单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 678 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2024-08-25 |
Association Between COVID-19 and Neurological Diseases: Evidence from Large-Scale Mendelian Randomization Analysis and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2024-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-03975-2
PMID:38300446
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析，探讨了COVID-19与神经系统疾病之间的因果关系 | 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析，揭示了SARS-CoV-2感染与癫痫和躁狂等神经系统疾病的因果关系 | 研究未观察到COVID-19对其他特征的显著影响 | 评估SARS-CoV-2感染与神经系统疾病之间的因果关系，并分析SARS-CoV-2在细胞水平的潜在入侵途径 | SARS-CoV-2感染与神经系统疾病的关系 | NA | 神经系统疾病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 23种细胞亚型 |
| 622 | 2024-08-24 |
Exploring the role of DNMT1 in dental papilla cell fate specification during mouse tooth germ development through integrated single-cell transcriptomics and bulk RNA sequencing
2024-Sep, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2024.06.010
PMID:38942194
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组学和批量RNA测序技术，探索了DNMT1在小鼠牙胚发育中牙乳头细胞命运决定的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序相结合的方法，揭示了DNMT1在早期成牙本质细胞发育中的关键调控作用 | 研究主要集中在胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞，未来研究可以扩展到不同发育阶段和不同物种 | 探究牙齿发育过程中牙间充质细胞的调控机制，特别是成牙本质细胞分化和表观遗传调控的作用 | 小鼠牙胚中的牙间充质细胞和成牙本质细胞分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | 单细胞调控网络推理和聚类（SCENIC） | RNA | 胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞和分离的牙间充质细胞 |
| 623 | 2024-08-24 |
Single-cell transcriptome sequencing partially revealed the changes of T cells in the early stage of aging kidney
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.06.005
PMID:39059207
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了衰老肾脏早期阶段T细胞的分子表型和组成变化 | 首次详细描述了衰老肾脏中T细胞的分子状态变化和极化现象，并识别出特定亚群的T细胞 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨人类肾脏衰老的具体情况 | 探究肾脏衰老早期阶段免疫细胞的变化及其分子机制 | 衰老小鼠肾脏中的T细胞和其他免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 624 | 2024-08-24 |
Resolution of Acinar Dedifferentiation Regulates Tissue Remodeling in Pancreatic Injury and Cancer Initiation
2024-Sep, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.04.031
PMID:38729450
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研究论文 | 本文通过比较转录组分析研究了胰腺损伤和癌症起始过程中腺泡细胞去分化调控的机制。 | 发现Sox4基因在胰腺腺泡细胞去分化过程中起到抑制作用，并揭示了其在维持组织稳态和肿瘤退化中的新功能。 | NA | 探讨胰腺腺泡细胞去分化在胰腺损伤和癌症起始中的作用及机制。 | 胰腺腺泡细胞去分化过程中的Sox4基因及其调控机制。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 625 | 2024-08-24 |
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本文研究了抑制肾素表达的调控机制，通过使用不同抑制剂处理As4.1细胞，并利用ATAC-seq、单细胞RNA测序等技术分析了肾素表达的表观遗传调控。 | 首次揭示了肾素表达在细胞中从活跃状态转变为准备状态的表观遗传调控机制，并识别了与肾素调控相关的转录因子基序和基因。 | 研究主要集中在As4.1细胞模型上，可能需要进一步在其他细胞类型或体内模型中验证这些发现。 | 探究肾素表达的表观遗传调控机制及其在细胞功能转换中的作用。 | As4.1细胞（源自小鼠近球小体的肿瘤细胞，持续表达肾素）。 | NA | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 处理和对照的As4.1细胞的生物学重复样本 |
| 626 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis" [Mol. Immunol. 172 (2024) 85-95]
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.013
PMID:39088936
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 627 | 2024-08-23 |
Comparison among different preclinical models derived from the same patient with a non-functional pancreatic neuroendocrine tumor
2024-Sep, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01107-5
PMID:39078546
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research paper | 本文比较了从同一非功能性胰腺神经内分泌肿瘤患者中衍生出的不同临床前模型 | 成功构建了患者来源的类器官和患者来源的异种移植模型，并提供了新的肿瘤建模平台 | NA | 深入研究胰腺神经内分泌肿瘤的分子生物学机制 | 胰腺神经内分泌肿瘤的临床前模型 | digital pathology | 胰腺肿瘤 | 免疫组织化学、全外显子测序、单细胞转录组测序 | NA | 组织 | 来自同一患者的多个模型 |
| 628 | 2024-08-23 |
Integrative analysis of long isoform sequencing and functional data identifies distinct cortical layer neuronal subtypes derived from human iPSCs
2024-Sep-01, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.00045.2024
PMID:38988287
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研究论文 | 本文比较了两种不同培养基中人诱导多能干细胞（iPSCs）向神经元分化的效率，并使用长读单细胞RNA测序验证了不同皮质层神经元亚型的存在 | 提出了一种时间效率高且稳健的神经元分化方法，能够在较短时间内高效生成功能性皮质层神经元 | 低分化效率是现有协议的主要缺点 | 研究iPSCs向神经元分化的效率，并验证生成的神经元的功能性 | 人诱导多能干细胞（iPSCs）及其向神经元分化的过程 | 再生医学 | NA | 长读单细胞RNA测序 | NA | RNA | 30天和35天的神经元培养物 |
| 629 | 2024-08-23 |
A unique human cord blood CD8+CD45RA+CD27+CD161+ T-cell subset identified by flow cytometric data analysis using Seurat
2024-Sep, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13803
PMID:38798051
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研究论文 | 本文利用Seurat包对高维流式细胞数据进行分析，识别出一种独特的人类脐带血CD8+CD45RA+CD27+CD161+ T细胞亚群 | 首次将Seurat包应用于高维流式细胞数据分析，并发现了一种独特的CD8 T细胞亚群 | NA | 展示Seurat包在流式细胞数据分析中的强大能力，并识别出一种独特的T细胞亚群 | 人类脐带血和成人血液中的T细胞 | 临床免疫学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | Seurat包 | 流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | 使用20种标记抗体面板，分析了脐带血和成人血液中的T细胞 |
| 630 | 2024-08-21 |
Comparative assessment of the intragenomic variations of dinoflagellate Tripos species through single-cell sequencing
2024-Sep, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2024.116690
PMID:39024906
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术评估和比较了三角藻属（Tripos）物种的基因组内变异（IGVs） | 首次使用高通量测序（HTS）对Tripos物种的18S rDNA V4区域进行单细胞测序，揭示了高水平的基因组内变异 | 研究仅限于Tripos物种的30个单细胞，可能无法代表所有Tripos物种的基因组内变异情况 | 评估和比较Tripos物种的基因组内变异，探讨其在分子多样性分析中的影响 | Tripos物种的基因组内变异 | 生物信息学 | NA | 高通量测序（HTS） | NA | DNA序列 | 30个Tripos物种的单细胞 |
| 631 | 2024-08-21 |
Sex-specific effects of injury and beta-adrenergic activation on metabolic and inflammatory mediators in a murine model of post-traumatic osteoarthritis
2024-Sep, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.03.109
PMID:38527663
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研究论文 | 本研究探讨了β-肾上腺素能受体激活对创伤后骨关节炎模型中小鼠膝关节代谢和炎症介质的影响，并发现这种影响具有性别特异性 | 首次揭示了β-肾上腺素能受体激活在创伤后骨关节炎中对女性小鼠的炎症和纤维化基因表达的抑制作用 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨长期治疗效果 | 研究创伤后骨关节炎中β-肾上腺素能受体激活对炎症和代谢过程的影响 | 12周龄的雄性和雌性小鼠膝关节 | NA | 创伤后骨关节炎 | β-肾上腺素能受体激动剂 | NA | 基因表达数据，代谢物数据 | 雄性和雌性小鼠各若干只 |
| 632 | 2024-08-21 |
Targeting mitochondrial dysfunction in atopic dermatitis with trilinolein: A triacylglycerol from the medicinal plant Cannabis fructus
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155856
PMID:39024674
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研究论文 | 本研究探讨了从药用植物大麻果实中提取的三亚油酸甘油酯（trilinolein）在治疗特应性皮炎（AD）中的作用及其机制 | 首次揭示了trilinolein通过AhR-Nrf2途径减轻NOX2依赖的线粒体功能障碍，修复皮肤屏障 | 研究主要集中在细胞和小鼠模型上，尚未进行人体临床试验 | 评估trilinolein在预防和治疗特应性皮炎中的潜力及其作用机制 | 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤样本，以及DNCB诱导的BALB/c小鼠和IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞 | NA | 特应性皮炎 | HPLC-ESI-MS/MS分析，单细胞转录组分析，蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质表达数据 | 慢性AD患者和健康对照者的皮肤样本，DNCB诱导的BALB/c小鼠，IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞 |
| 633 | 2024-08-21 |
FAT1 as a tumor mutation burden specific gene affects the immunotherapy effect in head and neck squamous cell cancer
2024-Sep, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101095
PMID:38986165
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研究论文 | 本研究探讨了FAT1基因突变与头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者免疫治疗反应之间的关系 | 发现FAT1基因突变与HNSCC患者对免疫治疗的抵抗性相关，并涉及多个代谢相关通路 | 样本量较小，仅包括33名HNSCC患者 | 研究肿瘤突变负荷（TMB）特异性基因如何影响头颈部鳞状细胞癌的免疫治疗效果 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 下一代测序（NGS） | NA | 转录组数据 | 33名头颈部鳞状细胞癌患者 |
| 634 | 2024-08-21 |
Expansion of effector regulatory T cells in steroid responders of severe alcohol-associated hepatitis
2024-Sep-01, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society
IF:4.7Q1
DOI:10.1097/LVT.0000000000000378
PMID:38809243
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研究论文 | 研究探讨了严重酒精相关性肝炎患者中，糖皮质激素治疗与效应调节T细胞（eTreg）的关系及其对临床结果的影响 | 首次揭示了糖皮质激素治疗严重酒精相关性肝炎患者中eTreg细胞数量的增加及其与治疗效果的关联 | 研究样本量较小，且仅包括了酒精相关性肝炎患者，可能限制了结果的普遍性 | 探究糖皮质激素治疗严重酒精相关性肝炎的效果及其与eTreg细胞的关系 | 严重酒精相关性肝炎患者及其治疗反应 | NA | 酒精相关性肝炎 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 血液单个核细胞 | 47名酒精相关性肝炎患者，其中18名接受糖皮质激素治疗，29名未接受治疗 |
| 635 | 2024-08-21 |
A distinct subset of urothelial cells with enhanced EMT features promotes chemotherapy resistance and cancer recurrence by increasing COL4A1-ITGB1 mediated angiogenesis
2024-Sep, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101116
PMID:38968684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，发现具有上皮-间质转化（EMT）特征的尿路上皮细胞亚群（EMT-UC）与化疗耐药和癌症复发显著相关，并验证了EMT-UC通过COL4A1-ITGB1相互作用促进肿瘤血管生成的作用。 | 首次揭示了EMT-UC通过COL4A1-ITGB1相互作用促进尿路上皮癌化疗耐药和复发的机制。 | EMT-UC不仅在肿瘤组织中被识别，也在邻近的正常组织中被发现，这限制了对EMT-UC特异性的理解。 | 探究尿路上皮癌化疗耐药和复发的潜在机制。 | 尿路上皮细胞亚群（EMT-UC）及其在化疗耐药和癌症复发中的作用。 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自不良预后患者的尿路上皮癌组织样本 |
| 636 | 2024-08-21 |
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110017
PMID:39097072
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研究论文 | 本研究探讨了通过表达一种修饰的磷酸二酯酶4D3 N端肽4D3(E)来改变视网膜神经节细胞（RGCs）基因表达，以逆转损伤相关的基因表达变化 | 通过使用单细胞RNA测序技术，研究了4D3(E)肽表达对视网膜神经节细胞在受到视神经压迫损伤后基因表达的影响 | NA | 探索磷酸二酯酶4D3位移促进神经保护的机制 | 视网膜神经节细胞（RGCs）及其在视神经压迫损伤后的基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 637 | 2024-08-21 |
Recryopreservation impairs blastocyst implantation potential via activated endoplasmic reticulum stress pathway and induced apoptosis
2024-Sep, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.689
PMID:39156765
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研究论文 | 本研究探讨了重复冷冻保存对胚泡植入潜能的影响及其机制 | 首次揭示了重复冷冻保存通过激活内质网应激途径和诱导细胞凋亡影响胚泡植入潜能的机制 | 研究样本仅来自一个学术生殖医学中心，可能限制了结果的普遍性 | 探究重复冷冻保存对胚泡植入潜能的影响及其分子机制 | 人类胚泡及其植入潜能 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光、TUNEL检测 | NA | 细胞 | 捐赠的人类胚泡 |
| 638 | 2024-08-20 |
IL-17A/F double producing T cells, unstable Tregs and quiescent TRMs in clinically healed lesions are potential cellular candidates for recurrence of psoriasis
2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110328
PMID:39067676
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和多重免疫组化染色技术，分析了自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤中的T细胞亚群，以揭示银屑病复发的细胞机制 | 首次在临床愈合的银屑病变中识别出IL-17A/F双产T细胞、不稳定Tregs和静息TRMs作为复发的潜在细胞候选者 | 研究结果需要进一步的深入工作以加深理解 | 阐明银屑病复发的免疫学机制 | 银屑病愈合病变中的T细胞亚群 | NA | 银屑病 | 单细胞测序，多重免疫组化染色 | NA | 细胞 | 自体愈合性病变、现场复发性银屑病变和相邻正常皮肤样本 |
| 639 | 2024-08-20 |
RBMS1 reflects a distinct microenvironment and promotes tumor progression in ocular melanoma
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109990
PMID:38969283
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研究论文 | 本研究通过多种机器学习算法分析了UM患者的DNA甲基化、转录组数据及临床信息，发现甲基化驱动的基因RBMS1与UM患者的临床预后不良相关，并揭示了RBMS1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤进展的影响。 | 首次揭示RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用，及其与肿瘤微环境和预后的关联。 | 研究主要基于UM患者的数据，未来研究需验证RBMS1在其他类型眼部黑色素瘤中的作用。 | 探讨RBMS1基因在眼部黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境和预后的影响。 | 眼部黑色素瘤，包括葡萄膜黑色素瘤（UM）和结膜黑色素瘤（CM）。 | 数字病理学 | 眼部黑色素瘤 | DNA甲基化分析、RNA测序、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | DNA甲基化数据、转录组数据、临床信息 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 640 | 2024-08-20 |
Adenosine A2A receptor activation regulates the M1 macrophages activation to initiate innate and adaptive immunity in psoriasis
2024-Sep, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110309
PMID:39002795
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研究论文 | 本研究探讨了腺苷A2A受体激活对M1巨噬细胞的调节作用及其在银屑病中的免疫机制 | 首次发现KRT16在M1巨噬细胞中的表达，并确定CXCL10/11主要来源于巨噬细胞和树突状细胞而非角质形成细胞 | NA | 探究M1巨噬细胞在银屑病发病机制中的作用 | M1巨噬细胞在银屑病中的作用及腺苷A2A受体的调节机制 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |