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当前共找到 580 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-10-21 |
Single-cell characterization of differentiation trajectories and drug resistance features in gastric cancer with peritoneal metastasis
2024-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70054
PMID:39422697
|
研究论文 | 研究胃癌腹膜转移患者的单细胞分化轨迹和药物耐药特征 | 揭示了MUC1+癌细胞在胃癌腹膜转移中的驱动作用，以及C1Q+巨噬细胞与GZMA+ T淋巴细胞在治疗失败中的相关性 | 样本量相对较小，且仅限于胃癌腹膜转移患者 | 阐明胃癌腹膜转移微环境中的细胞分化轨迹和关键药物耐药特征 | 胃癌腹膜转移患者的原发肿瘤、腹膜转移和化疗/免疫治疗前后的恶性腹水样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光和空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像和空间转录组数据 | 48名患者，包括30个单细胞RNA测序样本、30个多重免疫荧光样本和3个空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics of paediatric ovary: Molecular insights into the dysregulated signalling pathways underlying premature ovarian insufficiency in classic galactosemia
2024-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70043
PMID:39440457
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析经典半乳糖血症患儿卵巢组织，揭示早发性卵巢功能不全的分子机制 | 首次构建了经典半乳糖血症患儿卵巢的单核转录组图谱和空间转录组景观，揭示了PTEN/PI3K/AKT信号通路失调、内质网应激和DNA损伤等新机制 | 研究样本量有限，仅针对青春期前女孩，未验证治疗干预效果 | 探究经典半乳糖血症患者早发性卵巢功能不全的分子机制 | 经典半乳糖血症患儿的卵巢组织活检样本 | 数字病理学 | 卵巢功能不全 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | 青春期前女孩卵巢组织活检（含CG患者和对照） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-05 |
Dual targeting macrophages and microglia is a therapeutic vulnerability in models of PTEN-deficient glioblastoma
2024-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178628
PMID:39352749
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研究论文 | 在PTEN缺失的胶质母细胞瘤模型中，双重靶向巨噬细胞和小胶质细胞是一种治疗脆弱性 | 首次发现巨噬细胞与微胶质细胞在GBM肿瘤微环境中呈负相关，并揭示LOX抑制通过NF-κB-PATZ1通路上调OLFML3表达，导致微胶质细胞代偿性浸润 | 未在人类临床试验中验证，仅限于小鼠模型 | 探究PTEN缺失型胶质母细胞瘤中巨噬细胞和微胶质细胞的相互作用及双重靶向的治疗潜力 | PTEN缺失的胶质母细胞瘤小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学、多重顺序免疫荧光 | NA | 转录组数据、免疫荧光图像 | PTEN缺失型GBM小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-05 |
Endothelial YAP/TAZ activation promotes atherosclerosis in a mouse model of Hutchinson-Gilford progeria syndrome
2024-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173448
PMID:39352768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞YAP/TAZ激活促进HGPS小鼠动脉粥样硬化 | 首次阐明内皮YAP/TAZ信号通路在HGPS血管病理中的关键作用，为开发靶向YAP/TAZ药物治疗早衰症相关动脉粥样硬化开辟新途径 | 未介绍 | 探究HGPS血管病变的分子机制，特别是内皮细胞中YAP/TAZ通路的作用 | 表达早衰蛋白的LmnaG609G/G609G小鼠及野生型对照小鼠的主动脉样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq，原子力显微镜，超声评估 | NA | 基因表达数据，力学数据，超声图像 | 未明确样本数量，涉及HGPS模型小鼠和野生型对照小鼠 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 未明确 | 未明确 |
| 5 | 2026-07-04 |
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-10-22, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183984
PMID:39436695
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研究论文 | 本论文研究了1型糖尿病年轻成人中肾脏氧化代谢减弱及其与糖尿病肾病早期发展的关系 | 首次结合单细胞RNA测序、空间代谢组学与伪时间轨迹分析，揭示1型糖尿病患者肾近端小管细胞亚型转换与氧化代谢减弱的分子机制 | 样本量较小（T1D组30例，对照组20例），且未进行纵向随访验证因果关系 | 探究1型糖尿病中胰岛素敏感性下降是否通过改变肾脏氧化代谢促进糖尿病肾病发生 | 年轻1型糖尿病成人患者与健康对照者 | digital pathology | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，空间代谢组学，伪时间轨迹分析 | Slingshot算法 | 基因表达数据，代谢物空间分布数据 | 30例1型糖尿病年轻患者和20例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | NA | 使用11C-醋酸盐PET进行氧化代谢成像 |
| 6 | 2026-07-04 |
Evaluation of single-cell sorting accuracy using antibody-derived tag-based qPCR
2024-10, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24888
PMID:39132928
|
研究论文 | 开发了一种基于抗体衍生标签的qPCR方法，用于评估单细胞分选准确性 | 首次利用抗体衍生标签（ADTs）结合多路TaqMan qPCR来确认分选后单细胞的蛋白表达，从而验证单细胞分选准确性 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 开发一种新型检测方法，以确认分选单细胞的蛋白表达，并评估单细胞分选准确性 | 分选后的单细胞及全细胞裂解液 | NA | NA | qPCR， 荧光激活细胞分选（FACS）， 抗体衍生标签（ADTs） | NA | NA | NA | Thermo Fisher | NA | TaqMan | 多路TaqMan qPCR |
| 7 | 2026-07-03 |
Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing
2024-10, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13663
PMID:38770541
|
research paper | 利用单细胞RNA测序揭示慢性淋巴细胞白血病罕见亚群动力学及其驱动耐药性的分子特征 | 首次在治疗前阶段追踪到高基因组复杂度的耐药细胞亚群，并通过单细胞RNA测序表征其B细胞去分化特征 | 仅基于单一患者样本，结论普适性需更大规模队列验证 | 早期识别耐药癌细胞并解析其克隆演化与分子机制 | 慢性淋巴细胞白血病患者疾病进展与治疗反应过程中细胞亚群动态 | 单细胞基因组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序， 批量基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例慢性淋巴细胞白血病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-03 |
Autoimmunity Against Surfactant Protein B Is Associated with Pneumonitis During Checkpoint Blockade
2024-10-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202311-2136OC
PMID:38626354
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研究论文 | 发现针对表面活性蛋白B的自身免疫与免疫检查点抑制剂相关肺炎有关 | 首次揭示表面活性蛋白B特异性自身抗体和CD4 T细胞共同存在与免疫检查点抑制剂诱发肺炎的相关性，并提出治疗前抗体水平可能作为预测风险标志物 | 未说明样本量大小及因果关系直接证据，仅提示相关性 | 探讨自身抗体和自身反应性T细胞在免疫检查点抑制剂相关肺炎发展中的作用 | 非小细胞肺癌患者和黑色素瘤患者的血液样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于外周血T细胞分析 |
| 9 | 2026-07-01 |
MCAM is a prognostic biomarker in patients with liver cirrhosis and HCC
2024-10-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000532
PMID:39992088
|
研究论文 | 评估MCAM在肝硬化与肝细胞癌患者中的预后生物标志物价值 | 首次揭示sMCAM作为肝硬化及肝细胞癌预后血液生物标志物的潜力，并与传统标志物（透明质酸、TIMP1、甲胎蛋白）进行诊断性能比较 | 未说明 | 探究MCAM在慢性肝病中的表达特征并评估sMCAM作为肝硬化及HCC预后血液生物标志物的价值 | 肝硬化及肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝硬化, 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 血浆检测 | NA | 转录组数据, 免疫组化图像, 血浆样本数据 | 健康对照8例、慢性肝病66例、肝硬化236例、肝细胞癌72例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-06-26 |
Inhibitory Fcγ receptor deletion enhances CD8 T cell stemness increasing anti-PD-1 therapy responsiveness against glioblastoma
2024-10-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009449
PMID:39461881
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研究论文 | 探讨抑制性Fcγ受体缺失通过增强CD8 T细胞干性提高抗PD-1疗法对胶质母细胞瘤的响应 | 首次揭示FcγRIIB缺失通过增强CD8 T细胞干性（TCF1表达）改善抗PD-1免疫疗法对胶质母细胞瘤的疗效，并发现肿瘤特异性记忆T细胞（Ttsms）在肿瘤引流淋巴结中维持干性特征，成为肿瘤浸润的安全来源 | 基于鼠GL261胶质母细胞瘤模型，尚未在人类胶质母细胞瘤中验证其临床相关性 | 探索增强CD8 T细胞干性以提高免疫检查点阻断疗法对胶质母细胞瘤疗效的机制 | Fcgr2b基因敲除小鼠及GL261胶质母细胞瘤模型中的肿瘤浸润CD8 T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、过继转移、药物干预 | NA | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 鼠模型中涵盖Fcgr2b-/-小鼠和野生型小鼠的肿瘤组织及引流淋巴结样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞转录组分析 |
| 11 | 2026-06-26 |
SPI1+CD68+ macrophages as a biomarker for gastric cancer metastasis: a rationale for combined antiangiogenic and immunotherapy strategies
2024-10-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009983
PMID:39455096
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研究论文 | 本研究评估了SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌转移中的作用，并验证了联合抗血管生成和免疫治疗策略的合理性 | 首次揭示SPI1+CD68+巨噬细胞作为胃癌转移生物标志物，并阐明了其促进M2型巨噬细胞极化和血管新生的机制，为联合抗血管生成和免疫治疗提供了理论依据 | 研究主要基于体外和动物模型，临床验证样本量有限，可能未涵盖所有胃癌亚型 | 评估SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胃癌组织中的SPI1+CD68+肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析，免疫组化，免疫荧光，流式细胞术，多重荧光免疫组化，染色质免疫沉淀 | NA | 图像，文本 | 胃癌组织样本，包括原发肿瘤和转移灶；小鼠腹膜转移模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-06-26 |
Synergic activity of FGFR2 and MEK inhibitors in the treatment of FGFR2-amplified cancers of unknown primary
2024-10-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.07.011
PMID:39033323
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研究论文 | 本研究从腹水肿瘤细胞中衍生出两种原发灶不明癌症细胞系及其患者来源异种移植模型，通过多组学分析发现FGFR2基因扩增，并证明FGFR2与MEK抑制剂联合治疗具有协同抗肿瘤活性 | 首次在CUP模型中通过单细胞转录组学确认组织起源预测，并揭示FGFR2扩增作为驱动基因及联合靶向治疗的治疗潜力 | 仅基于两个患者衍生模型，需更大样本验证；未阐明FGFR2扩增导致CUP转移的机制 | 探索原发灶不明癌症的生物学特征及FGFR2靶向治疗策略 | 两种CUP细胞系（CUP#55和CUP#96）及其对应PDX模型 | 数字病理学 | 原发灶不明癌症 | 单细胞转录组测序、荧光原位杂交、微RNA表达谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、基因组测序数据、荧光原位杂交图像 | 2个CUP细胞系及对应PDX模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 13 | 2026-06-20 |
Oxysterols contribute to immune cell recruitment in SLE skin lesions
2024-10-22, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03414-6
PMID:39438997
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研究论文 | 本研究探索了氧化甾醇在系统性红斑狼疮（SLE）皮肤病变中的作用及其对免疫细胞招募的影响 | 首次通过靶向氧化脂质代谢组学分析鉴定了SLE皮肤病变中异常氧化胆固醇代谢，并阐明了成纤维细胞通过IL-1β介导的p38 MAPK和NFκB通路表达CH25H和CYP7B1，进而通过GPR183轴促进免疫细胞招募的机制 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内验证；样本量可能有限，且未涉及其他免疫细胞类型或长期临床结果 | 阐明氧化甾醇代谢在SLE皮肤病变发病机制中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的皮肤病变组织及成纤维细胞 | 自然语言处理 | 系统性红斑狼疮 | 液相色谱-质谱联用（LC-MS）靶向氧化脂质代谢组学、免疫组织化学染色、单细胞测序数据分析 | NA | 代谢组学数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-06-20 |
The miR-203/ZBTB20/MAFA Axis Orchestrates Pancreatic β-Cell Maturation and Identity During Weaning and Diabetes
2024-10-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0604
PMID:39058664
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研究论文 | 本研究揭示了miR-203/ZBTB20/MAFA轴在断奶和糖尿病期间调控胰腺β细胞成熟和身份的作用机制 | 首次发现miR-203的成熟形式（miR-203）在营养转变过程中调控β细胞成熟，并通过单细胞RNA测序证明miR-203升高促进未成熟β细胞向CgBHi内分泌细胞转化 | 未在人体样本中验证该调控轴的作用 | 探究营养转变与β细胞成熟之间的分子机制，揭示调控β细胞成熟的关键信号通路 | 胰腺β细胞 | 机器学习 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰腺β细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 15 | 2026-06-20 |
No Evidence for Persistent Enteroviral B Infection of Pancreatic Islets in Patients With Type 1 Diabetes and Prediabetes From RNA Sequencing Data
2024-10-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0076
PMID:39083653
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研究论文 | 通过RNA测序数据分析，未发现1型糖尿病及前驱糖尿病患者胰岛中存在持续性肠道病毒B感染的证据 | 首次利用人类胰腺分析计划（HPAP）的大规模RNA-seq数据（包括α、β、外分泌细胞及单细胞数据），通过Kraken2和STAR双重方法系统评估肠道病毒B的存在 | 无法排除非常低水平的持续性肠道病毒B感染存在的可能性 | 验证肠道病毒B持续性感染是否为1型糖尿病的重要病因 | 1型糖尿病、前驱糖尿病（自身抗体阳性但未发病）、2型糖尿病及非糖尿病患者的胰腺组织样本 | 自然语言处理 | 1型糖尿病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 243个批量RNA文库和79个单细胞RNA文库 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-06-20 |
Integrated analysis of bulk and single-cell RNA-seq data reveals cell differentiation-related subtypes and a scoring system in bladder cancer
2024-10, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70111
PMID:39400959
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研究论文 | 整合批量与单细胞RNA-seq数据，揭示膀胱癌细胞分化相关亚型并构建评分系统 | 首次识别膀胱癌细胞分化相关分子亚型并构建CDR评分系统，发现ANXA5作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性信息 | 探索膀胱癌细胞分化相关基因的分子亚型及其预后意义，并建立评分系统 | 膀胱癌细胞分化相关基因、膀胱癌患者样本 | 机器学习和数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、Lasso回归、Cox回归 | WGCNA、Lasso、Cox回归模型 | 基因表达数据（批量与单细胞RNA-seq） | 两个GEO单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-06-19 |
Putting proteins in context
2024-10-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009
PMID:39418999
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研究论文 | Li 等人提出了一种几何深度学习方法 PINNACLE，通过综合分析蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组学，生成具有生物或环境上下文的蛋白质表示 | 通过结合蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组学数据，生成了具有上下文信息的蛋白质表示，填补了传统蛋白质表示方法缺乏生物或环境背景的空白 | NA | 解决蛋白质表示缺乏生物或环境背景的问题，生成具有上下文信息的蛋白质表示 | 蛋白质及其在不同细胞类型中的功能和相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、几何深度学习 | 几何深度学习 | 蛋白质相互作用数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-06-17 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils Skin Cell Specific Antifungal Immune Responses and IL-1Ra- IL-1R Immune Evasion Strategies of Emerging Fungal Pathogen Candida auris
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619653
PMID:39463935
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示了皮肤细胞对新兴真菌病原体耳念珠菌的特异性抗真菌免疫反应及IL-1Ra-IL-1R免疫逃逸策略 | 首次通过单细胞转录组学揭示了耳念珠菌皮肤感染过程中免疫细胞与非免疫细胞的转录组特征，鉴定了成纤维细胞为主要富集的非免疫细胞，并阐明了IL-1Ra和IL-1R介导的免疫逃逸机制 | NA | 了解耳念珠菌皮肤定植的宿主免疫因子及其免疫逃逸机制 | 小鼠皮肤感染模型 | 单细胞转录组学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠皮肤感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-06-15 |
IRescue: uncertainty-aware quantification of transposable elements expression at single cell level
2024-10-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae793
PMID:39271103
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研究论文 | 介绍IRescue软件，一种在单细胞水平量化转座元件表达的软件，能够处理单细胞RNA测序数据中的多映射读段计数问题 | 提出独特的UMI去重算法纠正测序错误，并使用期望最大化程序有效重新分配多映射读段计数 | 未提及具体限制 | 解决单细胞RNA测序中因转座元件广泛分布和遗传相似性导致的表达量化挑战 | 人类结直肠癌、大脑、皮肤老化及SARS-CoV-2感染和恢复期间的外周血单核细胞的模拟和真实单细胞及细胞核RNA测序数据 | 计算生物学 | 结直肠癌, 神经系统疾病, 皮肤老化, 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 基于模拟数据和来自四类真实样本的数据：人类结直肠癌、大脑、皮肤老化及SARS-CoV-2感染和恢复期间的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-06-01 |
Graph attention automatic encoder based on contrastive learning for domain recognition of spatial transcriptomics
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07037-0
PMID:39424696
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研究论文 | 提出了一种基于图注意力自动编码器和对比学习的空间转录组数据域识别方法GAAEST | 引入自监督对比学习从局部、全局和上下文三个层次捕捉空间信息，显著提升空间域识别性能 | 未明确讨论方法的计算开销或对大规模数据集的扩展性 | 从空间转录组数据中准确识别空间域 | 空间转录组数据的空间域识别 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自动编码器 (GAAEST) | 基因表达数据，空间位置信息 | 基于多个数据集进行实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |