单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
561	2024-09-08	Integrated ultrasensitive metabolomics and single-cell transcriptomics identify crucial regulators of sheep oocyte maturation and early embryo development in vitro 2024-Sep-02, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.08.040 PMID:39233000	研究论文	本研究通过超灵敏代谢组学和单细胞转录组学分析，识别了影响绵羊卵母细胞体外成熟和早期胚胎发育的关键代谢物	本研究首次整合超灵敏代谢组学和单细胞转录组学，识别了体外培养系统中缺失的关键代谢物，并通过补充这些代谢物显著提高了胚胎发育率	本研究主要集中在体外培养系统，未涉及体内环境的影响	提高绵羊卵母细胞的体外发育能力	绵羊卵母细胞和早期胚胎	代谢组学	NA	超灵敏代谢组学分析，单细胞RNA测序	NA	代谢物数据，转录组数据	微量样本
562	2024-09-08	Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you 2024-Sep, Trends in plant science IF:17.3Q1 DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010 PMID:38570278	综述	本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在植物科学中的应用及其在空间信息方面的局限性	提出了利用空间信息来监督单细胞分析的可能性，以整合不同技术的优势	scRNA-seq在测序过程中会丢失细胞的位置信息，限制了其对复杂生物系统的全面描述	探讨如何通过整合空间信息来提升单细胞RNA测序的分析能力	单细胞RNA测序及其在空间信息恢复方面的局限性	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
563	2024-09-08	Cell Culture Differentiation and Proliferation Conditions Influence the In Vitro Regeneration of the Human Airway Epithelium 2024-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2023-0356MA PMID:38843491	研究论文	研究评估了不同培养基对体外人呼吸道上皮细胞再生和分化的影响	首次系统评估了不同培养基对单细胞RNA测序和成像技术下细胞组成、基因表达谱、细胞信号传导和上皮形态的影响	研究主要集中在体外培养条件下，未涉及体内实验	评估不同培养基对体外人呼吸道上皮细胞再生和分化的影响	人呼吸道上皮细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	多种培养基（BEGM, PneumaCult, Half & Half, Clancy）下的细胞样本
564	2024-09-08	Inferring Characteristics of the Tumor Immune Microenvironment of Patients with HNSCC from Single-Cell Transcriptomics of Peripheral Blood 2024-Sep-01, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0092 PMID:39113621	研究论文	研究探讨了从外周血单个核细胞的单细胞转录组数据中推断头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤免疫微环境特征的可能性	首次展示了从外周血单个核细胞的单细胞转录组数据中推断肿瘤免疫微环境特征的可行性，并发现这些特征可以作为免疫治疗反应的预测指标	研究样本量较小，需要进一步在大规模样本中验证	探索从外周血单细胞转录组数据中推断肿瘤免疫微环境特征的可能性，并评估其在免疫治疗反应预测中的应用	头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤免疫微环境特征	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	两个头颈部鳞状细胞癌患者的数据集，包含匹配的外周血单个核细胞和肿瘤组织的单细胞RNA测序数据
565	2024-09-07	Dynamic changes of the immune microenvironment in the development of gastric cancer caused by inflammation 2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology DOI:10.1016/j.omton.2024.200849 PMID:39228396	研究论文	本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，探讨了胃癌发展过程中不同细胞类型的分子变化	首次系统分析了从非萎缩性胃炎到胃癌过程中免疫微环境的动态变化，并发现了IL-17信号通路和Th17细胞分化的显著上调	研究主要基于单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，缺乏体内实验验证	揭示胃癌发展过程中从癌前病变到胃癌的分子机制，为早期诊断和治疗提供依据	胃癌发展过程中的免疫微环境和信号通路变化	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个单细胞RNA测序数据集和The Cancer Genome Atlas的bulk RNA测序数据
566	2024-09-07	TET3 is expressed in prostate cancer tumor-associated macrophages and is associated with anti-androgen resistance 2024-Sep-06, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03708-w PMID:39240303	研究论文	研究探讨了TET3在前列腺癌中的表达及其对雄激素拮抗疗法（ADT）疗效的影响	首次揭示了TET3在前列腺癌肿瘤相关巨噬细胞中的表达与雄激素拮抗疗法抗性的关联	研究样本主要来自数据库，缺乏临床试验验证	探究TET3在前列腺癌中的表达及其对ADT疗效的影响	前列腺癌及其肿瘤相关巨噬细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	基因表达数据	1965例前列腺癌样本和493例正常前列腺组织样本，以及21,292个单细胞
567	2024-09-07	Knocking Out CD70 Rescues CD70-Specific NanoCAR T Cells from Antigen-Induced Exhaustion 2024-Sep-03, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0677 PMID:38874582	研究论文	研究通过敲除CD70来提高CD70特异性纳米CAR T细胞在实体和液体恶性肿瘤治疗中的功能	通过CRISPR/Cas9技术敲除CD70，显著增强了CD70特异性纳米CAR T细胞在弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型中的功能，并保护其免受抗原诱导的耗竭	研究主要集中在体外和PDX模型中，尚未在临床试验中验证	优化CD70特异性CAR T细胞疗法，提高其在恶性肿瘤治疗中的疗效	CD70特异性纳米CAR T细胞及其在恶性肿瘤治疗中的应用	细胞疗法	淋巴瘤	CRISPR/Cas9	NA	单细胞转录组数据	涉及恶性横纹肌瘤类器官和弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型
568	2024-09-07	Itm2a expression marks periosteal skeletal stem cells that contribute to bone fracture healing 2024-Sep-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI176528 PMID:39225088	研究论文	研究确定了Itm2a作为骨膜骨干细胞的膜蛋白标记物，并探讨了其在骨折愈合中的作用	首次确定了Itm2a作为骨膜骨干细胞的标记物，并展示了其在骨折愈合中的关键作用	研究主要集中在小鼠模型上，尚未完全验证其在人类中的适用性	确定骨膜骨干细胞的标记物，并研究其在骨折愈合中的作用	骨膜骨干细胞及其在骨折愈合中的贡献	NA	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	小鼠模型
569	2024-09-07	Type 1 innate lymphoid cells: a biomarker and therapeutic candidate in sarcoidosis 2024-Sep-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI183708 PMID:39225095	研究论文	研究探讨了1型先天淋巴细胞（ILC1s）在结节病中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力	首次揭示了ILC1s在结节病中的特异性积累，并证明了CXCR4阻断可能作为治疗结节病的新方法	研究主要基于皮肤样本和小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证	探讨ILC1s在结节病中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力	结节病患者和非结节病性肉芽肿疾病患者的皮肤样本	免疫学	结节病	单细胞RNA测序和空间转录组学	NA	转录组数据	结节病和非结节病性肉芽肿疾病患者的皮肤样本
570	2024-09-07	Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes 2024-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51761-4 PMID:39227568	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了软骨鱼和硬骨鱼淋巴细胞的发育、保守性和多样性	首次通过单细胞RNA测序技术对软骨鱼和硬骨鱼的免疫细胞进行了跨物种比较，揭示了淋巴细胞在不同物种中的相似转录特征和功能差异	研究仅限于特定的软骨鱼和硬骨鱼物种，可能无法完全代表所有软骨鱼和硬骨鱼的淋巴细胞特征	阐明不同物种间细胞结构和细胞类型进化的特征，以理解免疫系统功能和对疾病的易感性	软骨鱼（白斑竹鲨）和硬骨鱼（斑马鱼和中国舌鳎）的淋巴细胞	基因组学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	包括白斑竹鲨、斑马鱼和中国舌鳎的免疫细胞样本
571	2024-09-07	Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution 2024-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51763-2 PMID:39227584	研究论文	研究通过单细胞RNA测序揭示了七鳃鳗淋巴细胞的组织特异性异质性，并发现了一种表达MPL-L的独特T-like细胞亚型	首次在七鳃鳗中发现了一种表达MPL-L的独特T-like细胞亚型，这种细胞在表达造血基因方面与有颌脊椎动物的T细胞有显著差异	研究仅限于七鳃鳗，未涉及其他无颌脊椎动物，且样本量较小	探讨无颌脊椎动物适应性免疫系统的进化特征	七鳃鳗的鳃、肠道和血液中的淋巴细胞	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	七鳃鳗的鳃、肠道和血液样本
572	2024-09-07	Multi-omics analyses reveal aberrant differentiation trajectory with WNT1 loss-of-function in type XV osteogenesis imperfecta 2024-Sep-02, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research IF:5.1Q1 DOI:10.1093/jbmr/zjae123 PMID:39126373	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了WNT1功能缺失在XV型成骨不全症中导致的异常分化轨迹	首次整合多组学数据，揭示了WNT1在骨骼祖细胞分化和成熟中的调控机制	样本量较小，且仅来自中国南方地区	探讨WNT1功能缺失在XV型成骨不全症中的分子机制及其对骨骼发育的影响	XV型成骨不全症患者及其骨骼样本	数字病理学	成骨不全症	多组学分析	NA	蛋白质组学数据、单细胞转录组数据	25名XV型成骨不全症患者和243名其他类型成骨不全症患者
573	2024-09-07	Molecular Regulation of Cardiac Conduction System Development 2024-Sep, Current cardiology reports IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s11886-024-02094-7 PMID:38990492	综述	本文综述了心脏传导系统发育的分子调控机制	本文介绍了最新的单细胞转录组学研究成果，以更好地理解心脏传导系统的形态发生	NA	探讨心脏传导系统发育的分子调控机制	心脏传导系统的起搏细胞和传导心肌细胞	发育生物学	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	转录组	NA
574	2024-09-07	WGCNA reveals a biomarker for cancer-associated fibroblasts to predict prognosis in cervical cancer 2024-Sep-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA IF:1.9Q2 DOI:10.1097/JCMA.0000000000001129 PMID:38946034	研究论文	本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别与癌症相关成纤维细胞（CAFs）相关的基因，并构建了一个预测宫颈癌预后的模型	首次通过WGCNA和LASSO Cox回归分析构建了一个基于CAF基因的宫颈癌预后模型	NA	分析CAF相关基因并构建预测宫颈癌预后的模型	宫颈癌患者及其肿瘤微环境中的CAFs	数字病理学	宫颈癌	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、实时荧光定量PCR	LASSO Cox回归模型	转录组数据、临床信息	来自TCGA和GEO数据库的宫颈癌患者数据
575	2024-09-07	Establishment and transcriptome analysis of single blastomere-derived cell lines from zebrafish 2024-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2024.07.018 PMID:39097227	研究论文	本文报道了从斑马鱼单个卵裂球中建立细胞系并进行转录组分析	首次从斑马鱼单个卵裂球中成功建立具有稳定染色体状态的细胞系，并通过单细胞转录组测序验证了其长期培养中的基因表达忠实性	NA	建立斑马鱼单个卵裂球来源的细胞系，并研究其在体外培养中的基因表达和细胞命运	斑马鱼单个卵裂球及其衍生的细胞系	细胞生物学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	20个斑马鱼细胞系
576	2024-09-07	Targeting EFHD2 inhibits interferon-γ signaling and ameliorates non-alcoholic steatohepatitis 2024-Sep, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2024.04.009 PMID:38670321	研究论文	研究探讨了EFHD2在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的作用及其作为治疗靶点的潜力	首次揭示了EFHD2在NASH中的免疫调节和炎症作用，并开发了一种新的α-螺旋肽作为潜在的治疗药物	研究主要基于小鼠模型和患者样本，需要进一步的临床试验验证	探讨EFHD2在NASH发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力	EFHD2在NASH患者和动物模型中的表达及其对疾病进展的影响	NA	非酒精性脂肪性肝炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、双重免疫组织化学	NA	RNA	NASH患者和两种饮食诱导的NASH小鼠模型
577	2024-09-07	Primary cilia signaling in astrocytes mediates development and regional-specific functional specification 2024-Sep, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-024-01726-z PMID:39103557	研究论文	本文研究了初级纤毛在星形胶质细胞中的信号传导作用，揭示了其在调节星形胶质细胞亚型特异性核心特征和神经发育中的关键作用	首次揭示了初级纤毛在星形胶质细胞中的信号传导作用，及其在神经发育和区域特异性功能分化中的重要性	NA	探讨初级纤毛在星形胶质细胞发育和区域特异性功能分化中的作用	小鼠大脑中的星形胶质细胞及其初级纤毛	NA	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	小鼠大脑中的星形胶质细胞
578	2024-09-07	Sex and disease regulate major histocompatibility complex class I expression in human lung epithelial cells 2024-Sep, Physiological reports IF:2.2Q3 DOI:10.14814/phy2.70025 PMID:39223101	研究论文	研究探讨了人类肺上皮细胞中主要组织相容性复合体I类（MHC I）表达在性别和疾病状态下的调节机制	首次揭示了人类肺上皮细胞中MHC I表达的性别差异及其在慢性呼吸系统疾病中的上调现象	研究仅限于人类肺上皮细胞，未涉及其他细胞类型或物种	探讨人类肺上皮细胞中MHC I表达的调控机制及其在慢性呼吸系统疾病中的作用	人类肺上皮细胞及其在慢性呼吸系统疾病中的MHC I表达	免疫学	呼吸系统疾病	单细胞RNA测序和免疫染色	NA	RNA	来自肺实质移植的人类肺上皮细胞样本
579	2024-09-07	scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering 2024-Sep-01, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654 PMID:39237193	研究论文	介绍了一个名为scRNA-Explorer的在线工具，用于单细胞RNA测序数据分析，支持基因相关性和数据过滤	开发了一个开源的在线工具scRNA-Explorer，简化了单细胞RNA测序数据的分析流程，并提供了基因相关性分析和基因富集分析功能	NA	开发一个用户友好的在线工具，用于简化单细胞RNA测序数据的分析	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
580	2024-09-06	Enhanced desmosome assembly driven by acquired high-level desmoglein-2 promotes phenotypic plasticity and endocrine resistance in ER+ breast cancer 2024-Sep-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217179 PMID:39154704	研究论文	本研究探讨了desmoglein-2在ER+乳腺癌内分泌治疗耐药性和细胞可塑性中的作用	首次揭示了DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的关键作用，并提出了DSG2标志物可能用于治疗干预	研究主要基于体外和异种移植模型，需要进一步的临床验证	探讨DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的作用机制	ER+乳腺癌细胞和异种移植模型	NA	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用了fulvestrant耐药的ER+乳腺癌模型