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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-05-09
The aminophospholipid transporter, ATP8B3, as a potential biomarker and target for enhancing the therapeutic effect of PD-L1 blockade in colon adenocarcinoma
2024-09, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,发现ATP8B3在结肠腺癌中可作为潜在生物标志物,抑制ATP8B3可降低PD-L1表达并增强免疫治疗效果 首次揭示ATP8B3在结肠腺癌中调控PD-L1表达及免疫抑制微环境的作用,并提出联合ATP8B3抑制剂与免疫疗法的新策略 由于MSS亚型微环境中缺乏免疫杀伤细胞,ATP8B3高表达未能增加该类患者对PD-L1抑制剂的敏感性 探究ATP8B3作为结肠腺癌潜在生物标志物及增强PD-L1阻断治疗效果的靶点 结肠腺癌患者及细胞系 机器学习, 数字病理学 结肠腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA, shRNA, 蛋白质印迹分析, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 免疫浸润数据 TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
42 2026-05-09
Multi-omics analysis reveals a pericyte-associated gene expression signature for predicting prognosis and therapeutic responses in solid cancers
2024-09, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 通过多组学分析揭示周细胞相关基因表达特征,用于预测实体癌预后和治疗反应 首次识别肿瘤来源周细胞中的51个差异表达基因,并基于其中5个关键基因构建预后风险模型,可准确预测肝癌和肺癌的预后及治疗反应 仅验证了肝癌和肺癌中的发现,未在其他实体瘤中进行广泛验证 探究肿瘤微环境中血管周细胞对癌症进展的影响,并构建基于周细胞的预后预测模型 实体癌(肝癌和肺癌)患者 机器学习 肝癌, 肺癌 转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫染色 预后风险模型 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 TCGA及GEO数据库中的多个样本集(具体数量未在摘要中说明) NA NA NA NA
43 2026-05-08
Deciphering cellular heterogeneity in Spodoptera frugiperda midgut cell line through single cell RNA sequencing
2024-09, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示草地贪夜蛾中肠细胞系的细胞异质性 首次在非模式生物中肠细胞系中应用单细胞RNA测序技术,发现并分类了十种独特的细胞群,包括干细胞、成肠细胞、肠细胞和肠内分泌细胞,并鉴定其特异性标记基因 未明确提及,可能包括细胞系与体内环境的差异、样本量有限以及缺乏功能验证等 探讨草地贪夜蛾中肠细胞系的细胞异质性,并研究呼吸和中肠膜杀虫剂靶标基因的表达 草地贪夜蛾中肠细胞系SfMG-0617细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 18,794个细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序平台
44 2026-05-08
Genetic structure analysis of yak breeds and their response to adaptive evolution
2024-09, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 通过全基因组重测序和单细胞RNA测序,研究牦牛品种的遗传结构及其对高海拔环境的适应性进化 首次结合全基因组重测序和单细胞RNA测序方法,系统分析牦牛肺和皮肤组织的转录图谱,揭示高海拔适应相关基因在不同细胞类型中的表达特征 未对牦牛的其他组织进行系统细胞分析,样本量可能有限 研究牦牛品种的遗传结构、遗传多样性及其对高海拔环境的适应性分子机制 不同牦牛品种(如TZ_牦牛、PL_牦牛、SB_牦牛等)及其肺组织和皮肤组织 机器学习和基因组学 高海拔适应 全基因组重测序(WGRS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组测序数据、单细胞转录组数据 八个牦牛群体 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA NA
45 2026-05-07
A spatiotemporally resolved atlas of mRNA decay in the C. elegans embryo reveals differential regulation of mRNA stability across stages and cell types
2024-09-20, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 通过转录抑制结合批量及单细胞RNA测序,直接测量线虫胚胎发育过程中全转录组的mRNA降解速率,揭示mRNA稳定性在不同阶段和细胞类型中的差异调控 首次实现胚胎发育过程中时空分辨的mRNA降解速率全转录组测量,并识别不同细胞类型和发育阶段中差异调控的mRNA降解 NA 研究线虫胚胎发育过程中mRNA降解的时空调控及其对基因表达动态的影响 线虫胚胎 NA NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA RNA测序数据 NA NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
46 2026-05-07
Benchmarking bulk and single-cell variant-calling approaches on Chromium scRNA-seq and scATAC-seq libraries
2024-09-20, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 评估在Chromium scRNA-seq和scATAC-seq文库上进行批量与单细胞变异检测的方法 系统比较了基于批量聚合读取与单个细胞的变异检测方法在10x Genomics平台上的表现,发现批量方法显著优于单细胞方法,并揭示了单细胞方法中RNA编辑事件的潜在捕获与噪声模式 未涵盖所有变异检测工具,且结果基于特定平台(10x Genomics Chromium),可能不适用于其他单细胞技术 评估在Chromium scRNA-seq和scATAC-seq文库上不同变异检测方法的优劣与挑战 匹配的批量全基因组测序样本库 生物信息学 NA scRNA-seq, scATAC-seq, 全基因组测序 NA 测序数据 多个匹配的批量全基因组测序样本库(具体数量未在摘要中提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序文库
47 2026-05-05
Single-cell analysis revealing the metabolic landscape of prostate cancer
2024-09-01, Asian journal of andrology IF:3.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示前列腺癌的代谢景观 利用计算流程进行单细胞RNA测序,首次描绘了前列腺癌中上皮细胞与基质细胞的代谢活性差异,并发现神经内分泌细胞具有高代谢率,可能解释神经内分泌前列腺癌的高营养和能量需求 仅基于计算和部分实验验证,未进行大规模临床样本验证 通过单细胞水平分析揭示前列腺癌的代谢异质性和疾病进展机制 前列腺癌细胞及其微环境中的上皮细胞、基质细胞和神经内分泌细胞 数字病理 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
48 2026-05-04
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过体内外模型研究致癌RAS剂量滴定如何改变衰老状态并影响肿瘤起始 首次开发RAS剂量递增模型,揭示低剂量RAS驱动的非连续性下游表型,并发现NRAS(G12V)水平降低可导致肝细胞免疫逃逸与肿瘤形成 未明确说明局限性 探究致癌RAS剂量变化对衰老表型及肿瘤起始的影响 肝细胞衰老模型中的小鼠肝细胞及肿瘤 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肝细胞样本及肿瘤样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
49 2026-05-01
Developmental regulation of dermal adipose tissue by BCL11b
2024-09-19, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 利用单细胞转录组学技术研究BCL11b对小鼠胚胎真皮脂肪组织发育的调控作用 首次发现BCL11b表达通过调节Wnt信号微环境促进真皮脂肪细胞分化,揭示了真皮与皮下及内脏脂肪组织在胚胎发育中的不同调控机制 未提供 研究胚胎发生过程中真皮脂肪组织的发育调控机制及其对代谢疾病的影响 小鼠胚胎发生过程中的细胞群体 单细胞转录组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠胚胎样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
50 2026-04-30
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 mosna是一个Python包,用于分析空间组学数据并整合临床数据,以揭示与免疫治疗反应和癌症生存相关的细胞相互作用模式 开发了一个与所有空间组学方法兼容的Python包,能够整合多种算法并利用临床数据构建准确的空间网络,无缝训练机器学习模型并识别最具预测力的变量 NA 使空间组学数据与临床或生物数据的集成分析更加易于进行,从而获得对细胞相互作用模式或组织结构的生物学洞察 空间组学数据产生的数据集,包括亚细胞分辨转录组学(MERFISH、seqFISH)、蛋白质组学(CODEX、MIBI-TOF、低多重免疫荧光)以及基于斑点的空间转录组学(10x Visium) 计算机视觉 癌症 空间组学 机器学习 模态数据(空间组学数据与临床数据) NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
51 2026-04-24
CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph nodes and blood following mRNA vaccination in humans
2024-Sep, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学评估mRNA疫苗接种后人类血液和淋巴结中CD4+ T细胞的转录表型 利用深度学习反向表位映射方法Trex预测抗原特异性,结合单细胞转录组学揭示了淋巴结和血液中刺突蛋白特异性CD4+ T细胞的异质性表型,并比较了疫苗接种与感染后的差异 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 探究mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中CD4+ T细胞的转录表型特征 BNT162b2 mRNA疫苗接种者和SARS-CoV-2感染者的刺突蛋白特异性CD4+ T细胞 机器学习 NA 单细胞转录组学 深度学习模型Trex 单细胞转录组数据 1277个刺突特异性CD4+ T细胞(其中238个通过Trex方法预测) NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-04-17
Oncogenic Calreticulin Induces Immune Escape by Stimulating TGFβ Expression and Regulatory T-cell Expansion in the Bone Marrow Microenvironment
2024-Sep-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了致癌性钙网蛋白通过刺激TGFβ表达和调节性T细胞扩增,在骨髓微环境中诱导免疫逃逸的机制 首次在骨髓增殖性肿瘤中鉴定出ERK/Sp1/TGFβ1轴作为免疫抑制机制,并证明靶向该轴可增强T细胞活性和糖酵解能力 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 探究致癌性钙网蛋白突变如何影响骨髓微环境并促进免疫逃逸 骨髓增殖性肿瘤患者和小鼠模型中的骨髓细胞及T细胞 肿瘤免疫学 骨髓增殖性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 四个独立患者队列及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-04-17
CD8+ T-cell differentiation and dysfunction inform treatment response in acute myeloid leukemia
2024-09-12, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过多模态方法揭示了急性髓系白血病中CD8+ T细胞分化状态、功能障碍与治疗反应之间的关联 首次发现早期记忆CD8+ T细胞在AML治疗反应中的关键作用,并揭示其分化为激活状态与NK样/衰老状态两种终末状态的动态过程 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证CD8+ T细胞衰老与治疗抵抗的因果机制 探究急性髓系白血病中CD8+ T细胞分化状态与治疗反应的关系 急性髓系白血病患者的CD8+ T细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 高维流式细胞术,单细胞转录组测序 NA 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据 整合多个独立数据集的AML CD8+ T细胞单细胞图谱 NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2026-04-17
Tumor immune microenvironment of NSCLC with EGFR exon 20 insertions may predict efficacy of first-line ICI-combined regimen
2024-09, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序和多重免疫荧光染色,探讨了EGFR外显子20插入突变非小细胞肺癌的肿瘤免疫微环境特征及其与免疫检查点抑制剂联合方案疗效的关联 首次在单细胞水平上比较了EGFR外显子20插入突变、L858R突变和野生型非小细胞肺癌的免疫微环境差异,并揭示了ex20ins患者中更抑制性的免疫微环境特征 样本量相对有限(scRNA-seq仅15例,mIF分析共62例),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证结论 探究EGFR外显子20插入突变非小细胞肺癌的肿瘤免疫微环境特征,并分析其与免疫检查点抑制剂联合方案疗效的相关性 非小细胞肺癌患者,包括EGFR外显子20插入突变、L858R突变和野生型三种亚型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 NA 单细胞转录组数据, 组织图像数据 scRNA-seq分析15例初治NSCLC样本,mIF分析62例(ex20ins 28例,L858R 30例,野生型4例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-04-15
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过抑制TRPC3通道,改善了阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 首次发现TRPC3在AD患者和模型中的上调,并鉴定出抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 研究主要基于动物和细胞模型,尚未在人类临床试验中验证 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病神经退行性变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 AD患者脑组织、AD小鼠模型(急性和慢性)以及培养的大鼠海马神经元 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、RNA-seq NA RNA-seq数据、细胞和动物模型数据 AD患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据、死后AD脑组织、急性和慢性AD小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-04-15
Lin-CD117+CD34+FcεRI+ progenitor cells are increased in chronic spontaneous urticaria and predict clinical responsiveness to anti-IgE therapy
2024-09, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究探讨了慢性自发性荨麻疹患者外周血中Lin-CD117+CD34+FcεRI+祖细胞的增加及其对抗IgE疗法临床反应性的预测价值 首次将外周血中特定的祖细胞亚群(Lin-CD34+CD117+FcεRI+)与CSU的临床表型及抗IgE治疗反应相关联,并利用单细胞RNA测序揭示了其细胞谱系组成 样本量相对有限(CSU患者n=55,对照组n=22),单细胞RNA测序仅在部分患者(n=8)和对照(n=4)中进行,需要更大规模的研究验证 探究慢性自发性荨麻疹的病理机制,并寻找预测抗IgE治疗(奥马珠单抗)临床反应性的生物标志物 慢性自发性荨麻疹患者(n=55,其中12人接受奥马珠单抗治疗)和健康对照(n=22)的外周血样本 免疫学,皮肤病学 慢性自发性荨麻疹 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 流式细胞数据,单细胞转录组数据 CSU患者55例(其中12例接受奥马珠单抗),健康对照22例;scRNA-Seq子集:CSU患者8例,健康对照4例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
57 2026-04-11
Multiplex, single-cell CRISPRa screening for cell type specific regulatory elements
2024-09-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种结合多重CRISPRa扰动与单细胞RNA测序的实验框架,用于识别细胞类型特异性的顺式调控元件及其调控基因 开发了一种将高度多重CRISPRa扰动与scRNA-seq结合的新方法,首次在单细胞水平上系统评估细胞类型特异性增强子和启动子对基因表达的调控作用 研究仅针对K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元两种细胞类型,未涵盖更广泛的细胞类型或体内环境 开发一种高通量筛选方法,以识别细胞类型特异性的CRISPRa响应顺式调控元件及其靶基因 K562细胞和iPSC衍生的兴奋性神经元 基因组学 自闭症谱系障碍和神经发育障碍 CRISPRa, 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用493个gRNA靶向候选顺式调控元件 NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-04-09
Revealing a cancer-associated fibroblast-based risk signature for pancreatic adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA-seq analysis
2024-09-26, Aging
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA-seq分析,揭示了胰腺腺癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)的风险特征,并构建了一个七基因风险特征用于预测预后和免疫治疗反应 首次探索了基于CAF的风险特征在胰腺腺癌中的预后意义,并构建了一个结合年龄和CAF特征的列线图模型,用于准确预测患者预后和免疫治疗反应 研究依赖于公开数据库数据,可能受样本异质性和数据质量限制,且风险特征在临床验证前需进一步外部验证 探索癌症相关成纤维细胞(CAF)在胰腺腺癌中的预后价值,并构建预测模型 胰腺腺癌(PAAD)患者样本 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),微阵列分析 LASSO回归,Cox回归,列线图模型 RNA-seq数据,微阵列数据 来自GSE155698(单细胞数据)、TCGA-PAAD队列和GEO数据库的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
59 2026-04-09
The cell rejuvenation atlas: leveraging network biology to identify master regulators of rejuvenation strategies
2024-09-09, Aging
研究论文 本研究开发了一个名为SINGULAR的细胞年轻化图谱,通过单细胞RNA-seq和网络生物学方法,系统分析了多种年轻化策略在多个器官中的分子机制 首次构建了统一的细胞年轻化图谱,利用网络生物学在单细胞分辨率下比较不同年轻化策略,并识别出调控年轻化反应的关键主调节因子 未在摘要中明确提及具体限制,但可能涉及数据覆盖范围或实验验证的局限性 旨在揭示年轻化策略的分子机制,以设计更全面的细胞年轻化干预措施 多种年轻化策略(如热量限制和部分重编程)在多个器官中的细胞 网络生物学 老年疾病 单细胞RNA-seq NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2026-04-09
A broken network of susceptibility genes in the monocytes of Crohn's disease patients
2024-09, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和两个独立的单细胞转录组数据集,探索了克罗恩病患者和健康对照中232个易感基因的表达网络 揭示了易感基因在人类肠道单核细胞中特异性严格表达,并首次在单细胞水平上展示了健康对照中易感基因网络的完整性及其在克罗恩病患者中的破坏 研究依赖于两个独立数据集,样本量可能有限,且未详细探讨环境因素如何具体影响基因网络 研究克罗恩病中大量易感基因的表达机制及其网络状态 克罗恩病患者和健康对照的肠道单核细胞 数字病理学 克罗恩病 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA-seq数据 两个独立数据集,具体样本数未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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