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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis of adult hippocampal neurogenesis in the human brain
2024 Sep-Oct, Journal of psychiatry & neuroscience : JPN
IF:4.1Q1
DOI:10.1503/jpn.240026
PMID:39414359
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研究论文 | 通过空间转录组学和多重荧光原位杂交技术研究人类大脑中成人海马神经发生的分布和特征 | 首次在人类死后海马样本中结合空间转录组学和多重荧光原位杂交技术评估成人海马神经发生现象 | 样本量较小且仅包含男性样本 | 评估人类成人海马神经发生的存在和特征 | 死后人类齿状回样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | NA | 空间转录组数据, 荧光原位杂交图像 | 婴儿1例(2岁), 青少年1例(16岁), 年轻成人2例(平均23.5岁), 中年男性8例(平均43岁) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2025-10-06 |
Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages (LAMs)
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614807
PMID:39386558
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了脂质相关巨噬细胞(LAMs)在多个组织和炎症条件下的保守性和组织特异性转录谱 | 首次系统性地比较了不同组织和炎症条件下LAMs的转录组特征，发现了保守性和组织特异性的基因程序 | 研究主要基于小鼠和人类的单细胞RNA测序数据，需要进一步的功能验证实验 | 探究脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录组特征及其在代谢性疾病中的作用 | 小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞(LAMs) | 单细胞转录组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织和疾病模型的小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
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研究论文 | 本研究揭示了中脑胆碱能神经元通过M1和M3毒蕈碱受体促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现胆碱能神经元活动通过长程投射和毒蕈碱信号通路特异性促进DMG生长，并揭示了与健康少突胶质前体细胞的平行增殖效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统，在人类患者中的直接验证仍需进一步研究 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、中脑胆碱能神经元、少突胶质前体细胞 | 神经肿瘤学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 | 小鼠疾病模型、hiPSC衍生神经元模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据、电生理数据 | 原发性患者DMG样本、小鼠模型、体外共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data analysis utilizing multi-type graph neural networks
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108921
PMID:39059210
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研究论文 | 提出一种利用多类型图神经网络和去噪自编码器的单细胞RNA测序数据分析模型 | 将零膨胀负二项模型与去噪自编码器结合，并集成多类型图神经网络处理单细胞数据 | NA | 解决单细胞RNA测序数据降维、去噪和聚类分析的技术难题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 去噪自编码器, 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108989
PMID:39142223
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，建立了癌症相关成纤维细胞miRNA特征模型来预测前列腺癌复发 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据构建CAFs相关miRNA预后模型，并鉴定出miR-106b-5p作为潜在治疗靶点 | 研究样本量相对有限，需要更大规模验证 | 建立CAFs相关miRNA模型以评估前列腺癌预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选 | 前列腺癌患者样本和成纤维细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, CCK8, 伤口愈合实验, 克隆形成实验, 细胞迁移实验 | Lasso, 随机森林, 支持向量机 | RNA测序数据 | 34例前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Transcriptional profiling in microglia across physiological and pathological states identifies a transcriptional module associated with neurodegeneration
2024-09-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06684-7
PMID:39294270
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研究论文 | 通过整合分析人类小胶质细胞的转录组数据，识别出在神经退行性疾病中共享的转录特征 | 整合多个神经退行性疾病的单细胞RNA-seq数据集，发现跨疾病共享的小胶质细胞转录特征，并将遗传变异与转录特征相关联 | 基于公开数据集进行二次分析，可能受原始数据质量和样本来源限制 | 识别小胶质细胞在生理和病理状态下的转录特征，探索其在神经退行性疾病中的作用 | 人类小胶质细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组关联分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 基因组数据 | 多个公开数据集，涵盖阿尔茨海默病、多发性硬化症和帕金森病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-10-06 |
SPRR1B+ keratinocytes prime oral mucosa for rapid wound healing via STAT3 activation
2024-09-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06864-5
PMID:39300285
|
研究论文 | 本研究通过整合分析口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的单细胞测序数据，揭示了STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在促进口腔黏膜快速愈合中的关键作用 | 首次发现STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在正常口腔黏膜中固有存在，而在正常皮肤中缺失，这一细胞亚群通过促进角质形成细胞迁移来加速伤口愈合 | 研究主要基于小鼠模型验证，在人类临床样本中的验证仍需进一步深入 | 探究口腔黏膜快速伤口愈合的细胞机制 | 口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的角质形成细胞 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | bulk mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 小鼠模型和人类口腔/皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Unraveling the spatial organization and development of human thymocytes through integration of spatial transcriptomics and single-cell multi-omics profiling
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51767-y
PMID:39237503
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据解析人类胸腺细胞的空间组织和发育过程 | 开发了TSO-his工具整合多模态数据，首次在单细胞分辨率重建胸腺空间结构，发现CD8αα与记忆B细胞和单核细胞的新共定位关系 | NA | 解析人类胸腺的空间组织和T细胞发育机制 | 人类胸腺细胞 | 空间生物学 | 免疫系统疾病 | 空间转录组学,单细胞多组学测序,VDJ测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞多组学数据,VDJ序列数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞多组学,VDJ测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Symbiotic symphony: Understanding host-microbiota dialogues in a spatial context
2024 Sep-Oct, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2024.03.001
PMID:38564842
|
综述 | 探讨在空间背景下研究宿主与微生物群对话的重要性及方法 | 强调空间转录组学技术在解析宿主-微生物相互作用中的创新应用，突破传统分离研究的局限 | 早期生命微生物研究中生物量有限，需在低生物量框架下进行分析 | 全面理解宿主与微生物群在空间背景下的相互作用机制 | 人类宿主与相关微生物群 | 空间转录组学 | 局部感染和炎症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Genomic and immune heterogeneity of multiple synchronous lung adenocarcinoma at different developmental stages
2024-09-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52139-2
PMID:39256403
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析多发性同步肺癌在不同发展阶段的基因组和免疫异质性 | 首次在单细胞分辨率揭示多发性同步肺癌从癌前病变到浸润性腺癌演变过程中的克隆独立性、趋同进化和免疫微环境动态变化 | 样本量较小（8例患者16个肿瘤），需要更大队列验证发现 | 探索多发性同步肺癌不同病理阶段的基因组和免疫异质性 | 8例多发性同步肺癌患者的16个肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,全外显子组测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,免疫组库数据 | 8例患者的16个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR测序,全外显子组测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
Glioblastoma cells increase expression of notch signaling and synaptic genes within infiltrated brain tissue
2024-09-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52167-y
PMID:39251578
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的基因表达差异 | 首次揭示浸润脑组织中的恶性细胞表现出神经发育通路和胶质细胞分化相关基因表达增加的空间特征 | 样本量较小(n=11)，且浸润脑组织的特征描述仍不够全面 | 探索胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的空间基因表达差异 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织和浸润脑组织中的恶性细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 11例样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
ST-GEARS: Advancing 3D downstream research through accurate spatial information recovery
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51935-0
PMID:39242563
|
研究论文 | 提出ST-GEARS系统通过精确空间信息恢复推进3D空间转录组学研究 | 引入分布式约束优化方案和数学证明的双截面场应用，实现跨截面锚点的超精确连接和原始空间谱系恢复 | 未明确说明系统在不同组织类型或复杂变形场景下的适用性限制 | 解决3D空间转录组学中空间信息丢失和实验变形导致的下游分析不可靠问题 | 三维空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 优化模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 3D空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
Intracellular spatial transcriptomic analysis toolkit (InSTAnT)
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49457-w
PMID:39242579
|
研究论文 | 开发了一种用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT | 首个专门用于单分子分辨率空间转录组数据分析的工具包，能够检测基因对和模块在细胞内及细胞间的共定位模式 | NA | 开发计算工具以解锁空间转录组数据在发现亚细胞生物模式方面的潜力 | 五个不同数据集，代表两种细胞系、两个脑结构、两个物种和三种不同技术 | 空间转录组学 | NA | 多重误差稳健荧光原位杂交(MERFISH)，空间转录组学 | 统计检验和算法 | 空间转录组数据 | 五个数据集 | NA | 空间转录组学，单分子分辨率成像 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
Cellular origin and clonal evolution of human dedifferentiated liposarcoma
2024-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52067-1
PMID:39266532
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示了人去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化机制 | 首次鉴定出肿瘤脂肪干细胞作为DDLPS的细胞起源，并证明其具有多能性特征 | 研究样本仅来自原发肿瘤，未涉及转移性病灶 | 探究去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化过程 | 人原发去分化脂肪肉瘤的成对分化良好和去分化组分 | 数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序, DNA测序, 原位多重免疫荧光, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 图像数据 | 原发DDLPS肿瘤的成对WD和DD组分 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
Maf expression in B cells restricts reactive plasmablast and germinal center B cell expansion
2024-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52224-6
PMID:39266537
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研究论文 | 本研究揭示了Maf在B细胞中作为晚期B细胞分化、浆母细胞增殖和生发中心B细胞形成的负调控因子 | 首次证明Maf在B细胞中通过调控细胞代谢、转运活性和线粒体蛋白来限制浆母细胞和生发中心B细胞的扩张 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类B细胞中验证 | 探究Maf在B细胞分化和免疫应答中的调控作用 | B细胞特异性Maf缺失小鼠的B细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Maf缺陷小鼠和野生型对照小鼠的脾脏B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-10-06 |
Immune profiling-based targeting of pathogenic T cells with ustekinumab in ANCA-associated glomerulonephritis
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52525-w
PMID:39300109
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组分析识别ANCA相关性肾小球肾炎中的致病性T细胞，并验证ustekinumab靶向治疗的潜力 | 首次通过空间和单细胞转录组分析揭示ANCA-GN中致病性T细胞的分子特征，并应用数字药理学方法识别ustekinumab作为潜在治疗药物 | 样本量较小（34例分析样本，4例治疗病例），随访时间较短（26周），需要更大规模的临床试验验证 | 开发针对ANCA相关性肾小球肾炎的精准免疫治疗方法 | ANCA相关性血管炎患者的肾脏组织和外周血样本 | 数字病理学 | ANCA相关性血管炎/肾小球肾炎 | 空间转录组分析,单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据,临床数据 | 34例ANCA-GN患者肾脏样本，4例复发患者接受治疗 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
Detecting anomalous anatomic regions in spatial transcriptomics with STANDS
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52445-9
PMID:39300113
|
研究论文 | 提出基于生成对抗网络的STANDS框架，用于从多样本空间转录组数据中检测和对齐异常组织区域 | 首个能够从多样本空间转录组数据中进行从头异常组织区域检测与解析的方法，整合了多模态学习、迁移学习和风格迁移技术 | 需要正常空间转录组数据集进行对比分析，但这些数据集通常稀缺 | 开发空间转录组数据分析方法，检测和解析异常组织区域 | 多样本空间转录组数据中的异常组织区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | GAN | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-06 |
PRDM3/16 regulate chromatin accessibility required for NKX2-1 mediated alveolar epithelial differentiation and function
2024-09-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52154-3
PMID:39284798
|
研究论文 | 本研究揭示了PRDM3和PRDM16通过调控染色质可及性介导NKX2-1依赖的肺泡上皮细胞分化机制 | 首次发现PRDM3/PRDM16组蛋白甲基转移酶通过调控染色质可及性影响NKX2-1转录靶点，从而介导肺泡上皮细胞分化 | 研究主要关注围产期肺泡上皮细胞分化，对其他发育阶段的影响尚未明确 | 探究PRDM3和PRDM16在肺泡上皮细胞分化和功能中的调控机制 | 小鼠肺内胚层细胞和AT2肺泡上皮细胞 | 表观遗传学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CUT&RUN | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
Integration of scHi-C and scRNA-seq data defines distinct 3D-regulated and biological-context dependent cell subpopulations
2024-09-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52440-0
PMID:39333113
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研究论文 | 开发了一种整合scHi-C和scRNA-seq数据的计算方法，用于定义3D染色质结构调控的细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下整合3D染色质结构和基因表达数据，提出了拓扑整合亚群(TISPs)的新概念 | 方法主要在乳腺癌细胞模型系统中验证，需要进一步在其他癌症类型中测试 | 研究3D染色质结构如何调控细胞异质性，特别是在癌症发展中的作用 | 乳腺癌细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | scHi-C, scRNA-seq, 多组学数据整合 | MUDI算法 | 单细胞3D基因组数据, 单细胞转录组数据 | 公开数据和新生成数据，包含20个TISPs | NA | 单细胞Hi-C, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-06 |
Single Cell Expression Analysis of Ductal Carcinoma in Situ Identifies Complex Genotypic-Phenotypic Relationships Altering Epithelial Composition
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.10.561724
PMID:39386437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺导管原位癌，揭示基因型与表型关系的复杂性及其对上皮细胞组成的影响 | 首次在DCIS中结合单细胞RNA测序和推断的拷贝数变异进行系统发育分析，揭示肿瘤内克隆异质性与基因表达差异的关联 | 样本量相对有限，且主要基于回顾性档案样本分析 | 探索DCIS生长机制及向浸润性癌进展的关键特性 | 乳腺导管原位癌病变及匹配的正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异推断, 系统发育分析, 反卷积分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | DCIS病变和匹配正常组织的临床标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |