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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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561 | 2024-09-06 |
RAB13 regulates macrophage polarization in sepsis
2024-09-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71771-y
PMID:39223234
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研究论文 | 研究RAB13在脓毒症患者外周血中的核心靶点作用及其分子功能和可能的机制 | 首次揭示RAB13在脓毒症中的潜在核心靶点作用,并通过单细胞测序和细胞实验验证了其促进巨噬细胞向M2表型分化的功能 | 研究样本量较小,且仅限于脓毒症患者和健康对照组,未来需扩大样本量并纳入更多疾病状态以验证结果的普适性 | 探讨RAB13在脓毒症中的分子功能及其可能的机制 | 脓毒症患者的外周血和单核细胞 | NA | 脓毒症 | RNA-seq, 10×单细胞测序 | NA | RNA | 脓毒症患者21例,健康个体9例 |
562 | 2024-09-06 |
Combined deletion of Mct8 and Dio2 impairs SVZ neurogliogenesis and olfactory function in adult mice
2024-Sep, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106572
PMID:38901782
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研究论文 | 研究了Mct8和Dio2基因缺失对成年小鼠SVZ神经胶质发生和嗅觉功能的影响 | 首次探讨了MCT8和DIO2在成年小鼠SVZ神经胶质发生中的作用,并揭示了其在神经退行性和脱髓鞘疾病中的潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨MCT8和DIO2在成年小鼠SVZ神经胶质发生中的作用 | 成年小鼠的SVZ神经干细胞和嗅觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Mct8/Dio2敲除小鼠和野生型小鼠 |
563 | 2024-09-06 |
Hematopoiesis after anti-CD117 monoclonal antibody treatment in the settings of wild-type and Fanconi anemia mice
2024-Sep-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.284275
PMID:38572555
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研究论文 | 研究抗CD117单克隆抗体在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血作用 | 发现抗CD117单克隆抗体ACK2在治疗后不会引起短期DNA损伤,并且在范可尼贫血小鼠中增加了集落形成,表明其对造血干细胞的潜在靶向作用 | 未完全探索这些治疗的短期和长期效应 | 评估抗CD117单克隆抗体ACK2在野生型和范可尼贫血小鼠中的造血效应 | 野生型和范可尼贫血小鼠 | NA | 范可尼贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和范可尼贫血小鼠 |
564 | 2024-09-06 |
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51649-3
PMID:39218971
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDist的计算工具,基于混合效应模型,用于在单细胞RNA测序数据中识别受扰动的细胞类型 | scDist通过混合效应模型提供了一种统计上严谨且计算高效的检测转录组差异的方法,显著优于现有方法 | NA | 开发一种新的计算工具,以准确识别单细胞RNA测序数据中的受扰动细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 转录组数据 | 有限样本量 |
565 | 2024-09-06 |
The immune microenvironment of steatotic hepatocellular carcinoma: Current findings and future prospects
2024-Sep-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000516
PMID:39225682
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研究论文 | 本文综述了非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌(MASH-HCC)的免疫微环境,并探讨了利用单细胞RNA测序、空间转录组学和质谱成像等前沿技术解析其复杂性 | 本文介绍了利用代谢抑制剂、表观遗传抑制剂和免疫调节剂等新型治疗手段,以改善MASH-HCC对PD-1抑制剂的反应 | 本文主要基于临床前模型讨论治疗创新,尚未涉及临床试验数据 | 探讨MASH-HCC的免疫微环境及其对免疫检查点抑制剂的反应,并提出个性化治疗策略 | 非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌(MASH-HCC)及其免疫微环境 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱成像 | NA | RNA | NA |
566 | 2024-09-05 |
CelltypeR: A flow cytometry pipeline to characterize single cells from brain organoids
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110613
PMID:39224516
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研究论文 | 本文开发了一个完整的流程,用于在复杂组织中可重复地表征细胞类型,特别是脑组织和诱导多能干细胞(iPSC)衍生的脑模型 | 结合流式细胞术(FC)抗体面板与计算流程CelltypeR,实现了数据对齐、无监督聚类优化、细胞类型注释和统计比较 | NA | 开发一个通用的方法,用于在复杂组织中可重复地识别细胞类型 | 人诱导多能干细胞衍生的中脑类器官中的主要脑细胞类型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 流式细胞术(FC), 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
567 | 2024-09-05 |
Gut Microbiota Defines Functional Direction of Colonic Regulatory T Cells with Unique TCR Repertoires
2024-Sep-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300395
PMID:39101764
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了无特定病原体和无菌小鼠结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性,发现肠道微生物群影响结肠调节T细胞的功能方向和克隆型扩展 | 首次揭示了肠道微生物群与免疫细胞相互作用的新模块,该模块可能有助于开发治疗肠道炎症疾病的新疗法 | NA | 研究肠道微生物群如何改变结肠调节T细胞的转录组和TCR特异性 | 结肠调节T细胞 | 免疫学 | 肠道炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 无特定病原体和无菌小鼠的结肠调节T细胞 |
568 | 2024-09-05 |
Glycolysis in Peritubular Endothelial Cells and Microvascular Rarefaction in CKD
2024-Sep-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000488
PMID:39226371
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研究论文 | 本研究探讨了慢性肾脏病(CKD)中肾小管周围内皮细胞的糖酵解代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | 首次揭示了肾小管周围内皮细胞中糖酵解失调是CKD中微血管稀疏的启动因素,并通过恢复糖酵解改善了微血管稀疏和纤维化病变。 | NA | 研究CKD中肾小管周围内皮细胞的代谢重编程及其对微血管稀疏的影响。 | CKD患者的肾小管周围内皮细胞和CKD小鼠模型。 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞测序和代谢分析 | NA | 细胞代谢数据 | CKD患者和CKD小鼠模型的肾小管周围内皮细胞 |
569 | 2024-09-05 |
The heterogeneity of erythroid cells: insight at the single-cell transcriptome level
2024-Sep, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03903-9
PMID:38953986
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的最新进展及其对红细胞功能异质性、新亚群识别、不同红细胞谱系追踪和命运决定机制揭示的贡献 | 强调了单细胞转录组测序技术在红细胞研究中的应用,特别是在识别前所未知的细胞亚群、分析细胞异质性和单个细胞的转录组特征方面的优势 | NA | 系统总结单细胞转录组测序技术的最新发展及其对红细胞研究的影响 | 红细胞及其在血液中的异质性和功能 | 生命科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
570 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq reveals heterogeneity in epithelial cells between high- and low-grade bladder urothelial carcinoma
2024-Sep, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.05.078
PMID:38796363
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
571 | 2024-09-05 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals the protective effects of lactate-mediated lactylation of microglia-related proteins on spinal cord injury
2024-Sep, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70028
PMID:39218784
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序与批量RNA测序分析,揭示了乳酸介导的微胶质蛋白乳酸化对脊髓损伤的保护作用 | 首次探讨了乳酸介导的微胶质蛋白乳酸化在脊髓损伤后的神经保护机制 | NA | 阐明糖酵解产生的乳酸对微胶质功能及其在脊髓损伤后潜在神经保护机制的影响 | 微胶质细胞及其相关蛋白的乳酸化 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 成年雄性C57BL/6小鼠 |
572 | 2024-09-05 |
Aging-Associated Molecular Changes in Human Alveolar Type I Cells
2024-Sep, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.35534/jrbtm.2024.10012
PMID:39220636
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据,分析了老年人肺泡I型细胞的分子变化 | 首次详细描述了老年人肺泡I型细胞的分子变化,包括细胞衰老和趋化因子基因表达增加,以及上皮特征的减少 | 研究仅限于健康人肺部的数据,未涉及疾病状态下的情况 | 探讨年龄相关的人肺泡I型细胞分子变化机制 | 人肺泡I型细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
573 | 2024-09-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals microenvironmental infiltration in non-small cell lung cancer with different responses to immunotherapy
2024-Sep, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3736
PMID:39228151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌中主要病理反应(MPR)和非主要病理反应(NMPR)样本的细胞组成,揭示了免疫治疗反应不同的肿瘤微环境差异 | 本研究发现了在MPR和NMPR样本中CD8+ T细胞群体的明显差异,并识别出一系列新的生物标志物,为预测治疗反应和克服免疫治疗耐药性提供了理论基础 | NA | 探索非小细胞肺癌中不同免疫治疗反应的肿瘤微环境差异 | 非小细胞肺癌中的主要病理反应(MPR)和非主要病理反应(NMPR)样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 包括四个主要MPR样本和八个主要NMPR样本 |
574 | 2024-09-04 |
SCG2 mediates blood-brain barrier dysfunction and schizophrenia-like behaviors after traumatic brain injury
2024-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401117R
PMID:39225388
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序评估创伤性脑损伤后额叶皮层细胞的转录变化,并探讨了SCG2在TBI诱发的精神分裂症中的介导作用及其机制。 | 首次揭示了SCG2通过CypA-MMP-9信号通路触发血脑屏障破坏,并提供了治疗TBI后精神障碍的新疗法。 | NA | 探究创伤性脑损伤后神经功能障碍的机制及其与精神分裂症样行为的关系。 | 创伤性脑损伤后的额叶皮层细胞及SCG2的作用。 | 神经科学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
575 | 2024-09-04 |
Single-cell transcriptomics reveals tumor-infiltrating B cell function after neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in non-small cell lung cancer
2024-Sep-02, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad138
PMID:37931147
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了12名III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞,探讨了新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能 | 首次详细探讨了肿瘤浸润B细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其与新辅助化疗免疫治疗效果的关系 | 研究样本量有限,且仅限于III期非小细胞肺癌患者 | 探讨非小细胞肺癌中新辅助化疗免疫治疗后B细胞亚型及其功能 | III期非小细胞肺癌患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12名III期非小细胞肺癌患者 |
576 | 2024-09-04 |
Characteristics and functions of an atypical inflammation-associated GZMK+GZMB+CD8+ T subset in people living with HIV-1
2024-Sep, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.07.003
PMID:39053388
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research paper | 本研究通过分析单细胞RNA测序(scRNA-seq)和匹配的T细胞受体序列(TCR)数据,深入探讨了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的特征及其与疾病的相关性 | 发现了HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的异质性,并进一步细分为GZMKGZMB子集和GZMKGZMB子集,后者在HIV-1感染者中显著富集 | NA | 探讨HIV-1感染者中GZMKCD8 T细胞的表型和功能特征及其与疾病的相关性 | HIV-1感染者中的GZMKCD8 T细胞 | 免疫学 | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
577 | 2024-09-04 |
Unraveling flavivirus pathogenesis: from bulk to single-cell RNA-sequencing strategies
2024-Sep-01, The Korean journal of physiology & pharmacology : official journal of the Korean Physiological Society and the Korean Society of Pharmacology
DOI:10.4196/kjpp.2024.28.5.403
PMID:39198221
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综述 | 本文综述了从批量到单细胞RNA测序策略在解析黄病毒发病机制中的应用 | 介绍了病毒包含的单细胞RNA测序(viscRNA-seq)这一创新技术,解决了非多聚腺苷酸黄病毒基因组带来的挑战 | NA | 探讨RNA测序技术在细胞系实验和黄病毒感染患者研究中的应用,加速有效诊断和治疗的发展 | 黄病毒及其与宿主的相互作用 | 生物信息学 | NA | RNA测序(RNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
578 | 2024-09-01 |
Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester - An analysis by single-cell RNA sequencing
2024-Sep, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100919
PMID:38941941
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了第一孕期人类胎盘绒毛周细胞的基因表达谱 | 首次揭示了胎盘绒毛周细胞在第一孕期的特定标记物和功能,并发现了其在整合素介导的信号通路和细胞外囊泡中的组织特异性功能 | NA | 探讨胎盘绒毛周细胞的标记物和功能,以增进对早期胎盘发育的理解并寻找治疗胎盘相关妊娠并发症的新靶点 | 人类胎盘绒毛周细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 第一孕期的胎盘绒毛样本 |
579 | 2024-09-01 |
Integrative analysis reveals different feature of intrahepatic cholangiocarcinoma subtypes
2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.16015
PMID:38924592
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研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了肝内胆管癌两种主要组织学亚型(大管型和小管型)在分子特征和免疫微环境方面的差异 | 发现了大管型肝内胆管癌中PPP1R1B的高表达及其在细胞增殖、迁移和侵袭中的作用,以及其作为潜在标记物和治疗靶点的可能性 | NA | 扩展对肝内胆管癌两种亚型分子特征和免疫微环境差异的理解 | 肝内胆管癌的两种主要组织学亚型 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序、批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 132名接受根治性手术的患者 |
580 | 2024-09-01 |
Single-cell RNA sequencing of cystic fibrosis liver disease explants reveals endothelial complement activation
2024-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15963
PMID:38847551
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了囊性纤维化相关肝病患者的肝组织,揭示了内皮细胞的补体激活特征 | 首次在单细胞水平上展示了囊性纤维化肝病患者的内皮细胞特征,特别是发现了一类上调补体级联反应和凝血相关基因的特殊内皮细胞群体 | 研究样本量较小,仅包括四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织 | 探究囊性纤维化相关肝病中内皮细胞的病理特征及其在疾病发展中的作用 | 囊性纤维化相关肝病患者的肝组织内皮细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四例囊性纤维化相关肝病患者的肝组织 |