细胞分辨率细胞间相互作用图谱，并应用于研究CD40激动剂（CD40ag）如何改变免疫细胞间的对话，特别是在肿瘤模型中与免疫检查点阻断（ICB）联合使用时 | 本文创新性地开发了一种计算方法，能够有效分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，并揭示了CD40ag在改善ICB反应中的作用 | 本文未详细讨论该计算方法在其他类型肿瘤或不同数据集上的适用性和泛化能力 | 研究如何通过分析单细胞RNA测序数据中的细胞间相互作用，揭示CD40ag在克服免疫检查点抑制剂耐药性中的作用 | 研究对象包括肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞，以及它们在CD40ag和ICB治疗下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 203 | 2024-11-26 |
Cell2Sentence: Teaching Large Language Models the Language of Biology
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557287
PMID:39554079
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研究论文 | 介绍了一种名为Cell2Sentence的新方法，将大型语言模型直接适应于生物学背景，特别是单细胞转录组学 | 通过将基因表达数据转化为“细胞句子”，Cell2Sentence方法填补了自然语言处理与生物学之间的空白 | NA | 探索如何将大型语言模型应用于生物学领域，特别是单细胞转录组学 | 单细胞转录组学数据和大型语言模型 | 自然语言处理 | NA | NA | GPT-2 | 基因表达数据 | NA |
| 204 | 2024-11-23 |
Transcriptomic mapping of the 5-HT receptor landscape
2024-Oct-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.101048
PMID:39569210
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和多重荧光原位杂交技术，对成年小鼠大脑中的5-HT受体进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞水平上揭示了5-HT受体的多样性分布和共转录现象 | NA | 研究5-HT受体在小鼠大脑中的转录模式和空间分布 | 5-HT受体及其在小鼠大脑中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 转录组数据 | 约400万细胞（scRNA-seq）和约1000万细胞（MERFISH） |
| 205 | 2024-11-22 |
Generation, expansion, gene delivery, and single-cell profiling in rhesus macaque plasma B cells
2024-Oct-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100878
PMID:39406231
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研究论文 | 本文开发了在食蟹猴血浆B细胞中进行细胞生成、扩增、基因递送和单细胞分析的方法 | 首次在非人灵长类（食蟹猴）B细胞中实现了高效的细胞扩增、分化和基因递送，并发现了与人类细胞不同的免疫检查点分子和主要组织相容性复合物分子的上调 | NA | 开发用于治疗目的的工程化B细胞在免疫健全的大型动物模型中的评估方法 | 食蟹猴血浆B细胞 | NA | NA | 单细胞测序、流式细胞术、腺相关病毒（AAV）递送 | NA | 转录组数据 | NA |
| 206 | 2024-11-22 |
Characterization of the single cell landscape in normal and osteoarthritic equine joints
2024-Oct-20, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-24-40
PMID:39507442
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了正常和骨关节炎马关节滑液中的细胞组成，揭示了骨关节炎免疫病理发生中的关键细胞类型和相互作用 | 首次在马关节滑液和滑膜中进行了单细胞RNA测序，识别了多种免疫细胞亚群及其在骨关节炎中的变化，为未来研究提供了马特异性细胞类型基因签名 | 样本量较小，仅包括三只正常马和三只骨关节炎马的关节滑液，以及一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 | 通过分析骨关节炎关节中的转录组反应，加深对骨关节炎免疫病理发生的理解，促进靶向疗法的开发 | 正常和骨关节炎马的关节滑液和滑膜中的免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,639个细胞来自正常和骨关节炎马的关节滑液，17,690个细胞来自一只正常马和一只骨关节炎马的滑膜 |
| 207 | 2024-11-22 |
Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.19.590370
PMID:38895328
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研究论文 | 研究了单细胞水平上核糖体含量与生长规律的关系 | 首次在单细胞水平上研究了核糖体含量与生长规律的关系，发现单细胞核糖体水平并不精确匹配群体生长速率或营养可用性 | 研究仅限于两种微生物，结果可能不适用于所有物种 | 探讨单细胞核糖体含量与生长规律的关系 | 单细胞酵母和细菌的核糖体含量 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 高斯过程模型 | 转录组数据 | 数千个单细胞样本，来自多种条件、重复和物种 |
| 208 | 2024-11-21 |
Sex-Based Differences in Thyroid Plasma B Cell Infiltration: Implications for Autoimmune Disease Susceptibility
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae148
PMID:39487734
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研究论文 | 研究探讨了甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 首次研究了女性甲状腺中浆细胞的浸润情况，并揭示了CXCL13-CXCR5信号轴在浆细胞招募和组织中的关键作用 | 研究仅限于女性甲状腺，未涉及男性甲状腺的对比分析 | 探讨甲状腺中浆细胞浸润的性别差异及其对自身免疫疾病易感性的影响 | 女性甲状腺中的浆细胞浸润情况 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 209 | 2024-11-21 |
New insight into the development of synpolydactyly caused by expansion of HOXD13 polyalanine based on weighted gene co-expression network analysis
2024-10-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01974-9
PMID:39472920
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）探讨了HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形（SPD）的分子机制 | 首次通过WGCNA分析揭示了HOXD13多聚丙氨酸扩展对免疫反应、破骨细胞分化和DNA复制的调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探讨HOXD13多聚丙氨酸扩展引起的并指多指畸形的分子机制 | HOXD13多聚丙氨酸扩展小鼠模型的肢芽细胞 | NA | 先天性畸形 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 单细胞RNA测序数据 | HOXD13+7A杂合子并指多指畸形小鼠模型的肢芽细胞 |
| 210 | 2024-11-21 |
Synergic activity of FGFR2 and MEK inhibitors in the treatment of FGFR2-amplified cancers of unknown primary
2024-Oct-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.07.011
PMID:39033323
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研究论文 | 研究探讨了FGFR2和MEK抑制剂在治疗FGFR2扩增的未知原发癌中的协同作用 | 首次在未知原发癌模型中验证了FGFR2和MEK抑制剂的协同治疗效果 | 研究仅限于两个CUP细胞系和相应的患者来源的异种移植模型 | 探索FGFR2和MEK抑制剂在治疗FGFR2扩增的未知原发癌中的潜在疗效 | 未知原发癌的细胞系和患者来源的异种移植模型 | 癌症研究 | 未知原发癌 | 荧光原位杂交分析 | NA | 基因表达数据 | 两个CUP细胞系和相应的患者来源的异种移植模型 |
| 211 | 2024-11-21 |
Stiff Hydrogel Encapsulation Retains Mesenchymal Stem Cell Stemness for Regenerative Medicine
2024-Oct-02, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.05.041
PMID:39553898
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研究论文 | 研究通过微流控技术制备薄壳海藻酸盐水凝胶微胶囊，探讨其对间充质干细胞（MSC）增殖和干性的影响 | 首次通过调整海藻酸分子量控制水凝胶壳的机械性能，发现较硬的水凝胶壳能促进MSC的增殖和干性维持 | 未详细探讨不同机械性能水凝胶对MSC亚群的具体影响机制 | 探讨水凝胶封装对MSC在再生医学中应用的潜力 | 间充质干细胞（MSC）和水凝胶封装技术 | 再生医学 | NA | 微流控技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 212 | 2024-11-21 |
Non-genetic differences underlie variability in proliferation among esophageal epithelial clones
2024-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012360
PMID:39466790
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研究论文 | 研究了食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性，发现非遗传因素在不同克隆的增殖能力中起重要作用 | 通过成像和细胞条形码技术追踪克隆，结合单细胞RNA测序，揭示了与高增殖克隆相关的细胞状态和基因通路 | 研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响 | 探讨食管上皮细胞克隆在体外培养中的增殖变异性和相关细胞状态 | 食管上皮细胞（EPC2-hTERT）的克隆增殖行为 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学模型 | 图像数据和基因表达数据 | 涉及约10%的指数增长克隆和其余的非增殖克隆 |
| 213 | 2024-11-20 |
Identifying a CD8T cell signature in the tumor microenvironment to forecast gastric cancer outcomes from sequencing data
2024-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-603
PMID:39554559
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研究论文 | 研究通过分析肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因，预测胃癌患者的预后 | 首次利用CD8T细胞相关基因构建胃癌预后预测模型 | 研究仅基于TCGA数据库的数据，样本量有限 | 探索肿瘤微环境中CD8T细胞相关基因在胃癌预后预测中的作用 | 胃癌患者的肿瘤微环境及CD8T细胞相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞mRNA测序 | Cox回归模型 | 基因数据 | TCGA数据库中的胃癌患者数据 |
| 214 | 2024-11-20 |
Landscape of immune cells in systematic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection: assessed by single-cell sequencing
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/kead673
PMID:38078808
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研究论文 | 研究分析了系统性红斑狼疮患者在有无EB病毒感染情况下的免疫细胞和B细胞受体（BCR）谱，并通过单细胞RNA测序识别两者之间的差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱，揭示了CD8+增殖T细胞比例和IFN-α/β通路在感染组中的变化 | 样本量较小，仅包括两名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 分析系统性红斑狼疮患者在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱，以更好地理解免疫反应机制 | 系统性红斑狼疮患者及其在EB病毒感染前后的免疫细胞和BCR谱 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共8名参与者，包括2名SLE-EBV+患者，4名SLE-EBV-患者和2名健康对照，共获得83,478个细胞 |
| 215 | 2024-11-20 |
Biallelic RXFP2 variants lead to congenital bilateral cryptorchidism and male infertility, supporting a role of RXFP2 in spermatogenesis
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deae195
PMID:39222519
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研究论文 | 研究探讨了RXFP2基因的双等位变异如何导致先天性双侧隐睾和男性不育，并支持RXFP2在精子发生中的作用 | 首次在人类病例中证实RXFP2在精子发生成熟中的作用，并发现双等位变异导致男性不育 | 目前仅基于一个家庭的研究，需要更多病例验证 | 探讨RXFP2基因变异对男性生育能力的影响 | RXFP2基因及其在精子发生中的作用 | NA | 男性不育 | 长读长测序、单细胞RNA测序、环AMP报告基因检测 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 一个家庭中的两名男性成员 |
| 216 | 2024-11-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptomic landscape and potential targets for human testicular ageing
2024-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deae199
PMID:39241251
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类睾丸衰老的转录组图谱和潜在靶点 | 首次提供了年轻和老年人类睾丸的全面单细胞转录组图谱，并揭示了与睾丸衰老相关的分子机制和潜在治疗靶点 | 由于收集人类睾丸组织的困难，样本量有限，未来需要进一步的功能和机制研究 | 探讨人类睾丸衰老的分子基础和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人类睾丸组织中的单细胞转录组 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6个年轻个体和6个老年个体的睾丸组织样本，以及10个年轻捐赠者和10个老年捐赠者的更大样本集 |
| 217 | 2024-11-20 |
The Inflammatory Characteristics of Symptomatic Glioma Associated With Poor Prognosis and Chemoresistance via Tumor Necrosis Factor Signaling Pathway
2024-Oct, Brain tumor research and treatment
DOI:10.14791/btrt.2024.0035
PMID:39542520
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研究论文 | 研究分析了有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异，发现有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 首次揭示了有症状胶质瘤通过肿瘤坏死因子信号通路增强炎症反应，导致预后不良和化疗耐药 | 研究为回顾性分析，样本量有限，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探讨有症状和无症状胶质瘤的分子和免疫微环境差异及其对预后和化疗耐药的影响 | 有症状和无症状胶质瘤样本 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 (RNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | TCGA和CGGA数据集中的胶质瘤样本 |
| 218 | 2024-11-19 |
VAPOR: Variational autoencoder with transport operators decouples co-occurring biological processes in development
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.27.620534
PMID:39554007
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAPOR的方法，通过变分自编码器与传输算子来解耦发育过程中同时发生的生物学过程 | VAPOR方法能够将基因表达动态分解为多个子空间，每个子空间的动态由常微分方程模型控制，从而揭示不同生物学过程的多方面时间尺度 | NA | 开发一种新的计算方法来解耦发育过程中同时发生的生物学过程的基因表达动态 | 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | 发育过程中的人类大脑单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 |
| 219 | 2024-11-19 |
Integrative analyses of bulk and single-cell RNA-seq reveals the correlation between SPP1+ macrophages and resistance to neoadjuvant chemoimmunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Oct-05, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03848-6
PMID:39367943
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，揭示了SPP1+巨噬细胞与食管鳞状细胞癌患者对新辅助化疗免疫治疗抵抗之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性，并发现了SPP1+巨噬细胞在治疗抵抗中的关键作用 | 研究样本量较小，且仅基于公开数据集，未来需要更大规模的临床验证 | 探讨新辅助化疗免疫治疗在食管鳞状细胞癌中的疗效差异及其潜在机制 | 食管鳞状细胞癌患者在接受新辅助化疗免疫治疗后的细胞异质性及巨噬细胞的作用 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 32例接受手术的食管鳞状细胞癌患者 |
| 220 | 2024-11-19 |
NitraTh epitope-based neoantigen vaccines for effective tumor immunotherapy
2024-Oct-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03830-2
PMID:39358493
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研究论文 | 介绍了一种基于NitraTh表位的肿瘤新抗原疫苗设计方法，该方法不依赖于计算预测CD4 T细胞表位，并在肝癌小鼠模型中显著抑制了肿瘤进展 | 提出了一种新的NitraTh表位，不依赖于计算预测CD4 T细胞表位，成功设计出能引发强烈新抗原特异性免疫反应的肿瘤新抗原疫苗 | NA | 开发一种有效的新抗原疫苗设计方法，用于肿瘤免疫治疗 | 肿瘤新抗原疫苗及其在肝癌小鼠模型中的效果 | 肿瘤免疫治疗 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | NA | H22细胞异种移植和患者来源的异种移植（PDX）肝癌小鼠模型 |