单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
1 2024-12-21
Does the brain make prolactin?
2024-10, Journal of neuroendocrinology IF:3.3Q2
综述 本文综述了关于脑内是否产生催乳素的研究证据 本文通过分析不同抗体和高度敏感的扩增技术检测到的催乳素免疫反应性,提出了对脑内催乳素产生可能性的质疑 证据不一致且变异性大,高度敏感的检测技术可能导致假阳性结果,且现代原位杂交和单细胞RNA测序未能提供支持证据 评估脑内催乳素产生的证据 催乳素及其受体在脑内的表达和功能 NA NA 原位杂交、单细胞RNA测序 NA mRNA NA
2 2024-12-21
Laminin Beta 2 Is Localized at the Sites of Blood-Brain Barrier and Its Disruption Is Associated With Increased Vascular Permeability, Histochemical, and Transcriptomic Study
2024-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
研究论文 本文研究了层粘连蛋白β2在血脑屏障中的定位及其破坏与血管通透性增加的关系 首次通过组织化学和转录组学研究,揭示了层粘连蛋白β2在血脑屏障中的定位及其在不同病理条件下的表达变化 研究主要集中在高级别胶质瘤中的血管生成,未涵盖其他类型的脑部疾病 探讨层粘连蛋白β2在血脑屏障中的作用及其在脑部病理中的变化 层粘连蛋白β2及其在血脑屏障中的定位和表达 数字病理学 脑部疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及正常脑组织和高级别胶质瘤的微血管样本
3 2024-12-20
Mechanisms of Berberine in anti-pancreatic ductal adenocarcinoma revealed by integrated multi-omics profiling
2024-10-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合药理学数据库与bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,揭示了小檗碱在抗胰腺导管腺癌中的潜在机制 首次通过多组学分析揭示了小檗碱在胰腺导管腺癌中的潜在抗肿瘤机制,并识别了关键的药物靶点和免疫调节作用 研究主要基于体外数据和计算分析,缺乏体内实验验证 揭示小檗碱在抗胰腺导管腺癌中的潜在机制 小檗碱在胰腺导管腺癌中的作用机制及潜在靶点 NA 胰腺癌 RNA-seq, scRNA-seq PPI网络 基因表达数据 NA
4 2024-12-20
Intestinal Tuft Cells Are Enriched With Protocadherins
2024-10, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
研究论文 研究揭示了肠绒毛细胞中富含原钙粘蛋白(protocadherins),并探讨了其在细胞微绒毛组织中的作用 首次发现原钙粘蛋白在肠绒毛细胞中的富集,并证明了其在小鼠和人类肠绒毛细胞中的关键作用 研究主要集中在小鼠和人类的小肠和结肠样本,未涵盖其他器官或物种 探讨肠绒毛细胞的结构和功能,特别是微绒毛组织的调控机制 肠绒毛细胞及其中的原钙粘蛋白 NA NA 免疫染色和单细胞RNA测序 NA 组织样本和RNA序列 小鼠和人类的肠组织样本
5 2024-12-19
Catalytic activity of Setd2 is essential for embryonic development in mice: establishment of a mouse model harboring patient-derived Setd2 mutation
2024-Oct, Frontiers of medicine IF:3.9Q2
研究论文 本文研究了Setd2的催化活性对小鼠胚胎发育的重要性,并建立了一个携带患者来源Setd2突变的小鼠模型 首次建立了携带患者来源催化失活Setd2突变的小鼠模型,揭示了Setd2催化活性对小鼠胚胎发育的必要性 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类疾病的具体机制 探讨Setd2催化活性在小鼠胚胎发育中的作用 Setd2基因及其催化活性在小鼠胚胎发育中的作用 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 Setd2和Setd2-CD小鼠模型
6 2024-12-18
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-Oct-22, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究探讨了1型糖尿病年轻患者肾脏氧化代谢的变化及其与糖尿病肾病发展的关系 首次通过多模态技术(包括PET、MRI、单细胞RNA测序和空间代谢组学)全面评估1型糖尿病患者肾脏氧化代谢的变化,并使用Slingshot算法分析了近端小管细胞的伪时间轨迹 样本量较小,且仅限于年轻成人群体,研究结果的普适性可能有限 探讨1型糖尿病患者肾脏氧化代谢的变化及其与糖尿病肾病发展的关系 1型糖尿病年轻患者和健康对照组的肾脏氧化代谢 NA 糖尿病 PET、MRI、单细胞RNA测序、空间代谢组学 Slingshot算法 图像、基因表达数据、代谢物数据 30名1型糖尿病患者和20名健康对照者
7 2024-12-18
iMIRACLE: an Iterative Multi-View Graph Neural Network to Model Intercellular Gene Regulation from Spatial Transcriptomic Data
2024-Oct, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management
研究论文 本文提出了一种名为iMiracle的迭代多视图图神经网络,用于从空间转录组数据中建模细胞间的基因调控 iMiracle整合了细胞间和细胞内网络,采用迭代学习克服空间转录组数据的稀疏性,并推断细胞特异性的配体-基因调控评分 NA 填补从空间转录组数据中连接细胞间通信与基因调控的空白,提供细胞间调控的生物学见解 细胞间的基因调控 机器学习 NA 图神经网络 图神经网络 空间转录组数据 九个模拟数据集和八个真实数据集
8 2024-12-17
Advancements in Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics for Central Nervous System Disease
2024-Oct-10, Cellular and molecular neurobiology IF:3.6Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)在中枢神经系统(CNS)疾病研究中的应用 通过scRNA-seq和ST技术,揭示了CNS疾病的细胞异质性和功能特异性,发现了新的细胞类型或亚型,提出了新的病理生理机制,并发现了潜在的治疗靶点和生物标志物 NA 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学在中枢神经系统疾病研究中的应用 中枢神经系统疾病,包括慢性神经退行性疾病和急性中枢神经系统损伤等 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学(ST) NA 转录组数据 NA
9 2024-12-16
Single-cell RNA-seq Reveals the Inhibitory Effect of Methamphetamine on Liver Immunity with the Involvement of Dopamine Receptor D1
2024-Oct-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 研究通过单细胞RNA测序探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 首次通过单细胞RNA测序揭示了甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的抑制作用,并发现多巴胺受体D1在其中的调节作用 研究仅限于慢性甲基苯丙胺暴露模型,未探讨急性暴露的影响 探讨甲基苯丙胺对肝脏免疫细胞的影响及多巴胺受体D1的参与 肝脏免疫细胞及多巴胺受体D1 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及多种肝脏免疫细胞类型
10 2024-12-14
Characterization of cell states in biliary tract cancers identifies mechanisms of therapeutic resistance in a phase II trial of DKN-01/nivolumab
2024-Oct-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析胆道癌患者的治疗前和治疗中的活检样本,构建了恶性细胞和免疫细胞的详细分子分类,并揭示了治疗抵抗的机制 首次系统分类了胆道癌中的功能性注释细胞状态,并发现了神经样和内皮样状态在胆道癌中的存在,这些状态在其他癌症中与治疗抵抗相关 研究仅限于单一的临床试验,样本量较小,且未观察到客观反应 揭示胆道癌治疗抵抗的机制,并为下一代临床试验提供新的见解 胆道癌患者的治疗前和治疗中的活检样本 数字病理学 胆道癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 治疗前和治疗中的活检样本
11 2024-12-12
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2024-Oct-06, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,探讨了人类皮肤老化过程中表皮和真皮细胞衰老的分子机制 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学构建了皮肤细胞衰老图谱,并提出了SenSkin™基因集,揭示了光老化和自然老化中细胞衰老的差异 研究主要集中在皮肤细胞的衰老机制,未深入探讨其他组织或器官的细胞衰老情况 探讨人类皮肤老化过程中表皮和真皮细胞衰老的分子机制及其对皮肤功能的影响 表皮和真皮中的衰老细胞,特别是黑色素细胞和网状真皮成纤维细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和空间转录组学 NA 基因表达数据 未明确具体样本数量
12 2024-12-11
IgG autoantibodies in bullous pemphigoid directly induce a pathogenic MyD88-dependent pro-inflammatory response in keratinocytes
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究探讨了天疱疮(BP)中的IgG自身抗体如何直接诱导角质形成细胞中的病理性MyD88依赖性促炎反应 首次揭示了BP-IgG自身抗体依赖的角质形成细胞反应在天疱疮病理中的作用,并证明了MyD88在BP-IgG诱导的炎症反应中的关键作用 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上,尚未完全阐明这些发现在人类中的直接应用 探讨天疱疮中IgG自身抗体对角质形成细胞的直接影响及其在疾病病理中的作用 天疱疮患者的IgG自身抗体、角质形成细胞、MyD88信号通路 NA 天疱疮 多重免疫分析、bulk RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 NA RNA 包括天疱疮患者和对照组的IgG处理过的原代角质形成细胞,以及患病和对照皮肤样本
13 2024-12-10
Analysis of the heterogeneity and complexity of murine extraorbital lacrimal gland via single-cell RNA sequencing
2024-Oct, The ocular surface
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠眶外泪腺的细胞异质性和复杂性 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠眶外泪腺的细胞多样性,并构建了细胞异质性的图谱 研究仅限于C57BL/6J小鼠的眶外泪腺,未涉及其他物种或组织 研究小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性,以了解其对维持眼表健康的作用 小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 43,850个高质量细胞
14 2024-12-10
The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics
2024-Oct, The ocular surface
研究论文 研究使用单细胞和空间转录组学技术探讨了两种小鼠模型中睑板腺功能障碍(MGD)的细胞组成、分化和基因表达变化 首次使用单细胞和空间转录组学技术研究睑板腺功能障碍的机制 仅限于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类 探讨睑板腺功能障碍的细胞和基因表达变化机制 野生型小鼠和Awat2敲除小鼠的睑板腺 NA NA 单细胞和空间转录组学 NA 基因表达数据 年轻(6个月)和老年(22个月)野生型C57Bl/6小鼠,以及年轻(3个月)和老年(13个月)Awat2敲除小鼠
15 2024-12-10
Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye
2024-Oct, The ocular surface
研究论文 评估干眼症对结膜免疫细胞数量和转录组特征的影响,特别是单核吞噬细胞 首次通过单细胞RNA测序和scATAC-seq技术分析了干眼症对结膜单核吞噬细胞基因表达的影响,并探讨了调节性巨噬细胞在其中的作用 研究仅限于C57BL/6小鼠模型,结果的普适性有待进一步验证 研究干眼症对结膜免疫细胞的影响及其基因表达模式 结膜免疫细胞,特别是单核吞噬细胞 NA 干眼症 单细胞RNA测序,scATAC-seq Monocle 3 基因表达数据 非应激和干眼症C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞
16 2024-12-08
Pharmacological and toxicological characteristics of baicalin in preventing spontaneous abortion and recurrent pregnancy loss: A multi-level critical review
2024-Oct-30, Heliyon IF:3.4Q1
综述 本文综述了黄芩苷在预防自然流产和反复妊娠丢失中的药理学和毒理学特性 提出了基于病理动力学的多模态立体测序研究,结合单细胞RNA测序、空间转录组学和单细胞多模态组学,深入探讨黄芩苷的保胎机制 从临床角度阐述了使用黄芩苷的局限性 探讨黄芩苷在母胎界面上的代谢、毒理学和药理学效应,以及其在预防自然流产和反复妊娠丢失中的作用机制 黄芩苷及其代谢产物黄芩素在母胎界面上的生物效应 NA 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多模态组学 NA NA NA
17 2024-12-08
scACT: Accurate Cross-modality Translation via Cycle-consistent Training from Unpaired Single-cell Data
2024-Oct, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management
研究论文 本文介绍了一种名为scACT的深度生成模型,用于从未配对的单细胞数据中提取跨模态生物学见解 scACT通过对抗训练对齐未配对的多模态数据,利用循环一致训练实现无先验知识的跨模态翻译,并通过模拟扰动探索可解释的调控相互联系 NA 解决现有跨模态翻译方法依赖于稀缺的高质量共测数据的问题 单细胞数据中的跨模态翻译 机器学习 NA 深度生成模型 对抗训练和循环一致训练 单细胞数据 多种单细胞数据集
18 2024-12-07
Hexokinase 2 expression in apical enterocytes correlates with inflammation severity in patients with inflammatory bowel disease
2024-10-23, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 研究了炎症性肠病患者中顶端肠上皮细胞的己糖激酶2表达与炎症严重程度的关系 首次系统研究了己糖激酶2表达与炎症性肠病活动性的关系,并提出了靶向己糖激酶2抑制作为潜在治疗途径 研究基于两个独立队列的数据,但样本量和队列数量有限 探讨己糖激酶2表达与炎症性肠病炎症严重程度的关系 炎症性肠病患者的顶端肠上皮细胞 NA 炎症性肠病 RNA测序、免疫荧光染色 NA 转录组数据 两个独立队列的炎症性肠病患者,包括克罗恩病和溃疡性结肠炎患者
19 2024-12-07
Integrative bioinformatics analysis for identifying the mitochondrial-related gene signature associated with immune infiltration in premature ovarian insufficiency
2024-10-08, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过综合生物信息学分析,识别与早发性卵巢功能不全(POI)相关的线粒体基因特征及其与免疫浸润的关系 首次揭示了线粒体功能与免疫反应在POI发展中的相互作用,并识别出可能的生物标志物和治疗药物 研究主要基于转录组数据和生物信息学分析,缺乏体内实验验证 探讨线粒体功能与免疫反应在早发性卵巢功能不全中的相互作用 早发性卵巢功能不全(POI)及其相关的线粒体基因和免疫细胞 生物信息学 生殖疾病 转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包括POI模型和人类颗粒细胞(GCs)在内的多种细胞类型
20 2024-12-06
An integrative single-cell atlas for exploring the cellular and temporal specificity of genes related to neurological disorders during human brain development
2024-Oct, Experimental & molecular medicine
研究论文 本文通过整合多个单细胞RNA测序数据集,构建了一个全面的人类大脑发育单细胞图谱,揭示了与神经系统疾病相关的基因在不同发育阶段的表达模式 本文首次整合了多个单细胞RNA测序数据集,构建了一个全面的人类大脑发育单细胞图谱,揭示了与神经系统疾病相关的基因在不同发育阶段的表达模式 本文主要依赖于单细胞RNA测序数据,可能无法全面反映基因表达的复杂性 揭示与神经系统疾病相关的基因在人类大脑发育过程中的细胞和时间特异性 人类大脑发育过程中的单细胞RNA测序数据 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 393,060个单细胞
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