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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-08 |
HIV-1 control in vivo is related to the number but not the fraction of infected cells with viral unspliced RNA
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405210121
PMID:39190360
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序方法比较HIV控制者与非控制者外周血单个核细胞中携带未剪接HIV RNA的感染细胞比例 | 首次使用灵敏定量的单细胞测序方法直接验证HIV控制者病毒控制机制,发现病毒控制与感染细胞总数而非未剪接RNA表达比例相关 | 研究样本仅限外周血单个核细胞,未涉及其他组织部位;机制分析主要基于相关性而非因果验证 | 探究HIV控制者病毒控制的关键机制,特别是未剪接HIV RNA在感染细胞中的表达特征 | HIV控制者和非控制者的外周血单个核细胞 | 传染病学 | HIV/AIDS | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | HIV控制者和非控制者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-10-05 |
Mouse blood cells types and aging prediction using penalized Latent Dirichlet Allocation
2024-Sep-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10763-8
PMID:39294566
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研究论文 | 本研究开发了一种基于惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)的统计方法,用于分析小鼠血液单细胞RNA测序数据以预测细胞类型和衰老状态 | 提出了惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)这一新型统计方法,用于单细胞RNA测序数据的降维表示学习 | 仅使用小鼠血液数据进行验证,未在其他组织或物种中进行测试 | 开发计算方法来分析单细胞RNA测序数据,以理解衰老过程中的转录组变化 | 小鼠血液细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA) | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-10-05 |
Positional information modulates transient regeneration-activated cell states during vertebrate appendage regeneration
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110737
PMID:39286507
|
研究论文 | 本研究通过非洲鳉鱼尾鳍再生模型,揭示了基底表皮中短暂再生激活细胞状态如何通过调节细胞外基质传递位置信息调控附肢再生 | 首次发现基底表皮中的短暂再生激活细胞状态能够根据截肢位置特异性调节再生过程,并通过CRISPR-Cas9技术证明ECM修饰因子可解耦再生生长速率与截肢位置的关系 | 研究仅限于非洲鳉鱼尾鳍再生模型,在其它物种和组织的普适性有待验证 | 探索位置信息在脊椎动物附肢再生过程中的调控机制 | 非洲鳉鱼尾鳍再生过程中的细胞状态和组织动态 | 发育生物学 | 组织损伤与再生 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据, 组织形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-05 |
Vascular heterogeneity of tight junction Claudins guides organotropic metastasis
2024-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00813-1
PMID:39289595
|
研究论文 | 本研究揭示了器官特异性血管异质性通过调控紧密连接蛋白Claudins的表达决定乳腺癌器官倾向性转移的机制 | 首次阐明血管内皮细胞特异性Claudins蛋白表达差异是决定器官特异性转移的关键因素,独立于癌细胞内在机制 | 研究主要聚焦于肺和肾脏转移的对比,其他器官转移机制尚未完全探索 | 探究乳腺癌器官特异性转移的机制 | 转移性乳腺 carcinoma 模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-05 |
Multi-condition and multi-modal temporal profile inference during mouse embryonic development
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.03.583179
PMID:38496477
|
研究论文 | 提出Sunbear联合建模框架,用于整合多条件和多模态的单细胞时间序列数据 | 开发能够整合多条件和多模态单细胞时间序列数据的联合建模框架,实现单细胞时间谱变化插补、多数据集多模态谱对齐以及缺失模态的外推预测 | 基于破坏性单细胞测量技术,无法捕获特定细胞的完整时间轨迹 | 开发单细胞多条件多模态时间序列数据的整合分析方法 | 小鼠胚胎发育过程中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 联合建模框架 | 单细胞时间序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-05 |
Construction of thyroid cancer classification and iodine metabolism related diagnostic model using thyroid differentiation score and bioinformation
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039464
PMID:39252309
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研究论文 | 构建基于甲状腺分化评分和生物信息学的甲状腺癌分类及碘代谢相关诊断模型 | 首次结合甲状腺分化评分与碘代谢特征构建甲状腺癌诊断模型,识别出5个独立预测基因 | 模型验证主要依赖公共数据库数据,需要进一步临床前瞻性研究验证 | 开发甲状腺癌亚型分类诊断模型以提高诊疗准确性 | 甲状腺癌患者基因表达数据和临床病理信息 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 逻辑回归模型, 机器学习模型 | 基因表达谱, 临床数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的甲状腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies interferon-inducible monocytes/macrophages as a cellular target for mitigating the progression of abdominal aortic aneurysm and rupture risk
2024-09-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae117
PMID:38836630
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞是减轻腹主动脉瘤进展和破裂风险的细胞靶点 | 首次通过单细胞RNA测序在腹主动脉瘤中发现独特的干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞亚群,并揭示其在疾病进展中的关键作用 | 研究基于AngII灌注的ApoE-/-小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探索腹主动脉瘤发展和进展中涉及的细胞类型和信号通路 | AngII灌注的ApoE-/-小鼠腹主动脉标本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同病理特征的腹主动脉标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-10-05 |
Modeling Lewy body disease with SNCA triplication iPSC-derived cortical organoids and identifying therapeutic drugs
2024-09-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk3700
PMID:39259788
|
研究论文 | 利用SNCA基因三倍化iPSC来源的皮质类器官模拟路易体病并筛选治疗药物 | 首次建立人类皮质路易体病模型,通过高通量药物筛选发现四种能抑制α-突触核蛋白聚集的FDA批准药物 | 研究基于基因三倍化特定突变模型,可能无法完全代表散发性路易体病的病理机制 | 阐明α-突触核蛋白在皮质神经元中的病理机制并筛选治疗药物 | 路易体病患者来源的iPSC皮质类器官和兴奋性神经元 | 数字病理学 | 路易体病 | 单细胞RNA测序, 实时震动诱导转化试验 | 皮质类器官模型 | 基因表达数据, 蛋白质聚集数据 | 1280种FDA批准药物筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-05 |
A pheromone receptor in cichlid fish mediates attraction to females but inhibits male parental care
2024-Sep-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.07.029
PMID:39094572
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和基因编辑技术揭示了慈鲷鱼类中信息素受体Or113a在调控雄性求偶行为和抑制父本育幼行为中的双重功能 | 发现单一信息素受体Or113a既能介导对雌性的吸引又能在演化中获得抑制父本育幼行为的新功能 | 研究仅针对慈鲷鱼类,其他鱼类物种的信息素感知机制仍需进一步探索 | 探究脊椎动物信息素信号演化如何导致新生殖行为策略的产生 | 慈鲷鱼类(特别是单倍色鲷类群)的生殖行为调控机制 | NA | NA | 单细胞转录组学,CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据,行为观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-10-05 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008
PMID:39255776
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤通过招募和分化颅骨骨髓中的树突状样“杂交”中性粒细胞来抑制肿瘤生长的机制 | 首次发现颅骨骨髓来源的具有树突状特征的杂交中性粒细胞在胶质母细胞瘤中发挥抗肿瘤作用 | NA | 探究胶质母细胞瘤中肿瘤相关中性粒细胞的来源、分化和功能 | 胶质母细胞瘤患者和小鼠模型中的肿瘤相关中性粒细胞 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
MultiSC: a deep learning pipeline for analyzing multiomics single-cell data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae492
PMID:39376034
|
研究论文 | 提出了一种名为MultiSC的深度学习流程,用于分析多组学单细胞数据 | 开发了首个能够有效整合三种组学数据(基因表达、染色质可及性、转录因子蛋白表达)的多组学单细胞分析流程 | NA | 解决多组学单细胞数据整合分析工具缺乏的问题 | 多组学单细胞数据 | 机器学习 | NA | NEAT-seq | 多模态约束自编码器, 矩阵分解模型, 多元线性回归 | 多组学数据(基因表达、染色质可及性、蛋白表达) | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
The choroid plexus synergizes with immune cells during neuroinflammation
2024-Sep-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.002
PMID:39089253
|
研究论文 | 本研究通过活体双光子成像和单细胞转录组学揭示了脉络丛在神经炎症中与免疫细胞协同作用的机制 | 首次发现脉络丛上皮细胞会短暂特化以滋养免疫细胞,并协调其招募、存活和分化,同时调控紧密连接以控制血脑屏障通透性 | 研究使用LPS诱导的脑膜炎小鼠模型,可能与人类疾病存在物种差异 | 阐明脉络丛在神经炎症调控中的分子机制 | 清醒小鼠的脉络丛组织和免疫细胞 | 神经科学 | 脑膜炎 | 纵向双光子成像, 单细胞转录组学 | LPS诱导的脑膜炎小鼠模型 | 影像数据, 转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
HA-1-targeted T-cell receptor T-cell therapy for recurrent leukemia after hematopoietic stem cell transplantation
2024-09-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024105
PMID:38683966
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研究论文 | 本研究评估了靶向HA-1抗原的T细胞受体T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的安全性和可行性 | 首次开发针对次要组织相容性抗原HA-1的TCR-T疗法用于移植后白血病复发治疗 | 研究样本量较小(9例患者),且非为评估疗效而设计 | 评估HA-1 TCR-T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的可行性和安全性 | 造血干细胞移植后复发白血病和髓系肿瘤患者 | 细胞治疗 | 白血病 | 单细胞RNA测序,T细胞受体基因转移 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 9例造血干细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
Identification of Disulfidptosis-Related Genes in Ischemic Stroke by Combining Single-Cell Sequencing, Machine Learning Algorithms, and In Vitro Experiments
2024-09-15, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-024-08804-2
PMID:39278970
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序、机器学习算法和体外实验,探索了缺血性脑卒中中双硫死亡相关基因的作用机制 | 首次将双硫死亡机制与缺血性脑卒中研究相结合,并利用多种机器学习算法识别关键基因 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 研究双硫死亡相关基因在缺血性脑卒中中的作用机制及其与免疫病理特征的相关性 | 缺血性脑卒中患者外周血样本和体外氧糖剥夺模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞测序,机器学习算法,体外细胞模型 | LASSO,随机森林,SVM-RFE | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 来自GEO数据库的人类缺血性脑卒中患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
Osr1-mediated mesothelial transition of liver mesenchymal cells exacerbates fibrotic liver damage
2024-Sep-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.02.024
PMID:38414241
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内谱系追踪揭示了肝星状细胞在肝损伤后向间皮细胞状态逆转的过程 | 首次发现肝星状细胞在损伤诱导下经历间充质-间皮细胞转变,并鉴定出关键转录因子Osr1在这一过程中的调控作用 | 研究主要基于小鼠NASH模型,在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究慢性肝病中肝纤维化的形成机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠非酒精性脂肪性肝炎模型中的肝星状细胞和间皮细胞 | 单细胞生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 体内谱系追踪, 双重组酶系统, 条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NASH模型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2025-10-06 |
Spatial microenvironments tune immune response dynamics in the Drosophila larval fat body
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612587
PMID:39345471
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研究论文 | 本研究通过活体光片荧光显微镜和空间转录组学技术,揭示了果蝇幼虫脂肪体免疫反应的空间动态模式 | 首次在果蝇幼虫脂肪体中发现了可重复的空间免疫反应模式,并证明该模式与微生物定位相关但不受其直接调控 | 研究局限于果蝇模型,需要在哺乳动物系统中进一步验证空间免疫组织的保守性 | 探究组织免疫反应的空间动态模式和调控机制 | 果蝇幼虫脂肪体 | 空间生物学 | 感染性疾病 | 活体光片荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | 果蝇幼虫 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury specific microenvironments and cellular interactions in kidney regeneration and disease
2024-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51186-z
PMID:39237549
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析小鼠肾脏缺血再灌注损伤中特定微环境的基因表达模式和细胞相互作用 | 首次应用空间转录组学揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式,并预测Clcf1-Crfl1在持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅针对小鼠肾脏缺血再灌注损伤模型,未涉及其他类型肾脏损伤或人类样本 | 解析肾脏损伤修复过程中的分子通路和细胞相互作用机制 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-06 |
PD-L2 drives resistance to EGFR-TKIs: dynamic changes of the tumor immune environment and targeted therapy
2024-Sep, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01317-2
PMID:38816578
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研究论文 | 本研究揭示了PD-L2通过调节肿瘤免疫环境驱动EGFR-TKIs耐药的新机制,并发现天然小分子抑制剂十一烯酸锌可逆转耐药 | 首次发现PD-L2动态变化是EGFR-TKIs获得性耐药的关键驱动因素,并鉴定出天然小分子PD-L2抑制剂十一烯酸锌 | 研究主要基于细胞系和同源肿瘤小鼠模型,尚未在临床患者中验证 | 探索EGFR-TKIs耐药机制并开发克服耐药的新策略 | EGFR突变肿瘤细胞系和同源肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
Prominent role of gut dysbiosis in the pathogenesis of cystic fibrosis-related liver disease in mice
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.041
PMID:38554847
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肠道菌群失调在囊性纤维化相关肝病发病机制中的关键作用 | 首次证明肠道CFTR缺陷通过维持致病性微生物群、创造炎症环境和改变肠道通透性,成为CFLD发展的必要共因子 | 研究基于小鼠模型,需要在人类患者中进行临床验证 | 探究肠-肝轴在囊性纤维化相关肝病发病机制中的作用 | 野生型小鼠、全身性Cftr敲除小鼠和肠道校正小鼠 | NA | 囊性纤维化相关肝病 | 单细胞RNA测序, 16S核糖体RNA测序, 蛋白质组阵列, FITC-葡聚糖检测 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 蛋白质组数据 | 三种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-06 |
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110017
PMID:39097072
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研究论文 | 本研究探讨了通过干扰磷酸二酯酶锚定来逆转损伤相关视网膜神经节细胞基因表达的机制 | 首次证明通过表达修饰的PDE4D3 N端肽4D3(E)能够逆转视神经损伤诱导的基因表达变化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索PDE4D3位移促进神经保护作用的分子机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |