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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of LGALS2: insights into tertiary lymphoid structure-associated dendritic cell activation and immunotherapeutic potential in breast cancer patients
2024-Sep-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02126-4
PMID:39350165
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研究论文 | 通过整合分析乳腺癌转录组数据,发现LGALS2是三级淋巴结构中的关键标志物,并揭示其在树突状细胞激活和免疫治疗中的潜力 | 首次通过生物网络计算策略和机器学习方法识别LGALS2作为三级淋巴结构的关键标志物,并阐明其在树突状细胞激活中的作用机制 | NA | 探索LGALS2在乳腺癌三级淋巴结构中的作用及其免疫治疗潜力 | 乳腺癌患者样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学,免疫组织化学,HE染色 | 机器学习 | 转录组数据 | 超过6000个乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
Permethrin exposure primes neuroinflammatory stress response to drive depression-like behavior through microglial activation in a mouse model of Gulf War Illness
2024-Sep-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03215-3
PMID:39272155
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研究论文 | 本研究通过建立海湾战争疾病小鼠模型,探讨了氯菊酯暴露如何通过小胶质细胞激活引发神经炎症应激反应并导致抑郁样行为 | 首次揭示氯菊酯暴露可通过启动小胶质细胞的炎症激活状态,在心理应激触发下导致抑郁样行为和神经可塑性改变 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 评估氯菊酯暴露是否能够启动神经炎症应激反应并引发与海湾战争疾病相关的精神症状 | 海湾战争疾病小鼠模型 | 神经科学 | 海湾战争疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | 21,566个从小鼠海马体收集的单细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
SCIntRuler: guiding the integration of multiple single-cell RNA-seq datasets with a novel statistical metric
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae537
PMID:39226185
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研究论文 | 开发了一种名为SCIntRuler的新型统计指标,用于指导多个单细胞RNA-seq数据集的整合 | 提出首个用于指导单细胞RNA-seq数据集整合的统计指标,帮助研究人员决定是否需要数据整合以及选择合适的整合方法 | NA | 解决多个单细胞RNA-seq数据集整合时的决策问题,包括是否需要整合以及选择何种整合方法 | 单细胞RNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
Advancing sequencing-based spatial transcriptomics with a comprehensive benchmarking study
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02326-2
PMID:38977827
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
Unveiling impaired vascular function and cellular heterogeneity in diabetic donor-derived vascular organoids
2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae043
PMID:39049437
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研究论文 | 本研究通过糖尿病供体来源的血管类器官揭示了糖尿病血管功能障碍和细胞异质性 | 首次在糖尿病供体来源的血管类器官中发现特异性内皮细胞亚群,揭示其ROS通路过度表达和血管生成特征表达不足 | 类器官可能需要额外的器官特异性分化因子来促进器官特异性身份的形成 | 研究糖尿病血管病变的体外模型和药物筛选平台 | 糖尿病和非糖尿病供体来源的诱导多能干细胞生成的血管类器官 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病和非糖尿病供体来源的血管类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-10-06 |
Dual-specificity phosphatases 13 and 27 as key switches in muscle stem cell transition from proliferation to differentiation
2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae045
PMID:38975693
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研究论文 | 本研究揭示了双特异性磷酸酶DUSP13和DUSP27在肌肉干细胞从增殖向分化转变过程中的关键调控作用 | 首次发现MyoD直接靶向调控Dusp13和Dusp27,并证明这两个磷酸酶在肌肉干细胞命运转变中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类肌肉干细胞中的功能需要进一步验证 | 探究肌肉干细胞从增殖向分化转变的分子调控机制 | 肌肉干细胞(MuSCs) | 发育生物学 | 肌肉再生障碍 | 单细胞RNA测序,基因敲除,基因过表达 | NA | 基因表达数据 | MyoD敲入小鼠和Dusp13:Dusp27双敲除小鼠的肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of long isoform sequencing and functional data identifies distinct cortical layer neuronal subtypes derived from human iPSCs
2024-09-01, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.00045.2024
PMID:38988287
|
研究论文 | 比较两种培养基中人类iPSCs分化为神经元的效果,发现E8M培养基能更高效生成功能性皮层神经元 | 首次结合长读长单细胞RNA测序和功能验证,鉴定出人类iPSCs来源的特定皮层神经元亚型 | 研究仅观察了35天内的分化效果,未评估长期稳定性 | 优化人类iPSCs向神经元分化的方法,提高分化效率 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs) | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 长读长单细胞RNA测序, 免疫细胞化学, 全细胞膜片钳记录 | NA | 单细胞RNA测序数据, 电生理记录数据, 免疫荧光图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
Identifying ADGRG1 as a specific marker for tumor-reactive T cells in acute myeloid leukemia
2024-Sep-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00560-0
PMID:39243082
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定ADGRG1作为急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特异性标志物 | 首次发现ADGRG1可作为CD8+肿瘤反应性T细胞的特定标志物,并通过小鼠模型和CAR-T系统验证其功能 | 研究样本仅限于RUNX1::RUNX1T1融合基因的AML患者,需要更广泛的患者群体验证 | 探索急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特征和特异性标志物 | 新诊断AML患者的骨髓T细胞和Runx1; Mx1-Cre小鼠模型 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | STARTRAC-like算法 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 新诊断RUNX1::RUNX1T1融合基因AML患者的骨髓T细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
Recent developments and new directions in the use of natural products for the treatment of inflammatory bowel disease
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155812
PMID:38905845
|
综述 | 系统回顾天然产物治疗炎症性肠病的最新研究进展 | 整合现代技术(如宏基因组学、单细胞测序、靶点识别和药物递送系统)推动天然产物在IBD治疗中的应用 | 天然产物在临床转化和药物开发方面仍面临挑战 | 探索天然产物治疗炎症性肠病的新方向 | 多酚、生物碱、萜类、醌类等天然产物 | NA | 炎症性肠病 | 宏基因组学, 单细胞测序, 靶点识别技术, 药物递送系统 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2025-10-06 |
Loss of synovial tissue macrophage homeostasis precedes rheumatoid arthritis clinical onset
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1252
PMID:39321281
|
研究论文 | 本研究深入探讨了类风湿关节炎患者、风险人群和健康对照者滑膜组织的髓系细胞景观 | 首次在RA临床发病前发现CD40表达巨噬细胞群的富集,识别了早期致病性髓系特征 | 样本量相对有限,需要进一步验证这些发现 | 研究类风湿关节炎发病前的滑膜组织巨噬细胞稳态变化 | 类风湿关节炎患者、风险人群和健康对照者的滑膜组织细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术,RNA测序,代谢分析,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 67,908个RA和HC滑膜组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-06 |
Skewed epithelial cell differentiation and premature aging of the thymus in the absence of vitamin D signaling
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9582
PMID:39321290
|
研究论文 | 研究维生素D信号缺失对胸腺上皮细胞分化和胸腺早衰的影响 | 首次揭示维生素D信号通过调控Aire表达影响胸腺上皮细胞分化,并发现其缺失导致胸腺早衰 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究维生素D信号在胸腺上皮细胞分化和胸腺衰老中的作用机制 | Cyp27b1基因敲除小鼠的胸腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2025-10-06 |
A Paradoxical Tumor Antigen Specific Response in the Liver
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.614002
PMID:39372792
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研究论文 | 本研究探讨了肝脏肿瘤中CD8+ T细胞功能异常及其在肝转移形成中的作用机制 | 发现肝脏肿瘤中肿瘤特异性CD8+ T细胞数量丰富但功能耗竭,并鉴定出SPP1+巨噬细胞与CD8+ T细胞在促纤维化区域的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据,需要更大样本验证 | 阐明肝脏肿瘤微环境中免疫细胞功能异常的机制 | 小鼠肿瘤模型和人类结肠癌肝转移患者 | 免疫学 | 结肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学CODEX, 多组学分析 | 差异伪时间轨迹推断分析 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 多个小鼠肿瘤模型和患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 173 | 2025-10-06 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614841
PMID:39386468
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术识别了果蝇侧角亮氨酸激肽神经元中整合睡眠与代谢状态的关键基因 | 首次在单神经元水平揭示饥饿状态下睡眠-代谢相互作用的转录调控机制 | 研究仅聚焦于果蝇特定神经元类型,结果在其他物种中的普适性有待验证 | 探究睡眠与代谢状态相互作用的细胞分子机制 | 果蝇侧角亮氨酸激肽神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, Patch-seq, CEL-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇LHLK神经元(饱食与24小时饥饿状态对比) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in pediatric research: Focusing on differentiation trajectories and immune microenvironment of neuroblastoma
2024-Sep, Pediatric discovery..
DOI:10.1002/pdi3.61
PMID:40625458
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在神经母细胞瘤研究中的应用,重点关注分化轨迹和肿瘤免疫微环境 | 系统总结了单细胞测序技术在神经母细胞瘤研究中揭示肿瘤分化轨迹、异质性和免疫微环境的新发现 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在儿科神经母细胞瘤研究中的应用价值 | 神经母细胞瘤 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis of adult hippocampal neurogenesis in the human brain
2024 Sep-Oct, Journal of psychiatry & neuroscience : JPN
IF:4.1Q1
DOI:10.1503/jpn.240026
PMID:39414359
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研究论文 | 通过空间转录组学和多重荧光原位杂交技术研究人类大脑中成人海马神经发生的分布和特征 | 首次在人类死后海马样本中结合空间转录组学和多重荧光原位杂交技术评估成人海马神经发生现象 | 样本量较小且仅包含男性样本 | 评估人类成人海马神经发生的存在和特征 | 死后人类齿状回样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | NA | 空间转录组数据, 荧光原位杂交图像 | 婴儿1例(2岁), 青少年1例(16岁), 年轻成人2例(平均23.5岁), 中年男性8例(平均43岁) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-06 |
Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages (LAMs)
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614807
PMID:39386558
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了脂质相关巨噬细胞(LAMs)在多个组织和炎症条件下的保守性和组织特异性转录谱 | 首次系统性地比较了不同组织和炎症条件下LAMs的转录组特征,发现了保守性和组织特异性的基因程序 | 研究主要基于小鼠和人类的单细胞RNA测序数据,需要进一步的功能验证实验 | 探究脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录组特征及其在代谢性疾病中的作用 | 小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞(LAMs) | 单细胞转录组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织和疾病模型的小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data analysis utilizing multi-type graph neural networks
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108921
PMID:39059210
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研究论文 | 提出一种利用多类型图神经网络和去噪自编码器的单细胞RNA测序数据分析模型 | 将零膨胀负二项模型与去噪自编码器结合,并集成多类型图神经网络处理单细胞数据 | NA | 解决单细胞RNA测序数据降维、去噪和聚类分析的技术难题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 去噪自编码器, 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-06 |
Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108989
PMID:39142223
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,建立了癌症相关成纤维细胞miRNA特征模型来预测前列腺癌复发 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据构建CAFs相关miRNA预后模型,并鉴定出miR-106b-5p作为潜在治疗靶点 | 研究样本量相对有限,需要更大规模验证 | 建立CAFs相关miRNA模型以评估前列腺癌预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选 | 前列腺癌患者样本和成纤维细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, CCK8, 伤口愈合实验, 克隆形成实验, 细胞迁移实验 | Lasso, 随机森林, 支持向量机 | RNA测序数据 | 34例前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
Transcriptional profiling in microglia across physiological and pathological states identifies a transcriptional module associated with neurodegeneration
2024-09-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06684-7
PMID:39294270
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研究论文 | 通过整合分析人类小胶质细胞的转录组数据,识别出在神经退行性疾病中共享的转录特征 | 整合多个神经退行性疾病的单细胞RNA-seq数据集,发现跨疾病共享的小胶质细胞转录特征,并将遗传变异与转录特征相关联 | 基于公开数据集进行二次分析,可能受原始数据质量和样本来源限制 | 识别小胶质细胞在生理和病理状态下的转录特征,探索其在神经退行性疾病中的作用 | 人类小胶质细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组关联分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 基因组数据 | 多个公开数据集,涵盖阿尔茨海默病、多发性硬化症和帕金森病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 180 | 2025-10-06 |
SPRR1B+ keratinocytes prime oral mucosa for rapid wound healing via STAT3 activation
2024-09-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06864-5
PMID:39300285
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研究论文 | 本研究通过整合分析口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的单细胞测序数据,揭示了STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在促进口腔黏膜快速愈合中的关键作用 | 首次发现STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在正常口腔黏膜中固有存在,而在正常皮肤中缺失,这一细胞亚群通过促进角质形成细胞迁移来加速伤口愈合 | 研究主要基于小鼠模型验证,在人类临床样本中的验证仍需进一步深入 | 探究口腔黏膜快速伤口愈合的细胞机制 | 口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的角质形成细胞 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | bulk mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 小鼠模型和人类口腔/皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |