单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 668 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-10-29 |
Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections
2024-Oct-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406684
PMID:39465672
|
研究论文 | 研究牙髓中的三级淋巴结构（TLS）在对抗细菌感染中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了健康和炎症牙髓中TLS的标志物，并发现炎症牙髓中免疫细胞类型和比例增加 | 研究主要集中在人类和小鼠模型上，可能不适用于其他物种 | 探讨牙髓中三级淋巴结构在免疫反应和细菌感染中的作用 | 健康和炎症状态下的牙髓 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康和炎症状态下的人类牙髓样本，以及小鼠牙髓炎模型 |
| 202 | 2024-10-29 |
The Contribution of the Novel CLTC-VMP1 Fusion Gene to Autophagy Regulation and Energy Metabolism in Cisplatin-Resistant Osteosarcoma
2024-Oct-28, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00302.2024
PMID:39466176
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研究论文 | 研究CLTC-VMP1融合基因在顺铂耐药骨肉瘤中的自噬调控和能量代谢作用 | 首次揭示了CLTC-VMP1融合基因在顺铂耐药骨肉瘤中的作用，并阐明了其通过调节自噬和凋亡平衡来重编程能量代谢的机制 | NA | 探讨CLTC-VMP1基因融合在骨肉瘤化疗耐药机制中的作用及其分子机制 | 骨肉瘤细胞及其对顺铂的耐药性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用了顺铂耐药的人骨肉瘤细胞系 |
| 203 | 2024-10-29 |
Blocking the HIF-1α/glycolysis axis inhibits allergic airway inflammation by reducing ILC2 metabolism and function
2024-Oct-27, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16361
PMID:39462230
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研究论文 | 研究HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 | 首次揭示了HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体中验证 | 探讨HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用 | 小鼠和人类的ILC2细胞 | NA | 哮喘 | 糖酵解抑制剂和HIF-1α抑制剂 | NA | 转录组数据、代谢数据和染色质免疫沉淀分析 | 小鼠和人类样本 |
| 204 | 2024-10-29 |
Aging alters the effect of adiponectin receptor signaling on bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2024-Oct-27, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14390
PMID:39462849
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研究论文 | 研究衰老对脂肪细胞因子受体信号在骨髓来源间充质干细胞中作用的影响 | 首次观察到衰老小鼠骨髓中脂肪细胞因子受体表达的差异，并揭示了这些差异对骨再生和修复的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨衰老如何改变脂肪细胞因子受体信号对骨髓来源间充质干细胞的影响 | 衰老小鼠和年轻小鼠的骨髓来源间充质干细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 衰老小鼠和年轻小鼠 |
| 205 | 2024-10-29 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2024-Oct-27, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
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研究论文 | 本文探讨了在缺血性中风和慢性脑小血管疾病中，胶质细胞（包括小胶质细胞）在神经免疫反应中的关键作用 | 通过转录组分析和单细胞RNA测序，识别了缺血暴露下小胶质细胞的不同基因表达特征，并发现了新的细胞亚型和功能假设 | NA | 研究胶质细胞在缺血性中风和慢性脑小血管疾病中的作用 | 小胶质细胞和星形胶质细胞在缺血性中风和慢性脑小血管疾病中的反应 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 206 | 2024-10-29 |
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomic data reveals novel insights into lipid metabolism and prognostic factors in hepatocellular carcinoma
2024-Oct-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01487-y
PMID:39453509
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研究论文 | 本研究整合了大量和单细胞转录组数据，揭示了肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 | 首次整合大量和单细胞转录组数据，识别出与脂质代谢相关的基因，并开发了机器学习模型用于预测肝细胞癌的预后 | 研究依赖于公共数据库中的数据，可能存在数据质量和代表性的限制 | 探讨肝细胞癌中脂质代谢相关基因的状态及其作为预后因子的潜力 | 肝细胞癌患者的脂质代谢相关基因及预后因子 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 大量和单细胞转录组数据来自公共数据库 |
| 207 | 2024-10-29 |
Microglia regulate GABAergic neurogenesis in prenatal human brain through IGF1
2024-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.19.619180
PMID:39464051
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研究论文 | 研究揭示了微胶质细胞通过IGF1调节人类胎儿大脑中GABA能神经元的生成 | 首次揭示了微胶质细胞通过IGF1促进神经前体细胞增殖和GABA能神经元发育的新机制 | NA | 探讨人类胎儿大脑中GABA能神经元生成的发育机制 | 人类胎儿大脑中的GABA能神经元和微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、生物信息学和组织学分析 | NA | 转录组数据 | 使用新开发的神经免疫hMGE类器官模型进行实验 |
| 208 | 2024-10-29 |
The First Comprehensive Description of the Platelet Single Cell Transcriptome
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.15.618506
PMID:39464035
|
研究论文 | 首次全面描述了血小板单细胞转录组 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析血小板转录组，揭示了血小板基因表达的异质性 | 现有的细胞识别算法可能导致血小板被错误分类为其他血细胞类型 | 扩展对血小板功能的理解，超越其在凝血中的传统角色 | 血小板单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名健康供体的血小板样本 |
| 209 | 2024-10-29 |
In vivo CRISPRi screen identified lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.16.618774
PMID:39464078
|
研究论文 | 通过体内CRISPRi筛选，识别出对皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长至关重要的lncRNA组合 | 首次通过单细胞测序数据和CRISPR干扰筛选，识别出在皮肤鳞状细胞癌中起关键作用的lncRNA组合 | 研究主要集中在体外和异种移植模型中，未来需要进一步验证这些lncRNA在人体内的作用 | 揭示皮肤鳞状细胞癌发展中的非编码RNA的作用 | 皮肤鳞状细胞癌中的lncRNA | 数字病理学 | 皮肤癌 | CRISPR干扰筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 来自正常和皮肤鳞状细胞癌的人类皮肤组织样本 |
| 210 | 2024-10-29 |
The mTOR Pathway: A Common Link Between Alzheimer's Disease and Down Syndrome
2024-Oct-17, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm13206183
PMID:39458132
|
研究论文 | 本文探讨了mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症之间的共同联系 | 本文首次利用基因组学、空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学等新技术，分析mTOR通路与唐氏综合症相关阿尔茨海默病的关系 | 本文尚未完全揭示唐氏综合症相关阿尔茨海默病病理进展的机制 | 研究mTOR通路在阿尔茨海默病和唐氏综合症中的作用 | mTOR通路及其上游调控因子在唐氏综合症相关阿尔茨海默病中的作用 | NA | 阿尔茨海默病 | 基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-10-29 |
Activation-Induced Marker Assay to Identify and Isolate HCV-Specific T Cells for Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-Oct-17, Viruses
DOI:10.3390/v16101623
PMID:39459954
|
研究论文 | 开发了一种激活诱导标记（AIM）检测法，用于识别、分离和后续单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析丙型肝炎病毒（HCV）特异性T细胞 | 使用激活诱导标记（AIM）方法，无需MHC多聚体即可高度敏感地检测稀有的抗原特异性T细胞 | 研究仅基于一个受试者，未来需要在更大样本中验证 | 开发一种新的方法来识别和分离HCV特异性T细胞，并进行单细胞RNA测序分析 | HCV特异性T细胞的识别、分离和单细胞RNA测序分析 | 免疫学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一个受试者的T细胞 |
| 212 | 2024-10-29 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569014
PMID:38168452
|
研究论文 | 研究了谷胱甘肽在植物再生过程中对细胞周期和细胞重编程的加速作用 | 开发了一套全面的细胞周期阶段标记物，并利用单细胞RNA测序和活体成像技术揭示了谷胱甘肽在细胞重编程中的关键作用 | NA | 探讨细胞周期在细胞重编程中的动态变化 | 拟南芥根部的细胞周期和再生过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序，活体成像 | NA | RNA测序数据，活体成像数据 | 拟南芥根部的多个细胞样本 |
| 213 | 2024-10-29 |
Single-Cell Antigen Receptor Sequencing in Pigs with Influenza
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.13.617920
PMID:39464079
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研究论文 | 本文开发了适用于猪的单细胞抗原受体测序方法，结合scRNAseq和TCR/BCR序列分析，研究了猪在流感感染后的肺部免疫反应 | 首次在猪中结合scRNAseq和TCR/BCR序列分析，研究了流感感染后的肺部免疫反应 | 仅限于猪模型，未在其他物种中验证 | 研究猪在流感感染后的肺部适应性免疫系统 | 猪的肺部T细胞和B细胞受体 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），10x Genomics VDJ测序 | NA | RNA | 来自表达和缺乏特定基因的猪的冷冻肺细胞，以及FACS分选的T细胞 |
| 214 | 2024-10-29 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2024-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568150
PMID:38045252
|
研究论文 | 本文开发了一种基于深度神经网络的方法DeepScence，用于在单细胞和空间转录组数据中识别衰老细胞 | DeepScence基于我们精心挑选的衰老相关基因集CoreScence，能够准确识别单细胞和空间转录组数据中的衰老细胞，显著优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确识别衰老细胞的方法，以研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度神经网络 | 单细胞和空间转录组数据 | NA |
| 215 | 2024-10-29 |
Obesity-Associated Changes in Immune Cell Dynamics During Alphavirus Infection Revealed by Single Cell Transcriptomic Analysis
2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.10.617696
PMID:39416014
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了肥胖与阿尔法病毒感染期间免疫细胞动态变化的关系 | 首次探讨了肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响，并发现了肥胖小鼠中缺失的一种独特巨噬细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨肥胖对阿尔法病毒感染期间免疫细胞功能的影响 | 肥胖和正常体重小鼠在阿尔法病毒感染期间的免疫细胞动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 肥胖和正常体重小鼠样本 |
| 216 | 2024-10-29 |
Integrative Omics Strategies for Understanding and Combating Brown Planthopper Virulence in Rice Production: A Review
2024-Oct-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010981
PMID:39456764
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综述 | 本文综述了利用整合组学策略理解并对抗褐飞虱对水稻生产的危害 | 整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据，深入理解褐飞虱的生物学特性，并探讨了通过操纵宿主-微生物相互作用来增强植物保护的新机会 | 尚未全面开展利用下一代组学技术对褐飞虱的遗传相互作用和种群动态进行全面研究 | 总结近期利用组学数据对抗褐飞虱的进展和新视角，以开发更可持续的害虫管理策略 | 褐飞虱及其与水稻的相互作用 | NA | NA | 基因组测序、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序、元基因组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA |
| 217 | 2024-10-29 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Cellular Heterogeneity and Drivers in Serrated Pathway-Driven Colorectal Cancer Progression
2024-Oct-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252010944
PMID:39456726
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了锯齿状病变在结直肠癌进展中的细胞异质性和驱动因素 | 研究样本量有限，可能影响结果的普适性 | 阐明锯齿状病变在结直肠癌进展中的机制 | 正常结肠组织和锯齿状病变组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三份正常结肠组织和十五份锯齿状病变组织 |
| 218 | 2024-10-29 |
The prognostic value and immunological role of calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) in pan-cancer study
2024-Oct-11, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000040072
PMID:39465821
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研究论文 | 本文研究了钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2（CAMKK2）在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用 | 首次全面评估了CAMKK2在泛癌研究中的分子特征和预后价值，并发现了其与免疫治疗效果的相关性 | 研究主要基于现有数据集，缺乏实验验证 | 探讨CAMKK2在不同癌症类型中的预后价值及其在免疫治疗中的潜在作用 | CAMKK2在不同癌症类型中的基因变异、表达水平及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | NA | 多组学数据整合 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种癌症类型的多组学数据和临床数据 |
| 219 | 2024-10-29 |
Identification of a seven-gene prognostic model for renal cell carcinoma associated with CD8+T lymphocyte cell
2024-Oct-04, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039938
PMID:39465721
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研究论文 | 本研究利用The Cancer Genome Atlas数据，通过加权基因共表达网络分析、基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书信号通路分析，构建了一个与CD8+T淋巴细胞相关的肾细胞癌七基因预后模型 | 首次构建了一个与CD8+T淋巴细胞相关的肾细胞癌七基因预后模型，该模型可能显著影响肾细胞癌患者的危险分层 | 研究仅基于The Cancer Genome Atlas数据，样本量有限，且未在其他数据集上验证模型的泛化能力 | 构建一个与CD8+T淋巴细胞相关的肾细胞癌预后模型，以提高对肾细胞癌患者的危险分层能力 | 肾细胞癌患者及其肿瘤微环境中的CD8+T淋巴细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 加权基因共表达网络分析、基因本体富集分析、京都基因与基因组百科全书信号通路分析、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 基于The Cancer Genome Atlas数据集 |
| 220 | 2024-10-29 |
Statistical batch-aware embedded integration, dimension reduction, and alignment for spatial transcriptomics
2024-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae611
PMID:39400541
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研究论文 | 本文提出了一种分层隐马尔可夫随机场模型STADIA，用于空间转录组学数据的批次效应校正、维度降低和空间域识别 | STADIA模型通过联合建模多个步骤，增强了技术伪影和生物信号之间复杂相互作用的理解，从而提高了结果的准确性和洞察力 | NA | 解决空间转录组学数据中批次效应和空间域识别的问题 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 隐马尔可夫随机场模型 | 基因表达数据 | 五个来自不同物种（人类和老鼠）、不同器官（大脑、皮肤和肝脏）以及不同平台（10x Visium、ST和Slice-seqV2）的数据集 |