单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
581	2024-09-05	Aging-Associated Molecular Changes in Human Alveolar Type I Cells 2024-Sep, Journal of respiratory biology and translational medicine DOI:10.35534/jrbtm.2024.10012 PMID:39220636	研究论文	本研究利用单细胞转录组学数据，分析了老年人肺泡I型细胞的分子变化	首次详细描述了老年人肺泡I型细胞的分子变化，包括细胞衰老和趋化因子基因表达增加，以及上皮特征的减少	研究仅限于健康人肺部的数据，未涉及疾病状态下的情况	探讨年龄相关的人肺泡I型细胞分子变化机制	人肺泡I型细胞	NA	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
582	2024-09-05	Single-cell RNA sequencing reveals microenvironmental infiltration in non-small cell lung cancer with different responses to immunotherapy 2024-Sep, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3736 PMID:39228151	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌中主要病理反应（MPR）和非主要病理反应（NMPR）样本的细胞组成，揭示了免疫治疗反应不同的肿瘤微环境差异	本研究发现了在MPR和NMPR样本中CD8+ T细胞群体的明显差异，并识别出一系列新的生物标志物，为预测治疗反应和克服免疫治疗耐药性提供了理论基础	NA	探索非小细胞肺癌中不同免疫治疗反应的肿瘤微环境差异	非小细胞肺癌中的主要病理反应（MPR）和非主要病理反应（NMPR）样本	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	包括四个主要MPR样本和八个主要NMPR样本
583	2024-09-04	SCG2 mediates blood-brain barrier dysfunction and schizophrenia-like behaviors after traumatic brain injury 2024-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202401117R PMID:39225388	研究论文	研究通过单细胞RNA测序评估创伤性脑损伤后额叶皮层细胞的转录变化，并探讨了SCG2在TBI诱发的精神分裂症中的介导作用及其机制。	首次揭示了SCG2通过CypA-MMP-9信号通路触发血脑屏障破坏，并提供了治疗TBI后精神障碍的新疗法。	NA	探究创伤性脑损伤后神经功能障碍的机制及其与精神分裂症样行为的关系。	创伤性脑损伤后的额叶皮层细胞及SCG2的作用。	神经科学	精神分裂症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
584	2024-09-04	Single-cell transcriptomics reveals tumor-infiltrating B cell function after neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in non-small cell lung cancer 2024-Sep-02, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiad138 PMID:37931147	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析了12名III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞，探讨了新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能	首次详细探讨了肿瘤浸润B细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其与新辅助化疗免疫治疗效果的关系	研究样本量有限，且仅限于III期非小细胞肺癌患者	探讨非小细胞肺癌中新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能	III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	12名III期非小细胞肺癌患者
585	2024-09-04	Characteristics and functions of an atypical inflammation-associated GZMK+GZMB+CD8+ T subset in people living with HIV-1 2024-Sep, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.003 PMID:39053388	research paper	本研究通过分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和匹配的T细胞受体序列（TCR）数据，深入探讨了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的特征及其与疾病的相关性	发现了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的异质性，并进一步细分为GZMKGZMB子集和GZMKGZMB子集，后者在HIV-1感染者中显著富集	NA	探讨HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的表型和功能特征及其与疾病的相关性	HIV-1感染者中的GZMKCD8 T细胞	免疫学	HIV-1感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据	NA
586	2024-09-04	Unraveling flavivirus pathogenesis: from bulk to single-cell RNA-sequencing strategies 2024-Sep-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology DOI:10.4196/kjpp.2024.28.5.403 PMID:39198221	综述	本文综述了从批量到单细胞RNA测序策略在解析黄病毒发病机制中的应用	介绍了病毒包含的单细胞RNA测序（viscRNA-seq）这一创新技术，解决了非多聚腺苷酸黄病毒基因组带来的挑战	NA	探讨RNA测序技术在细胞系实验和黄病毒感染患者研究中的应用，加速有效诊断和治疗的发展	黄病毒及其与宿主的相互作用	生物信息学	NA	RNA测序（RNA-seq）	NA	转录组数据	NA
587	2024-09-04	Hydatidiform mole identification using non-invasive single-cell sequencing of fetal circulating extravillous trophoblasts isolated from maternal blood 2024-Sep, Ultrasound in obstetrics & gynecology : the official journal of the International Society of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology IF:6.1Q1 DOI:10.1002/uog.27615 PMID:38354218	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
588	2024-09-01	Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester - An analysis by single-cell RNA sequencing 2024-Sep, Reproductive biology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.repbio.2024.100919 PMID:38941941	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了第一孕期人类胎盘绒毛周细胞的基因表达谱	首次揭示了胎盘绒毛周细胞在第一孕期的特定标记物和功能，并发现了其在整合素介导的信号通路和细胞外囊泡中的组织特异性功能	NA	探讨胎盘绒毛周细胞的标记物和功能，以增进对早期胎盘发育的理解并寻找治疗胎盘相关妊娠并发症的新靶点	人类胎盘绒毛周细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	第一孕期的胎盘绒毛样本
589	2024-09-01	Integrative analysis reveals different feature of intrahepatic cholangiocarcinoma subtypes 2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1 DOI:10.1111/liv.16015 PMID:38924592	研究论文	本研究通过综合分析揭示了肝内胆管癌两种主要组织学亚型（大管型和小管型）在分子特征和免疫微环境方面的差异	发现了大管型肝内胆管癌中PPP1R1B的高表达及其在细胞增殖、迁移和侵袭中的作用，以及其作为潜在标记物和治疗靶点的可能性	NA	扩展对肝内胆管癌两种亚型分子特征和免疫微环境差异的理解	肝内胆管癌的两种主要组织学亚型	数字病理学	肝内胆管癌	全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	132名接受根治性手术的患者
590	2024-09-01	Single-cell RNA sequencing of cystic fibrosis liver disease explants reveals endothelial complement activation 2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver IF:6.0Q1 DOI:10.1111/liv.15963 PMID:38847551	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了囊性纤维化相关肝病患者的肝组织，揭示了内皮细胞的补体激活特征	首次在单细胞水平上展示了囊性纤维化肝病患者的内皮细胞特征，特别是发现了一类上调补体级联反应和凝血相关基因的特殊内皮细胞群体	研究样本量较小，仅包括四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织	探究囊性纤维化相关肝病中内皮细胞的病理特征及其在疾病发展中的作用	囊性纤维化相关肝病患者的肝组织内皮细胞	数字病理学	囊性纤维化	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织
591	2024-09-01	Multi-omic analysis and validation reveal ZBP1 as a potential prognostic and immunotherapy-related biomarker in head and neck squamous cell carcinoma 2024-Sep, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery DOI:10.1016/j.jormas.2024.101901 PMID:38688403	研究论文	本研究通过多组学分析和验证，揭示了ZBP1作为头颈部鳞状细胞癌潜在的预后和免疫治疗相关生物标志物	首次全面揭示ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的潜在预后和免疫治疗相关作用	NA	旨在识别ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的可能功能	ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与临床预后和免疫特征的关系	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	多组学分析	NA	基因表达数据	66个肿瘤样本和37个对照样本
592	2024-09-01	Lung Fibrosis Is Linked to Increased Endothelial Cell Activation and Dysfunctional Vascular Barrier Integrity 2024-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2024-0046OC PMID:38843440	研究论文	本研究通过透射电子显微镜、免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了肺纤维化患者与供体肺血管的差异，并研究了血管屏障阻力、内皮-免疫细胞粘附及对炎症环境的敏感性。	首次详细描述了肺纤维化中内皮细胞的异常激活和血管屏障功能障碍，并提出了恢复内皮细胞稳态和功能作为治疗肺纤维化的新策略。	研究主要基于体外实验和患者样本，需要进一步的临床试验验证其治疗策略的有效性。	探讨肺纤维化中内皮细胞的激活和血管屏障功能障碍的机制。	肺纤维化患者的肺血管和内皮细胞。	NA	肺纤维化	透射电子显微镜、免疫组织化学、单细胞RNA测序	NA	图像、基因表达数据	多个肺纤维化患者和供体样本
593	2024-08-31	Bi-functional CpG-STAT3 decoy oligonucleotide triggers multilineage differentiation of acute myeloid leukemia in mice 2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids DOI:10.1016/j.omtn.2024.102268 PMID:39171140	研究论文	研究通过使用双功能CpG-STAT3诱饵寡核苷酸，触发小鼠急性髓系白血病细胞的多谱系分化	本研究揭示了通过STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制，并展示了双功能寡核苷酸通过同时抑制STAT3和/或DNMT来释放TLR9驱动的白血病细胞分化的免疫治疗潜力	NA	阐明STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制，并探索双功能寡核苷酸在白血病治疗中的应用	急性髓系白血病细胞	数字病理学	白血病	寡核苷酸技术	NA	转录组数据	小鼠来源的急性髓系白血病细胞
594	2024-08-30	The Novel-B-Cell-Related Gene Signature Predicts the Prognosis and Immune Status of Patients with Esophageal Carcinoma 2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer IF:1.6Q4 DOI:10.1007/s12029-024-01083-x PMID:38963643	研究论文	本研究通过单细胞转录组数据分析，开发了一种新的B细胞相关基因签名（BRGrisk），用于预测食管癌患者的预后和免疫状态	首次开发了B细胞相关基因签名（BRGrisk），用于食管癌患者的预后分层和个性化治疗策略的指导	NA	研究B细胞在食管癌中的预后意义及其在肿瘤微环境中的作用	食管癌患者的预后和免疫状态	数字病理学	食管癌	单细胞转录组分析	LASSO回归分析	基因数据	来自癌症基因组图谱队列的患者被分为训练队列和测试队列
595	2024-08-29	Analysis of single-cell transcriptome data from a mouse model implicates protein synthesis dysfunction in schizophrenia 2024-Sep, Genes & genomics IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s13258-024-01545-3 PMID:39083157	研究论文	研究使用单细胞RNA测序数据分析了Setd1a±敲除小鼠模型中基因表达的变化，以揭示精神分裂症的发病机制	首次在单细胞水平上分析了Setd1a±敲除小鼠模型中与精神分裂症相关的基因表达变化，并识别了关键的生物学途径，如蛋白质合成和EIF2信号传导途径	研究仅限于Setd1a±敲除小鼠模型，结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证	探讨精神分裂症的发病机制，特别是基因表达变化和相关生物学途径	Setd1a±敲除小鼠的前额叶皮质和纹状体中的单细胞RNA测序数据	数字病理学	精神分裂症	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因表达数据	前额叶皮质和纹状体中共识别了273个独特的差异表达基因（DEGs）和675个包含差异转录使用的基因峰（DTU）
596	2024-08-29	Function of unconventional T cells in oral lichen planus revealed by single-cell RNA sequencing 2024-Sep, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-024-01912-6 PMID:39073597	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔扁平苔藓中非典型T细胞的功能和分子特征	首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了口腔扁平苔藓中单个细胞的特征，并揭示了非典型T细胞在疾病中的独特应激反应状态	NA	旨在通过单细胞RNA测序技术探索口腔扁平苔藓中非典型T细胞的分子特征	口腔扁平苔藓患者的颊黏膜样本和健康个体的颊黏膜样本	数字病理学	口腔扁平苔藓	单细胞RNA测序	NA	细胞	口腔扁平苔藓患者和健康个体的颊黏膜样本
597	2024-08-29	Distinct granzyme k expression in immune cells: a single-cell rna-seq meta-analysis 2024-Sep, Genes & genomics IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s13258-024-01555-1 PMID:39115674	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序元分析，探讨了GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式	首次通过单细胞RNA测序元分析揭示了GZMK在不同免疫细胞和组织中的独特表达调控机制	NA	揭示GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式	GZMK在不同免疫细胞类型中的表达	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及成熟T细胞、NK细胞、B细胞和NKT细胞等多种免疫细胞类型
598	2024-08-29	Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer 2024-Sep, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108989 PMID:39142223	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，建立了一个与癌症相关成纤维细胞（CAFs）相关的miRNA模型，用于评估前列腺癌的预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选	首次通过单细胞转录组学分析，确定了89个与CAFs相关的mRNAs，并建立了一个基于9个CAFs相关miRNA的预后模型，用于预测前列腺癌的生化复发	研究主要基于数据库中的数据进行分析，未涉及大规模的临床试验验证	建立一个与CAFs相关的miRNA模型，用于个性化和精准治疗前列腺腺癌患者	前列腺癌相关成纤维细胞（CAFs）及其相关的miRNAs	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（buRNA-seq）	支持向量机（SVM）	RNA测序数据	34名前列腺癌患者
599	2024-08-27	Exploring the Influence of T Cell Marker Gene Expression on the Pathobiology and Clinical Prognostic Outcomes in Intestinal-Type Gastric Carcinoma 2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer IF:1.6Q4 DOI:10.1007/s12029-024-01104-9 PMID:39136893	研究论文	本研究探讨了T细胞标记基因表达在肠型胃癌病理生物学和临床预后中的作用	开发了一种基于T细胞标记基因的风险评分，用于胃癌患者的生存预测	NA	阐明免疫系统，特别是T细胞及其亚型在肠型胃癌发病和进展中的作用，并评估基于T细胞标记基因的风险评分对总体生存的预测效用	肠型胃癌患者的T细胞标记基因表达及其对生存预后的影响	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	使用了来自癌症基因组图谱(TCGA)和GSE15459数据集的数据
600	2024-08-26	Effects of tumor treating fields (TTFields) on human mesenchymal stromal cells 2024-Sep, Journal of neuro-oncology IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s11060-024-04740-0 PMID:38900237	研究论文	研究肿瘤治疗场（TTFields）对人类间充质基质细胞（MSCs）的影响	首次探讨了TTFields对MSCs的影响，填补了该领域的知识空白	仅在体外进行了实验，尚未在临床环境中验证	研究TTFields对间充质基质细胞的生物学效应	人类间充质基质细胞（MSCs）	NA	脑肿瘤	单细胞RNA测序、免疫荧光染色、流式细胞术、Boyden室实验	NA	细胞	患者样本中的间充质基质细胞