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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.016
PMID:38848718
|
研究论文 | 本研究利用空间增强分辨率组学测序和单细胞RNA测序技术，绘制了水稻种子萌发过程中胚胎细胞的时空转录组图谱 | 开发了基于深度学习的自动细胞分割模型，发现了两种先前未报道的盾片细胞类型，并提供了探索胚胎细胞在种子萌发中作用的新方法 | NA | 阐明不同胚胎细胞在调控种子活力和幼苗建成中的复杂生物学功能 | 水稻胚胎细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 原位杂交 | 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 吸水后6、24、36和48小时的水稻胚胎样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学和高分辨率活体成像技术，揭示了小鼠胚胎前内脏内胚层迁移的分子机制 | 首次结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组和活体成像技术系统研究AVE迁移，发现转录状态与细胞位置的紧密关联及信号素信号的关键作用 | 研究仅针对小鼠胚胎模型，结果在其他物种中的普适性有待验证 | 阐明前内脏内胚层独特迁移行为和功能的分子基础 | 小鼠胚胎前内脏内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 活体成像, 晶格光片显微镜, 短期谱系标记 | NA | 基因表达数据, 蛋白质磷酸化数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
c-Myc alone is enough to reprogram fibroblasts into functional macrophages
2024-09-12, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01605-x
PMID:39267119
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研究论文 | 本研究开发了一种通过c-Myc过表达将成纤维细胞重编程为功能性巨噬细胞的新方法 | 首次证明仅通过c-Myc单独过表达即可实现成纤维细胞向功能性巨噬细胞的重编程 | NA | 开发高效获取巨噬细胞的新方法以促进抗癌免疫治疗 | 成纤维细胞、巨噬细胞、白血病模型、乳腺癌模型、患者来源肿瘤异种移植模型 | 细胞重编程 | 白血病、乳腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、分子生物学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2025-10-07 |
Pharmacological targets and validation of remdesivir for the treatment of COVID-19-associated pulmonary fibrosis: A network-based pharmacology and bioinformatics study
2024-Sep-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039062
PMID:39331891
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研究论文 | 通过生物信息学和网络药理学方法研究瑞德西韦治疗COVID-19相关肺纤维化的靶点和分子机制 | 首次系统整合网络药理学、分子对接和单细胞测序数据验证瑞德西韦对COVID-19相关肺纤维化的多靶点作用机制 | 研究主要基于公开数据库的预测分析，需要后续实验验证 | 探究瑞德西韦治疗COVID-19相关肺纤维化的药理靶点和作用机制 | 瑞德西韦、COVID-19和肺纤维化的共同靶点 | 生物信息学 | COVID-19相关肺纤维化 | 网络药理学、生物信息学分析、分子对接、单细胞测序 | 蛋白互作网络分析、转录因子调控网络分析 | 组学数据、测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-07 |
Cytokines reprogram airway sensory neurons in asthma
2024-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.525731
PMID:39345572
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研究论文 | 本研究揭示了哮喘中细胞因子如何重编程气道感觉神经元及其在过敏反应中的作用机制 | 发现了一类特异性支配气道的炎症性迷走伤害感受神经元，并阐明了IL-13通过JAK/STAT6通路驱动神经元重编程的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究过敏性气道炎症中伤害感受神经元获得促炎特性的分子机制 | 小鼠气道伤害感受神经元和肺免疫细胞 | 神经免疫学 | 哮喘 | 逆行追踪、谱系报告、单细胞RNA测序、细胞特异性基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞测序数据 | 卵清蛋白诱导的气道炎症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-07 |
Aberrant activation of wound healing programs within the metastatic niche facilitates lung colonization by osteosarcoma cells
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.10.575008
PMID:38260361
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了骨肉瘤细胞通过诱导肺纤维化形成转移前微环境的机制，并验证了抗纤维化药物尼达尼布的治疗潜力 | 首次发现骨肉瘤细胞通过诱导肺泡上皮损伤和慢性伤口愈合表型来创建肺转移前微环境，并证明抗纤维化药物可阻断此过程 | 研究主要基于小鼠模型和异种移植模型，人类样本验证有限 | 阐明骨肉瘤肺转移前微环境形成的细胞和分子机制，并寻找转移特异性治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺组织微环境、免疫活性小鼠模型、免疫缺陷人源异种移植模型 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多参数免疫荧光 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据, 空间定位数据 | 免疫活性小鼠模型和免疫缺陷人源异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-07 |
MSIsensor-RNA: Microsatellite Instability Detection for Bulk and Single-cell Gene Expression Data
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae004
PMID:39341794
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研究论文 | 开发了一种基于基因表达数据检测微卫星不稳定性的软件工具MSIsensor-RNA | 首个能够同时处理批量和单细胞基因表达数据的MSI检测方法 | 未在摘要中明确说明 | 开发微卫星不稳定性检测工具 | 批量和单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序, 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-07 |
SCancerRNA: Expression at the Single-cell Level and Interaction Resource of Non-coding RNA Biomarkers for Cancers
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae023
PMID:39341795
|
研究论文 | 开发了一个名为SCancerRNA的综合性数据库，用于汇总非编码RNA生物标志物在单细胞水平的表达数据和相互作用网络 | 首个系统整理单细胞水平非编码RNA生物标志物表达数据的在线资源，整合了多种ncRNA类型及其相互作用网络 | 数据库内容依赖于已有的实验支持数据，可能无法覆盖所有相关研究 | 构建一个全面的非编码RNA生物标志物数据库，支持癌症诊断和治疗监测 | 长链非编码RNA、microRNA、PIWI互作RNA、小核仁RNA和环状RNA等非编码RNA生物标志物 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、相互作用网络数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-07 |
A targetable type III immune response with increase of IL-17A expressing CD4+ T cells is associated with immunotherapy-induced toxicity in melanoma
2024-09, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00810-4
PMID:39210005
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研究论文 | 本研究探讨了免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤时引发不良反应的免疫机制，发现III型免疫反应和IL-17A表达CD4+T细胞与免疫治疗毒性相关 | 首次揭示了III型免疫反应特征和IL-17A表达CD4+T细胞在免疫治疗毒性中的作用，并提供了抗IL-17A治疗不良反应的概念验证证据 | 样本量有限，抗IL-17A治疗仅在两名患者中验证，需要更大规模的临床试验确认疗效 | 研究免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤时引发不良反应的免疫机制 | 黑色素瘤患者接受免疫检查点抑制剂治疗期间出现不良反应的患者 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 蛋白质组学分析、多重细胞因子检测、流式细胞术、多重免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 血清蛋白质组数据、细胞因子数据、流式细胞数据、组织病理数据、空间转录组数据 | 未明确具体样本数量，包括血清样本、外周血样本、皮肤皮疹和结肠炎组织样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-07 |
Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease
2024-09, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae098
PMID:40162103
|
研究论文 | 评估FFPE乳腺组织中细胞类型反卷积方法的性能，并开发用于良性乳腺疾病分析的R包 | 构建了乳腺组织单细胞RNA-seq参考数据，测试了多种反卷积方法在FFPE样本中的表现，发现深度学习方法的优越性 | FFPE伪影显著影响反卷积方法的准确性，RMSE误差范围在0.04-0.17之间 | 优化从FFPE样本中定义个体细胞类型组成的策略 | 良性乳腺疾病组织 | 生物信息学 | 乳腺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 数字病理学 | 深度学习, 细胞类型反卷积方法 | 转录组数据, 图像数据 | 62个良性乳腺疾病RNA-seq样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2025-10-07 |
Gene expansions contributing to human brain evolution
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.26.615256
PMID:39386494
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研究论文 | 本研究通过分析完整的人类基因组序列，识别了与人类大脑进化相关的基因复制事件 | 首次利用完整端粒到端粒人类基因组序列(T2T-CHM13)系统识别人类特异性基因复制，并通过斑马鱼模型验证这些基因在大脑发育中的功能 | 研究主要关注基因复制事件，可能忽略了其他类型的基因组变异对大脑进化的贡献 | 探索人类大脑进化过程中基因复制事件的贡献 | 人类基因组序列、大脑转录组数据、斑马鱼模型 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序、单细胞RNA-seq、CRISPR基因编辑 | NA | 基因组序列、转录组数据、图像、行为数据 | 200个不同祖先背景的现代人类样本，多个斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 长读长测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-07 |
Inferring Characteristics of the Tumor Immune Microenvironment of Patients with HNSCC from Single-Cell Transcriptomics of Peripheral Blood
2024-09-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0092
PMID:39113621
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研究论文 | 本研究探索从头颈鳞状细胞癌患者外周血单细胞转录组数据推断肿瘤免疫微环境特征的可能性 | 首次证明可从外周血单细胞RNA测序数据推断肿瘤免疫微环境中的免疫细胞比例和基因表达谱，并开发了TIMEP预测工具 | 研究样本量有限，需要在更大规模研究中验证 | 探索从外周血推断肿瘤免疫微环境特征的方法及其在癌症免疫治疗中的应用价值 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个头颈鳞状细胞癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 外周血单个核细胞和肿瘤组织的单细胞RNA测序 |
| 153 | 2025-10-07 |
Trem2 deficiency attenuates breast cancer tumor growth in lean, but not obese or weight loss, mice and is associated with alterations of clonal T cell populations
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614811
PMID:39386686
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2缺陷在不同体重状态下对乳腺癌肿瘤生长的影响及其与T细胞克隆群体的关联 | 首次揭示TREM2缺陷在瘦小鼠而非肥胖或减重小鼠中抑制肿瘤生长，并发现肿瘤与周围脂肪组织间存在共享的T细胞克隆型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究肥胖与乳腺癌预后的关联机制及TREM2在其中的作用 | 绝经后乳腺癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | 基因敲除模型 | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 不同饮食干预组的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-07 |
Analyses of combined Merkel cell carcinomas with neuroblastic components suggests that loss of T antigen expression in Merkel cell carcinoma may result in cell cycle arrest and neuroblastic transdifferentiation
2024-09, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6304
PMID:39049595
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研究论文 | 本研究通过对两例合并神经母细胞分化的默克尔细胞癌进行多组学分析，探讨了T抗原表达缺失导致细胞周期停滞和神经母细胞转分化的机制 | 首次对合并神经母细胞分化的默克尔细胞癌进行全面的形态学、免疫组化、转录组、遗传和表观遗传特征分析，揭示了T抗原表达缺失与神经母细胞转分化的关联 | 仅分析了两例罕见病例，样本量有限 | 探究默克尔细胞癌中神经母细胞分化的分子机制 | 两例合并神经母细胞分化的默克尔细胞癌病例 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 全外显子测序,空间转录组学,DNA甲基化分析,免疫组化 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观遗传数据,病理图像 | 2例老年男性患者的肿瘤样本 | NA | 全外显子测序,空间转录组学,DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes and chromatin accessibility of endothelial cells unravel transcription factors associated with dysregulated angiogenesis in systemic sclerosis
2024-Sep-30, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225415
PMID:38754983
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了系统性硬化症中内皮细胞的转录组和染色质可及性变化，发现ETS转录因子家族在血管异常调控中的关键作用 | 首次在系统性硬化症中整合单细胞转录组和染色质可及性分析，识别出ELK4、ERF和ETS1作为调控血管异常的新靶点 | 样本量相对有限，主要聚焦皮肤组织，需要进一步验证这些发现在其他血管床的普适性 | 阐明系统性硬化症中内皮细胞功能障碍的分子机制 | 系统性硬化症患者和对照的内皮细胞 | 单细胞组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, 免疫荧光染色, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 156 | 2025-10-07 |
Multimodal contrastive learning for spatial gene expression prediction using histology images
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae551
PMID:39471412
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研究论文 | 提出一种基于多模态对比学习的空间基因表达预测方法mclSTExp，使用组织学图像预测空间转录组数据 | 将每个斑点视为'单词'，通过Transformer自注意力机制整合内在特征与空间上下文，并利用对比学习融合图像特征 | 仅在乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌数据集上进行了评估，未验证在其他癌症类型上的泛化能力 | 开发成本效益高的空间基因表达预测方法 | 乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌组织样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌,皮肤鳞状细胞癌 | 多模态对比学习,Transformer,自注意力机制 | Transformer,Densenet-121 | 图像,空间基因表达数据 | 两个乳腺癌数据集和一个皮肤鳞状细胞癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-07 |
Comprehensive Characterization of a Subfamily of Ca2+-Binding Proteins in Mouse and Human Retinal Neurons at Single-Cell Resolution
2024-Sep, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0145-24.2024
PMID:39260891
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术全面分析小鼠和人类视网膜神经元中钙结合蛋白亚家族的表达谱 | 首次在单细胞分辨率下系统比较小鼠和人类视网膜神经元中CaBP1-5的表达模式，发现双极细胞共表达多种CaBP而非单一蛋白 | 研究主要基于转录组数据，蛋白质水平验证不足；功能机制研究有待深入 | 阐明CaBP1、CaBP2和CaBP5在视网膜神经元中的表达模式和潜在功能 | 小鼠和人类视网膜神经元（包括无长突细胞、神经节细胞、水平细胞和双极细胞） | 单细胞转录组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞逆转录聚合酶链反应 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类视网膜神经元单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2025-10-07 |
IKKε-deficient macrophages impede cardiac repair after myocardial infarction by enhancing the macrophage-myofibroblast transition
2024-Sep, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01304-0
PMID:39261656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和磷酸化蛋白阵列技术，揭示了IKKε缺失通过增强巨噬细胞-肌成纤维细胞转化导致心肌梗死后心脏修复障碍的机制 | 首次发现IKKε-p38轴通过调控巨噬细胞-肌成纤维细胞转化影响心肌梗死后的心脏修复过程 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究IKKε在心肌梗死后炎症反应和心脏修复中的调控作用 | 心肌梗死小鼠模型中的心脏巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白阵列 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | IKKε敲除小鼠和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-07 |
An initial game-theoretic assessment of enhanced tissue preparation and imaging protocols for improved deep learning inference of spatial transcriptomics from tissue morphology
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae476
PMID:39367648
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研究论文 | 本研究通过改进组织制备和成像方案，评估其对基于深度学习的空间转录组学形态学推断性能的影响 | 首次从博弈论角度评估组织处理标准化对空间转录组学深度学习模型性能的边际效益 | 研究样本量有限（仅13例结直肠癌患者），需要更大规模验证 | 探索优化组织制备和成像方案对空间转录组学形态学推断模型性能的提升效果 | 13例病理T分期III期结直肠癌患者组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 空间转录组学，深度学习 | Inceptionv3 | 全切片图像 | 13例结直肠癌患者 | 10x Genomics, Leica | 空间转录组学 | Visium CytAssist, Leica Bond | Visium CytAssist检测，自动化苏木精-伊红染色，40×分辨率成像 |
| 160 | 2025-10-07 |
An integrated single-cell reference atlas of the human endometrium
2024-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01873-w
PMID:39198675
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研究论文 | 构建了一个高分辨率的人类子宫内膜单细胞参考图谱，整合了63位女性的单细胞转录组数据 | 首次创建了人类子宫内膜细胞图谱(HECA)，识别了先前未报告的细胞类型，并通过空间转录组学进行原位定位验证 | 样本数量相对有限(63位女性)，需要进一步扩大样本规模验证发现 | 建立人类子宫内膜的高分辨率单细胞参考图谱，研究子宫内膜生理和疾病机制 | 人类子宫内膜组织，包括患有和未患有子宫内膜异位症的女性 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序，空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 313,527个细胞(单细胞数据集)，312,246个细胞核(单核数据集)，来自63位捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，单核RNA-seq | NA | NA |