单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 633 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics defines injury specific microenvironments and cellular interactions in kidney regeneration and disease
2024-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51186-z
PMID:39237549
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析小鼠肾脏缺血再灌注损伤中特定微环境的基因表达模式和细胞相互作用 | 首次应用空间转录组学揭示肾脏损伤中空间依赖的基因表达模式，并预测Clcf1-Crfl1在持续损伤的近端小管细胞与成纤维细胞间的分子相互作用 | 研究仅针对小鼠肾脏缺血再灌注损伤模型，未涉及其他类型肾脏损伤或人类样本 | 解析肾脏损伤修复过程中的分子通路和细胞相互作用机制 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
PD-L2 drives resistance to EGFR-TKIs: dynamic changes of the tumor immune environment and targeted therapy
2024-Sep, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01317-2
PMID:38816578
|
研究论文 | 本研究揭示了PD-L2通过调节肿瘤免疫环境驱动EGFR-TKIs耐药的新机制，并发现天然小分子抑制剂十一烯酸锌可逆转耐药 | 首次发现PD-L2动态变化是EGFR-TKIs获得性耐药的关键驱动因素，并鉴定出天然小分子PD-L2抑制剂十一烯酸锌 | 研究主要基于细胞系和同源肿瘤小鼠模型，尚未在临床患者中验证 | 探索EGFR-TKIs耐药机制并开发克服耐药的新策略 | EGFR突变肿瘤细胞系和同源肿瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据，实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Prominent role of gut dysbiosis in the pathogenesis of cystic fibrosis-related liver disease in mice
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.041
PMID:38554847
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肠道菌群失调在囊性纤维化相关肝病发病机制中的关键作用 | 首次证明肠道CFTR缺陷通过维持致病性微生物群、创造炎症环境和改变肠道通透性，成为CFLD发展的必要共因子 | 研究基于小鼠模型，需要在人类患者中进行临床验证 | 探究肠-肝轴在囊性纤维化相关肝病发病机制中的作用 | 野生型小鼠、全身性Cftr敲除小鼠和肠道校正小鼠 | NA | 囊性纤维化相关肝病 | 单细胞RNA测序, 16S核糖体RNA测序, 蛋白质组阵列, FITC-葡聚糖检测 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 蛋白质组数据 | 三种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Sex-specific effects of injury and beta-adrenergic activation on metabolic and inflammatory mediators in a murine model of post-traumatic osteoarthritis
2024-Sep, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.03.109
PMID:38527663
|
研究论文 | 本研究探讨了在小鼠创伤后骨关节炎模型中，β-肾上腺素能受体激活对代谢和炎症介质的性别特异性影响 | 首次揭示了β-肾上腺素能受体激活在创伤后骨关节炎中具有性别特异性作用，女性小鼠对治疗更敏感 | 研究仅使用小鼠模型，结果需在人类中验证；代谢组学变化未受异丙肾上腺素显著影响 | 研究β-肾上腺素能受体激活对创伤后骨关节炎代谢和炎症过程的调节作用 | 12周龄雄性和雌性小鼠的膝关节组织（髌下脂肪垫和滑膜） | 骨关节炎研究 | 创伤后骨关节炎 | 组织学分析、多重基因表达分析、滑液代谢组学、机械性异常疼痛测试、单细胞RNA-seq数据分析 | 小鼠创伤后骨关节炎模型 | 基因表达数据、代谢组学数据、组织学图像、行为数据 | 12周龄雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Inhibition of Renin Expression Is Regulated by an Epigenetic Switch From an Active to a Poised State
2024-Sep, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究揭示了肾素表达抑制通过表观遗传开关从活跃状态转变为预备状态的调控机制 | 首次发现肾素表达抑制涉及从活跃状态到预备状态的表观遗传转换，并关联细胞间通讯减少和上皮-间质转化 | 研究仅使用小鼠来源的As4.1肿瘤细胞系，未在原发性细胞或体内模型中验证 | 探究肾素表达抑制的表观遗传调控机制 | 小鼠肾小球旁细胞来源的As4.1肿瘤细胞系 | 表观遗传学 | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序, CUT&Tag, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组学数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | As4.1细胞系的生物学重复样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, CUT&Tag | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Reversal of injury-associated retinal ganglion cell gene expression by a phosphodiesterase anchoring disruptor peptide
2024-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110017
PMID:39097072
|
研究论文 | 本研究探讨了通过干扰磷酸二酯酶锚定来逆转损伤相关视网膜神经节细胞基因表达的机制 | 首次证明通过表达修饰的PDE4D3 N端肽4D3(E)能够逆转视神经损伤诱导的基因表达变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证 | 探索PDE4D3位移促进神经保护作用的分子机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Flow Cytometry Panel for Analysis of Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-Sep, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.754
PMID:38606634
|
研究论文 | 本文提出了一种用于分析特发性声门下狭窄的综合流式细胞术检测方案 | 开发了针对iSGS的全面流式细胞术检测组合，首次系统描述了iSGS瘢痕组织的细胞特征 | 样本量较小（9对样本），单中心研究 | 建立特发性声门下狭窄的流式细胞术检测平台并分析其细胞组成 | 特发性声门下狭窄患者的正常组织和瘢痕组织样本 | 数字病理学 | 特发性声门下狭窄 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 9对正常和瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Machine learning-based gene expression biomarkers to distinguish Zika and Dengue virus infections: implications for diagnosis
2024-Sep, Virusdisease
DOI:10.1007/s13337-024-00885-8
PMID:39464736
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别能够区分寨卡病毒和登革热病毒感染的基因表达生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序数据和多种机器学习算法来识别区分寨卡和登革热病毒感染的基因生物标志物 | 仅分析了24小时时间点的数据，且需要进一步的实验验证 | 开发基于基因表达特征的寨卡和登革热病毒感染诊断方法 | 人类肝癌细胞系Huh7感染寨卡病毒和登革热病毒后的基因表达数据 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 逻辑回归，支持向量机，随机森林，决策树 | 基因表达数据 | GSE110496数据集中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
WITHDRAWN: Single-cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-09-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
撤稿文章 | 该文章因作者要求已被出版商撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-09, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14080
PMID:38713190
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，揭示了内皮细胞在慢性根尖周炎中的多样性及ICAM1-PTGS2通讯在铁死亡中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析慢性根尖周炎中内皮细胞亚群多样性，并发现ICAM1通过调控PTGS2影响铁死亡的新机制 | 样本量较小（5个CAP样本），主要基于体外细胞实验验证，需要更多临床样本进一步确认 | 探究慢性根尖周炎中内皮细胞多样性及ICAM1-PTGS2通讯在疾病发生发展中的作用机制 | 慢性根尖周炎患者组织样本、人脐静脉内皮细胞（HUVECs）、THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 实时PCR, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 基因表达数据 | 5个慢性根尖周炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Hyperedge Representations with Hypergraph Wavelets: Applications to Spatial Transcriptomics
2024-Sep-14, ArXiv
PMID:39314512
|
研究论文 | 本文提出了一种基于超图小波的超边表示方法，并将其应用于空间转录组学数据分析 | 引入了超图扩散小波概念，并展示了其在谱和空间特性方面的优势 | NA | 开发能够捕捉多对象间高阶关系的表示方法，应用于生物医学发现 | 空间转录组学数据中的疾病相关细胞生态位 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 超图小波 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
Bin2cell reconstructs cells from high resolution Visium HD data
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae546
PMID:39250728
|
研究论文 | 开发了一种从高分辨率Visium HD数据重建细胞的方法Bin2cell | 首个利用形态学图像分割和基因表达信息从2微米分辨率数据重建细胞的工具 | NA | 解决Visium HD平台捕获区域聚合成单细胞的挑战 | 小鼠大脑和人类结直肠癌数据 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据,形态学图像 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD, 2微米和8微米分辨率 |
| 53 | 2025-10-06 |
Scywalker: scalable end-to-end data analysis workflow for long-read single-cell transcriptome sequencing
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae549
PMID:39254601
|
研究论文 | 开发了一个名为scywalker的可扩展端到端数据分析工作流，用于处理长读长单细胞转录组测序数据 | 开发了新颖的可扩展细胞条形码解复用和单细胞异构体识别与定量方法，并将这些整合到一个易于部署的软件包中 | NA | 解决现有纳米孔单细胞数据分析工具在处理当前数据规模时的严重限制 | 人类大脑、拟南芥叶片和混合细胞系的长读长单细胞转录组测序数据 | 生物信息学 | NA | 长读长单细胞转录组测序，纳米孔测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，FASTQ格式序列数据 | NA | Oxford Nanopore | 单细胞RNA-seq，长读长测序 | NA | 纳米孔长读长单细胞转录组测序 |
| 54 | 2025-10-06 |
Combined deletion of Mct8 and Dio2 impairs SVZ neurogliogenesis and olfactory function in adult mice
2024-09, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106572
PMID:38901782
|
研究论文 | 本研究通过Mct8/Dio2双敲除小鼠模型揭示了甲状腺激素转运蛋白MCT8和活化酶DIO2在调控成年小鼠脑室下区神经胶质生成中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示MCT8和DIO2协同调控成年神经干细胞命运决定和嗅觉功能的机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究甲状腺激素可用性调节因子对成年神经发生和胶质发生的影响 | Mct8/Dio2双敲除成年小鼠的脑室下区神经干细胞及其衍生细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Expansion of effector regulatory T cells in steroid responders of severe alcohol-associated hepatitis
2024-Sep-01, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society
IF:4.7Q1
DOI:10.1097/LVT.0000000000000378
PMID:38809243
|
研究论文 | 本研究探讨效应调节性T细胞在严重酒精性肝炎患者对类固醇治疗反应中的作用机制 | 首次揭示类固醇治疗有效者体内效应调节性T细胞扩增现象及其与临床预后的相关性 | 样本量较小（n=47），单细胞RNA测序仅针对单个病例 | 阐明效应调节性T细胞在酒精性肝炎类固醇治疗反应中的作用机制 | 47例酒精性肝炎患者（18例重症接受类固醇治疗，29例轻症未治疗） | 免疫学 | 酒精性肝炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 临床数据 | 47例患者，采集基线和治疗7天后配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51649-3
PMID:39218971
|
研究论文 | 提出一种基于混合效应模型的单细胞RNA-seq数据分析工具scDist，用于稳健识别疾病条件下的扰动细胞类型 | 开发了基于混合效应模型的统计严谨计算方法，能有效减少个体间和队列间变异导致的假阳性发现 | NA | 开发稳健识别单细胞RNA-seq数据中扰动细胞类型的计算方法 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 生物信息学 | COVID-19, 免疫治疗相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
From bioinformatics to clinical applications: a novel prognostic model of cuproptosis-related genes based on single-cell RNA sequencing data in hepatocellular carcinoma
2024-09-09, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00649-5
PMID:39251909
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据开发了一种铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和RNA测序数据构建铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 模型验证仍需更多临床队列验证 | 研究铜死亡相关基因与肝细胞癌预后的关系并构建预后模型 | 肝细胞癌患者和正常对照 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的肝细胞癌患者和正常对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-06 |
Regulator of G-protein signaling expression in human intestinal enteroendocrine cells and potential role in satiety hormone secretion in health and obesity
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105283
PMID:39142076
|
研究论文 | 本研究揭示了人肠道内分泌细胞中G蛋白信号调节因子的表达谱及其在饱腹激素分泌和肥胖中的潜在作用 | 首次在瘦型和肥胖个体中通过单细胞RNA测序揭示了肠道内分泌细胞独特的RGS表达谱，并发现RGS9表达与BMI正相关、与餐后GLP-1和PYY负相关 | 样本量相对有限（61例患者），部分数据依赖公开数据集，需要进一步验证RGS的具体作用机制 | 探究RGS在肠道内分泌细胞中的表达特征及其对饱腹激素分泌的调节作用 | 人结肠和空肠L型肠内分泌细胞、61例患者肠道黏膜组织、NCI-H716细胞系 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 体外细胞培养, 激素检测 | NA | 转录组数据, 临床数据, 体外实验数据 | 61例患者（42例肥胖，19例瘦型），公开数据集GSE114853 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
IMPLICATIONS OF YWHAH GENE EXPRESSION IN THE EARLY DETECTION OF SEPSIS
2024-09-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002409
PMID:38904460
|
研究论文 | 本研究探讨YWHAH基因表达在脓毒症早期检测中的潜在价值 | 首次发现YWHAH基因表达在感染与脓毒症患者之间存在差异 | NA | 探索YWHAH基因表达与脓毒症发展的关联性 | 感染患者和脓毒症患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序,实时聚合酶链反应,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Probing Dermal Immunity to Mycobacteria through a Controlled Human Infection Model
2024-09-01, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2400053
PMID:39283647
|
研究论文 | 通过受控人类感染模型研究皮肤对分枝杆菌的免疫反应 | 首次在BCG初治人群中系统分析皮肤分枝杆菌感染的免疫反应动态，发现非免疫细胞在免疫应答中的潜在作用 | 样本量较小（10名参与者），仅使用单一菌株（BCG Tice株），治疗组间未观察到显著差异 | 探究皮肤对分枝杆菌的免疫反应机制 | 人类参与者接种BCG后的皮肤免疫反应 | 免疫学 | 分枝杆菌感染 | 流式细胞术, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞计数数据 | 10名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |