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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-01 |
Loss of NLRP6 increases the severity of kidney fibrosis
2024-09, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31347
PMID:38934623
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研究论文 | 本研究探讨了NLRP6在慢性肾病纤维化中的作用,发现其缺失会加剧肾脏炎症和纤维化 | 首次揭示了NLRP6在肾脏纤维化中的保护作用,并阐明了其通过p38 MAPK通路调节TGF-β1和Klotho表达的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养,人类临床样本验证有限,且未深入探讨NLRP6在其他肾脏细胞类型中的功能 | 探究NLRP6在慢性肾病纤维化中的功能和分子机制 | 野生型和Nlrp6缺陷小鼠、肾小管细胞培养物、人类肾脏转录组数据库 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序、基因表达分析、细胞培养 | NA | 转录组数据、基因表达数据 | 小鼠模型和细胞培养样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-02-27 |
SpaTopic: A statistical learning framework for exploring tumor spatial architecture from spatially resolved transcriptomic data
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4942
PMID:39331720
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaTopic的统计学习框架,用于从空间分辨转录组数据中探索肿瘤的空间结构 | SpaTopic通过整合单细胞转录组学和空间分辨转录组数据,协调spot聚类和细胞类型反卷积,利用主题建模将肿瘤微环境分层为具有一致细胞组织的空间域,提高了空间架构注释的性能 | NA | 开发一个统计学习框架,以探索和解释肿瘤空间分辨转录组数据中的空间架构 | 肿瘤组织及其微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间分辨转录组学,单细胞转录组学 | 主题建模 | 空间分辨转录组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-02-27 |
Chemically programmed metabolism drives a superior cell fitness for cartilage regeneration
2024-09-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4408
PMID:39259800
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研究论文 | 本研究通过药物筛选发现化合物FPH2能增强人软骨细胞的适应性,促进关节软骨再生,并揭示其通过抑制肉碱棕榈酰转移酶I和优化代谢稳态的机制 | 首次发现FPH2能诱导软骨细胞进入“超级适应”状态,并通过代谢编程提升细胞适应性,为软骨再生提供新策略 | 研究主要基于动物模型,人类临床应用效果需进一步验证;单细胞转录组学分析可能未覆盖所有细胞亚群 | 探索增强软骨细胞适应性和促进关节软骨再生的化学方法 | 人软骨细胞和关节软骨组织 | 细胞治疗与再生医学 | 骨关节炎 | 药物筛选、单细胞转录组学、动物模型实验 | NA | 转录组数据、组织图像 | 大鼠动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-02-27 |
High-Lactate-Metabolizing Photosynthetic Bacteria Reprogram Tumor Immune Microenvironment
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405930
PMID:38924191
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研究论文 | 本研究筛选出一种高乳酸代谢光合细菌(LAB-1),用于重编程肿瘤免疫微环境,以增强免疫治疗效果 | 首次通过正交实验模拟肿瘤微环境并利用乳酸作为唯一有机碳源筛选高乳酸代谢光合细菌,并证明其能选择性定植于肿瘤组织、降低乳酸水平、提高pH值,从而有效重编程肿瘤免疫微环境 | 研究仅在鼠源4T1模型中进行验证,尚未在人类肿瘤或更广泛的肿瘤模型中测试其普适性与安全性 | 通过降低肿瘤组织中的乳酸水平来重编程肿瘤免疫微环境,以增强肿瘤免疫治疗的效果 | 高乳酸代谢光合细菌(LAB-1)及其在鼠源4T1肿瘤模型中的作用 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 鼠源4T1肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-02-26 |
Senescence-targeted MicroRNA/Organoid composite hydrogel repair cartilage defect and prevention joint degeneration via improved chondrocyte homeostasis
2024-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.05.036
PMID:38855061
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研究论文 | 本研究探索了骨关节炎软骨缺损患者的细胞衰老标志物,并构建了一种靶向衰老的miR-24微球/SMSC类器官复合水凝胶用于软骨修复 | 首次发现miR-24在骨关节炎软骨缺损中作为衰老标志物,并构建了靶向衰老的复合水凝胶,通过调节软骨细胞稳态来修复软骨缺损和预防关节退变 | 研究主要基于大鼠模型,尚未在人体中进行临床试验,长期安全性和疗效需进一步验证 | 探索骨关节炎软骨缺损患者的衰老标志物,并开发一种新型的靶向衰老的复合水凝胶用于软骨修复 | 骨关节炎软骨缺损患者的临床软骨样本、SMSC类器官、大鼠模型 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 高通量microRNA测序、单细胞RNA-seq、免疫荧光染色、SA-β-Gal染色、荧光原位杂交、qRT-PCR、荧光素酶报告基因检测 | NA | microRNA表达谱、单细胞RNA-seq数据、图像数据 | 临床软骨样本(具体数量未明确)、大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量microRNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-02-21 |
Loss of p53 and SMAD4 induces adenosquamous subtype pancreatic cancer in the absence of an oncogenic KRAS mutation
2024-Sep-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101711
PMID:39232498
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研究论文 | 本研究通过建立基因工程小鼠模型,探索了在KRAS野生型背景下,Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失如何自发诱导胰腺癌,并揭示了其独特的组织学特征和肿瘤免疫微环境 | 首次在KRAS野生型小鼠模型中证明Trp53/Smad4或Trp53/Tgfbr2缺失足以驱动胰腺癌发生,并识别出腺鳞癌亚型,与KRAS突变型肿瘤在组织学和免疫微环境上存在差异 | 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类胰腺癌的复杂性,且样本量有限,需进一步验证 | 探究KRAS野生型胰腺癌的发病机制和分子特征 | 基因工程小鼠模型(PPSSC和PPTTC)及其胰腺肿瘤组织 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-02-17 |
An integrated approach identifies the molecular underpinnings of murine anterior visceral endoderm migration
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.014
PMID:38843837
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学、高分辨率活体成像和短期谱系标记与干预技术,揭示了小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)迁移的分子基础及其与转录状态的紧密关联 | 首次结合单细胞转录组、磷酸化蛋白质组学和活体成像技术系统解析AVE迁移的动态过程,发现AVE的瞬时性特征及其迁移过程中基因表达的异质性,并鉴定出信号素信号通路对正常迁移的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,人类胚胎中的保守性有待验证;技术整合虽全面但可能未覆盖所有调控层面 | 阐明小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)独特迁移行为及其限制原条形成的分子机制 | 小鼠胚胎前内脏内胚层(AVE)及周围内脏内胚层(VE)细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 高分辨率活体成像, 晶格光片显微镜, 短期谱系标记 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 活体成像视频 | 未明确样本数量的小鼠胚胎VE细胞(迁移前及迁移期间) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-02-15 |
TCfinder: Robust tumor cell discrimination in scRNA-seq based on gene pathway activity
2024-Sep, iMetaOmics
DOI:10.1002/imo2.22
PMID:41675543
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因通路活性和深度神经网络的肿瘤细胞识别工具TCfinder,用于单细胞RNA测序数据中的肿瘤细胞鉴别 | TCfinder通过整合通路活性和深度神经网络,在不同scRNA-seq平台上展现出稳健的识别效率,优于现有工具且能在稀疏数据下工作 | NA | 开发一种稳健的肿瘤细胞识别工具,以提高单细胞RNA测序数据中肿瘤细胞的鉴别准确性 | 单细胞RNA测序数据中的肿瘤细胞 | 自然语言处理 | 肿瘤 | scRNA-seq | 深度神经网络(DNN) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-02-13 |
Inflammation perturbs hematopoiesis by remodeling specific compartments of the bone marrow niche
2024-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.12.612751
PMID:39314376
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和流式细胞术,验证了骨髓中中央骨髓和骨内膜两个空间区室在炎症扰动下的特异性变化,揭示了I型干扰素反应如何影响间充质基质细胞的炎症表型,从而调节局部单核细胞动态 | 开发了一种可重复识别小鼠骨髓中7个关键中央骨髓和骨内膜群体的组合方法,并首次系统展示了不同扰动对骨髓区室的特异性影响,特别是I型干扰素反应在炎症中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类骨髓区室的直接应用尚未验证;方法可能受技术限制,如单细胞测序的覆盖深度和流式细胞术的标记特异性 | 探究骨髓空间区室化在炎症和肿瘤响应中的重要性,开发分子和功能表征方法 | 小鼠骨髓中的造血干细胞和祖细胞(HSPC)以及基质细胞,特别是中央骨髓和骨内膜区室 | 单细胞组学 | 炎症相关疾病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 跨多个小鼠品系的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-02-13 |
Activation of cGAS/STING Drives Inflammation and Cellular Senescence of Macrophages in Ovarian Endometrioma Induced by Endometriotic Cyst Fluid
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300711
PMID:38864247
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研究论文 | 本研究探讨了卵巢子宫内膜异位囊肿液通过激活cGAS/STING通路驱动巨噬细胞炎症和细胞衰老的机制,并验证了STING抑制剂H-151的治疗潜力 | 首次整合临床样本、单细胞测序及体内外模型,揭示OE液通过cGAS/STING通路导致卵巢功能下降的具体机制,并发现STING抑制剂H-151能有效缓解相关病理变化 | 未明确说明样本量大小或具体实验模型细节,机制研究可能仍需进一步验证 | 探究卵巢子宫内膜异位囊肿液对卵巢功能的影响及其分子机制 | 卵巢子宫内膜异位囊肿液、巨噬细胞、卵巢组织 | 数字病理学 | 卵巢子宫内膜异位症 | 单细胞测序、生物信息学分析、体内外实验模型 | NA | 测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-02-13 |
Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400056
PMID:38977414
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综述 | 本文综述了癌症类器官作为三维培养技术在癌症研究中的应用、优势、局限性和前景 | 介绍了四种主要癌症类器官类型,并讨论了单细胞RNA测序在探索癌症类器官中的最新应用 | 讨论了癌症类器官模型的局限性,包括其在模拟复杂肿瘤微环境方面的挑战 | 推动基础癌症研究向临床肿瘤治疗的转化,提高肿瘤药物开发成功率 | 癌症类器官模型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-02-13 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400120
PMID:38864263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,全面描述了雷公藤甲素诱导小鼠肾毒性的转录组图谱和细胞组成 | 首次在单细胞分辨率下系统解析雷公藤甲素诱导肾毒性的机制,揭示了肾单位上皮细胞的异质性反应、血管功能破坏以及免疫细胞损伤等新发现 | 研究仅基于小鼠模型,未在人体中进行验证;样本量相对有限;机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明雷公藤甲素诱导肾毒性的分子机制和细胞类型特异性反应 | 小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 肾毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和雷公藤甲素处理组小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-02-12 |
Characterization of Endothelial Cell Subclusters in Localized Scleroderma Skin with Single-Cell RNA Sequencing Identifies NOTCH Signaling Pathway
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms251910473
PMID:39408800
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对局限性硬皮病皮肤中的内皮细胞亚群进行了表征,并识别出NOTCH信号通路在疾病中的作用 | 首次在局限性硬皮病皮肤中应用单细胞RNA测序技术详细研究内皮细胞亚群,揭示了NOTCH信号通路的激活及其在疾病进展中的潜在作用 | 研究样本量相对有限(27名患者和17名健康对照),且主要关注内皮细胞,可能未全面覆盖其他细胞类型在疾病中的作用 | 探究局限性硬皮病皮肤中内皮细胞的分子机制及其在疾病发病机制中的作用 | 局限性硬皮病患者和健康对照者的皮肤分离细胞 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 27名局限性硬皮病患者(包括儿童和成人)和17名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-02-06 |
Endocytosis as a critical regulator of hematopoietic stem cell fate -implications for hematopoietic stem cell and gene therapy
2024-09-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03927-6
PMID:39334274
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评论 | 本文讨论了内吞作用作为造血干细胞命运关键调节因子的新发现及其对造血干细胞和基因治疗的影响 | 强调了MYCT1蛋白在调节造血干细胞内吞作用和环境感知中的新作用,为体外培养和扩增提供了新见解 | 对造血干细胞中所有潜在机制及其相互作用的完全理解仍存在空白,尤其是在细胞增殖时如何转化 | 探讨内吞作用在造血干细胞命运调节中的作用及其在细胞和基因治疗中的应用 | 造血干细胞,特别是脐带血造血干细胞 | 造血干细胞生物学 | 血液和免疫细胞疾病 | 敲低、过表达、单细胞RNA测序、移植实验 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2026-01-29 |
Epigenomic, transcriptomic and proteomic characterizations of reference samples
2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.612110
PMID:39314461
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研究论文 | 本研究通过ATAC-seq、Methyl-seq、RNA-seq和蛋白质组学分析,全面表征了乳腺癌细胞系和配对B细胞系的表观基因组、转录组和蛋白质组景观,提供了多组学参考材料 | 首次为两种细胞系提供了包括表观基因组和蛋白质组在内的全面多组学参考数据,填补了现有参考材料在表观组学和蛋白质组学方面的空白 | 研究仅基于两种细胞系,可能无法完全代表更广泛的生物样本多样性 | 开发和验证用于下一代测序技术和临床应用的参考标准材料 | 乳腺癌细胞系和配对的B细胞系 | 多组学分析 | 乳腺癌 | ATAC-seq, Methyl-seq, RNA-seq, 蛋白质组学分析, 全基因组测序, HiC, scRNA-seq | NA | 基因组、表观基因组、转录组、单细胞RNA-seq和蛋白质组数据 | 两种细胞系(乳腺癌细胞系和配对B细胞系) | Illumina, PacBio, Nanopore | 全基因组测序, HiC, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 甲基化测序, RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 56 | 2026-01-16 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-09, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 本研究探讨了APOE ε4等位基因通过下调IL-7/IL-7R通路影响效应记忆T细胞,从而加剧阿尔茨海默病中海马萎缩的机制 | 首次揭示了APOE ε4等位基因与IL-7/IL-7R通路下调在效应记忆T细胞中的关联,并建立了血浆IL-7水平与海马萎缩程度的负相关关系 | 样本量较小(仅54名患者),且为横断面研究,无法确定因果关系 | 探究APOE ε4等位基因影响外周炎症和神经炎症的潜在机制 | 晚发性阿尔茨海默病患者(包括APOE ε4携带者和非携带者) | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 54名患者(28名APOE ε4携带者,26名非携带者) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-01-13 |
NK cells with adhesion defects and reduced cytotoxic functions are associated with a poor prognosis in multiple myeloma
2024-09-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023529
PMID:38875515
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了多发性骨髓瘤患者中NK细胞的转录组变化及其与不良预后的关联 | 首次在多发性骨髓瘤中通过单细胞RNA测序系统描绘了NK细胞的转录组景观,并鉴定出具有粘附缺陷和细胞毒性功能降低的CD16/CD226低表达NK细胞亚群与患者生存期缩短相关 | 样本量相对较小(10例患者),且为回顾性队列分析,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究多发性骨髓瘤患者中NK细胞的表型和功能变化及其临床意义 | 多发性骨髓瘤患者和健康对照者的NK细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例多发性骨髓瘤患者和10例年龄/性别匹配的健康对照者进行单细胞测序;177例患者进行回顾性队列分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-01-13 |
Identification of Hypoxia-ALCAMhigh Macrophage- Exhausted T Cell Axis in Tumor Microenvironment Remodeling for Immunotherapy Resistance
2024-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309885
PMID:38956900
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研究论文 | 本研究通过整合bulk、单细胞和空间转录组学,揭示了肿瘤微环境中缺氧诱导的ALCAM高表达巨噬细胞与耗竭CD8 T细胞轴在免疫治疗抵抗中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率和空间架构下系统描绘缺氧景观,并发现由恶性细胞、ALCAM巨噬细胞和耗竭CD8 T细胞组成的缺氧介导细胞间通讯枢纽 | 研究主要基于转录组学数据,缺乏蛋白质水平验证;临床前模型结果需在人体临床试验中进一步证实 | 探究肿瘤微环境中缺氧导致免疫治疗抵抗的细胞适应性机制 | 肿瘤微环境中的恶性细胞、巨噬细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 59 | 2025-12-11 |
Longitudinal Multi-omic Immune Profiling Reveals Age-Related Immune Cell Dynamics in Healthy Adults
2024-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612119
PMID:39314416
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学免疫分析,揭示了健康成年人中与年龄相关的免疫细胞动态变化 | 结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术,对300多名健康成年人进行长期跟踪,构建了包含超过1600万个PBMCs的免疫健康图谱,首次系统揭示了T细胞在衰老过程中独特的转录变化积累 | 研究主要关注外周免疫细胞,未涉及组织特异性免疫变化;样本量虽大但可能无法完全代表所有人群;纵向跟踪时间仅为两年,可能不足以捕捉更长期的衰老效应 | 探究健康免疫系统在生命周期中的基本变化,为年龄相关感染和疾病易感性的干预措施开发提供依据 | 300多名健康成年人,包括96名年轻和老年参与者进行为期两年的年度疫苗接种跟踪 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 超过300名健康成年人,其中96名进行纵向跟踪,产生超过1600万个外周血单个核细胞(PBMCs)数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-11-29 |
Craters on the melanoma surface facilitate tumor-immune interactions and demonstrate pathologic response to checkpoint blockade in humans
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613595
PMID:39345527
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼和人黑色素瘤模型发现表面凹陷结构促进肿瘤-免疫相互作用并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 首次发现黑色素瘤表面凹陷结构是CD8 T细胞识别抗原和杀伤肿瘤的主要场所,并证明其预测免疫治疗反应的价值 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索免疫治疗中促进免疫应答的肿瘤微环境结构域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | 斑马鱼肿瘤模型 | 图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |