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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-30 |
Desmosome mutations impact the tumor microenvironment to promote melanoma proliferation
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.19.558457
PMID:37786690
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研究论文 | 本研究揭示了桥粒基因突变通过影响肿瘤微环境促进黑色素瘤增殖的新机制 | 首次发现桥粒基因在人类癌症中的高频突变,并阐明其通过改变角质形成细胞的微环境促进黑色素瘤增殖 | 研究主要基于原发黑色素瘤样本,未在转移性黑色素瘤中观察到相同现象 | 探究桥粒基因突变在黑色素瘤发生发展中的作用机制 | 人类黑色素瘤样本、角质形成细胞与黑色素瘤细胞共培养体系 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、蛋白质免疫荧光、基因敲低、细胞共培养 | 细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据、细胞增殖数据 | 未明确样本数量的人类黑色素瘤活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2025-11-07 |
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619529
PMID:39484491
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学和谱系追踪技术,揭示了肺腺癌肿瘤生长和转移过程中的时空动态结构 | 首次将高分辨率空间转录组学与演化谱系追踪技术相结合,阐明肿瘤扩张、可塑性和转移与微环境重塑的协同演化关系 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 探究肿瘤进展过程中癌细胞与微环境相互作用的时空动态演化机制 | Kras驱动的肺腺癌小鼠模型 | 空间转录组学 | 肺腺癌 | 空间转录组学, 谱系追踪 | 小鼠模型 | 空间转录组数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞技术 | NA | NA |
| 3 | 2025-11-03 |
Therapeutic single-cell landscape: methotrexate exacerbates interstitial lung disease by compromising the stemness of alveolar epithelial cells under systemic inflammation
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105339
PMID:39303666
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示甲氨蝶呤在系统性炎症下通过损害肺泡上皮细胞干性加重间质性肺病 | 首次在单细胞水平揭示甲氨蝶呤通过损害肺泡上皮细胞干性加重肺纤维化的机制 | 基于小鼠模型的研究结果需在人类患者中进一步验证 | 探究甲氨蝶呤和TNF抑制剂对类风湿关节炎相关间质性肺病的影响 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | 单细胞转录组学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-11-02 |
Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.044
PMID:39454576
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据差异表达分析的矩量法框架工具Memento | 开发了可同时分析均值表达、变异性和基因相关性的稳健高效差异分析工具,可扩展至数百万细胞和数千样本 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中区分生物和技术变异源、评估细胞组间定量比较统计显著性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩量法框架 | 基因表达数据 | 70,000气管上皮细胞、160,000 CRISPR-Cas9扰动T细胞、120万外周血单核细胞、5000万细胞CELLxGENE数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-27 |
Visualizing Immune Checkpoint Inhibitors Derived Inflammation in Atherosclerosis
2024-Oct-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324260
PMID:39328090
|
研究论文 | 本研究使用CCR2靶向放射性示踪剂和PET成像技术,可视化免疫检查点抑制剂引起的动脉粥样硬化炎症反应 | 首次开发非侵入性方法检测ICI治疗引起的动脉粥样硬化炎症,揭示IFNγ信号在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探索免疫检查点抑制剂引起动脉粥样硬化的机制并开发可视化检测方法 | Apoe-/-和Ldlr-/-基因敲除小鼠 | 分子影像学 | 心血管疾病 | PET成像、单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术 | NA | 影像数据、分子数据、单细胞测序数据 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,PET成像 | NA | 64Cu-DOTA-ECL1i PET示踪剂 |
| 6 | 2025-10-23 |
Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015
PMID:39025061
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了人类血管壁中早期间充质祖细胞的分布特征和功能特性 | 首次详细描绘了人类血管外膜干细胞微环境,发现CD201(PROCR)高表达定义了更原始的间充质祖细胞亚群 | NA | 表征人类血管周围祖细胞的表型、潜能和微解剖分布 | 人类血管组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-17 |
Integrative Multiomics in the Lung Reveals a Protective Role of Asporin in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-Oct-15, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 通过整合多组学方法研究肺动脉高压,发现asporin在肺血管中发挥保护作用 | 发现ASPN基因编码的asporin是肺动脉高压中的新型保护性靶点,具有治疗潜力 | 获取人类肺动脉高压肺样本较为困难,样本量相对有限 | 阐明肺动脉高压的病理生物学机制并发现新的治疗靶点 | 肺动脉高压患者肺组织样本、肺动脉平滑肌细胞、Sugen-低氧大鼠模型 | 多组学整合分析 | 肺动脉高压 | 转录组分析、全基因组关联研究、贝叶斯调控网络、单细胞转录组学、药物转录组学 | 贝叶斯网络、动物模型 | 转录组数据、临床病理数据、单细胞数据 | 96例疾病样本和52例对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析, 多组学整合 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-17 |
YAP1 Status Defines Two Intrinsic Subtypes of LCNEC with Distinct Molecular Features and Therapeutic Vulnerabilities
2024-Oct-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0361
PMID:39150543
|
研究论文 | 本研究通过YAP1状态将大细胞神经内分泌癌分为两个具有不同分子特征和治疗脆弱性的亚型 | 首次发现YAP1状态可定义LCNEC的两个内在亚型,并揭示了各自独特的分子特征和治疗脆弱性 | 研究样本量有限,主要基于细胞系和核心针活检样本 | 阐明大细胞神经内分泌癌的生物学特征并探索个性化治疗策略 | LCNEC细胞系、患者基因组数据和临床前模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、图像、序列数据 | LCNEC患者核心针活检样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-16 |
Distinct tumor architectures and microenvironments for the initiation of breast cancer metastasis in the brain
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.015
PMID:39270646
|
研究论文 | 本研究揭示了不同类型乳腺癌脑转移的独特肿瘤结构和微环境特征 | 发现TNBC和HER2+乳腺癌在脑转移过程中形成不同的肿瘤结构,并引发差异性的阿尔茨海默病相关小胶质细胞反应 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类组织样本,需要更大规模临床验证 | 理解乳腺癌脑转移的早期定植机制 | 三阴性乳腺癌和HER2+乳腺癌的脑转移过程 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织样本数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-11 |
Altered AP-1, RUNX and EGR chromatin dynamics drive fibrotic lung disease
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619858
PMID:39554071
|
研究论文 | 通过多组学单核测序分析揭示转录因子AP-1、RUNX和EGR在纤维化肺病中的调控机制 | 首次使用ChromBPNet神经网络工具在单碱基分辨率推断转录因子结合,并开发新型算法HALO验证转录因子活性 | 研究样本来源于移植肺组织,可能无法完全代表疾病早期阶段 | 探究纤维化肺病中成纤维细胞和巨噬细胞的转录调控机制 | 系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)患者和供体对照肺组织 | 计算生物学 | 肺纤维化 | 单核ATAC-seq, 单核RNA-seq, 多组学分析 | ChromBPNet神经网络, HALO算法 | 基因组可及性数据, 转录组数据 | SSc-ILD和供体对照肺组织(具体样本数未明确说明) | NA | 单核多组学测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-10 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma
2024-10-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111394
PMID:39595571
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现DNMT3B和PFKFB4基因表达与肝母细胞瘤转移特性相关 | 首次将代谢酶表达谱与肝母细胞瘤转移风险相关联,并开发了基于DNMT3B和PFKFB4表达的代谢评分系统 | 研究基于公共数据集GSE131329,样本量有限,需要进一步实验验证 | 识别与肝母细胞瘤转移相关的代谢酶生物标志物 | 肝母细胞瘤肿瘤组织与非癌肝组织 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,机器学习 | ElasticNet,逻辑回归 | 转录组数据 | GSE131329数据集中的肝母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-05 |
Inflammation-induced epigenetic imprinting regulates intestinal stem cells
2024-Oct-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.006
PMID:39232559
|
研究论文 | 本研究揭示了炎症通过代谢重编程诱导肠道干细胞表观遗传印记并影响其再生能力的机制 | 首次发现炎症暴露导致Lgr5肠道干细胞发生琥珀酸积累驱动的表观遗传重编程,并证明这种改变具有持久性 | 研究主要基于急性胃肠道移植物抗宿主病模型,其他炎症模型的普适性需要进一步验证 | 探究炎症暴露对肠道干细胞的适应性影响及其持久性效应 | Lgr5肠道干细胞 | 表观遗传学 | 胃肠道移植物抗宿主病 | 单细胞转录组测序, 表观基因组分析, 代谢分析, 类器官培养, 体内移植 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
Stiff Hydrogel Encapsulation Retains Mesenchymal Stem Cell Stemness for Regenerative Medicine
2024-Oct-02, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.05.041
PMID:39553898
|
研究论文 | 本研究通过调控水凝胶壳层刚度增强间充质干细胞的增殖能力和干性维持 | 首次发现较硬的水凝胶壳层能促进间充质干细胞增殖并维持其干性特征 | 水凝胶封装对MSC亚群的影响尚未完全阐明 | 探索水凝胶封装对间充质干细胞干性维持的影响机制 | 间充质干细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing of human eosinophils from nasal polyps reveals eosinophil heterogeneity in chronic rhinosinusitis tissue
2024-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.05.014
PMID:38797240
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的嗜酸性粒细胞,揭示其在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的异质性 | 首次在慢性鼻窦炎伴鼻息肉组织中通过单细胞RNA测序发现嗜酸性粒细胞存在四种不同亚型 | 样本量较小(5例患者),对照组鼻窦组织嗜酸性粒细胞数量过少未纳入分析 | 揭示鼻息肉组织中嗜酸性粒细胞的角色和异质性 | 鼻息肉组织和外周血中的嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 5名对照患者和5名CRSwNP患者的鼻窦组织和匹配外周血样本 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | 基于微孔板的单细胞RNA测序技术 |
| 15 | 2025-10-05 |
Synergy Between NK Cells and Monocytes in Potentiating Cardiovascular Disease Risk in Severe COVID-19
2024-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321085
PMID:38989579
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞和自然杀伤细胞在严重COVID-19患者心血管疾病风险增加中的协同作用机制 | 首次揭示了NK细胞通过激活增强单核细胞源性巨噬细胞对氧化低密度脂蛋白的摄取,阐明了两种免疫细胞在COVID-19相关心血管风险中的协同作用机制 | 样本量相对有限(严重组31例,康复组29例,对照组17例),主要关注严重COVID-19患者 | 研究严重COVID-19期间免疫细胞改变及其与心血管疾病风险的关联 | 严重COVID-19患者、康复患者和未感染SARS-CoV-2的对照人群 | 免疫学 | 心血管疾病 | 光谱流式细胞术、单细胞转录组分析、体外实验 | NA | 流式细胞数据、转录组数据、血浆生物标志物数据 | 严重COVID-19患者31例,康复患者29例,未感染对照17例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-05 |
IRG1/ACOD1 promotes neutrophil reverse migration and alleviates local inflammation
2024-Oct-01, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae110
PMID:38713770
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研究论文 | 本研究揭示了IRG1/ACOD1通过降低中性粒细胞表面ICAM-1表达促进其反向迁移并缓解局部炎症的机制 | 首次发现IRG1/ACOD1通过调控ICAM-1与Cd11a的结合促进中性粒细胞反向迁移,揭示了炎症消退的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究中性粒细胞反向迁移的分子机制及其在炎症中的作用 | 中性粒细胞(PMN)及其反向迁移现象 | 免疫学 | 急性肺部炎症 | 单细胞RNA测序,基因敲除,体内追踪 | NA | 基因表达数据,细胞迁移数据 | 小鼠炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-sequencing of human eosinophils in allergic inflammation in the esophagus
2024-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.05.029
PMID:38871184
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术深入分析了嗜酸性粒细胞在食管过敏炎症中的转录组特征和生物学功能 | 首次在单细胞水平揭示食管嗜酸性粒细胞存在两种不同功能状态的亚群,并发现其表达多种感应受体和炎症介质的特征 | 样本量相对有限(12名个体),且主要关注转录组水平,需要进一步功能验证 | 全面表征人类嗜酸性粒细胞在食管过敏炎症中的转录组和生物学功能 | 嗜酸性粒细胞在嗜酸性食管炎(EoE)患者中的表达特征 | 单细胞组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫染色, 刺激试验 | NA | 单细胞转录组数据 | 586个嗜酸性粒细胞(来自12名个体:6名患者血液,6名患者食管) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于重力的单细胞RNA测序方法 |
| 18 | 2025-10-05 |
VCAM-1 mediates proximal tubule-immune cell cross talk in failed tubule recovery during AKI-to-CKD transition
2024-Oct-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00076.2024
PMID:39116349
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研究论文 | 本研究揭示了VCAM-1在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中介导近端肾小管与免疫细胞相互作用导致修复失败的机制 | 首次证实VCAM-1通过NF-κB信号通路介导近端肾小管与免疫细胞的相互作用,促进AKI向CKD转变 | 主要基于体外细胞实验和动物模型,临床验证仍需进一步研究 | 探究VCAM-1在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中促进修复失败的作用机制 | 近端肾小管细胞、免疫细胞、小鼠模型、人类AKI和CKD患者样本 | 肾脏病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组分析、RNA测序、蛋白质分析、细胞培养 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、细胞实验数据 | AKI和CKD患者样本、小鼠模型、原代培养肾细胞 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-05 |
Single cell RNA-sequencing identifies the effect of Normothermic ex vivo liver perfusion on liver-resident T cells
2024-Oct, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2024.102104
PMID:39128812
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析常温离体肝脏灌注对肝脏组织驻留记忆T细胞的影响 | 首次在大鼠肝脏中创建了经历NEVLP的肝脏TRM T细胞图谱,并在单细胞基因表达水平证明了NEVLP对肝脏TRM T细胞的影响 | 研究仅针对大鼠肝脏,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究NEVLP对肝脏组织驻留免疫细胞表型的影响,评估抗炎细胞因子减少TRM活化的能力 | 大鼠肝脏和肝脏组织驻留记忆T细胞 | 单细胞组学 | 肝脏移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠肝脏样本(包括NEVLP处理组、抗炎细胞因子处理组和对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-05 |
Imaging macular carotenoids and their related proteins in the human retina with confocal resonance Raman and fluorescence microscopy
2024-Oct, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110043
PMID:39151780
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研究论文 | 利用共聚焦共振拉曼和荧光显微镜研究人视网膜黄斑区类胡萝卜素及其相关蛋白的分布 | 首次结合共振拉曼显微镜的荧光和拉曼模式,系统研究12种已知黄斑类胡萝卜素相关蛋白在人视网膜黄斑区的空间分布 | 蛋白质具体作用机制尚未完全阐明,样本量有限 | 探究黄斑类胡萝卜素相关蛋白在黄斑形成中的作用 | 人视网膜黄斑区及视网膜色素上皮细胞 | 生物医学成像 | 眼科疾病 | 共聚焦共振拉曼显微镜,荧光显微镜,Western blot,单细胞RNA测序 | NA | 图像,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 未明确样本数量的人视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |