单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 633 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-09-17 |
Single-cell profiling uncovers proliferative cells as key determinants of survival outcomes in lower-grade glioma patients
2024-Sep-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01302-8
PMID:39276278
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序，识别出一种与低级别胶质瘤患者预后不良相关的新型细胞类型，并构建了基于该细胞类型的预测模型 | 本研究首次识别出一种名为“Prol”的细胞类型，该细胞类型与低级别胶质瘤患者的预后不良相关，并构建了基于该细胞类型的预测模型，具有泛癌预测潜力 | NA | 本研究旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，识别出与低级别胶质瘤患者预后相关的新型细胞类型，并开发新的预测模型 | 低级别胶质瘤患者及其细胞类型 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | AI网络 | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 462 | 2024-09-17 |
Single-cell RNA sequencing analysis of peripheral blood mononuclear cells in PD-1-induced renal toxicity in patients with lung cancer
2024-Sep-14, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03754-0
PMID:39277735
|
研究论文 | 研究分析了PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的单细胞RNA测序特征 | 首次通过单细胞RNA测序分析了PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的差异表达基因及其富集的生物学过程 | 样本量较小，仅包括六名患者 | 旨在分析PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的特征 | 外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 463 | 2024-09-17 |
Single-cell RNA sequencing reveals the differentiation and regulation of endplate cells in human intervertebral disc degeneration
2024-Sep-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-71891-5
PMID:39271714
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了人类椎间盘退变中的终板细胞的分化和调控 | 首次通过单细胞RNA测序分析了退变终板细胞的细胞命运和特性，并发现了两种软骨细胞分化途径 | NA | 揭示椎间盘退变过程中终板细胞的分化和调控机制 | 人类椎间盘退变中的终板细胞 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8534个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2024-09-17 |
Machine learning algorithms for predicting glioma patient prognosis based on CD163+FPR3+ macrophage signature
2024-Sep-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00692-w
PMID:39271911
|
研究论文 | 研究利用机器学习算法基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征预测胶质瘤患者预后 | 首次基于CD163+FPR3+巨噬细胞相关特征构建了预测胶质瘤患者预后的机器学习模型，并展示了其优于传统临床因素和其他已发表签名的预测准确性 | NA | 开发一种基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征的机器学习模型，以提高胶质瘤患者预后的预测准确性 | 胶质瘤患者及其肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 脑肿瘤 | 单细胞测序分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 六个胶质瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 465 | 2024-09-17 |
scBubbletree: computational approach for visualization of single cell RNA-seq data
2024-Sep-13, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05927-y
PMID:39271980
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scBubbletree的新方法，用于可视化单细胞RNA测序数据 | scBubbletree方法通过将细胞聚类可视化为树状图上的气泡，解决了现有方法在可视化高维数据时的过绘制、缺乏定量信息和扭曲全局及局部生物模式的问题 | NA | 开发一种新的可视化方法，以更好地量化和展示单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | 包括一个超过120万细胞的大规模数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 466 | 2024-09-17 |
Single-cell, single-nucleus and xenium-based spatial transcriptomics analyses reveal inflammatory activation and altered cell interactions in the hippocampus in mice with temporal lobe epilepsy
2024-Sep-13, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00636-3
PMID:39272194
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、单核RNA测序和基于Xenium的空间转录组学分析，揭示了颞叶癫痫小鼠海马体中炎症激活和细胞相互作用的改变 | 首次建立了颞叶癫痫小鼠海马体的高分辨率单细胞转录组图谱，揭示了潜在的内在机制驱动炎症激活和细胞相互作用的改变 | NA | 探讨颞叶癫痫相关海马硬化发展的潜在机制 | 颞叶癫痫小鼠海马体中的胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、Xenium空间转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 31,390个胶质细胞和48,221个神经元核 | NA | NA | NA | NA |
| 467 | 2024-09-17 |
CYR61/CCN1: A Novel Mediator of Redox Response in Corneal Stromal Cells of Keratoconus
2024-Sep-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110093
PMID:39277098
|
研究论文 | 研究探讨了CYR61/CCN1在圆锥角膜基质细胞氧化应激反应中的作用 | 首次揭示了CYR61在圆锥角膜基质细胞氧化应激反应中的关键作用 | 研究主要集中在细胞水平，缺乏临床数据支持 | 阐明氧化应激在圆锥角膜病理生理中的分子机制 | 圆锥角膜基质细胞 | NA | 圆锥角膜 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 圆锥角膜组和对照组的基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 468 | 2024-09-17 |
Approximating mutual information of high-dimensional variables using learned representations
2024-Sep-03, ArXiv
PMID:39279839
|
研究论文 | 本文提出了一种名为潜在互信息（LMI）近似的方法，用于在高维数据中近似互信息 | LMI方法利用高维数据中的低维结构，通过非参数互信息估计器和简单理论模型架构学习到的低维表示来近似高维变量间的互信息 | NA | 探索在高维数据中利用低维结构近似互信息的方法 | 高维变量间的互信息 | 机器学习 | NA | 非参数互信息估计器 | 理论模型架构 | 高维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2024-09-17 |
FateNet: an integration of dynamical systems and deep learning for cell fate prediction
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae525
PMID:39177093
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FateNet的计算方法，结合动力系统理论和深度学习，用于预测细胞命运 | FateNet通过整合动力系统理论和深度学习，提高了细胞命运决策点的预测精度，并提供了对生物系统新状态的定性见解 | NA | 理解细胞决策过程及其对生物系统（如组织健康和功能）的影响 | 细胞命运决策和细胞状态动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习 | 基因表达数据 | 使用不同的scRNA-seq数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2024-09-17 |
Systematic comparison of sequencing-based spatial transcriptomic methods
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02325-3
PMID:38965443
|
研究论文 | 本文系统比较了11种基于测序的空间转录组学方法 | 首次全面基准测试不同的空间转录组学平台，并强调了分子扩散作为不同方法和组织中的变量参数 | 现有技术之间的变异性和数据集的多样性使得制定标准化的评估指标具有挑战性 | 帮助生物学家选择空间转录组学平台，并促进评估标准的共识 | 11种空间转录组学方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个参考组织和区域 | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2024-09-17 |
Unlocking reproducible transcriptomic signatures for acute myeloid leukaemia: Integration, classification and drug repurposing
2024-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70085
PMID:39267259
|
研究论文 | 本研究通过整合34个数据集，识别出10,000个与急性髓系白血病（AML）相关的基因，并利用机器学习技术发现191个AML特征，同时开发了一个用户友好的数据库平台CSAMLdb，以促进研究结果的复用和个性化分析 | 本研究通过整合多源数据集和使用机器学习技术，成功识别出AML相关的基因和特征，并开发了一个用户友好的数据库平台，以增强研究的复现性和可定制性 | NA | 解决急性髓系白血病（AML）转录组研究中的异质性问题，并发现新的治疗策略 | 急性髓系白血病（AML）及其亚型 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | XGBoost | 转录组数据 | 34个数据集，包括26个对照组、6个预后数据集和2个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2024-09-16 |
Reconstitution of the Multiple Myeloma Microenvironment Following Lymphodepletion with BCMA CAR-T Therapy
2024-Sep-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0352
PMID:39024031
|
研究论文 | 研究了BCMA CAR-T细胞疗法后多发性骨髓瘤微环境的重组 | 揭示了BCMA CAR-T疗法后多发性骨髓瘤微环境的动态变化，并提供了预测治疗反应性的线索 | 样本量较小，仅涉及七名患者 | 研究BCMA CAR-T细胞疗法后多发性骨髓瘤微环境的重组 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14个骨髓样本，来自7名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2024-09-15 |
Computational Strategies and Algorithms for Inferring Cellular Composition of Spatial Transcriptomics Data
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae057
PMID:39110523
|
综述 | 本文综述了空间转录组学数据中细胞成分推断的计算策略和算法 | 总结了最新的细胞比例估计进展，并展望了该领域的未来方向 | 当前空间技术无法直接测量细胞信息，只能通过空间点进行特征化 | 总结和展望空间转录组学数据中细胞成分推断的计算方法 | 空间转录组学数据中的细胞成分 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 474 | 2024-09-16 |
Exploring the relationship between the interleukin family and lung adenocarcinoma through Mendelian randomization and RNA sequencing analysis
2024-Sep-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01325-1
PMID:39264458
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和RNA测序分析探索白细胞介素家族与肺腺癌之间的关系 | 首次通过孟德尔随机化和RNA测序分析揭示了白细胞介素因子与肺腺癌发生和进展的因果关系 | 研究主要基于数据集分析，缺乏体内实验验证 | 揭示白细胞介素因子与肺腺癌之间的关联 | 白细胞介素因子与肺腺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 多个中心的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 475 | 2024-09-16 |
Spatial transcriptomics reveals tumor-derived SPP1 induces fibroblast chemotaxis and activation in the hepatocellular carcinoma microenvironment
2024-Sep-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05613-w
PMID:39267037
|
研究论文 | 研究揭示了肝细胞癌微环境中肿瘤细胞分泌的SPP1诱导成纤维细胞趋化和激活的机制 | 首次阐明了SPP1-CD44信号轴在肿瘤细胞与成纤维细胞相互作用中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的数据和临床样本，缺乏体内外实验的直接验证 | 探讨肝细胞癌微环境中肿瘤细胞与成纤维细胞相互作用的机制 | 肝细胞癌微环境中的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了10个空间转录组和12个单细胞转录组样本，以及20个肝癌患者的肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 476 | 2024-09-16 |
Single-cell sequencing of the vermiform appendix during development identifies transcriptional relationships with appendicitis in preschool children
2024-Sep-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03611-9
PMID:39267041
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了人类阑尾在发育过程中的转录特征，并探讨了其与学龄前儿童阑尾炎的关系 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了阑尾发育过程中的细胞图谱，并发现了BMP信号通路在阑尾上皮发育中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅限于学龄前儿童，可能影响结果的普适性 | 深入了解人类阑尾的发育过程及其与学龄前儿童阑尾炎的关系 | 人类阑尾在胎儿、儿童及学龄前炎症阶段的细胞 | 数字病理学 | 阑尾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括胎儿、儿童及学龄前炎症阶段的阑尾样本 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2024-09-16 |
Multi‑omics identification of a signature based on malignant cell-associated ligand-receptor genes for lung adenocarcinoma
2024-Sep-12, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12911-5
PMID:39267056
|
研究论文 | 本文通过多组学分析，构建了一个基于恶性细胞相关配体-受体基因的肺腺癌预后标志物 | 本文通过结合10种机器学习算法，开发了一种新的计算框架，用于识别肺腺癌的预后标志物 | NA | 开发一种新的方法来评估肺腺癌患者的预后，并提供开发更有效免疫疗法的见解 | 肺腺癌的恶性细胞相关配体-受体基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 317例免疫治疗患者 | NA | NA | NA | NA |
| 478 | 2024-09-16 |
A novel spherical GelMA-HAMA hydrogel encapsulating APET×2 polypeptide and CFIm25-targeting sgRNA for immune microenvironment modulation and nucleus pulposus regeneration in intervertebral discs
2024-Sep-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02783-z
PMID:39267105
|
研究论文 | 研究开发了一种新型球形GelMA-HAMA水凝胶，用于调节免疫微环境并促进椎间盘髓核再生 | 首次使用球形GelMA-HAMA水凝胶封装APET×2多肽和CFIm25靶向sgRNA，用于治疗椎间盘退变 | NA | 探讨CFIm25在椎间盘退变中的作用，并开发新型治疗策略 | 椎间盘髓核细胞和小鼠模型 | 生物医学工程 | 脊柱疾病 | CRISPR-Cas9, 单细胞转录组学, 高通量转录组学 | NA | 基因表达, 蛋白质表达, 细胞活性, 细胞迁移 | 小鼠椎间盘髓核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2024-09-16 |
Glucose deprivation-induced disulfidptosis in human nucleus pulposus cells: a novel pathological mechanism of intervertebral disc degeneration
2024-Sep-12, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00528-4
PMID:39267140
|
研究论文 | 研究了葡萄糖剥夺诱导的人椎间盘髓核细胞中的二硫化物死亡，揭示了椎间盘退变的新病理机制 | 首次揭示了葡萄糖剥夺诱导的二硫化物死亡在椎间盘退变中的作用，并鉴定了一个新的二硫化物死亡相关细胞亚群 | 研究仅限于体外实验和单细胞RNA测序分析，缺乏体内实验验证 | 探讨葡萄糖剥夺诱导的二硫化物死亡在椎间盘退变中的病理机制 | 人椎间盘髓核细胞和椎间盘退变样本 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组DNA甲基化 | 机器学习 | 基因表达数据 | 一个正常样本和一个椎间盘退变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2024-09-16 |
Identification of macrophage driver genes in fibrosis caused by different heart diseases based on omics integration
2024-Sep-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05624-7
PMID:39267173
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和批量RNA测序分析，探讨了不同心脏病引起的纤维化中巨噬细胞驱动基因的关系 | 首次通过整合单细胞转录组学和批量RNA测序数据，揭示了四种心脏病中巨噬细胞介导的心肌纤维化的驱动基因，并验证了左心室辅助装置（LVAD）对心衰患者的治疗效果 | NA | 探讨不同心脏病引起的心肌纤维化中巨噬细胞的遗传病理生理机制 | 巨噬细胞在心肌纤维化中的作用及其驱动基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四种心脏病（扩张型心肌病、缺血性心肌病、心肌梗死、心衰）的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |