单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
A sexually dimorphic hepatic cycle of periportal VLDL generation and subsequent pericentral VLDLR-mediated re-uptake
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52751-2
PMID:39341814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝脏功能在空间和时间上的性别二态性，特别是极低密度脂蛋白的生成与摄取循环 | 首次发现肝脏中存在性别二态性的门静脉周围VLDL生成和中央静脉周围VLDLR介导的再摄取循环 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 探究性别二态性如何影响肝脏功能的时空逻辑 | 小鼠肝脏和人类肝脏组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-10-06 |
Hypoxia induces ROS-resistant memory upon reoxygenation in vivo promoting metastasis in part via MUC1-C
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51995-2
PMID:39341835
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研究论文 | 本研究揭示缺氧通过诱导MUC1-C上调形成ROS抵抗性记忆，促进乳腺癌转移的机制 | 首次发现缺氧细胞在复氧后仍保持缺氧诱导基因表达，并鉴定MUC1-C在介导ROS抵抗和转移中的关键作用 | 主要基于动物模型和体外实验，临床验证仍需进一步研究 | 探究缺氧诱导肿瘤转移的分子机制 | 乳腺癌细胞、循环肿瘤细胞(CTCs)、患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、基因敲除、药物抑制 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq
2024-09-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52717-4
PMID:39333520
|
研究论文 | 本研究在单细胞RNA测序中引入合成热稳定RNase抑制剂，证明其性能优于传统蛋白质类RNase抑制剂 | 首次将合成热稳定RNase抑制剂应用于单细胞RNA测序，可在热循环过程中保持RNase抑制活性 | 未明确说明样本规模和具体实验条件的局限性 | 改进单细胞RNA测序中的RNase抑制方法 | RNase抑制剂在单细胞RNA测序中的应用 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
The estrogen response in fibroblasts promotes ovarian metastases of gastric cancer
2024-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52615-9
PMID:39349474
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素通过激活ER-MDK-LRP1信号轴促进胃癌卵巢转移的分子机制 | 首次在单细胞水平发现卵巢转移灶中成纤维细胞高表达雌激素受体和中期因子，并阐明雌激素-MDK-LRP1信号轴在胃癌卵巢转移中的关键作用 | 样本量相对有限（18例患者），需要更大规模研究验证 | 探究胃癌卵巢转移的分子机制，特别是雌激素在其中的作用 | 18例伴有卵巢转移的胃癌患者的45个肿瘤样本 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例患者的45个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
Protocol for optimized nasal mucosa sample processing to obtain high-quality scRNA-seq and scATAC-seq data
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103298
PMID:39244757
|
研究论文 | 提出优化的人类鼻黏膜样本处理流程，用于同时获取高质量单细胞转录组和表观基因组数据 | 开发了能够同时获得高质量scRNA-seq和scATAC-seq数据的鼻黏膜样本处理协议 | NA | 优化鼻黏膜样本处理流程以提高单细胞测序数据质量 | 人类鼻黏膜组织 | 单细胞测序技术 | 鼻腔疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-06 |
VisualZoneR: A computational protocol to identify compartmental zones from single-cell spatial transcriptomics using R
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103196
PMID:39067026
|
研究论文 | 介绍一种基于R语言的VisualZoneR计算协议，用于从单细胞空间转录组数据中识别区室化区域 | 开发了专门用于分析Visium和Visium HD空间转录组数据的R语言工具，能够识别从健康组织到转移区域的不同区室 | NA | 建立从单细胞空间转录组数据中识别区室化区域的计算方法 | 肝脏组织，包括健康肝组织和转移区域 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Visium HD | 10x Visium空间转录组技术 |
| 127 | 2025-10-06 |
Protocol for analysis of single-cell sequencing data by Seqtometry
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103209
PMID:39096493
|
研究论文 | 介绍用于单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据分析的Seqtometry分析平台协议 | 提出基于基因特征高级评分的Seqtometry分析平台，可直接通过生物学可解释维度识别和表征特定细胞 | NA | 开发单细胞测序数据分析协议 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Protocol to achieve high-resolution single-cell transcriptomics of cardiomyocytes in multiple species
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103194
PMID:39096494
|
研究论文 | 提供从多种物种中获取心肌细胞高分辨率单细胞转录组测序的详细实验方案 | 开发了适用于稀有心肌细胞群体（如再生/分裂细胞）的scRNA-seq方案，支持跨物种应用 | NA | 建立高质量单细胞转录组测序的实验流程 | 小鼠和斑马鱼心脏以及诱导多能干细胞中的心肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-10-06 |
Protocol to study the immune profile of syngeneic mouse tumor models
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103139
PMID:38878286
|
研究论文 | 本文提供了一个用于研究同源小鼠肿瘤模型免疫特征的实验方案 | 整合了流式细胞术和单细胞RNA测序等多种技术来全面表征肿瘤微环境的免疫特征 | NA | 建立标准化流程来研究小鼠肿瘤模型的免疫特征 | 荷瘤小鼠的肿瘤组织和免疫相关器官 | 数字病理学 | 肿瘤 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 单细胞悬液制备 | NA | 单细胞数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
Protocol for preparing mammalian skin samples encompassing hair follicles for spatial transcriptomics
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103254
PMID:39146191
|
方法论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学的哺乳动物皮肤样本制备方案，特别关注包含毛囊的样本 | 针对皮肤组织空间转录组学分析的挑战，开发了专门的样本制备流程 | 仅提供实验方案，未包含实际应用数据验证 | 建立适用于皮肤组织空间转录组学分析的标准化样本制备方法 | 哺乳动物皮肤组织样本，特别是包含毛囊的区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 131 | 2024-09-04 |
Hydatidiform mole identification using non-invasive single-cell sequencing of fetal circulating extravillous trophoblasts isolated from maternal blood
2024-09, Ultrasound in obstetrics & gynecology : the official journal of the International Society of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/uog.27615
PMID:38354218
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
WGCNA reveals a biomarker for cancer-associated fibroblasts to predict prognosis in cervical cancer
2024-Sep-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000001129
PMID:38946034
|
研究论文 | 通过WGCNA识别癌症相关成纤维细胞生物标志物并构建宫颈癌预后预测模型 | 首次基于CAF相关基因构建宫颈癌预后模型，并通过单细胞测序和实验验证关键基因在成纤维细胞中的特异性表达 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发基于癌症相关成纤维细胞基因特征的宫颈癌预后预测模型 | 宫颈癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，实时荧光定量PCR，免疫组织化学 | LASSO Cox回归模型，WGCNA网络分析 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和GEO数据库中的宫颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
Multimodal Spatial Profiling Reveals Immune Suppression and Microenvironment Remodeling in Fallopian Tube Precursors to High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.615007
PMID:39386723
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研究论文 | 通过整合高plex成像和空间转录组学分析输卵管前体病变向高级别浆液性卵巢癌发展的分子变化和肿瘤微环境重塑 | 首次通过多模态空间分析揭示输卵管前体病变中染色体不稳定性、持续性干扰素信号传导及免疫失调等分子变化 | 研究样本数量未明确说明，且仅关注输卵管前体病变向HGSOC的转变过程 | 阐明输卵管前体病变向高级别浆液性卵巢癌发展的分子机制和肿瘤微环境变化 | 人类输卵管组织样本，包括p53特征、浆液性输卵管上皮内癌和侵袭性HGSOC | 数字病理学 | 卵巢癌 | 高plex成像, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
Bronchopulmonary Dysplasia with Pulmonary Hypertension Associates with Loss of Semaphorin Signaling and Functional Decrease in FOXF1 Expression
2024-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609955
PMID:39253423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析早产儿肺组织，揭示了支气管肺发育不良伴肺动脉高压与信号素信号通路缺失及FOXF1表达功能下降的关联 | 首次在人类早产儿肺组织中通过单细胞RNA测序识别出BPD+PH特有的异常毛细血管细胞状态，并发现信号素引导信号通路缺陷 | 样本量相对有限，需要在更大队列中验证发现 | 探究驱动人类支气管肺发育不良发展的细胞和分子动态机制 | 早产儿肺组织（BPD和BPD+PH阶段）与足月婴儿肺组织的对比 | 单细胞基因组学 | 支气管肺发育不良，肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 早产儿和足月婴儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
Light and dopamine impact two circadian neurons to promote morning wakefulness
2024-Sep-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.07.056
PMID:39142287
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研究论文 | 本研究揭示了果蝇中两个表达ITP的昼夜节律神经元如何通过光和多巴胺信号调控早晨觉醒行为 | 首次发现两个ITP LN神经元具有早晨功能，并阐明光通过上调Dop1R1受体增强多巴胺信号促进早晨觉醒的机制 | 研究仅针对果蝇模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究果蝇昼夜节律神经元调控早晨觉醒行为的分子机制 | 果蝇的昼夜节律神经元，特别是两个表达离子运输肽(ITP)的侧神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞测序，CRISPR-Cas9基因编辑，体外活体成像，cAMP检测 | NA | 基因表达数据，行为数据，成像数据 | 果蝇神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
Analyzing embryo dormancy at single-cell resolution reveals dynamic transcriptional responses and activation of integrin-Yap/Taz prosurvival signaling
2024-Sep-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.06.015
PMID:39047740
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠胚胎滞育过程，揭示转录动态变化及整合素-Yap/Taz促生存信号通路的激活机制 | 首次在单细胞分辨率下分子定义胚胎滞育状态，发现休眠多能细胞通过整合素受体感知微环境并通过Yap/Taz信号维持存活的新机制 | 研究仅使用小鼠胚胎模型，未验证其他哺乳动物物种 | 解析胚胎滞育的分子调控机制 | 小鼠胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
A conserved cell-type gradient across the human mediodorsal and paraventricular thalamus
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.03.611112
PMID:39282422
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研究论文 | 通过单核和空间转录组学揭示人类丘脑背内侧核和室旁核中保守的兴奋性神经元梯度 | 发现跨物种保守的兴奋性神经元梯度，揭示人类MD区域相较于小鼠的扩张特征，并建立特定神经元亚群与精神疾病遗传风险的关联 | NA | 解析丘脑背内侧核及相邻中线核团的细胞组成及其与精神疾病的关联 | 人类和小鼠的丘脑背内侧核及室旁核区域 | 空间转录组学 | 精神疾病 | 单核转录组测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
Proteomic signatures improve risk prediction for common and rare diseases
2024-Sep, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-03142-z
PMID:39039249
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研究论文 | 本研究通过整合约3000种血浆蛋白质与临床信息，开发了针对218种常见和罕见疾病的稀疏预测模型 | 首次在大规模人群（41,931人）中系统评估血浆蛋白质组学对多种疾病风险预测的价值，并证明仅需5-20个蛋白质的稀疏模型优于传统临床预测模型 | 研究主要基于英国生物银行数据，需要在其他人群中进一步验证模型泛化能力 | 评估血浆蛋白质组学在常见和罕见疾病风险预测中的临床效用 | 41,931名英国生物银行参与者，涵盖218种常见和罕见疾病（81-6,038病例） | 生物医学信息学 | 多种疾病（包括多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、运动神经元疾病等） | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | 稀疏预测模型 | 蛋白质组数据，临床信息，单细胞RNA测序数据 | 41,931名个体，涵盖218种疾病 | NA | 蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07797-z
PMID:39112713
|
研究论文 | 本研究通过建立RAS剂量递增模型，揭示了致癌RAS剂量驱动的非线性表型连续谱及其在肿瘤发生中的作用 | 首次系统性地展示了致癌RAS剂量如何驱动从衰老到肿瘤起始的非线性表型连续谱 | 研究主要聚焦于肝细胞模型，其他细胞类型和组织中的表现仍需进一步验证 | 探究致癌RAS剂量对细胞衰老状态和肿瘤发生的影响 | 肝细胞和肝癌发生过程 | 癌症生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Subcellular Level Spatial Transcriptomics with PHOTON
2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612328
PMID:39314454
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研究论文 | 介绍PHOTON方法实现亚细胞分辨率空间转录组分析 | 结合高分辨率成像与高通量测序，实现亚细胞水平空间转录组分析 | NA | 开发亚细胞分辨率空间转录组分析方法 | 卵巢颗粒细胞、核仁、应激颗粒中的RNA | 空间转录组学 | NA | 高分辨率成像、高通量测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | PHOTON | PHOTON（纳米尺度转录组光选法） |