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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-02-07 |
Single-cell omics and machine learning integration to develop a polyamine metabolism-based risk score model in breast cancer patients
2024-Oct-23, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06001-z
PMID:39441216
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研究论文 | 本研究结合单细胞组学和机器学习,开发了一种基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型 | 首次将单细胞组学与机器学习结合,开发基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型,揭示了肿瘤微环境的异质性 | 未提及样本的具体数量,可能影响模型的泛化能力 | 开发一种基于多胺代谢的乳腺癌风险评分模型,以个性化预后评估 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | SuperPC模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2025-02-07 |
A prospective diagnostic model for breast cancer utilizing machine learning to examine the molecular immune infiltrate in HSPB6
2024-Oct-23, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05995-w
PMID:39441229
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研究论文 | 本研究利用机器学习技术分析乳腺癌中的分子免疫浸润,特别是HSPB6基因,以开发一种前瞻性诊断模型 | 通过机器学习模型识别乳腺癌诊断的关键基因,并揭示HSPB6在细胞迁移、增殖和凋亡中的作用 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步在体内模型中验证 | 深入了解乳腺癌的分子机制,并识别与疾病相关的关键基因 | 乳腺癌相关数据集和MCF7细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 差异基因表达分析、基因集富集分析(GSEA)、加权共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 乳腺癌相关数据集和MCF7细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2025-10-07 |
Novel insights into the heterogeneity of FOXP3 + Treg cells in drug-induced allergic reactions through single-cell transcriptomics
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09509-1
PMID:39073709
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示FOXP3+调节性T细胞在药物诱导过敏反应中的异质性及其免疫调节作用 | 首次在药物诱导过敏反应背景下发现FOXP3+Treg细胞的显著转录组异质性,并证实FOXP3过表达可减轻过敏反应 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探究FOXP3+Treg细胞在药物诱导过敏反应中的异质性和免疫调节功能 | 小鼠模型中的FOXP3+调节性T细胞 | 单细胞转录组学 | 药物过敏反应 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,CRISPR/Cas9基因编辑,ELISA,细胞增殖检测 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing revealed immune heterogeneity and its association with disease activity in rheumatoid arthritis patients
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09513-5
PMID:39009881
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序技术,揭示类风湿关节炎患者免疫异质性及其与疾病活动的关联 | 首次整合单细胞转录组/T细胞受体测序与两个大型队列的bulk RNA测序数据,系统揭示类风湿关节炎中免疫细胞异质性及其临床关联 | 样本来源仅限于外周血单个核细胞和滑膜液,未包含其他组织类型 | 探究类风湿关节炎患者免疫环境特征及其与临床特征的关联 | 类风湿关节炎患者的外周血单个核细胞和滑膜液样本 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液样本,整合两个大型队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-07 |
T cell receptor clonotype in tumor microenvironment contributes to intratumoral signaling network in patients with colorectal cancer
2024-10, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-024-09478-5
PMID:39112913
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中T细胞受体克隆型与信号网络的关系 | 首次在结直肠癌中整合单细胞转录组和T细胞受体测序,揭示TCR克隆扩增与肿瘤免疫信号网络的关联 | 样本量相对有限(30对样本),且仅针对结直肠癌 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中基因表达和免疫特征 | 结直肠癌患者肿瘤组织和配对正常组织 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 数字图像分析 | NA | 单细胞基因表达数据, TCR序列数据, 图像数据 | 30对结直肠癌和配对正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-07 |
Long non-coding RNA H19X as a regulator of mononuclear cell adhesion to the endothelium in systemic sclerosis
2024-10-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae034
PMID:38305495
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研究论文 | 本研究探讨长链非编码RNA H19X在系统性硬化症血管病变中作为内皮细胞活化调节因子的功能 | 首次揭示H19X通过调控内皮细胞粘附分子表达参与系统性硬化症血管病变的机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 阐明H19X lncRNA在内皮细胞活化过程中的功能作用 | 系统性硬化症患者皮肤活检组织、人真皮微血管内皮细胞、外周血单核细胞 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 荧光染色, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells
2024-10, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904
PMID:39117004
|
综述 | 本文通过单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞在正常和肿瘤状态下的更复杂分类 | 利用单细胞测序技术重新定义了胸腺上皮细胞的分类体系,揭示了从pre-AIRE状态到成熟medullary细胞再到post-AIRE细胞的分化轨迹 | NA | 探讨单细胞测序对胸腺上皮细胞分类的新见解 | 正常和肿瘤状态下的胸腺上皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-10-07 |
Spatial resolution of the head and neck cancer tumor microenvironment to identify tumor and stromal features associated with therapy response
2024-10, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12811
PMID:39048134
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学技术解析头颈癌肿瘤微环境特征与免疫治疗反应的关系 | 首次结合NanoString GeoMx空间转录组和Akoya Phenocycler-Fusion空间蛋白质组技术,在头颈癌中识别与免疫治疗反应相关的肿瘤和基质特征 | 样本量较小(仅12名患者),且为回顾性研究 | 识别头颈癌肿瘤微环境中与免疫治疗反应相关的生物学特征 | 头颈癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理 | 头颈癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 12名患者的25个组织核心(包括4名无应答者8个核心,2名应答者5个核心,6名未治疗者12个核心) | NanoString, Akoya | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler, PhenoCycler-Fusion | NanoString GeoMx全转录组空间分析, Akoya PhenoCycler-Fusion空间蛋白质组分析 |
| 189 | 2025-10-07 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组和染色质可及性分析揭示卵巢体细胞的进化特征 | 首次在人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子五个物种中整合分析单细胞转录组和染色质可及性数据,揭示卵巢细胞进化规律 | 研究仅针对成年卵巢,未涵盖发育过程;物种数量有限 | 探究不同物种间卵巢体细胞分子机制的保守性与差异性 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢体细胞 | 单细胞多组学 | 卵巢生理与疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 五个物种的卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 190 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice
2024-Oct, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006
PMID:39153545
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人巨细胞病毒感染人源化小鼠后外周血单核细胞的基因表达变化 | 首次在人源化小鼠模型中应用单细胞RNA测序技术研究HCMV感染后的免疫细胞反应 | 研究基于人源化小鼠模型,与真实人体感染环境存在差异 | 揭示HCMV感染过程中病毒与宿主的相互作用机制 | 人源化小鼠模型中的外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞测序分析 | 人巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-10-07 |
Metabolic Reprogramming Induced by Aging Modifies the Tumor Microenvironment
2024-10-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201721
PMID:39451239
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研究论文 | 本研究通过计算模型分析衰老如何通过代谢重编程改变肿瘤微环境 | 首次系统揭示衰老通过代谢可塑性影响肿瘤微环境的机制,特别是能量代谢通路在免疫细胞中的差异性变化 | 基于计算模型的分析需要实验验证,样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索衰老与代谢重编程的相互作用如何影响肿瘤微环境并促进肿瘤发生 | 17种与衰老相关的癌症类型,包括T细胞、巨噬细胞等免疫细胞 | 计算生物学 | 多种癌症 | MMPC计算模型,RNA-seq分析 | MMPC(代谢可塑性通路配对比较模型) | RNA-seq数据 | 涵盖17种癌症类型的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-10-07 |
Podoplanin Expression in Early-Stage Colorectal Cancer-Associated Fibroblasts and Its Utility as a Diagnostic Marker for Colorectal Lesions
2024-10-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201682
PMID:39451200
|
研究论文 | 本研究探讨了podoplanin在早期结直肠癌相关成纤维细胞中的表达及其作为结直肠病变诊断标志物的应用价值 | 首次发现早期结直肠癌中隐窝周围成纤维细胞和网状细胞是CAFs的细胞来源,并证实PDPN表达可作为区分结直肠非肿瘤性与肿瘤性病变的诊断特征 | 早期结直肠癌中PDPN阳性CAFs的研究尚不充分,样本量未明确说明 | 研究早期结直肠癌相关成纤维细胞中podoplanin的表达特征及其诊断价值 | 腺瘤、早期结直肠癌、神经内分泌肿瘤、正常邻近组织和非肿瘤性结直肠病变 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-07 |
NBAtlas: A harmonized single-cell transcriptomic reference atlas of human neuroblastoma tumors
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114804
PMID:39368085
|
研究论文 | 本研究整合了七个单细胞或单核转录组数据集,构建了一个包含362,991个细胞的人类神经母细胞瘤协调参考图谱 | 创建了首个涵盖61名患者的大规模神经母细胞瘤单细胞转录组协调参考图谱,揭示了肿瘤区室转录组特征与临床结局的关联 | 整合的研究数据量仍有限,可能无法完全代表神经母细胞瘤的全部异质性 | 构建人类神经母细胞瘤的单细胞转录组参考图谱并解析其肿瘤异质性 | 神经母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61名患者的362,991个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-10-07 |
PD-L1 restrains PD-1+Nrp1lo Treg cells to suppress inflammation-driven colorectal tumorigenesis
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114819
PMID:39368087
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研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过抑制PD-1+Nrp1lo Treg细胞调控IL6中性粒细胞募集,从而控制炎症驱动性结直肠肿瘤发生 | 首次发现PD-L1通过调控PD-1+Nrp1lo Treg细胞亚群和IL6中性粒细胞来抑制结直肠肿瘤发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究PD-L1在结直肠癌中调控T细胞功能的具体机制 | 小鼠结直肠肿瘤模型中的T细胞亚群和中性粒细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-07 |
Persistent bone marrow hemozoin accumulation confers a survival advantage against bacterial infection via cell-intrinsic Myd88 signaling
2024-10-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114850
PMID:39392758
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研究论文 | 本研究揭示了疟疾中血晶素在骨髓持续沉积通过细胞内在Myd88信号通路增强先天免疫记忆的机制 | 首次发现血晶素通过细胞内在Myd88依赖途径诱导骨髓生成偏向,并证实其能增强单核细胞杀菌能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究血晶素沉积对造血和免疫反应的调控机制 | 骨髓造血祖细胞和单核细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 骨髓嵌合体, 骨内注射 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2024-10-12 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing comparison of CD4+, CD8+ and T-cell receptor γδ+ cutaneous T-cell lymphomas reveals subset-specific molecular phenotypes
2024-Oct-11, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae374
PMID:39392468
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2025-10-07 |
Notch signaling regulates macrophage-mediated inflammation in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.08.016
PMID:39317200
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示Notch-RBPJ信号通路在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中调控单核细胞向巨噬细胞转化的关键作用 | 首次揭示Notch-RBPJ信号通路在MASH中控制单核细胞-巨噬细胞转化的时空动态机制,发现Rbpj缺陷通过上调CD36表达促进保护性Ly6C单核细胞的脂质摄取 | 巨噬细胞分化和功能的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝病/脂肪性肝炎中巨噬细胞分化和功能的调控机制 | 肝脏巨噬细胞群体(包括驻留库普弗细胞和单核来源巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序,命运图谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-07 |
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024
PMID:39214091
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对胰岛素衍生表位的反应动态和致病性 | 发现InsC-ChgA特异性CD4 T细胞偏向独特的Th1效应表型且具有致病性,而其他胰岛素表位特异性T细胞主要呈现调节表型 | 研究仅限于NOD小鼠模型,未在人类患者中验证 | 探究自身免疫性糖尿病中CD4 T细胞对不同胰岛素衍生表位的反应特性和致病机制 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序, 四聚体分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从胰腺中分选的CD4 T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-07 |
Comparative analysis of rhesus macaque and human placental organoids highlights evolutionary differences in placentation
2024-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.11.617873
PMID:39416122
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研究论文 | 通过建立猕猴和人类胎盘类器官模型,比较分析两者在胎盘形成过程中的进化差异 | 首次建立猕猴胎盘类器官模型,并通过单细胞RNA测序揭示猕猴与人类滋养细胞转录特征的异同 | 仅比较了猕猴和人类两个物种,可能无法完全代表所有灵长类的胎盘进化特征 | 探究灵长类胎盘进化的分子机制和物种间差异 | 猕猴和人类的胎盘组织及衍生的类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 猕猴和人类胎盘类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-07 |
Continuous cell type diversification throughout the embryonic and postnatal mouse visual cortex development
2024-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616246
PMID:39829740
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研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育过程中的全面单细胞转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 提供了胚胎期和出生后发育阶段最详细的小鼠视觉皮层细胞类型动态分子图谱,揭示了细胞类型在不同发育阶段的连续多样化过程 | 研究仅限于小鼠视觉皮层,结果可能无法直接推广到其他脑区或其他物种 | 揭示视觉皮层发育过程中细胞类型多样化的分子机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,单核多组学测序 | 发育轨迹重建 | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据 | 568,674个高质量单细胞转录组和194,545个高质量单核多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | 10x Chromium | 单核Multiome测序技术,提供转录组和染色质可及性联合分析 |