单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
581 2024-09-01
Multi-omic analysis and validation reveal ZBP1 as a potential prognostic and immunotherapy-related biomarker in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Sep, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 本研究通过多组学分析和验证,揭示了ZBP1作为头颈部鳞状细胞癌潜在的预后和免疫治疗相关生物标志物 首次全面揭示ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的潜在预后和免疫治疗相关作用 NA 旨在识别ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的可能功能 ZBP1在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与临床预后和免疫特征的关系 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 多组学分析 NA 基因表达数据 66个肿瘤样本和37个对照样本
582 2024-09-01
Lung Fibrosis Is Linked to Increased Endothelial Cell Activation and Dysfunctional Vascular Barrier Integrity
2024-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过透射电子显微镜、免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了肺纤维化患者与供体肺血管的差异,并研究了血管屏障阻力、内皮-免疫细胞粘附及对炎症环境的敏感性。 首次详细描述了肺纤维化中内皮细胞的异常激活和血管屏障功能障碍,并提出了恢复内皮细胞稳态和功能作为治疗肺纤维化的新策略。 研究主要基于体外实验和患者样本,需要进一步的临床试验验证其治疗策略的有效性。 探讨肺纤维化中内皮细胞的激活和血管屏障功能障碍的机制。 肺纤维化患者的肺血管和内皮细胞。 NA 肺纤维化 透射电子显微镜、免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA 图像、基因表达数据 多个肺纤维化患者和供体样本
583 2024-08-31
Bi-functional CpG-STAT3 decoy oligonucleotide triggers multilineage differentiation of acute myeloid leukemia in mice
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 研究通过使用双功能CpG-STAT3诱饵寡核苷酸,触发小鼠急性髓系白血病细胞的多谱系分化 本研究揭示了通过STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并展示了双功能寡核苷酸通过同时抑制STAT3和/或DNMT来释放TLR9驱动的白血病细胞分化的免疫治疗潜力 NA 阐明STAT3抑制/TLR9激活驱动的inv(16) AML重编程的分子机制,并探索双功能寡核苷酸在白血病治疗中的应用 急性髓系白血病细胞 数字病理学 白血病 寡核苷酸技术 NA 转录组数据 小鼠来源的急性髓系白血病细胞
584 2024-08-30
The Novel-B-Cell-Related Gene Signature Predicts the Prognosis and Immune Status of Patients with Esophageal Carcinoma
2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer IF:1.6Q4
研究论文 本研究通过单细胞转录组数据分析,开发了一种新的B细胞相关基因签名(BRGrisk),用于预测食管癌患者的预后和免疫状态 首次开发了B细胞相关基因签名(BRGrisk),用于食管癌患者的预后分层和个性化治疗策略的指导 NA 研究B细胞在食管癌中的预后意义及其在肿瘤微环境中的作用 食管癌患者的预后和免疫状态 数字病理学 食管癌 单细胞转录组分析 LASSO回归分析 基因数据 来自癌症基因组图谱队列的患者被分为训练队列和测试队列
585 2024-08-29
Analysis of single-cell transcriptome data from a mouse model implicates protein synthesis dysfunction in schizophrenia
2024-Sep, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 研究使用单细胞RNA测序数据分析了Setd1a±敲除小鼠模型中基因表达的变化,以揭示精神分裂症的发病机制 首次在单细胞水平上分析了Setd1a±敲除小鼠模型中与精神分裂症相关的基因表达变化,并识别了关键的生物学途径,如蛋白质合成和EIF2信号传导途径 研究仅限于Setd1a±敲除小鼠模型,结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证 探讨精神分裂症的发病机制,特别是基因表达变化和相关生物学途径 Setd1a±敲除小鼠的前额叶皮质和纹状体中的单细胞RNA测序数据 数字病理学 精神分裂症 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 基因表达数据 前额叶皮质和纹状体中共识别了273个独特的差异表达基因(DEGs)和675个包含差异转录使用的基因峰(DTU)
586 2024-08-29
Function of unconventional T cells in oral lichen planus revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了口腔扁平苔藓中非典型T细胞的功能和分子特征 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了口腔扁平苔藓中单个细胞的特征,并揭示了非典型T细胞在疾病中的独特应激反应状态 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术探索口腔扁平苔藓中非典型T细胞的分子特征 口腔扁平苔藓患者的颊黏膜样本和健康个体的颊黏膜样本 数字病理学 口腔扁平苔藓 单细胞RNA测序 NA 细胞 口腔扁平苔藓患者和健康个体的颊黏膜样本
587 2024-08-29
Distinct granzyme k expression in immune cells: a single-cell rna-seq meta-analysis
2024-Sep, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序元分析,探讨了GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 首次通过单细胞RNA测序元分析揭示了GZMK在不同免疫细胞和组织中的独特表达调控机制 NA 揭示GZMK在不同免疫细胞类型中的表达模式 GZMK在不同免疫细胞类型中的表达 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及成熟T细胞、NK细胞、B细胞和NKT细胞等多种免疫细胞类型
588 2024-08-27
Exploring the Influence of T Cell Marker Gene Expression on the Pathobiology and Clinical Prognostic Outcomes in Intestinal-Type Gastric Carcinoma
2024-Sep, Journal of gastrointestinal cancer IF:1.6Q4
研究论文 本研究探讨了T细胞标记基因表达在肠型胃癌病理生物学和临床预后中的作用 开发了一种基于T细胞标记基因的风险评分,用于胃癌患者的生存预测 NA 阐明免疫系统,特别是T细胞及其亚型在肠型胃癌发病和进展中的作用,并评估基于T细胞标记基因的风险评分对总体生存的预测效用 肠型胃癌患者的T细胞标记基因表达及其对生存预后的影响 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了来自癌症基因组图谱(TCGA)和GSE15459数据集的数据
589 2024-08-26
Effects of tumor treating fields (TTFields) on human mesenchymal stromal cells
2024-Sep, Journal of neuro-oncology IF:3.2Q2
研究论文 研究肿瘤治疗场(TTFields)对人类间充质基质细胞(MSCs)的影响 首次探讨了TTFields对MSCs的影响,填补了该领域的知识空白 仅在体外进行了实验,尚未在临床环境中验证 研究TTFields对间充质基质细胞的生物学效应 人类间充质基质细胞(MSCs) NA 脑肿瘤 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、流式细胞术、Boyden室实验 NA 细胞 患者样本中的间充质基质细胞
590 2024-08-07
Unlocking Skin's Symphony: Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal the Harmonious Interplay among Diverse Cell Populations
2024-Sep, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
591 2024-08-25
Association Between COVID-19 and Neurological Diseases: Evidence from Large-Scale Mendelian Randomization Analysis and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2024-Sep, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析,探讨了COVID-19与神经系统疾病之间的因果关系 首次通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序分析,揭示了SARS-CoV-2感染与癫痫和躁狂等神经系统疾病的因果关系 研究未观察到COVID-19对其他特征的显著影响 评估SARS-CoV-2感染与神经系统疾病之间的因果关系,并分析SARS-CoV-2在细胞水平的潜在入侵途径 SARS-CoV-2感染与神经系统疾病的关系 NA 神经系统疾病 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 23种细胞亚型
592 2024-08-24
Exploring the role of DNMT1 in dental papilla cell fate specification during mouse tooth germ development through integrated single-cell transcriptomics and bulk RNA sequencing
2024-Sep, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
研究论文 本研究通过综合单细胞转录组学和批量RNA测序技术,探索了DNMT1在小鼠牙胚发育中牙乳头细胞命运决定的作用 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序相结合的方法,揭示了DNMT1在早期成牙本质细胞发育中的关键调控作用 研究主要集中在胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞,未来研究可以扩展到不同发育阶段和不同物种 探究牙齿发育过程中牙间充质细胞的调控机制,特别是成牙本质细胞分化和表观遗传调控的作用 小鼠牙胚中的牙间充质细胞和成牙本质细胞分化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 单细胞调控网络推理和聚类(SCENIC) RNA 胚胎第14.5天的小鼠牙胚细胞和分离的牙间充质细胞
593 2024-08-24
Single-cell transcriptome sequencing partially revealed the changes of T cells in the early stage of aging kidney
2024-Sep, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了衰老肾脏早期阶段T细胞的分子表型和组成变化 首次详细描述了衰老肾脏中T细胞的分子状态变化和极化现象,并识别出特定亚群的T细胞 研究仅限于小鼠模型,且未探讨人类肾脏衰老的具体情况 探究肾脏衰老早期阶段免疫细胞的变化及其分子机制 衰老小鼠肾脏中的T细胞和其他免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 未具体说明样本数量
594 2024-08-24
Resolution of Acinar Dedifferentiation Regulates Tissue Remodeling in Pancreatic Injury and Cancer Initiation
2024-Sep, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本文通过比较转录组分析研究了胰腺损伤和癌症起始过程中腺泡细胞去分化调控的机制。 发现Sox4基因在胰腺腺泡细胞去分化过程中起到抑制作用,并揭示了其在维持组织稳态和肿瘤退化中的新功能。 NA 探讨胰腺腺泡细胞去分化在胰腺损伤和癌症起始中的作用及机制。 胰腺腺泡细胞去分化过程中的Sox4基因及其调控机制。 数字病理学 胰腺癌 RNA原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠模型
595 2024-08-24
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
研究论文 本文研究了抑制肾素表达的调控机制,通过使用不同抑制剂处理As4.1细胞,并利用ATAC-seq、单细胞RNA测序等技术分析了肾素表达的表观遗传调控。 首次揭示了肾素表达在细胞中从活跃状态转变为准备状态的表观遗传调控机制,并识别了与肾素调控相关的转录因子基序和基因。 研究主要集中在As4.1细胞模型上,可能需要进一步在其他细胞类型或体内模型中验证这些发现。 探究肾素表达的表观遗传调控机制及其在细胞功能转换中的作用。 As4.1细胞(源自小鼠近球小体的肿瘤细胞,持续表达肾素)。 NA NA ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 NA 基因表达数据, 染色质可及性数据 处理和对照的As4.1细胞的生物学重复样本
596 2024-08-07
Corrigendum to "Single-cell transcriptomics reveals CD8+ T cell structure and developmental trajectories in idiopathic pulmonary fibrosis" [Mol. Immunol. 172 (2024) 85-95]
2024-Sep, Molecular immunology IF:3.2Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
597 2024-08-23
Comparison among different preclinical models derived from the same patient with a non-functional pancreatic neuroendocrine tumor
2024-Sep, Human cell IF:3.4Q3
research paper 本文比较了从同一非功能性胰腺神经内分泌肿瘤患者中衍生出的不同临床前模型 成功构建了患者来源的类器官和患者来源的异种移植模型,并提供了新的肿瘤建模平台 NA 深入研究胰腺神经内分泌肿瘤的分子生物学机制 胰腺神经内分泌肿瘤的临床前模型 digital pathology 胰腺肿瘤 免疫组织化学、全外显子测序、单细胞转录组测序 NA 组织 来自同一患者的多个模型
598 2024-08-23
Integrative analysis of long isoform sequencing and functional data identifies distinct cortical layer neuronal subtypes derived from human iPSCs
2024-Sep-01, Journal of neurophysiology IF:2.1Q3
研究论文 本文比较了两种不同培养基中人诱导多能干细胞(iPSCs)向神经元分化的效率,并使用长读单细胞RNA测序验证了不同皮质层神经元亚型的存在 提出了一种时间效率高且稳健的神经元分化方法,能够在较短时间内高效生成功能性皮质层神经元 低分化效率是现有协议的主要缺点 研究iPSCs向神经元分化的效率,并验证生成的神经元的功能性 人诱导多能干细胞(iPSCs)及其向神经元分化的过程 再生医学 NA 长读单细胞RNA测序 NA RNA 30天和35天的神经元培养物
599 2024-08-21
Comparative assessment of the intragenomic variations of dinoflagellate Tripos species through single-cell sequencing
2024-Sep, Marine pollution bulletin IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术评估和比较了三角藻属(Tripos)物种的基因组内变异(IGVs) 首次使用高通量测序(HTS)对Tripos物种的18S rDNA V4区域进行单细胞测序,揭示了高水平的基因组内变异 研究仅限于Tripos物种的30个单细胞,可能无法代表所有Tripos物种的基因组内变异情况 评估和比较Tripos物种的基因组内变异,探讨其在分子多样性分析中的影响 Tripos物种的基因组内变异 生物信息学 NA 高通量测序(HTS) NA DNA序列 30个Tripos物种的单细胞
600 2024-08-21
Targeting mitochondrial dysfunction in atopic dermatitis with trilinolein: A triacylglycerol from the medicinal plant Cannabis fructus
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了从药用植物大麻果实中提取的三亚油酸甘油酯(trilinolein)在治疗特应性皮炎(AD)中的作用及其机制 首次揭示了trilinolein通过AhR-Nrf2途径减轻NOX2依赖的线粒体功能障碍,修复皮肤屏障 研究主要集中在细胞和小鼠模型上,尚未进行人体临床试验 评估trilinolein在预防和治疗特应性皮炎中的潜力及其作用机制 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤样本,以及DNCB诱导的BALB/c小鼠和IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞 NA 特应性皮炎 HPLC-ESI-MS/MS分析,单细胞转录组分析,蛋白质组学分析 NA 蛋白质表达数据 慢性AD患者和健康对照者的皮肤样本,DNCB诱导的BALB/c小鼠,IL-4及TNF-α诱导的HaCaT细胞
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