单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 644 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-08-13 |
Cold-adapted influenza vaccine carrying three repeats of a respiratory syncytial virus (RSV) fusion glycoprotein epitope site protects BALB/c mice and cotton rats against RSV infection
2024-Sep, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2024.105960
PMID:38986872
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研究论文 | 本研究开发了一种携带三个呼吸道合胞病毒（RSV）融合糖蛋白表位重复序列的冷适应流感疫苗，用于保护BALB/c小鼠和棉鼠免受RSV感染 | 首次开发了一种携带RSV融合蛋白中和表位重复序列的冷适应流感疫苗，显示出双重保护作用 | 需要进一步的临床前和临床研究来验证其安全性和有效性 | 开发一种新型双价疫苗，用于预防流感和RSV感染 | BALB/c小鼠和棉鼠 | NA | 呼吸道病毒感染 | 反向遗传技术，单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞T细胞抗原受体（TCR）测序 | NA | RNA | BALB/c小鼠和棉鼠 |
| 622 | 2024-08-09 |
New insights gained from cellular landscape changes in myocarditis and inflammatory cardiomyopathy
2024-Sep, Heart failure reviews
IF:4.5Q1
DOI:10.1007/s10741-024-10406-w
PMID:38896377
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研究论文 | 本文综述了心肌炎和炎症性心肌病（ICM）的最新研究，特别是通过单细胞RNA测序揭示的细胞景观变化 | 利用多组学技术，特别是单细胞RNA测序，深入理解心肌炎/ICM过程中的细胞景观变化 | NA | 提供心肌炎/ICM最新研究的全面概述 | 心肌炎和炎症性心肌病 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 623 | 2024-08-09 |
Identification of the CD8 + T-cell Related Signature for Predicting the Prognosis of Gastric Cancer Based on Integrated Analysis of Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000528
PMID:38809517
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征 | 首次探索了CD8+ T细胞在胃癌中的作用，并构建了一个新的风险模型 | NA | 旨在识别与胃癌预后相关的CD8+ T细胞相关特征，并指导免疫治疗决策 | 胃癌患者的CD8+ T细胞相关基因特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 896个CD8+ T细胞差异基因 |
| 624 | 2024-08-09 |
Cancer-associated fibroblasts: a versatile mediator in tumor progression, metastasis, and targeted therapy
2024-Sep, Cancer metastasis reviews
DOI:10.1007/s10555-024-10186-7
PMID:38602594
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research paper | 本文探讨了肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤进展、转移和靶向治疗中的作用 | 本文通过单细胞RNA测序技术识别了CAFs的多种表型，包括已知的肌成纤维细胞CAFs（myCAFs）和炎症性CAFs（iCAFs）以及新发现的亚型如抗原呈递CAFs（apCAFs） | NA | 研究CAFs在肿瘤发生、癌症干细胞性、血管生成、免疫抑制、代谢和转移中的多重功能，并探讨针对肿瘤微环境的靶向治疗 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在肿瘤微环境中的作用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 625 | 2024-08-09 |
SIRV: spatial inference of RNA velocity at the single-cell resolution
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae100
PMID:39108639
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research paper | 本文介绍了一种名为SIRV的方法，通过结合空间转录组学数据和参考单细胞RNA测序数据中的剪接和未剪接mRNA表达，实现单细胞分辨率下的空间RNA速度推断 | SIRV方法能够揭示仅通过单细胞RNA测序数据无法识别的空间分化模式，并成功应用于小鼠器官发生数据和鸡心脏发育数据 | 空间RNA速度的估计受限于无法在高分辨率空间转录组学中空间捕获剪接和未剪接的mRNA分子 | 研究组织中细胞分化动力学的空间背景 | 小鼠大脑发育中的中脑-后脑边界细胞和皮质边缘及间脑细胞的分化轨迹 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组学数据 | 小鼠大脑、鸡心脏和人类骨肉瘤细胞的数据 |
| 626 | 2024-08-08 |
A novel model combining genes associated with disulfidptosis and glycolysis to predict breast cancer prognosis, molecular subtypes, and treatment response
2024-Sep, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24329
PMID:38747344
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研究论文 | 本文开发了一种新型模型，结合与二硫化物死亡和糖酵解相关的基因，用于预测乳腺癌的预后、分子亚型和治疗反应 | 首次探讨了二硫化物死亡和糖酵解相关基因在乳腺癌中的作用机制及其预后价值 | NA | 开发一种能够准确预测乳腺癌预后、肿瘤微环境及药物治疗反应的模型 | 乳腺癌及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及正常和乳腺癌组织中的差异表达基因 |
| 627 | 2024-08-05 |
scGAAC: A graph attention autoencoder for clustering single-cell RNA-sequencing data
2024-Sep, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.06.010
PMID:38950719
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研究论文 | 提出了一种基于图注意力自编码器的聚类方法scGAAC，以处理单细胞RNA测序数据 | 引入了一种新的聚类方法，通过图注意力自编码器利用细胞间的结构信息，发现潜在关系 | 尽管scGAAC有效，但可能仍然受到数据噪声和高维度的影响 | 研究并改进单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | 四个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 628 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-Sep, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 本研究揭示了LRRc17在心脏成纤维细胞中介导铁死亡调节心肌梗死后心肌纤维化的作用 | 首次阐明了LRRc17在心肌梗死后心脏成纤维细胞铁死亡调节中的具体作用 | 本研究仅集中于特定基因LRRc17，可能忽视其他影响心肌纤维化的因子 | 探讨心肌梗死后心肌纤维化的发病机制，并寻找治疗靶点 | 心脏成纤维细胞（CFs），特别关注LRRc17对铁死亡的调节 | 数字病理学 | 心肌梗死 | RNA测序，qRT-PCR，Western blotting，Masson染色，细胞活力测定（CCK-8） | 体内外心肌梗死模型 | 基因表达数据 | NA |
| 629 | 2024-08-04 |
Dissecting prostate Cancer: Single-Cell insight into Macrophage Diversity, molecular Prognosticators, and the role of Peptidylprolyl Isomerase F
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112599
PMID:38959543
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中的单细胞转录组学，确定了巨噬细胞的异质性及其预后基因标记。 | 揭示了前列腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞异质性和功能特化，并识别了与预后相关的基因，特别是PPIF的作用。 | 研究主要依赖于现有的单细胞RNA测序数据，可能存在选择偏倚或数据完整性的问题。 | 研究前列腺癌中的肿瘤微环境及其与巨噬细胞的相互作用，识别潜在的预后基因。 | 前列腺癌的单细胞转录组学数据以及与巨噬细胞相关的基因。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 分析了9,178个细胞，归类为10种主要细胞类型 |
| 630 | 2024-08-04 |
CYP24A1 affected macrophage polarization through degradation of vitamin D as a candidate biomarker for ovarian cancer prognosis
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112575
PMID:38963981
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研究论文 | 本研究探讨了CYP24A1如何通过维生素D降解影响巨噬细胞极化，并作为卵巢癌预后候选生物标志物。 | 发现CYP24A1通过调节巨噬细胞极化与维生素D的相互作用，促进卵巢癌的恶性进展。 | 研究在体外构建了异种移植模型，但缺乏临床样本验证。 | 旨在筛选与卵巢癌预后相关的线粒体相关基因。 | 主要研究CYP24A1在卵巢癌细胞中的表达及其功能。 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA卵巢癌数据进行分析 |
| 631 | 2024-08-05 |
The complex association between the immune system and the skeletal system in osteoporosis: A study of single-cell RNA sequencing
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112611
PMID:38976947
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统与骨骼系统在骨质疏松症中的复杂关系 | 揭示了特定细胞亚群及其细胞间相互作用在骨质疏松症发病机制中的关键角色 | 缺乏对临床样本的广泛验证以增强研究结果的适用性 | 探索免疫系统与骨骼系统之间的生态联系以寻找临床预防和治疗的新策略 | 以人类腰椎层组织为研究对象，进行了单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类腰椎层组织的质量控制单细胞样本 |
| 632 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional landscape of intestinal diseases (Review)
2024-09, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2024.13281
PMID:38994768
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综述 | 本文总结了空间转录组学在肠道疾病中的应用。 | 通过空间转录组技术，深入揭示了肠道中细胞、基因、蛋白及信号之间的相互作用。 | NA | 探讨空间转录组学如何帮助理解与胃肠道相关的疾病机制。 | 肠道中的不同细胞类型及其相互作用。 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 空间转录组学(ST) | NA | NA | NA |
| 633 | 2024-08-05 |
From genes to therapy: A comprehensive exploration of congenital heart disease through the lens of genetics and emerging technologies
2024-Sep, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102726
PMID:38944223
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综述 | 本研究全面探索了先天性心脏病(CHD)的遗传学和新兴技术。 | 探讨了单基因和多基因因素对CHD的影响，并强调了新兴技术在该领域的变革性影响。 | 关于CHD病因的主要部分仍然不清楚，且研究可能未覆盖所有相关因素。 | 提升对先天性心脏病遗传机制的理解，以改善诊断和开发新疗法。 | 先天性心脏病的遗传学及其相关的疾病机制。 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 靶向新一代测序(NGS)、全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、人诱导多能干细胞(hiPSCs) | NA | NA | NA |
| 634 | 2024-08-05 |
Lysosomal dysfunction-derived autophagy impairment of gingival epithelial cells in diabetes-associated periodontitis with altered protein acetylation
2024-Sep, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111273
PMID:38950874
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病相关性牙周炎中牙龈上皮细胞的自噬障碍和溶酶体功能失调之间的关系 | 揭示了高葡萄糖条件下溶酶体功能受损会阻碍自噬通量，从而加重牙龈上皮细胞的炎症反应 | 未明确展示临床治疗效果或长时间的观察研究数据 | 阐明糖尿病相关性牙周炎中牙龈上皮细胞的超炎症反应机制 | 研究对象为糖尿病相关性牙周炎患者的牙龈上皮细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、免疫组化分析、蛋白质组学分析 | NA | 细胞样本 | 研究了来自糖尿病相关性牙周炎患者的临床牙龈上皮样本 |
| 635 | 2024-08-05 |
IL-17 signaling pathway: A potential therapeutic target for reducing skeletal muscle inflammation
2024-Sep, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2024.156691
PMID:38986253
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研究论文 | 该研究探讨了IL-17信号通路在骨骼肌炎症中的作用及其治疗潜力 | 研究首次揭示IL-17信号通路在骨骼肌炎症中的重要性，并探讨了抗IL-17抗体的治疗效果 | 尚未充分研究IL-17信号通路与其他炎症通路之间的相互作用 | 研究IL-17信号通路在骨骼肌炎症中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 使用小鼠模型研究IL-17信号通路与骨骼肌炎症的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），酶联免疫吸附实验（ELISA），免疫荧光，Western blot | NA | NA | 使用C57BL6/J小鼠模型进行实验 |
| 636 | 2024-08-04 |
Circular RNA-based therapy provides sustained and robust neuroprotection for retinal ganglion cells
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102258
PMID:39045516
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种基于环状RNA的疗法，该疗法为视网膜神经节细胞提供持久且强效的保护 | 本研究利用环状RNA（circRNA）来提高神经生长因子（NGF）的蛋白质表达，并为视网膜神经节细胞提供保护，这是一种创新的治疗方法 | 本研究未提及具体的药物传递系统的长期影响和临床转化的可行性 | 研究基于环状RNA的疗法在治疗眼部神经退行性疾病中的效果 | 研究对象为小鼠视神经挫伤模型中的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 眼部神经退行性疾病 | 脂质纳米颗粒（LNP）制备的circNGF | 小鼠视神经挫伤模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本大小 |
| 637 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Transcriptional Landscape of Neutrophils and Highlights the Role of TREM-1 in EAE
2024-Sep, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200278
PMID:38954781
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研究论文 | 本文揭示了中性粒细胞的转录组特征，并强调了TREM-1在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用 | 首次构建了EAE中颈部淋巴结内中性粒细胞的单细胞免疫细胞图谱，并发现TREM-1在中性粒细胞迁移中的关键作用 | 该研究在EAE小鼠模型中进行，结果可能不能完全代表人类多发性硬化症的病理机制 | 研究中性粒细胞在EAE进展过程中的功能及其转录组特征 | 中性粒细胞及其在颈部淋巴结中的不同亚型 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | EAE小鼠中观察到的大量中性粒细胞和多发性硬化症患者的外周中性粒细胞 |
| 638 | 2024-08-05 |
A general pHLA-CD80 scaffold fusion protein to promote efficient antigen-specific T cell-based immunotherapy
2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200827
PMID:39027379
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研究论文 | 本文介绍了一种通用的pHLA-CD80融合蛋白，以促进有效的抗原特异性T细胞免疫治疗 | 文中提出的APC-mimic融合蛋白有效模仿了抗原呈递细胞的自然抗原呈递模式，能够直接扩展T细胞 | 研究中未提及特定抗原呈递细胞的需求，可能在应用中存在局限 | 研究旨在提高抗原特异性T细胞的激活和扩展 | 研究对象为抗原特异性T细胞及其在小鼠模型中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞TCR测序（scTCR-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | OT-1小鼠模型 |
| 639 | 2024-08-04 |
Coupled single-cell and bulk RNA-seq analysis reveals the engulfment role of endothelial cells in atherosclerosis
2024-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101250
PMID:39022128
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞在动脉粥样硬化中吞噬凋亡细胞碎片的角色 | 发现了内皮细胞中一种独特亚群以及SR-B1在吞噬作用中的重要性 | NA | 研究内皮细胞在动脉粥样硬化中对凋亡细胞碎片的吞噬作用 | 内皮细胞和凋亡细胞碎片 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 小鼠主动脉和人类主动脉的样本 |
| 640 | 2024-08-05 |
s CIRCLE-An interactive visual exploration tool for single cell RNA-Seq data
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae084
PMID:39022325
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研究论文 | CIRCLE是一个用于单细胞RNA-seq数据集的探索性分析工具，专注于细菌的单细胞RNA-seq。 | 该软件从信息设计的角度重新构思了对单细胞RNA-seq数据低维表示的可视化和交互式探索。 | NA | 研究旨在提供一个交互式工具以探索单细胞RNA-seq数据。 | 单细胞RNA-seq数据集，特别是细菌的单细胞RNA-seq。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA |