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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-09-16 |
Exploring the relationship between the interleukin family and lung adenocarcinoma through Mendelian randomization and RNA sequencing analysis
2024-Sep-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01325-1
PMID:39264458
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和RNA测序分析探索白细胞介素家族与肺腺癌之间的关系 | 首次通过孟德尔随机化和RNA测序分析揭示了白细胞介素因子与肺腺癌发生和进展的因果关系 | 研究主要基于数据集分析,缺乏体内实验验证 | 揭示白细胞介素因子与肺腺癌之间的关联 | 白细胞介素因子与肺腺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 多个中心的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-09-16 |
Spatial transcriptomics reveals tumor-derived SPP1 induces fibroblast chemotaxis and activation in the hepatocellular carcinoma microenvironment
2024-Sep-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05613-w
PMID:39267037
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研究论文 | 研究揭示了肝细胞癌微环境中肿瘤细胞分泌的SPP1诱导成纤维细胞趋化和激活的机制 | 首次阐明了SPP1-CD44信号轴在肿瘤细胞与成纤维细胞相互作用中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的数据和临床样本,缺乏体内外实验的直接验证 | 探讨肝细胞癌微环境中肿瘤细胞与成纤维细胞相互作用的机制 | 肝细胞癌微环境中的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了10个空间转录组和12个单细胞转录组样本,以及20个肝癌患者的肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-09-16 |
Single-cell sequencing of the vermiform appendix during development identifies transcriptional relationships with appendicitis in preschool children
2024-Sep-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03611-9
PMID:39267041
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了人类阑尾在发育过程中的转录特征,并探讨了其与学龄前儿童阑尾炎的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了阑尾发育过程中的细胞图谱,并发现了BMP信号通路在阑尾上皮发育中的潜在作用 | 研究样本量较小,且仅限于学龄前儿童,可能影响结果的普适性 | 深入了解人类阑尾的发育过程及其与学龄前儿童阑尾炎的关系 | 人类阑尾在胎儿、儿童及学龄前炎症阶段的细胞 | 数字病理学 | 阑尾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括胎儿、儿童及学龄前炎症阶段的阑尾样本 | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-09-16 |
Multi‑omics identification of a signature based on malignant cell-associated ligand-receptor genes for lung adenocarcinoma
2024-Sep-12, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12911-5
PMID:39267056
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研究论文 | 本文通过多组学分析,构建了一个基于恶性细胞相关配体-受体基因的肺腺癌预后标志物 | 本文通过结合10种机器学习算法,开发了一种新的计算框架,用于识别肺腺癌的预后标志物 | NA | 开发一种新的方法来评估肺腺癌患者的预后,并提供开发更有效免疫疗法的见解 | 肺腺癌的恶性细胞相关配体-受体基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 317例免疫治疗患者 | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-09-16 |
A novel spherical GelMA-HAMA hydrogel encapsulating APET×2 polypeptide and CFIm25-targeting sgRNA for immune microenvironment modulation and nucleus pulposus regeneration in intervertebral discs
2024-Sep-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02783-z
PMID:39267105
|
研究论文 | 研究开发了一种新型球形GelMA-HAMA水凝胶,用于调节免疫微环境并促进椎间盘髓核再生 | 首次使用球形GelMA-HAMA水凝胶封装APET×2多肽和CFIm25靶向sgRNA,用于治疗椎间盘退变 | NA | 探讨CFIm25在椎间盘退变中的作用,并开发新型治疗策略 | 椎间盘髓核细胞和小鼠模型 | 生物医学工程 | 脊柱疾病 | CRISPR-Cas9, 单细胞转录组学, 高通量转录组学 | NA | 基因表达, 蛋白质表达, 细胞活性, 细胞迁移 | 小鼠椎间盘髓核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-09-16 |
Glucose deprivation-induced disulfidptosis in human nucleus pulposus cells: a novel pathological mechanism of intervertebral disc degeneration
2024-Sep-12, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00528-4
PMID:39267140
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研究论文 | 研究了葡萄糖剥夺诱导的人椎间盘髓核细胞中的二硫化物死亡,揭示了椎间盘退变的新病理机制 | 首次揭示了葡萄糖剥夺诱导的二硫化物死亡在椎间盘退变中的作用,并鉴定了一个新的二硫化物死亡相关细胞亚群 | 研究仅限于体外实验和单细胞RNA测序分析,缺乏体内实验验证 | 探讨葡萄糖剥夺诱导的二硫化物死亡在椎间盘退变中的病理机制 | 人椎间盘髓核细胞和椎间盘退变样本 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组DNA甲基化 | 机器学习 | 基因表达数据 | 一个正常样本和一个椎间盘退变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 487 | 2024-09-16 |
Identification of macrophage driver genes in fibrosis caused by different heart diseases based on omics integration
2024-Sep-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05624-7
PMID:39267173
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和批量RNA测序分析,探讨了不同心脏病引起的纤维化中巨噬细胞驱动基因的关系 | 首次通过整合单细胞转录组学和批量RNA测序数据,揭示了四种心脏病中巨噬细胞介导的心肌纤维化的驱动基因,并验证了左心室辅助装置(LVAD)对心衰患者的治疗效果 | NA | 探讨不同心脏病引起的心肌纤维化中巨噬细胞的遗传病理生理机制 | 巨噬细胞在心肌纤维化中的作用及其驱动基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四种心脏病(扩张型心肌病、缺血性心肌病、心肌梗死、心衰)的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-09-16 |
Construction and validation of a TAMRGs prognostic signature for gliomas by integrated analysis of scRNA and bulk RNA sequencing data
2024-Sep-11, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2024.149237
PMID:39270996
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建并验证了一种基于肿瘤相关巨噬细胞相关基因的胶质瘤预后模型 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,构建了一种新的预后模型,并验证了其在胶质瘤患者中的预后价值 | NA | 构建并验证一种基于肿瘤相关巨噬细胞相关基因的胶质瘤预后模型 | 胶质瘤患者的预后预测 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | LASSO回归和多变量Cox回归分析 | RNA测序数据 | 三个内部胶质瘤组织样本和TCGA-GTEx数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2024-09-15 |
Exploring the role of KIR3DL2 on NK cells in hepatocellular carcinoma and its potential prognostic implications
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110637
PMID:39262781
|
研究论文 | 本研究探讨了KIR3DL2在肝细胞癌中对自然杀伤细胞的作用及其潜在的预后意义 | 首次通过单细胞测序分析了原发性和复发性肝细胞癌患者肿瘤及邻近组织中免疫细胞的数量和基因表达谱,揭示了KIR3DL2表达与NK细胞耗竭及预后的关系 | 研究样本量较小,需要进一步的大规模验证 | 识别肝细胞癌的预后分子标志物 | 肝细胞癌患者的肿瘤及邻近组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 原发性和复发性肝细胞癌患者的肿瘤及邻近组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 490 | 2024-09-15 |
Targeting ALDOA to modulate tumorigenesis and energy metabolism in retinoblastoma
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110725
PMID:39262779
|
研究论文 | 本研究旨在阐明醛缩酶A(ALDOA)在视网膜母细胞瘤(RB)中的关键作用,并评估ALDOA抑制剂衣康酸在阻碍RB进展中的潜力 | 本研究首次揭示了ALDOA在视网膜母细胞瘤中的过度表达及其对细胞活性和代谢的影响,并验证了衣康酸作为ALDOA抑制剂的有效性 | 本研究主要集中在细胞和组织水平,尚未在临床试验中验证其疗效 | 阐明ALDOA在视网膜母细胞瘤中的作用并探索新的治疗策略 | 视网膜母细胞瘤细胞和组织 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种细胞类型,包括锥前体细胞、类视网膜母细胞瘤细胞和视网膜母细胞瘤样细胞,以及视网膜母细胞瘤组织和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-09-15 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Repair Features of Human Umbilical Cord Mesenchymal Stromal Cells
2024-Sep-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202310-1975OC
PMID:38564376
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术揭示人脐带间充质干细胞的修复特征,并探讨其在慢性肺病中的治疗潜力 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析人脐带间充质干细胞的转录组特征,并发现具有祖细胞样转录组的干细胞在实验性支气管肺发育不良中表现出更好的肺保护作用 | 临床试验结果尚未完全匹配前期研究的潜力,缺乏定义功能性不同干细胞的具体标准 | 确定并关联单细胞人脐带间充质干细胞的转录组特征与治疗潜力 | 人脐带间充质干细胞和人类新生儿真皮成纤维细胞 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 五个足月捐赠者的脐带间充质干细胞和人类新生儿真皮成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2024-09-15 |
SLC8A1, a novel prognostic biomarker and immunotherapy target in RSA and UCEC based on scRNA-seq and pan-cancer analysis
2024-Sep-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36899
PMID:39263055
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和泛癌分析,鉴定了SLC8A1作为RSA和UCEC的新型预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 首次将SLC8A1鉴定为RSA和UCEC的预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 仅限于体外实验,未进行临床试验验证 | 鉴定RSA和UCEC的预后生物标志物和免疫治疗靶点 | RSA和UCEC患者样本 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | RSA蜕膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-09-15 |
PGRMC2 influences the onset of postmenopausal osteoporosis through disulfidptosis in monocytes: Evidence from experimental validation and Mendelian randomization
2024-Sep-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36570
PMID:39263088
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研究论文 | 研究探讨了硫化物死亡在单核细胞中的作用及其与绝经后骨质疏松症的关系 | 首次将PGRMC2与绝经后骨质疏松症的病理机制联系起来,并提供了实验验证和孟德尔随机化分析的支持 | 研究主要基于实验动物模型和数据库分析,需要进一步的人体临床试验验证 | 探索PGRMC2在绝经后骨质疏松症发病机制中的作用 | 单核细胞、骨组织、骨髓间充质干细胞、成骨细胞和脂肪细胞 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、Western blotting、免疫组化、孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了去卵巢小鼠模型和来自decode和GWAS数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-09-15 |
Dissection of the cell communication interactions in lung adenocarcinoma identified a prognostic model with immunotherapy efficacy assessment and a potential therapeutic candidate gene ITGB1
2024-Sep-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36599
PMID:39263115
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研究论文 | 研究揭示了肺腺癌中细胞通讯交互作用,并开发了一种预测免疫治疗效果的预后模型,同时发现ITGB1基因作为潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析肺腺癌中的细胞通讯网络,并开发了一种新的预后模型和免疫治疗反应预测模型 | NA | 解析肺腺癌中的细胞通讯和分子模式,以发现新的生物标志物和免疫治疗反应预测因子 | 肺腺癌患者的肿瘤微环境中的细胞通讯交互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NMF算法 | 基因表达数据 | 多个肺腺癌患者队列的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-09-15 |
BCAA-producing Clostridium symbiosum promotes colorectal tumorigenesis through the modulation of host cholesterol metabolism
2024-Sep-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.07.012
PMID:39106870
|
研究论文 | 本文研究了Clostridium symbiosum在结直肠癌发生中的作用及其机制 | 首次发现Clostridium symbiosum通过调节宿主胆固醇代谢促进结直肠癌的发生 | NA | 探讨Clostridium symbiosum在结直肠癌发生中的作用及其机制 | Clostridium symbiosum、结直肠癌患者、小鼠模型 | NA | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个小鼠模型和结直肠癌患者肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-09-15 |
Targeting ribosome biogenesis as a novel therapeutic approach to overcome EMT-related chemoresistance in breast cancer
2024-Sep-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89486
PMID:39259576
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研究论文 | 本研究利用Tri-PyMT EMT谱系追踪模型和小鼠单细胞RNA测序分析了肿瘤细胞的EMT状态,发现抑制RiBi途径可以有效克服乳腺癌化疗耐药性 | 首次揭示了RiBi在EMT和MET过程中的关键作用,并证明了RiBi抑制剂与化疗药物联合使用可以显著减少肿瘤细胞的转移 | 研究主要在小鼠模型中进行,需要在临床试验中进一步验证 | 探索克服乳腺癌化疗耐药性的新疗法 | 乳腺癌细胞的EMT和MET过程 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-09-15 |
Comprehensive analysis of scRNA-Seq and bulk RNA-Seq reveals ubiquitin promotes pulmonary fibrosis in chronic pulmonary diseases
2024-09-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70659-1
PMID:39261509
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了泛素在慢性肺部疾病中的肺纤维化病理机制 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示了泛素在慢性肺部疾病中的异常表达及其与肺纤维化的关系 | 在独立的小鼠单细胞图谱中未能验证泛素化增强的现象,表明模型需要优化 | 阐明慢性肺部疾病的病理机制并推动药物开发 | 慢性阻塞性肺病(COPD)、间质性肺病(ILD)和特发性肺纤维化(IPF) | 数字病理学 | 慢性呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序(bulk RNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据,以及COVID-19、ILD和IPF的批量RNA数据 | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-09-15 |
A natural language processing system for the efficient extraction of cell markers
2024-09-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-72204-6
PMID:39261578
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研究论文 | 介绍了一种用于从文献中高效提取细胞标记的自然语言处理系统MarkerGeneBERT | 开发了MarkerGeneBERT系统,能够从单细胞测序相关研究中提取物种、组织、细胞类型和细胞标记基因的关键信息,并展示了其在细胞标记数据库补充和单细胞RNA测序数据注释中的应用 | 系统在完整性和准确性方面仍有提升空间,分别为76%和75% | 加速和增强单细胞RNA测序数据的注释和解释 | 单细胞RNA测序研究中的细胞标记提取 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | BERT | 文本 | 3702篇单细胞测序相关研究文章,涵盖7901个细胞标记和1606种细胞类型,以及8223个细胞标记和1674种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-09-15 |
Integrative genomics unveils basement membrane-related diagnostic markers and therapeutic targets in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Sep-11, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00529-3
PMID:39256753
|
研究论文 | 本研究通过综合基因组学分析,揭示了食管鳞状细胞癌中与基底膜相关的诊断标志物和治疗靶点 | 首次系统性地分析了基底膜相关基因在食管鳞状细胞癌诊断中的作用,并发现了七个关键的基底膜相关基因作为潜在的诊断标志物和治疗靶点 | 研究主要基于数据库中的基因表达数据,缺乏临床样本的直接验证 | 评估基底膜完整性在食管鳞状细胞癌中的诊断和治疗潜力 | 食管鳞状细胞癌及其基底膜相关基因 | 基因组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO、RF、SVM-RFE | 基因表达数据 | 使用Gene Expression Omnibus (GEO) 和 The Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据库中的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-09-15 |
Spatial resolved transcriptomics reveals distinct cross-talk between cancer cells and tumor-associated macrophages in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Sep-11, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00648-z
PMID:39256888
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研究论文 | 本文通过空间转录组学技术揭示了肝内胆管癌中癌细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用 | 首次在空间分辨率上全面描述了肝内胆管癌中肿瘤相关巨噬细胞与恶性亚克隆之间的相互作用 | NA | 研究肝内胆管癌中肿瘤微环境内细胞成分的空间结构及其基因表达的病理变化和细胞异质性 | 肝内胆管癌中的肿瘤相关巨噬细胞与恶性亚克隆 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 空间转录组学 (ST) 和数字空间分析 (DSP) | NA | 组织切片 | 来自肝内胆管癌患者的肿瘤组织切片 | NA | NA | NA | NA |