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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-28
Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma
2024-10-31, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA-Seq分析,将DNMT3B和PFKFB4的转录谱与肝母细胞瘤的转移特性联系起来 利用弹性网络机器学习方法识别了DNMT3B和PFKFB4作为肝母细胞瘤转移的关键预测因子,并构建了一个基于这两个酶表达的代谢评分,该评分在预测转移方面比现有分类器更敏感 研究基于GSE131329转录组数据集,样本来源可能有限,且未涉及实验验证或机制探讨 探究肝母细胞瘤中代谢酶的过表达与转移风险之间的关联,并开发预测转移的临床-生物学模型 肝母细胞瘤肿瘤组织与非癌性肝组织,重点关注代谢酶的表达差异 单细胞组学 肝母细胞瘤 单细胞RNA-Seq,转录组分析 ElasticNet机器学习,逻辑回归模型 转录组数据 基于GSE131329转录组数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-21
Characterization of HPV6/11-reactive T-cell subsets in papillomas of patients with juvenile-onset recurrent respiratory papillomatosis and identification of HPV11 E7-specific candidate TCR clonotypes
2024-10-22, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和RNA微阵列技术,分析了青少年发病型复发性呼吸道乳头状瘤病(JORRP)患者乳头状瘤组织中HPV6/11反应性T细胞亚群的特征,并鉴定了HPV11 E7特异性候选TCR克隆型 首次在JORRP乳头状瘤组织中鉴定出CD8+组织驻留记忆T细胞作为局部抗HPV6/11免疫的主要T细胞亚群,并成功分离出HPV11 E7特异性候选TCR克隆型,为TCR-T细胞疗法提供了潜在靶点 研究样本量有限,且主要聚焦于HPV11 E7特异性反应,未全面评估其他HPV抗原或更广泛的免疫细胞相互作用 阐明JORRP患者乳头状瘤组织中HPV6/11特异性T细胞免疫反应的细胞基础和分子特征 青少年发病型复发性呼吸道乳头状瘤病(JORRP)患者的乳头状瘤组织 免疫学 复发性呼吸道乳头状瘤病 单细胞RNA测序, RNA微阵列 NA 单细胞转录组数据, 微阵列数据 未明确说明样本数量,但涉及JORRP患者的乳头状瘤组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-03-21
Polybacterial Intracellular Macromolecules Shape Single-Cell Epikine Profiles in Upper Airway Mucosa
2024-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了上呼吸道黏膜上皮细胞中多细菌细胞内大分子(PIMs)的存在及其对单细胞效应细胞因子表达和药物反应的线性驱动作用 首次在单细胞分辨率下发现并量化了人类口腔黏膜上皮细胞中持久存在的多细菌细胞内大分子(包括细菌rRNA、mRNA和糖脂),并证明这些PIMs能线性驱动效应细胞因子表达并影响药物疗效预测 研究主要基于人类口腔黏膜样本,可能无法完全代表其他上呼吸道区域;PIMs的具体来源和持久性机制仍需进一步探究 探究宿主与微生物在黏膜上皮细胞类型中的相互作用,特别是在健康与炎症疾病状态下 人类口腔黏膜上皮细胞,包括人类口腔角质形成细胞(HOKs) 数字病理学 慢性炎症性疾病 单细胞RNA测序,杂交技术,免疫组织化学 NA 单细胞RNA测序数据,杂交和免疫组织化学图像数据 基于人类口腔黏膜单细胞RNA测序图谱的重新分析,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4 2026-03-20
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-Oct-22, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了1型糖尿病年轻成人患者肾脏氧化代谢减弱与胰岛素敏感性及早期肾脏结构变化的关系 首次在1型糖尿病年轻成人中,结合高胰岛素-正常血糖钳夹、多模态成像、肾脏活检、单细胞RNA测序和空间代谢组学,系统揭示了近端肾小管细胞从稳定状态向适应/适应不良亚型转变的谱系,并发现其与氧化代谢减弱和早期肾脏结构损伤相关 样本量相对较小(T1D组30人,健康对照组20人),且研究对象为年轻成人,结果可能无法推广至其他年龄段的1型糖尿病患者或疾病晚期阶段 探究1型糖尿病中胰岛素敏感性受损是否通过改变肾脏氧化代谢而促进糖尿病肾病的发生 年轻1型糖尿病成人患者和健康对照者 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序,空间代谢组学,高胰岛素-正常血糖钳夹,MRI,11C-乙酸盐PET,肾脏活检 Slingshot算法(用于伪时间轨迹分析) 单细胞转录组数据,空间代谢组数据,影像数据,临床生化数据 1型糖尿病患者30人,健康对照20人 NA 单细胞RNA-seq,空间代谢组学 NA NA
5 2026-03-18
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过BCR受体克隆、表达及单细胞转录组学分析,探讨了人类对普遍存在的N-乙酰-D-葡萄糖胺(GlcNAc)表位的B细胞库,并揭示了抗糖抗体在生发中心依赖的亲和力成熟过程 结合BCR克隆表达与单细胞转录组学,首次系统分析了人类抗GlcNAc B细胞库的免疫系统发育史,揭示了其在早期儿童期通过生发中心进行亲和力成熟的新机制 研究主要关注GlcNAc表位,可能未全面覆盖其他糖类抗原;样本队列和年龄范围可能限制结论的普遍性 解析人类抗体库对碳水化合物抗原的广泛反应性机制,特别是针对GlcNAc表位的B细胞选择与成熟过程 人类队列中的循环抗GlcNAc B细胞及其BCR受体 免疫学 NA BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据、BCR序列数据 人类队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-03-17
ADAMTS7 Promotes Smooth Muscle Foam Cell Expansion in Atherosclerosis
2024-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞扩增的机制 揭示了ADAMTS7通过上调PU.1和CD36表达促进平滑肌细胞氧化低密度脂蛋白摄取的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 阐明ADAMTS7在动脉粥样硬化中的细胞特异性促动脉粥样硬化机制 平滑肌细胞、内皮细胞、小鼠模型、人类颈动脉粥样硬化组织 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序、RNA测序 条件性基因敲除小鼠、转基因小鼠 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-03-15
Gene Regulatory Network Analysis of Decidual Stromal Cells and Natural Killer Cells
2024-10, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本文通过单细胞转录组数据分析,首次对早孕期蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞进行了基因调控网络分析,揭示了与妊娠成功相关的关键转录因子 首次对早孕期蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞亚群进行基因调控网络分析,发现了新的蜕膜化驱动转录因子(如DDIT3和BRF2)以及免疫耐受相关的转录因子(如IRX3和RELB) 研究基于第一孕期妊娠终止样本的单细胞转录组数据,样本来源和时间点可能存在局限性 研究蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞的转录调控网络,以理解其在妊娠成功中的作用机制 早孕期蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞 单细胞转录组学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序 基因调控网络分析 单细胞转录组数据 第一孕期妊娠终止样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-03-14
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究探讨了在非肥胖糖尿病小鼠中,针对胰岛素衍生表位的CD4 T细胞反应的动态性和致病性,特别关注了InsC-ChgA特异性CD4 T细胞的独特致病作用 通过单细胞RNA测序揭示了胰岛抗原特异性T细胞命运的多样性,并首次证明InsC-ChgA特异性CD4 T细胞偏向于独特的Th1效应表型且具有致病性 研究仅限于非肥胖糖尿病小鼠模型,未在人类中验证,且样本规模可能有限 探究自身免疫性糖尿病中T细胞介导的胰岛破坏机制,特别是针对胰岛素衍生表位的CD4 T细胞反应的异质性和致病性 非肥胖糖尿病小鼠的胰腺CD4 T细胞,特别是针对四种胰岛素衍生表位的反应 免疫学 自身免疫性糖尿病 单细胞RNA测序,四聚体分选 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-03-13
Perivascular NOTCH3+ Stem Cells Drive Meningioma Tumorigenesis and Resistance to Radiotherapy
2024-Oct-04, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本研究揭示了血管周围NOTCH3+干细胞驱动脑膜瘤发生和放疗抵抗的作用机制 首次在人、狗和小鼠的脑膜瘤中发现并证实了血管周围NOTCH3+干细胞的保守存在及其在肿瘤发生和放疗抵抗中的关键驱动作用 研究主要基于基因工程小鼠模型和异种移植模型,临床转化效果需进一步验证 探究脑膜瘤发生和放疗抵抗的细胞类型与信号机制 脑膜瘤(来自人类、狗和小鼠) 肿瘤生物学 脑膜瘤 单细胞转录组学、谱系追踪、成像技术 基因工程小鼠模型、异种移植模型 转录组数据、图像数据 跨物种(人、狗、小鼠)的脑膜瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2024-08-07
B-cell repertoire and functions in idiopathic nephrotic syndrome: what to learn from single-cell RNA sequencing?
2024-10, Kidney international IF:14.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11 2026-03-10
A LDH-Derived Metal Sulfide Nanosheet-Functionalized Bioactive Glass Scaffold for Vascularized Osteogenesis and Periprosthetic Infection Prevention/Treatment
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一种功能化生物活性玻璃支架,用于促进血管化骨生成并预防/治疗假体周围感染 首次将MgCuFe-LDH衍生的硫化物纳米片功能化到生物活性玻璃支架上,结合抗菌阳离子和NIR-II光热性能,同步解决假体周围感染和骨整合问题 研究主要基于动物模型,临床转化效果尚需验证 开发一种多功能骨科植入材料,同步促进血管化骨生成和预防/治疗假体周围感染 生物活性玻璃支架功能化材料及其在骨再生和抗感染中的应用 生物材料与组织工程 骨科植入并发症 转录组测序、单细胞测序 NA 基因表达数据、单细胞数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
12 2026-03-10
From Cell to Gene: Deciphering the Mechanism of Heart Failure With Single-Cell Sequencing
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文综述了单细胞测序技术在揭示心力衰竭(HF)机制中的应用,重点关注心肌细胞异质性和细胞间通讯网络 利用单细胞测序技术克服传统高通量测序的局限性,在单个细胞水平上解析基因表达,从而揭示HF中细胞组成和基因表达的变化,以及微环境中不同细胞群体的独特作用 当前心血管研究中单细胞测序技术仍面临挑战,如技术复杂性、数据分析难度以及样本获取限制等 深入探究心力衰竭的发病机制,特别是细胞异质性和细胞间相互作用 心力衰竭相关的心肌细胞及其他心脏细胞类型 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA 基因组/转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-03-10
GJB2 Promotes HCC Progression by Activating Glycolysis Through Cytoplasmic Translocation and Generating a Suppressive Tumor Microenvironment Based on Single Cell RNA Sequencing
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序发现GJB2在肝细胞癌恶性细胞中高表达,并通过细胞质易位激活糖酵解及抑制性肿瘤微环境促进HCC进展 首次揭示了GJB2在HCC中的细胞定位改变(从细胞膜转向细胞质/核),并阐明了其通过激活NF-κB和HIF-1α/GLUT-1/PD-L1通路促进糖酵解及免疫抑制微环境的新机制 未明确说明样本数量及具体实验模型细节,机制研究主要在细胞层面进行 寻找肝细胞癌的有效治疗靶点 肝细胞癌(HCC)细胞及肿瘤微环境 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-10
DrugFormer: Graph-Enhanced Language Model to Predict Drug Sensitivity
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为DrugFormer的新型图增强大语言模型,用于在单细胞水平预测药物敏感性 提出首个结合序列化基因标记和基于基因的知识图谱的图增强大语言模型,用于单细胞水平的药物反应预测 模型训练依赖于带药物反应信息的单细胞数据,数据质量和覆盖范围可能影响预测性能 预测药物耐药性并揭示耐药细胞的分子机制 难治性多发性骨髓瘤和急性髓系白血病患者的单细胞 自然语言处理 多发性骨髓瘤, 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 图增强大语言模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-10
Loss of Smek1 Induces Tauopathy and Triggers Neurodegeneration by Regulating Microtubule Stability
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了Smek1在tau蛋白病中防止神经退行性变的作用 首次揭示Smek1缺乏通过加剧tau病理和线粒体功能障碍,以年龄依赖性方式诱导神经退行性变 NA 研究Smek1在阿尔茨海默病和其他tau蛋白病中的生理和病理作用 小鼠模型和人类大脑组织 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞测序 NA NA NA NA single-cell RNA-seq NA NA
16 2026-03-10
Myeloid Cells and Sensory Nerves Mediate Peritendinous Adhesion Formation via Prostaglandin E2
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结合条件性基因敲除小鼠模型,揭示了髓系细胞和感觉神经通过前列腺素E2介导肌腱周围粘连形成的机制 首次阐明髓系细胞中的COX2和感觉神经中的EP4受体在肌腱粘连形成中的关键作用,并发现PGE2局部治疗可改善修复肌腱的生物力学性能 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析有限;PGE2治疗的长期效果和安全性尚未评估 探究肌腱周围粘连形成的分子机制和潜在治疗靶点 人类和小鼠的肌腱组织样本、八种条件性基因敲除小鼠模型 单细胞组学 肌腱损伤/粘连 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 人类和小鼠标本(具体数量未明确),八种基因敲除小鼠品系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-03-10
Hypoxic Upregulation of IER2 Increases Paracrine GMFG Signaling of Endoplasmic Reticulum Stress-CAF to Promote Chordoma Progression via Targeting ITGB1
2024-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群通过IER2/GMFG/ITGB1轴促进脊索瘤进展的分子机制 首次系统阐明了缺氧微环境如何通过上调IER2将CAFs重编程为ERS-CAF亚群,并发现该亚群通过旁分泌GMFG信号靶向肿瘤细胞ITGB1驱动脊索瘤进展 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证;ERS抑制剂的具体作用机制尚未完全阐明 探究内质网应激相关癌症相关成纤维细胞亚群在脊索瘤中的致癌机制 脊索瘤肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚群、肿瘤细胞和SPP1巨噬细胞 单细胞组学与空间转录组学 脊索瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、GeoMx数字空间分析、数据非依赖性采集蛋白质组学、bulk RNA-seq、多重定量免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据、免疫荧光图像数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学, bulk RNA-seq GeoMx Digital Spatial Profiler NA
18 2025-03-01
Single-cell RNA sequencing data identify a conserved population of metallothionein-expressing macrophages that may be ubiquitous in vital human organs
2024-Oct, Clinical and translational discovery
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
19 2026-03-05
Antigen specificity of clonally-enriched CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了多发性硬化症患者脑脊液和血液中的CD8+ T细胞,揭示了其克隆扩增、抗原特异性及其与EB病毒抗原的关联 首次结合无偏倚和靶向抗原发现方法,鉴定出多发性硬化症来源的CD8+ T细胞克隆能识别EB病毒抗原及多种新型模拟表位 研究样本仅来自未接受治疗的患者,且样本量相对有限,未涵盖疾病不同阶段或治疗后的变化 探究多发性硬化症中CD8+ T细胞的克隆特性、功能及抗原特异性 多发性硬化症患者及对照参与者的脑脊液和血液样本 单细胞组学 多发性硬化症 单细胞RNA-seq, TCR-seq NA 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 一组未接受治疗的多发性硬化症患者及对照参与者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-03-04
Biologically informed machine learning modeling of immune cells to reveal physiological and pathological aging process
2024-Oct-24, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究构建了涵盖人类从新生儿到超百岁老人生命周期的首个免疫细胞转录组图谱,通过生物信息学与机器学习方法揭示免疫细胞在生理和病理衰老过程中的变化 首次构建覆盖全生命周期的免疫细胞转录组图谱,开发了适用于单细胞和批量RNA-seq数据的生物年龄预测模型PHARE,并发现儿科COVID-19患者和冠状动脉疾病患者存在加速衰老现象 研究主要基于转录组数据,可能未完全涵盖蛋白质组或表观遗传层面的衰老变化;样本年龄分布可能存在不均匀性 探究衰老如何塑造免疫细胞功能,为不同生命阶段的精准治疗提供依据 人类免疫细胞(涵盖新生儿至超百岁老人) 机器学习 老年疾病 RNA-seq 机器学习模型(PHARE) 转录组数据 涵盖从新生儿到超百岁老人的多年龄段人类样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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