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当前共找到 633 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Machine learning-based gene expression biomarkers to distinguish Zika and Dengue virus infections: implications for diagnosis
2024-Sep, Virusdisease
DOI:10.1007/s13337-024-00885-8
PMID:39464736
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别能够区分寨卡病毒和登革热病毒感染的基因表达生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序数据和多种机器学习算法来识别区分寨卡和登革热病毒感染的基因生物标志物 | 仅分析了24小时时间点的数据，且需要进一步的实验验证 | 开发基于基因表达特征的寨卡和登革热病毒感染诊断方法 | 人类肝癌细胞系Huh7感染寨卡病毒和登革热病毒后的基因表达数据 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 逻辑回归，支持向量机，随机森林，决策树 | 基因表达数据 | GSE110496数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
WITHDRAWN: Single-cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-09-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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撤稿文章 | 该文章因作者要求已被出版商撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-09, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14080
PMID:38713190
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，揭示了内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性及ICAM1-PTGS2通讯在铁死亡中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析慢性根尖周炎中内皮细胞亚群多样性，并发现ICAM1通过调控PTGS2影响铁死亡的新机制 | 样本量较小（5个CAP样本），主要基于体外细胞实验验证，需要更多临床样本进一步确认 | 探究慢性根尖周炎中内皮细胞多样性及ICAM1-PTGS2通讯在疾病发生发展中的作用机制 | 慢性根尖周炎患者组织样本、人脐静脉内皮细胞（HUVECs）、THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 实时PCR, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 基因表达数据 | 5个慢性根尖周炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Hyperedge Representations with Hypergraph Wavelets: Applications to Spatial Transcriptomics
2024-Sep-14, ArXiv
PMID:39314512
|
研究论文 | 本文提出了一种基于超图小波的超边表示方法，并将其应用于空间转录组学数据分析 | 引入了超图扩散小波概念，并展示了其在谱和空间特性方面的优势 | NA | 开发能够捕捉多对象间高阶关系的表示方法，应用于生物医学发现 | 空间转录组学数据中的疾病相关细胞生态位 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 超图小波 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Bin2cell reconstructs cells from high resolution Visium HD data
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae546
PMID:39250728
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研究论文 | 开发了一种从高分辨率Visium HD数据重建细胞的方法Bin2cell | 首个利用形态学图像分割和基因表达信息从2微米分辨率数据重建细胞的工具 | NA | 解决Visium HD平台捕获区域聚合成单细胞的挑战 | 小鼠大脑和人类结直肠癌数据 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据,形态学图像 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD, 2微米和8微米分辨率 |
| 46 | 2025-10-06 |
Scywalker: scalable end-to-end data analysis workflow for long-read single-cell transcriptome sequencing
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae549
PMID:39254601
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研究论文 | 开发了一个名为scywalker的可扩展端到端数据分析工作流，用于处理长读长单细胞转录组测序数据 | 开发了新颖的可扩展细胞条形码解复用和单细胞异构体识别与定量方法，并将这些整合到一个易于部署的软件包中 | NA | 解决现有纳米孔单细胞数据分析工具在处理当前数据规模时的严重限制 | 人类大脑、拟南芥叶片和混合细胞系的长读长单细胞转录组测序数据 | 生物信息学 | NA | 长读长单细胞转录组测序，纳米孔测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，FASTQ格式序列数据 | NA | Oxford Nanopore | 单细胞RNA-seq，长读长测序 | NA | 纳米孔长读长单细胞转录组测序 |
| 47 | 2025-10-06 |
Combined deletion of Mct8 and Dio2 impairs SVZ neurogliogenesis and olfactory function in adult mice
2024-09, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106572
PMID:38901782
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研究论文 | 本研究通过Mct8/Dio2双敲除小鼠模型揭示了甲状腺激素转运蛋白MCT8和活化酶DIO2在调控成年小鼠脑室下区神经胶质生成中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示MCT8和DIO2协同调控成年神经干细胞命运决定和嗅觉功能的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究甲状腺激素可用性调节因子对成年神经发生和胶质发生的影响 | Mct8/Dio2双敲除成年小鼠的脑室下区神经干细胞及其衍生细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Expansion of effector regulatory T cells in steroid responders of severe alcohol-associated hepatitis
2024-Sep-01, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society
IF:4.7Q1
DOI:10.1097/LVT.0000000000000378
PMID:38809243
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研究论文 | 本研究探讨效应调节性T细胞在严重酒精性肝炎患者对类固醇治疗反应中的作用机制 | 首次揭示类固醇治疗有效者体内效应调节性T细胞扩增现象及其与临床预后的相关性 | 样本量较小（n=47），单细胞RNA测序仅针对单个病例 | 阐明效应调节性T细胞在酒精性肝炎类固醇治疗反应中的作用机制 | 47例酒精性肝炎患者（18例重症接受类固醇治疗，29例轻症未治疗） | 免疫学 | 酒精性肝炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 临床数据 | 47例患者，采集基线和治疗7天后配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51649-3
PMID:39218971
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研究论文 | 提出一种基于混合效应模型的单细胞RNA-seq数据分析工具scDist，用于稳健识别疾病条件下的扰动细胞类型 | 开发了基于混合效应模型的统计严谨计算方法，能有效减少个体间和队列间变异导致的假阳性发现 | NA | 开发稳健识别单细胞RNA-seq数据中扰动细胞类型的计算方法 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 生物信息学 | COVID-19, 免疫治疗相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
From bioinformatics to clinical applications: a novel prognostic model of cuproptosis-related genes based on single-cell RNA sequencing data in hepatocellular carcinoma
2024-09-09, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00649-5
PMID:39251909
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据开发了一种铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和RNA测序数据构建铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 模型验证仍需更多临床队列验证 | 研究铜死亡相关基因与肝细胞癌预后的关系并构建预后模型 | 肝细胞癌患者和正常对照 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的肝细胞癌患者和正常对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Regulator of G-protein signaling expression in human intestinal enteroendocrine cells and potential role in satiety hormone secretion in health and obesity
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105283
PMID:39142076
|
研究论文 | 本研究揭示了人肠道内分泌细胞中G蛋白信号调节因子的表达谱及其在饱腹激素分泌和肥胖中的潜在作用 | 首次在瘦型和肥胖个体中通过单细胞RNA测序揭示了肠道内分泌细胞独特的RGS表达谱，并发现RGS9表达与BMI正相关、与餐后GLP-1和PYY负相关 | 样本量相对有限（61例患者），部分数据依赖公开数据集，需要进一步验证RGS的具体作用机制 | 探究RGS在肠道内分泌细胞中的表达特征及其对饱腹激素分泌的调节作用 | 人结肠和空肠L型肠内分泌细胞、61例患者肠道黏膜组织、NCI-H716细胞系 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 体外细胞培养, 激素检测 | NA | 转录组数据, 临床数据, 体外实验数据 | 61例患者（42例肥胖，19例瘦型），公开数据集GSE114853 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
IMPLICATIONS OF YWHAH GENE EXPRESSION IN THE EARLY DETECTION OF SEPSIS
2024-09-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002409
PMID:38904460
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研究论文 | 本研究探讨YWHAH基因表达在脓毒症早期检测中的潜在价值 | 首次发现YWHAH基因表达在感染与脓毒症患者之间存在差异 | NA | 探索YWHAH基因表达与脓毒症发展的关联性 | 感染患者和脓毒症患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序,实时聚合酶链反应,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Probing Dermal Immunity to Mycobacteria through a Controlled Human Infection Model
2024-09-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2400053
PMID:39283647
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研究论文 | 通过受控人类感染模型研究皮肤对分枝杆菌的免疫反应 | 首次在BCG初治人群中系统分析皮肤分枝杆菌感染的免疫反应动态，发现非免疫细胞在免疫应答中的潜在作用 | 样本量较小（10名参与者），仅使用单一菌株（BCG Tice株），治疗组间未观察到显著差异 | 探究皮肤对分枝杆菌的免疫反应机制 | 人类参与者接种BCG后的皮肤免疫反应 | 免疫学 | 分枝杆菌感染 | 流式细胞术, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞计数数据 | 10名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating immune cells from human gastric muscularis propria for single-cell analysis
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103258
PMID:39133613
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研究论文 | 本文提供了一种从人胃肌层分离免疫细胞进行单细胞分析的详细实验方案 | 开发了专门针对人胃肌层组织免疫细胞分离的单细胞分析方案 | NA | 建立人胃肌层免疫细胞分离和单细胞分析的标准实验流程 | 人胃肌层组织中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51761-4
PMID:39227568
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示软骨鱼和硬骨鱼淋巴细胞的个体发育、保守性和多样性 | 首次构建软骨鱼和硬骨鱼的免疫细胞单细胞图谱，发现软骨鱼中存在共表达T、B细胞标志的T细胞亚群和具有吞噬功能的B细胞群体 | 研究仅涵盖三种代表性鱼类物种，可能需要更多物种验证普遍性 | 阐明有颌类脊椎动物免疫系统的起源和进化特征 | 软骨鱼（白斑竹鲨）和硬骨鱼（斑马鱼和半滑舌鳎）的免疫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种鱼类物种的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51763-2
PMID:39227584
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示七鳃鳗中一种表达MPL-L受体的独特T样细胞亚型 | 首次在无颌类脊椎动物中发现表达MPL样受体的新型T样淋巴细胞亚型 | 研究仅针对七鳃鳗单一物种，需在更多无颌类脊椎动物中验证 | 探究无颌类脊椎动物适应性免疫系统的细胞多样性 | 七鳃鳗(Lampetra morii)的鳃、肠道和血液组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 七鳃鳗多个组织(鳃、肠、血液、肝脏、肾脏、皮肤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Single Cell Profiling in the Sox10 Dom/+ Hirschsprung Mouse Implicates Hoxa6 in Enteric Neuron Lineage Allocation
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613729
PMID:39345473
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10 Dom/+小鼠模型，揭示了Hoxa6在肠神经系统神经元谱系分配中的作用 | 首次报道Hox基因参与肠神经元谱系多样化，发现Sox10 Dom/+突变导致新的祖细胞簇和神经元轨迹改变 | 研究仅限于小鼠模型，人类肠神经系统的直接适用性需要进一步验证 | 探究Sox10缺陷如何改变肠神经元亚型比例及其分子机制 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 | 单细胞生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 杂交链式反应(HCR) | NA | 单细胞转录组数据 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you
2024-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010
PMID:38570278
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术因丢失空间信息而存在的局限性，并提出整合空间转录组学数据的解决方案 | 提出通过空间信息指导单细胞分析的新思路，强调多技术整合的协同价值 | 当前单细胞分析流程无法完全恢复空间信息 | 分析单细胞RNA测序技术的局限性并探索空间信息整合方法 | 植物细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交 | NA | RNA测序数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
MerlinS13 phosphorylation regulates meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2024-09-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52284-8
PMID:39251601
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研究论文 | 本研究揭示了Merlin丝氨酸13位点磷酸化通过调控Wnt信号通路影响脑膜瘤生长的机制，并发现了一种可用于指导治疗的MRI影像学生物标志物 | 首次发现Merlin S13去磷酸化通过减弱与β-连环蛋白的抑制性相互作用激活Wnt通路驱动脑膜瘤生长，并鉴定ADC作为Merlin完整脑膜瘤的影像学生物标志物 | 对Merlin完整脑膜瘤生长的生化机制理解仍不完全，缺乏可用于指导治疗降级或影像监测的非侵入性生物标志物 | 阐明Merlin完整脑膜瘤的生化机制并开发影像学生物标志物 | 脑膜瘤异种移植模型和患者样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序,邻近标记蛋白质组质谱,磁共振成像 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据,影像数据 | 脑膜瘤异种移植模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组质谱,空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Uncovering Plaque-Glia Niches in Human Alzheimer's Disease Brains Using Spatial Transcriptomics
2024-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611566
PMID:39314329
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫组化技术揭示了阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块与周围胶质细胞相互作用的分子机制 | 首次结合空间转录组学和免疫组化技术系统解析人类AD大脑中斑块-胶质细胞微环境的转录组特征 | 研究样本为死后脑组织，无法观察疾病动态过程；样本量相对有限 | 探究阿尔茨海默病患者大脑中Aβ斑块与周围胶质细胞的相互作用机制 | 21名个体的78个死后脑切片，共258,987个空间转录组位点 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫组化，iPSC衍生微胶质细胞模型 | NA | 空间转录组数据，免疫组化图像 | 21名个体的78个脑切片，258,987个ST位点 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |