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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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601 | 2024-09-04 |
Progress in toxicogenomics to protect human health
2024-Sep-02, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-024-00767-1
PMID:39223311
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review | 本文综述了毒理基因组学在应用转录组学进行毒理学测试方面的进展,并强调了正在改变风险评估的先进技术。 | 本文介绍了高吞吐量剂量-反应建模、单细胞转录组学和多组学等新兴方法,这些方法利用毒理基因组学数据来保护人类健康,即使在无法预测特定危害的情况下。 | NA | 探讨毒理基因组学在保护人类健康方面的应用和进展。 | 分子特征如转录物、蛋白质、代谢物和表观遗传修饰,以及这些特征在理解预测环境与药物暴露毒理效应中的作用。 | NA | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
602 | 2024-09-04 |
Characteristics and functions of an atypical inflammation-associated GZMK+GZMB+CD8+ T subset in people living with HIV-1
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.003
PMID:39053388
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research paper | 本研究通过分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)和匹配的T细胞受体序列(TCR)数据,深入探讨了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的特征及其与疾病的相关性 | 发现了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的异质性,并进一步细分为GZMKGZMB子集和GZMKGZMB子集,后者在HIV-1感染者中显著富集 | NA | 探讨HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的表型和功能特征及其与疾病的相关性 | HIV-1感染者中的GZMKCD8 T细胞 | 免疫学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
603 | 2024-09-04 |
Unraveling flavivirus pathogenesis: from bulk to single-cell RNA-sequencing strategies
2024-Sep-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
DOI:10.4196/kjpp.2024.28.5.403
PMID:39198221
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综述 | 本文综述了从批量到单细胞RNA测序策略在解析黄病毒发病机制中的应用 | 介绍了病毒包含的单细胞RNA测序(viscRNA-seq)这一创新技术,解决了非多聚腺苷酸黄病毒基因组带来的挑战 | NA | 探讨RNA测序技术在细胞系实验和黄病毒感染患者研究中的应用,加速有效诊断和治疗的发展 | 黄病毒及其与宿主的相互作用 | 生物信息学 | NA | RNA测序(RNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
604 | 2024-09-04 |
Hydatidiform mole identification using non-invasive single-cell sequencing of fetal circulating extravillous trophoblasts isolated from maternal blood
2024-Sep, Ultrasound in obstetrics & gynecology : the official journal of the International Society of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/uog.27615
PMID:38354218
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
605 | 2024-09-01 |
Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester - An analysis by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100919
PMID:38941941
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了第一孕期人类胎盘绒毛周细胞的基因表达谱 | 首次揭示了胎盘绒毛周细胞在第一孕期的特定标记物和功能,并发现了其在整合素介导的信号通路和细胞外囊泡中的组织特异性功能 | NA | 探讨胎盘绒毛周细胞的标记物和功能,以增进对早期胎盘发育的理解并寻找治疗胎盘相关妊娠并发症的新靶点 | 人类胎盘绒毛周细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 第一孕期的胎盘绒毛样本 |
606 | 2024-09-01 |
Integrative analysis reveals different feature of intrahepatic cholangiocarcinoma subtypes
2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.16015
PMID:38924592
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研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了肝内胆管癌两种主要组织学亚型(大管型和小管型)在分子特征和免疫微环境方面的差异 | 发现了大管型肝内胆管癌中PPP1R1B的高表达及其在细胞增殖、迁移和侵袭中的作用,以及其作为潜在标记物和治疗靶点的可能性 | NA | 扩展对肝内胆管癌两种亚型分子特征和免疫微环境差异的理解 | 肝内胆管癌的两种主要组织学亚型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 132名接受根治性手术的患者 |
607 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA sequencing of cystic fibrosis liver disease explants reveals endothelial complement activation
2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15963
PMID:38847551
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了囊性纤维化相关肝病患者的肝组织,揭示了内皮细胞的补体激活特征 | 首次在单细胞水平上展示了囊性纤维化肝病患者的内皮细胞特征,特别是发现了一类上调补体级联反应和凝血相关基因的特殊内皮细胞群体 | 研究样本量较小,仅包括四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织 | 探究囊性纤维化相关肝病中内皮细胞的病理特征及其在疾病发展中的作用 | 囊性纤维化相关肝病患者的肝组织内皮细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织 |
608 | 2024-09-01 |
Multi-omic analysis and validation reveal ZBP1 as a potential prognostic and immunotherapy-related biomarker in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Sep, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
DOI:10.1016/j.jormas.2024.101901
PMID:38688403
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和验证,揭示了ZBP1作为头颈部鳞状细胞癌潜在的预后和免疫治疗相关生物标志物 | 首次全面揭示ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的潜在预后和免疫治疗相关作用 | NA | 旨在识别ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的可能功能 | ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与临床预后和免疫特征的关系 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 多组学分析 | NA | 基因表达数据 | 66个肿瘤样本和37个对照样本 |
609 | 2024-09-01 |
Lung Fibrosis Is Linked to Increased Endothelial Cell Activation and Dysfunctional Vascular Barrier Integrity
2024-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0046OC
PMID:38843440
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研究论文 | 本研究通过透射电子显微镜、免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了肺纤维化患者与供体肺血管的差异,并研究了血管屏障阻力、内皮-免疫细胞粘附及对炎症环境的敏感性。 | 首次详细描述了肺纤维化中内皮细胞的异常激活和血管屏障功能障碍,并提出了恢复内皮细胞稳态和功能作为治疗肺纤维化的新策略。 | 研究主要基于体外实验和患者样本,需要进一步的临床试验验证其治疗策略的有效性。 | 探讨肺纤维化中内皮细胞的激活和血管屏障功能障碍的机制。 | 肺纤维化患者的肺血管和内皮细胞。 | NA | 肺纤维化 | 透射电子显微镜、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 多个肺纤维化患者和供体样本 |
610 | 2024-08-31 |
Bi-functional CpG-STAT3 decoy oligonucleotide triggers multilineage differentiation of acute myeloid leukemia in mice
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102268
PMID:39171140
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研究论文 | 研究通过使用双功能CpG-STAT3诱饵寡核苷酸,触发小鼠急性髓系白血病细胞的多谱系分化 | 本研究揭示了通过STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并展示了双功能寡核苷酸通过同时抑制STAT3和/或DNMT来释放TLR9驱动的白血病细胞分化的免疫治疗潜力 | NA | 阐明STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并探索双功能寡核苷酸在白血病治疗中的应用 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 寡核苷酸技术 | NA | 转录组数据 | 小鼠来源的急性髓系白血病细胞 |
611 | 2024-08-30 |
The Novel-B-Cell-Related Gene Signature Predicts the Prognosis and Immune Status of Patients with Esophageal Carcinoma
2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-024-01083-x
PMID:38963643
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析,开发了一种新的B细胞相关基因签名(BRGrisk),用于预测食管癌患者的预后和免疫状态 | 首次开发了B细胞相关基因签名(BRGrisk),用于食管癌患者的预后分层和个性化治疗策略的指导 | NA | 研究B细胞在食管癌中的预后意义及其在肿瘤微环境中的作用 | 食管癌患者的预后和免疫状态 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组分析 | LASSO回归分析 | 基因数据 | 来自癌症基因组图谱队列的患者被分为训练队列和测试队列 |
612 | 2024-08-30 |
A Comprehensive Flow Cytometry Panel for Analysis of Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-Sep, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.754
PMID:38606634
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研究论文 | 本文介绍了一种用于特发性声门下狭窄(iSGS)分析的综合流式细胞术面板 | 提出了一个综合的流式细胞术面板,用于研究iSGS和其他上呼吸道病理的细胞机制 | NA | 开发和验证用于iSGS分析的流式细胞术面板 | iSGS患者的正常和瘢痕组织样本 | NA | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 9对正常和瘢痕组织样本 |
613 | 2024-08-29 |
Prominent role of gut dysbiosis in the pathogenesis of cystic fibrosis-related liver disease in mice
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.041
PMID:38554847
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物失调在囊性纤维化相关肝病(CFLD)发病机制中的作用,特别是在Cftr敲除小鼠模型中的作用。 | 本研究首次揭示了肠道微生物失调和肠道通透性增加在CFLD发病机制中的关键作用,并提出通过恢复肠道CFTR或调节微生物群来预防或减轻肝病的潜在治疗策略。 | 研究结果基于小鼠模型,需要进一步的临床验证以确定其在人类患者中的适用性。 | 探讨肠道-肝脏轴在囊性纤维化相关肝病发病机制中的作用。 | 野生型小鼠、全身Cftr敲除小鼠和肠道纠正的Cftr敲除小鼠。 | NA | 囊性纤维化相关肝病 | 免疫组织化学、单细胞转录组学(单细胞RNA测序)、蛋白质组阵列、16S核糖体RNA测序、FITC-葡聚糖试验 | NA | 组织、粪便 | 野生型小鼠、全身Cftr敲除小鼠和肠道纠正的Cftr敲除小鼠 |
614 | 2024-08-29 |
Analysis of single-cell transcriptome data from a mouse model implicates protein synthesis dysfunction in schizophrenia
2024-Sep, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01545-3
PMID:39083157
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序数据分析了Setd1a±敲除小鼠模型中基因表达的变化,以揭示精神分裂症的发病机制 | 首次在单细胞水平上分析了Setd1a±敲除小鼠模型中与精神分裂症相关的基因表达变化,并识别了关键的生物学途径,如蛋白质合成和EIF2信号传导途径 | 研究仅限于Setd1a±敲除小鼠模型,结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证 | 探讨精神分裂症的发病机制,特别是基因表达变化和相关生物学途径 | Setd1a±敲除小鼠的前额叶皮质和纹状体中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 前额叶皮质和纹状体中共识别了273个独特的差异表达基因(DEGs)和675个包含差异转录使用的基因峰(DTU) |
615 | 2024-08-29 |
Function of unconventional T cells in oral lichen planus revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01912-6
PMID:39073597
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔扁平苔藓中非典型T细胞的功能和分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了口腔扁平苔藓中单个细胞的特征,并揭示了非典型T细胞在疾病中的独特应激反应状态 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术探索口腔扁平苔藓中非典型T细胞的分子特征 | 口腔扁平苔藓患者的颊黏膜样本和健康个体的颊黏膜样本 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 口腔扁平苔藓患者和健康个体的颊黏膜样本 |
616 | 2024-08-29 |
Distinct granzyme k expression in immune cells: a single-cell rna-seq meta-analysis
2024-Sep, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01555-1
PMID:39115674
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序元分析,探讨了GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序元分析揭示了GZMK在不同免疫细胞和组织中的独特表达调控机制 | NA | 揭示GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 | GZMK在不同免疫细胞类型中的表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及成熟T细胞、NK细胞、B细胞和NKT细胞等多种免疫细胞类型 |
617 | 2024-08-29 |
Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer
2024-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108989
PMID:39142223
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,建立了一个与癌症相关成纤维细胞(CAFs)相关的miRNA模型,用于评估前列腺癌的预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选 | 首次通过单细胞转录组学分析,确定了89个与CAFs相关的mRNAs,并建立了一个基于9个CAFs相关miRNA的预后模型,用于预测前列腺癌的生化复发 | 研究主要基于数据库中的数据进行分析,未涉及大规模的临床试验验证 | 建立一个与CAFs相关的miRNA模型,用于个性化和精准治疗前列腺腺癌患者 | 前列腺癌相关成纤维细胞(CAFs)及其相关的miRNAs | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(buRNA-seq) | 支持向量机(SVM) | RNA测序数据 | 34名前列腺癌患者 |
618 | 2024-08-27 |
Exploring the Influence of T Cell Marker Gene Expression on the Pathobiology and Clinical Prognostic Outcomes in Intestinal-Type Gastric Carcinoma
2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-024-01104-9
PMID:39136893
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞标记基因表达在肠型胃癌病理生物学和临床预后中的作用 | 开发了一种基于T细胞标记基因的风险评分,用于胃癌患者的生存预测 | NA | 阐明免疫系统,特别是T细胞及其亚型在肠型胃癌发病和进展中的作用,并评估基于T细胞标记基因的风险评分对总体生存的预测效用 | 肠型胃癌患者的T细胞标记基因表达及其对生存预后的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自癌症基因组图谱(TCGA)和GSE15459数据集的数据 |
619 | 2024-08-26 |
Effects of tumor treating fields (TTFields) on human mesenchymal stromal cells
2024-Sep, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04740-0
PMID:38900237
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研究论文 | 研究肿瘤治疗场(TTFields)对人类间充质基质细胞(MSCs)的影响 | 首次探讨了TTFields对MSCs的影响,填补了该领域的知识空白 | 仅在体外进行了实验,尚未在临床环境中验证 | 研究TTFields对间充质基质细胞的生物学效应 | 人类间充质基质细胞(MSCs) | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、流式细胞术、Boyden室实验 | NA | 细胞 | 患者样本中的间充质基质细胞 |
620 | 2024-08-07 |
Unlocking Skin's Symphony: Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal the Harmonious Interplay among Diverse Cell Populations
2024-Sep, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.01.039
PMID:38678464
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |