单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 644 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-09-08 |
Natural killer (NK) cells-related gene signature reveals the immune environment heterogeneity in hepatocellular carcinoma based on single cell analysis
2024-Sep-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01287-4
PMID:39231877
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研究论文 | 本研究利用自然杀伤细胞（NK细胞）相关的基因预测模型，通过单细胞分析揭示了肝细胞癌（HCC）免疫环境的异质性 | 本研究首次建立了基于NK细胞相关基因的风险评分模型，并开发了用于精确预测HCC患者生存率的诺模图 | 本研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制 | 本研究旨在通过单细胞分析揭示肝细胞癌的免疫环境异质性，并为精准治疗提供基因水平的依据 | 本研究主要研究对象为肝细胞癌患者，重点关注NK细胞及其相关基因在肿瘤免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 本研究使用了来自肝细胞癌患者的单细胞RNA测序和RNA测序数据 |
| 542 | 2024-09-06 |
Publisher Correction: scParser: sparse representation learning for scalable single-cell RNA sequencing data analysis
2024-Sep-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03378-5
PMID:39232797
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 543 | 2024-09-08 |
Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you
2024-Sep, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010
PMID:38570278
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综述 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在植物科学中的应用及其在空间信息方面的局限性 | 提出了利用空间信息来监督单细胞分析的可能性，以整合不同技术的优势 | scRNA-seq在测序过程中会丢失细胞的位置信息，限制了其对复杂生物系统的全面描述 | 探讨如何通过整合空间信息来提升单细胞RNA测序的分析能力 | 单细胞RNA测序及其在空间信息恢复方面的局限性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 544 | 2024-09-08 |
Cell Culture Differentiation and Proliferation Conditions Influence the In Vitro Regeneration of the Human Airway Epithelium
2024-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0356MA
PMID:38843491
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研究论文 | 研究评估了不同培养基对体外人呼吸道上皮细胞再生和分化的影响 | 首次系统评估了不同培养基对单细胞RNA测序和成像技术下细胞组成、基因表达谱、细胞信号传导和上皮形态的影响 | 研究主要集中在体外培养条件下，未涉及体内实验 | 评估不同培养基对体外人呼吸道上皮细胞再生和分化的影响 | 人呼吸道上皮细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种培养基（BEGM, PneumaCult, Half & Half, Clancy）下的细胞样本 |
| 545 | 2024-09-07 |
Dynamic changes of the immune microenvironment in the development of gastric cancer caused by inflammation
2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200849
PMID:39228396
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，探讨了胃癌发展过程中不同细胞类型的分子变化 | 首次系统分析了从非萎缩性胃炎到胃癌过程中免疫微环境的动态变化，并发现了IL-17信号通路和Th17细胞分化的显著上调 | 研究主要基于单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 揭示胃癌发展过程中从癌前病变到胃癌的分子机制，为早期诊断和治疗提供依据 | 胃癌发展过程中的免疫微环境和信号通路变化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集和The Cancer Genome Atlas的bulk RNA测序数据 |
| 546 | 2024-09-07 |
Knocking Out CD70 Rescues CD70-Specific NanoCAR T Cells from Antigen-Induced Exhaustion
2024-Sep-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0677
PMID:38874582
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研究论文 | 研究通过敲除CD70来提高CD70特异性纳米CAR T细胞在实体和液体恶性肿瘤治疗中的功能 | 通过CRISPR/Cas9技术敲除CD70，显著增强了CD70特异性纳米CAR T细胞在弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型中的功能，并保护其免受抗原诱导的耗竭 | 研究主要集中在体外和PDX模型中，尚未在临床试验中验证 | 优化CD70特异性CAR T细胞疗法，提高其在恶性肿瘤治疗中的疗效 | CD70特异性纳米CAR T细胞及其在恶性肿瘤治疗中的应用 | 细胞疗法 | 淋巴瘤 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及恶性横纹肌瘤类器官和弥漫性大B细胞淋巴瘤PDX模型 |
| 547 | 2024-09-07 |
Itm2a expression marks periosteal skeletal stem cells that contribute to bone fracture healing
2024-Sep-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176528
PMID:39225088
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研究论文 | 研究确定了Itm2a作为骨膜骨干细胞的膜蛋白标记物，并探讨了其在骨折愈合中的作用 | 首次确定了Itm2a作为骨膜骨干细胞的标记物，并展示了其在骨折愈合中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未完全验证其在人类中的适用性 | 确定骨膜骨干细胞的标记物，并研究其在骨折愈合中的作用 | 骨膜骨干细胞及其在骨折愈合中的贡献 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 548 | 2024-09-07 |
Type 1 innate lymphoid cells: a biomarker and therapeutic candidate in sarcoidosis
2024-Sep-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI183708
PMID:39225095
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研究论文 | 研究探讨了1型先天淋巴细胞（ILC1s）在结节病中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次揭示了ILC1s在结节病中的特异性积累，并证明了CXCR4阻断可能作为治疗结节病的新方法 | 研究主要基于皮肤样本和小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨ILC1s在结节病中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 结节病患者和非结节病性肉芽肿疾病患者的皮肤样本 | 免疫学 | 结节病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 结节病和非结节病性肉芽肿疾病患者的皮肤样本 |
| 549 | 2024-09-07 |
Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes
2024-Sep-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51761-4
PMID:39227568
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了软骨鱼和硬骨鱼淋巴细胞的发育、保守性和多样性 | 首次通过单细胞RNA测序技术对软骨鱼和硬骨鱼的免疫细胞进行了跨物种比较，揭示了淋巴细胞在不同物种中的相似转录特征和功能差异 | 研究仅限于特定的软骨鱼和硬骨鱼物种，可能无法完全代表所有软骨鱼和硬骨鱼的淋巴细胞特征 | 阐明不同物种间细胞结构和细胞类型进化的特征，以理解免疫系统功能和对疾病的易感性 | 软骨鱼（白斑竹鲨）和硬骨鱼（斑马鱼和中国舌鳎）的淋巴细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括白斑竹鲨、斑马鱼和中国舌鳎的免疫细胞样本 |
| 550 | 2024-09-07 |
Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution
2024-Sep-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51763-2
PMID:39227584
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了七鳃鳗淋巴细胞的组织特异性异质性，并发现了一种表达MPL-L的独特T-like细胞亚型 | 首次在七鳃鳗中发现了一种表达MPL-L的独特T-like细胞亚型，这种细胞在表达造血基因方面与有颌脊椎动物的T细胞有显著差异 | 研究仅限于七鳃鳗，未涉及其他无颌脊椎动物，且样本量较小 | 探讨无颌脊椎动物适应性免疫系统的进化特征 | 七鳃鳗的鳃、肠道和血液中的淋巴细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 七鳃鳗的鳃、肠道和血液样本 |
| 551 | 2024-09-07 |
Multi-omics analyses reveal aberrant differentiation trajectory with WNT1 loss-of-function in type XV osteogenesis imperfecta
2024-Sep-02, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae123
PMID:39126373
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了WNT1功能缺失在XV型成骨不全症中导致的异常分化轨迹 | 首次整合多组学数据，揭示了WNT1在骨骼祖细胞分化和成熟中的调控机制 | 样本量较小，且仅来自中国南方地区 | 探讨WNT1功能缺失在XV型成骨不全症中的分子机制及其对骨骼发育的影响 | XV型成骨不全症患者及其骨骼样本 | 数字病理学 | 成骨不全症 | 多组学分析 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据 | 25名XV型成骨不全症患者和243名其他类型成骨不全症患者 |
| 552 | 2024-09-07 |
Molecular Regulation of Cardiac Conduction System Development
2024-Sep, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-024-02094-7
PMID:38990492
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综述 | 本文综述了心脏传导系统发育的分子调控机制 | 本文介绍了最新的单细胞转录组学研究成果，以更好地理解心脏传导系统的形态发生 | NA | 探讨心脏传导系统发育的分子调控机制 | 心脏传导系统的起搏细胞和传导心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 553 | 2024-09-07 |
Establishment and transcriptome analysis of single blastomere-derived cell lines from zebrafish
2024-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.07.018
PMID:39097227
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研究论文 | 本文报道了从斑马鱼单个卵裂球中建立细胞系并进行转录组分析 | 首次从斑马鱼单个卵裂球中成功建立具有稳定染色体状态的细胞系，并通过单细胞转录组测序验证了其长期培养中的基因表达忠实性 | NA | 建立斑马鱼单个卵裂球来源的细胞系，并研究其在体外培养中的基因表达和细胞命运 | 斑马鱼单个卵裂球及其衍生的细胞系 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 20个斑马鱼细胞系 |
| 554 | 2024-09-07 |
Targeting EFHD2 inhibits interferon-γ signaling and ameliorates non-alcoholic steatohepatitis
2024-Sep, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.04.009
PMID:38670321
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研究论文 | 研究探讨了EFHD2在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了EFHD2在NASH中的免疫调节和炎症作用，并开发了一种新的α-螺旋肽作为潜在的治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨EFHD2在NASH发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | EFHD2在NASH患者和动物模型中的表达及其对疾病进展的影响 | NA | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、双重免疫组织化学 | NA | RNA | NASH患者和两种饮食诱导的NASH小鼠模型 |
| 555 | 2024-09-07 |
Primary cilia signaling in astrocytes mediates development and regional-specific functional specification
2024-Sep, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01726-z
PMID:39103557
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研究论文 | 本文研究了初级纤毛在星形胶质细胞中的信号传导作用，揭示了其在调节星形胶质细胞亚型特异性核心特征和神经发育中的关键作用 | 首次揭示了初级纤毛在星形胶质细胞中的信号传导作用，及其在神经发育和区域特异性功能分化中的重要性 | NA | 探讨初级纤毛在星形胶质细胞发育和区域特异性功能分化中的作用 | 小鼠大脑中的星形胶质细胞及其初级纤毛 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑中的星形胶质细胞 |
| 556 | 2024-09-07 |
Sex and disease regulate major histocompatibility complex class I expression in human lung epithelial cells
2024-Sep, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70025
PMID:39223101
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研究论文 | 研究探讨了人类肺上皮细胞中主要组织相容性复合体I类（MHC I）表达在性别和疾病状态下的调节机制 | 首次揭示了人类肺上皮细胞中MHC I表达的性别差异及其在慢性呼吸系统疾病中的上调现象 | 研究仅限于人类肺上皮细胞，未涉及其他细胞类型或物种 | 探讨人类肺上皮细胞中MHC I表达的调控机制及其在慢性呼吸系统疾病中的作用 | 人类肺上皮细胞及其在慢性呼吸系统疾病中的MHC I表达 | 免疫学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序和免疫染色 | NA | RNA | 来自肺实质移植的人类肺上皮细胞样本 |
| 557 | 2024-09-07 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-Sep-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
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研究论文 | 介绍了一个名为scRNA-Explorer的在线工具，用于单细胞RNA测序数据分析，支持基因相关性和数据过滤 | 开发了一个开源的在线工具scRNA-Explorer，简化了单细胞RNA测序数据的分析流程，并提供了基因相关性分析和基因富集分析功能 | NA | 开发一个用户友好的在线工具，用于简化单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 558 | 2024-09-06 |
Enhanced desmosome assembly driven by acquired high-level desmoglein-2 promotes phenotypic plasticity and endocrine resistance in ER+ breast cancer
2024-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217179
PMID:39154704
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研究论文 | 本研究探讨了desmoglein-2在ER+乳腺癌内分泌治疗耐药性和细胞可塑性中的作用 | 首次揭示了DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的关键作用，并提出了DSG2标志物可能用于治疗干预 | 研究主要基于体外和异种移植模型，需要进一步的临床验证 | 探讨DSG2在ER+乳腺癌内分泌耐药中的作用机制 | ER+乳腺癌细胞和异种移植模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了fulvestrant耐药的ER+乳腺癌模型 |
| 559 | 2024-09-06 |
A novel in vitro tubular model to recapitulate features of distal airways: The bronchioid
2024-Sep-04, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00562-2024
PMID:39231631
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研究论文 | 本文介绍了一种新型体外管状模型，用于再现远端气道的特征 | 开发了一种名为bronchioid的模型，通过封装人支气管成体干细胞在海藻酸盐凝胶管状支架中，成功模拟了小气道的结构和功能 | 需要精细控制收缩水平以建立具有生理相关形状和大小的bronchiole模型 | 旨在克服当前体外培养系统的局限性，建立一种能够再现小气道结构和功能的模型 | 人支气管成体干细胞和小气道的结构与功能 | 数字病理学 | NA | 3D成像、基因表达分析和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从临床样本中提取的人支气管成体干细胞 |
| 560 | 2024-09-06 |
Identification of Therapy-Induced Clonal Evolution and Resistance Pathways in Minimal Residual Clones in Multiple Myeloma through Single-Cell Sequencing
2024-Sep-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0545
PMID:38900040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化和耐药途径 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析多发性骨髓瘤患者治疗前后的骨髓样本，揭示了治疗后转录组进化的三种主要轨迹，并发现了遗传和非遗传因素在驱动克隆进化中的显著相关性 | 样本量相对较小，且仅限于骨髓样本，可能无法全面反映所有患者的治疗反应 | 深入理解多发性骨髓瘤中治疗诱导的克隆进化分子机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 38个骨髓样本，包括1个意义未明的单克隆丙种球蛋白病、19个诊断时的多发性骨髓瘤患者、17个治疗后的多发性骨髓瘤患者和1个健康供体 |