单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 600 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-09-25 |
Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics
2024-10, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907
PMID:39206540
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-07-12 |
The generation of stable microvessels in ischemia is mediated by endothelial cell derived TRAIL
2024-10-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8760
PMID:39365855
|
research paper | 本文揭示了内皮细胞衍生的TRAIL在缺血条件下稳定微血管生成中的作用 | 发现了TRAIL在促进新生血管形成和血管稳定中的新作用，并提出了重新利用TRAIL-R2激动剂治疗缺血性疾病的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床应用的可行性和安全性需要进一步验证 | 探究TRAIL在缺血条件下微血管生成和稳定中的作用机制 | 内皮细胞、周细胞及其相互作用 | 血管生物学 | 外周动脉疾病(PAD) | 单细胞RNA测序 | 小鼠缺血模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和患者动脉样本 |
| 3 | 2025-07-11 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colon epithelial cells using i ColonEpithelium metabolic reconstruction
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619644
PMID:39484551
|
研究论文 | 本研究通过构建首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，揭示了与炎症性肠病相关的代谢变化 | 首次构建了人类结肠上皮细胞的特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，并整合单细胞RNA测序数据预测疾病相关代谢特征 | 模型预测结果需要进一步实验验证，且目前仅关注结肠上皮细胞，未全面考虑其他细胞类型的影响 | 解析人类结肠上皮细胞的代谢活动及其在疾病状态下的变化 | 人类结肠上皮细胞及其在炎症性肠病(克罗恩病和溃疡性结肠炎)中的代谢特征 | 系统生物学 | 炎症性肠病(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎) | 基因组尺度代谢模型(GEM)、单细胞RNA测序 | iColonEpithelium代谢网络模型 | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 4 | 2025-07-10 |
The G4 resolvase Dhx36 modulates cardiomyocyte differentiation and ventricular conduction system development
2024-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52809-1
PMID:39366945
|
研究论文 | 本研究揭示了Dhx36解旋酶在心肌细胞分化和心室传导系统发育中的关键作用 | 首次发现Dhx36通过调控启动子G-四链体结构影响心肌细胞基因网络和传导系统发育 | 研究仅限于小鼠模型，人类心脏发育的适用性尚需验证 | 探索心脏传导系统发育和心肌细胞分化的转录调控机制 | 胚胎期和新生期小鼠心脏 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(snRNA-seq)，单细胞ATAC测序(snATAC-seq) | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组和表观基因组数据 | Dhx36敲除小鼠胚胎和新生心脏样本 |
| 5 | 2025-07-02 |
Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619910
PMID:39554174
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞因子混合物对人类THP-1巨噬细胞的重新编程能力，使其表现出与阿尔茨海默病相关的分子和细胞表型 | 首次使用IL4、CSF1/MCSF、IL34和TGFβ的细胞因子混合物诱导人类巨噬细胞向疾病相关小胶质细胞(DAM)和脂质相关巨噬细胞(LAM)的转录状态转变 | 研究仅在体外THP-1巨噬细胞系中进行，未在体内或原代细胞中验证 | 探索细胞因子诱导的人类巨噬细胞重编程在神经退行性疾病中的作用机制 | 人类THP-1巨噬细胞系 | 神经退行性疾病研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、功能测定 | 体外细胞模型 | 基因表达数据、功能测定数据 | THP-1巨噬细胞系 |
| 6 | 2025-07-02 |
Proximity-dependent labeling identifies dendritic cells that drive the tumor-specific CD4+ T cell response
2024-10-04, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adq8843
PMID:39365874
|
研究论文 | 通过邻近依赖性标记技术识别驱动肿瘤特异性CD4+ T细胞反应的树突状细胞 | 使用LIPSTIC技术进行单细胞转录组学分析，识别出在肿瘤引流淋巴结和肿瘤微环境中能够向CD4 T细胞呈递抗原的树突状细胞 | 研究仅关注了树突状细胞与CD4 T细胞的相互作用，未涉及其他免疫细胞类型 | 研究树突状细胞在肿瘤免疫反应中的作用及其与检查点阻断免疫疗法的关系 | 树突状细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | LIPSTIC (Labeling Immune Partnerships by SorTagging Intercellular Contacts), 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 7 | 2025-06-27 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma
2024-Oct-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111394
PMID:39595571
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析，将DNMT3B和PFKFB4的转录谱与肝母细胞瘤的转移特性联系起来 | 发现DNMT3B和PFKFB4的双重过表达与肝母细胞瘤患者的转移风险相关，并开发了一个代谢评分作为独立的转移预测指标 | 研究样本可能有限，且未在独立队列中进行验证 | 探索肝母细胞瘤中代谢酶的过表达与转移风险的关系 | 肝母细胞瘤患者和非癌肝组织 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | ElasticNet, 逻辑回归 | 转录组数据 | GSE131329转录组数据集中的样本 |
| 8 | 2025-06-18 |
Polybacterial Intracellular Macromolecules Shape Single-Cell Epikine Profiles in Upper Airway Mucosa
2024-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617279
PMID:39416216
|
研究论文 | 本文研究了上呼吸道黏膜中多细菌细胞内大分子对单细胞表观因子谱的影响 | 揭示了多细菌细胞内大分子（PIMs）在黏膜上皮细胞中的持久存在及其对细胞因子表达和药物反应的线性驱动作用 | 研究主要基于人类口腔黏膜数据，可能不适用于其他黏膜部位 | 探究宿主与微生物在黏膜上皮细胞类型中的相互作用 | 人类口腔黏膜上皮细胞和基质细胞 | 单细胞RNA测序 | 慢性炎症性疾病 | 单细胞RNA测序、杂交、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 人类口腔角质形成细胞（HOKs） |
| 9 | 2025-06-13 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
|
research paper | 该研究探讨了抗体Fab和Fc特性在促进结核分枝杆菌限制中的作用 | 通过Fc交换优化保护性抗体，揭示了Fc效应功能在结核分枝杆菌限制中的关键作用，并发现抗体介导的限制与组织水平免疫反应的重组相关 | 研究主要基于小鼠模型，未涉及人类临床试验 | 探究抗体在结核分枝杆菌限制中的机制 | 结核分枝杆菌和单克隆抗体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-06-13 |
The frequency of CD38+ alveolar macrophages correlates with early control of M. tuberculosis in the murine lung
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52846-w
PMID:39358361
|
研究论文 | 本文通过多模态单细胞RNA测序在小鼠模型中展示了不同肺泡巨噬细胞亚群在结核病进展或控制中的不同作用 | 揭示了CD38阳性和阴性肺泡巨噬细胞在结核病控制中的动态作用及其表观遗传预激活机制 | 研究仅基于小鼠模型，结果在人类中的适用性有待验证 | 探究肺泡巨噬细胞亚群在结核病控制中的作用机制 | 小鼠模型中的肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 11 | 2025-06-12 |
Concerted transcriptional regulation of the morphogenesis of hypothalamic neurons by ONECUT3
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52762-z
PMID:39366958
|
研究论文 | 研究ONECUT3转录因子在下丘脑神经元形态发生中的调控作用 | 发现ONECUT3通过调控NAV2影响下丘脑神经元的极化和形态发生，这一机制在不同神经元亚型和多个物种中保守 | 研究主要基于小鼠和线虫模型，人类神经元中的具体机制尚需进一步验证 | 探究转录因子ONECUT3在神经元分化过程中的作用机制 | 下丘脑GABA能多巴胺神经元和促甲状腺激素释放激素(TRH)谷氨酸能神经元 | 神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能获得性实验、siRNA敲降 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和线虫模型 |
| 12 | 2025-06-12 |
The lncRNA SNHG26 drives the inflammatory-to-proliferative state transition of keratinocyte progenitor cells during wound healing
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52783-8
PMID:39366968
|
研究论文 | 该研究揭示了长链非编码RNA SNHG26在皮肤伤口愈合过程中调控角质形成细胞祖细胞从炎症状态向增殖状态转变的关键作用 | 首次发现SNHG26通过调控转录因子ILF2的基因组定位来促进角质形成细胞祖细胞的炎症-增殖状态转变 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索伤口愈合过程中炎症相向增殖相转变的分子机制 | 角质形成细胞祖细胞 | 分子生物学 | 皮肤创伤 | 单细胞转录组分析、功能获得和功能缺失实验 | 小鼠模型 | RNA-seq数据 | 未明确说明样本数量，使用Snhg26缺陷小鼠和体外培养细胞 |
| 13 | 2025-06-12 |
Trophoblast Side-Population Markers are Dysregulated in Preeclampsia and Fetal Growth Restriction
2024-10, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10764-w
PMID:39028417
|
research paper | 该研究描述了人类胎盘中滋养层侧群标记物的特征及其在先兆子痫和胎儿生长受限中的异常表达 | 首次在胎盘功能不全疾病中表征了滋养层侧群标记物的表达模式，并揭示了这些标记物在滋养层细胞分化过程中的动态变化 | 样本量相对较小（n=3用于定位研究，n=78/30/18用于mRNA测量），且SERPINE3在体外验证中未被检测到 | 探究滋养层侧群标记物在胎盘发育和胎盘功能不全疾病中的作用 | 人类胎盘组织、先兆子痫和胎儿生长受限患者的胎盘样本 | 生殖医学 | 先兆子痫和胎儿生长受限 | 单细胞转录组学、体外细胞分化模型、mRNA定量分析 | 人滋养层干细胞(hTSC)向绒毛外滋养层(EVT)分化模型 | 基因表达数据、组织切片 | 定位研究n=3，mRNA测量n=78先兆子痫/30FGR/18对照，体外验证n=5 |
| 14 | 2025-06-12 |
Suppression of GATA3 promotes epithelial-mesenchymal transition and simultaneous cellular senescence in human extravillous trophoblasts
2024-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119768
PMID:38838858
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子GATA3在早期妊娠胎盘中外绒毛滋养细胞(EVT)分化和成熟过程中的调控机制及其与妊娠障碍发生的关联 | 揭示了GATA3在EVT分化过程中对上皮-间质转化(EMT)和细胞衰老的双重调控作用，并发现其在复发性流产(RM)中的异常定位 | 研究主要基于细胞系和有限的临床样本，需要在更大规模的临床队列中验证 | 阐明GATA3在EVT分化和成熟过程中的调控机制及其与妊娠障碍的关系 | 人外绒毛滋养细胞(EVT)、JEG3和HTR8/SVneo细胞系 | 生殖医学 | 妊娠障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胎盘类器官模型和胎盘组织样本 |
| 15 | 2025-06-08 |
Identifying genetic variants that influence the abundance of cell states in single-cell data
2024-Oct, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01909-1
PMID:39327486
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Genotype-Neighborhood Associations (GeNA)的统计工具，用于在高维单细胞数据中识别影响细胞状态丰度的遗传变异 | GeNA工具无需预定义细胞状态，灵活识别与遗传变异最相关的细胞状态丰度 | 研究仅基于969名个体的外周血单细胞RNA测序数据，可能需要更大样本量验证 | 识别影响单细胞数据中细胞状态丰度的遗传变异 | 单细胞RNA测序数据中的免疫细胞状态 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | GeNA统计模型 | 单细胞RNA测序数据 | 969名个体的外周血样本 |
| 16 | 2025-06-06 |
Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52946-7
PMID:39384741
|
research paper | 该研究通过单细胞转录组学揭示了酒渣鼻患者面部皮肤中异常的细胞群，并发现成纤维细胞在酒渣鼻发展中起关键作用 | 首次构建了酒渣鼻患者面部皮肤的单细胞图谱，并鉴定出成纤维细胞作为酒渣鼻发展的关键决定因素 | 研究样本仅来自女性患者，可能限制了结果的普适性 | 探究酒渣鼻的细胞和分子机制 | 酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤细胞 | digital pathology | rosacea | single-cell transcriptomics | NA | transcriptomic data | 女性酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本 |
| 17 | 2025-06-06 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2024-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52990-3
PMID:39379371
|
研究论文 | 通过单细胞多组学测序技术研究Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）的组织特异性反应 | 首次使用单细胞转录组、表面蛋白质组和T细胞受体（TCR）测序技术对SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水疱液进行综合分析，揭示了HLA I类限制性CD8 T细胞的免疫病理机制 | 样本量较小（15名患者），且为罕见疾病，可能限制结果的普遍性 | 揭示SJS/TEN的细胞免疫病理机制并识别潜在的治疗靶点 | 15名SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水疱液 | 单细胞测序 | Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体（TCR）测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 15名SJS/TEN患者的109,888个细胞 |
| 18 | 2025-06-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis
2024-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53104-9
PMID:39375367
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示原发性胆汁性胆管炎（PBC）中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用 | 首次在PBC患者和小鼠PBC模型中鉴定出具有JAK-STAT激活的肝脏驻留Th1样细胞群，并通过阻断JAK-STAT通路减轻肝脏炎症 | 传统检测方法的局限性导致PBC的局部肝脏免疫发病机制尚未完全阐明 | 揭示PBC的免疫细胞景观和分子机制 | PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏细胞 | 单细胞转录组学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏样本 |
| 19 | 2025-06-06 |
Distinctive CD39+CD9+ lung interstitial macrophages suppress IL-23/Th17-mediated neutrophilic asthma by inhibiting NETosis
2024-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53038-2
PMID:39366998
|
研究论文 | 本文发现了一类独特的CD39+CD9+肺间质巨噬细胞，能够通过抑制NETosis来抑制IL-23/Th17介导的中性粒细胞性哮喘 | 首次揭示了CD39+CD9+间质巨噬细胞通过CD9依赖的附着和CD39依赖的ATP清除机制抑制NETosis和Th17细胞激活 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者数据仅作为验证 | 探索中性粒细胞性哮喘的免疫调节机制 | CD39+CD9+肺间质巨噬细胞和中性粒细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和哮喘患者样本 |
| 20 | 2025-06-05 |
GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae151
PMID:39499852
|
research paper | 通过斑马鱼垂体单细胞转录组学揭示了GnRH与促性腺激素细胞的相互作用 | 首次在gnrh3-/-斑马鱼中通过单细胞RNA测序分析了所有垂体细胞的基因表达，揭示了LH和FSH促性腺激素细胞中两种促性腺激素β亚基的表达比例及GnRH受体表达的差异 | Gnrh3与LH促性腺激素细胞通过Gnrhr2直接相互作用的结果尚不清楚，且Gnrh3调节fshb表达的途径仍需进一步研究 | 阐明下丘脑Gnrh3及其他机制在调节垂体促性腺激素细胞中的作用 | 野生型和gnrh3-/-成年雌性斑马鱼的垂体细胞 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和gnrh3-/-成年雌性斑马鱼的垂体细胞 |