单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 634 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-09-13 |
Increased autoreactivity and maturity of EBI2+ antibody-secreting cells from nasal polyps
2024-Sep-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177729
PMID:39253973
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研究论文 | 研究了鼻息肉中表达EBI2的B细胞是否具有更高的自身抗体产生倾向，并评估了鼻息肉中抗体分泌细胞的分子特征 | 首次揭示了鼻息肉中EBI2+抗体分泌细胞具有更高的自身抗体产生倾向，并展示了其分子特征 | 研究仅限于鼻息肉和扁桃体组织，未涉及其他组织或疾病状态 | 探讨鼻息肉中EBI2+ B细胞的自身抗体产生倾向及其分子特征 | 鼻息肉和扁桃体组织中的EBI2+抗体分泌细胞 | 免疫学 | 鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 鼻息肉和扁桃体组织的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 522 | 2024-09-13 |
Single-cell RNA sequencing reveals the change in cytotoxic NK/T cells, epithelial cells and myeloid cells of the tumor microenvironment of high-grade serous ovarian carcinoma
2024-Sep-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01290-9
PMID:39249551
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中NK/T细胞、上皮细胞和髓系细胞的变化 | 揭示了高级别浆液性卵巢癌从早期到晚期阶段上皮细胞的异质性和富集通路的变化，以及细胞间通讯的增强 | NA | 研究高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境的变化 | NK/T细胞、上皮细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 45,448个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 523 | 2024-09-13 |
Revealing the crosstalk between LOX+ fibroblast and M2 macrophage in gastric cancer by single-cell sequencing
2024-Sep-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12861-y
PMID:39251966
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了胃癌中LOX+成纤维细胞与M2巨噬细胞之间的相互作用 | 首次构建了胃癌患者的单细胞转录组图谱，并揭示了LOX+成纤维细胞与M2巨噬细胞在肿瘤微环境中的紧密定位和相互作用 | 研究仅限于胃癌样本，未来需在更多癌症类型中验证这些发现 | 揭示胃癌肿瘤微环境中成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用，寻找潜在的治疗靶点 | 胃癌患者的肿瘤微环境中的LOX+成纤维细胞和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 150,913个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 524 | 2024-09-13 |
Dimension reduction, cell clustering, and cell-cell communication inference for single-cell transcriptomics with DcjComm
2024-Sep-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03385-6
PMID:39252099
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研究论文 | 提出了一种名为DcjComm的方法，用于单细胞转录组学的综合分析，包括降维、细胞聚类和细胞间通信推断 | DcjComm通过非负矩阵分解联合学习模型进行降维和聚类，并整合配体-受体对、转录因子和靶基因来推断细胞间通信，性能优于现有方法 | NA | 改进单细胞转录组学分析中的降维、细胞聚类和细胞间通信推断方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解 | 联合学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-09-13 |
Cancer cell states: Lessons from ten years of single-cell RNA-sequencing of human tumors
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.005
PMID:39214095
|
研究论文 | 本文回顾了过去十年单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类肿瘤研究中的应用，并强调了从这些研究中获得的一些重要见解 | 本文总结了scRNA-seq在定义癌症细胞状态和肿瘤内异质性方面的创新方法和发现 | 本文讨论了在定义和命名肿瘤内异质性程序时存在的模糊性 | 回顾和总结scRNA-seq在人类肿瘤研究中的应用，并展望未来在临床中的应用 | 人类肿瘤中的癌症细胞状态和肿瘤内异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 526 | 2024-09-13 |
SpatialOne: end-to-end analysis of visium data at scale
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae509
PMID:39152991
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SpatialOne的端到端分析管道，用于简化10x Visium数据的分析 | SpatialOne整合了多种先进的计算方法，简化了空间转录组数据的分析流程 | NA | 简化空间转录组数据的分析 | 10x Visium数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2024-09-13 |
Identifying cancer cells from calling single-nucleotide variants in scRNA-seq data
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae512
PMID:39163479
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研究论文 | 开发了一种名为CCLONE的工具，用于从scRNA-seq数据中识别癌症细胞并匹配其表达谱 | 提出了CCLONE工具，能够处理scRNA-seq数据中SNV的不确定性和稀疏性，并联合识别癌症克隆群体及其相关变异 | 仅在急性髓系白血病和肺腺癌数据集上进行了验证，尚未在其他癌症类型中测试 | 解决从scRNA-seq数据中识别癌症细胞的挑战 | scRNA-seq数据中的单核苷酸变异（SNV） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及两个急性髓系白血病数据集和一个肺腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 528 | 2024-09-13 |
scDiffusion: conditional generation of high-quality single-cell data using diffusion model
2024-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae518
PMID:39171840
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scDiffusion的生成模型，结合扩散模型和基础模型，用于生成高质量的单细胞RNA测序数据，并能在控制条件下生成数据 | scDiffusion通过设计多个分类器同时指导扩散过程，并提出了一种新的控制策略——梯度插值，使得模型能够生成连续的细胞发育轨迹 | NA | 开发一种能够生成高质量单细胞RNA测序数据的生成模型，并能在控制条件下生成数据 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 扩散模型 | 生成模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 529 | 2024-09-13 |
Targeting transposable elements in cancer: developments and opportunities
2024-Sep, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189143
PMID:38936517
|
综述 | 本文综述了转座子在癌症中的作用及其在癌症治疗中的潜在应用 | 本文探讨了转座子在癌症中的多方面作用，并提出了基于转座子的诊断和治疗新方法 | NA | 探讨转座子在癌症中的作用及其在癌症治疗中的潜在应用 | 转座子及其在癌症中的作用 | NA | 癌症 | 长读长测序、计算分析、单细胞测序、蛋白质组学、CRISPR-Cas9技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 530 | 2024-09-13 |
Cathepsin D is essential for the degradomic shift of macrophages required to resolve liver fibrosis
2024-Sep, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101989
PMID:39019115
|
研究论文 | 研究探讨了溶酶体蛋白酶Cathepsin D在巨噬细胞介导的肝纤维化逆转中的关键作用 | 首次描述了Cathepsin D驱动的溶酶体活性在纤维化逆转过程中巨噬细胞修复功能中的核心作用 | NA | 探讨Cathepsin D在肝纤维化逆转中的作用机制 | 巨噬细胞和肝细胞中的Cathepsin D表达及其在肝纤维化中的功能 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类肝硬化样本和myeloid-CtsD及hepatocyte-CtsD敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2024-09-13 |
An Efficient Fluorescence-Activated Protoplast Sorting (FAPS) and Regeneration Protocol for Canola (Brassica napus)
2024-Sep, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70008
PMID:39264225
|
研究论文 | 本文介绍了一种高效的荧光激活原生质体分选（FAPS）和再生协议，用于油菜（Brassica napus）的研究 | 本文首次报道了将FAPS方法应用于油菜原生质体的分选和再生，为功能基因组学和基因编辑应用提供了新的工具 | NA | 开发一种高效的原生质体分选和再生协议，以支持植物科学中的基础和应用研究 | 油菜（Brassica napus）的原生质体 | 植物科学 | NA | 荧光激活原生质体分选（FAPS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2024-09-11 |
Human RP105 monoclonal antibody enhances antigen-specific antibody production in unique culture conditions
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110649
PMID:39246445
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研究论文 | 研究了在特定培养条件下，人RP105单克隆抗体增强抗原特异性抗体产生的能力 | 建立了新的培养条件，使得人B细胞在ɑhRP105的作用下被强烈激活，并成功检测到针对血型碳水化合物、ɑGal和SARS-CoV-2的特异性抗体产生 | 研究主要集中在体外培养条件下，尚未在临床环境中验证其效果 | 探讨人RP105单克隆抗体在特定条件下激活B细胞并促进抗体产生的能力 | 人B细胞、RP105单克隆抗体、CpGDNA | NA | 移植排斥、自身免疫疾病 | 液相色谱-电喷雾电离串联质谱、单细胞RNA测序、定量实时PCR | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 533 | 2024-09-11 |
DeepKINET: a deep generative model for estimating single-cell RNA splicing and degradation rates
2024-Sep-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03367-8
PMID:39237934
|
研究论文 | 提出了一种名为DeepKINET的深度生成模型，用于估计单细胞RNA剪接和降解速率 | DeepKINET能够在单细胞分辨率下估计剪接和降解速率，并优于现有的方法 | NA | 研究RNA剪接和降解速率在单细胞水平上的变化及其对基因表达调控的影响 | 单细胞RNA剪接和降解速率 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度生成模型 | RNA-seq数据 | 包括前脑和乳腺癌数据，以及红系细胞中的剪接因子突变数据 | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-09-11 |
Single-cell RNA sequencing explored potential therapeutic targets by revealing the tumor microenvironment of neuroblastoma and its expression in cell death
2024-Sep-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01286-5
PMID:39235657
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示神经母细胞瘤的肿瘤微环境及其在细胞死亡中的表达，探索潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面研究神经母细胞瘤，并分析了新的细胞死亡途径cuproptosis，以寻找新的临床治疗靶点 | NA | 通过单细胞RNA测序和cuproptosis分析，揭示神经母细胞瘤的肿瘤微环境，寻找新的治疗靶点 | 神经母细胞瘤及其肿瘤微环境中的神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自神经母细胞瘤患者的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 535 | 2024-09-11 |
A Bayesian framework for inferring dynamic intercellular interactions from time-series single-cell data
2024-Sep-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279126.124
PMID:39237300
|
研究论文 | 本文介绍了一种贝叶斯框架DIISCO，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断动态细胞间相互作用 | DIISCO框架利用结构化高斯过程回归来揭示不同细胞类型之间的时序相互作用，并结合受体-配体复合物的先验知识 | NA | 研究细胞间通信及其随时间的变化，以理解正常发育、疾病进展和治疗反应等生物过程的协调 | 细胞间相互作用及其时间动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯框架 | 时间序列数据 | 包括来自T细胞与淋巴瘤细胞共培养的新数据 | NA | NA | NA | NA |
| 536 | 2024-09-11 |
Inference of single-cell network using mutual information for scRNA-seq data analysis
2024-Sep-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05895-3
PMID:39237886
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于互信息的单细胞网络构建方法SINUM，用于分析scRNA-seq数据 | SINUM通过估计基因间的互信息来确定基因在特定细胞中的依赖性或独立性，相比现有方法在细胞类型识别上表现更优 | NA | 构建单细胞网络以揭示生物系统的动态变化和细胞间的异质性 | scRNA-seq数据中的基因表达网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 互信息 | 基因表达数据 | 涉及不同细胞数量的多个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2024-09-11 |
Enhanced osteogenic differentiation in 3D hydrogel scaffold via macrophage mitochondrial transfer
2024-Sep-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02757-1
PMID:39237942
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研究论文 | 评估一种新型3D生物仿生水凝胶支架在促进骨折愈合中的效果 | 通过巨噬细胞线粒体转移增强3D水凝胶支架的成骨分化能力 | NA | 评估新型3D生物仿生水凝胶支架在促进骨折愈合中的效果 | 3D生物仿生水凝胶支架、巨噬细胞、骨髓间充质干细胞、骨折愈合 | 生物医学工程 | 骨折 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 体外实验使用骨髓间充质干细胞，体内实验使用骨折小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2024-09-11 |
Loss of Annexin A1 in macrophages restrains efferocytosis and remodels immune microenvironment in pancreatic cancer by activating the cGAS/STING pathway
2024-Sep-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009318
PMID:39237260
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研究论文 | 研究了 Annexin A1 在胰腺癌中的作用，发现其在巨噬细胞中的缺失通过激活 cGAS/STING 通路抑制了吞噬作用并重塑了免疫微环境 | 揭示了巨噬细胞中 Annexin A1 在胰腺癌中的新作用，通过调节肿瘤相关巨噬细胞的吞噬作用促进抗肿瘤免疫反应 | NA | 研究 Annexin A1 在胰腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 胰腺癌患者样本和 myeloid-specific ANXA1-knockout 小鼠 | NA | 胰腺癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞 RNA 测序、流式细胞术 | NA | 组织样本、细胞 | 151 例胰腺癌患者样本和 myeloid-specific ANXA1-knockout 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2024-09-11 |
Dissecting viral infections, one cell at a time, by single-cell technologies
2024 Sep-Oct, Microbes and infection
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.micinf.2023.105268
PMID:38008398
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综述 | 本文综述了单细胞基因组技术，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）在病毒感染研究中的应用 | 探讨了单细胞技术在病毒学中的创新应用，特别是在COVID-19大流行期间的研究 | 技术限制、挑战及其解决方案 | 详细介绍单细胞水平研究病毒感染的优势，以及如何利用scRNA-seq技术实现这一目标 | 病毒与宿主的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-09-11 |
A polymeric nanoplatform enhances the cGAS-STING pathway in macrophages to potentiate phagocytosis for cancer immunotherapy
2024-Sep, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.07.039
PMID:39038546
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研究论文 | 设计了一种甘露糖修饰的pH响应性纳米平台，通过共封装R848和cGAMP，促进肿瘤相关巨噬细胞的极化和SIRPα表达的下调，从而增强抗肿瘤免疫治疗 | 首次设计了一种甘露糖修饰的pH响应性纳米平台，通过共封装R848和cGAMP，促进肿瘤相关巨噬细胞的极化和SIRPα表达的下调，从而增强抗肿瘤免疫治疗 | NA | 研究通过激活cGAS-STING通路来增强巨噬细胞的吞噬作用，从而提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和其表达的信号调节蛋白α（SIRPα） | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |