单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 657 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2024-09-07 |
WGCNA reveals a biomarker for cancer-associated fibroblasts to predict prognosis in cervical cancer
2024-Sep-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000001129
PMID:38946034
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别与癌症相关成纤维细胞（CAFs）相关的基因，并构建了一个预测宫颈癌预后的模型 | 首次通过WGCNA和LASSO Cox回归分析构建了一个基于CAF基因的宫颈癌预后模型 | NA | 分析CAF相关基因并构建预测宫颈癌预后的模型 | 宫颈癌患者及其肿瘤微环境中的CAFs | 数字病理学 | 宫颈癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、实时荧光定量PCR | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据、临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的宫颈癌患者数据 |
| 562 | 2024-09-07 |
Establishment and transcriptome analysis of single blastomere-derived cell lines from zebrafish
2024-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.07.018
PMID:39097227
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研究论文 | 本文报道了从斑马鱼单个卵裂球中建立细胞系并进行转录组分析 | 首次从斑马鱼单个卵裂球中成功建立具有稳定染色体状态的细胞系，并通过单细胞转录组测序验证了其长期培养中的基因表达忠实性 | NA | 建立斑马鱼单个卵裂球来源的细胞系，并研究其在体外培养中的基因表达和细胞命运 | 斑马鱼单个卵裂球及其衍生的细胞系 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 20个斑马鱼细胞系 |
| 563 | 2024-09-07 |
Targeting EFHD2 inhibits interferon-γ signaling and ameliorates non-alcoholic steatohepatitis
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.04.009
PMID:38670321
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研究论文 | 研究探讨了EFHD2在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了EFHD2在NASH中的免疫调节和炎症作用，并开发了一种新的α-螺旋肽作为潜在的治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨EFHD2在NASH发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | EFHD2在NASH患者和动物模型中的表达及其对疾病进展的影响 | NA | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、双重免疫组织化学 | NA | RNA | NASH患者和两种饮食诱导的NASH小鼠模型 |
| 564 | 2024-09-07 |
Primary cilia signaling in astrocytes mediates development and regional-specific functional specification
2024-Sep, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01726-z
PMID:39103557
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研究论文 | 本文研究了初级纤毛在星形胶质细胞中的信号传导作用，揭示了其在调节星形胶质细胞亚型特异性核心特征和神经发育中的关键作用 | 首次揭示了初级纤毛在星形胶质细胞中的信号传导作用，及其在神经发育和区域特异性功能分化中的重要性 | NA | 探讨初级纤毛在星形胶质细胞发育和区域特异性功能分化中的作用 | 小鼠大脑中的星形胶质细胞及其初级纤毛 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑中的星形胶质细胞 |
| 565 | 2024-09-07 |
Sex and disease regulate major histocompatibility complex class I expression in human lung epithelial cells
2024-Sep, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70025
PMID:39223101
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研究论文 | 研究探讨了人类肺上皮细胞中主要组织相容性复合体I类（MHC I）表达在性别和疾病状态下的调节机制 | 首次揭示了人类肺上皮细胞中MHC I表达的性别差异及其在慢性呼吸系统疾病中的上调现象 | 研究仅限于人类肺上皮细胞，未涉及其他细胞类型或物种 | 探讨人类肺上皮细胞中MHC I表达的调控机制及其在慢性呼吸系统疾病中的作用 | 人类肺上皮细胞及其在慢性呼吸系统疾病中的MHC I表达 | 免疫学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序和免疫染色 | NA | RNA | 来自肺实质移植的人类肺上皮细胞样本 |
| 566 | 2024-09-07 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-Sep-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
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研究论文 | 介绍了一个名为scRNA-Explorer的在线工具，用于单细胞RNA测序数据分析，支持基因相关性和数据过滤 | 开发了一个开源的在线工具scRNA-Explorer，简化了单细胞RNA测序数据的分析流程，并提供了基因相关性分析和基因富集分析功能 | NA | 开发一个用户友好的在线工具，用于简化单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 567 | 2024-09-06 |
Enhanced desmosome assembly driven by acquired high-level desmoglein-2 promotes phenotypic plasticity and endocrine resistance in ER+ breast cancer
2024-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217179
PMID:39154704
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研究论文 | 本研究探讨了desmoglein-2在ER+乳腺癌内分泌治疗耐药性和细胞可塑性中的作用 | 首次揭示了DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的关键作用，并提出了DSG2标志物可能用于治疗干预 | 研究主要基于体外和异种移植模型，需要进一步的临床验证 | 探讨DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的作用机制 | ER+乳腺癌细胞和异种移植模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了fulvestrant耐药的ER+乳腺癌模型 |
| 568 | 2024-09-06 |
A novel in vitro tubular model to recapitulate features of distal airways: The bronchioid
2024-Sep-04, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00562-2024
PMID:39231631
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研究论文 | 本文介绍了一种新型体外管状模型，用于再现远端气道的特征 | 开发了一种名为bronchioid的模型，通过封装人支气管成体干细胞在海藻酸盐凝胶管状支架中，成功模拟了小气道的结构和功能 | 需要精细控制收缩水平以建立具有生理相关形状和大小的bronchiole模型 | 旨在克服当前体外培养系统的局限性，建立一种能够再现小气道结构和功能的模型 | 人支气管成体干细胞和小气道的结构与功能 | 数字病理学 | NA | 3D成像、基因表达分析和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从临床样本中提取的人支气管成体干细胞 |
| 569 | 2024-09-06 |
Identification of Therapy-Induced Clonal Evolution and Resistance Pathways in Minimal Residual Clones in Multiple Myeloma through Single-Cell Sequencing
2024-Sep-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0545
PMID:38900040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化和耐药途径 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析多发性骨髓瘤患者治疗前后的骨髓样本，揭示了治疗后转录组进化的三种主要轨迹，并发现了遗传和非遗传因素在驱动克隆进化中的显著相关性 | 样本量相对较小，且仅限于骨髓样本，可能无法全面反映所有患者的治疗反应 | 深入理解多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 38个骨髓样本，包括1个意义未明的单克隆丙种球蛋白病、19个诊断时的多发性骨髓瘤患者、17个治疗后的多发性骨髓瘤患者和1个健康供体 |
| 570 | 2024-09-06 |
RAB13 regulates macrophage polarization in sepsis
2024-09-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71771-y
PMID:39223234
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研究论文 | 研究RAB13在脓毒症患者外周血中的核心靶点作用及其分子功能和可能的机制 | 首次揭示RAB13在脓毒症中的潜在核心靶点作用，并通过单细胞测序和细胞实验验证了其促进巨噬细胞向M2表型分化的功能 | 研究样本量较小，且仅限于脓毒症患者和健康对照组，未来需扩大样本量并纳入更多疾病状态以验证结果的普适性 | 探讨RAB13在脓毒症中的分子功能及其可能的机制 | 脓毒症患者的外周血和单核细胞 | NA | 脓毒症 | RNA-seq, 10×单细胞测序 | NA | RNA | 脓毒症患者21例，健康个体9例 |
| 571 | 2024-09-06 |
Combined deletion of Mct8 and Dio2 impairs SVZ neurogliogenesis and olfactory function in adult mice
2024-Sep, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106572
PMID:38901782
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研究论文 | 研究了Mct8和Dio2基因缺失对成年小鼠SVZ神经胶质发生和嗅觉功能的影响 | 首次探讨了MCT8和DIO2在成年小鼠SVZ神经胶质发生中的作用，并揭示了其在神经退行性和脱髓鞘疾病中的潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨MCT8和DIO2在成年小鼠SVZ神经胶质发生中的作用 | 成年小鼠的SVZ神经干细胞和嗅觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Mct8/Dio2敲除小鼠和野生型小鼠 |
| 572 | 2024-09-06 |
Hematopoiesis after anti-CD117 monoclonal antibody treatment in the settings of wild-type and Fanconi anemia mice
2024-Sep-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.284275
PMID:38572555
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研究论文 | 研究抗CD117单克隆抗体在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血作用 | 发现抗CD117单克隆抗体ACK2在治疗后不会引起短期DNA损伤，并且在范可尼贫血小鼠中增加了集落形成，表明其对造血干细胞的潜在靶向作用 | 未完全探索这些治疗的短期和长期效应 | 评估抗CD117单克隆抗体ACK2在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血效应 | 野生型和范可尼贫血小鼠 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和范可尼贫血小鼠 |
| 573 | 2024-09-06 |
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51649-3
PMID:39218971
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDist的计算工具，基于混合效应模型，用于在单细胞RNA测序数据中识别受扰动的细胞类型 | scDist通过混合效应模型提供了一种统计上严谨且计算高效的检测转录组差异的方法，显著优于现有方法 | NA | 开发一种新的计算工具，以准确识别单细胞RNA测序数据中的受扰动细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 转录组数据 | 有限样本量 |
| 574 | 2024-09-06 |
The immune microenvironment of steatotic hepatocellular carcinoma: Current findings and future prospects
2024-Sep-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000516
PMID:39225682
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研究论文 | 本文综述了非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）的免疫微环境，并探讨了利用单细胞RNA测序、空间转录组学和质谱成像等前沿技术解析其复杂性 | 本文介绍了利用代谢抑制剂、表观遗传抑制剂和免疫调节剂等新型治疗手段，以改善MASH-HCC对PD-1抑制剂的反应 | 本文主要基于临床前模型讨论治疗创新，尚未涉及临床试验数据 | 探讨MASH-HCC的免疫微环境及其对免疫检查点抑制剂的反应，并提出个性化治疗策略 | 非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌（MASH-HCC）及其免疫微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱成像 | NA | RNA | NA |
| 575 | 2024-09-05 |
CelltypeR: A flow cytometry pipeline to characterize single cells from brain organoids
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110613
PMID:39224516
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研究论文 | 本文开发了一个完整的流程，用于在复杂组织中可重复地表征细胞类型，特别是脑组织和诱导多能干细胞（iPSC）衍生的脑模型 | 结合流式细胞术（FC）抗体面板与计算流程CelltypeR，实现了数据对齐、无监督聚类优化、细胞类型注释和统计比较 | NA | 开发一个通用的方法，用于在复杂组织中可重复地识别细胞类型 | 人诱导多能干细胞衍生的中脑类器官中的主要脑细胞类型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 流式细胞术（FC）, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 576 | 2024-09-05 |
Gut Microbiota Defines Functional Direction of Colonic Regulatory T Cells with Unique TCR Repertoires
2024-Sep-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300395
PMID:39101764
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了无特定病原体和无菌小鼠结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性，发现肠道微生物群影响结肠调节T细胞的功能方向和克隆型扩展 | 首次揭示了肠道微生物群与免疫细胞相互作用的新模块，该模块可能有助于开发治疗肠道炎症疾病的新疗法 | NA | 研究肠道微生物群如何改变结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性 | 结肠调节T细胞 | 免疫学 | 肠道炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无特定病原体和无菌小鼠的结肠调节T细胞 |
| 577 | 2024-09-05 |
Glycolysis in Peritubular Endothelial Cells and Microvascular Rarefaction in CKD
2024-Sep-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000488
PMID:39226371
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研究论文 | 本研究探讨了慢性肾脏病（CKD）中肾小管周围内皮细胞的糖酵解代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | 首次揭示了肾小管周围内皮细胞中糖酵解失调是CKD中微血管稀疏的启动因素，并通过恢复糖酵解改善了微血管稀疏和纤维化病变。 | NA | 研究CKD中肾小管周围内皮细胞的代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | CKD患者的肾小管周围内皮细胞和CKD小鼠模型。 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞测序和代谢分析 | NA | 细胞代谢数据 | CKD患者和CKD小鼠模型的肾小管周围内皮细胞 |
| 578 | 2024-09-05 |
The heterogeneity of erythroid cells: insight at the single-cell transcriptome level
2024-Sep, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03903-9
PMID:38953986
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的最新进展及其对红细胞功能异质性、新亚群识别、不同红细胞谱系追踪和命运决定机制揭示的贡献 | 强调了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的应用，特别是在识别前所未知的细胞亚群、分析细胞异质性和单个细胞的转录组特征方面的优势 | NA | 系统总结单细胞转录组测序技术的最新发展及其对红细胞研究的影响 | 红细胞及其在血液中的异质性和功能 | 生命科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 579 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals heterogeneity in epithelial cells between high- and low-grade bladder urothelial carcinoma
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.078
PMID:38796363
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 580 | 2024-09-05 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals the protective effects of lactate-mediated lactylation of microglia-related proteins on spinal cord injury
2024-Sep, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70028
PMID:39218784
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序与批量RNA测序分析，揭示了乳酸介导的微胶质蛋白乳酸化对脊髓损伤的保护作用 | 首次探讨了乳酸介导的微胶质蛋白乳酸化在脊髓损伤后的神经保护机制 | NA | 阐明糖酵解产生的乳酸对微胶质功能及其在脊髓损伤后潜在神经保护机制的影响 | 微胶质细胞及其相关蛋白的乳酸化 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 成年雄性C57BL/6小鼠 |