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当前共找到 581 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
The SWI/SNF chromatin remodelling complex regulates pancreatic endocrine cell expansion and differentiation in mice in vivo
2024-Oct, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06211-7
PMID:38958700
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研究论文 | 本文研究了SWI/SNF染色质重塑复合物的BRG1和BRM ATP酶亚基在小鼠胰腺内分泌细胞发育和分化中的作用 | 首次在内分泌祖细胞特异性敲除BRG1并结合BRM杂合或纯合缺失，利用单细胞RNA测序揭示SWI/SNF复合物在胚胎期内分泌细胞发育中的关键调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在人类细胞或临床样本中验证；对SWI/SNF复合物下游具体靶基因的分子机制探讨有限 | 研究BRG1和BRM ATP酶亚基对胰腺内分泌祖细胞分化和发育的贡献 | 小鼠胰腺内分泌祖细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎第15.5天对照组和突变体的流式分选内分泌定向细胞 | Illumina | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-20 |
Lumican promotes calcific aortic valve disease through H3 histone lactylation
2024-10-05, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae407
PMID:38976370
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析人类主动脉瓣，揭示了lumican（LUM）通过激活炎症通路和增强糖酵解，促进组蛋白H3乳酸化修饰，进而驱动瓣膜间质细胞成骨转化和钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）的分子机制 | 首次发现lumican通过介导H3组蛋白乳酸化（特别是H3K14la和H3K9la位点）促进主动脉瓣钙化，并阐明其通过激活炎症通路和增强糖酵解导致乳酸积累的表观遗传调控新机制 | 摘要中未提及研究的具体局限性 | 阐明瓣膜间质细胞（VICs）向成骨细胞转化的病理过程，并揭示lumican（LUM）在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键调控作用和分子机制 | 人类主动脉瓣组织（9例）及ApoE-/-//LUM-/-双基因敲除小鼠模型中的瓣膜间质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，多组学分析，ChIP-PCR | NA | 图像，文本，基因表达数据 | 9例人类主动脉瓣样本，以及体外、离体和体内实验及双基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-16 |
Exponential family measurement error models for single-cell CRISPR screens
2024-10-01, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxae010
PMID:38649751
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研究论文 | 该论文提出了一种名为GLM-EIV的新方法，用于单细胞CRISPR筛选数据的统计分析，解决了传统阈值回归方法中存在的衰减偏差和偏差-方差权衡问题。 | 提出了GLM-EIV方法，将经典误差变量模型扩展到响应变量和噪声预测变量均服从指数族分布且可能受同一组混杂变量影响的情形，并开发了可在云端和高性能集群上跨数百个处理器部署的计算基础设施。 | 摘要中未明确提及该研究的局限性。 | 解决单细胞CRISPR筛选分析中的统计挑战，克服传统阈值回归方法的衰减偏差和偏差-方差权衡问题 | 单细胞CRISPR筛选数据集中的基因扰动与基因表达变化之间的关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | 广义线性模型, 误差变量模型 | 基因表达数据 | 两个近期的大规模单细胞CRISPR筛选数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-13 |
A self-training interpretable cell type annotation framework using specific marker gene
2024-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae569
PMID:39312689
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研究论文 | 提出了一种基于自训练策略和Transformer的可解释细胞类型注释框架sICTA，利用标记基因和生物先验知识进行单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 将自训练策略与伪标签技术及Transformer的非线性关联捕获能力相结合，并通过注意力机制将基因和通路的生物先验知识融入分类器以增强模型透明度，同时统一了聚类和注释过程，克服了传统两阶段方法对聚类算法的依赖 | 未明确说明 | 开发一种可解释的、基于标记基因的细胞类型注释方法，提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和可解释性 | 11个公开可用的单细胞数据集以及胰腺数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 11个公开单细胞数据集及1个胰腺数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-13 |
vSPACE: exploring virtual spatial representation of articular chondrocytes at the single-cell level
2024-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae568
PMID:39363499
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研究论文 | 该文章介绍了vSPACE，一个基于网络的应用程序，通过虚拟方式呈现人类关节软骨scRNAseq数据的空间分布 | 通过虚拟方式模拟空间转录组学技术，生成关节软骨细胞的二维分区分布模式，无需实际空间转录组实验即可推断空间分布 | 仅基于虚拟推断而非真实空间转录组数据，可能无法完全反映真实的空间信息 | 为关节软骨单细胞RNA测序数据提供虚拟空间可视化工具，揭示基因沿分区轴的表达模式 | 人类关节软骨细胞 | 空间转录组学, 单细胞分析 | 骨关节炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-09-13 |
Statistical batch-aware embedded integration, dimension reduction, and alignment for spatial transcriptomics
2024-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae611
PMID:39400541
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研究论文 | 本文提出了一种层次隐马尔可夫随机场模型 STADIA，用于空间转录组数据的批次效应校正、降维、对齐和空间域识别 | 提出了层次隐马尔可夫随机场模型 STADIA，能够联合建模批次效应校正、降维和空间域识别，实现多切片空间转录组数据的整合 | 摘要中未提及 | 减少批次效应，提取多个空间转录组切片间的共同生物模式，同时识别空间域 | 来自不同物种（人类和小鼠）、不同器官（脑、皮肤和肝脏）以及不同平台（10x Visium、ST 和 Slice-seqV2）的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 层次隐马尔可夫随机场 | 空间转录组数据 | 五个数据集，来自不同物种、器官和平台 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, ST, Slice-seqV2 | 10x Visium、ST 和 Slice-seqV2 平台 |
| 7 | 2026-09-13 |
scDRMAE: integrating masked autoencoder with residual attention networks to leverage omics feature dependencies for accurate cell clustering
2024-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae599
PMID:39404795
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研究论文 | 提出了一种基于掩码自编码器的细胞聚类模型scDRMAE，通过整合掩码机制与残差注意力网络，利用组学特征依赖性实现单细胞多组学数据的准确细胞聚类 | 利用掩码机制有效学习不同特征之间的关系并填补因丢失事件导致的假零值；通过注意力机制动态调整不同组学数据的权重以区分其在细胞聚类中的重要性 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决现有单细胞多组学细胞聚类方法中未充分考虑不同细胞类型间组学特征依赖性以及scRNA-seq和scATAC-seq数据高丢失率影响聚类性能的问题 | 单细胞多组学数据集（scRNA-seq和scATAC-seq数据）中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | 掩码自编码器, 残差注意力网络, K-means | 组学数据 | 15个多组学数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, single-cell multi-omics | NA | NA |
| 8 | 2026-09-13 |
A multi-modality and multi-granularity collaborative learning framework for identifying spatial domains and spatially variable genes
2024-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae607
PMID:39418177
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研究论文 | 本文提出了一种名为spaMMCL的多模态多粒度协同学习框架，用于从空间转录组数据中识别空间域和空间变异基因 | 通过掩蔽部分基因表达数据来减轻模态偏差的不利影响，使用共享图卷积网络整合基因和图像特征，并采用图自监督学习处理特征融合中的噪声；同时基于识别的空间域，整合多种策略在不同粒度上检测潜在的空间变异基因 | 未明确提及 | 准确识别空间域和空间变异基因，以理解组织结构和生物功能 | 空间转录组数据，包括基因表达、空间背景和组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络（GCN） | 图像和文本（基因表达） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-10 |
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619529
PMID:39484491
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研究论文 | 本研究整合高分辨率空间转录组学和进化谱系追踪技术，在小鼠肺腺癌模型中揭示了肿瘤生长、转移与微环境重塑的时空动态架构 | 首次将高分辨率空间转录组学与进化谱系追踪技术相结合，构建整合数据集，以解析肿瘤细胞状态和微环境结构的序贯变化如何协同促进肿瘤进展 | 摘要中未提及研究局限性 | 探究肿瘤扩张、可塑性和转移如何与微环境重塑共同演化，以阐明肿瘤进展的时空动态机制 | 小鼠肺腺癌模型中的肿瘤细胞及其微环境 | 空间转录组学 | 肺腺癌 | 空间转录组学、谱系追踪 | NA | 空间基因表达数据、谱系追踪数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-09-08 |
The multifaceted role of mitochondria in cardiac function: insights and approaches
2024-10-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01899-x
PMID:39472951
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综述 | 本文综述了心脏线粒体的起源、异质性及其在心脏功能和疾病相关重塑中的作用，并探讨了利用计算方法与单细胞测序技术研究线粒体与心血管疾病关联的潜力 | 强调线粒体具有善恶双重功能，并整合了线粒体亚群（如闰盘间、肌膜下、核周和核内线粒体）在心脏中的独特角色以及线粒体向核的逆行通讯，提出结合GWAS和单细胞测序技术来识别异质性和致病基因的新途径 | 本文为综述，未提供原始实验数据；线粒体功能障碍在其他并存疾病中的复杂角色可能限制靶向治疗的直接应用 | 探讨心脏线粒体在心血管疾病中的作用，并评估计算与单细胞技术用于遗传筛查的可行性 | 心脏线粒体亚群、线粒体异质性及其与细胞核的通讯机制 | 计算生物学与单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞测序、全基因组关联分析 | NA | 基因组和单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-09-08 |
Spatial-transcriptomic profiling: a new lens for understanding myelofibrosis pathophysiology
2024-10-21, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01877-3
PMID:39434124
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在骨髓纤维化病理生理学研究中的应用，探讨了其如何揭示骨髓和脾脏中的细胞异质性、空间基因调控及微环境相互作用 | 首次系统阐述空间分辨转录组学（SRT）作为新工具，通过高分辨率基因表达图谱揭示骨髓纤维化中骨髓和脾脏的病理微环境及“肿瘤替代”作用，为发现新治疗靶点和生物标志物提供新视角 | 当前研究主要基于综述视角，未包含原始实验数据或具体方法验证，可能缺乏定量证据支持 | 探讨空间转录组学如何增进对骨髓纤维化病理生理的理解，并促进诊断和治疗创新 | 骨髓纤维化患者骨髓和脾脏组织的空间转录组特征 | 空间转录组学 | 骨髓纤维化 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-07 |
Proteomic Heterogeneity of the Extracellular Matrix Identifies Histologic Subtype-Specific Fibroblast in Gastric Cancer
2024-10, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2024.100843
PMID:39305996
|
研究论文 | 该研究通过定量蛋白质组学分析胃癌组织中的脱细胞细胞外基质，揭示了ECM成分的蛋白质组异质性，并识别了与组织学亚型相关的特异性成纤维细胞。 | 该研究首次将ECM蛋白质组学与单细胞RNA测序结合，识别出PCC-NOS亚型特异性脂肪生成型癌症相关成纤维细胞，并发现ABCA8作为其表面标志物 | 研究样本量可能有限，且未详细说明其局限性。 | 探讨胃癌中ECM的蛋白质组异质性及其与组织学亚型和预后的关联，以识别亚型特异性生物标志物。 | 胃癌组织的ECM蛋白质组分及PCC-NOS亚型特异性成纤维细胞。 | 蛋白质组学 | 胃癌 | 定量蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、肿瘤微阵列分析 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、组织学图像 | 未提供具体样本数量。 | NA | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-09-06 |
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-10-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3257
PMID:39350665
|
研究论文 | 本研究采用初免-加强疫苗接种策略，通过肌肉注射DNA疫苗初免和鼻内接种减毒流感病毒载体疫苗加强，诱导产生肺组织驻留记忆CD8+ T细胞，并发现其源于中枢记忆T细胞，可有效预防肿瘤肺转移 | 首次揭示中枢记忆T细胞是疫苗诱导的肺组织驻留记忆CD8+ T细胞的主要前体细胞，并阐明了鼻内加强免疫通过CXCR3依赖性趋化重塑黏膜微环境促进TCM细胞分化为TRM细胞的机制 | 未明确提及 | 识别疫苗诱导的肺组织驻留记忆T细胞的来源，以优化预防肿瘤肺转移的疫苗策略 | 肺CD8+ TRM细胞、中枢记忆T细胞、转移性黑色素瘤和间皮瘤模型 | 免疫学 | 肿瘤转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 14 | 2026-09-04 |
Intestinal newborn regulatory B cell antibodies modulate microbiota communities
2024-10-09, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.08.010
PMID:39243760
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研究论文 | 研究发现新生儿调节性B细胞通过自分泌IL-10抑制IgM产生，其分泌的抗体可影响早期肠道微生物群落的多样性和成员间的合作，从而促进生命早期微生物组的建立 | 首次揭示IL-10产生的调节性B细胞通过自分泌IL-10调节IgM产生，并鉴定出肠道nBreg衍生的抗体可靶向早期微生物群落的多种细菌门，为调节性B细胞在新生儿期的功能提供了新见解 | 尚未明确nBreg抗体影响微生物群落的具体分子机制，且研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类情况 | 探讨新生儿调节性B细胞及其抗体在早期肠道微生物组建立中的作用和机制 | 新生儿调节性B细胞（nBreg）及其产生的单克隆抗体，以及它们对肠道微生物群落的影响 | 免疫学，微生物组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单克隆抗体克隆与表征 | NA | 单细胞转录组数据，抗体序列数据，微生物组组成数据 | 205个来自肠道nBreg的单克隆抗体，以及来自胎儿和新生儿肠道组织的细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 15 | 2026-09-03 |
Novel FABP4+C1q+ macrophages enhance antitumor immunity and associated with response to neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in NSCLC via AMPK/JAK/STAT axis
2024-10-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07074-x
PMID:39353883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别出一种新型FABP4+C1q+巨噬细胞亚型，该亚型在非小细胞肺癌新辅助帕博利珠单抗联合化疗响应中增强抗肿瘤免疫，并通过AMPK/JAK/STAT轴发挥协同作用。 | 发现并鉴定了一种新的FABP4+C1q+巨噬细胞亚型，该亚型与NSCLC患者新辅助免疫化疗的疗效相关，并揭示了其通过AMPK/JAK/STAT轴调节脂肪酸合成、抗凋亡和吞噬能力的新机制。 | 文中未提及具体局限性。 | 阐明新辅助帕博利珠单抗联合化疗疗效与巨噬细胞亚型之间的关联及其潜在机制。 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和淋巴结中的巨噬细胞亚型。 | 单细胞测序 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，多重荧光免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组化图像 | 文中未报告具体样本量 | 10x Genomics，Illumina | 单细胞RNA-seq，免疫组化 | 10x Chromium，Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 16 | 2026-09-01 |
Preventive Treatment with a CD73 Small Molecule Inhibitor Enhances Immune Surveillance in K-Ras Mutant Pancreatic Intraepithelial Neoplasia
2024-10-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-24-0200
PMID:39099209
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研究论文 | 本研究探讨了CD73小分子抑制剂AB-680在K-Ras突变胰腺上皮内瘤变模型中的预防性治疗效果，发现其能增强免疫监视并抑制病变进展 | 首次在K-Ras突变PanIN模型中验证CD73小分子抑制剂的免疫预防作用，通过单细胞RNA测序揭示了其对T细胞、B细胞和巨噬细胞亚群的调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；治疗周期和剂量优化未深入探讨 | 评估CD73抑制对PanIN形成和免疫微环境的影响，探索免疫预防治疗策略 | KrasG12D; PdxCre1 (KC)基因工程小鼠模型及其胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胰腺样本，具体数量未在标题和摘要中说明 | 未明确提及，可能为10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 17 | 2026-08-29 |
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-10-22, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183984
PMID:39436695
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研究论文 | 研究年轻1型糖尿病患者的肾脏氧化代谢减弱及其与胰岛素敏感性的关联 | 结合高胰岛素-正葡萄糖钳夹、MRI、11C-乙酸PET、肾活检、单细胞RNA测序和空间代谢组学，首次揭示T1D早期肾脏氧化代谢异常与近端小管细胞亚型分布的关系 | 样本量较小且仅纳入年轻成人，研究为横断面设计，无法确定因果关系 | 评估T1D患者肾脏氧化代谢改变及其与胰岛素敏感性和早期肾脏结构变化的关系 | 年轻T1D患者和健康对照者的肾脏组织及临床数据 | 数字病理学、机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、空间代谢组学、PET、MRI | Slingshot算法（轨迹分析） | 影像、基因表达、代谢物、临床数据 | 30名T1D患者和20名健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 18 | 2026-08-27 |
Genotype-phenotype profile of global ASPH-associated ectopia lentis and clinical findings from a Chinese cohort
2024-Oct-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148600
PMID:38788814
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研究论文 | 本研究通过靶向下一代测序和单细胞RNA测序，分析了中国队列中与ASPH相关的晶状体异位（Traboulsi综合征）的基因型-表型特征，并发现了新发错义变异和复发性无义变异 | 首次在中国队列中鉴定ASPH基因的新错义变异c.2075G>A (p.G692D)和复发性无义变异c.1126C>G (p.R376*)，并通过单细胞表达图谱和分子建模揭示了ASPH在睫状体上皮中的表达模式及变异对蛋白质结构的影响 | 样本量较小，仅包含两个家系，且未进行功能实验验证变异对蛋白功能的影响 | 探讨ASPH相关晶状体异位的基因型-表型关联，并阐明ASPH在晶状体异位发病机制中的潜在作用 | 中国晶状体异位队列中的两个家系，包含两名5岁男孩及其相关临床样本 | 基因组学, 单细胞转录组学, 生物信息学 | 晶状体异位, Traboulsi综合征 | 靶向下一代测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 分子建模 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 临床表型数据 | 2个家系，2名患者 | Illumina | 靶向测序, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Genomics Chromium | 靶向下一代测序使用Illumina NovaSeq平台，单细胞RNA测序使用10x Genomics Chromium平台 |
| 19 | 2026-08-26 |
Regulation of Diseases-Associated Microglia in the Optic Nerve by Lipoxin B4 and Ocular Hypertension
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.585452
PMID:38562864
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序等技术，探究了脂氧素B4在视神经和视网膜中对小胶质细胞的调控作用及其在眼高压诱导神经退行性变中的神经保护机制 | 首次发现LXB4通过调控视神经远端小胶质细胞向稳态表型转化并抑制疾病相关表型（如CD74表达）发挥神经保护作用，并揭示了眼高压诱导的独特CD74阳性小胶质细胞群体 | 未明确提及研究局限性 | 探究LXB4在眼高压诱导神经病变中对视网膜和视神经中小胶质细胞的调控作用及其神经保护机制 | 小鼠视网膜和视神经中的小胶质细胞，以及视网膜神经节细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、免疫组化、形态学分析（MorphOMICs）、伪时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠模型（具体样本量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 20 | 2026-08-26 |
Expression, DNA methylation pattern and transcription factor EPB41L3 in gastric cancer: a study of 262 cases
2024-10-01, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01849-7
PMID:39354571
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌中EPB41L3基因的表达、DNA甲基化模式及转录因子调控机制，发现非CpG甲基化与肿瘤进展相关，并鉴定CDC5L为关键转录因子 | 首次揭示EPB41L3启动子非CpG甲基化与胃癌恶性进展的关联，并鉴定CDC5L为调控EPB41L3表达的新型转录因子 | 未提供具体局限性信息 | 阐明EPB41L3在胃癌中的表达和甲基化模式，鉴定调控转录因子及受影响的下游通路 | 胃癌患者组织样本及细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组化、亚硫酸盐测序、RNA-seq、单细胞RNA-seq、ChIP-qPCR、荧光素酶报告基因 | NA | 组织样本、细胞系数据 | 262例胃癌患者组织（其中70例用于测序） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |