单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
421	2024-09-19	Identification and experimental validation of key genes in osteoarthritis based on machine learning algorithms and single-cell sequencing analysis 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37047 PMID:39286216	研究论文	基于机器学习算法和单细胞测序分析，识别和实验验证骨关节炎的关键基因	通过机器学习算法和单细胞测序分析，识别出与骨关节炎进展密切相关的四个关键基因，并验证了其在早期诊断中的潜力	研究样本量较小，且仅限于特定的数据集和实验条件	识别骨关节炎的诊断标志物，揭示其发病机制并促进早期诊断	骨关节炎的诊断标志物和关键基因	机器学习	骨关节炎	单细胞RNA测序	机器学习算法	基因表达数据	53个滑膜组织样本（30个骨关节炎样本，23个对照组样本）
422	2024-09-19	EEF1B2 regulates the proliferation and apoptosis of human spermatogonial stem cell lines through TAF4B 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36467 PMID:39281470	研究论文	研究探讨了EEF1B2通过TAF4B调控人类精原干细胞增殖和凋亡的机制	揭示了EEF1B2和TAF4B在人类精原干细胞中的新型调控机制	主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内验证	探究EEF1B2在调控人类精原干细胞增殖和凋亡中的作用	人类精原干细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	人类睾丸样本
423	2024-09-19	Development and validation of a risk prognostic model based on the H. pylori infection phenotype for stomach adenocarcinoma 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36882 PMID:39281596	研究论文	本研究基于幽门螺杆菌感染相关的巨噬细胞表型，构建并验证了一个用于预测胃腺癌预后的风险模型	本研究首次基于幽门螺杆菌感染相关的巨噬细胞表型构建了一个风险模型，用于预测胃腺癌的预后，并开发了一个结合风险评分的诺模图，以准确预测胃腺癌患者的生存	NA	构建并验证一个基于幽门螺杆菌感染表型的风险模型，用于预测胃腺癌的预后	胃腺癌患者及其幽门螺杆菌感染相关的巨噬细胞表型	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	风险评分模型	RNA测序数据	17397个细胞样本
424	2024-09-19	Strategic targeting of miR-183 and β-catenin to enhance BMSC stemness in age-related osteoporosis therapy 2024-09-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-72474-0 PMID:39277663	研究论文	研究探讨了miR-183和β-catenin在年龄相关性骨质疏松症治疗中对骨髓间充质干细胞（BMSCs）干性的调控作用	揭示了miR-183通过靶向β-catenin调控BMSCs干性的分子机制，并提出了以miR-183和β-catenin为靶点增强BMSCs干性的治疗策略	NA	探讨miR-183和β-catenin在年龄相关性骨质疏松症中对BMSCs干性的调控机制，并提出新的治疗策略	骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其干性相关分子miR-183和β-catenin	NA	骨质疏松症	单细胞RNA测序和miRNA测序	NA	RNA	NA
425	2024-09-19	Light and dopamine impact two circadian neurons to promote morning wakefulness 2024-Sep-09, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2024.07.056 PMID:39142287	研究论文	研究探讨了光和多巴胺如何通过影响果蝇的两种昼夜节律神经元来促进早晨的清醒	首次揭示了光和多巴胺通过调节特定神经元的多巴胺受体Dop1R1的mRNA水平，从而影响早晨清醒的机制	研究仅限于果蝇模型，尚未在哺乳动物中验证	探讨光和多巴胺对果蝇早晨清醒的影响机制	果蝇的两种昼夜节律神经元	神经科学	NA	单细胞测序、CRISPR-Cas9基因编辑、活体成像	NA	mRNA表达数据、cAMP响应数据	17组果蝇昼夜节律神经元
426	2024-09-19	High-Lactate-Metabolizing Photosynthetic Bacteria Reprogram Tumor Immune Microenvironment 2024-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202405930 PMID:38924191	研究论文	本文研究了利用高乳酸代谢光合细菌（LAB-1）重编程肿瘤免疫微环境以提高免疫治疗效果	本文首次筛选出一种高乳酸代谢光合细菌（LAB-1），用于重编程肿瘤免疫微环境，从而提高肿瘤免疫治疗的效果	NA	研究如何通过降低肿瘤组织中的乳酸水平来重编程肿瘤免疫微环境，以增强免疫治疗效果	高乳酸代谢光合细菌（LAB-1）及其在肿瘤免疫微环境中的作用	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠4T1模型
427	2024-09-19	Human Pluripotent Stem Cell-Derived Astrocyte Functionality Compares Favorably with Primary Rat Astrocytes 2024-Sep, eNeuro IF:2.7Q3 DOI:10.1523/ENEURO.0148-24.2024 PMID:39227152	研究论文	本文比较了人多能干细胞衍生的星形胶质细胞与大鼠原代星形胶质细胞在支持人神经网络活动和成熟方面的功能	首次展示了人多能干细胞衍生的星形胶质细胞在支持人神经网络活动和成熟方面与大鼠星形胶质细胞相当，甚至更优	NA	研究人多能干细胞衍生的星形胶质细胞在支持人神经网络活动和成熟方面的功能	人多能干细胞衍生的星形胶质细胞与大鼠原代星形胶质细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
428	2024-09-18	Associations between cuprotosis-related genes and the spectrum of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease: An exploratory study 2024-Sep-16, Diabetes, obesity & metabolism DOI:10.1111/dom.15946 PMID:39285685	研究论文	研究铜代谢相关基因与代谢功能障碍相关脂肪性肝病及其相关肝细胞癌之间的关联	首次探讨铜代谢相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝病不同阶段的作用，特别是与肝纤维化和肝细胞癌的关系	研究依赖于现有的RNA测序数据和基因组关联研究，缺乏直接的实验验证	探索铜代谢相关基因与代谢功能障碍相关脂肪性肝病及其相关肝细胞癌的关联	铜代谢相关基因、代谢功能障碍相关脂肪性肝病及其相关肝细胞癌	基因组学	肝病	RNA测序、基因组关联研究	NA	RNA数据	331例代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者和271例相关肝细胞癌患者，以及656例独立队列的代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者
429	2024-09-17	Integrative analysis of pan-cancer single-cell data reveals a tumor ecosystem subtype predicting immunotherapy response 2024-Sep-15, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-024-00703-w PMID:39277681	研究论文	本研究通过整合泛癌单细胞数据，揭示了一种肿瘤生态系统亚型，该亚型与免疫治疗反应的改善相关	建立了新的免疫治疗反应生态型特征（IRE.Sig），并通过机器学习模型成功预测了ICI反应	缺乏直接的临床证据支持	揭示肿瘤生态系统亚型与免疫治疗反应的关系，并开发预测工具	泛癌单细胞数据和ICI治疗患者的数据	数字病理学	NA	scRNA-Seq	机器学习模型	单细胞RNA测序数据	涉及5个CRISPR筛选队列和多个验证与测试队列
430	2024-09-17	Single-cell sequencing analysis of multiple myeloma heterogeneity and identification of new theranostic targets 2024-Sep-14, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-07027-4 PMID:39271659	研究论文	研究通过单细胞转录组测序分析多发性骨髓瘤的异质性，并识别新的治疗靶点	通过单细胞转录组测序揭示了多发性骨髓瘤与健康捐赠者之间B淋巴细胞系通讯的破坏，并发现了独特的信号分子	NA	阐明多发性骨髓瘤的异质性并识别新的治疗靶点	多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞和健康捐赠者的骨髓细胞	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	48,293个骨髓细胞，包括多发性骨髓瘤患者和健康捐赠者
431	2024-09-17	Cell therapy using ex vivo reprogrammed macrophages enhances antitumor immune responses in melanoma 2024-Sep-14, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-024-03182-w PMID:39272209	研究论文	研究通过体外重编程巨噬细胞进行细胞疗法，增强黑色素瘤中的抗肿瘤免疫反应	首次展示了使用HDAC6抑制剂体外重编程巨噬细胞作为治疗实体瘤的可行性细胞疗法	NA	设计新策略以增加肿瘤微环境中M1/M2比例，从而增强基于巨噬细胞的细胞疗法	巨噬细胞、肿瘤微环境、黑色素瘤	细胞疗法	黑色素瘤	HDAC6抑制剂、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序	NA	RNA	使用SM1小鼠黑色素瘤模型和NSG-SGM3人源化小鼠模型进行研究
432	2024-09-17	Single-cell profiling uncovers proliferative cells as key determinants of survival outcomes in lower-grade glioma patients 2024-Sep-14, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-024-01302-8 PMID:39276278	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和批量RNA测序，识别出一种与低级别胶质瘤患者预后不良相关的新型细胞类型，并构建了基于该细胞类型的预测模型	本研究首次识别出一种名为“Prol”的细胞类型，该细胞类型与低级别胶质瘤患者的预后不良相关，并构建了基于该细胞类型的预测模型，具有泛癌预测潜力	NA	本研究旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，识别出与低级别胶质瘤患者预后相关的新型细胞类型，并开发新的预测模型	低级别胶质瘤患者及其细胞类型	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序	AI网络	RNA	NA
433	2024-09-17	Single-cell RNA sequencing analysis of peripheral blood mononuclear cells in PD-1-induced renal toxicity in patients with lung cancer 2024-Sep-14, BMC nephrology IF:2.2Q2 DOI:10.1186/s12882-024-03754-0 PMID:39277735	研究论文	研究分析了PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的单细胞RNA测序特征	首次通过单细胞RNA测序分析了PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的差异表达基因及其富集的生物学过程	样本量较小，仅包括六名患者	旨在分析PD-1治疗引起的肾毒性中，外周血单核细胞的特征	外周血单核细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	6名患者
434	2024-09-17	Single-cell RNA sequencing reveals the differentiation and regulation of endplate cells in human intervertebral disc degeneration 2024-Sep-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-71891-5 PMID:39271714	研究论文	研究通过单细胞RNA测序分析了人类椎间盘退变中的终板细胞的分化和调控	首次通过单细胞RNA测序分析了退变终板细胞的细胞命运和特性，并发现了两种软骨细胞分化途径	NA	揭示椎间盘退变过程中终板细胞的分化和调控机制	人类椎间盘退变中的终板细胞	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	8534个单细胞
435	2024-09-17	Machine learning algorithms for predicting glioma patient prognosis based on CD163+FPR3+ macrophage signature 2024-Sep-13, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-024-00692-w PMID:39271911	研究论文	研究利用机器学习算法基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征预测胶质瘤患者预后	首次基于CD163+FPR3+巨噬细胞相关特征构建了预测胶质瘤患者预后的机器学习模型，并展示了其优于传统临床因素和其他已发表签名的预测准确性	NA	开发一种基于CD163+FPR3+巨噬细胞特征的机器学习模型，以提高胶质瘤患者预后的预测准确性	胶质瘤患者及其肿瘤相关巨噬细胞	机器学习	脑肿瘤	单细胞测序分析	机器学习算法	基因表达数据	六个胶质瘤队列
436	2024-09-17	scBubbletree: computational approach for visualization of single cell RNA-seq data 2024-Sep-13, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-024-05927-y PMID:39271980	研究论文	本文介绍了一种名为scBubbletree的新方法，用于可视化单细胞RNA测序数据	scBubbletree方法通过将细胞聚类可视化为树状图上的气泡，解决了现有方法在可视化高维数据时的过绘制、缺乏定量信息和扭曲全局及局部生物模式的问题	NA	开发一种新的可视化方法，以更好地量化和展示单细胞RNA测序数据	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	scRNA-seq数据	包括一个超过120万细胞的大规模数据集
437	2024-09-17	Identification of microenvironment features associated with primary resistance to anti-PD-1/PD-L1 + antiangiogenesis in gastric cancer through spatial transcriptomics and plasma proteomics 2024-Sep-13, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02092-x PMID:39272096	研究论文	研究通过空间转录组学和血浆蛋白质组学识别与胃癌抗PD-1/PD-L1 + 抗血管生成原发性耐药相关的微环境特征	揭示了M2巨噬细胞在肿瘤微环境中的增强存在和S100A10蛋白在肿瘤细胞中的过度表达与耐药性的关系，并发现了与不良临床结果相关的细胞因子水平升高	研究主要集中在白人患者群体，可能不适用于所有人群	探讨胃癌患者对抗PD-1/PD-L1 + 抗血管生成治疗的耐药机制	胃癌患者及其肿瘤微环境	数字病理学	胃癌	空间转录组学和血浆蛋白质组学	NA	转录组数据和蛋白质组数据	白人患者群体，具体数量未明确提及
438	2024-09-17	Permethrin exposure primes neuroinflammatory stress response to drive depression-like behavior through microglial activation in a mouse model of Gulf War Illness 2024-Sep-13, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-024-03215-3 PMID:39272155	研究论文	研究评估了接触除虫菊酯如何通过小胶质细胞激活引发与海湾战争疾病相关的抑郁样行为	首次揭示了除虫菊酯暴露通过小胶质细胞激活引发抑郁样行为的机制，并使用单细胞RNA测序分析了相关转录网络	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证	评估除虫菊酯暴露对神经炎症应激反应的影响，并探讨其与海湾战争疾病相关抑郁样行为的关系	小鼠模型中的小胶质细胞激活和抑郁样行为	神经科学	精神疾病	单细胞RNA测序	深度学习模型	基因表达数据	21,566个单核细胞
439	2024-09-17	Single-cell, single-nucleus and xenium-based spatial transcriptomics analyses reveal inflammatory activation and altered cell interactions in the hippocampus in mice with temporal lobe epilepsy 2024-Sep-13, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00636-3 PMID:39272194	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、单核RNA测序和基于Xenium的空间转录组学分析，揭示了颞叶癫痫小鼠海马体中炎症激活和细胞相互作用的改变	首次建立了颞叶癫痫小鼠海马体的高分辨率单细胞转录组图谱，揭示了潜在的内在机制驱动炎症激活和细胞相互作用的改变	NA	探讨颞叶癫痫相关海马硬化发展的潜在机制	颞叶癫痫小鼠海马体中的胶质细胞和神经元	数字病理学	癫痫	单细胞RNA测序、单核RNA测序、Xenium空间转录组学分析	NA	转录组数据	31,390个胶质细胞和48,221个神经元核
440	2024-09-17	Single cell sequencing delineates T-cell clonality and pathogenesis of the parapsoriasis disease group 2024-Sep-13, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.09.004 PMID:39278361	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了皮肤病变中的T细胞克隆性和发病机制，特别是针对类天疱疮疾病群	本文首次提出了“多克隆类天疱疮斑块”这一新术语，并描述了一种迄今未被发现的先天淋巴细胞群体	NA	旨在表征类天疱疮疾病谱	研究对象为类天疱疮至早期MF谱系中的患者皮肤活检样本，包括小斑块和大斑块	数字病理学	皮肤疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	研究涉及8例大斑块病变和7例小斑块病变，以及特应性皮炎、银屑病和健康对照皮肤样本