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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
PoweREST: Statistical Power Estimation for Spatial Transcriptomics Experiments to Detect Differentially Expressed Genes Between Two Conditions
2024-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610564
PMID:39257799
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研究论文 | 开发用于空间转录组学实验中差异表达基因检测统计功效估计的工具PoweREST | 首个专门针对空间转录组学数据差异表达基因检测的统计功效计算工具 | 目前仅支持10X Genomics Visium数据，尚未扩展到其他空间转录组技术平台 | 解决空间转录组学实验中统计功效计算缺失的问题 | 空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计功效计算模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium空间转录组技术 |
| 62 | 2025-10-06 |
Identification of the CD8 + T-cell Related Signature for Predicting the Prognosis of Gastric Cancer Based on Integrated Analysis of Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000528
PMID:38809517
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研究论文 | 基于批量RNA测序和单细胞RNA测序数据整合分析，构建了预测胃癌预后的CD8+T细胞相关特征模型 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据构建CD8+T细胞相关特征模型，用于胃癌预后预测和免疫治疗指导 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发能够预测胃癌预后和免疫治疗反应的生物标志物 | 胃癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 风险模型，列线图 | 基因表达数据 | 来自TCGA数据库和GSE134520数据集的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
Molecular pathology, developmental changes and synaptic dysfunction in (pre-) symptomatic human C9ORF72-ALS/FTD cerebral organoids
2024-09-18, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01857-1
PMID:39289761
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研究论文 | 本研究利用iPSC来源的脑类器官模型揭示了C9ORF72基因突变导致的ALS/FTD疾病早期分子病理和突触功能障碍 | 首次在3D人脑类器官模型中系统揭示了C9-ALS/FTD从无症状期到症状期的分子病理发展过程 | 无症状携带者的下游细胞缺陷检测结果存在个体差异 | 探究C9ORF72基因突变导致ALS/FTD疾病的早期病理机制 | C9-ALS/FTD患者、无症状C9ORF72-HRE携带者和对照组的iPSC来源脑类器官 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化/额颞叶痴呆 | 单细胞RNA测序,膜片钳电生理学 | 脑类器官模型 | 基因表达数据,电生理数据 | C9-ALS/FTD患者、无症状携带者和对照组的多个人iPSC系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
SuperFeat: Quantitative Feature Learning from Single-cell RNA-seq Data Facilitates Drug Repurposing
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae036
PMID:39401181
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研究论文 | 开发了一个名为SuperFeat的计算框架，通过单细胞RNA测序数据学习定量特征以促进药物重定位 | 提出了基于人工神经网络的监督特征学习与评分框架，能够评估病理组织中的典型细胞状态/特征并识别靶向这些特征的潜在药物 | NA | 开发计算框架促进药物重定位 | 单细胞RNA测序数据中的细胞特征 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals the protective effects of lactate-mediated lactylation of microglia-related proteins on spinal cord injury
2024-09, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70028
PMID:39218784
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示了乳酸介导的小胶质细胞蛋白乳酸化对脊髓损伤的保护作用 | 首次发现乳酸通过调节小胶质细胞蛋白乳酸化影响其炎症表型，为脊髓损伤治疗提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明糖酵解来源乳酸通过乳酸化对小胶质细胞功能的调控机制及其在脊髓损伤中的神经保护作用 | 小鼠脊髓损伤模型和小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 成年雄性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Single-cell exome sequencing reveals polyclonal seeding and TRPS1 mutations in colon cancer metastasis
2024-09-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01960-8
PMID:39307879
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研究论文 | 通过单细胞外显子测序揭示结肠癌转移中的多克隆播散和TRPS1基因突变机制 | 首次在单细胞水平证明结肠癌肝转移和淋巴转移均来源于多克隆循环肿瘤细胞，并发现TRPS1 R544Q突变通过TRPS1/ZEB1轴促进癌症侵袭转移 | 研究仅基于一例IV期结肠癌患者，样本量有限 | 探索结肠癌转移的克隆演化和遗传异质性机制 | 结肠癌患者的原发肿瘤、肝转移灶和淋巴转移灶 | 癌症基因组学 | 结肠癌 | 单细胞外显子测序，单细胞转录组分析 | NA | 基因组测序数据，转录组数据 | 来自1例IV期结肠癌患者的150个单细胞（包括原发肿瘤、肝转移和淋巴转移） | NA | 单细胞外显子测序，单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
A new paradigm for generating high-quality cardiac pacemaker cells from mouse pluripotent stem cells
2024-09-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01942-w
PMID:39237509
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研究论文 | 本研究开发了一种通过双起搏细胞标记物和模拟发育路径从小鼠多能干细胞生成高质量心脏起搏细胞的新方法 | 采用双标记物Shox2和Hcn4建立报告细胞系，并通过FSK方法显著提高起搏细胞产量，同时通过单细胞RNA测序绘制分化轨迹并鉴定关键调控因子ZFP503 | 研究仅使用小鼠多能干细胞，尚未在人类细胞中验证 | 开发高质量心脏起搏细胞的分化策略以推进心脏生物起搏技术 | 小鼠多能干细胞及其分化的心脏起搏细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，干细胞分化 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了LRRc17通过调节心脏成纤维细胞铁死亡来调控心肌梗死后心肌纤维化的机制 | 首次发现LRRc17基因在心肌梗死后通过调节心脏成纤维细胞铁死亡影响心室重构 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床试验验证 | 阐明心肌梗死后纤维化的发病机制并寻找治疗靶点 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, Western blotting, 荧光染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 基于GEO数据库中的GSE153485和GSE210159数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-06 |
Lysosomal dysfunction-derived autophagy impairment of gingival epithelial cells in diabetes-associated periodontitis with altered protein acetylation
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111273
PMID:38950874
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞溶酶体功能障碍通过改变蛋白质乙酰化导致自噬受损的分子机制 | 首次发现高糖环境下溶酶体功能障碍通过改变自噬-溶酶体通路相关蛋白的乙酰化水平导致自噬流阻塞 | 研究主要基于体外细胞实验，需要更多体内实验验证 | 探究糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞过度炎症反应的分子机制 | 人牙龈上皮细胞和临床牙龈上皮组织 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,组织图像 | 临床牙龈上皮组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Monocytes Reprogrammed by 4-PBA Potently Contribute to the Resolution of Inflammation and Atherosclerosis
2024-Sep-27, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325023
PMID:39224974
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研究论文 | 本研究开发了一种利用4-PBA重编程单核细胞的新方法，可有效促进炎症消退并减轻动脉粥样硬化 | 首次发现4-PBA可将单核细胞重编程为具有免疫调节功能的消退表型，并阐明其通过CD24介导抗炎活性传播的新机制 | 研究主要基于ApoE-/-小鼠模型，人体应用效果尚需验证 | 开发针对单核细胞的精准治疗方法以解决动脉粥样硬化中的慢性炎症 | 单核细胞和ApoE-/-小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫学方法, 生化遗传学方法, 共培养实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Spatial multi-omics reveal intratumoral humoral immunity niches associated with tertiary lymphoid structures in pancreatic cancer immunotherapy pathologic responders
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.22.613714
PMID:39386736
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研究论文 | 本研究通过空间多组学分析揭示了胰腺癌免疫治疗病理应答者中与三级淋巴结构相关的瘤内体液免疫微环境 | 首次构建了胰腺癌免疫治疗的空间多组学图谱，发现了TLS特异性空间基因表达特征与患者生存改善的关联，揭示了TLS成熟与IgG/IgA分布共定位的空间特征 | 样本量相对有限（26例肿瘤），研究结果需要在更大队列中验证 | 探究三级淋巴结构在胰腺癌免疫治疗中的作用及其在肿瘤微环境中的空间关系 | 26例接受联合免疫治疗的胰腺导管腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学,空间蛋白质组学,BCR谱分析,H&E图像分析 | 机器学习分类模型,无监督基因表达矩阵因子分解方法,无监督学习 | 图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 26例PDAC肿瘤 | NA | 空间多组学,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52490-4
PMID:39294132
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研究论文 | 开发了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架，用于识别细胞类型特异性的顺式调控元件 | 将高度多重化的CRISPRa扰动与单细胞RNA测序相结合，能够同时测试多个调控元件在特定细胞类型中的功能 | 未明确说明样本规模限制或技术重复次数 | 开发识别细胞类型特异性顺式调控元件的筛选方法 | K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 | CRISPRa, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用493个gRNA文库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Oncogenic Calreticulin Induces Immune Escape by Stimulating TGFβ Expression and Regulatory T-cell Expansion in the Bone Marrow Microenvironment
2024-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3553
PMID:38885318
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研究论文 | 本研究揭示了致癌性钙网蛋白通过刺激TGFβ表达和调节性T细胞扩增诱导骨髓微环境中免疫逃逸的机制 | 首次发现CALRdel52突变通过ERK/Sp1/TGFβ1轴促进免疫抑制，并证明靶向该轴可增强T细胞活性 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩大 | 探究致癌性CALR突变在骨髓增殖性肿瘤中诱导免疫逃逸的分子机制 | 骨髓微环境中的TGFβ1产生细胞和调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠MPN模型 | 基因表达数据 | 四个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activity
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.26.600782
PMID:38979296
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研究论文 | 开发了一个名为STAN的计算框架，用于从空间转录组数据推断转录因子活性 | 提出首个整合TF-靶基因先验知识、mRNA表达、空间坐标和形态学特征的线性混合效应计算方法，实现点特异性TF活性预测 | 方法仅在线性框架下建模，可能无法捕捉复杂的非线性调控关系 | 开发空间信息化的转录因子活性推断方法 | 淋巴结、乳腺癌和胶质母细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据, 成像数据 | 多个组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
A distribution-free and analytic method for power and sample size calculation in single-cell differential expression
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae540
PMID:39231036
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研究论文 | 提出了一种基于广义估计方程的scPS方法，用于单细胞差异表达分析中的功效和样本量计算 | 无需假设数据分布，考虑样本内细胞间相关性，采用解析方法而非耗时模拟策略 | 未在摘要中明确说明 | 开发单细胞差异表达分析中功效和样本量计算的统计方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义估计方程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Age-related epithelial defects limit thymic function and regeneration
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01915-9
PMID:39112630
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了与年龄相关的非典型胸腺上皮细胞状态及其对胸腺功能和再生的限制机制 | 首次发现两种年龄相关的非典型胸腺上皮细胞状态，这些细胞形成无胸腺细胞的高密度上皮簇，作为TEC生长因子的吸收池并干扰再生通路 | 未明确说明样本数量和研究对象的详细信息 | 探究胸腺年龄相关功能衰退和再生能力下降的细胞机制 | 非造血基质细胞和胸腺上皮细胞 | 空间转录组学 | 衰老相关免疫缺陷 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 谱系追踪, 先进成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Fc-engineered antibodies promote neutrophil-dependent control of Mycobacterium tuberculosis
2024-Sep, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01777-9
PMID:39174703
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造识别结核分枝杆菌荚膜的抗体Fc区域，探索了抗体介导的结核病控制机制 | 构建了52种Fc变体抗体，首次发现Fc工程化抗体可通过中性粒细胞依赖性方式促进结核分枝杆菌限制 | 研究主要基于人类全血感染模型，尚未进行体内验证 | 探索抗体Fc介导的结核分枝杆菌限制机制及治疗潜力 | 结核分枝杆菌和工程化抗体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，Fc工程化 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614590
PMID:39386496
|
研究论文 | 本研究探讨了利鲁唑通过增加BDNF水平逆转颅脑放疗引起的认知功能障碍和神经退行性后果 | 首次证明利鲁唑可通过增加BDNF水平逆转放疗引起的认知功能障碍，并利用空间转录组学揭示了海马兴奋性神经元的神经保护机制 | 研究仅使用小鼠模型，未涉及人类临床试验；未观察到神经发生改善 | 评估利鲁唑对放疗引起的认知功能障碍的治疗效果 | 成年小鼠模型（颅脑照射9 Gy） | 神经科学 | 脑癌放疗后认知功能障碍 | 空间转录组学，双重免疫荧光染色，生化评估 | 动物模型 | 基因表达数据，免疫荧光图像，行为学数据 | 小鼠实验组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Gene expression prediction from histology images via hypergraph neural networks
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae500
PMID:39401144
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研究论文 | 提出一种基于超图神经网络从组织学图像预测基因表达的新方法 | 引入梯度增强模块增强对细胞形态信息的感知，通过注意力机制和多潜在阶段特征融合，利用超图建立不同尺度特征间的高阶关联 | 未明确说明模型在哪些特定疾病类型上的泛化能力限制 | 从成本较低的组织学图像预测基因表达 | 癌症和肿瘤疾病样本 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 超图神经网络(Hypergraph Neural Network) | 组织学图像 | 多个数据集（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Genetic association with autoimmune diseases identifies molecular mechanisms of coronary artery disease
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110715
PMID:39262791
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研究论文 | 本研究通过遗传学方法探索自身免疫疾病与冠状动脉疾病之间的遗传关联及分子机制 | 首次系统性利用GWAS数据识别自身免疫疾病与CAD之间的共享遗传位点、因果基因和通路，并结合单细胞RNA测序数据在细胞类型层面进行功能验证 | 研究主要基于遗传关联分析，需要后续功能实验验证具体分子机制 | 探究自身免疫疾病与冠状动脉疾病之间的遗传关联和分子机制 | 自身免疫疾病患者和冠状动脉疾病患者的遗传数据 | 遗传学 | 冠状动脉疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, CPASSOC, Mendelian Randomization, COLOC | 统计遗传学模型 | 遗传关联数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |